广西扶绥县壮族肝癌家系人群Itgb1基因多态性与肝癌遗传易感性的研究

目的 研究广西扶绥县壮族肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC,以下简称肝癌)高发家系人群Itgb1基因rs2298141位点单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)和肝癌遗传易感性的关系.方法 采用病例-对照研究方法,选择扶绥县20个肝癌高发家系共79例(肝癌高发家系组)和10个正常对照家系共40名(正常对照家系组)为研究对象,应用时间飞行质谱技术(MALDI-TOF MS)检测两组Itgb1基因rs2298141位点的基因型及等位基因频率,并应用非条件logistic回归分析该位点基因多态性与肝癌遗传易感性的关系.结果 正常对照家系组人群携带AA、AG、GG基因型频率分别为40.00％、47.50％、12.50％.肝癌高发家系组人群携带AA、AG、GG基因型频率分别为50.00％、40.00％、10.00％;两组Itgb1基因rs2298141位点各基因型频率与期望值吻合度较好(P＞0.05),符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律.正常对照家系组人群中AG、GG基因型个体罹患肝癌的风险分别是AA基因型个体的0.67倍(95％CI:0.22～2.1,P=0.50)和1.05倍(95％CI:0.17～6.6,P=0.96);肝癌高发家系组人群中未患肝癌者AG、GG基因型个体罹患肝癌的风险分别是AA基因型个体的0.91倍(95％CI:0.31～2.71,P=0.86)和2.2倍(95％CI:0.40～11.96,P=0.37),但差异无统计学意义(P＞0.05).结论 广西扶绥县壮族人群中Itgb1基因rs2298141位点的SNP与罹患肝癌无明显相关性.     

广西扶绥县壮族人群ITGβ1基因多态性与肝癌家系遗传易感性的关系

目的 探讨广西扶绥县壮族人群中肝癌高发家系ITGβ1基因rs2298141位点多态性与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)遗传易感性的关系.方法 采用病例-对照研究方法,选取广西扶绥县壮族人群正常对照家系组40名;肝癌高发家系组79例,其中肝癌患者20例,直系亲属59例.采用质谱方法检测ITGβ1基因rs2298141位点基因型分布频率,非条件logistic回归分析不同基因型与HCC发病风险的关系.结果 ITGβ1基因rs2298141位点存在AA、AG、GG 3种基因型.ITGβ1基因rs2298141位点基因型分布遵循Hardy-Weinberg遗传平衡定律.ITGβ1基因rs2298141位点A等位基因在正常对照组、肝癌高发家系直系亲属组、肝癌高发家系肝癌患者组中的分布频率分别为63.75％、61.02％、70％,G等位基因分布频率分别36.25％、38.98％和30％,与A等位基因型个体比较,正常对照家系人群中携带G等位基因型的个体发生HCC的风险增加0.75倍(95％ CI:0.33～1.7,P=0.50),肝癌高发家系直系亲属组人群发生HCC的风险增加0.67倍(95％CI:0.31～1.45,P=0.31).正常对照家系组、肝癌高发家系直系亲属组和肝癌高发家系肝癌患者组人群AA基因型分布频率分别为40％、42.73％和50％,AG基因型分别为47.5％、37.29％和40％,GG基因型分别为12.5％、20.34％和10％.与AA基因型个体相比,正常家系组和肝癌高发家系直系亲属组中AG基因型个体发生HCC的风险分别增加0.67倍(95％ CI:0.22～2.1,P=0.50)和0.9倍(95％ CI:0.31～2.71,P=0.86);GG基因型个体发生HCC的风险分别增加1.05倍(95％ CI:0.17～6.6,P=0.96)和2.2倍(95％ CI:0.40～11.96,P=0.37),差异均无统计学意义(P＞0.05).结论 未发现ITGβ1基因rs2298141位点多态性与广西扶绥县肝癌家族聚集的遗传易感性存在显著相关.     

