DJ-1蛋白在晚发型阿尔茨海默病蛋白组学的表达

目的 从蛋白质水平初步探讨晚发型阿尔茨海默病发病机制,寻找并鉴定与之有关的生物标志物.方法 选择经病理证实的8例晚发型阿尔茨海默病患者及5例正常老年人颞叶脑皮质为研究对象.分别进行双向凝胶电泳后采用基质辅助激光解析-电离-飞行时间质谱及电喷雾电离串联质谱法进行质谱分析,搜索数据库鉴定蛋白质.结果 分别获得两组脑组织双向凝胶电泳蛋白质组表达图谱,DJ-1蛋白在疾病组明显上调.结论 DJ-1蛋白可能成为具有临床诊断意义的晚发型阿尔茨海默病潜在标志物,从而帮助开发靶向目的 蛋白质的新型抗神经退化药物.     

溃疡性结肠炎血清差异蛋白的筛选研究

目的 应用蛋白质组学寻找溃疡性结肠炎(UC)血清差异蛋白,初步探索UC可能的生物标志物.方法 收集UC患者30例和健康对照者30名的血清标本,双向凝胶电泳(2-DE)分离等量混合血清的蛋白质,运用图像分析软件进行比较和分析,识别差异表达蛋白质.应用基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定部分差异蛋白质点.结果 UC组和对照组之间年龄、体重指数、吸烟情况和饮酒量的差异均无统计学意义(P值均＞0.05).初步筛选出UC患者与健康对照者存在明显差异的39个蛋白点,选择其中9个点,经质谱分析发现触珠蛋白、热休克转录因子2、受体酪氨酸激酶、醛脱氢酶、载脂蛋白C-Ⅲ、中心粒旁物质1在UC患者中表达水平升高,角蛋白1、细丝蛋白A结合蛋白1、肌球蛋白3在UC患者中表达水平降低.结论 采用蛋白质组学2-DE和质谱技术,筛选并鉴定出与UC相关的9个血清蛋白质,为提供新的UC生物学行为研究分子标志物奠定基础.     

荧光差异双向凝胶电泳法筛选大鼠脑缺血相关蛋白

目的 鉴定局灶性脑缺血相关蛋白并筛选早期神经保护蛋白.方法 应用先进的差异蛋白质组学荧光差异双向凝胶电泳（2D DIGE）技术,比较大鼠大脑中动脉闭塞（MCAO）6 h病灶侧大脑皮层和正常大鼠相应部位蛋白质变化;采用DeCyder-DIA软件、单因素方差分析ANOVA,选择两组间蛋白表达量差异具有统计学意义（P＜0.05）且AR＞1.4的蛋白点;基质辅助激光解析/电离-飞行时间（MALDI-TOF）质谱鉴定差异蛋白.结果 脑缺血6 h组与正常对照组比较13个蛋白点符合统计学要求;经质谱分析仅鉴定出一个缺血组明显减少的蛋白点为α-微管蛋白.结论 作为结构蛋白之一的α-微管蛋白在脑缺血早期即发生明显变化,是缺血性脑血管病早期相关蛋白.     

应用蛋白质组学技术筛检肝癌血清差异蛋白质并分离鉴定阿朴脂蛋白AⅡ

目的 应用蛋白质组学技术筛选并鉴定肝癌患者血清中的差异蛋白质.方法 采用表面增强激光解析及电离飞行时间质谱技术,对33例肝癌患者和33例正常对照的血清蛋白质进行了检测分析,筛选肝癌的差异蛋白;用等电点沉淀法、十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳及高效液相色谱串联质谱等一系列方法分离鉴定差异蛋白质.肝癌组与正常组蛋白质峰差异比较采用两样本t检验. 结果 肝癌组与正常人组血清蛋白质图谱在相对分子质量为2 000～10 000范围内,有65个蛋白质峰差异有统计学意义(P<0.05),由此组建的诊断模型灵敏度为100%,特异度为96.97%其中包括8706.5 M/Z和8579.2M/Z(t值分别为2.562和2.783,P值均<0.05),经分离鉴定其为阿朴脂蛋白AⅡ. 结论 阿朴脂蛋白AⅡ是肝癌的差异蛋白之一,可能与肝癌的发生有关.     

