聚合酶链反应在诊断结核性胸腔积液中的应用

应用聚合酶链反应（ＰＣＲ）技术对６２例胸水进行结核菌ＤＮＡ检则，并同时与胸水涂片及培养结果进行比较。结果显示：３４例结核性胸水涂片抗酸染色、结核菌培养和ｐＣＲ检测阳性率分别为５．９％、８．８％和５２．９％，后者显著高于前二者（Ｐ均＜０．０１）。２８例非结核性胸水涂片和培养结果均呈阴性，但ＰＣＲ有４例（１４．３％）出现阳性。结果表明ＰＣＲ直接检测胸水中结核菌显示出快速、敏感和高效等优点。同时还对影响ＰＣＲ检测结核菌的某些因素作了分析。     

聚合酶链反应诊断军团菌感染的实验研究

目的早期诊断军团菌感染。方法采用聚合酶链反应（ＰＣＲ）检测嗜肺军团菌（Ｌｐ）ｍｉｐ基因的特异性片段，并应用于豚鼠米克戴德军团菌（Ｌｍ）感染后的组织标本检测。结果可以扩增出ＬｐＩ型和Ｌｍ６３０ｂｐ的特异性片段，其他临床分离株不被测得，检测灵敏度为１５０ｆｇ军团菌基因组ＤＮＡ（相当于１５～３０个军团菌）。对２２份Ｌｍ感染后不同时间获取的豚鼠组织标本，应用该法与培养法检测结果比较显示，在感染后３．５天培养法阳性率为８８．９％，ＰＣＲ法１００％，在感染后７．５天培养法阳性率为０，而ＰＣＲ法仍有２２．２％的阳性率。结论本方法敏感、特异，既能检出嗜肺军团菌，又能测得Ｌｍ，大大提高了军团病的诊断率     

聚合酶链技术检测慢性前列腺炎病原体的评价(附2071例报告)

目的探索慢性前列腺炎的病因，提高诊治水平。方法应用聚合酶链技术(PCR)对门诊疑诊慢性前列腺炎患者的前列腺液行淋球菌(NG)、沙眼衣原体(CT)及解脲支原体(UU)检测。结果检出单纯NG感染33例(9．09％)，CT感染32例(5．15％)，UU感染250例(23％)，CT与UU合并感染13例，NG合并UU感染5例，NG合并CT感染4例，并应用PCR监测治疗效果。结论PCR检测慢性前列腺炎病原体具有快速、敏感性高、特异性强等优点，值得临床推广应用。     

聚合酶链反应方法检测诱导排痰标本对卡氏肺孢子虫肺炎的诊断价值

目的 评价聚合酶链反应方法检测诱导排痰标本中卡氏肺孢子虫DNA对卡氏肺孢子虫肺炎（PCP）的诊断意义。方法 分别用姬姆萨和六胺银（GMS）两种染色方法和mt-rRNA-PCR方法检测痰液中的卡氏肺孢子虫。结果 化学染色法检测16例临床拟诊PCP的患者痰标本。结果 8例阳性,20例非PCP患者痰标本均为阴性,化学染色方法的敏感性和特异性分别为50％和100％。PCR方法检测16例临床拟诊PCP患者痰液中卡氏肺孢子虫,14例阳性,20例非PCP患者痰标本均为阴性,mt-rRNA-PCR方法的敏感性和特异性分别为88％和100％。结论 姬姆萨和GMS两种细胞化学染色方法联合检测痰标本卡氏肺孢子虫,特异性高,但敏感性偏低。mt-rRNA-PCR检测痰标本中卡氏肺孢子虫DNA方法敏感性高于化学染色法且特异性高,更适于临床应用。     

实时定量多聚酶链反应技术在诊断曲霉菌感染中的应用

近年曲霉菌感染的发病率急剧上升,曲霉病的病死率亦高居不下。早期诊断曲霉菌感染是改善预后的关键。曲霉病临床表现无特异性,早期诊断困难。最新的实时定量聚合酶链反应技术集快速、灵敏、特异、定量等优点于一体,在曲霉菌感染的诊断中有着广阔的应用前景。     

多重PCR检测方法在鼠疫监测中的应用

目的验证在鼠疫疫源地调查中应用多重PCR方法快速检测鼠疫菌的实用性。方法在14个省的17个鼠疫监测点采集标本2524份。选用针对鼠疫菌特异序列的引物,并加入内部对照模板,直接从鼠肝、脾等脏器标本中进行鼠疫核酸检测,与细菌分离培养结果相比较并进行统计学分析。结果两种检测方法的符合率为92.67%。PCR方法阳性检出率为10.38%,较细菌培养阳性检出率(4.48%)高(x~2=682.25,P<0.01)。结论多重PCR方法可应用于鼠疫监测中,比传统方法迅速、灵敏,但还有待于优化。     

