基于网络药理学的射干麻黄汤治疗支气管哮喘的作用机制分析

目的:通过网络药理学的方法初步探讨射干麻黄汤治疗支气管哮喘的作用机制。方法:基于TCMSP、Pubchem、BATMAN-TCM数据库获取射干麻黄汤化学成分及其对应靶点,基于OMIM、Drugbank、Disgenet数据库获取支气管哮喘相关靶点,将药物靶点与疾病靶点映射得到的重复靶点视为射干麻黄汤作用于支气管哮喘的预测靶点,利用Cytoscape软件构建中药-靶点及蛋白相互作用网络(PPI),对PPI网络进行拓扑分析得到Hub蛋白,通过Reactome对预测靶点进行通路富集分析。结果:共获得95个化合物,219个射干麻黄汤验证靶点及513个预测靶点和224个支气管哮喘相关靶点,映射后获得54个射干麻黄汤作用于支气管哮喘的预测靶点,拓扑分析得到NR3C1、HPS90AA1、PARP1、TGFB1等9个Hub蛋白。Reactome信号通路共239条,其中14条显著富集,主要涉及免疫、信号转导、代谢3种生物途径。HPS90AA1、TGFB1、NFKB2、MMP9可能是射干麻黄汤作用于免疫性炎症通路的关键靶点,NR3C1、PGR可能是其治疗难治性哮喘的关键靶点。结论:本研究系统地探讨了射干麻黄汤治疗支气管哮喘的作用机制,为今后进一步实验验证提供了依据。     

基于网络药理学的小青龙汤治疗支气管哮喘作用机制分析

目的基于网络药理学方法探讨小青龙汤治疗支气管哮喘的作用机制。方法基于中药系统药理学技术平台(TCMSP)获取小青龙汤化学成分及其对应靶点,通过OMIM、Drugbank、Disgenet数据库获取哮喘相关靶点,将药物靶点与疾病靶点映射得到小青龙汤作用于哮喘的预测靶点。利用Cytoscape软件构建化合物-靶点网络及蛋白与蛋白相互作用网络,利用DAVID数据库分析预测靶点的基因百科全书(KEGG)信号通路。结果预测结果表明,小青龙汤作用于哮喘的有效成分有96个,靶点47个,关键有效成分包括槲皮素、山奈酚、麻黄碱等,关键靶点包括血管内皮生长因子A、肿瘤坏死因子、过氧化氢酶等。通路富集分析得到CGMP-PKG信号通路、NF-κB信号通路、TNF信号通路等7条信号通路。结论小青龙汤主要通过减轻气道炎症反应、抑制气道重塑和平滑肌收缩等发挥治疗哮喘的作用。     

基于网络药理学的射干麻黄汤对支气管哮喘的作用机制研究

目的:利用网络药理学方法探究射干麻黄汤治疗支气管哮喘(简称哮喘)的分子作用机制。方法:利用中药系统药理数据库和分析平台(Traditional Chinese Medicines Systems Pharmacology Platform,TCMSP)数据库筛选出射干麻黄汤的有效化合物及化合物作用靶点,从TTD数据库和CTD数据库中检索哮喘相关的靶点,将二者进行交集得到射干麻黄汤治疗哮喘的潜在作用靶点,利用在线服务器及软件分析出射干麻黄汤治疗哮喘的关键作用靶点,然后利用生物信息学手段分析关键作用靶点参与的生物学过程和信号通路信息。结果:经过筛选后得到射干麻黄汤有效化合物114个,这些化合物共作用于79个靶点,其中与哮喘相关的靶点有39个,再次筛选后得到12个射干麻黄汤治疗支气管哮喘的关键作用靶点。这些作用靶点参与机体平滑肌细胞增殖的阳性调控、炎症反应、蛋白激酶B信号阳性调节等100种生物学过程及调控磷脂酰肌醇3-激酶(Phosphatidylinositol-3-Kinases,PI3K)/蛋白质丝氨酸苏氨酸激酶(Protein-serine-threonine Kinase,AKT)信号通路、MAPK信号通路、缺氧诱导因子-1(hypoxia-inducible factor,HIF-1)等45条信号通路。结论:本研究通过网络药理学方法初步揭示了射干麻黄汤对支气管哮喘的作用机制,射干麻黄汤通过黄芩素、黄芩苷、酸枣仁皂苷、儿茶素、槲皮素等多种有效成分,参与机体免疫反应、炎症反应等生物学过程和调控多种信号通路,以“多成分、多靶点、多途径”的特点干预哮喘疾病的发生发展,为下一步对射干麻黄汤治疗支气管哮喘的基础研究提供参考依据。     

