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1.
幽门螺杆菌cagA基因3’端多态性分析及其临床意义   总被引:2,自引:0,他引:2  
目的探讨幽门螺杆菌(H.pylon)eagA基因3’端多态性及其与临床疾病的相关性。方法收集NCBI网络数据库H.pylorieagA基因全序列95条,eagA基因3’端可变区碱基、氨基酸序列387条,用Vector NTI advance 10软件对已知疾病背景的256条网络数据库eagA氨基酸序列进行多序列比较,分析eagA基因3’端序列特征及其与临床疾病的相关性。结果(1)91条eagA基因全长氨基酸序列之间相同氨基酸百分比为27%,相似性较低;其3’端序列之间差异明显,存在大量氨基酸的插入、缺失、替换外和重复,而5’端序列相对保守。(2)eagA基因3’端氨基酸序列含有六种重复序列,分别命名为C1,C2,C3,C4,C5,C6;其中C3,C4,C6可分为两种类型,东亚型(Cn东)和西方型(Cn西)。大部分(81.86%)eagA基因3’端氨基酸序列基本结构为C1—C2-C1-C3东/C3西-C4东/C西-C5-C1-C6东/C6西。少数菌株eagA基因3’端氨基酸序列长度较长,具有不同的重复序列数目及组合方式,根据其重复序列数目及组合方式不同,可将这少数菌株eagA基因3’端氨基酸序列分为10型,其中1、7、9、10型仅存在于西方来源菌株,2、3、5、8型仅存在于东方来源菌株,4、6型为东西方菌株共有类型。(3)〉4个EPIYA模体的菌株检出率在萎缩性胃炎组(11.90%)与消化性溃疡(PU)组(1.27%)比较差异有统计学意义(P〈’0.05),且含有4个以上EPIYA模体的菌株87.5%是在萎缩性胃炎及胃癌(GU)中检出。含多个EPIYA—C/D位点的菌株在胃癌患者中的检出率(16.67%)显著高于消化性溃疡(5.06%)患者(P〈0.05)。c4数目=3时,GC组(14.81%)与Pu组(2.53%)比较差异有统计学意义(P〈0.05),其余重复序列数目在不同胃十二指肠疾病中无统计学意义(P〉0.05)。第6型菌株在胃癌患者中的检出率(14.81%)显著高于消化性溃疡(2.53%)患者(P〈0.05)。结论(1)且pylori菌株casA基因3’可变区多态性明显,其差异主要由重复序列的种类、数目和组合方式造成。(2)感染〉4个EPIYA模体的CagA+H.pylori可能与萎缩性胃炎及胃癌有关。(3)含多个EPIYA—C/D位点的CagA+H.pylori及第6型CagA+H.pylori可能与胃癌有关。  相似文献   

2.
目的:探讨上海地区人群杆菌(H.pylori)cagA基因3’区和vacA基因的多态性及其临床意义。方法:99株H.pylori菌株分离自17例慢性浅表性胃炎(CSG)、21例慢性萎缩性胃炎(CAG)、19例胃溃疡(GU)、23例十二指肠溃疡(DU)和19例胃癌(GC)患者。用聚合酶链反应(PCR)技术对H.pylori菌株的cagA基因3’区和vacA基因基因信号序列及中间区等位基因进行扩增和检  相似文献   

3.
幽门螺杆菌(Helicobacterpylori,Hp)是慢性胃炎的重要病因,与消化性溃疡发生和复发密切相关,并与胃癌相关。1994年WHO/IARC会议将Hp确定为Ⅰ类致癌原[1],但Hp确切的致癌因子及致癌机制尚不明了。Hp的毒力因子我括运动力(鞭毛)、粘附力(粘附素)、尿素酶活性、脂多糖内毒素样活性物质、蛋白分解酶及磷脂酶A等,这些毒力因子为所有的Hp具有。但另外两种毒力因子只存在于50%-60%的Hp中,所以越来越受人们的关注:它们是分子量为90kDa(Mr90000)的细胞空泡毒素(Vacuolatingcytotoxin…  相似文献   

