浅议抗肿瘤药物的筛选策略

随着分子生物学和分子肿瘤学的发展,人们对肿瘤细胞恶化过程中许多新靶点有了进一步的了解,并且针对这些靶点研究和开发了许多新的天然抗肿瘤药物.本文主要举几种筛选方法的例子进行说明,并对其发展趋势进行展望.     

基于网络药理学研究黄芪-白术治疗新冠肺炎的作用机制

目的采用网络药理学的方法探讨黄芪-白术治疗新型冠状病毒肺炎(新冠肺炎)的作用机制。方法利用TCMSP数据库对黄芪-白术活性成分和作用靶点进行查找与筛选,获得黄芪-白术的有效活性成分和作用靶点,用Cytoscape 3.7.2软件绘制黄芪-白术的有效活性成分-作用靶点网络;利用GeneCards数据库获取新冠肺炎作用靶点,利用Venny 2.1.0在线工具,获得黄芪-白术与新冠肺炎共同作用靶点(即是黄芪-白术治疗新冠肺炎的作用靶点);利用String数据库构建和分析共同作用靶点互作网络;最后利用R软件对共同作用靶点进行GO和KEGG富集分析。结果通过对黄芪-白术活性成分、作用靶点查找与筛选,获得黄芪-白术有槲皮素、山奈酚、蛇床子素、毛蕊异黄酮等19个有效活性成分,作用靶点189个,并绘制出黄芪-白术的有效活性成分-作用靶点网络图;用GeneCards数据库获取新冠肺炎作用靶点259个,经过Venny 2.1.0在线工具分析,获取41个黄芪-白术与新冠肺炎共同作用靶点;GO和KEGG富集分析提示:黄芪-白术参与细胞因子受体结合、细胞因子活性、受体配体活性、磷酸酶结合等生物学过程,可能通过调...     

基于网络药理学和分子对接的时疫清瘟丸治疗新冠肺炎潜在机制研究

目的 基于网络药理学和分子对接,探讨时疫清瘟丸治疗新冠肺炎的潜在分子机制.方法 使用化合物数据库和疾病数据库对时疫清疫丸的化合物和治疗疾病靶点进行筛选,进而构建药物-活性成分-疾病靶点网络并对疾病靶点关系进行拓扑学分析,然后使用中药抗新型冠状病毒肺炎药效预测分析平台对时疫清瘟丸治疗重症新冠肺炎的效果进行预测.最后进行G...     

氧化应激与动脉粥样硬化研究进展

近年来许多研究发现，氧化应激与致动脉粥样硬化危险因素的关系并不十分密切，但是却能在心血管系统受损后诱导其组织重构，对其病理发展具有促进作用，该结论丰富了动脉粥样硬化发病机制的理论。我们对这一作用进行阐述，为寻找新的改善动脉粥样硬化的药物提供新靶点。     

抗血小板药物研究进展

 目的 综述抗血小板药物的应用现状和研究进展。方法 在总结国内外文献的基础上,对临床上现有的抗血小板药物以及正在研究中的新的抗血小板药物及其新靶标进行总结和分析。结果与结论 抗血小板药物开发是一个热门的研究领域,当前对血小板生物学以及对血小板黏附、活化和聚集相关的机制以及药物作用的潜在靶点有了越来越多的了解,笔者主要从影响血小板黏附、活化扩增,抑制血小板聚集及抗血小板作用新靶点等方面进行综述,并对未来开发出具有临床作用的新靶点的抗血小板药物,为血栓栓塞性疾病提供安全、有效的药物治疗进行展望。
     

调血脂药物的研究进展

 目的 介绍调血脂药物及其治疗靶点的研究进展,为其深入研究提供参考。方法 对近年来有代表性的文献进行综 述。结果 由于医学及分子生物学的发展,出现了许多针对调血脂的治疗靶点,也有许多药物正处于临床前研究阶段。结论 目前临床上常用的较为有效、不良反应较小的调血脂药物仍为他汀类药物,因此开发针对多靶点的不良反应小、疗效确切 的调血脂药物对于广大医药工作者面临巨大的挑战。     

