荧光定量聚合酶链反应对乙型肝炎患者个体用药疗效的评定

应用荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR),对5 0例乙肝患者连续检测血清中乙型肝炎病毒(HBV)的数量,观察临床个体用药治疗的效果.结果有41例随着治疗的进程, 血清中HBV -DNA相应地逐渐减少,最后降至阴性,另有9例连续治疗半年后HBV-DNA无任何下降趋势. 认为FQ-PCR可以检测HBV的真实感染和复制情况,对于乙型肝炎的临床诊断、个体用药方案的选择和疗效评价具有较大指导意义.     

应用竞争性荧光定量聚合酶链反应检测乙型肝炎病毒DNA

目的:建立竞争性荧光定量聚合酶链反应(CFQ-PCR),并探讨CFQ-PCR在乙型肝炎病毒(HBV)临床检测中的意义.方法:根据HBV病毒adr亚型基因组序列合成一对HBV特异的引物,和一条特异的TaqMan探针;根据上述引物序列,采用分子克隆技术制备内对照DNA;再根据内对照序列合成一条内对照DNA特异的与上述TaqMan探针不同标记的TaqMan探针;将适量的内对照DNA加入到PCR反应体系中,使其与HBV靶序列共扩增.结果:在30μL CFQ-PCR反应体系中,加入约20拷贝内对照DNA能够稳定地获得共扩增曲线;经琼脂糖凝胶电泳分析,加入约100-500拷贝内对照DNA能够有效地获得共扩增产物条带信号;在210个临床HBsAg阳性血清标本的CFQ-PCR扩增中识别出8个未能有效扩增的标本,60份HBsAg阴性血清标本中识别出2个内对照未能有效扩增的标本,后经DNA纯化处理,上述全部标本的内对照均获得阳性扩增结果,其中有7个HBsAg阳性血清标本获得HBV DNA扩增阳性结果.结论:CFQ-PCR能够有效地提示临床标本HBV DNA体外扩增时由于扩增失败导致的假阴性,适合临床推广应用.     

套式及免疫套式聚合酶链反应检测乙型肝炎表面抗原阴性肝病患…

为了更准确，简便而又快速地了解乙型肝炎表面抗原（ＨＢｓＡｇ）阴性肝病患者的病因，建立了套式和免疫套式聚合酶链反应（ＰＣＲ）检测血清中乙型肝炎病毒（ＨＢＶ）ＤＮＡ的技术，结合丙型肝炎病毒（ＨＣＶ）感染指标的检测，对ＨＢｓＡｇ阴性肝病患者的病因进行了研究，发现套式ＰＣＲ能将单次ＰＣＲ的敏感性稳定地提高１０００倍；免疫套式ＰＣＲ可检测到０．１～０．０１ｐｇ／Ｌ水平，检测ＨＢｓＡｇ阴性肝硬化２２例（Ａ组）     

荧光定量聚合酶链反应检测乙型肝炎患者血清HBV DNA及临床价值

目的探讨荧光定量聚合酶链反应法定量检测乙型肝炎病毒(HBV)核酸的临床应用价值。方法应用荧光定量聚合酶链反应定量检测1962例乙型肝炎患者血清HBV DNA水平并与血清HBV标志物进行比较,并对35例乙型肝炎患者在拉米夫定治疗前后血清HBV DNA含量及相关指标作动态观察。结果乙型肝炎患者HBVDNA定量范围在6.79×102～1.95×109拷贝/毫升之间,在HBeAg阳性患者,其检出率和定量拷贝数较高。拉米夫定治疗后患者外周血HBV DNA载量下降明显。结论荧光定量PCR法是一种相对准确、灵敏度高、特异性强的定量检测HBV DNA的技术,对乙型肝炎诊断、指导、临床用药和疗效监测方面具有实用价值。     