Rac 1基因rs 6951997位点多态性与广西扶绥县壮族肝癌家族聚集的遗传易感性关系

目的探讨广西扶绥县壮族Rac 1基因rs 6951997位点多态性与肝癌家族聚集的遗传易感性关系。方法以广西扶绥县壮族20个肝癌高发家族(肝癌家族组79例)和10个健康对照家族(健康对照家族组40名)为研究对象,应用飞行时间质谱技术(MALDI-TOF MS)检测两组中Rac 1基因rs 6951997位点的基因型及等位基因频率,以非条件logistic回归分析其多态基因型与肝癌发生危险性的关系。结果肝癌家族组Rac 1基因rs 6951997位点的GT基因型的分布频率(6.30%)高于健康对照家族组(2.50%),二者差异无统计学意义(OR=3.76,95%CI∶0.28~51.45,P=0.32)。其位点等位基因T型、G型在肝癌家族组中的分布频率分别为96.83%、3.16%,在健康对照家族组中的分布频率分别为98.75%、1.25%,两组差异均无统计学意义(P均>0.05)。结论 Rac 1基因rs 6951997位点多态性与广西扶绥县壮族肝癌家族聚集的遗传易感性未有显著相关。     

广西扶绥县壮族人群 ESR1 基因SNP与肝癌家系遗传易感性的关系

目的：探讨广西壮族自治区扶绥县肝癌高发地区壮族人群雌激素受体1基因（estrogen receptor1 gene, ESR1）单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与肝癌遗传易感性的关系。方法： 采用病例-对照研究和限制性片段长度聚合酶链反应（PCR-RFLP）方法,对扶绥县21个肝癌高发家系组共85例及同居住地10个正常对照家系组共39例进行 ESR1 基因型分布频率的检测;运用非条件Logistic回归分析基因多态性与肝癌发生危险性的关系,并将实验结果结合临床资料进行统计学分析。 结果： （1）经 ESR1 基因型检测分型,正常对照家系组人群携带AA、AG、GG基因型频率分别为74.36%、17.95%和7.69%;肝癌高发家系组人群携带AA、AG、GG基因型频率分别为83.53%、11.76%和4.71%;（2）基因型在两组人群中的分布符合 Hardy-Weinberg平衡定律;（3）正常对照家系组人群中AG、GG基因型个体罹患肝癌的风险率分别是AA基因型个体的0.218（95% CI =0.025~1917, P =0.170）和0.509（95% CI =0.049~5.260, P =0.571）,肝癌高发家系组人群中非肝癌者AG、GG基因型的个体罹患肝癌的风险率分别是AA基因型个体的0.298（95% CI =0.035~2.515, P =0.233）和0.671（95% CI =0.070~6.391, P =0729）,差异均无统计学意义。 结论： 广西扶绥县壮族人群中, ESR1 基因rs3798757位点SNP多态性与罹患肝癌无关。     

广西扶绥县壮族人群 ATF 5 基因多态性与肝癌家系遗传易感性的关系

目的:探讨广西扶绥县壮族人群ATF5基因rs283526和rs8647位点多态性与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)遗传易感性的关系.方法:采用病例-对照研究方法,选择广西扶绥县壮族人群HCC家系79例(观察组)、正常对照家系40例(对照组),运用质谱方法检测ATF5基因rs283526和rs8647位点基因型分布频率;应用非条件Logistic回归分析不同基因型与HCC发病风险的相关性.结果:对照组人群ATF5基因rs283526位点CT、TT基因型个体发生HCC的风险分别是CC基因型个体的0.181倍(95％ CI =0.440-0.736,P＜0.05)和0.348倍(95％ CI=0.151-0.804,P＜0.01)、rs283526位点携带T等位基因型的个体发生HCC的风险是C等位基因型个体的0.405倍(95％CI=0.226-0.726,P＜0.01).ATF5基因rs8647对照组人群GA、AA基因型个体发生HCC的风险分别是GG基因型个体的1.022倍和1.949倍,其携带A等位基因型的个体发生HCC的风险是G等位基因型个体的0.952倍,但差异均无统计学意义(P＞0.05).结论:广西扶绥县HCC家系ATF5基因rs283526多态性与肝癌遗传易感性有相关性,其等位基因T是HCC的保护因素.     

