六味地黄丸治疗糖尿病视网膜病变网络药理学与分子对接分析

目的 基于网络药理学研究六味地黄丸治疗糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy,DR)的潜在机制并利用分子对接进行验证。方法 通过TCMSP数据库平台筛选六味地黄丸的有效成分以及相关靶点,通过疾病数据库(GeneCards、OMIM、Drugbank、TTD数据库)获取DR相关靶标并预测六味地黄丸治疗DR的潜在靶点。通过STRING网站和Cytoscape3.7.2软件绘制“复方活性成分-交集靶点”网络结构,同时建立PPI网络模型并找到关键靶点。对六味地黄丸治疗DR的靶标进行基因本体(GO)富集分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,最后采用AutoDock软件实现分子对接。结果 (1)获得六味地黄丸活性成分69个,有效成分靶点蛋白203个,DR相关基因3326个,交集靶点121个,核心靶标13个。(2)与DR治疗相关的生物学进程(biological process,BP)包括对脂多糖、氧化应激、化学应激的反应等,KEGG富集分析提示关键的通路涵盖AGE-RAGE、PI3K-Akt、HIF-1信号通路等。(3)分子对接显示槲皮素、薯蓣皂苷、山柰酚、β...     

槲皮素治疗心力衰竭的分子机制:基于网络药理学与分子对接方法

目的 基于网络药理学和分子对接研究槲皮素治疗心力衰竭(HF)的分子机制。方法 利用TCMSP、PharmMapper、CTD和GeneCards数据库得到槲皮素和HF相关靶点,通过在线Venn网站得到槲皮素-HF交集靶点,构建蛋白质相互作用网络后导入Cytoscape3.7.2得到槲皮素治疗HF的核心靶点。通过R包进行GO、KEGG通路富集分析,利用Auto Dock Vina进行分子对接。通过蛋白质免疫印迹检测槲皮素处理HF细胞模型的AKT1、Phospho-AKT（Ser473）、eNOS、MMP9和Caspase-3的蛋白水平。结果 分析得到80个槲皮素-HF交集靶点,槲皮素治疗HF核心靶点5个：AKT1、CASP3、MAPK1、MMP9和MAPK8。GO分析中,生物过程集中在对肽类激素的反应、磷脂酰肌醇介导的信号传导、脂多糖的反应、对细菌来源分子的反应和炎症反应的调节等。KEGG通路富集分析表明富集最显著的信号通路为：脂质与动脉粥样硬化通路、癌症中的蛋白多糖、PI3K-AKT信号通路、糖尿病心肌病和MAPK信号通路。分子对接显示槲皮素对5个核心靶点具有良好的结合活性。蛋白质免疫印迹结果显示,100 μmol/L 槲皮素可明显降低心力衰竭细胞AKT1、Phospho-AKT（Ser473）、eNOS、MMP9和Caspase-3水平（P<0.01）。结论 槲皮素可能通过调节AKT1-eNOS-MMP9通路抗凋亡从而改善心力衰竭的病理变化。     

橙皮苷防治糖尿病视网膜病变药效及网络药理学机制研究

目的观察橙皮苷对高糖诱导的视网膜血管内皮细胞的影响,并运用网络药理学及分子对接探讨其分子机制。方法在高糖环境下培养视网膜血管内皮细胞,检测橙皮苷对高糖条件下细胞迁移和试管形成的影响。利用Pubchem、Swisstarget和PharmGKB等数据库检索橙皮苷抗糖尿病视网膜病变潜在作用靶点,通过DAVID数据库进行富集分析,采用Accelrys Discovery Studio Client 2.5将橙皮苷和靶蛋白进行分子对接。结果橙皮苷可减少视网膜内皮细胞的迁移数量,同时降低细胞成管能力。网络药理学结果显示,橙皮苷抗糖尿病视网膜病变靶点共17个,KEGG通路富集得到8条信号通路。结论橙皮苷可以抑制高糖诱导下内皮细胞迁移和管道形成,提示橙皮苷可能具有防治糖尿病视网膜病的药效,其机制可能与影响表皮生长因子受体、血管内皮生长因子-A、雌激素受体1和雌激素受体2等有关。     

