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相似文献
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1.
目的探讨Vitek Compact微生物自动鉴定仪器对1例布鲁菌误鉴定原因及临床影响分析。方法 1例无明显诱因发热患者血培养分离菌株,采用Vitek Compact细菌鉴定系统,形态学、传统手工生化对分离株进行鉴定。采用PCR扩增16S rRNA基因并测序,对所测得的核酸序列进行同源性比对分析。结果从该患者血液中分离到1株缓慢生长的革兰阴性短小杆菌,Vitek Compact鉴定仪器,GN鉴定卡首次鉴定为支气管炎鲍特菌,基于16S rRNA基因序列分析表明,菌株与马耳他布鲁菌或人苍白杆菌核酸匹配度高达100%,完全排除支气管炎鲍特菌的可能。将保存的菌株用Vitek Compact鉴定仪器,GN鉴定卡复检,结果为马耳他布鲁菌。结论 16S rRNA基因序列分析是鉴定临床非发酵革兰阴性杆菌的最有效手段,微生物自动鉴定仪器鉴定慢生长细菌如布鲁菌等有明显局限性,对布鲁菌病等传染病的临床治疗及流行病学调查可产生误导。  相似文献   

2.
目的建立布鲁菌聚合酶链反应(PCR)方法,对其进行应用评价。方法针对布鲁菌外膜蛋白编码基因(omp-2)设计PCR引物,建立PCR方法,利用19种常见细菌和布鲁菌株DNA分别对其进行特异性和敏感度评价,对3株疑似布鲁菌株进行核酸检测,并与分离培养法进行结果比对。结果本研究建立的布鲁菌PCR检测方法仅能检出布鲁菌阳性菌株,对照菌DNA未出现目的条带;敏感度为100拷贝/反应;PCR方法对3株疑似布鲁菌株检出omp-2基因条带,鉴定结果为布鲁菌,与分离培养法结果相同。结论本研究建立了一种布鲁菌PCR检测方法,与分离培养法相比,布鲁菌PCR方法准确、快速,适合布鲁菌病疫情的快速检测。  相似文献   

3.
贾琴妹  杨传莲  黄艳梅 《疾病监测》2020,35(11):1025-1030
目的分析研究VITEK-2 Compact全自动微生物鉴定仪与VITEK MS质谱仪在摩根摩根菌鉴定中的应用及对其鉴定结果的准确性做出评价,为临床精准治疗提供科学依据。方法收集2017年1月至2020年5月云南省第三人民医院送检的不同类型标本中分离出的50株摩根摩根菌;常规方法进行菌株培养;采用VITEK-2 Compact全自动微生物鉴定仪,手工生化补充试验和VITEK MS质谱仪对菌株进行菌种鉴定,鉴定结果不一致的菌株采用16S rDNA测序验证。结果共分离出5株β溶血表型和45株非β溶血表型摩根摩根菌;VITEK-2 Compact全自动微生物鉴定仪对非β溶血摩根摩根菌鉴定结果均符合,对β溶血摩根摩根菌鉴定结果均不符合,且均鉴定为奇异变形杆菌,鉴定符合率为90%;手工生化补充试验结果也符合奇异变形杆菌;VITEK MS质谱仪对非β溶血和β溶血摩根摩根菌的鉴定结果均符合,鉴定符合率为100%;16S rDNA测序对鉴定结果不一致的5株β溶血菌的测序结果均为摩根摩根菌。结论 VITEK-2 Compact全自动微生物鉴定仪对非β溶血摩根摩根菌的鉴定结果准确可信;对β溶血摩根摩根菌鉴定结果均不准确,且鉴定为奇异变形杆菌的概率很高;VITEK MS质谱仪对摩根摩根菌的鉴定结果均准确快速且不受细菌β溶血与否影响。  相似文献   

