MMP家族基因与宫颈癌的关系研究

目的利用癌症基因组图谱（TCGA）数据库中宫颈癌的相关数据,研究人乳头瘤病毒（HPV）阳性宫颈癌人群与HPV阴性宫颈癌人群的基质金属蛋白酶（MMP）家族相关免疫基因的变化。方法从TCGA数据库中收集宫颈癌患者137例及相关数据信息,分为HPV阴性宫颈癌组和HPV阳性宫颈癌组。利用EdgeR计算分析所有样本的转录组测序（RNA-Seq）数据,寻找两组之间差异表达的基因;并利用基因本体（GO）对表达差异的基因进行生物功能富集分析;利用RNA-Seq及拷贝数变异等数据,对MMP家族相关免疫基因进行分析;利用Kaplan-Meier分析评估MMP家族免疫特征基因对患者总生存期和无进展生存期的影响。结果通过EdgeR计算分析发现,两组之间有2368个基因的表达差异有统计学意义（P＜0.01）;其中有823个基因表达上调,1545个基因表达下调。通过GO进行功能富集分析发现,表达上调的差异基因主要富集在免疫反应通路上。MMP家族3个免疫基因的变化在拷贝数变异和mRNA表达上相关联,当基因的拷贝数扩增时,mRNA表达相应上调,反之亦然。MMP-1、MMP-3、MMP-13基因对HPV宫颈癌患者的总生存期和无进展生存期均无明显影响。结论与HPV阴性宫颈癌患者相比,HPV阳性宫颈癌患者中有大量差异表达的基因,表达上调的基因主要富集在免疫通路上,其中免疫基因MMP-1、MMP-3、MMP-13的mRNA表达与拷贝数变异类型相关联;有多种免疫通路上的基因都会影响MMPs家族免疫基因的改变,从而诱发癌症。     

基于数据库挖掘皮肤黑色素瘤微环境预后生物标志物

目的 通过探索肿瘤微环境(TME)来确定与皮肤黑色素瘤(SKCM)预后生存相关基因,并进一步构建评估SKCM患者预后的风险预测模型。方法 根据癌症基因组图谱(TCGA)数据库和ESTIMATE算法计算SKCM患者的免疫评分和基质评分,筛选高分组与低分组之间的差异表达基因(DEG),并进一步通过功能富集分析、蛋白质相互作用网络(PPI)、生存分析和Lasso回归分析筛选预后显著相关基因,最终利用预后显著相关基因构建风险预测模型。结果 471例SKCM病例纳入本研究,根据免疫评分和基质评分的中位数,将236例评分≥中位数的患者纳入高分组,235例评分<中位数的患者纳入低分组。高免疫评分组和高基质评分组的中位生存时间分别显著长于低免疫评分组和低基质评分组(P值均<0.05)。Kaplan-Meier生存曲线显示,免疫评分、基质评分均与SKCM患者的生存时间呈正相关(P=0.000 11、0.046)。SKCM患者中高分组和低分组的基因表达数据分析结果显示,高分组和低分组具有不同的基因表达谱。基于免疫评分的结果显示,高分组有1 257个基因上调,20个基因下调[log_2<...     

基于单样本基因富集分析分型构建肺腺癌的风险预测模型

目的研究基于单样本基因富集分析（ssGSEA）分型构建肺腺癌的风险预测模型的价值。方法从癌症基因组图谱（TCGA）数据库及基因表达数据库（GEO）中分别获取515例及116例肺腺癌患者的数据。基于TCGA数据库进行ssGSEA分析及聚类分析,将样本分为高免疫评分组和低免疫评分组,并进行免疫相关分析、富集分析及差异分析,进一步获得免疫相关的差异表达基因。将TCGA数据集患者以7∶3随机分为训练集和内部验证集。基于TCGA训练集的免疫相关差异表达基因数据,通过单因素Cox风险回归、套索算法（Lasso）回归以及多元逐步Cox风险回归分析降维,构建肺腺癌患者预后的预测模型,获得相应的风险分数（Riskscore）,并用TCGA内部验证集及GEO外部验证集进行验证。将Riskscore与临床特征进行独立预后因素分析,建立列线图。ROC曲线与校正曲线分析分别用来评估模型的效能及拟合度。结果根据患者样本的ssGSEA免疫评分、聚类分析及差异分析的结果,患者被分为高免疫评分组和低免疫评分组以及获得1447个差异表达基因。再通过单因素Cox风险回归、Lasso回归以及多元逐步Cox风险回归分析降维,获得剩余8个预后相关免疫差异表达基因的最优集合和每例患者的Risks-core。该风险预测模型在训练集、内部验证集及外部验证集的AUC分别为0.703、0.713、0.750。根据独立预后分析结果,肺腺癌的分期及预测模型的Riskscore是肺腺癌患者的两个独立预后因子并联合绘制列线图。列线图1、3、5年总生存期的AUC分别为0.789、0.763、0.746。校正曲线分析也显示该模型的拟合度较好。结论基于ssGSEA分型构建并验证的肺腺癌患者预后风险预测模型,具有较高的预后风险预测效能,可为临床医师判断肺腺癌患者总生存期提供辅助工具。     

