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相似文献
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1.
目的基于单细胞测序技术解析血小板源性生长因子B(PDGFB)在胃癌组织中的表达及其临床意义。方法选用3对胃癌及配对的癌旁组织样本进行单细胞转录组测序(scRNA-seq)。CellTypist对过滤后的单细胞表达数据进行亚群分类, 使用Wilcoxon rank-sum对测序数据进行拟时序分析, 探究不同细胞簇中PDGFB的差异表达。通过癌症基因组图谱(TCGA)及免疫组织化学技术(IHC)分析PDGFB在胃癌组织中的表达。收集68例胃癌患者临床数据, 采用单因素和多因素Cox比例风险回归模型确定影响胃癌患者预后的独立因素。结果 scRNA-seq分析发现, PDGFB与4种促血管生成因子(FLT4、FLT1、TEK、KDR)在胃癌组织中均显著高表达(PDGFB与4种胃癌组织中的表达显著高于在癌旁组织中的表达, PDGFB在胃癌组织中的相对表达量为2.907, FLT4的相对表达量为2.293, FLT1的相对表达量为2.049, TEK的相对表达量为1.851, KDR的相对表达量为1.843, F=19.399, P<0.01);不同细胞亚群的标记基因分析显示, PDGFB在...  相似文献   

2.
目的探讨长链非编码核糖核酸ZNRD1-AS1(lncRNA ZNRD1-AS1)在胃癌组织中的表达特点及其诊断学价值。方法选取嘉兴学院附属第二医院胃肠外科收治的96例经手术治疗、且留有手术样本的胃癌患者作为研究对象, 根据是否发生转移分为转移癌41例和原位癌55例。详细统计患者的临床病理和预后资料, 并采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)实验检测癌组织及癌旁健康组织的lncRNA ZNRD1-AS1和微小核糖核酸-375模拟物(miR-375 mimic)表达水平。两组之间的比较行配对设计或独立样本t检验, 多组间的比较行单因素方差分析。结果癌组织的lncRNA ZNRD1-AS1表达水平高于癌旁健康组织(1.051±0.205比0.645±0.145, t=15.845, P<0.001);癌组织的miR-375表达水平低于癌旁健康组织(1.014±0.197比1.365±0.245, t=10.965, P<0.001)。转移癌组织的lncRNA ZNRD1-AS1表达水平高于原位癌组织(1.201±0.165比0.953±0.148, t=3.604, P<0.0...  相似文献   

3.
目的探讨长链非编码RNA(lncRNA) PAPAS与口腔鳞状细胞癌临床病理特征及预后的关系。方法选取2019年12月至2023年3月收治的60例口腔鳞状细胞癌和对应癌旁组织作为研究对象, 采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)分析癌组织和癌旁组织lncRNA PAPAS表达水平。分析lncRNA PAPAS表达水平与口腔鳞癌患者临床病理特征的关系。并采用Kaplan-Meier分析口腔鳞癌患者3年生存情况, COX回归分析影响口腔鳞癌不良预后发生的危险因素。结果口腔鳞状细胞癌lncRNA PAPAS表达水平(1.94±0.25)明显高于癌旁组织(1.03±0.12), 差异有统计学意义(t=25.940, P<0.05)。低分化患者lncRNA PAPAS表达水平(2.22±0.21)明显高于中高分化患者(1.85±0.16), 差异有统计学意义(t=7.632, P<0.05)。淋巴结转移患者lncRNA PAPAS表达水平(2.19±0.24)明显高于未淋巴结转移患者(1.84±0.16), 差异有统计学意义(t=6.729, P<0.05)。浸润深度≥5 mm患者...  相似文献   

