基于GEO数据库脓毒症心肌病差异基因的筛选与生物信息分析

目的 利用脓毒症心肌病（SCM）的差异性基因,检测与SCM有关的潜在靶点,为寻找最新的诊断方法与疗法提供新途径。方法 从美国GEO数据库上下载GSE79962基因芯片,并使用NetworkAnalyst的网络大数据分析技术工具分析SCM病人和对照组患者（NF）所表达的差异基因,并将结果可视化。将不同差异基因（DEGs）经过分析,使用Metascape网络数据库系统和String网站对其经过富集分析及蛋白质互助作用构建PPI网络图,从而检测出重要基因组和功能模块。结果 一共筛选出了390个DEGs,包括上升基因288个,下降基因162个。而基因组本体分析则表明,DEGs在生物过程学中一般富集在对药物反应、对血栓形成的积极调控、对细菌繁殖的负性调控等;在细菌组成方面一般是富集于细胞外区段、细胞外间隙、浆膜的整体成分等;在分子物质作用功能则一般是富集于与蛋白质的融合、钙离子融合、受体结合等。通路分析提示,DEGs主要富集于PI3K-Akt信号通路、胰岛素抵抗等。利用Cytoscape的在线数据库,检测出了2种显著作用模块和10个重要基因,它们为STAT3、SERPINE1、TIMP1、TP5...     

类风湿关节炎与骨质疏松症的生物信息学分析

目的 利用生物信息学分析类风湿关节炎（RA）与骨质疏松症（OP）的关系。方法 通过Genecards、OMIM、TTD等数据库查找RA和OP的疾病基因,对两组疾病的基因取交集,将共同基因导入STRING数据库构建蛋白互作（PPI）网络图,使用R软件筛选出PPI网络中的关键基因,利用DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析。结果 通过检索数据库筛选出RA相关基因5 388个、OP相关基因4 587个,取交集后获得共同靶点基因1 899个,PPI网络图显示IL-6、INS、AKT1、TNF、TP53、VEGFA、EGFR等为RA与OP的共同关键基因,GO富集主要与受体配体活性、细胞因子受体结合、囊泡、T细胞活化、肽分泌的调节等相关,KEGG信号通路包括PI3K-Akt信号通路、JAK-STAT信号通路、破骨细胞分化、细胞凋亡、Th17细胞分化等。结论 所获得RA与OP的共同关键基因和涉及的信号通路,有助于理解两者在疾病过程中的相关性,为药物的研发提供理论参考。     

基于GEO数据库的IgA肾病基因的筛选和生物信息学分析

目的 通过生物信息学分析鉴定IgA肾病的生物标志物,旨在阐明IgA肾病疾病进展的可能分子机制.方法 从GEO数据库下载包含IgA肾病患者和健康对照的微阵列数据集GSE104948、GSE93798和GSE37460数据集,并使用limma R包进行分析,以获得差异表达基因.然后进行GO分析和KEGG通路富集分析,运用S...     

基于GEO数据库的IgA肾病的关键差异基因分析

目的:基于GEO数据库初步挖掘、分析探讨IgA肾病的差异基因,为治疗IgA肾病提供新的靶点。方法:在GEO数据库中检索有关IgA肾病的相关芯片,根据样本数量及芯片类型,筛选出符合条件的芯片,借助R语言软件筛选出符合条件的差异基因,构建蛋白质-蛋白质相互作用关系网络(PPI),利用Cytoscape软件与R语言软件对差异基因进行拓扑分析,找出核心基因,并利用后者对差异基因进行GO富集分析和KEGG通路分析。结果:检索GEO数据库确定序列号为GSE93798的芯片,利用R语言分析筛选出417个差异基因,通过String数据库构建PPI网络,利用Cytoscape软件与R语言软件拓扑分析得到20个核心基因;通过R语言软件对差异基因进行GO富集分析得出差异基因主要是通过细胞外基质结构组成、长链脂肪酸转运蛋白活性、有机酸结合、羧酸结合等途径表达的,KEGG信号通路则主要富集在PPAR信号通路、色氨酸代谢信号通路、精氨酸和脯氨酸代谢信号通路和由叶酸构成的碳池信号通路上。结论:利用生物信息学相关知识分析GEO数据库的原始基因芯片数据,可以获得芯片的内在生物学信息,通过多靶点、多通路途径挖掘IgA肾病可能存在的发病机制,为日后研究治疗该病提供合理思路与理论依据。     