基于缺氧相关基因甲状腺癌预后模型的研究

目的 通过检索肿瘤与癌症基因组图谱（TCGA）及hypoxiaDB数据库中甲状腺癌的相关数据,建立一个基于差异表达的缺氧相关基因模型。方法 比较TCGA数据库和hypoxiaDB数据库中的基因,获得与甲状腺癌缺氧相关的差异表达基因。随后进行基因功能富集分析、构建蛋白质-蛋白质相互作用网络、筛选出具有预后价值的缺氧相关基因来建立并验证预后模型。结果 共发现326个缺氧相关甲状腺癌基因。功能富集分析表明,这些基因主要参与生物功能调节。单因素Cox回归分析结果显示,共有23个基因与甲状腺癌预后相关,其中,11个基因通过多因素Cox分析构建了新的预后模型。结果显示,高风险评分（P <0.005）的患者总生存期比低风险评分的患者短。对甲状腺癌患者预后价值的单变量分析结果显示,构建的预后模型与患者的总体生存率显著相关。结论 本研究的模型对甲状腺癌的预后有很好的预测作用。     

基于TCGA在宫颈癌肿瘤微环境中挖掘免疫疗效相关的预后基因

目的 结合生物信息学方法,使用肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中宫颈癌表达谱数据,通过ESTIMATE算法分析肿瘤微环境挖掘有价值的预测免疫治疗疗效相关的预后基因.方法 从TCGA数据库下载宫颈癌数据,运用R软件ESTIMATE包将宫颈癌基因表达谱数据分为高低免疫/高低基质评分组,通过limma包计算各组差异基因,最终...     

基于TCGA和Oncomine数据库子宫内膜癌生物信息学分析

目的 通过TCGA和Oncomine数据库对子宫内膜癌进行生物信息学分析,深入挖掘子宫内膜癌发生关键基因.方法 从TCGA数据库中下载子宫内膜癌转录组数据,利用R软件对子宫内膜癌与癌旁正常组织进行比较,获取差异表达基因,进一步通过在线生物信息学工具对差异表达基因进行功能富集分析,并构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网...     

CD40LG是与浸润性乳腺癌肿瘤微环境中免疫和基质相关的预后标志物

目的 旨在寻找与浸润性乳腺癌（BRCA）发生相关的肿瘤微环境（TME）相关基因,以预测其预后并为临床提供治疗靶点。方法 从癌症基因组图谱（TCGA）数据库中检索到RNA转录组数据和临床相关数据。利用ESTIMATE算法计算基质评分和免疫评分。然后通过取交集筛选出差异表达基因（DEGs）。利用蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络和单变量COX回归分析来确定DEGs中的核心基因。选取一个核心基因进行GSEA集富集分析和CIBERSORT分析,以分别区分核心基因表达的功能和肿瘤浸润免疫细胞（TICs）的比例。最终用Western blot和qRT-PCR对CD40LG的表达水平进行临床验证。结果 从TCGA中提取了1222个样本（124个正常样本和1098个肿瘤样本）进行分析,共获得了487个DEG。这些基因主要富集在与免疫相关的途径中。进一步的交叉分析揭示了11个关键基因,包括CD40LG、ITK、CD5、CD3E、SPN、IL7R、CD48、CCL19、CD2、CD52和CD2711,这些基因被证明与乳腺癌TME状态相关。挑选了CD40LG进行进一步研究,结果表明,CD40LG高表达BR...     