鼠疫菌pYC质粒对菌体蛋白质组影响的初步研究

目的 了解鼠疫菌pYC质粒对菌体蛋白质组的作用。方法 将含有pYC质粒的鼠疫菌与不含该质粒的鼠疫菌通过双向电泳的方法进行蛋白质组比对,并将差异蛋白进行质谱鉴定。结果 含有pYC质粒的鼠疫菌与不含该质粒的鼠疫菌的蛋白图谱可识别的蛋白点均在500个以上,两者总体上相似性较高;前者较后者在大小约70×103、等电点5.0左右处,明显多一个蛋白点簇,该蛋白簇经质谱鉴定均为伴侣蛋白GroEL,但该蛋白并非是pYC质粒编码蛋白。结论 pYC质粒对菌体蛋白质组有影响,其编码蛋白pYC_p10与pYC_p11,可能调控GroEL高表达。     

额颞叶痴呆的蛋白质组研究

目的 为深入理解额颞叶痴呆分子机制并寻找诊断治疗该疾病的蛋白质标记物,选取5例经病理证实的额颞叶痴呆患者与4例无神经系统疾病老年人尸检脑标本进行蛋白质组学研究.方法 死亡24 h内新鲜取材的尸检额叶、颞叶蛋白质以固相pH梯度等电聚焦为第一向,SDS-PAGE垂直电泳为第二向进行双向电泳（2-DE）,图象分析软件Imagemaster 2D Elite分析电泳图谱,MALDI-TOF质谱或MALDI-TOF/TOF串联质谱鉴定蛋白质.结果 18种蛋白质的表达量在额颢叶痴呆患者与正常老年人显著不同.12个在额颞叶痴呆表达量上调的蛋白质被鉴定为3-磷酸甘油醛脱氢酶、尿嘧啶DNA糖苷水解酶、Cu-Zn超氧化物歧化酶、异柠檬酸脱氢酶亚单位、synaptotagmin I、Peroxiredoxin2、胶质纤维酸性蛋白、P25 alpha、烯酰辅酶A水合酶短链1、吡哆醇-5′-磁酸氧化酶、Mn超氧化物歧化酶、α-烯醇化酶;6个在额颞叶痴呆表达量下调的蛋白质被鉴定为抗氧化蛋白2（酸性钙离子依赖型磷脂酶A）、铁蛋白H链、谷氨酸脱氢酶、肽基脯氨酸顺反异构酶A、血清白蛋白前体、二氢嘧啶酶相关蛋白2.结论 额颞叶痴呆患者脑组织中神绛纤维缠结相关蛋白、氧应激蛋白、凋亡相关蛋白及重要代谢酶的表达发生变化,有助于深入理解额颞叶痴呆分子机制并有望在额颞叶痴呆的早期诊断及新药开发上发挥作用.     

核苷二磷酸激酶等蛋白在人胰腺癌与癌旁组织中的差异表达

目的 应用比较蛋白质组学方法研究人胰腺导管腺癌组织和癌帝组织之间差异的蛋白质.方法利用双向凝胶电泳(2-DE)对8例胰腺导管腺癌组织和癌旁组织的总蛋白进行分离,两组间差异蛋白质点用质谱和数据库检索鉴定利用蛋白质印迹分析和免疫组织化学法检测差异蛋白在胰腺癌和癌旁组织的表达.结果 鉴定出30个差异表达蛋白,包括亲环素A、过氧化氧化还原蛋白1、14-3-3 sigma、Annexin Ⅱ、热休克蛋白27、核苷二磷酸激酶(NDPD)等.差异表达蛋白NDPK在35例胰腺癌组织表达率为77.1%,而配对癌旁组织为28.6%.结论 2-DE为基础的蛋白质学技术是研究肿瘤的一种重要手段.NDPK等差异表达蛋白可能是潜在的胰腺癌诊断标记物.     

6-羟基多巴胺诱导PC12细胞帕金森病模型中CaBP1表达的研究

目的应用蛋白质组学技术研究6-羟基多巴胺（6-OHDA）诱导PC12细胞帕金森病（PD）模型中钙结合蛋白1（CaBP1）的表达。方法在建立6-OHDA诱导PC12细胞帕金森病模型的基础上，分别提取6-OHDA处理组和对照组细胞总蛋白，应用荧光差异双向凝胶电泳（DIGE）技术获得蛋白点的差异表达信息，运用基质辅助激光解吸／电离飞行时间质谱仪（MAID1-TDF MS）鉴定出差异蛋白质。结果DIGE分析发现6-OHDA组表达明显增高的一个蛋白质点，经质谱分析鉴定确认为CaBP1。结论6-OHDA诱导PC12细胞的帕金森病模型中CaBP1表达增高，提示CaBP1增高可能与PD的发病机制有关。     