4.
幽门螺杆菌cagA基因与致病性的研究   总被引:5,自引:1,他引:5  
1材料和方法1.1材料1997/1998我校附属医院消化科门诊和住院部患者.通过临床和内镜镜检诊断为十二指肠溃疡病(DU)24例,胃溃疡病(GU)19例,慢性胃窦胃炎(GI)39例,无明显病变者20例.年龄21岁~69岁,男女比例相当.1.2方法①H...  相似文献   

5.
具有cagA,vacA基因的幽门螺杆菌与胃肠疾病   总被引:7,自引:0,他引:7  
Hp感染后可导致不同的临床及病理结果,受感染者可形成慢性胃炎,胃或十二指肠球部溃疡、甚至胃癌。造成上述不同结果的机制尚不清楚。近年随着分子生物学技术的发展及应用,认为Hp菌株中cagA、vacA基因的存在与表达可能与上述结果的形成有关。本文就cagA、vacA基因的检测及其在胃肠疾病中的致病作用作一综述。  相似文献   

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7.
吴莺  张尤历 《胃肠病学》2007,12(4):249-251
细胞毒素相关基因A(cagA)编码CagA蛋白,是研究最多的幽门螺杆菌(H.pylori)基因之一。CagA蛋白经由Ⅳ型分泌系统进入Hpylori黏附的胃上皮细胞,其C-端发生酪氨酸磷酸化,磷酸化的CagA可引起细胞骨架重排、诱导细胞发生形态学变化、增强细胞动力,造成细胞异常运动和增殖.最终导致癌变。因此cagA阳性H.pylori菌株较cagA阴性菌株毒力更强。cagA基因3’端可变区重复序列数目的差异造成了cogA基因结构的多态性以及CagA蛋白大小、功能和细菌毒力(致病性)的差异。因此,cagA基因3’端可变区及其蛋白的EPIYA基序与H.pylori感染临床结果的相关性,成为目前H.pylori研究的热点之一。  相似文献   

8.
目的:探讨上海地区人群中幽门螺杆菌(H.Pylori)cagA基因3′区和vacA基因的多态性及其临床意义.方法:99株H.pylori菌株分离自17例慢性浅表性胃炎(CSG)、21例慢性萎缩性胃炎(CAG)、19例胃溃疡(GU)、23例十二指肠溃疡(DU)和19例胃癌(GC)患者.用聚合酶链反应(PCR)技术对H.Pylori菌株的cagA基因3′区和vacA基因信号序列及中间区等位基因进行扩增和检测.结果:99株H.Pylori菌株中84株(84.8%)cagA基因阳性,其3′区产物大小均约650 bp,属A型.vacA基因信号序列仅检出s1a型,见于从94.1%(16/17)的CSG、95.2%(20/21)的CAG、89.5%(17/19)的GU、87.0%(20/23)的DU和89.5%(17/19)的GC患者中分离的菌株(P=0.87);中间区等位基因仅检出m2型,见于从70.6%(12/17)的CSG、71.4%(15/21)的CAG、63.2%(12/19)的GU、73.9%(17/23)的DU和57.9%(11/19)的GC患者中分离的菌株(P=0.72).结论:上海地区人群中H.Pylori菌株的cagA基因3′区相对保守;绝大多数vacA基因属s1a/m2型.本研究结果不支持这些基因的多态性与H.Pylori感染临床结局相关的观点.  相似文献   

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10.
目的: 研究幽门螺杆菌( H pylori) cagA、iceA基因及其不同组合对H pylori感染结局的影响, 探讨西安地区H pylori的优势致病基因型.方法: 用快速尿素酶试验(rapid urease test,RUT)筛选出H pylori阳性胃黏膜标本101例,细菌基因组DNA提取试剂盒提取DNA, 用聚合酶链反应(PCR)扩增尿素酶C( ureC)基因的方法筛选出H pylori阳性标本91例. 经PCR及琼脂糖凝胶电泳对cagA, iceA的基因亚型进行检测, 用χ2检验以及Fisher精确检验分析各基因及其不同组合与疾病的相关性.结果: cagA基因的阳性率为79.1%, iceA的总检出率为75.82%, 其中iceA1为50.5%, iceA2为38.5%, cagA+/ iceA1+的检出率高于其他组,单一基因及其不同组合在各疾病组中分布没有显著差异. iceA与cagA存在相关性. iceA2分别发现有229、334、439、549 bp以及229bp+334 bp的基因片段.结论: cagA+/ iceA1+是西安地区H pylori的优势致病基因型, cagA、iceA1、iceA2各单一基因以及其不同组合与感染的临床结局无关. iceA与cagA基因可能存在协同作用, 该地区iceA2基因有较大的变异性.  相似文献   

