2005年-2009年大连市季节性甲型H1N1流感病毒HA基因序列分析

目的:分析大连市2005年-2009年流感病毒H1N1亚型血凝素抗原性及其基因变异情况,为流感防治提供技术支持。方法:采集流感样病例的鼻咽拭子标本,用MDCK细胞进行流感病毒的病原分离,采用红细胞凝集实验测定病毒的滴度,用血凝抑制试验和RT-PCR进行流感病毒型别鉴定,通过RT-PCR扩增血凝素HA片段的基因,电泳、纯化后进行基因序列测定,利用生物信息学进行序列分析。结果:2005年-2009年共分离到季节性甲型H1N1流感病毒39株,其中28株进行了测序。与当年的疫苗株相比,2005年、2006年、2007年和2008年分离株的HA1区分别发生了11个、9个、15、15个突变。结论:在近几个年度的流行季节中,该地区有H1N1亚型流感的存在。该地H1N1流感病毒分离株有多处氨基酸发生替换,氨基酸的替换导致毒株的抗原性发生了漂移。     

2009甲型H1N1亚型流感病毒血凝素重链(HA1)基因分析

[目的]从基因层面初步探讨近8个月甲型H1N1流感病毒HA1基因变异情况。[方法]收集19株2009年5～12月欧美及亚洲最新上传的甲型H1N1流感流行株血凝素重链(HA1)区域的氨基酸序列,分析其与墨西哥城第一株流感病毒分离株A/MexicoCity/001/2009在HAl以及HAl抗原决定簇区域的氨基酸差异。[结果]与A/Mex-icoCity/001/2009比较,HA1区氨基酸序列的同源性为96.98%～99.7%;并且,A/Pennsylvania/09/2009、A/Fukuoka-C/1/2009和A/Milan/UHSR1/20093株流感流行株HA1区抗原决定簇B区197位氨基酸出现了A﹥T替换。[结论]2009甲型H1N1流感流行的近8个月HA1基因存在一定的变异。     

安徽省2009年～2011年甲型H1N1流感病毒HA基因特性监测

目的了解安徽省2009~2011年安徽省甲型H1N1流感病毒HA的基因特性。方法提取病毒RNA,经RT-PCR扩增HA基因后测序,进行同源性分析和基因进化分析。结果传入阶段HA基因同源性为99.4%~99.6%,蔓延阶段为99.4%~99.7%,稳定阶段为98.8%~99.5%,再现阶段为98.8%~99.1%,说明甲型H1N1流感病毒HA基因在研究两年期间保持较高的稳定性。结论 2011年甲型H1N1流感毒株HA基因较2009年流行毒株存在一定程度的进化,但基本保持遗传的稳定性。     

南平市2009年季节性H1N1流感病毒血凝素HA1基因特征研究

目的了解南平市2009年季节性H1N1流感病毒血凝素HA1基因特征。方法随机选取4株从哨点医院分离到的季节性H1N1流感毒株,进行核酸提取和RT-PCR扩增,获得HA1基因片段,测定核苷酸序列,分析其基因特征。结果 4株季节性H1N1流感病毒与A/California/01/2009（H1N1）高度同源,同源性高达99.1%;相对于当前疫苗代表株A/Brisbane/59/2007（H1N1）,其HA1区出现V131A、S141N、I184V、G185A、N186D、A189T和F260Y的氨基酸位点的改变;糖基化位点未发生改变。结论南平市2009年分离的季节性H1N1流感病毒抗原性发生一定的突变,但变异程度不大,应密切关注疫苗株对毒株的免疫效果。     

甲型H1N1流感病毒抗原HA基因进化分析

目的 分析甲型H1N1流感病毒抗原HA基因的突变和分子进化树.方法 由河南省各市(地)疾病预防控制中心和流感监测哨点医院采集流感患者咽拭样本,从咽拭样本中分离甲型H1N1流感病毒毒株,选择20株提取病毒RNA,设计引物运用逆转录-聚合酶键反应(RT-PCR)技术扩增编码HA蛋白的基因序列,测序分析核酸和编码的蛋白序列突变位.结果 分离到51株新型H1N1流感病毒;扩增20株HA编码基因,18株成功扩增到HA编码基因,2部分基因片段分别为1 024 bp和654 bp,与预期大小相符;BLAST分析结果显示,在中国多个地区分布有甲型H1N1流感病毒HA基因433 T/C(N端145 S/P)突变株,进化树分析结果显示,这一位点的突变有可能是来自于猪-人之间相互感染.结论 甲型H1N1流感病毒抗原HA基因在中国内地传播期间个别氨基酸位点发生了突变,但是抗原性未改变.     

