宏基因组二代测序在重症肺炎病原学诊断中的价值

目的探讨宏基因组二代测序（mNGS）对重症肺炎患者病原学诊断的价值。方法选择2021年5月至2023年5月宁波市泌尿肾病医院收治的60例重症肺炎患者。收集肺泡灌洗液5~10mL分别行常规检测与mNGS检测。比较mNGS检测与常规检测病原微生物阳性率。结果mNGS检测病原微生物阳性率为81.67%,显著高于常规检测的58.33%（P=0.002）。mNGS检测细菌阳性率为53.33%,显著高于常规检测的35.00%（P=0.005）;检测真菌阳性率为36.67%,显著高于常规检测的20.00%（P=0.005）;检测病毒阳性率为21.67%,显著高于常规检测的8.33%（P=0.011）。结论mNGS对重症肺炎病原学诊断阳性率较高,具有临床意义。     

经鼻和经气管插管支气管肺泡灌洗在病原学诊断及耐药率监测中的应用比较

目的 通过比较经鼻和经气管插管行支气管肺泡灌洗培养的病原菌检测及耐药特征,探索支气管肺泡灌洗在诊断肺部感染病原学及耐药率监测中的应用。 方法 回顾性分析比较2013年1月-2015年12月广西医科大学第四附属医院各科肺部感染住院患者经鼻和经气管插管行支气管肺泡灌洗(BAL)培养的病原菌检测及耐药率情况,用SPSSS 19.0及WHONET 5软件进行数据统计分析。 结果 3年期间行支气管镜纤维支气管肺泡灌洗1 332例,其中经鼻BAL(A组)207例、经气管插管BAL(B组)1 125例,ICU+神经外科监护室占标本总量84.5%。2组灌洗液涂片合格率及致病菌检出率差异均无统计学意义(P>0.05)。除了鲍曼不动杆菌外,2组病原菌的分布构成比差别不大(P>0.05),但2组分离的病原菌对常用抗菌素的耐药率有所差别。 结论 经鼻和经气管插管行支气管肺泡灌洗BAL涂片合格率及致病菌检出率均无差别,经鼻和经气管插管行支气管肺泡灌洗对肺部感染病原学的诊断和耐药率监测均具有较高的临床应用价值。      

宏基因组二代测序在重症肺炎肺泡灌洗液中的检测优势

目的：探讨宏基因组二代测序(mNGS)在重症肺炎肺泡灌洗液中的检测优势。方法：选取2019年12月至2021年10月在武汉大学中南医院收治的70例重症肺炎患者,所有患者均已行mNGS和传统培养(肺泡灌洗液培养、痰培养),回顾性分析mNGS在重症肺炎患者中病原体检测的优势。结果：mNGS病原体检测的阳性率高于传统培养(98.6%vs 62.9%,P<0.001)。在传统培养阴性而mNGS阳性的患者中,mNGS能进一步识别出多种病原体感染。在病原体分布上,mNGS检出细菌71株、真菌39株和病毒3株。在混合感染中,mNGS诊断阳性率更高(67.1%vs 12.9%,P<0.001)。此外,在合并基础疾病的患者中,mNGS有更高的病原体检出率(98.0%vs 69.4%,P<0.001),尤其在合并免疫低下的患者中,mNGS可识别出特殊病原体（肺孢子菌、巨细胞病毒）感染。结论：mNGS可以提高重症肺炎患者病原微生物的检出率,可作为传统培养阴性的重症肺炎患者的补充检测技术。mNGS在混合感染诊断中有优势,能同时识别多种病原体感染。临床上,推荐合并免疫缺陷的重症肺炎患者尽早应用...     