基于网络药理学和实验研究探讨胃转安方治疗胃癌前病变的作用机制

目的 基于网络药理学、分子对接和动物实验探讨胃转安方治疗胃癌前病变(Precancerous lesions of gastric cancer, PLGC)的作用机制。方法 利用TCMSP数据库与OMIM、GeneCards、PharmGKB、DrugBank疾病数据库筛选胃转安方活性成分、作用靶点与PLGC疾病靶点,构建蛋白互作网络图,进行GO和KEGG通路富集分析,对关键靶点和活性成分进行分子对接,建立PLGC大鼠模型,观察胃转安方干预效果,检测胃转安方对关键信号通路的影响。结果 胃转安方与PLGC共同靶点130个,共获得2337个GO条目,95条通路KEGG信号通路,其中关键通路为PI3K信号通路,分子对接结果显示木樨草素、槲皮素、异鼠李素与关键靶点有较强的结合力。动物实验结果显示胃转安方可改善胃黏膜萎缩、肠化及异型增生病变程度。Western Blot结果显示胃转安方各剂量组降低p-PI3K、p-AKT、p-FoxO4的蛋白表达,升高FoxO4蛋白表达水平,差异有统计学意义(P<0.05),证实胃转安方抑制PI3K/AKT/FoxO4信号通路发挥治疗作用。结论 胃转安方...     

丹参治疗糖尿病神经病变分子机制及其归经实质探讨

目的:探析丹参治疗糖尿病神经病变分子机制及其归经实质。方法:通过TCMSP数据库、PubChem数据库、PharmMapper数据库、CTD数据库、String数据库、BioGPS数据库收集药物成分、靶点、靶点相互关系、靶点在心肝胰肺肾等器官的蛋白表达情况和涉及的主要通路等相关信息。结果:获得36个丹参活性成分,133个中药相关靶点,通过CTD检索糖尿病神经病变相关基因靶点18 044个,其中丹参治疗糖尿病神经病变基因靶点129个。根据degree>30筛选得到关键靶点32个;涉及生物功能33个,信号通路23条,其中FoxO信号通路、PI3K-Akt信号通路及MAPK信号通路富集的靶点最多。通过BioGPS数据库检索丹参133个基因在心肝胰肺肾等器官的表达情况,结果显示54个基因在心脏表达最高,35个基因在肝脏表达最高;与糖尿病神经病变相关的129个基因,在心肝胰肺肾等器官均有表达。结论:丹参治疗糖尿病神经病变主要通过23条信号通路发挥效果,其中以FoxO信号通路、PI3K-Akt信号通路及MAPK信号通路进行实验验证成功的可行性高。靶点表达数据表明丹参归经心肝与靶点的表达有关,糖尿病神经病变是一个复杂的系统性疾病,其发病与五脏相关;丹参不仅仅是通过心肝的靶点,还通过胰肺肾等器官的靶点达到治疗糖尿病神经病变的效果。     

通络糖泰方治疗糖尿病周围神经病变作用机制的网络药理学和分子对接分析

目的：利用网络药理学筛选通络糖泰方（TLTT）治疗糖尿病周围神经病变（DPN）的活性成分,预测作用靶点及信号通路,探讨其作用机制。方法：采用中药系统药理学分析平台（TCMSP）收集TLTT的主要化学成分及作用靶点;利用基因卡片（Genecards）数据库检索与DPN相关的蛋白;利用STRING数据库和网络可视化软件Cytoscape3.9. 1构建蛋白-蛋白互作（PPI）网络;通过京都基因与基因组百科全书（KEGG）和分子对接技术对靶点进行通路富集分析及成分-靶点对接。将30只SD大鼠随机分为对照组、弥可保组和TLTT组,每组10只,给予弥可保和TLTT灌胃制备含药血清;复苏1株RSC96雪旺细胞,设置对照组、高糖模型组、弥可保组和TLTT组,采用细胞计数检测法观察各组细胞存活率,Western blotting法检测各组细胞中丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)和抑癌基因TP53蛋白表达水平。结果：TLTT治疗DPN的有效化合物成分95个,463个靶点,DPN相关蛋白1 187个,137个药物-疾病共同靶点;基因本体论（GO）分析中生物过程、细胞组成和分子功能分别得到5 505个、466...     