连云港地区甲型H1N1流感病毒HA1基因病原学特征研究

目的 对连云港地区2018年-2019年甲型H1N1流感病毒表面血凝素HA1基因特征及抗原变异情况进行分析.方法 对2018年-2019年连云港地区流感监测样本进行毒株分离,将分离到的6株甲型H1N1流感病毒株,用RT-PCR法对HA1基因进行扩增并测序,运用Lasergene软件包中MegAlign软件进行核苷酸以及...     

猪流感病毒流行特点及其新型甲型H1N1流感病毒的基因来源分析

猪流感（Swine influenza,SI）是由A型流感病毒引起的一种猪的急性呼吸道传染病。虽然也从猪体内分离到了C型流感病毒,但感染猪的主要还是A型流感病毒。日前该病呈世界分布,但主要以地方性流行为主。世界各地流行的猪流感病毒（Swine influenza virus,SIV）包括三种主要的亚型：H1N1,H3N2和H1N2亚型,其中又包括不同的基因型：古典猪H1N1,类禽H1N1,类人H3N2,基因重配的H3N2以及多基因型的H1N2亚型^[1,2,3]。猪流感病毒对养猪业和人类公共卫生都有重大影响．     

新型甲型H1N1流感流行期间大连市郊区流感病毒监测分析

目的:了解2009~2010年新型甲型H1N1流感大流行期间,大连市郊区流感病毒的流行情况。方法:对大连市外各区的流感样病人咽拭子标本采用Real-time RT-PCR方法进行流感病毒核酸检测。结果:2009年11月~12月郊区标本均为新型甲型H1N1流感病毒核酸阳性,2010年1月部分地区标本季节性流感病毒核酸阳性,2010年2月后各区标本均季节性流感病毒核酸阳性。结论:2010年1月为新型甲型H1N1流感病毒和季节性流感病毒交替期,之前流行株为新型甲型H1N1流感病毒,之后的流行株为季节性流感病毒。     

湖州市甲型H1N1流感病毒株的HA基因分析

目的:研究2010年湖州市甲型H1N1流感分离株(A/Huzhou/2010(H1N1))的HA基因特征。方法:采用MD-CK细胞对患者咽拭子和漱口液标本进行病毒分离,逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒HA基因并进行序列测定,用DNAstar和MegAlign等软件分析处理。结果:湖州市2010年甲型H1N1分离株的HA基因为1739个核苷酸,与湖州市2009年的分离株及WHO2010/2011推荐的甲型H1N1疫苗株相比,没有核苷酸的插入与丢失,氨基酸同源性分别为99.0%和98.9%。进化树分析显示,本次分离株与湖州市2009年的分离株及WHO2010/2011推荐的疫苗株非常相似。结论:甲型H1N1流感分离株的分子生物学特征及变异特征分析,对制定科学有效的防控策略具有重要意义。     

2000-2007年佛山市甲1亚型(H1N1)流感病毒监测情况及其HA1基因的变异

目的分析2000-2007年佛山市甲1亚型(H1N1)毒株流行情况及其HA1基因变异情况。方法用MDCK细胞分离流感病毒,采用血球凝集抑制试验进行型别鉴定,选取每年2~4株甲1亚型毒株的细胞培养物提取病毒核酸,进行HA1基因的逆转录,对其核苷酸和氨基酸序列及亲缘关系进行分析。结果病毒分离结果显示2000-2007年间甲1亚型流感病毒在佛山市人群中的流行是间断性的,只在2000、2001、2005、2006年4个年份分离到甲1亚型流感毒株。毒株的HA1区氨基酸序列与流感疫苗推荐株A/New Caledonia/20/99和A/Solomon Islands/3/2006相比,同源性分别为97.2%~99.7%和97.2%~98.5%。氨基酸残基平均替换数随年份的推移而增加,只有2006年的毒株在抗原决定簇发生了替换。结论与疫苗株比较,佛山市的甲1亚型流感毒株抗原性已逐渐发生了改变,应密切注意疫苗对毒株的免疫效果。     

