上海地区遗传性耳聋基因检测室间质量评价

目的通过开展遗传性耳聋基因检测室间质量评价(EQA),评估上海地区临床实验室遗传性耳聋基因检测能力,以提高检测质量。方法 2017年EQA共涉及4个耳聋相关基因的9个突变位点,样本盘包含5个样本,样本类型为干血斑。要求参评实验室收到样本后在规定时间内检测并上报检测结果。计算各实验室成绩、不同样本的总体符合率及不同检测方法的符合率,统计检测错误类型。结果共收到18份有效回报结果。77.78%的实验室回报结果完全正确,5.56%的实验室出现错误结果但总成绩合格,16.67%的实验室成绩不合格。阴性样本(野生型样本)的检测符合率为100%,阳性样本(突变型样本)的检测符合率为93.59%。共出现检测错误10个,错误类型集中表现为假阴性。结论上海地区临床实验室遗传性耳聋基因检测总体准确率较高,质量控制对于保证检测结果的准确性具有十分重要的作用。     

乙型肝炎病毒YMDD突变室间质量评价调查品制备及应用

目的制备乙型肝炎病毒(HBV)YMDD突变室间质量评价(EQA)调查品,评估上海地区临床实验室检测HBV YMDD突变的能力。方法筛选HBV DNA5×104 IU/ML的临床样本,经稀释制成含HBV YMDD不同突变类型的样本盘。采用实时荧光聚合酶链反应(PCR)、高温连接酶反应(LDR)和测序法筛选EQA候选样本,并采用PCR评估样本均匀性和稳定性。2017年2次EQA各制备5份样本,要求参评实验室在规定时间内检测样本并上报检测结果。对回报结果进行分析。结果 2017年2次EQA分别收到12份和10份有效回报结果,66.67%的实验室检测结果完全正确。HBV YIDD、YVDD、YIDD+YVDD和YMDD不同突变样本的检测符合率分别为90.63%、86.36%、77.27%和88.24%。结论制备的调查品均匀、稳定,可用于EQA;部分临床实验室HBV YMDD突变检测能力尚需提高,应加强质量控制以保证检测结果的准确性。     

上海地区PIK3CA基因突变检测室间质量评价分析

目的利用室间质量评价评估上海地区临床实验室PIK3CA基因突变的检测能力。方法选用含有特定PIK3CA突变型的福尔马林固定石蜡包埋细胞样本作为室间质评样本,对其均匀性和稳定性进行评价后,将5个样本随机编号后发送至参评实验室,要求实验室在规定时间内检测并回报结果,综合分析评价回报结果。结果均匀性和稳定性均符合中国合格评定国家认可委员会对能力验证样品的要求。2018年和2019年分别收到有效回报结果28份和19份,回报结果完全正确的实验室分别为78.6%(22/28)和89.5%(17/19),成绩不合格实验室分别为17.9%(5/28)和10.5%(2/19)。样本的整体符合率分别为86.4%(121/140)和93.7%(89/95),其中假阳性率为8.6%(12/140)和2.1%(2/95),假阴性率为8.3%(7/84)和5.3%(4/76)。结论上海地区临床实验室PIK3CA基因突变检测质量整体较好,但部分实验室检测能力尚需提高。实验室通过参加室间质量评价可发现自身问题,持续改进并提高其检测质量。     

表皮生长因子受体（EGFR）基因突变检测质控品制备及应用

目的　制备模拟临床样本的表皮生长因子受体（epidermal growth factor receptor EGFR）基因突变检测质控品,评估其临床适用性。方法　选择含EGFR 不同突变位点和无EGFR 突变位点细胞,培养收集后制作成蜡卷。用三种临床常用试剂盒检测,并评估其均一性和稳定性。将含不同突变型5 份样本的样本盘,随机编码后发送至参评实验室,评价回报结果。结果　三种不同试剂检测样本盘结果一致。结果显示质控品均匀, 室温放置可稳定12 个月。28 家实验室5 个样本符合率分别为92.88%,96.43%,78.57%,96.43% 和100%,突变型样本和野生型样本的符合率分别为91.07%（102/112）和100%（28/28）。结论　研制的EGFR 基因突变质控品具有较好的临床适用性,可用于室内质量控制和室间质量评价。     

上海地区真菌培养鉴定及体外药物敏感性试验室间质量评价结果分析

目的 通过室间质量评价(EQA)了解上海地区临床实验室真菌培养鉴定及体外药物敏感性试验的开展情况及检测质量.方法 2019年EQA共发放10份样本(冻干菌株)进行真菌培养鉴定,其中4份要求同步进行体外药物敏感性试验.通过反馈结果对真菌鉴定符合率和体外药物敏感性试验的开展情况进行统计分析.结果 共收到75份有效回报结果,...     

