SLC7 A2作为肝细胞癌新的生物标志物研究

目的:探讨SLC7A2基因作为肝细胞癌(HCC)患者潜在新的生物标志物前景.方法:利用肿瘤基因组图谱(TCGA)数据挖掘SLC7A2在HCC患者中的表达水平.采用Kaplan-Meier法、Cox回归分析法和列线图评价SLC7A2在HCC中的预后价值.结果:与正常肝组织相比,HCC组织SLC7A2表达显著降低(P<0.05).SLC7A2低表达与血清中高AFP水平、血管浸润、残余肿瘤、复发和死亡显著相关(P<0.05).Kaplan-Meier分析表明,SLC7A2的低表达与肝细胞癌的整体生存率(OS)显著相关(P=0.006),与无病生存期(DFI)无显著相关(P=0.09).多因素分析进一步证实SLC7A2低表达是肝细胞癌患者OS的独立指标(P<0.05).HCC中SLC7A2的表达下调基于DNA拷贝缺失和SLC7A2甲基化减少.结论:SLC7A2可作为HCC患者预后新的生物标志物和候选治疗靶点.     

SLC7A11蛋白在小儿肾母细胞瘤中的表达及临床意义

目的 探讨溶质载体家族7成员11(SLC7A11)蛋白在小儿肾母细胞瘤(WT)中的表达情况及其临床意义。方法 选取103例WT患儿作为研究对象。取手术切除的癌组织及癌旁组织，采用免疫组织化学法检测组织中SLC7A11蛋白的表达情况。随访5年并记录WT患儿存活情况。比较癌组织与癌旁组织中SLC7A11蛋白的表达情况，以及不同临床病理特征WT患儿癌组织中SLC7A11蛋白的表达情况。分析癌组织中不同SLC7A11蛋白表达情况的WT患儿的预后差异，以及WT患儿预后的危险因素。结果 WT患儿癌组织中的SLC7A11蛋白阳性表达率高于癌旁组织(P<0.05)。肿瘤直径≥5 cm、肿瘤分期为Ⅲ/Ⅳ期的WT患儿癌组织中SLC7A11蛋白阳性表达率均分别高于肿瘤直径<5 cm、肿瘤分期为Ⅰ/Ⅱ期的WT患儿(均P<0.05)。癌组织中SLC7A11蛋白阳性表达的WT患儿5年生存率低于阴性表达的WT患儿(分别为45.95%、72.41%,P<0.05)。单因素COX回归分析显示，肿瘤直径、肿瘤分期、癌组织中SLC7A11蛋白表达情况均是影响WT患儿预后的因素(均P<0.05)...     

结肠癌中SLC11A1基因的表达及其临床意义

目的:探讨多个结肠癌数据集中SLC11A1的表达情况及其与结肠癌临床预后的关系,以及在结肠癌肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)中的潜在作用。方法:利用肿瘤基因表达图谱(the cancer genome atlas,TCGA)及基因表达汇编(gene expression omnibus,GEO)汇总结肠癌相关数据,分析SLC11A1表达及其与结肠癌临床预后关系,同时使用ESTIMATE算法和单样本基因集富集分析(single-sample gene-set enrichment analysis,ssGSEA)算法,探索SLC11A1与TME中免疫细胞浸润之间的关联。结果:在TCGA、GEO数据集中,SLC11A1表达在肿瘤中增高(P<0.001),其高表达是结肠癌患者总体生存(overall survival,OS)的独立危险因素,且SLC11A1与肿瘤相关巨噬细胞(tumor associated macrophages,TAMs)和M2型巨噬细胞的浸润、聚集密切相关。进一步分析发现,其与CD8+T细胞抑制剂TGFB1和CXCL12及其受体的...     

CD276在泛癌中的免疫表达及预后

目的 探讨CD276在泛癌中的表达和对患者预后的影响及其作用机制。方法 采用TCGA和GTEx数据库分析CD276在肿瘤组织与正常组织中的差异表达，采用R语言分析CD276对泛癌患者预后、肿瘤微环境、肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性的影响，进一步分析肿瘤组织中CD276表达与肿瘤免疫细胞浸润的相关性，采用基因集富集分析（GSEA） CD276的生物学功能，最后采用实时PCR对CD276在肿瘤中的表达进行体外验证。结果 肿瘤组织与正常组织间CD276表达存在统计学差异（P <0.05）。CD276影响肿瘤预后并与肿瘤微环境、肿瘤突变负荷、微卫星不稳定性和肿瘤免疫细胞浸润密切相关。结论 全面的泛癌分析确定CD276是免疫浸润和癌症预后不良的生物标志物，可将其作为新的免疫调节靶点，用于开发新的免疫治疗靶向药物，为肿瘤治疗提供新思路。     