基于网络药理学探讨麻杏二三汤治疗支气管哮喘作用机制

目的：联合网络药理学数据库研究麻杏二三汤治疗支气管哮喘的作用机制。方法：运用传统中药系统药理学数据库和分析平台与有机小分子生物活性数据库获取麻黄、苦杏仁、陈皮、半夏、茯苓、紫苏子、莱菔子、白芥子、诃子、甘草的有效成分及对应靶点;从人类基因数据库和在线人类孟德尔遗传数据库获取支气管哮喘相关靶标,同时利用Venny 2.1在线网络获取交集基因;运用Cytoscape (Version3.7.2)和STRING数据库构建药物-成分-靶标-疾病网络图和蛋白质-蛋白质相互作用网络,进而运用cytoHubba插件鉴定出核心靶标。最后,运用Metascape数据库进行基因本体（GO）富集分析与京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：研究筛选得到麻杏二三汤治疗支气管哮喘的主要治疗靶标包括血管内皮生长因子A (VEGFA)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子（TNF）、禽肉瘤病毒17(JUN)、p53肿瘤蛋白（TP53）、信号转导及转录激活蛋白3 (STAT3)、促分裂素原活化蛋白激酶3 (MAPK3)、前列腺内过氧化物合成酶2 (PTGS2)、促分裂素原活化蛋白激酶1 (MAPK...     

基于网络药理学的射干-麻黄药对治疗支气管哮喘的分子机制探讨

目的:基于网络药理学分析射干-麻黄药对治疗支气管哮喘的有效活性成分,预测其作用靶点,并探讨其潜在作用机制。方法:用中药系统药理学数据库(TCMSP)平台收集射干-麻黄药对的活性成分及预测相应的作用靶点;采用STRING数据库与Cytoscape软件构建药物-活性成分-靶点网络和蛋白互作网络,通过Cluster Profiler和Clue GO对核心靶点的生物功能和代谢通路进行富集。最后把候选作用靶点映射在京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路图上进行分析。结果:通过口服生物利用度(OB)和类药性(DL)两个参数筛选得到38个有效活性成分,包括木犀草素(luteolin),豆甾醇(stigmasterol),香木叶素(diosmetin),柚皮素(naringenin),槲皮素(quercetin),鸢尾甲黄素A(iristectorigenin A),异鼠李素(isorhamnetin)等,与疾病相关的候选作用靶点共214个,该文首要分析核心靶点55个,包括RAC-α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(Akt1),肿瘤坏死因子(TNF),分裂原活化蛋白激酶1(MAPK1),血管内皮生长因子A(VEGFA),白细胞介素-10(IL-10),核转录因子-κB抑制因子α(NFKBIA)等,并富集得到多条相关的基因本体(GO)功能和KEGG通路。结论:射干-麻黄药对可能是通过调控Th1和Th2,Th17等细胞分化,Asthma,IL-17,磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/Akt,MAPK,NF-κB,VEGF等信号通路,干预细胞代谢的多个过程,抑制促炎因子的基因表达,发挥治疗支气管哮喘的作用。     