4.
目的探讨苏氨酰tRNA合成酶(TARS)在肝细胞癌(HCC)中的表达及其与患者预后、肝癌细胞增殖、迁移、侵袭的关系。方法收集93例HCC患者的临床病理资料, 用免疫组织化学检测肝癌组织和癌旁组织中TARS的表达差异, 分析其与患者临床病理特征及预后的关系;使用小干扰RNA(siRNA)技术下调肝癌细胞内TARS的表达, 细胞计数试剂盒(CCK-8)实验检测细胞的增殖能力;Transwell小室检测细胞的迁移、侵袭能力, 组间比较采用单因素和多因素方差分析及t检验。结果肝癌组织中TARS的表达明显高于癌旁组织(60.2%比25.8, P<0.01);TARS高表达组的整体生存期明显低于TARS低表达组(P<0.01), TARS高表达是影响HCC患者整体生存独立风险因素(P<0.01)。siRNA组细胞中TARS mRNA表达(0.04±0.01比0.99±0.03, P<0.01)及蛋白(0.18±0.02比1.11±0.07, P<0.01)表达低于对照组。CCK-8实验结果表明, 与对照组比较, TARS降表达组细胞吸光度值在第3天(3.08±0.03...  相似文献   

5.
目的探讨AEG-1、NF-κB在胃癌组织中的表达情况及其与胃癌临床病理特征的关系。方法采用免疫组织化学法检测84例胃癌患者AEG-1、NF-κB表达情况,观察两个指标之间的相互关系及其与患者临床病理特征及预后的关系。使用SPSS16.0统计软件进行统计分析,计量数据使用均数±标准差(x珋±s)表示,采用方差分析进行多组间比较,两组间比较采用独立样本t检验;Spearman等级相关分析AEG-1、NF-κB表达的相关性,用COX回归分析模型进行多因素分析,P0.05为差异具有统计学意义。结果胃癌组织中AEG-1的阳性表达率为75.00%,其阳性表达的PU值明显高于癌旁胃组织(t=12.206,P0.01);其阳性表达与分化程度、TNM分期、淋巴结转移有关(P0.05)。NF-κB在胃癌组织中的阳性表达率为80.95%,其阳性表达的PU值明显高于癌旁胃组织(t=11.997,P0.01);其阳性表达与分化程度、浸润深度、TNM分期、淋巴结转移有关(P0.05)。胃癌组织中AEG-1、NF-κB阳性表达呈正相关。COX模型多因素分析显示,AEG-1表达情况、淋巴结是否转移及临床TNM分期是影响胃癌术后生存率的指标中最为重要的3个指标(P0.05)。结论胃癌组织中可能存在AEG-1、NF-κB信号通路。检测胃癌组织中AEG-1、NF-κB的表达,有利于判断胃癌的发生、发展、浸润、转移并可评价胃癌的预后。  相似文献   

6.
目的探讨异质性胞核核糖核蛋白A2B1(HNRNPA2B1)在肾透明细胞癌(ccRCC)组织浸润CD8+T细胞中表达分布特征及其临床意义。方法利用基因表达综合数据库(GEO)公共数据分析HNRNPA2B1在ccRCC组织浸润免疫细胞以及CD8+T细胞亚群中的表达分布;转录组测序技术(RNA-seq)差异分析高、低表达HNRNPA2B1 ccRCC患者高变免疫基因并富集相关通路。多标记免疫荧光染色(mIHC)检测223例ccRCC患者癌组织和癌旁正常组织浸润CD8+T细胞中HNRNPA2B1的表达分布特征, 采用R语言做统计分析, 经单因素Cox、最优子集回归和LASSO回归交叉验证筛选临床因素并纳入多因素Cox回归构建列线图预测模型。Wilcoxon检验用于组间差异显著性分析, 生存分析采用Kaplan-Meier法和Log-rank检验。结果 HNRNPA2B1在CD8+T细胞上高表达并参与抗原加工呈递、T细胞增殖调节等多个信号通路。肾透明细胞癌患者肿瘤组织浸润HNRNPA2B1+CD8+T细胞比率高于癌旁正常组织[1.26%(0%, 35.56%)比0.28%(0%, 13.35%)...  相似文献   