11.
目的建立竞争性定量 PCR 检测幽门螺杆菌 cagA 基因的方法。方法以重组 PCR 将乳糖操纵子中 Lac 阻抑蛋白特异性结合序列(21bp)重组入 cagA 基因397bp 的片段中构建内参标模援(rfcagA)。体外克隆并表达具有双功能的 GST-LacI 融合蛋白,其一端只有 GST 酶活性,另一端可特异性地与重组内参标模板结合。在定量 PCR 中,以 rfcagA 为内参标模板,pMC3 或 Hp 基因组 cagA 作为竞争性模板,PCR 产物的5′-端标记了生物素,可与包被了亲和素的微孔板结合,只有 rfcagA 的 PCR 产物可与融合蛋白结合而显色。结果 GST 底物的显色程度与样本的 ca-gA 含量呈负相关,当反应体系中的起始模板量为10-10~5拷贝,循环次数小于等于20次。原始模板数以指数方式增长,并建立了原始模板的考贝数与 A_(340)值同的标准曲线。用该方法检测12份已知菌株中的 cagA 含量,8份 cagA 阳性,cagA 基因的拷贝数为6.3×10~(10)-2.14×10~(11)/L,特异性为100%,敏感度达可检出 cagA 基因2倍的差别。结论这是一个特异、敏感及很实用的定量检测 cagA 基因的方法。  相似文献   

12.
具有cagA基因的幽门螺杆菌感染与胃十二指肠粘膜损伤的关系张小勇,张红杰,赵志泉作者单位,210029南京医科大学第一附属医院消化科幽门螺杆菌(Helicobacterpylo-ri,Hp)是慢性胃炎和消化性溃疡的重要致病因素之一,并与胃癌的发生密切...  相似文献   

13.
目的:分析广东地区细胞毒素相关基因(cagA)在幽门螺杆菌(H.pylori)中的分布情况及其与患者性别、年龄的关系;探讨H.pylori cagA在不同胃肠疾病发生中的作用及其与胃粘膜慢性炎症程度及H.pylori定植密度的关系。方法:采用改良Skirrow培养基分离培养得到191株H.pylori,用特定引物对各株细菌的cagA 3′端行聚合酶链反应(PCR)扩增鉴定;对其中83例患者再各取胃窦粘膜2块,经HE及Giemsa染色后观察胃粘膜慢性炎症程度及H.pylori定植密度。结果:广东地区H.pylori cagA阳性者占85.3%(163/191);H.pylori cagA阳性率与患者的性别、年龄无关;消化性溃疡及胃癌患者的H.pylori cagA阳性率显著高于慢性胃炎患者;cagA阳性H.pylori菌株在胃粘膜表面的定植密度较cagA阴性菌株更高,引起的胃粘膜慢性炎症也更为严重;H.pylori的定植密度与其引起的慢性炎症程度呈正相关。结论:广东地区cagA阳性H.pylori感染者占绝大多数;cagA阳性菌株较cagA阴性菌株具有更强的致病力,可能引起更为严重的胃肠道损害。  相似文献   

14.
15.
幽门螺杆菌(Hp)感染是引起胃、十二指肠疾病的重要病因。Hp感染可持续数十年甚至终生,但是,Hp感染人群大多无症状,只有少数人可致病,这主要是由于Hp菌株间毒力不同所致。含cagA基因(细胞毒素相关蛋白的基因)的菌株,无论表型和基因型都与无cagA基...  相似文献   