上海市及其他地区临床实验室B 族链球菌核酸检测室间质量评价分析

目的 通过开展B 族链球菌（group B Streptococcus,GBS）核酸检测室间质量评价计划（简称室间质评）,评价参评实验室检测能力,分析存在的问题,提高检测质量。方法 2021 年GBS 核酸检测室间质评计划为一年两次,每次质评计划样本盘包含4 支由灭活的GBS 培养液稀释而成的不同浓度阳性样本和1 支阴性样本。样本冷链寄送至各参评实验室,并要求其在规定时间内按要求检测并回报结果,依据回报结果计算各实验室成绩,汇总不同样本的总体符合率。结果 2021 年两次室间质评分别有33 家实验室报名参加,收到有效报告31 份和32 份。所有实验室室间质评成绩均合格,两次结果完全正确的实验室分别有87.10%（27/31）和96.88%（31/32）,样本的总体符合率为97.42%（151/155）和99.38%(159/160)。结果汇总中共出现检测错误5 例,错误类型集中表现为假阴性。结论 各参评实验室GBS 核酸检测能力总体较高,个别实验室检测能力尤其是弱阳性样本检测能力有待提高。通过参加室间质评计划能帮助实验室及时发现问题并持续改进以提高检测质量。     

2016—2018年江苏省血液EGFR基因突变检测室间质量评价

摘要:目的：对 2016—2018年江苏省血液表皮生长因子受体（ EGFR ）基因突变检测室间质量评价的总体情况及存在问题进行分析和探讨，为临床实验室检测流程的规范和检测质量的保证提供依据。 方法：室间质评每年1次，2016年样本盘为4支cfDNA（cell-free DNA）样本，2017和2018年样本盘均为5支含cfDNA的血浆样本，要求各参评实验室收到样本后在规定的时间内检测并将所需填报的信息及测定结果上传至江苏省临床检验中心数据库；依据回报结果计算各实验室的成绩，分析每批样本的总体符合率、假阴性率、假阳性率及问题与风险。 结果：3次室间质评分别收到10份、16份和20份有效回报结果。检测结果完全符合的实验室分别为30.0%（3/10）、37.5%（6/16）和10.0%（2/20）；以得分≥80分为合格，合格率分别为90.0%（9/10）、56.2%（9/16）和50.0%（10/20）；假阴性率分别为70.0%（7/10）、56.2%（9/16）和88.9%（16/18），而假阳性率分别为0%（0/10）、25.0%（4/16）和22.2%（4/18）。测定方法敏感性和cfDNA提取效率不高是假阴性的主要原因，污染和阈值设置缺乏验证是假阳性的主要原因。 结论：针对血液标本的肿瘤相关基因突变检测需选择高敏感性测定方法、优化核酸提取效率、规范检验流程和强化结果的分析和验证。     

沙眼衣原体室间质量控制质控品的制备及其应用

目的 制备可模拟真实临床样本的沙眼衣原体室间质量评价（EQA）质控品,以客观评价上海地区临床实验室沙眼衣原体检测能力。方法 选用HELA-299细胞株培养沙眼衣原体血清型E,制备成沙眼衣原体EQA质控品,通过均匀性和稳定性验证后,用于上海市临床检验中心EQA计划。结果 制备的沙眼衣原体EQA质控品均匀性和稳定性均通过验证。对上海市54家临床实验室进行EQA,有51家回报结果,所有回报结果的实验室EQA成绩均为100分。结论 成功制备了可模拟临床样本的沙眼衣原体EQA质控品。上海地区临床实验室沙眼衣原体检测质量良好。     