7.
目的探讨长链非编码RNA(lncRNA) POU3F3在黑色素瘤中的表达变化, 以及lncRNA POU3F3与黑色素瘤转移的关系。方法选取来郑州大学第一附属医院2022年1月至2023年5月收治并接受手术治疗的47例患者的临床样本作为研究对象, 采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)技术分析黑色素瘤和癌旁组织lncRNA POU3F3的表达水平, 并采用免疫组织化学分析肿瘤组织和癌旁组织中黏着斑激酶(FAK)、β-连环蛋白(β-catenin)、N-钙黏蛋白(N-Cadherin)和锌指转录因子Snail蛋白的表达水平。相关性分析lncRNA POU3F3和转移相关蛋白水平的关系。采用Transwell分析lncRNA POU3F3敲降对细胞迁移和侵袭的影响。组间计量数据比较采用t检验。相关性分析采用皮尔森分析。结果癌旁组织中lncRNA POU3F3表达水平(1.23±0.18)明显低于黑色素瘤组织表达水平(2.31±0.19), 差异有统计学意义(t=27.890, P<0.05)。癌旁组织中FAK和β-catenin表达水平(58.98±11.11、73.38±12.26)明...  相似文献   

8.
目的探讨环形交叉轴突导向受体同源物1(ROBO1)在神经胶质瘤组织表达和临床意义。方法选取2019年9月至2022年9月河南省人民医院收治的72例神经胶质瘤和癌旁组织作为研究对象, 采用荧光定量和免疫组织化学分析ROBO1蛋白在神经胶质瘤和癌旁组织中的表达水平;并分析ROBO1表达水平与神经胶质瘤患者临床病理特征之间的关系。采用生存曲线分析ROBO1表达水平与患者预后预后的关系。并采用单因素方差分析和多因素Cox比例分线回归模型分析影响神经胶质瘤预后的独立危险因素。结果神经胶质瘤组织中ROBO1信使RNA(mRNA)(2.38±0.35)明显高于癌旁组织(1.04±0.19), 差异有统计学意义(t=28.390, P<0.05)。神经胶质瘤组织中ROBO1蛋白表达阳性率(90.28%, 65/72)明显高于癌旁组织(11.11%, 8/72), 差异有统计学意义(χ2=25.321, P<0.05)。Ⅰ~Ⅱ级患者神经胶质组织ROBO1 mRNA水平(2.14±0.20)明显低于Ⅲ~Ⅳ级患者(2.60±0.32), 差异有统计学意义(t=7.180, P<0.05)。...  相似文献   

9.
目的观察微小RNA(miRNA, miR)-124通过靶向激活的蛋白激酶C受体1(RACK1)对胃癌细胞增殖、周期和凋亡的影响。方法选取2020年6月至2022年6月收集的76例胃癌组织和癌旁组织作为研究对象, 采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)分析肿瘤组织和癌旁组织miR-124表达水平。采用慢病毒介导对照miRNA和miR-124感染人胃癌细胞系BGC-823, 分为对照miRNA和miR-124组, 分别采用细胞计数试剂(CCK-8)和EdU染色分析细胞增殖, 流式细胞术分析两组细胞的周期和凋亡;采用生物信息学和双荧光素酶报告基因分析miR-124的靶基因;蛋白质印迹法(Western blot)分析肿瘤组织和细胞靶基因表达及其周期和凋亡蛋白表达。组间比较采用t检验。结果癌旁组织miR-124表达水平(1.06±0.22)明显高于胃癌组织(0.56±0.13), 差异有统计学意义(t=16.940, P<0.05)。对照miRNA组细胞48 h吸光值A(2.09±0.13)明显高于miR-124组(1.36±0.11), 差异有统计学意义(t=10.660, P<0....  相似文献   