天然产物来源的抗HIV-1多靶点抑制剂研究进展

在复杂疾病的治疗过程中,发现使用单靶点药物治疗越来越难得到预期的疗效。基于系统生物学和网络药理学的发展,对于复杂疾病的发病机制和病理过程的研究更加深入透彻,发现使用多靶点药物治疗复杂疾病能够克服单靶点药物的许多缺陷。多靶点药物包括多组分多靶点药物和单组分多靶点药物,而单组分多靶点药物较多组分多靶点药物更有优势。艾滋病的治疗是当今世界难题,先后采用单靶点药物和多组分多靶点联合用药(高效抗逆转录疗法)治疗艾滋病,但是由于病毒的高度变异性和药物严重的毒副作用制约了2种疗法的广泛应用,因此开发低毒、高效的单组分多靶点抗免疫缺陷病毒1型(HIV-1)药物成为治疗艾滋病的重要方向。抗HIV-1单组分多靶点药物主要通过合理药物设计合成或筛选得到,其中天然产物来源广泛,种类繁多,不乏抑制HIV-1的活性化合物,是发现抗HIV-1多靶点先导化合物的重要途径。对天然产物来源的具有多靶点抗HIV-1活性的化合物进行了综述。     

促进低密度脂蛋白受体基因表达药物的最新进展

 目的介绍提高和促进低密度蛋白受体(low density lipoprote in receptor,LDLR)基因表达药物的研究进展,提出提高LD-LR转录和转录后水平可作为开发降脂药物的一个新靶点,从而预防高胆固醇血症和动脉粥样硬化(atherosc lerosis,AS)的发生。方法以国内外发表的论文为材料,按药物对提高LDLR转录和转录后水平等分别予以介绍。结果与结论研究证实,许多药物可提高和促进LDLR基因表达,使血中LDL水平降低。本文提出提高LDLR转录和转录后水平可作为开发降脂药物的一个新靶点,从而预防高胆固醇血症和AS的发生。     

英发现一个乳腺癌治疗新靶点

<正>英国研究人员日前宣布发现一个有助治疗乳腺癌的新靶点。动物实验显示,如能影响这个靶点,可以增强现有药物的作用,使肿瘤显著缩小。英国帝国理工学院的贾斯廷·斯特宾教授等人在新一期英国学术期刊《自然—医学》上报告说,目前常用他莫西芬等药物来治疗乳腺癌,但许多病人的肿瘤逐渐出现耐药     

基于网络药理学与化学成分研究的连花清瘟胶囊治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）作用机制探讨＊

目的 通过网络药理学与分子对接的方法，根据最新研究进展，探讨连花清瘟胶囊治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的作用机制。方法 纳入相关化学成分研究，从中明确连花清瘟胶囊内所含有的化学成分与入血成分信息；于TCMSP、STITCH数据库搜索药物作用靶点蛋白后使用UniProt数据库进行相关转化；通过GeneCards、DisGeNET、UniProt数据库筛选COVID-19相关靶点，同时利用PubMed数据库搜索SARS-CoV-2病毒全基因组信息；将药物有效成分作用靶点与疾病靶点比对筛选后构建连花清瘟内有效化合物治疗COVID-19的核心成分-靶点相互作用网络图；利用STRING平台对核心靶点进行PPI网络分析，找出关键靶点信息；使用CytoScape插件ClueGo对核心靶点进行GO功能富集分析与KEGG通路富集分析；将核心成分与相关受体通过Autodock Vina软件进行分子对接分析。结果 筛选出连花清瘟胶囊中25个活性成分和146个潜在靶点，新冠肺炎相关靶点为122个，经比对后选出与连花清瘟胶囊治疗新冠肺炎核心作用靶点为26个；通过PPI网络数据选出IL6、IL10、TNF、CCL2、DPP4等核心靶点，KEGG通路与GO富集分析筛选出17条信号通路，7个相关的生物进程；分子对接结果显示大黄素、芦荟大黄素、山奈酚、芦丁等成分同与ACE2结合的SARS-CoV-2刺突蛋白受体结合域结合能较强。结论 通过网络药理学证实了连花清瘟胶囊多成分、多靶点、整体调节的作用特点，预测了LQC治疗COVID-19的主要可能的作用机制，为其活性成分研究和实验研究提供理论依据，并有助于阐明连花清瘟胶囊对新冠肺炎的治疗原理。     

