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相似文献
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1.
不同产地老鹳草遗传多样性ISSR分析   总被引:1,自引:1,他引:0  
尹海波  王吉华  涂秀文  朱明慧  姜海燕  钟鸣 《中草药》2013,44(22):3206-3211
目的 从DNA水平对老鹳草种质进行遗传多样性分析,并建立老鹳草稳定的ISSR-PCR反应体系。方法 采用正交试验设计及单因素梯度优化相结合的方法确定老鹳草ISSR-PCR反应体系,对我国20个主要分布区的老鹳草进行ISSR-PCR扩增与检测,扩增结果转化为“0”、“1”矩阵后,利用Popgene32及Ntsyspc-2.1软件对数据进行处理计算遗传距离,并采用UPGMA聚类法构建亲缘关系树状图。结果 15条引物共得到207条清晰可辨的扩增条带,其中有197条呈现多态性,占94.6%,遗传距离变化范围在0.201 8~0.939 4。20份样品分为2大类,聚类较为复杂,大多种质遗传多样性与地理位置及生态环境具有一定的关系。结论 我国老鹳草植物的遗传多样性十分丰富,为筛选优质种质奠定了遗传基础。  相似文献   

2.
不同产地石斛属种质资源的ISSR遗传多样性分析   总被引:3,自引:2,他引:1  
目的 对24份不同产地石斛属样品的遗传多样性和亲缘关系进行分析.方法 采用ISSR分子标记技术和非加权平均距离法(UPGMA)对24份石斛属样品进行遗传多样性和聚类分析.结果 从100条ISSR引物中共筛选出6条多态性稳定、清晰的引物,24份石斛样品共扩增出847个DNA片段,平均每个引物扩增出141个DNA片段,其多态性为100%.结论 24份不同产地石斛样品被划分为6个类群,遗传多样性非常丰富.  相似文献   

3.
石建明  李牡丹  杨鹏  陈兴银  彭昌琴  刘鑫  关萍 《中草药》2018,49(13):3122-3126
目的对贵州不同产地粗毛淫羊藿样品的遗传多样性和亲缘关系进行分析。方法利用Pop Gene 32软件及NTsys2.10e软件分析贵州5个不同产地粗毛淫羊藿的遗传多样性及亲缘关系,并根据UPGMA法,构建亲缘关系树状图。结果从100个随机引物中筛选出13条多态性稳定、条带清晰的引物,结果表明,共扩增出211个位点,从物种水平上看,共有205个多态性位点,多态性百分率(PPB)为97.16%,Shannon’s信息指数(I)为0.455 7,Nei’s基因多样性指数(H_e)为0.297 3,有效等位基因数(N_e)为1.490 2,5个居群间总的遗传多样性(H_t)为0.297 3,而居群内的遗传多样性(H_s)为0.207 5,表明粗毛淫羊藿的遗传变异主要存在于群体内,种群内的遗传分化大于种群间。利用UPGMA法构建的居群遗传距离聚类树,表明,5个居群被分为2支,其中来自安顺、花溪、高坡的3个居群聚在一支,来自龙里和雷山的2个居群共同聚为一支。结论 ISSR分子标记技术可以用于贵州不同产地的粗毛淫羊藿植物的遗传多样性和亲缘关系分析。  相似文献   

4.
张旻桓  金晓玲  成仿云  卢惊鸿  吴莎 《中草药》2016,47(7):1193-1198
目的深入了解和掌握湖南产牡丹Paeonia suffruticosa的亲缘关系及遗传多样性。方法利用ISSR分子标记生物技术从100条ISSR引物中筛选出条带清晰、多态性好的引物7条,对源自湖南省内牡丹种质资源及部分实生后代共47份样品DNA进行扩增实验。结果共扩增获得77条带型完整清晰的谱带,其中多态性带为67条,多态位点比率为87.01%,表明湖南产牡丹种质资源多态性较高,具有较高的遗传多样性。经计算机软件计算结果分析,平均有效等位基因数为1.395 4,平均Nei’s基因多样性指数为0.248 0,平均Shannon’s信息指数为0.385 9;各品种间的Jaccard相似系数介于0.532 5~0.961 0,平均为0.751 5。UPGMA作图法将47份材料划分为2个类群3个亚类,很好地将不同来源的品种区分开来。结论从分子水平上揭示了湖南产牡丹品种间亲缘关系及较高的遗传多样性,为耐湿热牡丹的新品种选育工作提供了理论依据。  相似文献   