宏基因组二代测序技术对AECOPD患者病原学诊断价值

目的：探究宏基因组二代测序技术（mNGS）对感染导致的慢性阻塞性肺疾病急性加重（AECOPD）患者病原学诊断价值。方法：AECOPD患者58例,观察组38例采集肺泡灌洗液同时作mNGS检测和细菌培养;对照组20例采集肺泡灌洗液仅作细菌培养。结果：观察组mNGS检测病原体阳性率（94.7%）高于灌洗液培养（31.6%）,差异具有统计学意义（χ2=22.04,P<0.01）。观察组平均住院时间9.89±2.01天,短于对照组的12.00±2.74天,差异具有统计学意义（t=3.344,P<0.01）。结论：mNGS对AECOPD患者病原学检测较传统方法更敏感,有助于更早获得致病菌信息,及时调整抗感染治疗。     

二代基因测序技术联合半乳甘露聚糖检测对重症肺炎合并真菌感染的诊断价值

目的 探究二代基因测序技术（NGS）联合半乳甘露聚糖（GM）检测对重症肺炎合并真菌感染的诊断价值。方法 选取2020年3月—2023年3月大庆龙南医院急诊重症监护室收治的重症肺炎患者148例。收集支气管肺泡灌洗液行病原微生物培养及肺泡灌洗液NGS检测,同期行血清GM检测。以病原微生物培养为金标准,分析血清GM及肺泡灌洗液NGS诊断重症肺炎合并真菌感染的敏感性、特异性,评估血清GM检测、肺泡灌洗液NGS检测单独及联合诊断重症肺炎合并真菌感染结果与病原微生物培养结果的一致性。结果 148例重症肺炎中合并真菌感染30例,其中肺孢子菌10例、白色念珠菌8例、曲霉菌7例、根霉菌1例、肺孢子菌感染合并白色念珠菌3例、肺孢子菌感染合并鲍曼不动杆菌1例。血清GM检测结果显示,阳性28例,阴性120例,与病原学培养诊断真菌感染的Kappa值为0.700。肺泡灌洗液NGS诊断结果显示,阳性34例,阴性114例,与病原学培养诊断真菌感染的Kappa值为0.841。血清GM联合肺泡灌洗液NGS诊断结果显示,阳性30例,阴性118例,病原学培养诊断真菌感染的Kappa值为0.916。血清GM、肺泡灌洗液NGS单独及联合诊断重症肺炎合并真菌感染的敏感性分别为73.3%（95% CI：0.538,0.870）、93.3%（95% CI：0.765,0.988）、93.3%（95% CI：0.765,0.988）,特异性分别为94.9%（95%CI：0.888,0.979）、94.9%（95% CI：0.889,0.979）、98.3%（95% CI：0.934,0.997）,曲线下面积分别为0.841、0.941和0.958。结论 血清GM联合肺泡灌洗液NGS诊断重症肺炎合并真菌感染,在肺孢子菌、白色念珠菌及曲霉菌等常见菌种中的诊断效能良好。     

纤支镜引导经鼻气管插管和肺泡灌洗抢救重症肺炎的临床观察

目的：探讨纤维支气管镜（纤支镜）引导下经鼻气管插管联合肺泡灌洗在抢救重症肺炎所致的呼吸衰竭患者中的应用价值。方法：对50例重症肺炎需要进行机械通气的患者,行床边纤支镜引导下经鼻气管插管并肺泡灌洗,比较治疗前后动脉血气分析各指标的变化、A—PACHEⅡ评分、肺部感染控制情况。结果：所有患者均顺利行纤支镜引导经鼻气管插管并肺泡灌洗,效果满意,无明显并发症;术后肺通气功能和肺部感染明显改善好转。结论：纤支镜引导下经鼻气管插管并肺泡灌洗在抢救肺炎所致重症呼吸衰竭的患者中,具有重要的应用价值,值得临床推广。     