4.
目的 比较Vitek2 Compact和Walkaway 40全自动微生物鉴定系统在布鲁菌鉴定中的应用。方法 临床分离菌株,采用Vitek2 Compact和Walkaway 40全自动微生物鉴定系统进行鉴定,并将鉴定结果和16S rRNA基因序列检测的结果进行比较。结果 临床分离菌株经Vitek2 Compact GN鉴定卡鉴定为马耳他布鲁菌,Walkaway 40 NC31鉴定卡鉴定为动物溃疡威克斯菌、莫拉菌属等。16S rRNA基因序列分析表明,该临床分离菌株的16S rRNA基因序列与布鲁菌匹配,排除动物溃疡威克斯菌、莫拉菌属等的可能,确定该菌株为马耳他布鲁菌。结论 Vitek2 Compact可以准确的鉴定出布鲁菌,经Vitek2 Compact鉴定为布鲁菌后,可采用分子生物学方法进行佐证,大大地提高了布鲁菌的检出率,降低误诊的可能性。Walkaway 40无法准确的鉴定出布鲁菌,误鉴定会导致错误的治疗并使工作人员处于实验室获得性感染的危险之中。建议使用Walkaway 40的实验室在鉴定出动物溃疡威克斯菌或莫拉菌属等细菌时应谨慎报告,并使用Vitek2 Compact或分子生物学方法进行复查。  相似文献   

5.
目的 分析梅里埃基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization-time of flightmass spectrometry,MALDI-TOF-MS)系统与VITEK 2 Compact 全自动微生物鉴定仪对临床常见病原菌鉴定的一致性。方法 收集福建医科大学孟超肝胆医院2018 年6 月~ 2019 年3 月来自临床不同标本分离的非重复菌株300 株,分别采用梅里埃MALDI-TOF-MS 系统和VITEK 2 Compact 全自动微生物鉴定仪对病原菌进行鉴定,结果不一致菌株采用16SrDNA 基因测序予以确认,比较两种鉴定方法的准确性与一致性,评估两种方法在鉴定16 株大肠埃希菌的时间和经济成本。结果 300 株临床分离菌中,鉴定到种水平的菌株MALDI-TOF-MS 有268 株(89.33%),VITEK 2 Compact 有266 株(88.67%);鉴定到属水平的菌株MALDI-TOF-MS 有297 株(99.00%),VITEK 2 Compact 有297 株(99.00%);两种方法在种属鉴定的一致性分别为82.67% 与98.33%,MALDI-TOF-MS 的准确性略高于VITEK 2 Compact。两种方法鉴定不一致菌株有39 株(13.00%),与16SrDNA 测序鉴定结果相比,MALDI-TOF MS 的准确率(79.49%) 高于VITEK 2Compact(58.97%)。对16 株大肠埃希菌的鉴定,MALDI-TOF-MS 耗时较VITEK 2 Compact 少3.5h,且成本仅为VITEK2 Compact 的2/5。结论 MALDI-TOF MS 与VITEK 2 Compact 对于临床常见病原菌的鉴定结果较为一致,但MALDITOFMS 准确率更高,且更快速与经济。  相似文献   

6.
MALDI-TOF 质谱仪在临床常见细菌鉴定中的应用   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的:探讨两种质谱仪 Biotyper MS 和 Vitek-MS 系统在临床常规分离细菌鉴定中的应用价值。方法收集沈阳军区总医院2012年3月至2013年1月分离自血液、尿液、脑脊液、分泌物和痰液等标本的临床常见菌细菌149株(包括14个菌属和30个菌种)。同时采用两种 MALDI-TOF-MS 系统对上述菌株进行鉴定,结果与 Vitek2 compact 常规生化鉴定进行比较,对3种方法检测结果不一致菌株用16S rRNA 测序进行确认。结果在149株常见细菌中,Bruker Biotype 属和种的正确鉴定率分别为98%和96%,Vitek-MS 属和种的正确鉴定率分别为97%和95%。两者均无错误鉴定菌株。结论对该组常见细菌,两种质谱仪鉴定结果比较差异无统计学意义(P >0.05),均呈现出优异的鉴定水平,适合用于临床微生物的常规鉴定。  相似文献   

