miRNA功能研究进展

miRNA是一类长度为20~25nt的小分子非编码RNA。在线虫、小鼠、人、植物等多种生物中已发现了数百种miRNA。无论在低等的线虫还是在高等的哺乳动物中，miRNA都起着调控基因表达的重要作用。生物信息学分析表明人类全部基因的三分之一都受到miRNA的调控。这表明，miRNA分子实际上是基因调控网络中的核心成分。近来研究发现miRNA与人类的某些疾病密切相关。本文对miRNA分子功能及其研究方法的进展做一概述。     

microRNA在眼内的表达及其与常见眼部疾病的关系

miRNA是一种小的内源性非编码RNA分子,大约由21~25个核苷酸组成。1个miRNA可以调节下游百余个靶mRNAs,而1个mRNA又可以受多个miRNAs所调控。Lee等[1]于1993年在对线虫发育研究时发现了第1个miRNA—lin-4。2000年第2个miRNA lin-7被发现[2]。miRNAs存在于所有的多细胞生物中,其数量约相当于每种生物体蛋白编码基因的1％。     

微小RNA在基因表达调控中的作用研究进展

微小RNA是近年来在多种真核生物及病毒中发现的一类长度为19-26nt(或bp)、具有基因表达调控作用的单链或双链RNA分子。目前已发现的微小RNA分子包括siRNA、miRNA以及新近发现的调节性小RNA(small modulatory RNA，smRNA)。它们具有基因表达调控等重要作用，因而受到了较为广泛的关注。本文对3种微小RNA在基因表达调控方面的作用作一综述。     

HOXC基因簇在造血干/祖细胞中的表达及与肿瘤的关系

同源盒(homeobox,HOX)基因最初由Mcginnis等~([1])在果蝇(Drosophila melanogaster)中发现,存在于从酵母到人类的几乎所有真核细胞中,属于发育基因.哺乳动物的HOX基因是决定发育的主控基因(master control gene),在转录及翻译的不同阶段行使特定的表达调控功能~([2]).本文就HOX基因C簇(又称HOXC基因簇)的研究进展进行综述.     

应激诱导的MicroRNAs调控作用研究进展

MicroRNAs是一种内源性的长约22个核苷酸的非编码RNA.近年的研究发现miRNAs不仅参与了细胞发育、增殖、凋亡、分化等几乎所有的生理过程,而且在疾病发生,细胞对外界刺激的响应等病理过程中发挥着重要作用.外界刺激影响miRNAs的表达,miRNAs通过调控靶基因的表达对外界刺激作出响应.本文就miRNAs研究最新进展及miRNAs在各种应激中的调控作用作一综述,并对miRNAs在航天医学中的研究及应用进行了分析与展望.     

循环miRNA在肿瘤诊治中的研究进展

微小RNAs（microRNAs,miRNAs）是一类内源性非编码小分子RNA,通过降解或抑制靶mRNA翻译,在转录后水平调节基因表达,广泛参与细胞分化、增殖、生长、凋亡等生理过程。近年来．存对多种肿瘤类型miRNA表达谱分析研究中发现miRNA的组织特异性和发育阶段特异性表达有助丁对疾病进行分类、诊断、分期和预后判断。最近,研究发现循环血液中存在稳定的miRNA分子,且肿瘤患者的循环核酸中存在源自肿瘤的miRNA分子,不同的肿瘤类型盛肿瘤的不同亚型都有不同的miRNA表达模式。这一发现开启了使用循环miRNA作为无创诊断肿瘤的新思路。     

内含子miRNA反馈调节宿主基因的表达与功能研究进展

miRNA是近年来发现的一类重要的基因表达调控因子。研究发现,许多miRNA位于编码蛋白基因（宿主基因）的内含子中,称为内含子miRNA。现有的证据表明,大多数内含子miRNA和它们的宿主基因表达一致,提示这些内含子miRNA参与宿主基因在功能和表达上的调控,本文就这方面的最新研究进展做一综述。     

