SPRIDA对小鼠H22肝癌相关基因表达谱的影响

目的研究SPRIDA（施普睿达）对荷H ₂₂肝癌小鼠基因表达的调节差异,探讨SPRIDA治疗小鼠肝癌的可能机制。方法运用基因表达谱芯片技术检测SPRIDA对荷瘤小鼠的基因表达调节,并对差异基因进行Pathway聚类和统计分析。结果SPRIDA作用前后表达有差异的基因共358条（占芯片基因总数的8.74％）,其中172条（172/4096,4.20％）基因表达上调,186条（186/4096,4.54％）基因表达下调。经Pathway聚类分析,表达差异基因主要属于细胞凋亡、细胞周期、NK细胞介导的细胞毒、细胞黏附分子、肿瘤生长因子β、Wnt等信号通路。结论SPRIDA主要是通过影响肿瘤细胞周期进程、调节肿瘤细胞凋亡和黏附相关基因的表达等多种途径抑制肿瘤的增殖和转移。关键词：SPRIDA;基因表达谱;基因芯片;小鼠H ₂₂肝癌     

p27kip1高表达乳腺癌细胞株MCF-7基因表达谱的差异分析

目的:利用基因芯片技术筛选p27kip1转染乳腺癌MCF-7细胞的差异表达基因,探讨p27kip1调控肿瘤细胞增殖和细胞周期的分子机制。方法:将含p27cDNA的质粒在脂质体介导下体外转染乳腺癌MCF-7细胞,利用Affy-metrix公司的人类基因组基因芯片U133A分别检测表达p27kip1蛋白和空载体的乳腺癌细胞株的基因表达谱,用生物信息学软件进行比较分析,对差异表达基因进行功能分类。结果:在含22277个基因cDNA的芯片上差异表达的基因有1379条,其中表达谱发生明显变化(2倍以上)的基因173条,占总检测基因的0·78%。157条基因表达明显上升(SLR>1),占总检测基因的0·705%;16条基因表达明显下降(SLR<-1),占总检测基因的0·072%。基因表达差异主要集中在物质代谢、细胞增殖、细胞周期调控、细胞分化与凋亡、免疫反应、信号传导、蛋白转运、调节转录等方面。结论:多基因共同参与了p27kip1抑制肿瘤细胞过度增殖以及促进细胞凋亡的作用。对于p27kip1相关基因群的研究有助于认识p27kip1蛋白在细胞周期调控乃至整个细胞癌变过程中作用的分子机制。     

应用基因表达谱芯片技术研究Rituximab的耐药机制

目的 应用基因表达谱芯片技术检测Rituximab耐药细胞株差异表达基因、富集信号通路及相关生物学行为,初步探讨Rituximab的耐药机制。方法 成功构建Rituximab耐药B细胞性非霍奇金淋巴瘤细胞株Jeko-1/R和Raji/R,应用基因表达谱芯片技术检测耐药细胞株与亲本细胞株的差异表达基因,用KEGG数据库及DAVID软件进行生物信息学分析。结果 在两株Rituximab耐药细胞株中,同为上调和同为下调表达的差异基因分别有70个和42个;KEGG 通路分析提示Rituximab耐药细胞与亲本细胞相比,MAPK信号通路呈富集;基因本体论（gene ontology,GO）分析提示耐药细胞生物学行为表现主要集中在抗凋亡、促增殖、促血管发育等方面。结论 与Rituximab耐药关系最密切的通路可能为MAPK信号通路,其机制可能是Rituximab激活MAPK信号通路后抑制肿瘤细胞凋亡,促进肿瘤细胞增殖及促进肿瘤血管发育,这为预测Rituximab耐药及逆转耐药提供了理论依据。     

人参皂苷Rh2对荷肺癌小鼠基因表达的肿瘤特异性调节

目的研究人参皂苷Rh2对正常和荷肺癌小鼠基因表达的调节差异。方法运用寡核苷酸芯片技术,检测Rh2对正常和荷瘤小鼠的基因表达调节,并对差异基因进行聚类和统计分析。为了进一步验证芯片结果,我们使用实时荧光定量PCR方法检验Rh2对基因表达的作用效果。结果与正常小鼠相比,Rh2对荷瘤小鼠的基因表达影响更大,二者的主要受调脏器也不同;Rh2对正常和肿瘤小鼠基因表达调节没有明显的相关性;Rh2能有效拮抗局部接种肿瘤引起的荷瘤小鼠各脏器基因异常表达。结论Rh2对荷瘤小鼠的基因表达调节具有肿瘤特异性。     