泛癌中CCL18的差异表达、预后及其与免疫细胞浸润的相关性分析

目的 旨在通过多数据库的分析来揭示CCL18在33种癌症类型中的表达、预后及其与免疫细胞浸润的相关性。方法 通过GTEx数据库、CCLE数据库、TCGA数据库综合分析CCL18在泛癌中的表达模式。单因素Cox回归用于分析CCL18在泛癌中的生存和预后。通过TIMER2.0数据库分析CCL18与免疫微环境的关系。分析了CCL18与免疫检查点基因表达谱、DNA错配修复基因(MMRs)和甲基转移酶编码基因的关系。Spearman用于分析CCL18表达水平与肿瘤突变负荷(TMB)和微卫星不稳定性(MSI)的关系。结果 在本研究中，发现CCL18在大多数癌症中异常过表达。CCL18与肿瘤患者的年龄、性别、肿瘤分期和免疫亚型等临床参数密切相关。单因素回归分析表明CCL18表达与患者在ACC、DLBC、LAML、UVM、CESC和LGG中的不良预后密切相关。在大多数癌症中，CCL18的表达与28种免疫细胞亚型、免疫相关通路、肿瘤微环境呈正相关。CCL18与主要组织相容性复合体、免疫激活剂、免疫抑制剂、趋化因子和趋化因子受体相关基因共表达。此外，CCL18与许多癌症中的肿瘤新抗原、肿瘤突变负荷、微卫星...     

铜死亡相关基因SLC31A1在肾细胞癌中的功能及预后价值

目的:探讨铜死亡相关基因SLC31A1在肾细胞癌的表达水平、肿瘤浸润免疫细胞相关性及其对预后的影响，并在体外实验中验证SLC31A1在肾细胞癌中的功能。方法:采用TCGA数据库收集肾细胞癌的临床数据及铜死亡相关基因转录组数据；采用HPA数据库收集蛋白表达数据；采用ssGSEA和Spearman分析计算免疫细胞浸润水平及其与铜死亡相关基因的关系；采用R语言比较肾细胞癌患者不同临床分期中SLC31A1的mRNA表达水平差异；采用Kaplan-Meier(KM)分析探索SLC31A1对肾细胞癌预后的影响；采用COX分析判断SLC31A1是否是独立预后因素；采用RT-qPCR检测SLC31A1 mRNA的表达水平。过表达质粒调控SLC31A1在细胞中的表达后采用克隆形成及划痕实验检测调控SLC31A1后对细胞增殖侵袭能力的影响。结果:铜死亡相关基因FDX1、DLD、DBT、SLC31A1、ATP7A、GCSH、DLST、DLAT、PDHA1、PDHB在肾细胞癌中的mRNA和蛋白水平均低于正常组织(P<0.05)。SLC31A1与17种瘤内免疫浸润细胞正相关(P<0.05)。SLC3...     

溶质载体家族7成员11基因SLC7A11与肝癌临床特征相关性

目的 明确溶质载体家族7成员11基因（SLC7A11）在肝癌及癌旁组织中的表达水平,了解SLC7A11基因与肝癌患者临床特征的关系。方法 收集102例肝癌患者肝癌组织及其癌旁组织,通过半定量PCR 、Real-time PCR测定SLC7A11基因在组织中的表达水平,分析该基因与肝癌患者年龄、性别、肿瘤大小、HBV感染、淋巴结转移、生存期及组织学分级的关系。结果 随机挑选20对肝癌和癌旁组织进行半定量PCR,SLC7A11基因在85.0%（17/20）的肝癌组织较癌旁组织中mRNA的表达水平明显上调。Real-time PCR检测102例肝癌和癌旁组织中SLC7A11 mRNA表达水平,72.5%（74/102）肝癌组织中SLC7A11基因表达水平明显上调（P<0.01）。在64例肝癌患者中SLC7A11 mRNA高表达组的平均生存期为16个月,低表达组的平均生存期为22个月,SLC7A11 mRNA高表达组生存期较短（P<0.01）。SLC7A11基因表达水平与肿瘤大小成正相关,肿瘤大于3 cm的肝癌患者SLC7A11基因的表达水平明显上调（P<0.05）。SLC7A11基因表达水平与患者的年龄、性别、HBV感染、淋巴结转移与否及组织学分级无关（P>0.05）。结论 SLC7A11基因在肝癌组织中表达上调,影响着肿瘤的增生及患者的生存期,提示SLC7A11基因在肝细胞癌发生发展中起着重要的作用。     