早期肺鳞癌相关蛋白的筛选及其表达验证

目的应用蛋白质组学技术筛选早期肺癌癌变相关蛋白。方法利用双向凝胶电泳方法分离人早期肺鳞癌组织和相应癌旁正常组织总蛋白,选择差异蛋白质点进行质谱分析。免疫组织化学法验证部分差异蛋白质的表达差异。结果用DeCyder软件DIA模块分析显示,每块2-DE胶分离近1470左右个蛋白质点,再经过BVA模块分析,找出在9张图像中均出现,差异有统计学意义(P0.05)、两组间蛋白含量比值在1.5倍以上的差异性蛋白质点24个,成功鉴定14个。选择在癌组织中高表达的差异蛋白点进行质谱分析,最终鉴定为AnnexinⅡ、Cathcpsin D等蛋白质。免疫组织化学检测结果显示,AnnexinⅡ、Cathcpsin D蛋白在肺鳞癌组织中的阳性表达率均显著增高(P0.05)。结论蛋白质组学方法是一种应用于初步筛选早期肺癌相关蛋白的有效方法 ,所鉴定的蛋白为进一步筛选用于肺癌早期诊断及其治疗的分子标志物奠定了前期基础。     

Tau蛋白病的蛋白质组研究

目的 对Tau蛋白病患者与4例正常老年人尸检脑标本进行蛋白质组学研究以期了解Tau蛋白病分子机制并寻找诊断治疗该疾病的蛋白质标记物。方法 颞叶蛋白质以固相pH梯度等电聚焦为第一向,SDS-PAGE垂直电泳为第二向进行双向电泳(2-DE),分析电泳图谱,基质辅助激光解析／电离-飞行时间(MALDI-TOF)质谱或MALDI-TOF／TOF串联质谱鉴定蛋白质。结果 18种蛋白质的表达量在Tau蛋白病患者与正常老年人显著不同。分别被鉴定为3磷酸甘油醛脱氢酶、尿嘧啶。DNA糖苷水解酶、Cu-Zn超氧化物歧化酶、异柠檬酸脱氢酶亚单位、synaptotagminⅠ、Peroxiredoxin 2、胶质纤维酸性蛋白、p25α、烯酰辅酶A水合酶短链1、吡哆醇-5′-磷酸氧化酶、Mn超氧化物歧化酶、α-烯醇化酶、抗氧化蛋白2、铁蛋白H链、谷氨酸脱氢酶、肽基脯氨酸顺反异构酶A、血清白蛋白前体、二氢嘧啶酶相关蛋白2。结论 上述差异蛋白有助于深入理解Tau蛋白病机制并有望在Tau蛋白病的早期诊断及新药开发上发挥作用。     

塞莱昔布对幽门螺杆菌蛋白质组的影响

目的:探讨选择性COX-2抑制剂塞莱昔布对幽门螺杆菌(H.pylori)蛋白质组的影响.方法:双向凝胶电泳技术(2-DE)分离塞莱昔布处理前后的H.pylori标准株26695全菌蛋白,银染法凝胶染色,图像扫描分析软件识别差异蛋白,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALD-TOF-MS)、串联质谱(MALDI-TOF-MS/MS)分析差异蛋白;SYBRGreenⅠ实时定量PCR测定差异蛋白基因的表达变化.结果:塞莱昔布处理后,H.pylori标准株26695发现17个蛋白质斑点表达有差异.7个蛋白质斑点得到阳性鉴定,分别归为H.pylori的3种蛋白质:热休克蛋白60(HSP60),即groEL,延伸因子(EF-TU),谷氨酰转肽酶(GGT).与DMSO溶媒对照相比,塞莱昔布处理后的H.pyloriHSP60(groEL)、EF-TU、GGT表达下调.实时定量PCR测定显示,编码H.pyloriEF-TU、GGT基因的mRNA水平降低(0.07±0.06vs1.01±0.16;0.31±0.13vs0.98±0.01,均P<0.05),而编码H.pyloriHSP60(groEL)基因的mRNA水平增加(1...     