沙棘籽渣黄酮诱导人乳腺癌细胞凋亡相关基因的表达谱变化

背景与目的:研究显示,沙棘含有多种黄酮类化合物,具有抗氧化、防辐射等作用。cDNA基因表达谱芯片技术具有高通量、高效、快捷的特点,本实验拟利用cDNA基因表达谱芯片研究沙棘籽渣黄酮(flavonoidsfromseedresiduesofHippophaerhamnoidesL.,FHR)诱导人乳腺癌细胞Bcap鄄37凋亡相关基因的表达谱变化。方法:抽提FHR作用前后的Bcap鄄37细胞总RNA,经逆转录合成荧光分子(Cy3/Cy5)标记的cDNA探针,与含有13824个cDNA基因的人14K基因表达谱芯片杂交,利用Genespring软件分析实验组和对照组之间差异表达的基因,对所获得的基因进行生物信息学分析。结果:实验组与对照组中表达上调的基因有305条,表达下调的基因有361条。差异表达的与细胞凋亡相关的基因有32条,占芯片基因总数的0.23%,其中表达上调的有25条(平均Ratio值为3.071),下调的有7条(平均Ratio值为0.418)。生物信息学分析表明,FHR在对Bcap鄄37细胞作用的过程中,该32条差异表达基因与Bcap鄄37细胞凋亡有关,其中包括CTNNB1、TSSC3、IGFBP4、IGFBP6、GADD34、TNFRSF10B、Caspase鄄9和PCNA等。结论:FHR诱导Bcap鄄37细胞凋亡的机制是由多基因协同,并通过胞内和胞外信号转导途径共同调节完成。     

康莱特抗小鼠肺腺癌LA795肺转移相关基因表达谱的研究

目的 寻找康莱特抗肿瘤转移的表达差异基因。方法 以LA795小鼠肺腺癌肺转移组织，制备mRNA探针，应用含有4096条鼠基因的cDNA表达谱芯片，用ScanAr ray3000扫描仪扫描芯片荧光信号图像，分析肿瘤组织和康莱特治疗后肿瘤组织中差异表达基因。结果 发现在康莱特组和对照组存在差异表达的基因，其中重复3次均差异表达的基因有27条，其中表达增高的基因25条，表达降低的基因2条。其中12条是小鼠肌cDNA文库中的基因。经初步研究，发现6条可能与肿瘤发生、发展及转移相关的基因。结论 运用本基因表达谱芯片对基因表达谱进行分析，能够有效筛查出抗肺转移的相关差异基因。本组共发现6条与康莱特抗肿瘤转移相关的基因。     

微小RNA在肿瘤研究方面的进展

微小RNA(miRNA)通过特异性碱基对互补调节其靶mRNA的基因表达,参与细胞的增殖、分化与凋亡过程.肿瘤细胞中miRNA表达水平与正常细胞有显著差异.miRNA可以表现为致癌基因和抑癌基因,与肿瘤的发生发展密切相关,并有望成为新的治疗靶点.     

宫颈癌放疗前后肿瘤细胞凋亡及其相关基因的变化

目的:探讨宫颈癌组织放疗前后肿瘤细胞凋亡及凋亡调节基因p53、bcl-2和bax蛋白表达的变化及意义.方法:选择未经治疗的宫颈癌患者20例为试验对象,采集放疗前和放疗10Gy后宫颈癌组织标本,用原位DNA切口末端标记(TUNEL)法检测凋亡细胞;单克隆抗体免疫组化SABC法检测细胞凋亡相关基因p53、bcl-2和bax的蛋白表达水平.结果:1)在宫颈癌放疗前后,肿瘤细胞凋亡阳性率和平均凋亡指数分别为25.00%和0.11%、75.00%和3.40%,放疗前后有显著性差异(P＜0.01);2)放疗前肿瘤细胞凋亡相关基因p53、bax和bcl-2蛋白表达阳性率分别为55%、10%和20%,而放疗后分别为25%、60%和25%,放疗后p53蛋白表达减少,bax蛋白明显增加,bcl-2蛋白无明显变化.结论:放射治疗诱导宫颈癌肿瘤细胞凋亡,可能与凋亡调节基因bax基因表达的诱导密切相关.     

p16基因在膀胱肿瘤细胞凋亡中的作用

 目的　探讨p16基因与膀胱肿瘤细胞凋亡的关系。方法　应用SABC免疫组织化学法检测了51例膀胱移行细胞癌p16基因的表达,同时用流式细胞仪检测其细胞凋亡情况。结果　p16阳性表达率为47.1%(24/51),平均凋亡肿瘤细胞百分比为1.5%,p16阳性表达的肿瘤组织凋亡细胞百分比>1.5%的发生率为62.5%,p16阴性表达的肿瘤组织凋亡细胞百分比>1.5%的发生率为25.9%,两者比较有显著性差异(P<0.01)。结论　p16基因的表达与膀胱肿瘤细胞凋亡有关,p16基因可能参与膀胱肿瘤细胞凋亡的正向调节作用。     