基于网络药理学和分子对接探究参芪复方治疗糖尿病肾病分子机制

目的 运用网络药理学和分子对接技术探讨参芪复方治疗糖尿病肾病(diabetic kidney disease,DKD)的分子机制。方法 首先运用TCMSP数据库获得参芪复方的活性成分及对应靶点;从OMIM、DrugBank、TTD、GeneCards数据库中筛选获得DKD的相关靶点。接着将参芪复方活性成分靶点和疾病靶点取交集,得到交集靶点。运用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-活性成分-靶点”(D-A-T)网络图。然后将交集靶点上传至String平台进行PPI网络分析,并挖掘网络中核心靶点;采用Metascape平台分析对交集靶点进行GO功能富集分析与KEGG通路富集分析。最后,运用AutoDock Vina 1.1.2对参芪复方的核心成分与核心靶点进行分子对接验证。结果 研究发现参芪复方通过槲皮素、山柰酚、木樨草素等核心成分作用于AKT1、IL6、MAPK1、VEGFA等核心靶点,调节糖尿病并发症中AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、胰岛素抵抗、松弛素信号通路,并且参与了对有毒物质的反应、对受伤的反应、细胞迁移的正向调节等生物学过程以调控DKD。分子对接结果表明参芪...     

基于网络药理学和分子对接探讨黄连治疗高脂血症的作用机制

目的 采用网络药理学方法和分子对接,研究黄连治疗高脂血症的作用机制。方法 借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索黄连主要活性成分,利用SwissTargetPrediction数据库和TargetNet数据库,获取黄连活性成分对应的作用靶点。通过GeneCards、OMIM和Drugbank数据库筛选高脂血症相关靶点。使用Venny2.1汇总化合物靶点和疾病靶点交集基因并绘制韦恩图。运用Cytoscape 3.8.2绘制“黄连-成分-靶点-高脂血症”的网络图。通过STRING构建黄连-高脂血症核心靶点的PPI网络。采用R软件与Bioconductor工具包进行关键靶基因GO与KEGG功能富集分析,通过文献分析黄连治疗高脂血症的作用机制。最终对黄连主要活性成分与核心靶点进行分子对接验证。结果 获取黄连14个活性成分,关联138个作用靶点。黄连主要涉及脂质代谢过程的调节等生物过程,通过作用核心靶点AKT1、TNF、EGFR等并通过调节AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、AMPK信号通路、脂肪细胞中脂解的调节等信号通路来发挥降脂作用。分子对接结果证明黄连主要活性成分与核心靶点结合...     

基于网络药理学与分子对接技术探讨开郁种玉汤治疗不孕症作用机制

目的 基于网络药理学及分子对接技术探讨开郁种玉汤治疗不孕症的生物信息学基础及分子机制。方法 检索中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）获得开郁种玉汤组方药物的活性成分及靶点蛋白,构建“活性成分-靶点”网络,通过GeneCards数据库获取不孕症相关靶点。将开郁种玉汤与不孕症靶点绘制韦恩图取交集,通过STRING 11.0b数据库建立蛋白质-蛋白质相互作用网络,筛选关键靶点。利用DAVID 6.8数据库对关键靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析,将活性成分进行分子对接验证。结果 筛选出开郁种玉汤58个活性成分,共对应604个靶点,获得开郁种玉汤治疗不孕症相关靶点150个,开郁种玉汤治疗不孕症的关键成分可能为槲皮素、木犀草素、山柰酚等,关键靶点可能为AKT1、TNF、TP53等;开郁种玉汤可能影响与不孕症相关的RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、炎症反应、蛋白结合、酶结合过程等多条生物过程及分子功能,以及PI3K-Akt信号通路等多条信号通路。分子对接结果显示,活性成分与关键靶点对接良好。结论 开郁种玉汤治疗不孕症有多成分、多靶点、多通路的特点,通过抗生殖系统局部炎症、调节氧化应激、...     