5.
魏晓雨  田义新  赵智灵  孙福仁 《中草药》2014,45(21):3153-3158
目的采用RAPD和ISSR分子标记技术对我国10个产地的西洋参Panax quinquefolium的遗传多样性进行分析。方法以人参及加拿大西洋参为对照,采用CTAB法提取基因组DNA,选取13个RAPD随机引物及12个ISSR引物对样品进行PCR扩增,根据条带数目,应用NTSYS-pc2.10e软件采用UPGMA方法进行聚类分析。结果 13条RAPD引物共扩增出97条清晰条带,多态性条带81,多态性百分率为85.51%;12条ISSR引物共扩增出99条清晰条带,多态性条带64,多态性百分率为64.65%;通过聚类分析,RAPD及RAPD+ISSR综合将样品聚为4大类;ISSR将样品聚为2大类。结论 RAPD和ISSR标记构建的样品聚类树状图在分类上稍有差异,但总体趋势一致。人参与西洋参被明显区分开来;在ISSR上,吉林兴参镇与北岗镇西洋参与人参聚为一大类;在生长环境及种植条件影响下,东北部分产地西洋参与加拿大西洋参相比在遗传多样性上有所改变。  相似文献   

6.
卜静  王冬梅  李登武 《中草药》2012,43(9):1824-1828
目的 研究中国不同居群野生玉竹种质资源的遗传多样性.方法 选取我国11个不同居群的野生玉竹样品和1个居群的栽培样品进行ISSR分析,Popgene 32及Ntsyspc-2.1软件分析处理数据.结果 通过筛选得到10条ISSR引物,扩增得到115条带,其中108条为多态性条带,多态性条带百分率为93.38%; Nei's基因多样性(H)为0.432 1±0.084 1,Shannon 信息指数(Ⅰ)为0.619 7±0.100 5,遗传距离(GD)变异为0.128 9~0.496 5;利用UPGMA法构建分子树状图,可将12个居群聚合为两大类.结论 不同产地野生玉竹种间存在较高的多态性,遗传多样性较为丰富;野生玉竹的遗传多样性高于栽培居群的遗传多样性,可能与栽培方式和环境因素有关;药用植物玉竹对环境变化的适应能力强,地理来源相同的野生居群和栽培居群先行聚合,与其种质间的亲缘关系较近有关;聚类结果可以部分反映地理分布的特点,为种质资源的鉴定打下良好基础.  相似文献   

7.
白术遗传多样性ISSR分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
孙靓  郑玉光  袁媛  卜璟  王雪  蒋超  陈敏 《中国中药杂志》2012,37(22):3381-3385
目的:对白术12个栽培居群及3个半野生居群的遗传多样性进行分析.方法:应用ISSR分子标记技术研究浙江、安徽、河北等省15个居群356个样品的遗传多样性;采用POPGEN32进行数据分析,UPGMA绘制聚类图.结果:13条ISSR引物共检测到102个清晰的扩增位点,多态性位点94个,多态位点百分率为92.16%;Nei's基因多样性指数(Hr)为0.406 5,Shannon多样性指数(I)为0.590 3,基因分化系数(Gst)为0.202 5.居群间的遗传相似系数为0.690 7 ~0.960 5,平均为0.825 6.聚类分析可知,居群间并无明显分类.结论:白术具有较高的遗传多样性,遗传分化水平低,无明显地域性差异及品种差异.这与白术目前栽培及种质流通现状呈正相关.  相似文献   