上海地区[STBX]PIK3CA[STBZ]基因突变检测室间质量评价分析

摘要：目的：利用室间质量评价评估上海地区临床实验室[STBX]PIK3CA[STBZ]基因突变的检测能力。 方法：选用含有特定[STBX]PIK3CA[STBZ]突变型的福尔马林固定石蜡包埋细胞样本作为室间质评样本，对其均匀性和稳定性进行评价后，将5个样本随机编号后发送至参评实验室，要求实验室在规定时间内检测并回报结果，综合分析评价回报结果。 结果：均匀性和稳定性均符合中国合格评定国家认可委员会对能力验证样品的要求。2018年和2019年分别收到有效回报结果28份和19份，回报结果完全正确的实验室分别为78.6%（22/28）和89.5%（17/19），成绩不合格实验室分别为17.9%（5/28）和10.5%（2/19）。样本的整体符合率分别为86.4%（121/140）和93.7%（89/95），其中假阳性率为8.6%（12/140）和2.1%（2/95），假阴性率为8.3%（7/84）和5.3%（4/76）。 结论：上海地区临床实验室[STBX]PIK3CA[STBZ]基因突变检测质量整体较好，但部分实验室检测能力尚需提高。实验室通过参加室间质量评价可发现自身问题，持续改进并提高其检测质量。     

上海地区氯吡格雷药物代谢基因检测室间质量评价

目的通过开展氯吡格雷药物代谢基因——细胞色素P450 2C19(CYP2C19)*2、*3、*17位点检测室间质量评价(简称室间质评)项目,评估参评临床实验室的检测能力及存在的问题。方法 2015年2次室间质评样本盘均分为2组,每组各包含5支样本。要求参评实验室收到样本后在规定时间内检测样本并网上上报检测结果。依据回报结果计算各实验室成绩,汇总不同位点的总体符合率,并分析检测方法和试剂的符合率。结果 2015年2次室间质评分别收到16份和17份有效回报结果,成绩满分的实验室分别占93.75%和88.24%,CYP2C19*2、*3和*17检测总符合率分别为95.00%、95.00%、100.00%和98.82%、98.82%、95.00%。2次室间质评中,使用自配试剂进行检测的实验室分别占37.5%和35.3%,满分实验室占83.33%和83.33%。使用注册试剂检测实验室成绩为满分的分别占100%和90.91%。结论各实验室在CYP2C19基因各位点检测总体准确率很高,但个别实验室检测能力有待提高。临床实验室的质量控制对于保证检测结果准确性具有十分重要的作用。     

上海地区苯丙酮尿症基因检测室间质量评价

目的通过开展苯丙酮尿症基因检测室间质量评价计划(简称室间质评),评估参评实验室检测能力,提高检测质量。方法2019年室间质评计划为1年2次,共包含苯丙氨酸羟化酶基因(phenylalanine hydroxylase,PAH)的4个致病变异位点,涉及错义变异和剪接变异2种类型。样本盘包含5支样本,类型为干血斑。要求参评实验室收到样本后在规定时间内检测样本并网络上报检测结果。依据回报结果计算各实验室成绩,汇总不同样本的总体符合率,并分析致病变异位点检测及结果报告错误类型。结果2次室间质评分别收到3份和2份有效回报结果,成绩合格的实验室分别为1家和2家。2次室间质评中,样本检测结果的总体符合率分别为60%(9/15)和100%(10/10)。结果汇总中共出现检测错误6例,错误的类型集中表现为假阴性。剪接变异的检出符合率明显低于错义变异。结论临床实验室在苯丙酮尿症遗传基因致病变异检测及结果分析报告方面能力有待提高。通过参加室间质评计划能帮助实验室发现检测中存在的问题,提高检测质量。     

上海地区伊立替康药物代谢相关基因检测室间质量评价结果分析

目的以抽取自人全血的基因组DNA为质控样本,开展伊立替康代谢相关基因室间质量评价(EQA)计划,评估参评实验室检测能力,提高其检测质量。方法通过对人类基因组DNA的测序,获得包含多种尿苷二磷酸葡萄糖醛酸基转移酶1A1(UGT1A1)*6和UGT1A1*28不同基因型组合的样本,制备EQA质控样本盘。每个样本盘包含5支样本,要求参评实验室收到样本后在规定时间内检测,并上传检测结果。汇总各实验室各样本的总体符合率,分析不同检测方法的符合率和检测错误类型。结果 2019年2次EQA中,满分的实验室分别占88.00%(22/25)和86.36%(19/22),样本检测的总符合率分别为96.33%(236/245)和96.74%(208/215);其中,荧光分子杂交法样本符合率均为100.00%,Sanger测序法样本符合率分别为91.82%(101/110)和93.00%(93/100)。结论参评实验室检测的总体准确率较高,但个别实验室检测能力仍有待提高,尤其是需加强实验室自建的Sanger测序法的全程质量控制。     