10.
目的分析B细胞淋巴瘤7A(BCL7A)在肝细胞癌中的表达以及与预后的关系, 以及BCL7A表达对肝癌细胞侵袭、迁移的影响和机制。方法前瞻性收集2017年11月至2018年3月于南通大学附属医院肝胆外科行根治性肝切除术的40例肝细胞癌患者的癌组织及癌旁组织用于提取蛋白质, 其中男性29例, 女性11例, 年龄(58.5±10.4)岁。从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载374例肝细胞癌和50例癌旁组织样本信息, 肝癌细胞系Hep3B、SMMC-7721分别转染过表达BCL7A质粒及空载体质粒(阴性对照)。Western印迹和免疫组化检测BCL7A表达, Western印迹检测上皮间质转化相关蛋白表达(神经钙黏素、上皮钙黏素、锌指转录因子)。Transwell以及细胞划痕实验检测细胞侵袭迁移能力。结果 TCGA中50例肝细胞癌患者(癌组织与癌旁组织匹配), 与癌旁组织相比, 癌组织中BCL7A的mRNA相对表达显著升高, 差异具有统计学意义(t=13.38, P<0.001)。依据BCL7A mRNA表达水平的中位数将374例患者分为BCL7A高表达组(n=187)和低表达组(n...  相似文献   

11.
目的探讨喉癌组织中长链非编码RNA(lncRNA) LUCAT1的表达水平, 及其与患者临床病理特征、预后和新辅助化疗疗效的关系。方法选取2020年12月到2022年12月商丘市第一人民医院手术切除的73例喉癌标本作为研究对象, 取周围的癌旁组织作为对照样本。采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)分析肿瘤组织和癌旁组织中lncRNA LUCAT1表达水平;分析lncRNA LUCAT1与喉癌患者临床病理特征的关系;分析影响喉癌的预后因素;分析lncRNA LUCAT1与新辅助化疗疗效的关系。组间计量数据比较采用t检验。结果癌旁组织中lncRNA LUCAT1表达水平(1.10±0.15)明显低于喉癌组织中表达水平(2.18±0.32), 差异有统计学意义(t=26.510, P<0.05)。Ⅲ~Ⅳ期患者肿瘤组织lncRNA LUCAT1表达水平(2.39±0.24)明显高于Ⅰ~Ⅱ期患者(1.99±0.24), 差异有统计学意义(t=7.045, P>0.05)。低分化患者肿瘤组织lncRNA LUCAT1表达水平(2.39±0.25)明显高于中高分化患者(1.98±0.23),...  相似文献   

12.
目的基于单细胞组学分析肝内胆管癌(ICC)根治性切除术后患者的生存获益。方法本研究为回顾性病例系列研究。整合基因表达综合数据库中4个数据集的ICC单细胞测序结果, 共获得46例患者根治性切除样本, 探索ICC微环境的特征。同时分析附有生存数据的EMBI数据库共100例ICC组织芯片数据, 通过ssGSEA算法计算芯片数据每个样本中各个上皮细胞亚群的浸润丰度, 探索与患者较差预后相关的关键上皮细胞亚群, 并研究该亚群关键标志(marker)基因的临床价值。通过单因素与多因素 Cox 比例风险模型筛选预后相关marker基因, 使用目标基因构建 Cox比例风险模型并绘制列线图, 使用Kaplan-Meier 生存分析验证评分与患者预后的关系, 通过受试者工作特征(ROC)曲线、校准曲线及决策曲线(DCA)对模型预测效能进行评估。结果上皮细胞亚群几乎仅在肿瘤组织中浸润。表达MT2A的上皮细胞亚群与患者更差的预后相关且浸润丰度很高, 以该亚群浸润为特征的患者被定义为抗氧化型。经单因素与多因素Cox比例风险模型筛选该亚群的marker基因, 其中filp1l、nakbia、peg10、serpi...  相似文献   