7.
目的 探讨两种质谱仪Biotyper MS和Vitek-MS系统在临床常规分离细菌鉴定中的应用价值。方法 收集沈阳军区总医院2012年3月至2013年1月分离自血液、尿液、脑脊液、分泌物和痰液等标本的临床常见菌细菌149株(包括14个菌属和30个菌种)。同时采用两种MALDI-TOF-MS系统对上述菌株进行鉴定,结果与Vitek2compact常规生化鉴定进行比较,对3种方法检测结果不一致菌株用16Sr RNA测序进行确认。结果 在149株常见细菌中,Bruker Biotype属和种的正确鉴定率分别为98%和96%,Vitek-MS属和种的正确鉴定率分别为97%和95%。两者均无错误鉴定菌株。结论 对该组常见细菌,两种质谱仪鉴定结果比较差异无统计学意义(P>0.05),均呈现出优异的鉴定水平,适合用于临床微生物的常规鉴定。  相似文献   

8.
目的评估Vitek 2 Compact全自动微生物鉴定药敏分析仪对临床相关革兰阴性菌和革兰阳性菌的药敏测定能力。方法选取89株北京协和医院临床菌株(革兰阴性菌48株,革兰阳性菌41株)和66株本实验室保存的参考菌株(革兰阴性菌41株,革兰阳性菌25株)为评估菌株,分别采用Vitek 2 Compact AST-GN09(革兰阴性菌)、AST-P536(葡萄球菌)、AST-P534(肠球菌和无乳链球菌)和AST-P533(肺炎链球菌)药敏卡进行药敏测定,测定结果与参考方法Etest结果进行对照。32株以CLSI纸片确证法检测为ESBL阳性的菌株(其中包括16株经PCR扩增测序确定产SHV或CTX-M型ESBLs的菌株),以Vitek 2 Compact检测其是否产ESBLs。结果根据临床和实验室标准协会(CLSI)规定的药敏折点,对Vitek 2 Compact和Etest法测得的药敏结果进行解释,在全部的1626株细菌一抗生素组合中,Vitek 2 Compact药敏测定的标准符合率(CA)为90.83%,严重错误(VME)为4.91%,重大错误(ME)为2.09%,一般错误(MIE)为6.40%。90%以上的肠杆菌科菌、非发酵糖菌、微球菌科菌和链球菌科菌分别在11、13、11和12h内完成测定。32株ESBL阳性菌以Vitek 2 Compact检测均为阳性。结论Vitek 2 Compact能够对临床相关革兰阴性菌和革兰阳性菌的药物敏感性进行准确、快速的测定,对ESBLs检测的敏感性、特异性高,是临床微生物实验室的有利工具。  相似文献   

9.
摘要 目的 评价基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对大肠埃希菌菌群的鉴别能力。方法 通过VITEC 2 Compact全自动细菌鉴定仪及药敏分析系统对人和动物源性的大肠埃希菌敏感菌株进行初步筛选,然后将获得的21株人源和42株动物源性大肠埃希菌进行16S rRNA基因测序及同源性分析,同时通过MALDI-TOF MS技术对大肠埃希菌指纹图谱进行鉴定。结果 与16S rRNA基因测序相比,不同来源的菌株蛋白质特征图谱呈现明显的分群趋势,MALDI-TOF MS法对不同来源的菌株具有较强的鉴别区分能力。结论 MALDI-TOF MS法可用于菌株来源差异性的鉴别。  相似文献   

10.
目的探讨用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)快速鉴定引起血流感染的大肠埃希菌。方法用SELDI-TOF-MS建立大肠埃希菌的蛋白质指纹模型。临床分离的168株菌经SELDI-TOF-MS检测,数据与大肠埃希菌模型进行相似度比较,对该模型进行评价。SELDI-TOF-MS检测88株微生物血培养分析仪阳性报警的革兰阴性杆菌,与大肠埃希菌蛋白质指纹模型进行相似度比较,对其中的大肠埃希菌进行鉴定。结果 19株建模组菌株经PCR及测序鉴定均为大肠埃希菌,并建立了该菌的蛋白质指纹模型;用168株验证组菌株对该模型进行验证,对大肠埃希菌鉴定的符合率为100%(60/60);用该模型对88株引起血流感染的革兰阴性杆菌进行鉴定,鉴定结果与传统微生物学鉴定结果具有较高的一致性(k=0.905)。结论 SELDI-TOF-MS可快速鉴定引起血流感染的大肠埃希菌,为血流感染细菌的快速诊断提供了新技术。  相似文献   