心房颤动患者循环microRNAs表达谱的初步研究

目的 利用microRNA(miRNA)芯片研究持续性和阵发性心房颤动(房颤)患者循环miRNAs表达谱的改变,为进一步探讨miRNA对房颤的调控机制提供依据.方法 解放军总医院心内科2010年11月-2011年2月持续性房颤患者、阵发性房颤患者和健康对照者各5例,取其全血标本,提取血清总RNA,采用microRNA芯片进行杂交,得到miRNA表达谱,通过Volcano Plot方法寻找差异表达的miRNAs,并采用MEV软件进行聚类分析.结果 和健康对照者相比,阵发性和持续性房颤患者血清中表达都有明显差异的miRNA共有13个,其中表达上调的有8个:miR-3169,miR-3612,miR-634,miR-376a,miR-517b,miR-377*,miR-590-3p,miR-664;表达下调的有5个:miR-1,kshv-miR-K12-5,miR-378c,miR-204,miR-27a.阵发性房颤和持续性房颤患者间miRNA的表达谱也有显著差异.结论 持续性和阵发性房颤患者循环miRNAs表达谱有显著改变,提示循环miRNAs可用于房颤发生和发展过程中调控机制的研究.     

60Co γ射线照射致小鼠肝脏的miRNAs表达改变

目的 应用miRNA芯片筛选4 Gy60Co γ射线照射后小鼠肝脏中差异表达的miRNAs,生物信息学方法探索差异表达miRNAs调控的主要功能.方法 SPF级C57BL/6J小鼠接受4 Gy60Co γ射线单次全身照射后,进行外周血白细胞计数和骨髓嗜多染红细胞微核计数.应用miRNA芯片筛选照射后小鼠肝脏中差异表达的miRNAs,用miRNA特异引物对部分差异表达miRNA进行实时定量PCR(real time PCR)验证.运用生物信息学方法,对差异miRNAs靶基因及调控功能进行预测.结果 4 Gyγ射线照射后,外周血白细胞总数与对照组相比显著减少(t=2.87,P＜0.05),而骨髓嗜多染红细胞微核率与对照组相比显著增加(t=-2.91,P＜0.05).miRNA芯片结果显示,照射组与对照组差异表达的miRNAs共17个,其中9个表达上调,8个表达下调.miR-124和miR-34a的实时荧光定量RT-PCR验证结果与芯片结果一致.GO分析发现,与黏附、细胞周期相关的通路被抑制,一些免疫相关通路被激活.结论 miR-34a和miR-194参与了急性辐射损伤的调控,起主要调控作用的miRNAs还有miR-124、miR-382和miR-92a*.

Abstract：

Objective To investigate the differential expression profiles of microRNAs in the liver of 60Co γ-ray irradiated mice using microRNA microarray and to explore their main functions by bioinformatic analysis.Methods After SPF C57BL/6J mice expose to 4 Gy-single whole body radiation,total number of peripheral WBC and the fMNPCE were measured at 3 d.The differentially expressed miRNAs in mouse liver were detected with miRNA microarray,miRNA-124 and miR-34a were confirmed by real time RT-PCR assay.Bioinformatic analysis was applied to explore target genes and the main functions of the differential expressed miRNAs.Results Compared with control group,the total number of peripheral WBC decreased( t = 2.87,P ＜ 0.05 ) ,while the fMNPCE in bone marrow increased ( t =-2.91,P ＜0.05) after 4 Gy γ-ray irradiation.miRNA microarray revealed that 17 miRNAs were differentially expressed,in which 9 up-regulated,8 down-regulated.The expression levels of miR-124 and miR-34a were coincident with the result of real time RT-PCR.GO analysis showed that some pathways including adherens junction and cell cycle were suppressed,while some immune-related pathways were activated.Conclusions miR-34a and miR-194 were involved in the regulation of acute radiation damage,some other miRNAs including miR-124、miR-382 and miR-92a* also played important roles in radiation process.     

模拟失重下小鼠成骨细胞功能相关miRNA生物信息学预测

目的 应用生物信息学方法预测模拟失重环境下与小鼠成骨细胞功能变化相关的miRNAs.方法 收集并整理已报道的针对模拟失重环境下小鼠成骨细胞内mRNAs表达变化的基因芯片检测数据,分析差异表达显著的mRNAs,搜集其基因组定位信息;在miRBase数据库中查找处于这些基因组位置上的内含子miRNAs,并应用靶基因预测、GO富集分析和KEGG pathway富集分析进行后续miRNA功能预测.结果 鉴定出5种与宿主mRNA共处同一转录单元的潜在内含子miRNAs.结论 预测出的5种内含子miRNAs在模拟失重环境所致成骨细胞功能变化中具有潜在调控作用,为进一步实验研究提供数据支持和理论指导.     