基于网络药理学和实验研究探讨加味甘姜苓术汤对非酒精性脂肪肝小鼠模型影响及作用机制

目的 甘姜苓术汤是金匮要略名方,增加丹参、小茴香二位药物形成加味方以提升疗效,本研究通过网络药理学、分子对接、动物实验证实其抗脂肪肝的影响和机制。方法 通过数据库,寻找加味方和脂肪肝的共同靶点,做蛋白互作图,进行GO富集分析和KEGG通路预测。对主要化合物和主要蛋白做分子对接。动物实验中,C57BL6小鼠60%脂肪功能造模饲料造模。对照组无给药,低剂量、中剂量、高剂量加味甘姜苓术汤组采用加味甘姜苓术汤灌胃给药。原方组采用原方灌胃,阳性药组采用易善复灌胃,模型组采用同等剂量纯净水灌胃。测定肝指数,HE染色、油红O染色切片观察肝组织形态学改变,ELISA检测肝脏氧化还原水平,自动生化仪检测血脂水平。Western blot验证网络药理学和分子对接的相关通路蛋白表达水平。结果 网络药理学研究发现疾病与药物成分靶点共同靶点98个。蛋白互作PPI分析证实JUN,AKT1,MAPK1,MAPK3,STAT3,HSP90AA1等为核心基因。KEGG通路预测了HIF-1、MAPK、NOD、TNF、TLR等信号通路。分子对接证实主要化合物和蛋白之间连接紧密。动物实验证实,4周给药后,加味方、原方、阳性药...     

基于网络药理学和分子对接探讨桃红四物汤治疗慢性胆囊炎的机制

目的 ：基于网络药理学和分子对接探讨桃红四物汤治疗慢性胆囊炎的机制,为新药研发节约成本,使实验更具有针对性。方法 ：通过TCMSP数据库寻找药物有效成分,在wiss Target Prediction中预测其对应的靶点,再通过Gene Cards数据库预测慢性胆囊炎的靶点,建立药物和疾病的靶点数据库后绘制PPI网络图、药物成分-靶点图以及GO、KEGG富集分析。根据度值,筛选出核心成分的靶点,再做分子对接验证两者结合情况,最后通过脂多糖刺激人胆囊上皮细胞诱导炎症,使用ELISA试剂盒检测上清液炎症介质的浓度,在使用不同浓度THSWD处理后,采用Western blot法检测AKT和p-AKT的表达。结果 ：筛选了桃红四物汤49个活性成分共计3,262个潜在靶点,去重后获得了665个潜在靶点;疾病靶点共681个。GO富集分析结果显示靶蛋白主要参与平滑肌细胞增殖、MAPK级联反应、炎症反应、蛋白激酶B信号的调控等。KEGG富集分析发现靶点参与了140条通路,主要涉及AGERAGE信号通路、HIF-1信号通路、PI3K-Akt信号通路等。根据度值筛选的核心靶点为AKT1、TNF、TP53、V...     

基于网络药理学研究抵当芪桂汤治疗糖尿病周围神经病变的潜在机制

目的 利用网络药理学及分子对接技术分析抵当芪桂汤治疗糖尿病周围神经病变的作用机制。方法通过TCMSP、HERB数据库筛选出抵当芪桂汤的有效成分;使用UniProt数据库下载相关基因靶点。通过GeneCards、OMIM、TTD、PharmGKB、DrugBank数据库筛选出糖尿病周围神经病变的基因靶点;取抵当芪桂汤药物成分与糖尿病周围神经病变的交集靶点,根据交集靶点进行基因本体（GO）功能及京都基因与基因组百科全书（KEGG）代谢通路分析;通过分子对接实验进行验证。结果 筛选得到抵当芪桂汤有效化合物123个,药物与疾病的交集靶点214个,通过网络图分析得到抵当芪桂汤治疗糖尿病周围神经病变有效药物成分为槲皮素（quercetin）、熊果酸（ursolic acid）、D-甘露醇（D-mannitol）、山柰酚（kaempferol）等,有效基因靶点为SRC、STAT3、MAPK3、PIK3CA、MAPK1和AKT1等,主要涉及通路为PI3K-AKT信号通路、脂质和动脉粥样硬化、MAPK信号通路、AGE-RAGE信号通路在糖尿病并发症、内分泌抵抗、HIF-1信号通路等;分子对接结果表明：槲...     