ABCC4基因表达对前列腺癌免疫微环境的影响

目的：探究ATP结合盒亚家族C成员4(ABCC4)基因在前列腺癌（PCa）中的表达，分析ABCC4对PCa肿瘤免疫微环境（TME）的影响。方法：使用GEO数据库中的GEO2R计算PCa与癌旁组织的差异表达基因。通过GEPIA2数据库探究ABCC4基因在PCa中的表达。将从UCSC Xena数据库下载的TCGA中的PCa数据分为ABCC4基因高、低表达组。使用clusterprofafiler R包进行GO分析和基因集富集分析（GSEA）。利用TISIDB数据库、ESTIMATE和CIBERSORT分析ABCC4基因表达与免疫指标的相关性。结果：PCa组织中ABCC4基因表达高于癌旁组织（P<0.05）。ABCC4高表达组PCa患者生存能力较差。在GSEA中，ABCC4低表达组中Th1和Th2细胞分化通路被激活，ABCC4基因可能在PCa的TME中起作用。TISIDB分析证实ABCC4基因表达与NK和T细胞丰度呈负相关关系（P<0.05）。ABCC4基因高表达与免疫检查点基因低表达有关。ESTIMATE和CIBERSORT分析表明，ABCC4基因表达可抑制PCa的免疫细胞浸润...     

生物信息学方法分析与宫颈癌有关联的基因

目的 通过TCGA和GEO数据库筛选与宫颈癌相关的关键基因,探讨其分子机制及临床意义。方法 通过TCGA和GEO数据库获取宫颈癌的基因表达谱数据,采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)获取宫颈癌与正常宫颈组织差异表达基因(DEGs),对DEGs进行富集分析、蛋白-蛋白互作网络(PPI)分析并识别关键基因,进一步对关键基因与预后及蛋白表达、以及与宫颈癌免疫浸润的关系进行分析。结果 通过TCGA与GEO数据库中共得到88个宫颈癌DEGs, GO分析发现大部分基因与核染色体减速分裂、核染色体分裂、染色体集缩、核染色体等相关;KEGG信号通路分析发现宫颈癌DEGs参与了细胞周期、DNA复制、卵母细胞减数分裂、p53信号通路、同源重组等信号通路。鉴定出20个宫颈癌关键基因,仅有丝分裂阻滞缺陷2样蛋白1(MAD2L1)低表达患者的总生存期(OS)长于MAD2L1高表达患者(P=0.013),但MAD2L1高表达患者的无病生存期(DFS)与低表达患者差异无统计学意义(P>0.05),宫颈癌组织中MAD2L1蛋白高于正常组织。TIMER在线软件分析显示,MAD2L1与肿瘤的免疫浸润水平均相关(...     

基于TCGA数据构建乳腺癌上皮间质转化相关lncRNA的预后模型

目的：通过生物信息学分析,探讨上皮间质转化（EMT）相关的长链非编码RNA(lncRNA)在乳腺癌中的预后作用。方法：从TCGA数据库下载乳腺癌的转录组数据及临床信息,在MSigDB数据库下载EMT相关基因的数据集,然后利用差异分析、共表达分析、Cox回归分析、Lasso回归分析、生存分析等生物信息学方法,构建乳腺癌中EMT相关lncRNA的风险特征,并进一步检验其预测效能。结果：乳腺癌肿瘤组和正常组有311个差异表达的EMT相关基因（P<0.05）,与这些基因存在共表达关系的lncRNA有315个（皮尔逊相关系数r=0.7,P<0.001）,其中,与预后可能相关的lncRNA有16个（P<0.05）。进一步行Lasso回归分析及多因素Cox回归分析,最终得到基于9个lncRNA表达水平的风险评分公式,根据风险评分的中位数将患者分为高、低风险组,生存分析结果显示,相比于低风险组,高风险组患者的总生存期更低(P<0.001)。ROC曲线结果表明,风险评分预后模型对乳腺癌的3、5、10年生存期具有较好的预测效能,Cox回归分析结果进一步表明该模型可以作为一个独立的预...     