石家庄市2009年H3N2亚型流感病毒血凝素重链区基因变异分析

目的:了解石家庄市2009年H3N2亚型流感病毒流行情况,研究2009年分离H3N2亚型流感病毒株血凝素重链(HA1)的基因特性及变异情况。方法:用MDCK细胞分离流感病毒,采用血抑实验分型鉴定。随机选取24株H3N2亚型流感毒株进行RNA提取、逆转录扩增获得HA1基因产物,将其进行基因序列测定,之后用DNAStar软件的MegAlign功能进行序列比对和分析。结果:经MegAlign将24株毒株与WHO疫苗推荐株A/Wisconsin/67/200(07～08)、A/Bris-bane/10/2007(08～10)进行比对,发现与同年疫苗株同源性较高,为98.2%～98.6%,仅有个别位点出现氨基酸替换。结论:2009年石家庄市H3N2亚型流感毒株HA1区与同年疫苗株基因序列符合率较高,尚未形成一个新的变异株。     

Efficacy of inactivated swine influenza virus vaccines against the 2009 A/H1N1 influenza virus in pigs

The gene constellation of the 2009 pandemic A/H1N1 virus is a unique combination from swine influenza A viruses (SIV) of North American and Eurasian lineages, but prior to April 2009 had never before been identified in swine or other species. Although its hemagglutinin gene is related to North American H1 SIV, it is unknown if vaccines currently used in U.S. swine would cross-protect against infection with the pandemic A/H1N1. The objective of this study was to evaluate the efficacy of inactivated vaccines prepared with North American swine influenza viruses as well as an experimental homologous A/H1N1 vaccine to prevent infection and disease from 2009 pandemic A/H1N1. All vaccines tested provided partial protection ranging from reduction of pneumonia lesions to significant reduction in virus replication in the lung and nose. The multivalent vaccines demonstrated partial protection; however, none was able to prevent all nasal shedding or clinical disease. An experimental homologous 2009 A/H1N1 monovalent vaccine provided optimal protection with no virus detected from nose or lung at any time point in addition to amelioration of clinical disease. Based on cross-protection demonstrated with the vaccines evaluated in this study, the U.S. swine herd likely has significant immunity to the 2009 A/H1N1 from prior vaccination or natural exposure. However, consideration should be given for development of monovalent homologous vaccines to best protect the swine population thus limiting shedding and the potential transmission of 2009 A/H1N1 from pigs to people.     

2000—2007年佛山市甲1亚型（H1N1）流感病毒监测情况及其HA1基因的变异

目的分析2000—2007年佛山市甲1亚型（H1N1）毒株流行情况及其HA1基因变异情况。方法用MDCK细胞分离流感病毒，采用血球凝集抑制试验进行型别鉴定，选取每年2～4株甲1亚型毒株的细胞培养物提取病毒核酸，进行HA1基因的逆转录，对其核苷酸和氨基酸序列及亲缘关系进行分析。结果病毒分离结果显示2000—2007年间甲1亚型流感病毒在佛山市人群中的流行是间断性的，只在2000、2001、2005、2006年4个年份分离到甲1亚型流感毒株。毒株的HAl区氨基酸序列与流感疫苗推荐株A／NewCMedonia／20／99和A／Solomon Islands／3／2006相比，同源性分别为97．2％～99．7％和97．2％-98．5％。氨基酸残基平均替换数随年份的推移而增加，只有2006年的毒株在抗原决定簇发生了替换。结论与疫苗株比较，佛山市的甲1亚型流感毒株抗原性已逐渐发生了改变，应密切注意疫苗对毒株的免疫效果。     

合肥市2009流行年度甲型H1N1流感发病率估算

甲型H1N1流感实际病例数的估算比较困难[1].本研究在综合多种监测与现场调查的基础上,对合肥市2009年8月至2010年1月实际发生病例数和发病率进行估算.     