宏基因组测序在实体器官移植术后肺部感染患者中应用价值初探

目的 通过比较实体器官移植术后肺部感染患者支气管肺泡灌洗液的病原学检测方法，探索宏基因测序技术的应用价值。 方法 57例诊断为肺部感染的肝移植和肾移植受者均采集支气管肺泡灌洗液，对标本仅采用传统病原学检测方法的有38例，为传统方法组。接受mNGS和传统病原学检测方法的有19例，为mNGS组。传统方法组进行细菌、真菌、抗酸杆菌涂片及培养，呼吸道多项病原体抗原抗体、Gene Xpert MTB/RIF检测等传统病原学检测方法。mNGS组除行常规传统检测方法外，标本同时送检宏基因组测序。比较两组病原学检出情况、确诊时间、采信率和住院时间等。采用SPSS 21.0对数据进行统计分析。 结果 mNGS组病原学检出阳性率94.74%（18/19），传统方法组病原学阳性率47.36%（18/38），两组差异有统计学意义（χ2=13.36，P <0.01）。病原学阳性的36例病例中，传统方法组和mNGS组的中位确诊时间分别为3.0（2.0,4.8）天和1.0(1.0,1.25)天，差异具有统计学意义（Z=4.746, P <0.01）。mNGS结果被采信的有94.4%（17/18）,传统方法组仅72.2%（13/18）,两组病原学结果临床采信率（F=3.446, P =0.063）,无显著统计学差异。mNGS组和传统方法组的中位住院天数分别为24.0（13.0,40.0）天和21(12.0,30.0) 天，两组住院天数分布差异无统计学意义（Z=0.373，P=0.709）。 结论 实体器官移植后肺部感染患者支气管肺泡灌洗液mNGS检测阳性率显著高于传统检测方法，且缩短确诊时间，尤其在耶氏肺孢子菌、巨细胞病毒、军团菌等特殊病原体检测中有较大优势。     

支气管肺泡灌洗液在ICU肺部感染病原学上的诊断价值

目的了解支气管肺泡灌洗（BALF）液在ICU肺部感染病原学上的诊断价值。方法 68例患者,均于采用无菌一次性吸痰管吸引气道分泌物留痰送细菌培养。结果 BALF培养阳性检出率明显高无菌痰培养。结论支气管肺泡灌洗液在明确肺部感染病原学上有较高意义。     

纤维支气管镜引导经鼻气管插管在呼吸监护病房的临床应用

目的探讨纤维支气管镜引导经鼻气管插管在呼吸监护病房的临床应用。方法选择呼吸监护病房的42例患者回顾性分析经纤维支气管镜引导经鼻气管插管连接机械通气治疗及取痰培养、吸痰、支气管冲洗、支气管肺泡灌洗、止血治疗等．总结分析临床资料。结果本组42例患者均进行纤维支气管镜引导经鼻气管插管，机械通气治疗，插管均一次性获得成功，平均插管时间〈2min，机械通气患者成功撤机拔管，34例经过纤维支气管镜吸痰、支气管冲洗、取痰液送病原学培养加药敏，阳性率100％，支气管肺泡灌吸14例，3例咳血窒息经纤维支气管镜止血治疗出血停止，支气管冲洗，支气管肺泡灌吸，治疗前后血气及血氧饱和度复查，PaO2、SO2与治疗前后中相比有较明显增高，PaCO2明显下降，差异均有显著性（P〈0．01）。结论纤维支气管镜引导经鼻气管插管在呼吸监护病房有较大的临床应用价值，操作简单、快速、安全。     

支气管镜检查及肺泡灌洗术治疗儿童重症肺炎的临床研究

目的：探讨支气管镜检查及肺泡灌洗术在治疗儿童重症肺炎中的临床价值。方法将该院200例随机分成观察组和对照组各100例,对照组使用常规病原检测方法及常规治疗方法,观察组行支气管镜检查及肺泡灌洗术进行肺泡灌洗液收集及灌洗治疗,比较两组病原检出率、治疗效果和不良反应,以评价支气管镜检查及肺泡灌洗术在治疗重症肺炎中的临床价值。结果观察组肺泡灌洗液培养检测率65%,而对照组痰培养检测率52%;观察组支原体PCR阳性率42%,对照组肺炎支原体抗体阳性率31%,两者差异有统计学意义（P<0.05）;观察组治疗总有效率99%（99/100）,显著高于对照组治疗总有效率82%（82/100）,两组临床疗效组间比较差异有统计学意义;两组患儿均未无严重不良反应发生。结论虽然支气管镜检查及肺泡灌洗术容易引起轻微的不良反应,但是相比于常规的痰培养或血清肺炎支原体抗体检测,肺泡灌洗液培养、肺泡灌洗液PCR检测率明显增高,且治疗效果明显提高,故根据患儿体质、病情等情况,值得推广使用。     