EB病毒核酸检测质控品制备及其应用

目的制备可模拟真实临床标本的EB病毒(EBV)核酸检测质控品用于上海地区临床实验室室间质评,以评估其EBV DNA的检测能力。方法选择整合有EBV基因组的淋巴细胞(NAMALWA)进行培养,收集细胞后观察细胞原液对国内常用商品化试剂盒的适用性,随后用EBV国际标准品对其定值,经血浆稀释制得含有阴、阳性共5份样本的样本盘,随机编码后发送至参加EBV DNA室间质评的临床实验室,并对回报结果进行分析。结果采用不同公司EBV PCR检测试剂盒检测NAMALWA细胞原液,结果全部阳性。EBV国际标准品对NAMALWA细胞原液定值浓度约为2.13×105IU/m L,部分参评实验室出现假阳性和假阴性问题,高浓度样本(105和104IU/ml)的符合率均为100%,低浓度样本(103和102IU/m L)的符合率分别为92%和40%,阴性样本的符合率为90%。重复样本实验室内检测结果的平均变异系数(CV)为4.1%(1.4%~11.3%),实验室间CV为6%;大多数实验室(75%)的检测结果与预期值呈良好的线性相关。结论成功制备可模拟临床标本的EBV PCR检测质控品,并证实其可有效用于临床实验室室间质评。质评结果显示上海地区参评实验室EBV DNA检测质量整体较好,但个别实验室检测能力尚需提高。     

人乳头瘤病毒16和18型核酸检测用质控品制备及其应用

目的制备可模拟真实临床标本的HPV-16和HPV-18核酸检测用质控品,并用于上海地区临床实验室的室间质量评价。方法分别选择整合有HPV-16和HPV-18 L1基因的宫颈癌细胞系(Siha和Hela)进行培养,收集细胞后用HPV国际标准品定值并分装,对其均匀性和稳定性进行评价,然后将样本盘发送至参评实验室,对回报结果进行分析评价。结果均匀性评价结果显示质控品间均匀性良好,稳定性评价结果表明质控品检测结果随时间延长无明显趋势变化。参评实验室对高浓度样本的检测符合率较高,低浓度样本的检测符合率较低。对于不分型项目,26%参评实验室由于上报假阴性结果导致出错。对于分型项目,不同检测方法的结果间没有显著差异,样本检测出错主要是因为错检或漏检某一亚型所致。结论制备的核酸检测用质控品的均匀性和稳定性良好,可有效用于临床实验室室间质量评价。质评结果显示上海地区参评实验室HPV核酸检测质量整体较好,个别实验室检测能力尚需提高。     

2005年至2008年全国HLA低分辨基因分型检测室间质量评价结果分析

目的 总结并分析2005年至2008年全国医院I临床实验室HLA低分辨基因分型检测室间质量评价(EQA)结果,为进一步提高临床实验室HLA基因分型检测水平提供有价值的参考.方法 根据HLA低分辨基因分型检测的特点,用常规统计方法归纳了连续4年EQA活动的结果,分析了近4年EQA活动中回报结果的错误率以及导致错误结果的可能原因.结果 2005年至2008年,参与HLA低分辨基因分型检测EQA项目的 临床实验室从22家增加到61家;连续4年EQA活动中回报数据共计2 844份,总体错误率为1.05%(30/2 844);每年出现错误的实验室比率分别为13.6%(3/22)、10.7%(3/28)、10.6%(5/47)、16.4%(10/61);连续4年EQA活动中错误数据共计30份,错误类型主要包括HLA基因分型错误25份、人为错误5份.结论 目前我国临床实验室HLA低分辨基因分型检测错误的比例过高;由于错误类型以基因分型错误和人为错误为主,反映了从业人员在HLA基因分型技术上存在不容忽视的问题.     