血清miRNA与肺癌的诊断及预后进展

肺癌是目前我国及全世界发病率最高的恶性肿瘤,同样也是导致死亡人数最多的恶性肿瘤.Mi-croRNAs(miRNAs)是一类长度为18至24个核苷酸组成的短链非编码单链RNA,参与了人体内60％以上基因表达和细胞内绝大部分信号通路的调控,在恶性肿瘤的发生发展过程持续扮演着重要角色,同时miRNA也被证实其循环浓度可用于恶...     

微小RNAs在分子放射生物学中的研究进展

微小RNAs (miRNAs)是一类新近发现的能调节基因表达的短小非编码RNA.miRNAs通过负性调节靶基因,在辐射诱导的凋亡、辐射耐受性、旁观者效应等辐射反应中起重要作用.越来越多的证据表明,miRNAs与放射治疗所致的辐射生物效应相关.miRNAs有可能成为改善放射治疗肿瘤疗效的潜在新靶点.     

基于转录组测序筛选和田羊毛囊周期性变化过程中差异表达miRNAs以及初步分析

为了探讨miRNAs在和田羊毛囊周期性变化中皮肤组织的表达差异,同时预测其在和田羊毛囊周期性变化过程中发挥的潜在功能.本研究选取和田羊毛囊周期性变化的生长期(P1、5月份、n=3)、退行期(P2、10月份、n=3)以及休止期(P3、次年1月份、n=3)的皮肤毛囊组织为材料进行转录组测序和分析.结果共鉴定了143个已知miRNAs并预测了759个新miRNAs,显示相较于P1组,P2组共鉴定了173个显著差异表达miRNAs,其中包含7个显著上调的miRNAs与166个显著下调的miRNAs;而在P3组中鉴定了243个差异表达miRNAs,其中包含28个显著上调的miRNAs与215个显著下调的miRNAs;相较于P2组,P3组共鉴定了71个显著差异表达miRNAs,其中包含23个显著上调的miRNAs与48个显著下调的miRNAs.针对差异表达miRNAs进行靶基因预测和功能分析,发现靶基因显著富集在与毛囊发育相关的激素水平调节、细胞分解代谢、周期蛋白结合、骨细胞发育等GO条目中以及与毛囊发育相关的AMPK、Hedgehog、TNF等信号通路中.在和田羊毛囊周期性变化过程中差异表达miRNAs可能通过以上通路调控靶基因的表达进而参与和田羊毛囊的周期性变化过程.     

人类管家基因和非管家基因microRNA绑定密度的比较及与3′UTR进化保守性关系的分析

目的：该研究从整体水平比较microRNA（miRNA）对管家基因和非管家基因的调控差异并研究3′UTR的进化保守性与miRNA对两类基因调控差异之间的相关性。方法通过对3个基于序列的miRNA靶基因预测软件整合分析,并结合基于miRNA-靶基因的表达谱数据相关性分析,以获得miRNA对两类基因的调控情况,同时利用phastCons保守性分值对两类基因的3′UTR区域进行多物种进化分析。结果研究发现miRNA在管家基因的3′UTR上有显著地高密度绑定,管家基因的3′UTR区域具有相对较高的序列保守性。结论该研究结果突出了miRNA对管家基因表达调控的重要作用,对于重新理解miRNA对真核生物基因表达调控作用具有一定的参考价值。     

电离辐射诱发的非编码小分子RNA改变

非编码小分子RNA(microRNA,miRNA)是近年来发现的一类普遍存在于动植物体内的非编码单链小分子RNA,长约19～25 nt,其通过碱基互补配对的方式作用于靶mRNA,导致靶mRNA降解或转录后翻译受抑[1].miRNA掌握真核细胞许多功能,影响基因表达、细胞周期调控和个体发育等多种行为[2].大量研究表明,miRNA与肿瘤的形成有密切的关系[3-4].细胞中miRNA的表达受多种环境因素的影响[5],电离辐射作为一种外界的损伤因素,能直接穿透组织细胞,将能量沉积在细胞中,对细胞造成损伤,是诱发肿瘤的重要因素.本文对电离辐射引起miRNA的表达改变作一综述,探讨miRNA在辐射致癌及肿瘤放射治疗中的功能研究.     