纤支镜采样病原学诊断重症肺部感染

目的：探讨床边纤支镜采样技术与常规取痰方法在危重症患者肺部感染病原学诊断中的应用价值.方法：对具有肺部感染临床症状的危重症患者39例采用床边经纤支镜防污染毛刷采样（PSB）及支气管肺泡灌洗（BAL）进行查验采样作病原学诊断,并与常规取痰方法的结果比较.结果：纤支镜采样标本阳性37例,阳性率94.8%;常规采样标本符合21例,阳性率56.7%.结论：床边纤支镜采样技术在危重症患者肺部感染病原学诊断以及在指导临床用药比常规采样技术具有明显的优势和及其重要的应用价值.     

宏基因组学二代测序在不明原因发热患者病原体检测中的应用

目的：分析宏基因组学二代测序（mNGS）技术在不明原因发热患者病原检测中的应用价值。方法：选择不明原因发热51例患者,留取可疑部位标本送传统细菌培养,同时外送进行病原mNGS检测。比较细菌培养与mNGS病原二代测序结果,统计病原微生物检出敏感性、特异性、诊断效能等。结果：51例患者中传统培养共检出细菌8例（含结核分枝杆菌1例）,真菌4例,病原mNGS在30份标本中鉴定出60个病原体,其中细菌22例（含结核分枝杆菌4例）、真菌12例,mNGS检出的病原体数量和种类明显多于传统培养。病原mNGS检测阳性率41.18%（21/51）,高于传统培养阳性率23.53%（12/51）,差异有统计学意义（P=0.012）。病原mNGS检测细菌、真菌的灵敏度,特异性,阳性预测值,阴性预测值和约登指数分别为91.67％,74.36%、52.38%、96.67%、0.6603,将mNGS检测到的病毒、支原体计算在内,检测阳性率从传统培养的23.53％（12/51）增至60.78％（31/51）。结论：mNGS用于临床病原学检测较传统培养更敏感,有助于不明原因发热患者的诊断和抗菌药物的合理使用。     

早期纤支镜介入诊治机械通气患者临床疗效观察

目的探讨早期纤支镜检查、PSB取痰液标本培养和支气管肺泡灌洗术治疗在机械通气患者诊疗价值。方法选取62例有创机械通气患者,将其分为治疗组和对照组。治疗组31例机械通气患者3天内接受纤支镜检查,PSB取痰液标本病原菌分离培养鉴定及药敏试验,并行纤支镜下吸痰及支气管肺泡灌洗治疗,对照组31例机械通气3天内常规吸痰管吸引呼吸道分泌物病原菌分离培养鉴定及药敏试验。比较两组检查结果、采样培养的阳性率、纤支镜吸引及支气管肺泡灌洗术治疗前后疗效、纤支镜吸引及支气管肺泡灌洗术治疗后和对照组比较及纤支镜检查不良反应。结果治疗组纤支镜检查结果:口腔分泌物5例占19.35%,气管插管囊上积液10例占32.26%,气管支气管炎症5例占19.35%,气管支气管黏膜霉菌斑2例占6.45%,气管支气管异物2例占6.45%,痰液堵塞支气管2例占6.45%,对照组2例改为纤支镜检查;对照组与治疗组痰采样培养的阳性率分别为19.35%和25.81%(P<0.05);治疗组纤支镜治疗前后,患者pH改善、PaO2升高、PaCO2下降、SO2升高(P<0.05),3天后治疗组和对照组比较患者pH改善、PaO2升高、PaCO2下降、SO2升高(P<0.05);纤支镜检查不良反应发生:鼻腔气管黏膜出血2例占6.45%,血压升高8例占25.8%,指脉氧减低12例占38.7%。结论机械通气时早期纤支镜检查及介入治疗有助于疾病早期诊断、获得合理抗菌药物治疗,呼吸道内吸引及支气管肺泡灌洗术疗效确切,纤支镜检查治疗危险性小,值得临床应用。     