类风湿关节炎患者与药源性胃黏膜损伤的生物信息学分析

目的：利用生物信息学分析类风湿关节炎患者与药源性胃黏膜损伤的关系。方法：通过GeneCards、OMIM、TTD、pharmGKB、drugbank数据库检索“rheumatoid arthritis”“drug induce gastric mucosal injury”,获取类风湿关节炎及药源性胃黏膜损伤2个疾病基因,制作韦恩图获取2个疾病的共同基因,将共同基因导入STRING进行PPI网络分析、GO功能富集及KEGG通路分析。结果：通过检索不同数据库整理去重后,筛选出相关类风湿关节炎基因4953个,药源性胃黏膜损伤相关基因1489个,将2个疾病相关基因取交集后获得共同靶点基因1060个,PPI网络显示TNF、AKT1、GAPDH、CTNNB1、STAT3等为共同关键基因,GO富集主要与线粒体、腺苷受体信号通路、蛋白活性、磷酸酶结合等相关,KEGG信号通路包括NF-κB信号通路、JAK-STAT信号通路、Wnt信号通路等。结论：所获得的类风湿关节炎及药源性胃黏膜损伤的共同关键基因和涉及的信号通路,有助于理解两者在疾病过程中的相关性,为药物的研发提供理论参考。     

类风湿关节炎肾损害

类风湿关节炎肾损害包括原发性肾损害和继发性肾损害 ,前者包括系膜增生性肾小球肾炎、膜性肾病、膜增生性肾炎和基底膜变薄等 ,后者包括肾血管炎、肾淀粉样变、药物性肾损害 (继发于非甾体抗炎药、青霉胺、金制剂、环孢素A及氨甲喋啶的肾损害 )、肾结石等。本文综述类风湿关节炎肾损害的发病机理、病理及临床表现、治疗进展及预后等。     

骨质疏松与类风湿关节炎

类风湿关节炎和骨质疏松在我国都属于常见病和多发病,而二者之间又有着非常重要的联系。但是目前临床上还没有一个广泛应用的药物可以同时对两者都产生很好的治疗效果。为了进一步了解骨质疏松和类风湿关节炎的关系,将来能够找到更好的治疗药物,笔者从流行病学、发病机制以及治疗方法等方面分别进行了论述。     

联合GEO数据库使用网络药理学探讨四妙勇安汤治疗类风湿关节炎的作用机制

目的:联合GEO数据库使用网络药理学探讨四妙勇安汤治疗类风湿关节炎的主要成分和可能的作用机制.方法:通过GEO芯片数据挖掘OMIM数据库和Genecards数据库,检索收集类风湿关节炎靶点;通过TCMSP数据库,以生物利用度>30％,类药性>0.18为筛选条件,收集四妙勇安汤的活性成分及对应靶点.将四妙勇安汤靶点与类风...     

类风湿关节炎继发骨质疏松症的临床分析

目的 探讨类风湿关节炎（rheumatoid arthrilis,RA)继发骨质疏松症（Osteoporosis,OP)的相关性,提高此类患者的生命质量。方法 选取RA患者和正常人群各60例分为观察组和对照组两组,检测两组的骨密度值,同时观察RA继发OP组及非OP组的临床症状及血沉（ESR)、类风湿因子（RF)、C反应蛋白（CRP)等实验室指标。结果 60例RA患者腰椎L1-4、髋部的骨密度检测均明显低于对照组,18例RA继发OP患者较非OP组（骨量正常、骨量减少）,42例RA患者HAQ积分更高（P <0.01),关节功能更差（P <0.01),炎症指标更高（P <0.01)。结论 类风湿关节炎较正常人群的骨质疏松症的发生率明显升高,RA继发OP患者的HAQ评分、关节功能、炎症指标等较RA骨量正常者明显升高。     

治疗类风湿关节炎药物不良反应的临床分析

目的 了解我院治疗类风湿关节炎药物不良反应发生情况.方法 对148例类风湿关节炎患者中出现不良反应的资料进行回顾性分析.结果 治疗类风湿关节炎主要是联合用药,用药品种数越多不良反应发生率越大,不良反应发生率占56.1%且涉及器官以消化道损害为主,长期大量服用非甾体抗炎药、激素药,易导致不良反应发生.甲氨喋呤致不良反应16例次,羟氯喹致不良反应10例次,来氟米特致不良反应8例次.结论 依据患者具体情况,选择不同的抗类风湿关节炎药物联合治疗,密切观察不良反应.     