低级别胶质瘤差异基因筛选及功能预测

目的 基于美国癌症肿瘤基因图谱(TCGA)数据库联合GTEx数据库分析低级别胶质瘤组织及正常脑组织的差异表达基因,并探讨其相关分子机制。方法 从TCGA数据库及GTEx数据库下载所有低级别胶质瘤中mRNA转录组数据。共包含样本569例,其中低级别胶质瘤组织为529例,正常脑组织为40例。在R语言环境下,应用edge R工具包处理数据,得到差异表达基因。利用DAVID数据库对差异表达的前1000个基因进行GO分析及KEGG通路富集分析。对显著差异表达的前200个差异表达基因进行分析,基于Cysctoscape绘制蛋白互作网络图。比较关键基因在低级别胶质瘤组织及正常脑组织中的表达水平。以关键基因的中位表达水平为界值,将关键基因分为高表达组与低表达组,比较高表达组与低表达组的生存情况。结果 共筛选出9045个差异表达基因,其中,上调基因5566个,下调基因3479个。GO分析结果显示,其生物过程有DNA结合转录激活活性,RNA聚合酶Ⅱ特异性,肌动蛋白结合,有机酸结合,肽结合等功能富集。KEGG富集分析结果表明,差异表达基因的信号通路主要化学致癌物-活性氧自由基,粘附蛋白激酶,肺癌蛋白多糖,催...     

与肺腺癌发病相关的关键基因筛选及其功能分析

目的 采用美国肿瘤与癌症基因组图谱(Tumor and Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库分析肺腺癌的组织与正常人体组织的差异基因,寻找与肺腺癌发病相关的关键基因,为临床早期诊断肺腺癌提供参考。方法 在R语言环境下,用limma包处理从TCGA数据库下载的肺腺癌mRNA转录组数据与临床数据,其中mRNA转录组数据包含正常组织59例,肺腺癌组织535例,共594例样本。对数据进行差异表达分析,筛选log₂FC排名前200位的基因,并对其进行GO和KEGG富集分析。对FDR值排序,选取排名前200位的mRNA差异基因并构建蛋白互作网络图。将网络节点降序排列并寻找关键基因,以关键基因中位值为界将其分为低表达组与高表达组,并进行生存分析。将生存分析中差异有统计学意义的关键基因根据Stage分期进行分组,并进行差异分析以明确关键基因在临床早期与随疾病分期进展的表达情况。结果 筛选出5526个差异表达基因。GO富集分析结果表明,其生物过程主要在多细胞生物过程等功能富集。KEGG富集分析结果则显示,其生物过程主要在神经活性配体-受体相互作用等方面发挥作用...     

肿瘤微环境中免疫与基质细胞相关基因在肺腺癌中的预后价值

目的:鉴别与肺腺癌预后相关的免疫与基质细胞基因。方法:501例肺腺癌基因表达数据来自癌症基因组图谱（TCGA）数据库。肺腺癌样本的免疫和基质评分从ESTIMATE数据库中获取。χ2检验分析基质、免疫评分与患者临床病理特征的相关性。采用t检验以及Cytoscape中的Mcode模块筛选差异表达基因（DEGs）。采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线。结果:基质细胞评分与M分期显著相关（χ2=6.391,P=0.011）。免疫评分与M分期（χ2=4.769,P=0.029）、T分期（χ2=11.672,P=0.009）和总生存期（χ2=6.334,P=0.009）显著相关。基于免疫评分的DEGs有262个,基于基质评分的DEGs有391个。基因功能富集分析和蛋白-蛋白相互作用网络分析差异表达基因,富集分析表明,DEGs参与调节免疫应答、抗原结合、免疫应答和受体结合。生存分析表明POSTN（P=0.0181）、PLEK（P=0.0434）、LY86（P=0.0136）、HCK（P=0.0487）对肺腺癌患者具有预后价值。结论:基质细胞相关基因POSTN高表达与患者不良预后相关,免疫细胞相关基因PLEK、LY86、HCK高表达预示患者预后较好。     