实时荧光定量PCR在病毒检测中的应用

实时荧光定量PCR是通过荧光信号监测目的基因扩增数量的定量PCR技术,具有灵敏度高,检测速度快等优点。实时荧光定量PCR已被应用于乙肝病毒、登革热病毒、流感病毒、水疱口炎病毒等病毒的快速检测,在病毒快速分型、相似病毒的鉴别检测、耐药病毒突变体检测等临床和公共卫生领域得到广泛应用。狂犬病是危害严重的人兽共患病,病死率几乎为100%。实时荧光定量PCR技术已被应用于狂犬病病毒和狂犬病相关病毒的核酸检测,具有与金标准DFA相当的灵敏度和特异度,同时克服了金标准DFA的某些局限性,如检测速度更快,无需提取脑组织,对唾液、脑脊液等低病毒载量样本具有较好的检出效果,具有成为人间狂犬病诊断技术的潜力。灵敏度是传统RT-PCR的200倍以上,交叉污染的风险更低。实时荧光定量PCR也应用于欧洲蝙蝠病毒等狂犬病相关病毒的检测,可建立多重实时荧光定量PCR在单一检测体系对多种病毒进行快速鉴别,对于预防病毒性传染病具有重要的公共卫生意义。本文详细介绍了该技术的相关原理和方法,以及在病毒检测方面的国内外研究进展。     

Rapid molecular characterization of Hb H disease in Chinese by polymerase chain reaction

Summary We have developed a rapid method to molecularly distinguish different types of Hb H disease. The study depended on (a) most of the Hb H disease in Taiwan having an-thalassemia-1 of the Southeast Asia type (-SEA) in one allele and (b) the differences of X box of-globin gene cluster in the other allele. To detect the -SEA allele, we utilized the primers located on either side of the breakpoint to do PCR, then characterized the amplified products. For the other allele, we sequenced part of the X box, and found that bases –2803 to –2461 of the X box of – ^3.7 belonged to the X box of ₂ globin gene. In – ^4.2, the bases belonged to the X box of ₁ globin gene, whereas in ^cs it contained both X boxes of ₁ and ₂ globin genes. There was anMboII site at this region of the X box of ₂ globin gene. We utilized PCR to amplify this region and digested it with restriction enzymeMboII, then combined it with another PCR of different primer pairs to molecularly diagnose different types of Hb H disease. One hundred and one cases of Hb H disease from different families were studied: all of the cases had one allele of -SEA deletion, while the other allele showed that 52/101 were – ^3.7, 41/101 were ^cs , 7/101 were – ^4.2, and 1/101 was – ^G.Taichung. Of 52 cases of Hb H with – ^3.7, 47 were type-I deletion and five were type-II deletion.     

应用多重聚合酶链式反应鉴别布鲁杆菌

目的 探讨应用多重聚合酶链式反应(Muhiple-PCR)进行布鲁杆菌株种型的鉴别.方法 以6株布鲁杆菌标准菌株(牛种、羊种、猪种、犬种、绵羊附睾种、沙林鼠种布鲁杆菌标准菌株)作为阳性对照,以大肠埃希菌O∶157和小肠结肠炎耶尔森菌O∶9作为阴性对照,待测布鲁杆菌株29株.先用布鲁杆菌属特异性聚合酶链式反应(BCSP31-PCR)扩增上述待测布鲁杆菌株,扩增结果为阳性的菌株再用Muhiple-PCR方法进行布鲁杆菌种型鉴别.结果 29株待测布鲁杆菌株BCSP31-PCR方法扩增均为阳性,进一步Multiple-PCR方法扩增均为阳性,其中有20株鉴定为羊种菌,5株鉴定为猪种菌、3株鉴定为牛种菌、1株鉴定为犬种菌.结论 Multiple-PCR方法是一种快速、特异、简便、低风险的布鲁杆菌种型鉴定方法.     