类风湿关节炎致自发性手指肌腱断裂的临床分析

目的探讨类风湿关节炎致自发性手指肌腱断裂的临床特点和治疗效果。方法对8例自发性手指肌腱断裂的患者（均有3～8年类风湿关节炎的病史），其中2例拇长伸肌腱断裂，采用示指固有伸肌腱转位修复；3例环、小指指伸肌腱断裂，采用环指指伸肌腱与中指指伸肌腱端侧编织缝合，示指固有伸肌腱移位修复小指固有伸肌腱；2例中、环、小指指伸肌腱断裂，采用冷冻异体指伸肌腱移植修复。1例拇长屈肌腱断裂，采用环指指浅屈肌腱转位修复。结果术后局部滑膜和肌腱组织送病理检查均显示为慢性炎症伴局灶性坏死。术后随访6个月～7年，未见肌腱再次断裂，优良率为100％。结论多根肌腱同时断裂是类风湿关节炎致自发性手指肌腱断裂的常见特点，手术采用肌腱转位或异体肌腱移植术，疗效确切。     

浅谈中医治疗类风湿关节炎60例

探讨中医药治疗类风湿关节炎的治疗方法和临床疗效,辨别类风湿关节炎的基本证型及主要症状,通过对比说明中医药治疗类风湿关节炎的优势及其不可替代的作用.     

类风湿关节炎并发骨质疏松的研究进展

类风湿关节炎(RA)与骨质疏松(0P)在临床上属于常见疾病,严重威胁患者身心健康.但是,无论医生还是患者对其危害程度认识还不够.为了进一步了解类风湿关节炎与骨质疏松之间的相互关系,特别是RA并发OP的发生机制,本文对该病的流行病学研究、病理生理机制、诊断、预防与治疗的最新研究进展进行综述,以期加深医务工作者对RA并发O...     

类风湿关节炎骨质疏松危险因素分析

目的类风湿关节炎(RA)是继发性骨质疏松的常见原因,本研究旨在通过分析比较RA患者血清类风湿因子(RF)、抗环瓜氨酸多肽抗体(anti-CCP)、C-反应蛋白(CRP)、血细胞沉降率(ESR)及骨代谢六项指标水平,探讨RA患者骨质疏松的危险因素。方法 133例RA患者根据双能X线检测的骨密度(BMD)结果分为骨质疏松组、骨量减低组和骨量正常组,检测各组受试者RF、anti-CCP、CRP、ESR及骨代谢六项等指标,分析比较各组受试者各指标水平差异,并比较各组患者糖皮质激素用药情况,多元logistic回归分析上述指标与RA患者骨质疏松的关系。结果①RA患者血清RF、anti-CCP、CRP及ESR水平相较于正常人群显著升高;②骨质疏松和骨量减低组CRP、ESR及骨碱性磷酸酶(BALP)、β胶原特殊序列(β-CTx)两项骨代谢指标水平较RA骨量正常组显著升高,且OP组糖皮质激素使用率明显高于骨量正常组,差异有统计学意义;③患者年龄、病程、疾病活动度及使用糖皮质激素是RA患者发生骨质疏松的独立危险因素OR(95%CI)分别为1.116(1.013-1.230)、1.775(1.191-2.645)、4.356(1.741-10.898)和9.448(1.040-85.802)。结论 RA患者血清自身抗体、炎症指标及骨代谢指标水平存在不同程度异常,患者年龄、病程、疾病活动度及糖皮质激素使用情况可作为判断RA患者骨质疏松风险的参考指标,有助于指导临床对RA患者疾病发展和病程进行监测,并进行及时的合理治疗。     

颈椎类风湿关节炎的诊疗进展

类风湿关节炎（rheumatoid arthritis,RA）是一种以滑膜关节病变为主要表现的慢性自身免疫性疾病,构成关节的各种组织,如滑膜、软骨、韧带、肌腱以及骨骼均可受累。手足病变最为常见,多表现为对称性多关节炎;颈椎亦常受累,表现为各种颈椎不稳,可导致延髓、脊髓或神经根受压而表现相应的神经功能障碍。颈椎RA患者常合并周围关节的畸形、僵直或活动受限,体格检查不能准确评估神经功能状态,患者一旦出现明显的神经症状,颈椎不稳已进展较为严重。因此,应加深对颈椎RA的认识,有助于疾病的及时诊治。本文将就颈椎RA的诊断和手术治疗进展作一综述。