FDX1基因在乳腺癌中的表达及临床预后价值

目的 探讨FDX1基因在乳腺癌中的表达和预后价值，分析其潜在的生物学功能及对免疫微环境的影响。方法 利用TCGA数据库获取乳腺癌样本数据信息，分析FDX1在肿瘤中的的表达情况；免疫组化法检测FDX1在乳腺组织中的蛋白表达；Bc-GeExminer 3.0数据库分析在乳腺癌中FDX1表达与ER、PR、HER2表达的关系；Kaplan-Meier Plotter分析FDX1表达与总生存期(OS)、无复发生存期(RFS)、无远处转移生存期(DMFS)相关性；采用Timer数据库和GSVA数据库分析乳腺癌中FDX1表达与免疫细胞浸润的相关性；利用LinkedOmic中基因集富集分析(GSEA)探讨FDX1介导的生物学功能机制。结果 在TCGA数据集中，FDX1在乳腺癌肿瘤组织中表达降低；免疫组化结果显示，FDX1在乳腺癌肿瘤组织中蛋白水平降低；FDX1表达与PR表达、ER表达、PAM50状态相关(P<0.001),与年龄、T分级、N分级、M分级、病理分级、组织学分型、解剖肿瘤部位、是否接受放射治疗均无关(P>0.05);Bc-GeExminer 3.0数据库免疫组化结果提示FDX1...     

基于生物信息学分析儿童低度恶性胶质瘤的关键预后基因

目的:通过基因表达谱(GEO)数据库和癌症基因组图谱(TCGA)数据库筛选儿童低级别胶质瘤(LGG)的预后显著差异基因,为寻找儿童LGG预后生物标志物提供参考.方法:从GEO、TCGA数据库下载儿童LGG全基因组表达谱数据,筛选出儿童LGG差异表达基因.应用R语言进行基因GO、KEGG富集分析,绘制蛋白质间互作网络图,...     

TLR2对胶质母细胞瘤的预后价值和体外作用

目的 探究TCGA数据库中TLR2基因在胶质母细胞瘤(GBM)中的预后价值,并明确该基因对胶质母细胞瘤细胞LN229的体外作用。方法 从TCGA数据库中获取169例胶质母细胞瘤患者的临床信息和肿瘤样本的转录组数据,通过Kaplan-Meier生存曲线分析评估TLR2基因在GBM患者中的预后作用。构建TLR2敲减的人胶质母细胞瘤LN229细胞系,通过RT-qPCR和Western Blot验证。通过CCK8、克隆形成、细胞划痕、Transwell小室法,检测敲减TLR2对LN229细胞的增殖、克隆形成、迁移、侵袭能力的影响。结果 与正常样本相比,TLR2在GBM患者样本中表达增高。生存分析结果显示,TLR2高表达组患者总生存期显著低于低表达组患者(总生存期中位值333 d vs.402 d,P<0.05)。RT-qPCR和Western Blot结果显示,TLR2敲减的人胶质母细胞瘤LN229细胞系成功构建。与转染si-control的LN229胶质瘤细胞相比,转染si-TLR2的LN229胶质瘤细胞增殖能力明显降低(P<0.05)。与转染si-control的LN229胶质...     

基于肿瘤干性相关基因的肾癌预后模型构建

目的 通过挖掘基因表达汇编(GEO)数据库中肾癌干细胞芯片数据,寻找肾癌细胞干性标志物,并联合癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的肾癌临床及转录组数据构建一种评估肾癌预后的模型.方法 从GEO数据库GSE48550数据集中下载芯片数据,筛选肾癌干细胞和正常肾小管上皮细胞之间的差异表达基因,通过基因本体(GO)和基因集富集分析进行功能及通路分析,通过蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络构建确定肾癌干细胞核心基因.从TCGA数据库下载肾癌患者年龄、临床分期、预后情况及相关基因的表达水平,通过单因素及多因素Cox回归分析筛选肾癌预后的独立危险因素,构建预测肾癌患者总生存期的列线图模型.结果 通过分析肾癌干细胞和正常肾小管上皮细胞的芯片数据,发现差异表达基因富集在细胞趋化、细胞外基质形成及受体配体活性等模块,炎症反应通路、P53通路及TNF-α/NF-κB通路在肾癌干细胞中显著激活.单因素及多因素Cox回归分析结果表明,年龄、临床分期为肾癌预后的独立危险因素,趋化因子家族中的C-X3-C基序趋化因子配体1(CX3CL1)是肾癌预后的独立保护因素.通过评估模型区分度,发现基于年龄、临床分期及CX3CL1表达水平的风险模型可准确预测肾癌患者总体生存率,其中C指数为达到0.803.结论 通过GEO和TCGA数据库联合分析筛选肾癌干性相关基因,构建了一种联合患者年龄、临床分期及CX3CL1表达水平的新模型,新模型可用于评估肾癌患者预后.     