11.
目的了解基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对链球菌属临床菌株的鉴定能力。方法收集2015-2019年同济大学附属东方医院临床分离的链球菌,16SrRNA基因测序确定细菌种类。采用直接涂抹法平行使用Autof MS1000型质谱仪、VITEK MS质谱鉴定系统及Bruker Biotyper系统对菌株进行质谱鉴定。结果134株链球菌属细菌中,3套质谱鉴定系统对无乳链球菌、化脓链球菌、解没食子酸链球菌、戈登链球菌及变异链球菌的准确鉴定率均为100%。Bruker Biotyper和Autof MS1000型质谱仪对21株停乳链球菌及14株星座链球菌未能鉴定到亚种,5株缓症链球菌鉴定为口腔链球菌,肺炎链球菌和咽峡炎链球菌各有1株鉴定错误;Autof MS1000型质谱仪鉴定链球菌种水平置信度高于Bruker Biotyper系统。VITEK MS质谱鉴定系统可鉴定停乳链球菌的部分亚种,但14株星座链球菌未能鉴定到亚种,7株缓症链球菌鉴定为缓症链球菌/口腔链球菌,2株咽峡炎链球菌分别鉴定为星座链球菌和肺炎链球菌。结论3套质谱鉴定系统对链球菌属中临床常见的无乳链球菌、化脓链球菌可准确鉴定、直接报告,但是对一些种类菌株鉴定结果有误或不能鉴别亚种,需要DNA序列分析或结合血清学或其他补充实验来准确鉴定。  相似文献   

12.
目的 评价MALDI-TOF MS在临床常见细菌快速鉴定中的应用.方法 选择浙江大学医学院附属第二医院2008年12月至2009年8月分离自血液、痰液、分泌物和尿液的临床常见细菌和浙江省疾病预防与控制中心收集的沙门菌共426株.包括革兰阳性球菌76株和革兰阴性杆菌350株.采用Vitek系统将细菌鉴定到种,血清凝集试验对沙门菌和志贺菌进行血清分型.PCR扩增91株细菌的16S rDNA基因并测序,所得核苷酸序列与GenBank中的数据库进行比对,确定细菌种类.用MALDI-TOF MS对所有细菌进行快速鉴定,比较不同鉴定方法 之间的符合情况.结果 除沙门菌和志贺菌外的所有革兰阳性球菌和革兰阴性杆菌的Vitek和MALDI-TOF MS两者的鉴定结果 完全符合.23株沙门菌中只有2株肠炎沙门菌鼠伤寒血清型的3种鉴定方法 结果 相符,另有1株伤寒沙门菌、3株甲型副伤寒沙门菌、1株乙型副伤寒沙门菌、1株肠炎沙门菌和1株肠炎沙门菌病牛血清型的血清凝集结果 与16s rDNA基因测序结果 相符.Vitek及血清凝集试验鉴定为福氏志贺菌的4株菌16s rDNA基因测序和MALDI-TOF MS的鉴定结果 均为大肠埃希菌.结论 MALDI-TOF MS可快速、准确地对细菌进行鉴定,具有良好的重复性,但对沙门菌和志贺菌效果不佳.  相似文献   

13.
肖洁  宋建  彭涛 《国际检验医学杂志》2013,34(21):2883-2885
目的 探讨16SrDNA基因测序方法在鉴定采血耗材中未知细菌污染方面的应用价值.方法 对15例采血原辅耗材样本进行采样、分离、纯化培养.可疑阳性标本进一步采用16SrDNA基因测序检测,同时用表皮葡萄球菌标准菌株作为实验阳性对照.结果 15例样本中有3例细菌培养可疑阳性,PCR扩增其16SrDNA片段,测序结果与GenBank比对,分别与Macrococcus caseolyticus strain(巨型球菌)、Klebsiella pneumoniae(肺炎克雷伯菌)与Bacillus thuringiensis(苏云金芽孢杆菌)的同源性为99%.表皮葡萄球菌标准菌株16SrDNA基因测序结果与来源一致.结论 16SrDNA基因测序方法可用于血制品耗材中未知细菌的污染检测,在菌株鉴定方面有快速、特异的优势.  相似文献   