荧光定量聚合酶链反应检测献血员HCMV-DNA

目的　了解献血员血清中HCMV核酸含量。方法　采用FQ -PCR法定量检测 36 3例献血员的血清标本。结果　经FQ -PCR检测 ,血清标本HCMVDNA平均拷贝数为 1 2× 10 5基因拷贝 /μl。献血员的血清HCMV含量在不同性别及职业、文化程度、经济水平、献血次数、献血年限、ALT水平、是否定期献血组间均差异无显著性 ,只是在不同年龄段之间有差别。以FQ -PCR为“金标准” ,发现ELISA法灵敏度为 6 7 89% ,特异度为 93 16 % ,阳性预测值为 95 4 3%。结论　FQ -PCR能够避免PCR后处理导致的假阳性污染 ,并实现实时定量     

聚合酶链反应对母婴乙型肝炎病毒感染的反馈调查

聚合酶链反应对母婴乙型肝炎病毒感染的反馈调查杨德春尚世强洪文澜为了揭示ＨＢｓＡｇ阴性母亲所引起的乙型肝炎病毒（ＨＢＶ）垂直传播及影响ＨＢＶ传播的某些因素，采用聚合酶链反应（ＰＣＲ）结合血清学方法，反馈性地（即由ＨＢＶＤＮＡ阳性新生儿调查其母ＨＢＶ感染...     

两种实时荧光定量聚合酶链反应检测血清HCV RNA的比较

目的 比较全自动病毒载量检测系统(COBAS TaqMan)和国产荧光定量PCR试剂盒对血清HCV RNA载量的检测结果,探讨两种检测方法在临床诊断和治疗中的应用价值.方法 收集26例慢性丙型肝炎患者抗病毒治疗前和治疗过程中2、4、8、12、24、36和48周的系列血标本,共168份,采用COBAS TaqMan 48全自动分析系统和广州某国产TaqMan实时PCR试剂盒分别检测系列血清中的HCV RNA载量.统计学处理采用x2检验和t检验.结果 当血清HCV RNA≥1×104IU/mL时(0周),COBAS检测和国产试剂盒均能很好测定HCV载量,而且国产试剂盒检测值为1.35×107IU/mL高于COBAS检测值2.21×106IU/mL,差异有统计学意义(t=2.05,P<0.05);血清HCV RNA<1×104IU/mL时(2～48周),COBAS检测出的HCV阳性率为21.4%(30/140),远高于国产试剂盒的1.4%(2/140),差异有统计学意义(t=3.66,P<0.01);治疗4周时,COBAS检测26例患者中14例血清HCV为阳性,12例病毒载量低于检测下限,获得快速病毒学应答(RVR);国产试剂盒检测结果为3例血清HCV为阳性,23例获得RVR.COBAS与国产试剂盒梧比,转阴率差异有统计学意义(x2=10.575,P<0.01).治疗12周时,COBAS检测完全早期病毒学应答(cEVR)率为95.7%(22/23),国产试剂盒检测的cEVR为100%(17/17),差异无统计学意义(x2=0.726,P>0.05).结论 国产荧光定量PCR试剂盒可用于HCV疑似患者的筛查和高HCVRNA载量者的确诊,对于低HCV RNA载量的疑似患者和抗病毒治疗过程中HCV载量的检测,COBAS则更为敏感.