13.
目的探究肿瘤坏死因子-α诱导蛋白8-1(TNFAIP8L1, TIPE1)在结肠癌及癌旁正常组织的表达, 及其表达水平与结肠癌患者临床病理参数和预后生存的关系。方法收集青岛大学附属医院2013年1月至2014年12月间诊断为结肠癌的患者的癌和癌旁正常组织。采用免疫组织化学(IHC)染色法检测样本中TIPE1的表达以分析其与患者年龄、性别、肿瘤大小、TNM分期、淋巴结转移、远处转移、病理分期等的相关性。组间比较采用t检验, 患者预后生存采用Kaplan-Meier生存分析及单因素/多因素COX回归分析。结果 TIPE1在结肠癌组织中的表达低于正常结肠组织(57.2±31.1比86.9±35.6, t=8.304, P<0.01)。共纳入181例结肠癌患者, TIPE1高表达患者69例, 低表达112例。TIPE1高表达组患者平均生存期时间高于低表达组患者(80.9个月比59.0个月, Log-rank=14.615, P<0.01)。同时, COX回归分析提示, TIPE1表达水平为影响结肠癌患者预后的独立因素之一[风险比(HR)=0.538, 95%可信区间(CI):0.3...  相似文献   

14.
15.
目的 探讨miR-490-3p表达水平与胃癌临床病理特征和预后的关系。方法 通过实时荧光定量PCR(qPCR)方法检测80例胃癌患者的癌组织与癌旁正常组织中miR-490-3p的相对表达量,分析其与临床病理特征的关系,采用Kaplan-Meier曲线、Cox比例风险回归模型进行预后分析。结果 miR-490-3p在癌组织中的相对表达量为(0.652±0.072),低于癌旁正常组织中的(1.259±0.069),差异有统计学意义(t=40.528,P<0.05);miR-490-3p表达与浸润深度、淋巴结转移及TMN分期显著相关(P<0.05);miR-490-3p低表达和高表达患者无进展生存期差异有统计学意义(23个月vs 30个月,χ2=8.583,P=0.03);miR-490-3p、淋巴结转移及TNM分期是胃癌预后的独立影响因素(HR=2.396、0.472、0.230,均P<0.05)。结论 mi R-490-3p表达降低可促进胃癌的增殖、分化和迁移,可成为胃癌诊断和预后的潜在分子标志物。  相似文献   

16.
目的探讨微小RNA(miR)-1246靶向糖原合成酶激酶3β(GSK3β)对前列腺癌(PCa)细胞迁移、侵袭和增殖的作用及分子机制。方法采用miRNA-Seq技术检测PCa组织及癌旁组织中差异表达的miRNA;采用实时荧光定量聚合酶连反应(qRT-PCR)技术检测PCa患者癌组织和血清中miR-1246的表达水平;采用生物信息学分析、荧光素酶报告基因实验、qRT-PCR、蛋白质印迹法分析miR-1246对GSK3β的靶向调控关系。人PCa细胞DU145和LNCaP分别转染miR-1246类似物(mimics)/阴性对照(NC mimics)或miR-1246抑制剂(inhibitor)/阴性对照(NC inhibitor), 通过细胞计数试剂盒(CCK-8)法检测细胞的增殖能力, 通过划痕实验和Transwell迁移实验检测细胞的迁移侵袭能力。两组间比较采用独立样本t检验。结果 miRNA-Seq结果显示, 与癌旁组织比较, PCa组织中有15个miRNA表达显著升高, 51个miRNA表达显著降低, 其中miR-1246在PCa患者组织及血清中表达显著升高(组织:7.93±2.39比...  相似文献   

17.
目的:探讨蛋氨酸腺苷转移酶2B(MAT2B)在三阴性乳腺癌(TNBC)组织中的表达及其与预后的相关性。方法:回顾性分析2015年3月—2016年6月安康市中医院收治的98例TNBC患者的临床资料。实时定量聚合链式反应(RT-qPCR)检测TNBC癌组织及癌旁组织中MAT2B mRNA的表达。Cox多因素回归分析MAT2B表达与TNBC预后的相关性。结果:TNBC癌组织中MAT2B mRNA相对表达量2.53±0.42,显著高于癌旁组织的1.08±0.21(t=30.568,P<0.001)。MAT2B mRNA表达与TNBC肿瘤大小、分化程度、组织学分级、T分期、N分期、M分期密切相关(P<0.05)。MAT2B高表达患者总生存期显著低于MAT2B低表达患者(χ2=8.7000,P=0.003)。多因素回归分析表明,肿瘤分化程度、肿瘤大小、组织分级、T分期、M分期、MAT2B是影响TNBC预后的独立危险因素(P<0.05)。结论:MAT2B是影响TNBC预后的独立危险因素,可作为评估TNBC生存预后的生物标志物运用于临床。  相似文献   