8.
李华  史美荣  肖娅萍 《中草药》2015,46(11):1666-1672
目的研究绞股蓝Gynostemma pentaphyllun种质资源的遗传多样性及亲缘关系。方法采用ISSR分子标记技术对来自全国12个省市不同生态环境的48份绞股蓝种质材料进行遗传多样性及亲缘关系分析。结果 100条ISSR引物中共筛选出15条扩增条带清晰、稳定性好且多态性明显的引物,48份材料DNA扩增共获得214个位点,其中多态位点206个,多态性比率(PPL)96.26%,平均每条引物扩增位点为14.27个;平均观察等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Shannon多样性信息指数(I)和Nei’s基因多样性指数(H)分别为1.962 6、1.335 8、0.221 1和0.359 8;种质材料间的遗传相似系数变幅为0.57~0.96,平均为0.72。利用UPGMA聚类分析,以遗传相似系数0.71为界,48份材料聚为4大类。结论绞股蓝种质材料间的遗传多样性较高,种质间的亲缘关系与其地理分布和生态环境并不完全一致。  相似文献   

9.
目的:从DNA分子水平分析不同产地猫豆的遗传多样性,探索其相互之间的亲缘关系。方法:采用简单重复序列区间(ISSR)分子标记技术对11份不同产地猫豆进行聚类分析,ISSR-聚合酶链式反应(PCR)扩增程序为94℃预变性4min,94℃变性45s,48~54℃退火1min,72℃延伸90s,40个循环,72℃延伸7min,10℃保存。在单因素试验基础上,通过L16(45)正交试验考察ISSR-PCR的5个主要因素(Mg2+,引物,dNTPs,模板DNA及Taq聚合酶)。运用Ntsys-pc软件和Popgene软件对11份样品进行分析。结果:ISSR-PCR反应最佳体系为模板DNA20ng,0.3μmol·L-1引物,0.15mmol·L-1的dNTPs,2.4mmol·L-1MgCl2,1UTaqDNA聚合酶(5U·μL-1),PCR缓冲液2μL,加入灭菌水至20μL。从40条ISSR引物中筛选出10条扩增条带清晰且重复性良好的引物,共扩增出97个条带,其中多态性条带25条,多态性位点比率25.8%。11份猫豆资源间的遗传相似系数0.866~0.9691,聚类分为3个大类群。结论:猫豆遗传差异与地理分布有一定关系,但整体遗传变异小,遗传稳定性强。  相似文献   

10.
川乌遗传多样性的ISSR鉴定   总被引:8,自引:2,他引:8  
罗群  马丹炜  王跃华 《中草药》2006,37(10):1554-1557
目的应用ISSR标记技术分析川乌遗传多样性。方法对江油附子和9个野生乌头居进行了ISSR分析,探索川乌各居群间的遗传多样性。结果8个引物共扩增出98条带。其中68条具有多态性,多态位点百分率为69.39%;观测等位基因数(Na)为1.6939,有效等位基因数(Ne)为1.3715,Nei′s基因多样性指数为0.2308,Shannon信息指数(I)为0.3530;用ISSR855引物能够区分川乌的10个供试居群。结论ISSR标记适合于构建川乌的DNA指纹图谱、品种鉴定和遗传多样性分析。  相似文献   

11.
不同产地丹参遗传关系的DNA标记分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的 分析不同产地丹参的遗传背景与遗传关系,为丹参药材的栽培育种提供依据.方法 采用RAPD与ISSR标记对4个产地的野生丹参、6个产地的栽培丹参共计50个样本进行分析,利用分析软件计算遗传相似性,建立遗传聚类图.结果 DNA标记共检测了102个位点,多态条带比率(P)为95.10%,栽培丹参的P值高于野生丹参;居群的总遗传变异Ht为0.238 9;UPGMA聚类可以将不同来源的丹参很好地区分开来.结论 不同产地间的丹参存在丰富的遗传多样性,丹参种质在遗传背景上较为复杂,不同产地的丹参已出现明显的遗传分化,但是与地理分布没有相关性.  相似文献   

12.
Zhang Y  Yu L  Ao M  Jin W 《Journal of ethnopharmacology》2006,105(1-2):274-279
Maca (Lepidium meyenii Walp.) is a cruciferous plant from the Andes of Peru. The root of Maca is traditionally employed for its supposed properties in aphrodisiacs and improving fertility, it also has been widely used to help alleviate the symptoms of menopause. The purpose of this study was to evaluate the effect of ethanol extract of Maca on postmenopausal osteoporosis in ovariectomized rats. Female Sprague-Dawley rats were divided into four groups: Sham-operated and ovariectomized groups were fed with equivolume of distilled water, and the remaining ovariectomized groups were orally administrated with ethanol extract of Maca at 0.096 and 0.24 g/kg for 28 weeks. The findings derived from the basis of bone mineral density, biomechanical, biochemical and histopathological parameters indicated that higher dose of ethanol extract of Maca was effective in the prevention of estrogen deficient bone loss.  相似文献   