基于网络药理学探讨射干-麻黄治疗哮喘的机制

目的基于网络药理学探讨射干-麻黄治疗哮喘的机制。方法收集刘小虹教授门诊病例,并使用古今医案云平台分析得出最常用射干-麻黄药对,利用TCMSP、Drug bank、TTD等数据库查找射干-麻黄药对化合物及治疗哮喘的作用靶点,通过Draw Venn Diagram软件取化合物靶点与哮喘靶点交集,使用String 11. 0平台分析蛋白相互作用网络,最后进行GO分析和KEGG通路分析。结果共有40个化合物作用于15个哮喘靶点,主要涉及PTGER3、CHRM4、SERPINE1、ADRA2C等;GO分析主要涉及IL-4和IL-13信号传导、钙信号通路等;KEGG信号通路共8条,包括神经活性配体-受体相互作用、调节脂肪细胞中的脂肪分解、c AMP信号通路、HIF-1信号通路等。结论射干-麻黄通过调节IL-4和IL-13信号传导、钙信号通路、c AMP信号通路、HIF-1信号通路等通路,从而起到治疗哮喘的作用。     

基于网络药理学探讨补肾益气方治疗支气管哮喘的作用机制

目的?采用网络药理学方法探讨补肾益气方治疗支气管哮喘的物质基础和作用机制。方法 采用中药系统药理数据库和分析平台（TCMSP）结合文献检索获取补肾益气方的有效成分,并结合UniProt知识库得到对应的靶点信息。利用OMIM、DrugBank、TTD和Genecards数据库挖掘哮喘相关靶点。通过Cytoscape3.7.1软件构建补肾益气方有效成分-靶点及哮喘-靶点网络,绘制维恩图以获得重叠靶点。利用String平台构建重叠靶点的蛋白相互作用网络,通过Cytoscape的Cytohubba模块依据度值获得核心靶点。使用Metascape数据库,对所获靶点进行富集分析。结果?筛选到黄芪17种有效成分及209个潜在靶点,淫羊藿23种有效成分及222个潜在靶点,生地黄2种有效成分及31个潜在靶点,综合分析得到237个补肾益气方有效成分的相关靶点,并同时筛选到930个哮喘相关靶点,匹配到103个重叠靶点。通过生物信息学分析,定位到20个核心靶点,进一步富集分析发现其发挥作用可能涉及白细胞介素-17（IL-17）、肿瘤坏死因子（TNF）、Toll样受体、NF-κB、NOD样受体、MAPK、PI3K-Akt等信号通路。结论?补肾益气方中槲皮素、山柰酚、刺芒柄花素、淫羊藿苷、淫羊藿素、谷甾醇、豆甾醇等成分可能是治疗哮喘的物质基础,与调节炎症反应、T细胞分化、氧化应激、平滑肌细胞增殖等机制有关。     

基于网络药理学探讨玉屏风散治疗支气管哮喘的作用机制

目的:运用网络药理学筛选玉屏风散治疗支气管哮喘的作用靶标及信号通路,为临床治疗提供有力依据.方法:利用TCMSP筛选中药活性成分和有效成分靶点信息.利用Uniprot数据库和Excel找出有效成分靶点信息基因名.在GeneCards、OMIM、Drugbank数据库搜集疾病相关靶标,采用Venny软件对中药靶点基因与疾...     

基于网络药理学探讨固本平喘剂治疗支气管哮喘的作用机制

目的：基于网络药理学方法筛选固本平喘剂(补骨脂、地龙、防风)中的主要活性成分,探讨其治疗支气管哮喘的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库TCMSP数据库、中药与化学成分数据库,筛选固本平喘剂的活性成分及靶标。利用Genecards、OMIM数据库获得支气管哮喘的潜在靶标基因。将两者靶基因进行映射后通过Cytoscape3.6.1软件构建“成分-靶标”网络、结合String数据库构建蛋白质相互作用网络扩充核心靶点。依托功能注释生物信息学分析平台DAVID数据库对固本平喘剂的作用靶点进行基因本体(gene ontology, GO)生物学过程和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)通路富集注释分析,通过Autodock vina软件进行分子对接以验证结果。结果：符合筛选条件的共有53个活性成分,补骨脂18个,地龙17个,防风18个,筛选得到固本平喘剂关键成分,包括补骨脂黄酮类、补骨脂查耳酮类、汉黄芩素、补骨脂酚、β-谷甾醇等;通过GenCards、OMIM数据库剔除重复后,共收集支气管哮喘潜在靶点2 358个。将固本...     