广西扶绥县肝癌家系XRCC1基因Arg399Gln多态性与肝细胞癌的遗传易感性

目的研究广西扶绥县肝癌家系人群DNA修复基因XRCC1Arg399Gln多态性与肝细胞癌（HCC）遗传易感性的相关性。方法采用病例-对照研究方法,对扶绥县21个肝癌家系人群和10个正常家系人群,运用PCR-RFLP方法分析XRCC1基因Arg399Gln位点多态性,并应用Logistic回归模型分析该位点多态性与肝细胞癌遗传易感性的关系。结果通过XRCC1Arg399Gln基因型检测分型,肝癌家系人群携带变异等位基因Gln的频率为23.68%,正常家系人群为13.16%,等位基因在两组间的分布差异无统计学意义（P〉0.05）。基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律。正常家系人群中携带Arg/Gln者发生HCC的风险是携带Arg/Arg者的1.622倍（95%CI=0.475～5.541,P=0.440）。肝癌家系人群中除肝癌患者外,携带Arg/Gln、Gln/Gln者发生HCC的风险分别是携带Arg/Arg者的1.198倍（95%CI=0.362～3.968）和2.964倍（95%CI=0.434～20.220,P分别为0.768、0.267）。结论广西扶绥县肝癌家系人群中,XRCC1399Arg/Gln基因型和Gln/Gln基因型者患HCC的风险较Arg/Arg基因型者有增加的趋势,但不存在显著相关性。     

相关基因的单核苷酸多态性与肿瘤的遗传易感

提到肿瘤的遗传 ,人们自然会想到单基因改变所致的家族性遗传性肿瘤综合征。然而 ,这种遗传方式在整个肿瘤的发病中只占很少的比例 (<1% ) ,绝大多数肿瘤的发生是环境因素与肿瘤易感因素共同作用的结果。而基因的单核苷酸点突变所造成的基因多态性 (ｓｉｎｇｌｅｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓ ,ＳＮＰｓ)是遗传易感的重要物质基础之一。一、环境因素与遗传因素交互作用的方式及在肿瘤发生中的意义众所周知 ,致癌的环境因素包括物理 (如辐射 )、化学 (如苯丙芘、烟草 )及生物 (如病毒、细菌、毒素 )因素 ,但无论何种因素 ,…     

单核苷酸多态性与肿瘤遗传易感性的研究进展

目的:总结国内外关于单核苷酸多态性(SNP)与肿瘤的相关研究进展。方法:应用Medline和CNKI期刊全文数据库检索系统,以"SNP"和"肿瘤"为关键词,检索1999-01-2010-11相关肿瘤易感性分析的文献。纳入标准:1)SNP的定义和应用;2)肿瘤易感基因的分类;3)SNP的作用机制;4)SNP与环境因子在肿瘤发展过程中的协同作用。根据纳入标准纳入分析43篇文献。结果:肿瘤易感相关基因包括癌基因和抑癌基因、DNA修复基因、代谢酶基因以及免疫相关基因等几大类。这些基因上含有多个SNP位点,其中有部分SNP可导致不同个体间肿瘤易感性的差异。结论:研究SNP在恶性肿瘤发生、发展过程中的致肿瘤性作用,有助于进一步理解肿瘤的发生机制,有望在肿瘤靶向治疗上取得新的突破。     

PLXNC1 多态性与广西肝癌遗传易感的关系及其表达*

目的：探讨PLXNC1 基因多态性与广西肝癌遗传易感性关系及表达。方法：以广西20个肝癌高发家族（肝癌家族组79例）和10个健康对照家族（健康对照组40例）为研究对象,应用飞行时间质谱技术检测两组中PLXNC1 基因rs 2272335 的基因型及等位基因频率,免疫组织化学染色检测PLXNC1 在不同肝组织中的表达。结果：PLXNC1 基因rs 2272335 位点健康对照组人群中携带C 等位基因型的个体发生干细胞肝癌（hepatocellularcarcinoma ,HCC ）的风险分别是T 等位基因型个体的4.16倍（95%CI 为0.37～47.3）,差异有统计学意义（P = 0.032）。核心成员组与 肝癌患者组两组间差异无统计学意义（P > 0.05）。PLXNC1 基因rs 2272335 位点基因型TT、TC、CC在肝癌患者组人群、核心成员组人群、健康对照组人群三组间者差异无统计学意义（P > 0.05）。 肝癌组织中,PLXNC1 蛋白表达水平3.12± 1.12显著高于肝癌癌旁组织1.54± 0.67和正常肝组织1.23± 0.87（P < 0.05）。结论：PLXNC1 基因rs 2272335 位点C 等位基因型可能是广西HCC 发生的危险因素。PLXNC1 过度表达与肝癌发生密切相关。     