18.
目的分析载体膜蛋白3(SCAMP3)在肝细胞癌中的表达和对预后的影响以及基因集富集分析。方法通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析SCAMP3表达和预后。收集2021年1月期间丽水市中心医院4例肝细胞癌患者的癌组织及癌旁组织检测SCAMP3的表达。基于TCGA数据, 单因素和多因素Cox回归分析SCAMP3表示与肝细胞癌患者预后关系。利用基因集富集分析探索SCAMP3的生物学作用。结果 TCGA数据库中, 肝细胞癌组织中SCAMP3表达高于正常肝组织, 差异有统计学意义(Z=-8.38, P<0.001)。基于SCAMP3表达的中位数将患者分为低表达组(n=185)和高表达组(n=185), SCAMP3高表达患者总体生存率更低。手术切除的4例肝细胞癌患者癌组织和癌旁组织, 癌组织中SCAMP3 mRNA、蛋白相对表达均高于癌旁组织, 差异均有统计学意义(t=8.55、6.24, 均P<0.001)。多因素Cox回归分析, SCAMP3表达越高, 死亡风险越高(HR=1.466, 95%CI:1.143~1.881, P<0.001)。基因集富集分析在SCAMP3高...  相似文献   

19.
目的探讨十-十一易位蛋白(TETs)和5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)在食管鳞癌组织的表达及临床意义。方法随机选取2020年1月至2022年8月于郑州大学第一附属医院进行手术治疗的食管鳞癌患者癌组织和癌旁组织(距离癌组织2~3 cm)各10例, 采用高效液相-质谱联用法(LC-MS/MS)检测5hmC在食管鳞癌中的修饰水平;采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)技术检测TETs mRNA在食管鳞癌中的表达;采用蛋白质印迹法(Western blot)检测TETs在食管鳞癌中的蛋白表达水平, 组间比较采用t检验。结果食管鳞癌组织中5hmC修饰水平显著高于食管癌癌旁组织[(0.21±0.03)%比(0.05±0.01)%, t=3.095, P<0.01]。TCGA数据库分析, 食管癌组织中TET1表达水平显著高于食管癌癌旁组织(1.48±0.08比0.22±0.05, t=5.032, P<0.01);TET2表达水平显著高于食管癌癌旁组织(6.12±0.32比2.86±0.45, t=11.035, P<0.05);TET3表达水平显著高于食管癌癌旁组织(3.69...  相似文献   

20.
目的探究长链非编码RNA(lncRNA))同源盒基因A11反义RNA(HOXA11-AS)对肝细胞癌(HCC)细胞增殖及HCC相关基因表达的影响。方法 15例人HCC组织及癌旁组织由西安交通大学第二附属医院生物诊疗中心样本库于2017年6月至2019年11月收集。采用实时定量聚合酶链反应(qPCR)检测HOXA11-AS的表达并用RNA荧光原位杂交进行亚细胞定位;通过转染lncRNA Smart Silencer敲低Bel-7402和Hep3细胞中HOXA11-AS的表达, 并采用细胞计数试剂(CCK-8)、平板克隆形成实验、流式细胞术检测细胞的增殖、周期及凋亡情况;利用qPCR芯片检测敲低HOXA11-AS对HCC相关基因表达的影响, 使用R语言clusterProfiler包对差异基因进行功能富集分析, 并通过rescue实验验证差异基因介导HOXA11-AS调控HCC细胞增殖的作用。分别采用t检验和Turkey检验分析两组或多组间差异。结果 HOXA11-AS在HCC组织中的表达明显高于癌旁组织(9.72±5.99比5.53±4.92, t=2.09, P<0.05), 在...  相似文献   

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