基于数据挖掘和网络药理学探究中医药治疗新型冠状病毒感染初期的用药规律和作用机制

目的：基于数据挖掘分析中医药治疗新型冠状病毒感染（简称新冠感染）初期的用药规律,同时采用网络药理学分析高频药物治疗新冠感染初期的潜在作用机制。方法：检索中国知网、万方、维普中文期刊和中国生物医学文献数据库中2019年12月12日―2022年12月10日中医或中西医结合治疗新冠感染初期的文献,对文献中所涉及的方剂进行筛选、整理,采用R语言对药物组成进行频数分析、关联规则分析及聚类分析;从中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）数据库和Gene Cadrs等数据库中分别获得药物和新冠感染相关靶点,利用Venny取交集后通过Cytoscape 3.9.1制作药物-成分-靶点网络;将共同靶点上传STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用（Protein-protein Interaction,PPI）网络分析;运用Metascape数据库对共同靶点进行京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路和基因本体论（GO）功能富集分析。结果：共收集到中医药治疗新冠感染初期的处方42首,高频药物有苦杏仁、广藿香、茯苓、麻黄、半夏、黄芩等17味中药;关联规则分析关联系数高的药物组合分别为半夏-麻黄-桂枝...     

抗良性前列腺增生药物作用靶点的研究进展

 目的综述抗良性前列腺增生(BPH)药物作用靶点的基本生物学特征、与前列腺增生的关系。方法查阅近年来相关文献,对其进行分析、归纳和整理。结果与结论BPH的发病机制比较复杂,与多种酶和受体有关。近年来抗BPH的药物类别越来越多,其中有不少是作用于新的靶点,也发现了一些已知靶点的新作用。这些靶点主要包括:5α-还原酶、α₁肾上腺素受体、磷酸二酯酶5、糖酵解酶、芳香化酶、生长因子和内皮素。     

无标记小分子探针技术与中药靶点发现

靶点的确定是阐明中药作用机制的核心,是构建化学成分与药效作用相关性的关键。鉴于中药的多样性、化学成分的复杂性,传统的靶点筛选方法有所局限,靶点发现已成为中药机制研究的瓶颈。无标记小分子探针技术是化学蛋白组学领域的新兴技术,其突出特点为无需对小分子成分进行结构修饰与改造,普适于复杂的中药化学成分,同时该方法基于蛋白质组进行靶点筛选,利于发现中药作用的新靶点、新途径。鉴于该方法在中药研究中的应用潜力,该文综述了其分析原理与应用现状,总结了其一般性分析步骤,以促进该方法在中药化学成分靶点阐明中的应用。     

基于网络药理学探讨新加疏调汤治疗胃癌的分子生物学机制研究

胃癌属于恶性肿瘤的一种,在中国地区发病率较高,并且临床上预后多数较差,为了提高胃癌患者的生活质量,证明新加疏调汤在临床上对胃癌患者的有效性,故于此进行作用分析。新加疏调汤是国医大师张震根据人体气机的基本理论,加之临床实践得出的疏调气机汤加减而来,去山药,易枳实为枳壳,更加符合治疗胃癌的性质,经过实践证明了其有效性,故而通过药理学理论说明其作用机制。本研究使用中医药整合药理学研究平台（TCMIP）V2.0获取新加疏调汤的化学成分及其对应靶点,通过GeneCards数据库获得胃癌的靶点信息,创建药物与疾病的核心靶点网络。使用Hiplot网站进行基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析,通过TCGA数据库获得部分核心靶点所对应基因在患者和正常人中的表达情况,对主要成分进行吸收、分布、代谢、排泄和毒性（Absorption,Distribution, Metabolism,Excretion,Toxicity,ADMET）水平分析、类药性定量评估（Quantitative Estimate of Drug-likeness,QED）,随后得到新加疏调汤287个化学成分,...     

蛋白质组学技术与药物作用新靶点研究进展

 目的阐述蛋白质组学技术和方法学的最新进展及其在药物作用新靶点发现中的应用。方法阅读国内外近年来相关的文献资料,进行整理,分析归纳和综合评价。结果和结论蛋白质组学技术和方法不断成熟,在药物作用靶点的探测、验证和优化方面起到了重要的作用,提高了药物发现的效率。     

基于网络药理学和分子对接技术的银柴胡解热作用机制探讨

目的：采用网络药理学与分子对接技术探讨银柴胡解热作用的机制。方法：借助中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、中医药整合药理学研究平台（TCMIP）和中药分子机制生物信息学分析工具（BATMANTCM）筛选银柴胡活性成分和相关作用靶点;使用GeneCards、OMIM和TTD数据库筛选发热相关靶点;通过STRING数据库构建活性成分靶点与发热疾病靶点蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络;利用Cytoscape软件的Network Analysis插件对获得的PPI网络进行拓扑分析,筛选核心节点;使用Venny软件获得银柴胡活性成分靶点、发热疾病靶点和核心节点的交集靶点,并通过进一步的拓扑分析筛选得到关键成分和关键靶点;通过DAVID数据库进行基因本体（GO）功能注释和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;利用Schr?dinger软件对关键靶点与对应的关键成分进行分子对接。结果：银柴胡解热关键成分为银柴胡胺D和银柴胡新木质素-β-D-葡萄糖苷A～D,71个关键靶点主要包括促丝裂原活化蛋白激酶10 (MAPK10)、蛋白激酶B1 (Akt1)、热休克蛋白90AA1(HS...     