应用飞行检查结果分析上海地区临床实验室的检测质量

目的通过对2017年上海市临床检验中心(SCCL)全覆盖飞行检查和室间质量评价(EQA)反馈数据的统计,结合上海地区各临床实验室上报的室内质量控制(IQC)数据,探讨飞行检查对于准确评估临床实验室检测质量的作用。方法收集2017年第1次飞行检查和EQA定量项目的实验室上报数据,计算各项目结果的稳健变异系数(CV)并作分析。结果 770家临床实验室接受了SCCL组织的飞行检查,同时参加了EQA。在飞行检查中,102家实验室有不合格的计划[血脂、血气和酸碱分析、凝血试验、快速C反应蛋白、快速血糖、同型半胱氨酸(Hcy)、肿瘤标志物],其中有85家(83.33%)的实验室在EQA中这些计划的成绩均为合格。相同项目飞行检查与EQA结果CV的差异从0.11%[载脂蛋白B(apo B)]到52.15%[糖类抗原(CA)19-9],平均为6.10%(P=0.014),且飞行检查的CV大于EQA的CV。结论飞行检查能更真实地反映实验室的检测质量,实验室应保存EQA原始数据以保证EQA上报数据的真实性。     

2009-2014年全国HLA低分辨基因分型检测室间质量评价结果分析

目的为进一步提高全国临床实验室人类白细胞抗原(HLA)基因分型检测水平提供有价值的参考。方法利用常规统计方法归纳总结2009-2014年全国医疗机构和商业临床实验室HLA低分辨基因分型检测室间质量评价(EQA)结果,分析在连续6年的EQA活动中,回报结果的错误率、错误类型以及导致错误结果的原因。结果2009-2014年全国参加HLA低分辨基因分型检测EQA项目的临床实验室数目从63家增至83家;在连续6年EQA活动中,回报HLA分型数据共计7 836份,总体错误率为2.12%(166/7836);2009-2014年每年出现错误的实验室比例分别为1.59%(1/63)、11.48%(7/61)、0.00%(0/69)、2.74%(2/73)、2.82%(2/71)、10.84%(9/83);连续6年EQA活动中错误数据共计166份,主要包括HLA基因分型错误23份、血清型和基因型混淆错误14份、录入错误108份,漏报错误21份。结论目前我国临床实验室HLA低分辨基因分型整体检测水平仍不容乐观,错误比例过高;反映了从业人员在HLA基因分型技术上和规范化管理上存在不容忽视的问题。     

2种方法检测非小细胞肺癌EGFR基因突变的比较

目的比较测序法和Taqman实时荧光PCR法检测表皮生长因子受体(EGFR)基因19、21外显子基因突变的一致性,为寻找适宜临床应用的EGFR基因突变检测方法提供实验依据。方法收集60例非小细胞肺癌患者肿瘤组织,应用测序法和Taqman实时荧光PCR法分别检测EGFR基因19、21外显子基因突变,比较两种方法的有效性。结果两法检测EGFR基因19、21外显子突变结果符合率分别为96.7%(58/60)和98.3%(59/60),差异无统计学意义(P>0.05)。结论 2种方法均可用于EGFR基因19、21外显子突变检测,测序法更适合指导临床分子靶向治疗。     

2010至2014年参加卫生部血铅检测室间质评结果回顾分析

目的通过回顾分析2010至2014年参加卫生部临床检验中心血铅检测室间质量评价(EQA)的成绩,探讨稳定和提高血铅检测质量的因素,为实验室全面质量管理的实施提供科学依据。方法采用偏差、能力比对(PT)得分和Z比分数对2010至2014年7个批次35份EQA成绩进行统计分析。结果分析2010~2014年5年内参加卫生部临床检验中心血铅检测EQA的成绩,偏差符合卫生部临床检验中心要求,均属在控范围;能力比对得分均为100%;Z比分数2.0,均为满意。结论本实验室的血铅检测系统完全胜任大批量样本的检测需求。在EQA统计中,Z比分数能更好剔除离群值的影响,更全面客观地反映参评者的检测水平,可作为新的EQA统计方法。     

HRM法检测结直肠癌患者循环DNA中KRAS和EGFR基因突变

摘要:目的：探讨高分辨率熔解曲线(HRM) 法检测结直肠癌患者循环DNA中KRAS和EGFR基因突变的可行性。 方法：用HRM法检测70例结直肠癌患者KRAS基因2号和3号外显子以及EGFR基因19和21号外显子的突变情况,用直接测序法验证结果的准确性。 结果：70 例结直肠癌患者血液标本经HRM法、直接测序法分别检测到18例(25.7%)和17例(24.3%)KRAS基因2号外显子突变;均检测到3例EGFR基因19号外显子突变(4.3%);两法均未检测到3号外显子和21号外显子突变。HRM检测与直接测序法结果符合率为99.6% (279/280)。 结论：HRM法检测结直肠癌患者血样本KRAS和EGFR基因突变,具有准确度高、操作简单、检测成本低等优点,适合在临床推广应用。