Abstract：

Objective To compare the plasma hepatitis C virus(HCV)RNA levels detected by the fully automated viral load detection system(COBAS TaqMan)and the national real-time quantitative polymerase chain reaction(PCR)kit,and to investigate the clinical application value of these two methods in clinical practice.Methods A total of 168 serial plasma samples collected from 26 patients with chronic hepatitis C(CHC)before and at week 2,4,12,24,36 and 48 of antiviral treatment were detected by both COBAS Taqman 48 analyzing system and the national real-time quantitative PCR kit.The results of two methods were compared by chi square test and t test.Resnlts Both COBAS and national kit showed great positive detecting results when HCV RNA≥1×104IU/mL(at week O),and the virus load value detected by national kit was significantly higher than that detected by COBAS(t=2.05,P<0.05).However,when HCV RNA<1×104(at week 2-48),the positive rate of HCV detected by COBAS was significantly higher than that detected by national kit (t=3.66,P<0.01).At week 4 of treatment,the rapid virological response(RVR)rate was 46.2 % (12/26)detected by COBAS,while that was 88.5%(23/26)detected by national kit,and the difference was significant(x2=10.575,P<0.01).At week 12 of treatment,the complete early virological response(cEVR)was 95.7%(22/23)detected by COBAS,while that was 100%(17/17)detected by national kit,and the difference was not significant(x2=0.726,P>0.05).Conclusions The national TaqMan real-time quantitative PCR kits could be used to screen the suspected cases of HCV infecrion and to diagnose CHC cases with high HCV virus load.COBAS detection is more sensitive in cases with low HCV virus load and in on-treatment monitor during anti-HCV therapy.     

三种乙型肝炎病毒DNA定量聚合酶链反应试剂比较及其假阴性原因分析

乙型肝炎e抗原（HBeAg）是乙型肝炎病毒（HBV）复制的一个标志，乙型肝炎表面抗原（HBsAg）阳性、HBeAg阳性、抗-HBc阳性的患者体内HBV DNA亦较高。有报道所有该类标本均可检测到HBV DNA，且绝大部分（83．33％）的HBV DNA滴度高于10^6拷贝／ml。然而，我们在对临床标本进行HBV DNA定量检测中发现，相当一部分该类血清标本不能检测到HBV DNA或检测结果低于试剂盒检测下限。为了排除所用试剂盒缺陷造成的可能，我们对目前国内医疗机构常用的三种HBV DNA荧光定量聚合酶链反应（PCR）试剂进行了比较与分析。     

SYBR实时定量聚合酶链反应检测鸭乙型肝炎病毒的研究

采用SYBR实时定量聚合酶链反应(PCR)检测鸭乙型肝炎病毒(DHBV)，现将结果报道如下。     

聚合酶链反应检测乙型肝炎患者肝外组织中的乙型肝炎病毒DNA

应用巢式聚合酶链（ＰＣＲ）技术对１８例石蜡包埋的胆囊、肾、脾、肾上腺、心、睾丸、胰腺及肝脏组织的乙型肝炎病毒（ＨＢＶ）ＤＮＡ进行了检测，并与其免疫组化及原位杂交方法作比较。二组引物检测的结果表明：肝组织中均有ＨＢＶ感染，其中５例有ＨＢＶ的复制。肝外组织中ＨＢＶ检出率分别为胆囊８５．７％、７５．０％、肾７２．７％、肾上腺６６．７％、心脏５５．６％、睾丸５５．６％和胰腺５４．５％，但均未检测出ＨＢＶ的复制，ＰＣＲ检测发现与免疫组化及原位杂交结果基本一致。ＨＢＶ可以感染肝外组织但并不在这些组织中复制的发现可以解释受感染的肝外组织可以作为肝外感染源，但并不引起这些脏器出现明显的病理变化。     

乙型肝炎病毒基因型(A-F)多引物PCR分型法的初步建立

目的：建立一种简便易行的乙型肝炎病毒基因分型方法（只需PCR）。方法:对GenBank中查获的114例HBV全序列进行比较分析，找出每种基因型相对于其他5种基因型的独特序列，并根据这些独特序列设计出6对分别针对A－F基因型的特异引物。用这6对引物分别对标本进行PCR，根据阳性结果判断出标本的基因型。进一步简化该方法，用多引物对PCR法（PCR with several primer sets in a single tube,Multiplex PCR)将B，C，D3种基因型的特异引物混合进行PCR，根据扩增片断的大小判断基因型。用此方法对已鉴定的B，C，D型标本进行比较和验证。结果：单引物对PCR与多引物对PCR的分型结果一致，且与以前用PCR－RFLP法的分型结果一致。结论：用多引物对PCR分型法准确易行，灵敏性高，便于推广应用。     