聚合酶链反应快速检出耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的研究

目的 建立耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的快速检出方法。方法 利用聚合酶锭反应（ＰＣＲ）快速检出耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（金葡菌），建立一种从葡萄球菌中快速提取ＤＮＡ方法，以粗提ＤＮＡ作为ＰＣＲ模板，检测编码耐甲氧西林金葡菌青霉素结合蛋白２（ＰＢＰ２ａ）的ｍｅｃＡ基因。结果 １８４金葡菌有ＰＣＲ方法及药敏法比较，药敏法鉴定为耐甲氧西林金葡菌（ＭＲＳＡ）５８株，仅一株ＰＣＲ扩增ｍｅｃＡ基因阴性，１２６株甲     

Tropheryma whippelii endocarditis confirmed by polymerase chain reaction

This report concerns a patient with cardiac manifestation ofWhipple's disease. For the first time, the gene that encodesthe 16s rRNA of Tropheryma whippelii was identified in a nativeaortic valve by means of a polymerase chain reaction technique.DNA amplification gives evidence of Tropheryma whippelii asa causative organism in infective endocarditis.     

应用聚合酶链反应快速检测临床标本中的肺炎支原体

应用聚合酶链反应（ＰＣＲ）技术检测临床标本中的肺炎支原体（ＭＰ）。在１４０例非细菌性肺炎患者的标本中，ＰＣＲ试验阳性３０例。其中间接血凝试验阴性面ＰＣＲ试验阳性者２１例。ＰＣＲ阳性标本经ＭＰ５－４寡核苷酸探针检测验证，均为阳性结果。     

16SrRNA基因PCR加反相杂交技术检测细菌DNA

目的探讨聚合酶链反应（ＰＣＲ）加反相杂交技术在细菌ＤＮＡ检测中的应用。方法以１６ＳｒＲＮＡ基因为靶序列，设计引物及寡核苷酸探针，采用ＰＣＲ法加反相杂交检测标准菌株及临床标本细菌ＤＮＡ。结果对２０株不同标准菌株进行ＰＣＲ扩增，均出现３７１ｂｐ长度的ＤＮＡ片段，敏感性试验可检测出１０－１２ｇ的细菌ＤＮＡ，与人基因组及病毒无交叉反应；２２份血培养阳性标本及４份脑脊液培养阳性标本均扩增出３７１ｂｐ长度ＤＮＡ条带，反相杂交区分革兰阳性／阴性细菌与培养结果相符。结论１６ＳｒＲＮＡ基因ＰＣＲ加反相杂交技术检测细菌ＤＮＡ，具有敏感、快速、准确的特点，为细菌感染的临床诊断提供了科学的依据。     

结核分支杆菌DNA的单管巢式聚合酶链反应检测

目的探讨单管巢式聚合酶链反应（ＳＮＰＣＲ）检测石蜡包埋组织结核分支杆菌ＤＮＡ的特异性和敏感性。方法应用普通ＰＣＲ（ＧＰＣＲ）、双管巢式ＰＣＲ（ＤＮＰＣＲ）和ＳＮＰＣＲ对结核分支杆菌ＢＣＧ和３０例结核性淋巴结炎石蜡包埋组织进行结核分支杆菌复合群ＩＳ６１１０特异插入序列片段ＤＮＡ检测。结果ＤＮＰＣＲ和ＳＮＰＣＲ检测ＢＣＧＤＮＡ均于１５ｆｇ以上呈现阳性结果，其敏感性明显优于ＧＰＣＲ（４８０ｆｇ）。ＧＰＣＲ、ＤＮＰＣＲ和ＳＮＰＣＲ检测３０例结核性淋巴结炎阳性率分别为４３％、１００％和１００％，抗酸染色阳性率（１０％）与３种ＰＣＲ法相比差异有非常显著意义（均Ｐ＜０．０１）。ＧＰＣＲ阳性率与ＤＮＰＣＲ和ＳＮＰＣＲ相比差异亦具非常显著意义（均Ｐ＜０．０１）。ＳＮＰＣＲ阳性率与ＤＮＰＣＲ相同。结论巢式ＰＣＲ检测淋巴结石蜡包埋组织结核分支杆菌的敏感性显著高于ＧＰＣＲ，其中ＳＮＰＣＲ具有与ＤＮＰＣＲ相同的特异性和敏感性，并具有更大的实用价值。     

Optimization of competitively differentiated polymerase chain reaction in detection of HBV basal core promoter mutation