活化白细胞黏附分子与肿瘤

活化自细胞黏附分子(ALCAM)是免疫球蛋白基因超家族成员,主要表达在白细胞和胸腺上皮细胞.ALCAM在细胞间异嗜性黏附和同嗜性黏附中起重要作用.研究表明,ALCAM在多种肿瘤细胞表面高表达,参与肿瘤的发生发展,在人类肿瘤,ALCAM的表达与乳腺癌、食管癌、结肠癌、卵巢癌、肝癌及恶性黑色素瘤等密切相关.     

补骨脂素对乳腺癌MCF-7细胞基因表达谱的影响

 目的 观察中草药补骨脂分离提取的有效成分—补骨脂素对人乳腺癌MCF 7(ER阳性)细胞基因表达谱的影响。 方法 用补骨脂素对人乳腺癌细胞株MCF-7(ER阳性)进行体外生长抑制实验,将经过补骨脂素作用的实验组细胞与对照组细胞株分别提取总RNA,用22K人类基因表达谱芯片检测基因表达情况,分析补骨脂素作用后MCF-7细胞出现的差异表达基因。 结果 经补骨脂素作用的实验组细胞样本与对照组细胞样本比较, 呈现差异表达的基因有1 053个(4.78%)。其中表达上调的有456个(43.3%, Radio>2.0),表达下调的有657个(56.7%,Radio<0.5)。差异表达明显的基因主要与细胞凋亡、细胞周期调控、核酸转译调节、转译因子活性、核苷酸转移酶活性、血管收缩调节等有关。 结论 补骨脂素对人乳腺癌MCF-7细胞抑制作用的分子机制是通过对细胞凋亡、细胞周期、核酸转译等多种基因的调控而起作用的。     

Gene expression profiling in seminoma and nonseminoma.

PURPOSE: Gene expression profiles of seminoma were compared with nonseminoma to get insights into tumorigenesis. MATERIALS AND METHODS: Eleven testicular tumor biopsies (five pure seminoma, six nonseminoma; pT1N0M0 to pT2N2M1) and biopsies from unaffected sites were analyzed once per patient using a macroarray (1,176 genes). On the same patients, six genes were validated using real-time quantitative (RTQ) polymerase chain reaction (PCR). Additionally, in a separate cohort of 19 patients, 24 genes selected from the macroarray were measured using RTQ-PCR. RESULTS: (1) The agreement in gene expression was 94% between the two methods and two different patient cohorts. (2) Two features in gene expression were independent of the tumor entity: Most changes of gene expression occurred in five functional groups like "cell cycle" and "apoptosis." Genes within these groups were almost similarly (> 80%) up- or downregulated. (3) Nonseminoma were characterized by downregulated genes (75%), but in seminoma, upregulated genes (64%) prevailed. Furthermore, 64.4% of those genes that were differentially expressed in both tumor entities were usually upregulated in seminoma but downregulated in nonseminoma. A reverse pattern was found in 24.4% of such genes. Eleven percent of these genes showed a similar up- or downregulation in gene expression in both tumor entities. CONCLUSION: Seminoma in this preliminary study can be differentiated from nonseminoma due to almost opposing gene expression profiles (89% of the significantly differentially expressed genes) and are in line with the histological discrimination of both tumor entities. Underlying mechanisms and implications regarding the origin and tumor progression of both entities are discussed.     

全反式维甲酸对胶质瘤SHG-44细胞基因表达谱的影响

背景与目的:胶质瘤有恶性进展的趋势,而诱导分化治疗可诱导高级别肿瘤的分化,使肿瘤恶性程度降低甚或转为正常。本研究旨在检测全反式维甲酸(all-transretinoicacid,ATRA)处理后胶质瘤SHG-44细胞的基因表达谱改变,为进一步研究胶质瘤的基因治疗奠定基础。方法:以10μmol/LATRA处理SHG-44细胞后,提取总RNA进行反转录聚合酶链反应,并以荧光染料Cy3和Cy5标记cDNA产物,然后进行芯片杂交,检测ATRA诱导前后SHG-44细胞的基因表达谱,获得差异表达基因;随机选择数个差异基因进行Northern杂交实验,以验证cDNA微阵列的结果。结果:应用cDNA微阵列检测发现ATRA处理前后的SHG-44细胞之间存在42个差异表达基因,其中表达上调28个、表达下调14个。这42个差异表达基因按功能分为:凋亡类3个、细胞迁移和转移类3个、细胞周期与生长调节类2个、细胞骨架类2个、分化类1个、细胞代谢类5个、癌基因1个、氧化磷酸化类1个、受体与信号传导类2个、核蛋白体类3个、泛素-蛋白酶系统类2个、生长因子与细胞因子类1个及其他类相关基因16个。结论:ATRA可引起胶质瘤SHG-44细胞基因表达谱的改变,上述差异表达基因可能不仅介导药物诱导胶质瘤分化的机制,而且调节胶质瘤的演进。     