基于网络药理学探讨白果治疗哮喘作用机制

目的 基于网络药理学探讨白果治疗哮喘作用机制.方法 基于TCMSP数据库获取白果化学成分及其对应靶点,基于OMIM、Gene Cards数据库获取哮喘相关靶点,利用Venny2.1绘制白果靶点与哮喘疾病靶点的韦恩图,利用Cytoscape3.6.1软件构建中药-靶点网络及应用STRING平台构建蛋白相互作用网络(PPI...     

基于网络药理学的地龙平喘作用机制研究

目的 基于网络药理学方法研究地龙平喘的作用机制。方法 通过中国知网（CNKI）数据库、百链数据库、PubMed数据库文献检索和SwissADME平台筛选获得地龙活性化合物;通过SwissTargetPrediction预测活性成分的潜在靶点,并与OMIM、DrugBank数据库中哮喘的疾病靶点数据进行比对,获得地龙平喘的作用靶点;通过STRING 11.0平台分析靶点的蛋白质相互作用网络;通过Matascape数据库对地龙平喘靶点进行基因本体（GO）分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;采用Cytoscape 3.7.1软件构建成分-靶点-通路网络;通过豚鼠离体气管平滑肌诱导收缩实验验证地龙提取物对胆碱能受体兴奋引起的气管平滑肌收缩的抑制作用。结果 共收集地龙平喘活性成分56个,包括氨基酸、脂肪酸、核苷酸等,预测其作用靶点包括前列腺素G/H合酶2、毒蕈碱型乙酰胆碱受体家族、β₂-肾上腺素受体等67个,潜在调控花生四烯酸代谢、胆碱能神经突触信号、色氨酸代谢等通路和生物过程。验证实验结果表明,地龙提取物对胆碱能受体兴奋引起的离体气管平滑肌收缩有明显的舒张作用。结论 地龙的平喘作用具有多成分、多靶点、多途径作用的特点,为地龙平喘作用机制的进一步研究提供了参考。     

基于网络药理学探讨乌梅治疗哮喘的作用机制

目的基于网络药理学方法,探讨乌梅治疗哮喘的作用机制。方法运用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)检索乌梅的活性成分和靶标蛋白。运用治疗靶点数据库(TTD)检索哮喘的靶标蛋白。通过Cytoscape软件对二者的靶标蛋白进行交集,得到交集靶标蛋白并在Unitprot数据库查询交集靶标蛋白的基因名称。将交集靶标蛋白输入STRING数据库中构建蛋白相互作用网络。使用DAVID在线分析工具对交集靶标蛋白基因进行GO富集及KEGG通路富集分析。结果从乌梅中筛选出8种活性成分,涉及哮喘的靶标有14个。其治疗机制可能与神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路、脂肪细胞脂解的调控、cAMP信号通路、利什曼病、胆碱能突触、TNF信号通路、弓形虫病有关。结论乌梅治疗哮喘涉及多种黄酮类、甾醇类化合物,可能与肾上腺素受体、肿瘤坏死因子、趋化因子、白三烯等有关,并涉及神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路等通路。     