乙型肝炎病毒相关性肝细胞癌患者肝硬化组织与癌组织蛋白质组的差异

目的分析乙型肝炎病毒(HBV)相关性肝细胞癌患者肝硬化组织与癌组织蛋白质组之间的差异,鉴定其中的差异蛋白质点。方法应用双向聚丙烯酰胺凝胶电泳,对12例肝细胞癌患者的肝细胞癌组织与肝硬化组织的蛋白质进行差异分析,应用基质辅助激光解吸离子化飞行时间质谱仪对差异蛋白质点进行了鉴定。结果经肝细胞癌绀织与癌周组织的差异对比分析,共发现有表达水平存在显著差异的35个蛋白质点,14个差异蛋白质点得到了初步鉴定,其中5个蛋白质既往文献中曾报道其与肝细胞癌变相关。结论HBV相关性肝细胞癌蛋白质组与肝硬化组织蛋白质组之间存在差异;本实验研究中初步鉴定的差异蛋白质,可能有助于HBV相关性肝细胞癌的癌变机制、肿瘤标记和治疗靶标的进一步研究。     

HBV相关性肝细胞癌肝组织蛋白质组差异的初步分析

目的分析HBV相关性肝细胞癌蛋白质组与癌周组织（肝硬化组织、慢性肝炎组织）蛋白质组之间的差异，鉴定其中的差异蛋白质点。方法应用双向聚丙烯酰胺凝胶电泳，对18例肝细胞癌组织与12例肝硬化组织、6例慢性肝炎组织的蛋白质组表达谱进行差异分析，应用基质辅助激光解吸离子化飞行时间质谱仪对差异蛋白质点进行了鉴定。结果肝细胞癌组织与癌周组织的对比中，共发现有表达水平存在显著差异的47个蛋白质点，17个差异蛋白质点得到了初步鉴定，其中8个蛋白质点在既往文献中未曾报道其与肝细胞癌变相关。结论慢性肝炎基础上发生的癌变与肝硬化基础上发生的癌变，其癌变机制存在差别。本实验研究中初步鉴定的差异蛋白质，可能有助于HBV相关性肝细胞癌的癌变机制、肿瘤标记和治疗靶标的进一步研究。     

燃煤污染型砷中毒肝损伤患者血清差异蛋白质的筛选

目的 对比分析燃煤污染型砷中毒肝损伤患者和健康人血清中差异表达的蛋白,筛选与燃煤污染型砷中毒致肝损伤发生密切相关的血清蛋白质.方法 6例血清标本来自于贵州省兴仁县交乐病区燃煤型砷中毒肝损伤患者及病区健康人(对照组),采用双向凝胶电泳(2-DE)分离血清中总蛋白,硝酸银染色后经图像分析识别差异表达的蛋白质,基质辅助激光解吸电离飞行时问质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定差异表达的蛋白质点,寻找与燃煤污染型砷中毒致肝损伤有关的蛋白质.结果成功地建立了血清2-DE图谱.差异蛋白分析显示,砷中毒肝损伤组平均蛋白点数为(824±31)个,对照组为(782±42)个,两组血清2-DE图谱的匹配率为94.9%(782/824).筛选出两组间的差异蛋白点49个,对其中表达量差异3倍以上的30个蛋白点进行MALDI-TOF-MS分析,鉴定出相关蛋白10个.与对照组比较,其中α2-巨球蛋白、B细胞受体相关蛋白31、细胞角蛋白1、载脂蛋白A-I在砷中毒肝损伤组表达上调,触珠蛋白、α2-HS-糖蛋白、细胞外信号调节激酶4、锌指蛋白323、ZAP-70、SP40表达下调.结论成功地建立了分辨率高、重复性较好的燃煤污染型砷中毒肝损伤患者血清2-DE图谱,并筛选出一些与健康人血清中差异表达的蛋白质,这些蛋白质能否作为燃煤污染型砷中毒肝损伤诊断的血清标志物还有待于进一步验证.     