AIM: To improve competitively differentiated polymerase chain reaction (CD-PCR) in detection of HBV basal core promoter mutation. METHODS: Recombinant plasmid of double point mutation A1762T/G1764A in basal core promoter of HBV constructed by site-directed mutagenesis was used as mutant control. To reveal the deficiency mechanism of CD-PCR, relationship between the circle number of PCR and the increased speed of products of each competitive primer was comparatively studied. Diversified amount of dNTPs and mutual primer of the competitive primers were tried to optimize CDPCR. Optimized CD-PCR was evaluated by detecting A1762T/G1764A mutation in recombinant plasmids and clinical sera from patients with HBV infection. RESULTS: The deficiency mechanism of CD-PCR was that the products of mismatched competitive primer grew fast when the amplification of matched primer entered into plateau stage, which led to decrease in or disappearance of the difference in the amount of their products. This phenomenon could be eliminated by reducing dNTPs to 10μmol/L and mutual primer to about 100 nmol/L. Optimized CD-PCR could detect both mutant and wild strain independent of the amount of templates and the number of PCR cycles. Its detection limit was 103 copies/mL, about 50 copies/reaction. About 10% of mutant DNAs among wild type DNAs could be detected. A1762T/G1764A mutant was detected in 41.8% (51/122) of patients with HBV infection, but not detected in controls with negative HBsAg. CONCLUSION: Optimized CD-PCR can detect mutation independent of the amount of initial templates and the number of PCR cycles.     

实时定量聚合酶链反应技术在鉴别结节病与增殖性结核病中的应用

目的利用实时定量聚合酶链反应（PCR）方法检测结节病和结核病病理组织中结核分枝杆菌DNA，以探讨结核分枝杆菌在结节病发病中的作用及本方法在结节病与增殖性结核病鉴别中的应用价值。方法以上海市肺科医院1998年1月至2003年12月住院患者76例为研究对象，其中结核病组30例、结节病组31例和正常对照组（其他疾病）15例，利用定量PCR检测用石蜡包埋的淋巴结或肺组织中结核分枝杆菌DNA，并以胎鼠肺组织作为阴性对照。结果结核病组结核分枝杆菌DNA检出的阳性率（30／30）明显高于结节病组（6／31）和正常对照组（2／15），结节病组与正常对照组结核分枝杆菌DNA检出的阳性率无明显差别。结核病组结核分枝杆菌DNA检出的绝对和相对拷贝数明显高于结节病组和正常对照组，结节病组与正常对照组无明显差别，而胎鼠肺组织中未检出结核分枝杆菌DNA。结论本研究结果不支持结核分枝杆菌感染与结节病的相关性。实时定量PCR法检测石蜡包埋病理组织中结核分枝杆菌DNA可作为鉴别增殖性结核和结节病的方法之一。     

应用逆转录聚合酶链反应检测原发性肝癌患者外周血肿瘤细胞

目的寻求检测循环血中肝癌细胞的灵敏方法。方法采用逆转录聚合酶链反应（ＲＴ－ＰＣＲ）技术，对肝癌患者外周血有核细胞人甲胎蛋白ｍＲＮＡ（ＡＦＰｍＲＮＡ）进行检测。结果３１例原发性肝癌中有１５例检出ＡＦＰｍＲＮＡ，阳性率为４８．４％。良性肝病、肝转移癌患者和健康对照组均为阴性。外周血细胞ＡＦＰｍＲＮＡ的存在与肝内转移、门静脉癌栓和远处转移密切相关。结论外周血细胞ＡＦＰｍＲＮＡ是反映原发性肝癌患者有无血行播散的重要标志，ＲＴ－ＰＣＲ技术是检测循环血中原发性肝细胞癌的灵敏方法     

原位逆转录PCR检测胃癌及癌前组织中端粒酶RNA及其临床意义

目的　研究胃癌及癌前病变胃粘膜端粒酶RNA的检测及其临床意义。方法　选取经病理组织学证实的胃粘膜活检标本 15 0例 ,包括慢性浅表性胃炎 3 2例、肠上皮化生 3 6例、不典型增生 3 4例、胃癌 48例 ,采用原位逆转录PCR、端粒重复序列扩增 (TRAP)法检测上述胃粘膜端粒酶RNA与端粒酶活性。结果　原位逆转录PCR技术检测胃粘膜活检标本端粒酶RNA阳性率为 5 5 .3 % (83 / 15 0 ) ,显著高于TRAP法检测端粒酶活性阳性率 (4 0 .0 % ,60 / 15 0 ) ,P <0 .0 5。端粒酶RNA在胃癌及癌前病变 (包括肠上皮化生与异型增生 )中检出率显著高于浅表性胃炎 (P <0 .0 5 ) ,胃癌中端粒酶RNA检出率亦显著高于肠上皮化生及不典型增生 (P <0 .0 5 ) ,但后两者比较差异无显著性 (P >0 .0 5 )。端粒酶RNA主要分布于胃粘膜癌细胞及癌前病变上皮细胞的胞核内。结论　端粒酶RNA与胃癌的发生密切相关。原位逆转录PCR技术检测胃粘膜端粒酶RNA对胃粘膜癌变的早期诊断和预测有重要价值 ,而且可能是较端粒酶活性更灵敏的生物学指标