树突状细胞MicroRNA表达谱在HBsAg刺激后的变化

目的 建立HBsAg刺激树突状细胞(DC)前后microRNA (miRNA)表达的差异谱,为研究miRNA在乙型肝炎病毒感染的免疫机制中的作用提供理论基础.方法 体外培养原代DC,分别用HBsAg、LPS、TNFα刺激24 h后提取细胞总RNA,利用基因芯片技术进行比较,筛选出HBsAg刺激后差异表达显著的miRNA,利用计算机软件技术进行靶基因初步预测.结果 HBsAg刺激前后miRNA差异表达2倍以上者共30个,其中16个上调,14个下调.三个不同刺激组间miRNA差异谱存在不同差异.筛选出的靶基因中包含DC信号通路的相关成分.结论 HBsAg刺激DC后的miRNA表达谱的变化存在特异性;靶基因的初步筛选结果进一步提示了miRNA在乙型肝炎病毒感染的免疫机制中可能起着重要作用.     

MiR-106b-5p调控老年骨质疏松性骨折的分子网络

背景:骨质疏松性骨折是与年龄有关的疾病,由于人口老龄化,其发病率和患病率不断上升。目的:鉴定miRNA与老年骨质疏松性骨折有关。方法:通过limma包分析GSE93883中骨质疏松性骨折相关的差异表达miRNA;通过RAID数据库预测差异表达miRNA的靶标基因,并通过PPI(蛋白质-蛋白质相互作用)网络识别关键miRNA及靶标基因;富集分析识别靶标基因参与的生物功能和信号通路。最后,收集5例老年骨质疏松性骨折和5例老年非骨质疏松性骨折患者的骨组织,利用qPCR和Western blot验证关键miRNA及信号通路。结果与结论:(1)共获得21个骨质疏松性骨折相关的差异表达miRNA并预测得到530个靶标基因;通过PPI网络鉴定miR-106b-5p为关键调控基因,其靶标基因主要与MAPK活性的激活等生物功能以及PI3K-Akt和转化生长因子β信号通路相关;(2)qPCR结果验证了miR-106b-5p在老年骨质疏松性骨折骨组织中的表达较对照骨组织显著下调(P <0.05);Western blot结果显示PI3K-Akt和转化生长因子β信号通路在老年骨质疏松性骨折中被激活;(3...     

微小RNA在肿瘤侵袭转移中的作用

微小RNA(miRNA)是一类长度为19-25个核苷酸对的非编码小分子RNA,通过与靶 mRNA互补配对而在转录水平上对基因的表达进行负调控.实验表明miRNA可通过调控其靶基因参与的信号通路,影响肿瘤的发生、发展和转移,发挥着类似原癌基因或抑癌基因的功能.因此研究miRNA在肿瘤侵袭转移调控中的作用有着重要意义.     

miRNA-519a在子宫内膜癌中的诊断及预后价值及机制探寻

目的利用TCGA数据库探寻miRNA-519a在子宫内膜癌中的诊断及预后价值及机制。方法通过对TCGA数据库中UCEC数据进行差异表达和生存分析,挑选出肿瘤组织中显著高表达且高表达提示预后不良的miRNA,并对该miRNA的靶基因进行富集分析,将富集出的关键通路中的mRNA与UCEC组织中低表达的mRNA交集,找出miRNA在UCEC中的靶基因和通路,并进一步利用双荧光素酶报告基因分析检测miRNA与靶基因mRNA的靶向结合进而调控其功能。结果TCGA-UCEC数据库中癌旁组织和癌组织存在不同miRNA差异表达,共148个miRNA上调,75个miRNA下调(|logFC|>2);进一步对差异表达miRNA进行预后分析发现,和正常组织相比,miRNA-519a在UCEC组织中显著高表达,且高表达的患者预后不良;通过mirDB数据库预测miRNA-519a靶基因(共685个),并用DAVID数据库将这些mRNA进行KEGG-PATHWAY富集分析,发现miRNA-519a的靶基因富集于肿瘤相关通路,且该通路相关基因中PDGFRA和TGFBR2在UCEC组织中显著低表达;双荧光素酶报告基因分析证明,miRNA-519a可与PDGFRA和TGFBR2 mRNA的3'-UTR直接结合并抑制两者的表达。结论miRNA-519a能够作为UCEC诊断和预后的生物标志物,miRNA-519a通过调控PDGFRA和TGFBR2的表达进而调控肿瘤的进程。     