无菌吸痰管吸痰与纤维支气管镜肺泡灌洗在机械通气患者下呼吸道感染病原学诊断中的应用比较

目的：比较无菌吸痰管吸痰与纤维支气管镜肺泡灌洗采样培养在机械通气患者下呼吸道感染病原学诊断中的价值。方法：64例机械通气合并下呼吸道感染患者,均先后使用无菌吸痰管吸取下呼吸道分泌物和纤维支气管镜肺泡灌洗两种方法进行采样,并进行病原学分析和诊断试验的评价。结果：无菌吸痰管与支气管肺泡灌洗采样培养的阳性率分别为71.88%和78.13%(P>0.05),两种方法诊断一致率达81.25%。结论：无菌吸痰管采样对于机械通气合并下呼吸道感染患者,不仅能获得准确的病原,帮助临床医生选择敏感抗生素,而且还是一种简单、安全和经济的病原采集方法,值得推广应用。     

纤维支气管镜在呼吸衰竭患者机械通气治疗中应用价值探讨

目的探讨纤维支气管镜（纤支镜）在呼吸衰竭患者有创机械通气治疗中的应用价值.方法回顾性分析189例行机械通气治疗的呼吸衰竭患者病历资料,包括气管插管,机械通气过程中纤支镜检查、取痰培养、吸痰、支气管冲洗、支气管肺泡灌洗、止血治疗、气管插管深度调整等.结果 189例行纤支镜引导下经鼻气管插管,成功率100%;215例次经纤支镜吸痰、支气管冲洗或支气管肺泡灌洗;209例次纤支镜取痰细菌和真菌培养,阳性率为81.3%;6例经纤支镜止血治疗出血停止,有效率100%;24例经纤支镜直视下调整气管插管深度;6例检出支气管肿物.结论纤维支气管镜在呼吸衰竭患者机械通气治疗中具有很大的应用价值,值得推广.     

纤维支气管镜技术在ICU中的应用研究

目的探讨纤维支气管镜（简称纤支镜）技术在ICU中抢救治疗各种危重病患者的应用价值。方法采用中纤支镜治疗1CU 109例危重病患者,包括气管插管、机械通气过程中纤支镜检查、获取痰培养、吸痰、支气管冲洗、支气管肺泡灌洗、顽固性气胸封堵、代替胸腔镜治疗胸腔积液、止血治疗等情况。结果全部患者经纤支镜引导下经鼻气管插管,成功率99．17％,插管操作均在30s～3min内完成。442例次经纤支镜吸痰、支气管冲洗或支气管肺泡灌洗;306例次纤支镜取痰标本病原学培养,阳性率为92％;2例呼吸道出血致窒息患者经纤支镜止血治疗出血停止。1例顽固性气胸在纤支镜下封堵成功;1例胸腔积液在纤支镜直视下治愈。结论纤维支气镜技术在ICU中具有较大的临床应用价值。     

肺泡灌洗液Xpert MTB/RIF联合血清TSPOT-TB在病原学阴性肺结核中的诊断价值

目的：分析肺泡灌洗液利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测技术（Xpert MTB/RIF）联合血清结核感染T细胞斑点试验（TSPOT-TB）在病原学阴性肺结核中的诊断价值。方法：选取2021年2月至2022年2月在我院收治的120例可疑痰病原学阴性的肺结核患者为研究对象,研究对象的三次痰抗酸杆菌涂片检测均为阴性,且同时进行肺部CT、支气管镜检查等临床诊断,最终将120例肺结核患者分为肺结核组和非结核组,同时进行肺泡灌洗液Xpert MTB/RIF、血清TSPOT-TB检测、MGIT 960药敏试验。结果：经血清TSPOT-TB检测涂阴肺结核阳性预测值为75.00%（48/64）、阴性预测值为73.21%（41/56）;经支气管肺泡灌洗液Xpert MTB/RIF检测涂阴肺结核阳性预测值为75.34%（55/73）、阴性预测值为82.97%（39/47）;支气管肺泡灌洗液Xpert MTB/RIF、血清TSPOT-TB及二者联合诊断涂阴肺结核的ROC曲线下面积（AUC）值分别为0.741、0.779、0.865;以MGIT 960药敏试验结果为金标准,Xpert MTB/RIF诊断利福平耐药性的阳性预测值和阴性预测值分别为88.89%（8/9）和96.86%（62/64）。结论：肺泡灌洗液Xpert MTB/RIF联合血清TSPOT-TB在病原学阴性肺结核诊断中有较好的应用价值,且肺泡灌洗液Xpert MTB/RIF检测利福平耐药性较可靠,值得临床推广使用。     