14.
目的探讨基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)系统用于快速鉴定临床分离菌的可靠性和实用性。方法收集南京军区南京总医院2013年7~10月自临床标本分离的非重复细菌1 061株,分别使用MALDI-TOF MS和Vitek 2 Compact全自动细菌鉴定仪系统进行鉴定,结果不一致的菌株采用16S r DNA测序验证。结果 1 061株临床分离菌中1 058株(99.7%)经MALDI-TOF MS系统正确鉴定到属水平,1 016株(95.8%)正确鉴定到种,其余3株(0.3%)未给出鉴定结果。5株鉴定结果不一致的菌株经16S r DNA测序确认,结果与MALDI-TOF MS和Vitek 2 Compact鉴定符合率分别为40.0%(2/5)和0(0/5)。结论 MALDI-TOF MS可以作为一个快速、准确和价廉的工具应用于临床分离菌的鉴定。  相似文献   

15.
临床分离洋葱伯克霍尔德菌鉴定方法的探讨   总被引:7,自引:0,他引:7  
目的:探讨建立简便、实用鉴定临床分离洋葱伯克霍尔德菌的方法。方法:对临床分离的38株菌和4株标准菌株用表型和洋葱伯克霍尔德菌群特异引物聚合酶链反应(PCR)进行鉴定确认,再用由三糖铁琼脂、氧化酶试验、产黄色素、触酶试验、纸片扩散法抗生素谱组成的方法进行鉴定。结果:PCR扩增阳性菌在三糖铁琼脂上均不利用葡萄糖且氧化酶阳性、触酶延迟反应,抗生素谱中亚胺培南耐药、头孢呋辛、复方新诺明敏感或中度耐药。在PCR阴性组中仅1株临床菌触酶延迟反应,鉴定为伯克霍尔德菌属细菌。结论:利用三糖铁琼脂、氧化酶试验、触酶试验、抗生素耐药谱可对洋葱伯克霍尔德菌鉴定到种水平。  相似文献   

16.
目的比较MicroflexTM基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)和Vitek 2 Compact全自动微生物分析系统(简称Vitek 2 Compact)对肠杆菌科细菌的鉴定能力。方法采用MicroflexTMMALDI-TOF MS和Vitek 2 Compact同时对545株肠杆菌科质控菌株和临床分离菌株进行鉴定,鉴定结果不一致者采用沙门菌血清凝集试验或细菌16S r DNA基因测序予以确证。结果 MicroflexTMMALDI-TOF MS对545株细菌的种和属的鉴定率分别为97.1%、2.9%。Vitek 2 Compact对545株细菌的种、群、属的鉴定率分别为83.3%、13.9%和2.2%,鉴定错误率为0.2%,未鉴定率为0.4%。结论 MicroflexTMMALDI-TOF MS对肠杆菌科细菌的鉴定符合率高于Vitek 2 Compact,且操作快速、简便,成本低,可用于临床肠杆菌科细菌的常规快速鉴定。  相似文献   

17.
目的 应用MALDI-TOF MS鉴定临床常见病原菌.方法 复苏560株临床分离株,其中革兰阳性细菌(G+ )260株、革兰阴性细菌(G-)180株、酵母菌60株、肠道致病菌60株.MALDI-TOF MS鉴定结果与Vitek2 Compact全自动微生物鉴定系统比对,结果差异菌株采用16S rDNA测序验证.结果 MALDI-TOF MS与Vitek2 Compact鉴定结果比较,G+细菌鉴定符合率为94.6%( 246/260),G-细菌鉴定符合率为96.7% (174/180),酵母菌鉴定符合率为95.0% (57/60),肠道致病菌鉴定符合率为93.3%( 56/60).15株鉴定结果不符的菌株经16S rDNA测序确认,结果与Vitek2Compact和MALDI-TOF MS鉴定符合率分别为26.7% (4/15)和66.7%( 10/15).结论 MALDI-TOF MS可用于常见病原微生物鉴定,其快速、低成本的特点具有推广价值.  相似文献   