蜂胶黄酮PB3A作用下结肠癌细胞株中miRNA-198和miRNA-296-5p的表达及功能预测

目的:探讨蜂胶黄酮短叶松素-3-乙酸酯(pinobanksin-3-acetate,PB3A)对结肠癌SW480细胞微小RNA(microRNA,miRNA)表达谱的影响,为结肠癌的治疗及靶向药物研发提供理论依据。方法:使用miRNA芯片技术分析检测蜂胶黄酮PB3A处理人类结肠癌SW480细胞后miRNA表达谱的变化。通过实时荧光定量PCR方法检测miRNA-198和miRNA-296-5p的表达水平,以此来验证miRNA芯片结果的准确性和可靠性。利用miRWalk、Micro T、miRanda等12个网上数据库预测这2条miRNAs的靶基因并进行靶基因功能富集分析。结果:miRNA芯片分析结果显示,蜂胶黄酮PB3A干预24 h后结肠癌SW480细胞中差异表达倍数在2倍及以上的miRNA有267条,其中差异表达倍数达10倍及以上的miRNA有30条,28条为上调表达,2条下调表达;RT-qPCR实验结果显示miRNA-198和miRNA-296-5p的表达量趋势跟miRNA芯片结果一致,表达差异有统计学意义(P0.05)。miRNA靶基因预测发现miRNA-198有859个靶基因,miRNA-296-5p有906个靶基因;对这些可能被调控的靶基因进行Gene Class分析,结果显示miRNA-198和miRNA-296-5p的靶基因功能主要为转录因子、拷贝数变异、细胞分化、癌基因、蛋白激酶、组蛋白、转移癌基因、肿瘤抑制基因等(P0.05)。信号通路富集分析结果显示,miRNA-198靶基因显著富集于肿瘤通路、Wnt信号通路、胞吞通路、Erb B信号通路、黏着斑通路、黑素生成通路等信号通路,而miRNA-296-5p靶基因在MAPK信号通路、胞吞通路、轴突导向通路、Wnt信号通路、胰岛素信号通路、钙离子信号通路等信号通路中出现聚集(P0.05)。结论:蜂胶黄酮PB3A影响结肠癌SW480细胞的miRNA表达谱。PB3A作用下miRNA-198和miRNA-296-5p的异常表达可能参与PB3A抗结肠癌的过程。     

MicroRNA在类风湿关节炎中的作用

MicroRNA(miRNA)是一类新型保守的非编码单链小分子RNA,能够在转录后水平调节mRNA表达导致蛋白翻译抑制或促进靶mRNA降解.到目前为止,在生物界已发现5000多种miRNA,在miRBase所登记的miRNA数据库中仅人类就有千余种,预计人类有超过30％的蛋白编码基因受miRNA调控.免疫细胞中表达多种miRNA,对固有免疫和适应性免疫的分子通路和细胞分化及功能有广泛的影响,其表达失调将导致免疫相关的疾病(如类风湿关节炎),因此研究miRNA对诊断各种疾病类型及预后有潜在临床应用价值.     

MicroRNA-338-3p在肿瘤中的研究进展

微小RNA(microRNA,miRNA)是一种广泛分布于身体各个器官的短链非编码RNA.miRNA可广泛调控基因,通过基因调控控制细胞的生长、分化、增殖以及凋亡等,在正常的细胞生命活动中起着重要作用.随着近年来肿瘤发病率的日益增高,miRNA与肿瘤的关系正成为研究热点,其可作为肿瘤诊断、治疗及预后的标志物.多项研究证实miR-338-3p在多种实质瘤中的表达降低.进一步的研究显示,miR-338-3p可抑制肿瘤基因,通过调控肿瘤基因以及相关信号通路等一系列方式影响肿瘤的进展以及诊断预后.越来越多的证据显示miR-338-3p可作为一种新颖的肿瘤生物标志物,并且有可能成为新的治疗靶点.     

基于microRNA差异表达探讨恶性纤维组织细胞瘤致病机制

目的 应用芯片表达分析技术探讨miRNA在恶性纤维组织细胞瘤发病机制中的作用.方法 利用miRCURYTM LNA miRNA表达谱芯片技术高通量筛选NMFH1与MSC、HSF、MRC-5和HT-1080细胞系差异表达miRNA,筛选靶基因,分析调控作用机制.结果 筛查NMFH1与4种对照组细胞系差异表达miRNA,选取与所有正常样本对比均下调miR-222、miR-186及miR-933,均上调miR-886-3p、miR-886-5p、miR-183、miR-340及miR-BART7进行qRT-PCR实验,验证芯片数据可靠性.基于生物信息学方法挖掘miRNA靶基因,构建基因调控网络,基于功能组注释信息分析NMFH1风险疾病基因及通路,揭示MFH恶性病变机制.结论 miRNA在肿瘤样本与正常细胞系间显著差异表达,是参与MFH发生发展过程的重要调控因子,发挥负调控基因表达作用,使肿瘤细胞逃避正常生长调控机制,无限增殖和转移,出现恶性表型.     

microRNA在系统性红斑狼疮中的作用及其机制的研究进展北大核心CSCD

系统性红斑狼疮(SLE)病因未明、发病机制复杂。microRNA(miRNA)是一类非编码RNA分子,通过与靶基因mRNA3'UTR相互作用,使靶基因mRNA降解或翻译抑制,作为转录后基因沉默的调控分子,miRNA调控的免疫细胞发育和功能异常与自身免疫病相关。研究证实多种miRNA与SLE发病及免疫功能异常密切相关,在SLE患者中表达上调或下调并与疾病活动度相关。研究表明miRNA可能通过以下方式参与SLE发病:1型干扰素通路;异常的炎性因子分泌;DNA低甲基化和组织炎症等。本文综述了miRNA与SLE发病之间的关系及作用机制研究进展。     

microRNA在系统性红斑狼疮中的作用及其机制的研究进展

系统性红斑狼疮(SLE)病因未明、发病机制复杂。microRNA(miRNA)是一类非编码RNA分子,通过与靶基因mRNA3'UTR相互作用,使靶基因mRNA降解或翻译抑制,作为转录后基因沉默的调控分子,miRNA调控的免疫细胞发育和功能异常与自身免疫病相关。研究证实多种miRNA与SLE发病及免疫功能异常密切相关,在SLE患者中表达上调或下调并与疾病活动度相关。研究表明miRNA可能通过以下方式参与SLE发病:1型干扰素通路;异常的炎性因子分泌;DNA低甲基化和组织炎症等。本文综述了miRNA与SLE发病之间的关系及作用机制研究进展。