2012 - 2013 年长春地区甲 3( H3N2) 亚型流感病毒 HA1 基因序列分析

目的了解2012—2013年长春地区流感病毒优势流行甲3（H3N2）亚型流感病毒HA1基因序列的特性。方法采用MDCK细胞分离培养流感病毒,提取病毒RNA,进行逆转录和聚合酶链式反应（RT—PCR）,扩增产物用纯化试剂盒纯化后测序,用Mega5．10软件中NeighborJoining方法进行基因种系发生树分析。结果（1）2012—2013年吉林省长春地区流行的H3N2亚型流感毒株核苷酸同源性为95．8％-100．0％,2012年流行的H3N2亚型流感毒株与WHO推荐的2011—2012年疫苗株A／perth／16／2009相比有15个氨基酸发生了变异;2013年流行的H3N2亚型流感毒株与WHO推荐的2012—2013年疫苗株A／Victoria／361／2011相比有13个氨基酸发生了变异。（2）2012年2—3月分离的毒株与2012年11月-2013年3月分离的毒株在进化树上处于两个不同的侧枝上。结论2012—2013年长春地区流行的H3N2亚型流感毒株与WHO推荐的疫苗株A／peah／16／2009、A／Victoria／361／2011相比HA1基因已经发生了一定的变化,不同时间流行的病毒株也有差异。     

长沙市2009年甲型H1N1流感病毒血凝素基因特性分析

2009年4月21日,美国疾病预防控制中心(CDC)检出2名儿童感染新甲型H1N1流感病毒~[1],该病毒属于正黏病毒科(orthomyxoviridae),甲型流感病毒属(influenza virus A),单股负链RNA病毒,由大小不等的8个独立片段组成,共编码11种蛋白,主要通过飞沫或气溶胶经呼吸道传播,极易造成流行.     

Innate immunemodulator containing adjuvant formulated HA based vaccine protects mice from lethal infection of highly pathogenic avian influenza H5N1 virus

The highly pathogenic avian influenza (HPAI) H5N1 viruses and their spillover into the human population pose substantial economic and public health threats. Although antiviral drugs have some effect in treating influenza infection, vaccination is still the most effective intervention to prevent possible pandemic outbreaks. We have developed a novel H5 influenza vaccine to improve the world’s pandemic preparedness. We produced a hemagglutinin (HA) of HPAI H5N1 virus A/Alberta/01/2014 (AB14) using both mammalian (m) and bacterial (b) expression systems. The purified recombinant proteins were formulated with a proprietary adjuvant (TriAdj) and their efficacy as vaccine candidates was evaluated in mice. Intramuscular delivery of two doses of TriAdj formulated mammalian expressed HA (m-HA/TriAdj) was shown to provide full protection against a lethal challenge of AB14 in mice. In contrast, bacterially expressed HA with TriAdj (b-HA/TriAdj), b-HA without adjuvant, and m-HA without adjuvant resulted in no protection in immunized mice. Furthermore, m-HA/TriAdj elicited significantly higher levels of balanced Th1 and Th2 responses and neutralizing antibody titres. All the mice in the m-HA/TriAdj group survived a lethal AB14 H5N1 challenge and showed no signs of disease or infection as demonstrated by no loss of body weight or detectable virus in the lungs. Our results suggest that m-HA formulated with TriAdj has potential to protect against pandemic H5N1 in the event of its cross over to the human host.     

1998～1999年浙江省甲3型流感病毒代表株HA1序列比较

目的　对浙江省 1998年初至 1999年底流行的甲3 型流感病毒的不同血凝特性进行分析。方法　采用对甲3 流感病毒的血凝素基因HA1 进行核苷酸序列测定。结果　占我省分离株主流的对鸡红细胞不凝集的O相代表株A/浙江 6 /99其HA1 区域与当年的国际标准株A/武汉 /35 9/95血清学交叉HI试验抗原比为2 2 6 ,两者的氨基酸同源性仅为 94 82 % ,存在较大差异 ,而在分离中占极少数的对鸡红细胞凝集的D相代表株A/浙江 /10 /98与A/武汉 /35 9/95的血清学交叉HI试验抗原比为 0 7,两者的同源性为 99 7% ,几乎无差异。结论　近年我省甲3 型流感流行的主要原因 ,是由于流感病毒在免疫压力下在HA1 区域发生变异所引起的