生长抑素2型受体基因转染对胰腺癌细胞蛋白表达的影响

目的 探讨生长抑素2型受体(hSSTR2)基因转染对胰腺癌细胞PANC1蛋白表达的影响,以寻找新的胰腺癌敏感治疗靶点.方法 利用前期构建的腺病毒载体Ad.CMV.hSSTR2.GFP将hSSTR2全长cDNA导入胰腺癌细胞PANC1.采用双向荧光差异凝胶电泳(2D-DIGE)技术分离并筛选转染hSSTR2的实验组、空载体对照组以及空白组胰腺癌细胞之间差异表达蛋白,用反射式基质辅助激光解吸附电离串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)技术对差异蛋白进行鉴定.结果 hSSTB2成功地转染了胰腺癌细胞,获得了hSSTR2阴性和阳性表达的PANC1荧光差异蛋白表达图谱,经DeCyder v6.5软件分析,共有18个差异在1.3倍以上的蛋白质点,经质谱鉴定得到13个蛋白质.低表达的蛋白7个,为GMP合酶、磷酸化应激诱导蛋白、谷氨酸脱氢酶、Septin-11、波形蛋白、异柠檬酸脱氢酶α亚基、线粒体内膜易位酶;高表达蛋白6个,为真核延长因子1α1、丙酮酸激酶异构体M2型、烯酰-CoA水合酶、转录调节因子1-β、Mitofilin、HSP105.结论 hSSTR2基因转染胰腺癌细胞PANC1后引起蛋白表达发生变化,这些差异蛋白功能涉及到糖、脂肪、核酸代谢以及细胞生长调节和细胞凋亡等,从而为寻找新的胰腺癌敏感治疗靶点奠定基础.     

羟基喜树碱诱导SMMC-7721细胞线粒体跨膜电位耗散的蛋白质组分析

目的比较蛋白质组,分析羟基喜树碱诱导肝癌细胞株SMMC-7721细胞凋亡前后的线粒体蛋白质表达谱。方法用羟基喜树碱诱导肝癌SMMC-7721细胞发生线粒体跨膜电位耗散,提取线粒体并用Western blot法对线粒体纯度进行鉴定；用二维凝胶电泳分离溶解度不同的3种蛋白质组分并对蛋白质进行银染色；利用PDQuest图像分析软件分析比较凝胶结果,获得差异蛋白质；采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱鉴定部分差异蛋白质,并用Western blot法对部分差异蛋白质进行进一步的鉴定。结果羟基喜树碱成功地诱导线粒体发生跨膜电位耗散,并获得纯度很高的线粒体；通过PDQuest图像分析软件发现,线粒体发生跨膜电位耗散前后比较约有39个蛋白质点表达有差异,对其中28个差异蛋白质斑点进行了肽质指纹图分析,鉴定出20种可能的蛋白质。结论获得了羟基喜树碱诱导线粒体凋亡前后差异蛋白的相关信息,为从蛋白质水平进一步研究羟基喜树碱诱导癌细胞发生凋亡的机制奠定了基础。     

肾上腺皮质癌组织蛋白的筛选及意义

目的比较肾上腺皮质癌（ACC）与其癌旁组织的蛋白表达谱的差异,筛选新的诊断ACC的肿瘤标志物。方法分别提取12例ACC组织蛋白及其癌旁组织蛋白。蛋白定量后,采用双向凝胶电泳（2-DE）对组织蛋白表达谱进行分离,采用飞行时间质谱对差异位点进行蛋白鉴定。结果共鉴定出29个ACC相关蛋白,其中表达上调20个,下调9个。上调蛋白的分子功能主要为蛋白质结合和氧化还原酶活性功能。结论成功筛选出一组在ACC组织中表达差异的蛋白,可能为ACC的候选肿瘤标志物。     

Proteome Analysis of Human Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Tissue Using Two-Dimensional Gel Electrophoresis and Tandem Mass Spectrometry for Identification of Disease-Related Proteins

A comparative proteomic approach has been used to identify and analyze proteins related to pancreatic cancer. Proteomes of eight pairs of clinical pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) tissue samples and samples of normal adjacent tissue were obtained by two-dimensional gel electrophoresis (2DE). Comprehensive analysis of proteins was focused on total protein spots for which there were statistical differences between the two groups. Proteins were identified by peptide mass fingerprinting with tandem mass spectrometry (MS–MS). Western blotting and immunohistochemistry (IHC) were also performed to verify the expression of some candidate proteins. Thirty protein spots were identified, including proteases, antioxidant proteins, signal-transduction proteins, calcium-binding proteins, structural proteins, chaperones, and others. Western blotting and IHC confirmed up-regulated expression of two candidate proteins, nucleotide diphosphatase kinase (NDPK) and annexin II, in tumorous tissues. These results suggest that combination of 2DE with MS is an effective strategy for discovery of differently expressed proteins in PDAC which may be molecular markers for diagnosis or therapeutic targets. Rui Tian and Li-Ming Wei contributed equally to this work