Rapid and quantitative detection of hepatitis B virus

Despite availability of a universal vaccine, hepatitis B virus(HBV) infection has a huge impact on public health worldwide. Accurate and timely diagnosis ofHBV infection is needed. Rapid developments have been made in the diagnostic and monitoring methods for HBV infection, including serological and molecular assays. In clinical practice, qualitative hepatitis B surface antigen(HBs Ag) testing has long served as a diagnostic marker for individuals infected with HBV. More recently, HBs Ag level has been used to predict treatment outcome when determined early during treatment or at baseline. However, identification of HBV DNA positive cases that do not have detectable HBs Ag has encouraged the application of molecular tests. Hence, combination of quantitative detection of HBV DNA and HBs Ag can be used to discriminate patients during the course of HBV infection and to monitor therapy. This article reviews the most commonly used quantitative methods for HBs Ag and HBV DNA.     

乙型肝炎病毒共价闭合环状DNA套式-实时荧光定量聚合酶链反应的建立

目的 建立检测HBV共价闭合环状DNA(cccDNA)的套式一实时荧光定量PCR法.方法 根据HBV cccDNA与松环DNA(rcDNA)结构上的差异,设计2对跨缺口的特异引物及1条位于负链缺口下游的特异TaqMan荧光探针.根据Plasmid-SafeTM ATP-Dependent Dnasc(PSAD)对rcDNA与cccDNA作用的不同,对模板DNA进行酶切纯化,降解reDNA,再进行套式PCR扩增,先用外引物和模板进行第一轮常规PCR,再用内引物、荧光探针和第一轮PCR产物进行实时荧光定量PCR,根据阳性参照标准品,得出待检标本定量值.结果 检测阳性参照标准品.得出该方法灵敏度可达2 lg拷贝/mL.用上述方法检测34份乙型肝炎患者血清HBV DNA阳性标本,25份血清HBVcccDNA阳性,28份外周血单个核细胞HBV cccDNA阳性.27份健康对照者血清HBV DNA阴性标本,6份HBV cccDNA阳性.对5份HBV cccDNA阳性标本扩增产物进行克隆测序,无碱基缺失、突变.与HBV不同基因型序列(A～G)比较,同源性为90.6%～99.1%,其中,与B、C基因型同源性为95.3%～99.1%,验证了方法的特异度.结论 套式-实时定量PCR法可检测乙型肝炎患者血清、PBMC中的HBV CCCDNA,且具有敏感、特异性.     

乙型肝炎病毒基因组剪接变异体结构分析

目的 了解乙型肝炎病毒(HtBV)基因组剪接变异体的基因结构及特点。方法 从慢性乙型肝炎患者血清中扩增并克隆HBV基因组剪接变异体DNA，测序并比较基因结构特点。结果 共获得10种HBH基因组剪接变异体，基因组大小介于765～2039bp之间。导致剪接变异体产生的5′端供体位点和3′端受体位点各6个。HBVH基因组剪接变异体在C、前-Sl、前-S2及S编码区存在不同程度的缺失，但均保留与致病密切相关的X基因以及病毒复制、包装所必须的DNA序列。结论 HBV基因组剪接变异体在慢性乙型肝炎患者血清中普遍存在。     

Long-term clinical impact of occult hepatitis B virus infection in chronic hepatitis B patients