环介导等温扩增技术对结核分枝杆菌检测的临床应用价值

目的评估环介导等温扩增技术(LAMP)对肺结核的诊断价值。方法回顾性分析2017年4月至2018年9月郑州大学第一附属医院进行LAMP检测的413例患者,其中LAMP检测标本情况为肺泡灌洗液266例、痰标本147例。根据临床诊断情况将患者分为肺结核病组和非肺结核病组。将患者抗结核治疗前的LAMP结果与最终临床诊断及痰涂片结果进行比较,评价其敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、阳性似然比及阴性似然比。应用χ~2检验对肺结核患者肺泡灌洗液及痰标本的阳性率差异进行分析,P<0.05为差异有统计学意义。结果 413例中119例(28.8%)为临床诊断的肺结核病患者,其中65例LAMP阳性,LAMP的综合敏感度为54.6%(65/119)。294例(71.2%)为非肺结核病患者,其中276例LAMP检测结果为阴性,特异度为93.9%(276/294),阳性预测值为78.3%(65/83),阴性预测值为83.6%(276/330),阳性似然比为11.42,阴性似然比为0.32。LAMP在痰涂片阳性标本中的敏感度为95.2%,在痰涂片阴性标本中的敏感度为45.9%,特异度为93.9%。在临床诊断肺结核患者中肺泡灌洗液标本和痰标本中LAMP的阳性率分别为63.2%(48/76)和39.5%(17/43)(χ~2=6.183,P<0.05)。结论 LAMP检测痰标本和肺泡灌洗液标本中的结核分枝杆菌用于结核病诊断具有良好的特异度。在临床诊断的肺结核患者中,LAMP对肺泡灌洗液标本检出的阳性率高于痰标本。     

肺泡灌洗液二代测序在间质性肺病急性加重的诊断价值

目的：探究肺泡灌洗液宏基因组二代测序（mNGS）在间质性肺病急性加重的病原学诊断及预后价值。方法：收集2018年7月—2021年10月武汉大学中南医院呼吸与危重症医学科行mNGS的37例间质性肺病急性加重患者的临床资料,同时收集60例未行mNGS的间质性肺病急性加重患者的临床资料作为对照,了解病原体感染情况,进一步分析两组患者的预后结局及mNGS较传统病原学检测的优势。结果：mNGS组和未行mNGS组在年龄、性别、免疫功能、临床症状及影像学表现、治疗前实验室检测结果、出现不良事件发生率等方面无差异,两组的28 d全因死亡率有显著差异（P<0.05）。mNGS检出病原体阳性率明显高于传统病原学检测（75.7%vs 40.5%,P<0.05）,对于混合感染较传统方法也有更高的检出率（40.5%vs 10.8%,P<0.05）。73.7%传统检测阴性的患者通过mNGS发现潜在病原体,其灵敏度显著高于传统病原学检测（96.4%vs 46.4%,P<0.05）,但其特异度与传统法相比无显著差异（P>0.05）。在间质性肺病急性加重的患者中,检出病原体主要以细菌和病毒...     

支气管肺泡灌洗液在ICU肺部感染病原学上的诊断价值

目的 了解支气管肺泡灌洗(BALF)液在(BALF)肺部感染病原学上的诊断价值.方法 68例患者,均于采用无菌一次性吸痰管吸引气道分泌物留痰送细菌培养.结果 BALF培养阳性检出卒明显高无菌痰培养.结论 支气管肺泡灌洗液在明确肺部感染病原学上有较高意义.