18.
目的研究临床分离自新生儿的耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌的耐药性及碳青霉烯酶耐药基因类型。方法收集2013年12月至2015年12月南宁市2家妇幼保健院住院新生儿临床分离碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌8株。使用生物梅里埃公司的VITEK-2Compact全自动细菌鉴定仪对细菌进行鉴定以及菌株最低抑菌浓度(MIC)检测。改良Hodge试验筛选碳青霉烯酶阳性菌株,乙二胺四乙酸(EDTA)纸片增效试验筛选产金属酶菌株。PCR扩增碳青霉烯酶基因(KPC、GES、SME、NMC、IMI、IMP、NDM-1、VIM、SIM),并对PCR阳性产物测序鉴定,测序结果与GenBank数据库进行比对。结果药敏结果显示,8株耐药菌株对大部分临床常用抗菌药物高度耐药,对氟喹诺酮类抗菌药物和氨基糖苷类抗菌药物有较高的敏感性。表型确认试验显示,6株改良Hodge试验阳性,7株EDTA协同试验阳性。8株碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌均携带IMP-4碳青霉烯酶基因,未检出KPC、GES、SME、NMC、IMI、NDM-1、VIM、SIM型碳青霉烯酶基因。结论本地区新生儿碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌对多种抗菌药物的耐药率较高,新生儿临床分离碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌主要耐药机制是产B类碳青霉烯酶,IMP-4是其主要酶型。  相似文献   

19.
目的 应用小片段PCR产物对布鲁菌进行快速种属鉴定.方法 收集2008年1月至2009年6月在吉林省松原地区从92例布鲁菌病患者血液中分离出的布鲁菌13株,其中羊布鲁菌9株,牛布鲁菌2株,猪布鲁菌2株.根据布鲁菌属细菌重复插入序列IS711及羊布鲁菌、牛布鲁菌及猪布鲁菌种间特异性基因片段设计引物,对3株布鲁菌标准菌株及13株临床分离布鲁菌分别进行PCR反应,获得相应PCR产物.将PCR产物T-A克隆并进行测序分析.对布鲁菌标准菌株DNA模板进行稀释,对每一稀释度的DNA模板分别进行10次PCR扩增,进行灵敏度和稳定性检测.结果 4种PCR反应均可获得特异的小片段PCR产物,片段长度分别为63、67、81和83 bp,T-A克隆测序结果 与目的 基因片段比较,符合率为100%,检测模板的最低DNA浓度为1 μg/L,分别用不同的引物对相应布鲁菌DNA模板进行10次PCR扩增,均得到预期结果 .结论 本研究建立的PCR反应能鉴定布鲁菌种属,具有良好的特异性、灵敏度和稳定性.  相似文献   

20.
目的建立铜绿假单胞菌的蛋白指纹诊断模型,为细菌的快速鉴定奠定基础。方法利用表面增强激光解析电离飞行时间质谱检测20株铜绿假单胞菌的细菌蛋白,筛选稳定表达的蛋白峰,将其数据导入自建Fingerwave软件建立铜绿假单胞菌的蛋白指纹诊断模型。收集临床分离的126株细菌,对模型的诊断能力进行评价,确定铜绿假单胞菌的鉴定阈值并应用模型对铜绿假单胞菌进行鉴定。结果建立了铜绿假单胞菌的蛋白指纹诊断模型.开4用临床菌株对建立的模型进行评价,确定该模型鉴定阈值为70%,对铜绿假单胞菌鉴定结果与传统微生物学鉴定方法及分子生物学结果相比符合率为97.7%(42/43)。结论应用细菌蛋白指纹模型可快速对铜绿假单胞菌细菌进行鉴定,为细菌感染的快速诊断提供了可能性。  相似文献   

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