BACKGROUND/AIMS: Long-term clinical outcomes of occult hepatitis B virus (HBV) infection were studied. METHODS: Fifteen chronic hepatitis B patients were monitored for a median of 4.4 years (range 0.9-15.3) after hepatitis B surface antigen (HBsAg) seroclearance. Serum HBV DNA was measured by real-time detection polymerase chain reaction. Thirteen patients underwent liver biopsies at the end of follow-up and liver histology was evaluated by Ishak score. Liver HBV DNA was also measured for 12 patients. RESULTS: At the end of follow-up, HBV viremia was absent in 13 (87%) patients, and antibody titers to hepatitis B core antigen showed an inverse correlation with time from HBsAg seroclearance (r=-0.554; P=0.0040). However, all patients retained liver HBV DNA and tested positive for the covalently closed circular HBV DNA replicative intermediate. The hepatic HBV DNA loads had no relation to liver histology. Paired biopsies from 11 patients disclosed that each necroinflammatory score significantly improved after HBsAg seroclearance. Amelioration of liver fibrosis was also evident in eight (73%) patients (P=0.0391 by signed rank test). CONCLUSIONS: A long-standing but strongly suppressed HBV infection may confer histological amelioration after HBsAg seroclearance.     

HepG2.2.15细胞内乙型肝炎病毒cccDNA的定量检测

目的　建立一种细胞内乙型肝炎病毒cccDNA的定量检测方法。方法　消化收集处于对数生长期的HepG2.2.15细胞,取1×106 个细胞用小量质粒抽提试剂盒抽提细胞内的cccDNA,抽提产物用绿豆核酸酶酶切纯化,所得酶切产物用特异的引物和探针进行选择性荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测。用对数生长期前的细胞培养上清液、4 份HBV DNA阳性和2 份HBV DNA阴性的慢性乙型肝炎(轻度)患者血清验证荧光定量PCR法的特异性,并用不同浓度的质粒标准品检测该方法的敏感性。结果　证实HepG2.2.15细胞内存在cccDNA,其含量约为每个细胞18 拷贝。对数生长期前培养上清液和慢性乙型肝炎(轻度)患者血清均未检测到荧光信号,本实验条件下用该方法可检测低至103 拷贝/ml的cccDNA分子。结论　该方法操作方便,特异性高,敏感性较好,可用于定量检测细胞内的cccDNA及抗病毒药物的筛选和评价等。     

乙型肝炎病毒基因型的分布及与临床相关性

目的了解镇江地区乙型肝炎病毒(HBV)基因型的分布及与临床的相关性。方法选择镇江地区HBV感染者257例,其中慢性HBV携带者49例,慢性乙型肝炎轻度52例、中度38例、重度32例,重型肝炎22例,肝硬化41例,原发性肝癌23例。应用聚合酶链反应(PCR)微板核酸杂交-酶联免疫吸附(ELISA)技术检测HBV的基因型。结果257例HBV感染者中B基因型112例(43.6%),C基因型140例(54.5%),B C基因型5例(1.95%),未发现A、D、E、F、G和H基因型。C基因型在慢性乙型肝炎重度、重型肝炎、肝硬化、肝细胞癌中占绝对优势,分别占65.6%、72.7%、68.3%、78.3%,显著高于慢性HBV携带者的38.8%,P<0.05。C基因型HBV感染者的血清丙氨酸氨基转移酶(ALT)水平(262.3±319.7u/L)、总胆红素(TBIL)水平(69.9±35.8μmol/l)、HBeAg阳性率(67.1%)、HBV DNA定量中位数绝对值(6.02±1.34)显著高于B基因型(141.5±206.1u/L)、(38.3±22.4μmol/l)、46.4%和4.18±1.10,P<0.05。B基因型HBV感染者的血清白蛋白(ALB)水平(39.6±9.6g/)显著高于C基因型(30.1±7.3g/l),P<0.05。结论PCR微板核酸杂交—ELISA技术可用于HBV基因型的临床检测。镇江地区HBV感染者基因型以单一的B型或C型为主,含少量B C型。C基因型为本地区优势基因型,并在严重肝病和原发性肝癌中比例较高,其引起的ALT、TBIL、病毒血症水平均较高,HBeAg血症持续时间长,故预后较差。