CMTM6基因作为免疫浸润相关的泛癌预后生物标志物

目的:CMTM基因是人类趋化因子样基因超家族的新成员.已有研究表示CMTM6在不同的肿瘤中发挥着不同的作用.本研究旨在探讨CMTM6在泛癌中的预后,并研究CMTM6表达与免疫浸润的关系.方法:在本研究中,我们在TIMER、PrognoScan、Kaplan-Meier Plotter等多个数据库中,研究了CMTM6在泛癌中的表达模式和预后价值.然后,利用TIMER数据库及ESTIMATE算法,研究了CMTM6在癌症中的表达与免疫浸润的相关性.结果:总体来说,与正常组织相比,在多个肿瘤组织中CMTM6异常表达.生存分析表明,CMTM6在4种癌症中预后较差,包括肾透明细胞癌(KIRC),肝细胞癌(LIHC),胰腺导管腺癌(PDAC),嗜铬细胞瘤和副神经节瘤(PCPG).在另外5种癌症中,CMTM6则预后较好,包括膀胱癌(BLCA),乳腺癌(BRCA),胸腺瘤(THYM),甲状腺腺瘤(THCA),子宫体子宫内膜癌(UCEC).CMTM6的表达与B细胞、CD8+T细胞、CD4+T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞和树突状细胞的免疫浸润情况呈显著正相关.ESTI-MATE算法来计算TCGA队列中每个样品的免疫评分.结论:CMTM6可作为泛癌的预后生物标志物,并且与免疫浸润有关.     

基于生信数据的Toll样受体4泛癌分析

目的 探讨Toll样受体4(toll-likereceptors,TLR4)在不同癌症类型的表达水平、预后结果、免疫浸润等。方法使用GEO数据库、TCGA数据库、人类蛋白质图谱(humanproteinatlas,HPA)和多种生物信息工具对TLR4进行泛癌分析,从分子水平、基因表达水平、生存状态、免疫浸润、基因突变以及相关细胞代谢途径等方面来探讨TLR4在不同类型癌症发生发展和癌症患者临床预后中的作用。结果 TLR4在大多数癌症中呈现低表达(P<0.05),并且与癌症患者的预后有一定的相关性(P<0.05),TLR4在多数癌症的表达与癌相关成纤维细胞(cancer-associatedfibroblasts,CAFs)浸润有关。TLR4参与到免疫应答、DNA转录调控、肿瘤增殖、凋亡、翻译后修饰和自噬等多种生物过程。结论TLR4表达与癌症患者临床预后和免疫细胞浸润存在统计学相关性,这将有助于人们从临床角度认识TLR4在癌症发生发展中所扮演的角色。     

生物信息学分析SLC10A1在肝细胞癌的临床意义和作用机制

目的 探讨溶质载体家族10成员1 (SLC10A1)在肝细胞癌(HCC)中的表达、作用机制及免疫浸润特征。方法 利用肿瘤和癌症基因组图谱数据库和高通量基因表达数据库中的HCC数据信息,分析SLC10A1的表达与HCC临床病理特征、生存期之间的关系,Western blotting验证其在HCC组织中的表达水平;利用“DESeq2”差异表达分析和基因集富集分析探讨其潜在作用机制;TISIDB和TIMER数据库用于免疫浸润分析。结果 SLC10A1在HCC中显著低表达,低表达SLC10A1的HCC患者总体生存期、疾病特异性生存期和无进展生存期更短,临床预后不良。组成型雄烷受体通路、硫氨基酸代谢、过氧化物酶体脂质代谢和脂肪酸Ω氧化等胆汁酸代谢相关通路是SLC10A1参与HCC进展的潜在机制。SLC10A1表达与细胞毒性T细胞、辅助型T细胞1、辅助型T细胞2、滤泡辅助性T细胞和巨噬细胞浸润呈负相关关系。结论 SLC10A1在HCC中低表达,其表达降低致使HCC患者预后差、复发率高,胆汁酸代谢相关通路失调、免疫逃逸促进可能是SLC10A1参与HCC发生发展的关键途径。     

HL7组织与HL7标准简介

HL7标准在国内的普及应用需要各方面力量的共同努力,组建HL7中国委员会将起到凝聚的作用.HL7标准是不断发展的,我们在追赶最新潮流的同时,更应该扎扎实实地学习和借鉴已经成熟并广泛应用的版本.     