13.
Lepidium meyenii Walpers (Maca) is traditionally employed in the Andean region for its supposed properties to improve energy and fertility. The aim of this study was to evaluate the effect of acute and chronic Maca pulverised root oral administration on rat sexual behaviour. Sixty male sexually experienced rats (20 group) were daily treated for 15 days with Maca 15 mg kg(-1), Maca 75 mg kg(-1) or saline 0.5 ml kg(-1). The following sexual performance parameters were evaluated at first and last day of treatment: 1st mount (ML), 1st intromission (IL), ejaculation (EL) and postejaculatory (PEL) latencies, intercopulatory interval (ICI) and copulatory efficacy (CE). An activity cage test was carried out to evaluate if Maca-induced locomotion changes could indirectly improve rat sexual performances. It was observed that both lower and higher Maca doses acutely decreased ML, IL and ICI in a significant way (P < 0.05), while only the 75 mg kg(-1) dose decreased the PEL (T = 29, P < 0.05). This effect seems to be the only one dose-dependent. After 15 days of treatment, both doses are able to significantly decrease ML, IL, EL and PEL, while the 75 mg kg(-1) dose decreased the ICI (T = 40, P < 0.05) too. IL, EL and PEL variations seem to be dose-related after chronic treatment. Moreover, chronic Maca treatment induced an apparently not dose-related increase in rat locomotion, during the second 10-min period of observation in the activity cage. The late in Maca-induced locomotion modification excludes that improvement of tested sexual performance parameters is related to an increase in rat aspecific activity. Thus, it was concluded that both acute and chronic Maca oral administration significantly improve sexual performance parameters in male rats.  相似文献   

14.
不同产地丹参药材的ISSR分析与鉴别   总被引:7,自引:1,他引:7  
目的对不同产地丹参药材的亲缘关系进行分析研究,建立具有鉴别意义的DNA指纹图谱。方法采用ISSR分子标记对丹参药材的基因组DNA进行PCR扩增,利用NTSYS-pc2.1和POPGENE 1.32软件分析不同产地药材间的亲缘关系,构建树系图。结果从66条ISSR引物中筛选出两条具有鉴别意义的多态性引物,在11个不同产地的丹参药材中共得到32位点,1条是单态的,31条是多态的,多态性位点达96.88%,遗传距离在0.1699~1.0678,平均为0.4712。结论不同产地的丹参药材间遗传分化明显,具有丰富的遗传多样性,但是遗传分化与地理关系没有表现出相关性。ISSR标记可以作为不同产地丹参药材鉴别的有效分子标记。  相似文献   

15.
目的对不同来源的赶黄草进行遗传多样性分析,为进一步开发利用和保护赶黄草药用资源提供理论基础。方法利用ISSR分子标记方法对7个不同来源110个赶黄草样品进行DNA分子水平的评价,采用PAUP 4.0b软件处理进行聚类分析。结果筛选出19个ISSR引物,利用其中3条引物进行了不同来源赶黄草样品的ISSR-PCR分析,共获得34条多态性条带,多态位点百分率为100%,同时进行了居群间遗传多样性差异分析。结论赶黄草四川居群与其他两个居群间存在着一定的分化。本方法在评价赶黄草遗传多样性、亲缘关系、品种鉴别、遗传进化等方面有很好的适用性,可为赶黄草及其近缘属植物的系统学研究提供更多信息。  相似文献   