基于网络药理学的丹参治疗哮喘作用机制初探

目的 运用网络药理学方法探讨丹参治疗哮喘的作用靶点及通路。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）获取丹参活性成分及潜在靶点;应用OMIM、GeneCards、TTD、DrugBank和DisGeNET数据库收集哮喘靶点,利用R语言获得丹参治疗哮喘的作用靶点,依据STRING 11.0数据库获取蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络;在Metascape平台进行京都基因与基因组百科全书（KEGG）和基因本体（GO）分析,运用Cytoscape 3.5.1软件构建丹参治疗哮喘的成分-靶点-通路网络,并筛选核心靶点,采用MOE 2019软件对重要化合物进行分子对接验证。结果 筛选得到丹参治疗哮喘的59个化学成分、108个靶点及20条关键通路。其中,隐丹参酮主要通过肿瘤坏死因子（TNF）、Toll样受体4（TLR4）等蛋白抑制核转录因子-κB（NF-κB）通路,减轻哮喘气道炎症;丹参酮Ⅱ_A主要通过核转录因子-κB抑制剂α（NFKBIA）等减弱TNF-α和NF-κB表达,抑制NF-κB通路,减轻炎症损伤;木犀草素主要通过蛋白激酶B1（Akt1）、白细胞介素-6（IL-6）和信号传导与转录激活因子3（STAT3）等介导磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）-Akt和Janus激酶-信号转导子与转录激活因子（JAK-STAT）通路,通过缓解气道炎症、改善气道重塑和免疫调节治疗哮喘。分子对接显示,三者与疾病靶点生物亲和力高。结论 丹参可以通过多成分、多靶点、多途径发挥治疗哮喘的作用。     

基于网络药理学探索射麻止喘液治疗哮喘的作用机制

目的:运用网络药理学探讨射麻止喘液治疗哮喘的潜在机制。方法:利用中药分子机制的生物信息学分析工具、中药系统药理数据库和分析平台查找射麻止喘液的成分及其靶点,从比较毒理基因组学数据库(CTD)获取与哮喘相关的基因;将射麻止喘液-基因和哮喘-基因的数据集导入Draw Venn Diagram进行交集分析,得出射麻止喘液-哮喘-基因数据集;使用String 11. 0进行射麻止喘液-哮喘-基因数据集的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,运用Cytoscape 3. 6. 1进行可视化,用其插件MCODE分析重要模块;采用DAVID 6. 8分析射麻止喘液-哮喘-基因的通路富集和生物学过程。结果:获得射麻止喘液399个化合物与2 099个潜在的靶点;同时检索出98个与哮喘相关靶点;应用交集和PPI分析筛选出45个共同基因和关键基因16个,包括转化生长因子-β_1,血红素氧合酶-1,白细胞介素-4等;富集分析显示射麻止喘液和哮喘的共同生物学过程与炎症反应、气道的收缩与重塑、细胞增殖与凋亡等相关,共同生物学通路包括肿瘤坏死因子信号通路、免疫球蛋白E(IgE)的高亲和力受体信号通路、核转录因子-κB信号通路、核苷酸结合寡聚化结构域样受体信号通路等。结论:射麻止喘液是通过多靶点、多通路治疗哮喘,可为其深入研究和临床应用提供参考。     

血脂异常的分子机制研究＊

目的 基于网络药理学方法分析枳术丸治疗血脂异常的药理机制，为新药研发及经典方剂临床拓展运用提供参考。方法 通过TCMSP（Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform）数据库获取白术、枳实、荷叶的主要化学成分及其靶点，根据ADME筛选中药活性组分；通过Gencards、OMIM、TTD、DRUGBANK数据库获取血脂异常主要靶点，利用String平台进行蛋白质相互作用分析，构建PPI网络并挖掘网络中潜在的蛋白质功能模块。采用Metascape平台分析“药物-成分-靶点”及其参与的生物过程及通路，而后采用Cytoscape3.7.1软件构建“枳术丸成分-血脂异常靶点-通路”网络，最后通过Systems Dock Web Site进行分子对接验证。结果 枳术丸调治血脂异常的核心活性成分为槲皮素、山柰酚、木犀草素、柚皮素等，核心靶点有ESR1、NOS2、ESR2、PPARG、PTGS2、PTGS1、MAPK14、ACHE、ADRB2、F7等，分子对接验证亦显示评分大于4.25者占总数85%,大于5者占63.6%，即大部分靶点与成分的结合活性较好。枳术丸调治血脂异常的生物学通路主要作用于AGE-RAGE信号通路、HIF-1信号通路以及脂肪细胞中脂肪分解等通路，其功能主要为调节细胞内类固醇受体的生命活动等。结论 本研究初步揭示了枳术丸调治血脂异常的多成分、多靶点、多通路的作用机制，为枳术丸的临床开发利用提供基础。     