基于锦灯笼对白血病作用机制的网络药理学和分子对接技术的生物信息学分析

目的 基于网络药理学探讨锦灯笼（PCF）在白血病发生发展过程的作用,阐明其生物活性成分主要作用靶点和信号通路相关机制。 方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）数据库以“锦灯笼”为关键词检索其生物活性成分及对应的潜在靶点,并采用蛋白质数据库（PDB）和小分子药物靶点预测在线平台（Swiss Target Prediction）网站对其潜在靶点进行评估预测。采用GeneCards、OMIM和DrugBank数据库以“Leukemia”为关键词对相关靶点进行检索。利用Draw Veen Diagram在线软件将PCF生物活性成分靶点与白血病靶点交集,得到的交集靶点即为PCF作用于白血病的靶点;利用基因/蛋白相互作用检索搜查工具（STRING）数据库获取交集靶点蛋白的蛋白-蛋白互作（PPI）网络信息并进行可视化处理;采用注释可视化和集成发现数据库（DAVID）对交集基因进行基因本体（GO）生物功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路富集分析,并利用Cytoscape 3.7.2软件对PPI网络进行拓扑分析筛选核心靶点和核心活性成分,采用 AutoDock 和PyMol软件进行分子对接验证。 结果 对TCMSP数据库检索结果进行筛选后得到6个PCF活性成分,收集PCF与白血病的共同靶点29个。GO富集分析主要涉及造血或淋巴器官的发育、蛋白代谢调控和细胞凋亡等生物进程;KEGG信号通路富集分析主要包括癌症通路、肿瘤坏死因子 （TNF）和T细胞受体 （TCR） 等信号通路。拓扑网络分析得到蛋白激酶B1 （AKT1）、含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶3 （Caspase-3） 等10个核心靶点,结合KEGG信号通路筛选出核心活性成分谷甾醇和禾本甾醇。分子对接,PCF活性成分谷甾醇与原癌基因 JUN及禾本甾醇与AKT1和Caspase-3对接能均<－6.0 kcal·mol^－1,表明对接较好。 结论 PCF的主要活性成分谷甾醇和禾本甾醇可能通过调控JUN、AKT1和Caspase-3等基因参与癌症通路和TCR等信号通路,进而影响白血病的发生发展。     

木丹颗粒治疗气虚血瘀证糖尿病周围神经病变的分子机制研究

目的 基于病证结合的原则,运用网络药理学的方法分析木丹颗粒治疗气虚血瘀证糖尿病周围神经病变(Diabetic peripheral neuropathy, DPN)的分子机制,并通过分子对接和动物实验加以验证。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),中医药综合数据库(TCMID)获取木丹颗粒主要活性成分及其靶点,从SymMap数据库中收集气虚血瘀证11个中医症状相应的现代医学症状(MM Symptom)名称,采用人类基因数据库(GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)获取11个中医症状和DPN的相关靶点。利用STRING平台获取蛋白互作信息,DAVID 6.8数据库对交集靶点进行富集分析,随后基于分子对接验证关键活性成分与核心靶标的结合活性。通过蛋白质印迹法(Western Blot)检测小鼠坐骨神经组织中IL-6、ERK1/2、P38MAPK、PI3K以及AKT蛋白的表达,验证网络药理学对分子机制的预测。结果 木丹颗粒治疗气虚血瘀证DPN的主要活性成分有槲皮素、山柰酚、木犀草素等,PPI网络显示核心靶点有AKT1、ALB、IL-6、MAPK1等,“中...     

基于网络药理学和分子对接探讨灵芪胶囊治疗结直肠癌作用机制

目的 通过网络药理学和分子对接探讨灵芪胶囊(LQC)治疗结直肠癌(CRC)的分子作用机制。方法 从中药系统药理学数据库(TCMSP)获取LQC有效成分及靶蛋白数据,从OMIM、TTD、GeneCards数据库获取CRC相关靶点数据,比对得到交集靶点并用STRING数据库构建PPI网络,用Cytoscape软件构建LQC成分-靶点网络图。使用“NetworkAnalysis”插件分析网络拓扑参数并筛选核心基因,借助David6.8数据库对核心靶点进行基因本体论(GO)、京都基因组百科(KEGG)富集分析,结合THPA数据库分析核心基因的蛋白表达情况,再利用分子对接分析LQC与核心靶点的亲和力。结果 数据挖掘共获得LQC有效成分227种,对应382个潜在靶点。GO与KEGG功能富集分析结果主要涉及HIF-1、IL-17、肿瘤坏死因子等信号通路;TIMER数据库分析显示VEGFA、ESR1、SNAI1、PPARG、MMP9、PARP1、DNMT1、AR、IFNG、PGR、NFKB1表达在正常组织与CRC组织之间有显著差异,其中VEGFA、AKT1、PARP1在CRC组织中呈强阳性表达,分子对...     