16.
黑籽重楼种内形态标记和ISSR标记的遗传分化研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
该文对黑籽重楼Paris thibetica种内两变种--黑籽重楼原变种Paris thibetica var. thibetica与无瓣黑籽重楼Paris thibetica var. apetala在形态学及ISSR分子标记上的差异进行了研究和比较.形态特征分析表明黑籽重楼原变种与无瓣黑籽重楼在萼片长宽、花药数、花丝长等7个花器官性状方面有显著差异,但通过在主成分分析图上不能明显区分两个变种,两变种总体形态上的分化不明显.ISSR分析上,从100个ISSR引物中筛选出8个引物,在300~1500 bp间共扩增出 36条带,其中黑籽重楼原变种特征带有5条,无瓣黑籽重楼扩特征带有8条.  相似文献   

17.
目的:研究玛咔根脂溶性部位的化学成分。方法:通过研究不同的提取方法,包括超临界CO2萃取法、回流提取法、水蒸气蒸馏法,提取得到玛咔根脂溶性部位并对其进行化学成分研究。结果:通过GC-MS分析,超临界CO2萃取法、回流提取法(石油醚、80%乙醇)、水蒸气蒸馏法(包括比重大于1与小于1部位)分离鉴定的化合物数目分别为38、31、14、21(比重小于1部位)、25(比重大于1部位),分别占其脂溶性样品总量的85.79%、81.18%、62.08%、98.36%(比重小于1部位)、81.54%(比重大于1部位)。结论:该结果为玛咔的进一步深入研究与开发奠定了一定基础。  相似文献   

18.
贵州天麻遗传多态性的ISSR初步分析   总被引:6,自引:0,他引:6  
目的:构建贵州天麻ISSR指纹图谱,分析彼此间的遗传关系。方法:采用ISSR分子标记技术对贵州省境内的23个野生和栽培天麻居群的样品进行了初步研究,从24个ISSR引物中筛选出4个有效引物,在供试的23个样品中共检测到32个位点,其中29个表现出多态性,占总带数的90.63%,平均每个引物扩增的DNA带数为8条。天麻的多态位点百分率(PPB)在80%和100%之间。用NTSYSpc,vet.2.02软件进行UFGMA聚类分析。结果:23个居群的相似性系数在0.13—1.00之间,同一变型的天麻样品并不严格聚为一类,不同变型天麻样品之间的遗传变异较大。结论:地理分布和生长环境的差异以及人为的选择是导致天麻形成丰富的遗传多态性的一个重要的原因。  相似文献   

19.
目的建立香附ISSR分子标记的方法,对10个不同种源香附的遗传多样性和亲缘关系进行分析。方法采用ISSR分子标记技术和非加权平均距离法(UPGMA)对不同种源香附进行遗传多样性和聚类分析。结果从51条ISSR引物中筛选出14条扩增条带清晰且重复性好的引物,共扩增出116条带,其中多态性条带106个,总多态位点百分率(PPB)为91.7%; Nei's基因多样性指数(H)为0.309 8,Shannon's多态性信息指数(I)为0.471 3;种源间遗传相似度范围在0.396 6~0.801 6,遗传距离范围在0.298 9~0.882 3;根据ISSR聚类分析结果可将10个不同种源的香附分为2大类群。结论 ISSR可作为研究香附遗传多样性及遗传分化的有效标记。香附种质资源间具有很高的多态性,遗传多样性水平较为丰富;遗传亲缘关系与产地具有一定的相关性,但地理位置不是唯一主导因素。  相似文献   

20.
目的 采用简单序列重复区间(ISSR)分子标记技术分析不同产地温莪术的遗传多样性和亲缘关系。方法 以3个产地8个温莪术居群的42个样品为材料,从20条ISSR引物中筛选出6条进行PCR扩增,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳检测后,利用PopGene 32软件对不同居群ISSR标记结果进行多态性分析,通过UPGMA方法聚类并构建亲缘关系树。结果 6条引物共扩增出 42 个多态性位点,居群水平多态位点平均百分率为29.17%。居群间遗传分化系数Gst为0.3886,居群间每代个体的基因流系数(Nm)为 0.7868。8个居群遗传一致性范围为 0.8481-0.9736,遗传距离范围为 0.0268-0.1647。结论 供试8个温莪术居群之间的遗传多样性水平偏低,遗传变异较少,基因流动性水平较低。本研究的开展为温莪术的引种栽培及育种提供了一定的分子生物学依据。  相似文献   

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