基于网络药理学及质谱技术的葶苈大枣泻肺汤抗心力衰竭的有效成分发现及作用机制分析

目的:基于网络药理学、高分辨质谱及分子对接技术探讨葶苈大枣泻肺汤治疗心力衰竭(简称心衰)的有效成分及作用机制.方法:通过文献查阅并结合BATMAN-TCM数据库对葶苈大枣泻肺汤中两味中药成分及药物靶标进行检索;以“heart failure”作为关键词,利用GeneCards数据库,对心衰疾病的靶标进行搜集;基于药物与...     

基于网络药理学和生物信息学筛选小青龙汤治疗支气管哮喘的关键基因和通路

目的:运用网络药理学与生物信息学方法构建疾病-基因-靶点-成分-药物网络以探索小青龙汤治疗支气管哮喘的关键基因和信号通路.方法:基于高通量基因表达(GEO)数据库筛选哮喘与健康人差异基因,通过TCMSP数据库检索小青龙汤中药物活性成分,筛选疾病基因和药物成分靶点作为交集基因,采用R语言,Cytoscape3.7.2...     

基于网络药理学探寻淫羊藿治疗哮喘的关键靶标及作用机制

目的:基于网络药理学与分子对接方法,系统挖掘淫羊藿治疗哮喘的关键靶标及作用机制.方法:利用多种数据库寻找淫羊藿的活性成分与作用靶标,建立预测模型并利用分子对接技术对靶标进行筛选与验证;查找疾病数据库得到哮喘相关靶标;构建靶标互作网络筛选关键靶标;利用数据库进行GO功能富集分析与KE GG通路富集分析;构建生物网络并进行...     

荆芥-防风药对治疗荨麻疹作用机制的网络药理学研究

目的基于网络药理学方法探讨荆芥-防风药对治疗荨麻疹的作用机制。方法通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索荆芥、防风的化学成分和作用靶点,运用UniProt数据库查询靶点对应的基因,以Cytoscape 3.7.1软件构建化合物-靶点(基因)网络。借助OMIM、Digsee、TTD等数据库查询荨麻疹相关的基因,运用Venny 2.1.0筛选出荆芥-防风与荨麻疹的交集基因,并将筛选出的核心靶标蛋白导入STRING在线网站数据库,获取蛋白相互作用关系。运用DAVID数据库进行基因本体(GO)功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果化合物-靶点网络包含26个化合物和208个相应靶点,关键靶点涉及前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、二肽激肽酶4(DPP4)、凝血因子Ⅱ(F2)、热休克蛋白HSP90α(HSP90AA1)、前列腺素内过氧化物合酶1(PTGS1)等。荆芥-防风与荨麻疹蛋白质相互作用网络包含18个蛋白,关键蛋白涉及白介素2(IL2)、干扰素γ(IFNG)、白介素4(IL4)等。GO分析得到GO条目16个(靶点基因富集度>55%),其中生物过程(BP)条目13个,细胞组分(CC)条目3个;KEGG分析得到17条信号通路(P<0.05)。结论荆芥-防风药对可能通过RAC-α丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶(AKT1)、IL4、白介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)等靶点调节炎症细胞因子,并调控FCεRI信号通路、T细胞受体信号通路、Jak-STAT信号通路等发挥治疗荨麻疹的作用。