GHR基因单核苷酸多态性与广西肝癌家系遗传易感性的研究

目的 探讨生长激素受体（growth hormone receptor,GHR）基因单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）与广西扶绥县肝癌家系遗传易感性的关系。方法 选取广西扶绥县25个肝癌家系和17个健康对照家系人群为研究对象,其中肝癌家系肝癌患者25例（肝癌家系肝癌组）、非肝癌者81名（肝癌家系非肝癌组）;健康对照家系80名（对照组）。采用飞行时间质谱技术检测GHR基因rs6451620位点基因型及等位基因分布频率,非条件logistic回归模型分析rs6451620位点多态性与肝癌遗传易感性的关系。结果 GHR基因rs6451620位点存在G和A两种等位基因,AA、GA、GG 3种基因型。GHR基因rs6451620位点基因型频率符合遗传平衡。GHR基因rs6451620位点等位基因G和A在肝癌家系肝癌组中的分布频率分别为64%和36%,肝癌家系非肝癌组为60.5%和39.5%,对照组为70.6%和29.4%。以肝癌家系肝癌组和非肝癌组人群为研究对象时,携带A等位基因型的个体发生肝癌的风险是G等位基因型个体的0.81倍（95%CI：0.27～2.41,P=0.699）,以肝癌家系肝癌组和健康对照人群为研究对象时,携带A等位基因型个体发生肝癌的风险是G等位基因型个体的1.49倍（95%CI：0.73～3.04,P=0.274）。结论 GHR基因rs6451620位点单核苷酸多态性与广西肝癌家系遗传易感性无明显相关性。     

广西地区人群TNF-α基因启动子区多态性与肝癌的易感性研究

背景与目的:原发性肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是一种高度恶性的肿瘤,TNF-α参与了HCC的病理发生、发展过程。本研究探讨广西地区人群TNF-α基因启动子区-1031C/T(rs1799964)和-308A/G(rs1800629)的单核苷酸多态性及其与环境因素的交互作用与HCC遗传易感性的关系。方法:采用以医院为基础的病例对照研究,选择来自于广西地区的新发HCC患者620例,相同地区年龄、性别和民族频数匹配的非肿瘤患者625例。采用TaqMan MGB实时荧光定量PCR方法对TNF-α基因-1031位点和-308位点进行基因分型,比较不同基因型与HCC患病风险的关系,并探讨基因-环境的交互作用对患病风险的影响。结果:TNF-a基因-1031位点3种基因型TT、TC、CC在病例组和对照组中分布差异无统计学意义(P>0.05),与TT基因型患者相比,TC或CC基因型者患HCC的风险并无显著增加(P>0.05)。TNF-α基因-308位点GG、GA、AA基因型在病例组和对照组中分布差异无统计学意义(P>0.05),与GG基因型患者相比,GA或AA基因型者患HCC的风险并无显著增加(P>0.05)。叉生分析结果表明,TNF-α基因-1031位点单核苷酸多态性与吸烟、饮酒及HBV感染等环境因素在HCC发生中存在交互作用,OR分别为3.367、4.709和25.433;-308位点与吸烟、饮酒、食鱼生及HBV感染等环境因素在HCC发生中存在交互作用,OR分别为3.720、5.316、24.975和19.822。结论:TNF-α基因-1031位点和-308位点单核苷酸多态性在HCC发生过程中,可能无独立的危险作用,但与吸烟、饮酒、食鱼生及HBsAg阳性等环境因素交互作用能增加HCC的发病风险。     

细胞色素P450 2E1基因多态与肝癌遗传易感性研究

目的：探讨细胞色素Ｐ４５０ ２Ｅ１基因多态与肝癌的关系。方法：应用ＰＣＲ－ＲＦＬＰ方法对８４例肝癌患者和１４４例健康对照的细胞色素Ｐ４５０ ２Ｅ１基因ＲｓａⅠ多态进行检测。结果：病例组基因型Ａ频率为７１．４３％,等位基因ｃ１频率为８４．５２％,对照组则分别为５５．５６％和７５．３５％,两组差别均有统计学意义（Ｐ〈０．０５）。其比值比分别为２．００和１．７９,提示具有基因型Ａ或等位基因ｃ１的个体患肝     