基于网络药理学与分子对接探究银杏叶提取物治疗动脉粥样硬化的作用机制

目的 运用网络药理学及分子对接技术探究银杏叶提取物治疗动脉粥样硬化的作用机制。方法 在TCMSP平台筛选出银杏叶的活性成分,在Swiss Target Prediction数据平台和GeneCards数据库收集活性成分对应的靶点,在GeneCards和DisGeNET数据库检索“动脉粥样硬化”的相关靶点,通过Venny平台获得两者间的共同靶点。将共同靶点导入STRING数据库,利用Cytoscape 3.8.0构建蛋白互作网络和核心靶点网络,并获取拓扑参数。利用DAVID进行GO和KEGG通路富集分析,并对结果运用微生信和OmicShare平台进行图像可视化处理。采用Cytoscape 3.8.0软件进行“活性成分-靶点-疾病”网络模型构建与分析,最后使用AutoDock、Pymol软件进行重要成分和核心靶点的分子对接并预测其结合能力。结果 从银杏叶中筛选出27个活性成分,动脉粥样硬化和活性成分的共同靶点有163个,其中核心靶点有7个,主要有关通路有PPAR信号通路、TNF信号通路以及Proteoglycans in cancer信号通路等。分子对接结果显示,所有核心靶点与活性成分的分...     

基于网络药理学和实验验证探讨降糖通脉方治疗糖尿病肺损害的作用机制

目的 通过网络药理学挖掘降糖通脉方治疗糖尿病肺损害的可能活性成分及靶点,并在动物实验中验证降糖通脉方治疗糖尿病肺损害的作用和机制。方法 应用TCMSP数据库及BATMAN-TCM数据库检索降糖通脉方中的活性成分及靶基因,通过GeneCards数据库筛选得到肺损害的疾病靶点,通过GO生物功能分析、KEGG通路富集和Cytoscape 3.7.2软件构建药物-疾病-活性成分-信号通路互作网络图。观察降糖通脉方对糖尿病肺损害大鼠模型肺组织TGF-β1/Smads信号通路上的相关蛋白表达的影响,验证降糖通脉方治疗糖尿病肺损害的作用和机制。结果 降糖通脉方中共得到36个活性分子,作用靶点有109个,其中与糖尿病肺损害相关的作用靶点有95个,核心靶基因Smad2、Smad3、Smad7、Skil相关蛋白通过TGF-β1信号通路、AGE-RAGE信号通路以及TNF信号通路等干预糖尿病肺损害。动物实验表明,与模型组相比,降糖通脉方低、中、高剂量均能改善糖尿病肺损害,减少炎症细胞浸润,降低Smad2/3表达（P<0.01）,上调Smad7水平(P<0.05),增加SnoN蛋白表达(P<...     

基于网络药理学与分子对接探讨铁皮石斛抗炎性衰老的作用

目的 基于网络药理学、分子对接和动物实验探讨铁皮石斛抗炎性衰老的作用机制。方法 通过数据库ETCM、Pubchem、Swiss TargetPrediction获得石斛靶点,从Rat Genome Database网站下载衰老大鼠基因,应用STRING数据库构建PPI蛋白互作网络;利用DAVID数据库对石斛作用于老年大鼠的潜在靶点进行GO、KEGG通路分析;应用分子对接方法对石斛主要活性成分和关键作用靶点进行对接。老年大鼠灌胃石斛溶液10周后ELISA检测IL-6、IL-10蛋白表达。结果 筛选到主要活性成分齿叶黄皮素、吴茱萸碱、吴茱萸次碱、紫花前胡,关键靶点NOS3、STAT3、AKT1、GSK3B,主要信号通路PI3K-AKT、Calcium、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性、HIF-1、Apelin、VEGF,分子对接显示主要活性成分和关键靶点之间均能自发结合,且形成稳定的氢键。石斛中剂量组IL-6表达量较空白对照组（P <0.01）、低剂量组（P <0.01）和百令胶囊组（P <0.05）降低,低剂量组IL-10表达量较空白组（P <0.05）升高。结论 ...     