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cagA阳性幽门螺杆菌感染与老年胃十二指肠病的相关性   总被引:3,自引:0,他引:3  
目的 探讨老年人幽门螺杆菌 (Hp)cagA基因存在状况及其与老年胃十二指肠病的关系。方法 收集 89例老年和 96例青壮年慢性胃炎、消化性溃疡患者及 3 0例正常人群的血清标本及胃组织标本 ,应用血清学方法检验其Hp cagA阳性菌株感染状况。结果  89例老年患者中慢性胃炎、胃溃疡、十二指肠溃疡的Hp cagA基因的阳性率分别为 73 .5 % ( 3 8/5 2 )、81.3 % ( 13 /16)和85 .7% ( 18/2 1) ;96例青壮年患者中慢性胃炎、胃溃疡、十二指肠溃疡的Hp cagA基因的阳性率分别为 5 9.3 % ( 3 2 /5 4)、68.8% ( 11/16)和 61.5 % ( 16/2 6) ;对照组Hp cagA阳性菌株感染率为 3 3 .3 %。各疾病组间Hp cagA阳性菌株感染率比较无显著性差异 (P >0 .0 5 ) ,但均高于对照组 (P <0 .0 5 ) ;老年组cagA阳性菌株感染率高于青壮年组 (P <0 .0 5 )。结论 老年患者cagA阳性菌株感染与上述 3种胃十二指肠疾病的发生均密切相关 ,老年患者感染的Hp绝大多数为cagA阳性菌株  相似文献   

18.
中国幽门螺杆菌cagA克隆和基因序列分析   总被引:4,自引:5,他引:4  
目的 了解和分析中国幽门螺杆菌( Helicobacter pylori, Hp)菌株细胞毒素相关基因A(cagA) 的核苷酸序列特性.方法 从两位患胃溃疡儿童的胃粘膜中分离两株 Hp 菌株,用PCR方法扩增cagA 基因的5○端和3○端的两个片段并作克隆和序列分析.结果 两株中国 Hp 菌株cagA 基因之间的同源性为94 % ~95 % . 中国Hp 菌株与国外菌株相同区段比较,5○端的同源性为89 % ~92 % ,3○端的同源性为69 % .结论 中国Hp 菌株与国外Hp 菌株cagA 基因5○端序列部分区域的同源性较好,可以作为分子检测 Hp 感染的靶基因序列,而cagA 基因3○端序列部分区域的同源性较差,可以作为Hp 分子流行病学研究的靶基因序列.  相似文献   

19.
目的研究幽门螺杆菌(Helicobecterpylori)cagA、iceA与胃十二指肠疾病的关系及二者的相关性。方法从138例胃黏膜活检组织中分离培养H·pylori,PCR扩增检测cagA、iceA,并测序。结果cagA /iceA1 /iceA2 在消化性溃疡中的阳性率明显高于慢性胃炎和胃癌。cagA、iceA1同时阳性为55·4%(62/112),cagA阴性iceA1阳性为11·5%(3/26),存在统计学差异。cagA、iceA2同时阳性为51·8%(58/112),cagA阴性iceA2阳性为30·8%(8/26),存在统计学差异。结论cagA /iceA1 /iceA2 菌株可能与消化性溃疡的发生、发展相关,cagA和iceA1可能存在协同作用,和iceA2关系不大。  相似文献   

20.
探讨上海地区人群中幽门螺杆菌(H.pylori)cagA基因3’区和vacA基因的多态性及其临床意义。方法:99株H.pylori菌株分离自17例慢性浅表性胃炎(CSG)、21例慢性萎缩性胃炎(CAG)、19例胃溃疡(GU)、23例十二指肠溃疡(DU)和19例胃癌(GC)患者。用聚合酶链反应(PCR)技术对H.pylori菌株的cagA基因3’区和vacA基因信号序列及中间区等位基因进行扩增和检测。结果:99株H.pylori菌株中84株(84.8%)cagA基因阳性,其3’区产物大小均约650bp,属A型。vacA基因信号序列仅检出sla型,见于从94.1%(16/17)的CSG、952%(20/21)的CAG、89.5%(17/19)的GU、87.00(20/23)的DU和89.5%(17/19)的GC患者中分离的菌株(P=0.87);中间区等位基因仅检出m2型,见于从70.6%(12/17)的CSG、71.4%(15/21)的CAG、63.20(12/19)的GU、73.9%(17/23)的DU和57.9%(11/19)的GC患者中分局的菌株(P=0.72)。结论:上海地区人群中H.pylori菌株的cagA基因3’区相对保守;绝大多数vacA基因属sla/m2型。本研究结果不支持这些基因的多态性与H.pylori感染临床结局相关的观点。  相似文献   

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