ASPM基因在乳腺癌中的表达及临床意义

目的 研究有丝分裂相关基因ASPM(abnormal spindle microtubule assembly)在乳腺癌中的表达及临床意义,并探讨ASPM作用机制。方法 利用Oncomine数据库检测ASPM在乳腺癌组织中的表达情况,采用GSE3494数据集和Kaplan-Meier在线分析ASPM表达与乳腺癌患者的预后关系,并结合TCGA数据库分析ASPM表达与临床病理指标的相关性。利用GSE3494数据集进行基因富集分析 (GSEA)预测ASPM相关通路。利用String数据库分析与ASPM相关的蛋白并通过TIMER数据库验证。利用RT-qPCR验证在13对乳腺癌组织与配对的癌旁组织中ASPM的表达情况。结果 与正常乳腺组织比较,ASPM在乳腺癌组织中高表达,且高表达组具有较短的总生存期 (HR=1.71, P=0.000)。GSE3494和TCGA数据库分析发现ASPM表达与ER、PR水平显著相关(P=0.000),TCGA数据库分析结果显示ASPM表达还跟年龄 (P=0.002)以及TNM分期中的T分期 (P=0.000)和N分期 (P=0.030)显著相关。ASPM高表达样本主要富集在细胞周期、氧化磷酸化、DNA修复、错配修复、剪接体和蛋白酶体等基因集 (P<0.01),结合String以及TIMER的结果,ASPM可能与BUB1、CCNA2、TTK、CDC20、CDK1相互结合作用,促进乳腺癌的发生、发展。RT-qPCR结果显示,ASPM在乳腺癌组织中表达上调。结论 ASPM基因在乳腺癌组织中高度表达,并与临床病理指标相关,可作为预测乳腺癌预后的标志物进一步研究。     

基于TCGA和GEO数据库分析FOXD1在口腔鳞状细胞癌中的表达和临床意义

目的通过对TCGA和GEO数据库中口腔鳞状细胞癌(OSCC)的数据挖掘,探讨FOXD1基因的表达及临床意义。方法从TCGA和GEO数据库中提取FOXD1在OSCC组织及正常组织的表达信息,分析FOXD1表达与临床特征的关系及预后相关性。采用ESTIMATE和CIBERSORT算法,评估FOXD1高表达组和低表达组肿瘤微环境中基质评分、免疫评分和免疫细胞浸润水平的差异。利用基因集富集分析(GSEA)预测FOXD1相关的生物学功能和信号通路。结果 TCGA和GEO数据集分析发现FOXD1表达在OSCC组织中显著上调(P <0.001)。FOXD1表达与与不良预后相关(P <0.05)。FOXD1表达变化影响肿瘤微环境中M1型巨噬细胞,未活化树突状细胞、活化肥大细胞和滤泡辅助性T细胞的水平。结论 FOXD1在OSCC中呈高表达,且与不良预后相关,FOXD1基因可能是原癌基因,因此可作为OSCC诊断和治疗的潜在靶点。     

原纤维蛋白1基因在胃癌组织中的表达、功能富集及信号通路生物信息学分析

目的 探讨原纤维蛋白1(FBN1)基因在胃癌组织中的表达、相关生物学功能和信号通路以及FBN1表达与胃癌患者生存期的关系。方法 应用生物信息大数据挖掘技术分析癌症基因组图谱数据库(TCGA)中人胃癌癌组织和癌旁正常组织中FBN1 mRNA表达水平。应用蛋白相互作用数据库STRING构建FBN1基因相关蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络并对蛋白网络中的编码基因进行功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析。根据胃癌组织中FBN1 mRNA表达水平的中位数将胃癌患者分为高表达组(n=126)和低表达组(n=118),采用Cox回归模型比较FBN1高表达组与低表达组患者总生存期(OS)和无疾病进展生存期(DFS)。结果 FBN1 mRNA在胃癌癌组织中的表达显著高于癌旁正常组织(P<0.05)。FBN1基因PPI网络中共有21个蛋白和143个相互作用关系,各蛋白平均相互作用指数为0.816,网络中各个蛋白功能富集明显(P<0.05)。FBN1基因生物学过程主要富集于翻译后蛋白质修饰、解剖结构发育等;细胞组分主要富集于内质网内腔、细胞外基质和内质网等;分子功能主要富集...