低剂量辐射对肿瘤细胞凋亡、细胞周期以及凋亡相关蛋白Bcl-2的影响

目的探讨低剂量辐射对小鼠移植肿瘤细胞的凋亡、细胞周期以及Bcl-2的影响。方法昆明种雄性小鼠左后肢腹股沟皮下接种S180肉瘤细胞,接种后7天γ射线全身照射75mGy,照射后24、48小时分别处死直接测量肿瘤大小变化,取肿瘤组织分别进行流式细胞仪分析凋亡、细胞周期以及免疫组化染色半定量分析凋亡相关蛋白Bcl-2表达的变化。结果与直接荷瘤组相比,低剂量照射组肿瘤生长缓慢(P<0.05),24小时后肿瘤细胞阻滞于G1期,Bcl-2蛋白表达下降,48小时后肿瘤细胞凋亡增加(P<0.001)。结论低剂量辐射可使机体肿瘤细胞阻滞于G1期并通过凋亡相关蛋白表达变化导致肿瘤细胞凋亡增加,明显提高机体抗肿瘤的作用,具有肿瘤治疗和辅助放化疗的实际临床意义。     

Budesonide exerts its chemopreventive efficacy during mouse lung tumorigenesis by modulating gene expressions

Budesonide, a glucocorticoid, was proven to be a highly effective agent in preventing the development of lung tumors in A/J mice. In a lung tumor bioassay, budesonide produced 70% inhibition of tumor multiplicity and 94% reduction of total tumor load compared to benzopyrene (B[a]P) treated mice. Gene expression array analysis was performed on mouse lung tumors from this bioassay using Affymetrix U74Av2 GeneChips to determine gene expression changes associated with budesonide treatment. We found 363 genes that were changed between lung tumors induced by treatment with B[a]P and similar tumors treated with budesonide. Among them, 243 genes were overexpressed and 120 genes were underexpressed after budesonide treatment. In addition, 108 genes differentially expressed during mouse lung tumorigenesis (50 genes overexpressed and 58 genes underexpressed) were modulated back to normal levels after budesonide treatment when compared with the controls group. These genes are involved in a broad range of different pathways including control of cell cycle, signal transduction, and apoptosis and may play a role in the observed preventive effect. Our results suggest that budesonide exerts its effects of chemoprevention through growth arrest via Mad2/3 and through apoptosis via Bim/Blk and, by inference, caspase-8/9. Using the pathway visualization tool GenMapp, G protein pathway and MAPK cascade were also regulated by budesonide. Thus, we have determined, for the first time, the expression profiles of genes modulated by budesonide during murine lung tumorigenesis. Our results indicate that the chemopreventive effects of budesonide in the mouse lung tumorigenesis assay involved increase and decrease expression of a wide variety of genes in multiple signaling pathways.     

转染4-1BBL基因的胃癌细胞在小鼠体内的抗肿瘤及免疫调节作用

目的:观察转染4-1BBL基因的小鼠胃癌细胞株MFC的体内致瘤性及其对小鼠免疫功能的影响。方法:通过脂质体介导以重组质粒pMKITneo和pMKITneo/4-1BBL转染小鼠胃癌细胞株MFC。用RT-PCR法检测目的基因的表达。计数法绘制体外培养细胞生长曲线。将转染前后肿瘤细胞,分别接种于615小鼠背部皮下观察其致瘤性。流式细胞仪测定荷瘤小鼠外周血NK、CD4 T和CD8 T细胞数,并测定荷瘤小鼠肿瘤结节内细胞凋亡率。结果:MFC/4-1BBL细胞中可检测到4-1BBLmRNA表达。转染前后肿瘤细胞的体外生长速度无明显变化。MFC/4-1BBL细胞在小鼠体内的致瘤性较MFC/pMKITneo细胞和野生型MFC细胞明显降低。接种MFC/4-1BBL细胞的小鼠外周血NK细胞及CD8 T细胞数明显增多;其肿瘤结节内细胞凋亡率亦明显增高。结论:转染4-1BBL基因后并未影响MFC细胞的体外生长,但其在小鼠体内的致瘤性明显降低。MFC/4-1BBL细胞可诱导荷瘤小鼠体内CD8 T和NK细胞增殖,而且能促进肿瘤细胞的凋亡。