宣肺化浊方治疗新型冠状病毒感染肺炎的网络药理学分析

目的:通过网络药理学以及现代药理学基础分析探讨宣肺化浊方治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用靶点及信号通路,阐述其可能的作用机制。方法:从TCMSP和BATMAN-TCM数据库搜索宣肺化浊方各中药的化合物及靶点,使用GeneCards,NCBI以及CTD数据库检索COVID-19靶点;通过STRING数据库构建蛋白质相互作用网络。采用Cytoscape3. 7. 0软件构建中药-归经网络图以及中药-化合物-关键靶点-疾病网络,利用Omicshare平台对共有靶点进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析及基因本体(GO)分析。除此之外,检索多脏器损伤、免疫损伤以及重症急性呼吸综合征(SARS)的疾病靶点,将宣肺化浊方与之做映射,计算交集靶点占宣肺化浊方靶点的比例。结果:宣肺化浊方共10味中药,其中有6味归肺经,5味归脾经,5味归胃经。化合物共409个,相对应的靶标2 271个。宣肺化浊方的靶点与新冠肺炎有8个相同的炎症因子,每个炎症因子对应多个化合物。宣肺化浊方与COVID-19有135个交集靶点,筛选得到36个关键靶点。KEGG通信号通路富集筛选得到172条信号通路(P0. 05),GO分析得到生物过程结果有4 000个,细胞组成有254个,分子功能有408个(P0. 05))。宣肺化浊方与各脏器损伤靶点和免疫损伤靶点的共有靶点较多,且共有靶点/XFHZP靶点的比例在7. 6%～97. 8%,宣肺化浊方与SARS有173个交集靶点。结论:宣肺化浊方可能通过发挥抗炎、保护脏器损伤、免疫等作用治疗新冠肺炎,这将为治疗新冠肺炎药物的开发提供一定的理论依据。     

线粒体ATP合酶中寡霉素敏感相关蛋白的研究进展

 目的阐述线粒体ATP合酶中寡霉素敏感相关蛋白(OSCP)的位置、结构、功能及其在药理学中作为分子靶点的研究。方法根据近年文献资料对寡霉素敏感相关蛋白的位置、结构、功能及其作为分子靶点的研究进行综述。结果与结论寡霉素敏感相关蛋白位置、结构及功能方面的阐述是其作为分子靶点方面研究的基础,分子靶点的研究将成为分子治疗学的一个新关注点。     

基于整体化学和生物效应谱推演的中药靶点研究新模式及应用

中药的生物靶点是中药和机体互作的核心元件,明确中药靶点对阐明中药的物质基础和作用机制至关重要。通过对中药和靶点的作用方式进行总结和定义,系统阐述了当前中药靶点研究发现的思路和方法,评述其特点和缺陷,在此基础上,将几种思路凝练整合,提出一种“基于整体化学和生物效应谱推演的中药靶点研究新模式”,综合“化学性”和“生物性”对中药靶点作用路径进行系统研究,并对新模式在中医药领域的应用进行总结,为中药分子作用机制研究提供更加系统的思路和框架。     

新型抗凝药物研发进展

静脉血栓形成及栓塞是严重危害人类健康的疾病,是继急性冠脉综合征与脑卒中之后第三大心血管疾病.随着对凝血与血栓形成机制、静脉栓塞发病机制,及普通肝素、低相对分子质鼍肝素、华法林等传统用药研究与了解的进一步深入,以凝血因子靶点Ⅹa、Ⅱa、Ⅸa,以及Ⅲ(TF)/Ⅶa特异性抑制为基础的新抗凝药物研发取得了很大进展.同时,理想的抗凝约物标准为新型药物研发提出了更高的要求,靶点选择、获益与风险、效应与毒性评价等许多问题更值得关注.综述静脉血栓形成原因与机制,传统用药,以及新药研发靶点与研发进展、研发注意事项.