电离辐射诱发的非编码小分子RNA改变

非编码小分子RNA(microRNA,miRNA)是近年来发现的一类普遍存在于动植物体内的非编码单链小分子RNA,长约19～25 nt,其通过碱基互补配对的方式作用于靶mRNA,导致靶mRNA降解或转录后翻译受抑[1].miRNA掌握真核细胞许多功能,影响基因表达、细胞周期调控和个体发育等多种行为[2].大量研究表明,miRNA与肿瘤的形成有密切的关系[3-4].细胞中miRNA的表达受多种环境因素的影响[5],电离辐射作为一种外界的损伤因素,能直接穿透组织细胞,将能量沉积在细胞中,对细胞造成损伤,是诱发肿瘤的重要因素.本文对电离辐射引起miRNA的表达改变作一综述,探讨miRNA在辐射致癌及肿瘤放射治疗中的功能研究.     

电离辐射诱发的非编码小分子RNA改变

非编码小分子RNA(microRNA,miRNA)是近年来发现的一类普遍存在于动植物体内的非编码单链小分子RNA,长约19～25 nt,其通过碱基互补配对的方式作用于靶mRNA,导致靶mRNA降解或转录后翻译受抑[1].miRNA掌握真核细胞许多功能,影响基因表达、细胞周期调控和个体发育等多种行为[2].大量研究表明,miRNA与肿瘤的形成有密切的关系[3-4].细胞中miRNA的表达受多种环境因素的影响[5],电离辐射作为一种外界的损伤因素,能直接穿透组织细胞,将能量沉积在细胞中,对细胞造成损伤,是诱发肿瘤的重要因素.本文对电离辐射引起miRNA的表达改变作一综述,探讨miRNA在辐射致癌及肿瘤放射治疗中的功能研究.     

模拟失重下氧化应激对EA.hy926细胞miRNA表达谱的影响及生物信息学分析

目的探索模拟失重条件下EA.hy926细胞氧化应激后microRNAs(miRNAs)表达谱的变化及生物学意义。方法 EA.hy926细胞分为对照组(Con组)、对照氧化应激组(Con+H2O2)、模拟失重组(MG组)和模拟失重后氧化应激组(MG+H2O2),采用Illumina HiSeq 2500平台开展miRNAs测序并筛选差异表达miRNAs。筛选出的miRNAs以qRT-PCR进行验证,对验证具有显著差异表达的miRNAs进行靶基因预测、靶基因Gene Ontology(GO)功能富集分析、KEGG信号通路分析以及STRING蛋白互作分析。结果模拟失重下氧化应激导致EA.hy926细胞内miRNAs表达谱发生改变。qRT-PCR结果显示,与Con+H2O2组相比,MG+H2O2组细胞内hsa-miR-29b-3p、hsa-miR-200c-3p表达增加,与miRNA测序结果一致。GO及KEGG通路显著性富集分析结果显示,hsa-miR-29b-3p靶基因显著富集于细胞外基质等生物学过程及局部黏附信号通路,hsa-miR-200c-3p靶基因显著富集于调控细胞代谢过程等生物学过程及miRNA癌症通路等信号通路。蛋白互作分析结果表明,hsa-miR-29b-3p靶基因中COL家族蛋白处于互作关键位置,hsa-miR-200c-3p靶基因中RHOA处于互作关键位置。结论模拟失重下氧化应激可导致EA.hy926细胞miRNAs表达出现显著差异,其中hsa-miR-29b-3p和hsa-miR-200c-3p可通过对靶基因及其信号通路调节对内皮细胞功能发挥调控作用。     

miRNA参与的动物发育调控研究进展

动物的发育是一个严格受控的复杂过程,需要在时空上精确控制相关基因的表达.miRNA通过抑制靶mRNA翻译或使之降解失稳从而在转录后降低基因的活性.近期的实验研究表明,miRNA在动物发育的诸多方面发挥着重要调控功能,并表现出特有的调控模式.本文对miRNA参与动物发育过程的调控研究进行了综述.     

miRNA分子miR-24的研究进展

mRNA又称microRNA、微小RNA,是一类22个碱基左右的非编码单链小分子RNA,最初于1993年由研究人员在研究果蝇发育的时序性调控过程中发现.最先发现的miRNA为lin-4和let-7,最近十多年来,越来越多的miRNA被发现[1-2].