NAT2基因多态性与膀胱癌遗传易感性的关系

目的　探讨NAT2基因多态性与膀胱癌遗传易感性的关系。方法　以病例对照研究方法 ,采用PCR RFLP技术 ,对 6 9例膀胱癌患者和 88例健康对照者的NAT2基因型进行检测 ,分析NAT2基因型的分布特征。结果　NAT2慢基因型在病例组的频率为 2 6 .1% (18/6 9) ,对照组为 14 .8% (13/88) ,差异有显著性 (P <0 .0 5 ) ,携带慢基因型者患膀胱癌的危险性比携带快基因型者高 2倍。以NAT2快基因型 /不吸烟者为参照 ,慢基因型 /吸烟者患膀胱癌的危险性增加 5 .8倍 (P <0 .0 5 )。在吸烟量 >10PY(1PY =平均每年每天吸烟 2 0支 )的吸烟者中 ,病例组的慢基因型分布频率显著高于对照组 (P <0 .0 5 )。病例组中 ,NAT2基因型与膀胱癌组织分级呈显著相关性 (P <0 .0 5 )。慢基因型在表浅性肿瘤患者中的频率为 12 .8% ,浸润性肿瘤患者则为 5 4 .5 % ,差异有显著性 (P <0 .0 1)。结论NAT2基因多态性与膀胱癌的易感性有关 ,携带慢基因型的人群易患膀胱癌 ,而且肿瘤恶性程度更高。     

TNF-a基因多态性与广西肝癌家族聚集性的相关性研究

目的研究肿瘤坏死因子基因TNF—a-308、TNF-a-238与广西肝癌家族聚集性的关系。方法在广西肝癌高发区选取12个肝癌高发家族（124例）及与之相对应的12个非肿瘤对照家族（129例）为研究对象,采用SNP芯片技术检测两组中TNF—a-308、TNF—a-238的基因型及等位基因频率。结果肝癌高发家族组TNF-a-308G／A基因型分布频率高于对照家族组,差异有统计学意义（22．6％ vs 11．6％,x2=5．376,P=0．020）;肝癌高发家族组TNF-a-308A等位基因分布频率亦高于对照家族组,差异有统计学意义（11.3％VS5．8％,x2=4．877,P=0．024）。两组TNF-a-238基因型频率及等位基因频率差异均无统计学意义（P〉0．05）。结论TNF—a-308基因多态性可能与广西肝癌家族聚集性相关,携带TNF-a-308A等位基因可能会增加肝癌高发家族成员患肝癌的风险;TNF—a-238基因多态性与广西肝癌家族聚集无统计学关联。     

髓过氧化物酶基因多态性与肺癌遗传易感性的研究

背景与目的:髓过氧化物酶(myeloperoxidase,MPO)基因启动子区域-463bp处存在G/A多态位点,国外研究表明此位点与肺癌遗传易感性有关,但中国人MPO基因型与肺癌易感性关系尚未见报道,本研究拟对此问题作一探讨。方法:采用病例-对照分子流行病学方法,以PCR-RFLP技术检测98例原发性肺癌和112名健康对照MPO基因型,通过比较不同基因型者的比值比(oddsratio,OR)及其95%可信区间(confidenceinterval,CI)分析基因多态性与中国人肺癌易感性的关系。结果:正常人群G/G、G/A、A/A基因型频率分别为47.3%、42.9%和9.8%,肺癌病例组分别为63.3%、33.7%和3.0%,杂合子G/A在两组人群中分布无显著性差异(P>0.05),但病例组A/A基因型频率显著低于对照组(P<0.025)。携带至少一个等位基因A者患肺癌的风险是基因型为G/G者的52.0%(95%CI0.29～0.93)。在吸烟人群中,等位基因A对肺癌易感性的保护作用有显著性意义(OR=0.41,P<0.025),而在非吸烟人群,这种保护作用无显著性意义(P>0.25)。结论:本研究人群MPO基因多态与肺癌遗传易感性相关,等位基因A对吸烟人群的肺癌易感性有保护作用。