重组hBMP7基因转染成纤维细胞及其表达

目的 探讨重组骨形态发生蛋白-7腺病毒载体(AdCMV-BMP7)在人真皮成纤维细胞获得稳定表达的可行性。方法 重组腺病毒载体AdcMV-BMP7经293细胞包装、扩增后，转染人真皮成纤维细胞。转染48h后以免疫组织化学、RT-PCR等方法检测hBMP7基因在人真皮成纤维细胞内的表达情况。结果 在合适的滴度下，重组腺病毒载体AdCMV-BMP7对成纤维细胞的增殖能力无明显影响。转染48h后免疫细胞化学显示已转染AdCMV-BMP7的成纤维细胞内有大量的hBMP7表达，RT-PCR也检测到特异的hBMP7基因片段的表达。结论 重组腺病毒载体AdcMV-BMP7能够被转导入成纤维细胞内。并稳定表达hBMP7。     

重组hBMP7基因转染成纤维细胞及其表达

目的探讨重组骨形态发生蛋白-7腺病毒载体(AdCMV-BMP7)在人真皮成纤维细胞获得稳定表达的可行性.方法 重组腺病毒载体AdCMV-BMP7经293细胞包装、扩增后,转染人真皮成纤维细胞.转染48 h后以免疫组织化学、RT-PCR等方法检测hBMP7基因在人真皮成纤维细胞内的表达情况.结果在合适的滴度下,重组腺病毒载体AdCMV-BMP7对成纤维细胞的增殖能力无明显影响.转染48 h后免疫细胞化学显示已转染AdCMV-BMP7的成纤维细胞内有大量的hBMP7表达,RT-PCR 也检测到特异的hBMP7基因片段的表达.结论重组腺病毒载体AdCMV-BMP7能够被转导入成纤维细胞内,并稳定表达hBMP7.     

7—氯苄基四氢巴马汀对正常及肥厚心脏大鼠血管环的作用

目的观察7－氯苄基四氢巴马汀(7－chlor－BTHP)对正常及肥厚心脏大鼠血管环的作用。方法用去甲肾上腺素（NA）和氯化钾（KCl）引起血管收缩,然后观察7－chlor－BTHP对正常及肥厚心脏大鼠血管环的作用。结果在肥厚及正常心脏大鼠的离体血管环上,7－chlor－BTHP及奎尼丁(Qui)对NA所致的收缩均有抑制作用。7－chlor－BTHP的IC50分别为76及39μmol*L-1,而Qui则分别为4.6及8μmol*L-1。Qui对氯化钾所致血管环的收缩有明显的抑制作用,其PD2'分别为4.3（肥厚）及4.0（正常）,而7－chlor－BTHP则对其无影响。结论7－chlor－BTHP有拮抗α－受体作用,而无钙拮抗作用。     

7—氨基去乙酰氧基头孢烷酸（7-ADCA）

7—氨基去乙酰氧基头孢烷酸(7—ADCA)是合成头孢类抗生素的一个重要中间体,其制备一般以青霉素G为原料,经氧化、扩环重排、裂解三步反应制得。本文综述了这三步反应的情况,并对7-ADCA的精制进行介绍。     

稳定表达小鼠PNPLA7的Huh7细胞系的构建

目的:构建稳定表达小鼠PNPLA7-Flag蛋白的人类肝癌细胞Huh7细胞系,观察小鼠PNPLA7在Huh7细胞中的过表达以及对Huh7细胞脂质含量的影响?方法:构建pCMV6 -PNPLA7-Flag真核表达载体,应用脂质体转染技术将该质粒导入Huh7细胞,随后通过G418筛选稳定表达的细胞系,运用Western blot方法检测PNPLA7蛋白表达;并通过油酸处理及油红染色观察过表达PNPLA7蛋白对Huh7细胞中脂质含量的影响?结果:成功获得2株稳定过表达PNPLA7-Flag的Huh7细胞系;Huh7细胞中过表达PNPLA7蛋白,在油酸处理后细胞内脂滴含量减少?结论:稳定表达小鼠PNPLA7的Huh7细胞系构建成功;小鼠PNPLA7在Huh7细胞中的表达会引起细胞中脂质含量减少,从而为后续研究PNPLA7蛋白在脂代谢通路的功能及机制提供可靠的细胞模型?     

TRPM7与肿瘤

瞬时受体电位(transient receptor potential,TRP)通道是位于细胞膜上的一类重要的阳离子通道超家族。TRPM(transient receptor potential melastatin)7是TRPM亚族的一员,是具有离子通道和激酶活性双功能的膜蛋白。它对阳离子有通透性,使细胞去极化,可使自身和底物磷酸化。TRPM7可以介导感觉信号的传递,调节细胞钙镁平衡和影响发育,其表达及活性异常与多种疾病特别是肿瘤的发生具有相关性。TRPM7通道激酶在细胞的增殖、存活、分化、生长和迁移等一系列细胞活动中起重要作用。