补肾化痰方治疗多囊卵巢综合征的作用机制：基于网络药理学和分子对接方法

目的 探究补肾化痰方治疗多囊卵巢综合征的主要活性成分、靶点、通路等药理学作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选出补肾化痰方中药物的主要活性成分,使用 PubChem和Swiss Target Prediction预测活性成分相关作用靶点;应用GeneCards、OMIM筛选治疗疾病多囊卵巢综合征的作用靶点;将药物靶点与疾病靶点通过Uniprot校正后,取交集靶点;结合STRING构建蛋白-蛋白互作（PPI）网络,并利用Cytoscape3.7.2中的CytoNCA插件对交集靶点进行PPI分析,筛选出核心靶点;采用DAVID数据库进行基因功能GO富集分析和KEGG通路富集分析;利用AutoDock对补肾化痰方中的核心活性成分和核心靶点进行分子对接验证。以动物实验进行验证,24只SPF级雌性C57BL/6J小鼠按随机数字表法分为3 组：对照组［n=8,1 mg/（kg?d）生理盐水灌服35 d］,模型组［n=8,1 mg/（kg?d）来曲唑溶于1%羧甲基纤维素（CMC）中,连续灌服35 d,并予高脂饲料喂养］,治疗组［n=8,造模后予以1 mg/（kg?d）补肾化痰方颗粒剂溶于5%生理盐水中,连续灌服35 d］。小鼠末次给药后,取卵巢组织于-80 ℃保存,Western blot法检测小鼠卵巢组织中核心靶点和核心通路的表达。结果 补肾化痰方中14味中药共筛选出125个潜在活性成分,990个药物靶点,4759个PCOS靶点,药物与PCOS交集靶点434个;核心活性成分主要为β-谷甾醇、山奈酚、槲皮素等,核心靶点主要为PIK3CA、PIK3R1、APP、AKT1、MAPK1等;GO功能富集主要包括药物反应、凋亡过程的负调控、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控等;KEGG富集通路主要包括癌症通路、HIF-1信号通路、Rap1信号通路、PI3K-Akt信号通路等;分子对接结果显示核心活性成分β-谷甾醇、山奈酚、槲皮素与核心靶点PIK3CA、PIK3R1、APP、AKT1、MAPK1均有强烈的结合能力;动物实验结果表明,补肾化痰方能明显改善多囊卵巢综合征相关症状,并下调PI3K,AKT蛋白表达,上调MAPK1蛋白表达,验证了网络药理学的部分预测结果。结论 揭示了补肾化痰方多成分、多靶点、多途径的作用特点,预测并通过实验初步验证了补肾化痰方治疗多囊卵巢综合征的可能作用机制。     

基于网络药理学预测白藜芦醇治疗溃疡性结肠炎靶点与分子机制

目的：运用网络药理学方法探寻白藜芦醇治疗溃疡性结肠炎的关键靶点及分子作用机制。方法：通过SwissTargetPrediction数据库查找白藜芦醇的作用靶点;采用GeneCards数据库搜索溃疡性结肠炎的相关蛋白。将白藜芦醇作用靶点和溃疡性结肠炎靶点取交集,即为白藜芦醇治疗溃疡性结肠炎潜在靶点。采用STRING数据库找出靶点的作用关系,使用Cytoscape 3.9.2软件筛选核心靶点。使用基因微生信网站进行GO与KEGG通路富集分析,以Cytoscape3.9.2软件构建“成分-靶点-通路”网络。使用SwissDock进行分子对接。结果：从SwissTargetPrediction得到69个白藜芦醇作用靶点,GeneCards数据库得到的533个溃疡性结肠炎相关靶点,两者取交集后共得到22个白藜芦醇抗溃疡性结肠炎的作用靶点。在蛋白相互作用网络中EGFR、SRC、MMP9、MMP2处于核心位置。在GO富集分析和KEGG通路分析中,EGFR、SRC、MMP9、MMP2均存在于内分泌抵抗、松弛素信号通路、雌激素信号通路中。分子对接结果显示,白藜芦醇与核心靶点均有较强的相互作用。结论：白藜...