TIM-3基因启动子区-1516G/T(Rs10053538)和外显子区-882C/T(Rs4704853),-574T/G(Rs1051746)位点多态性与蒙古族儿童哮喘的关系研究

目的探讨哮喘免疫调节基因T细胞免疫球蛋白黏蛋白域3(Tim-3)启动子区多态性位点-1516G/T(Rs10053538)和外显子区多态性位点-882C/T(Rs4704853),-574T/G(Rs1051746)与内蒙古地区蒙古族儿童哮喘的遗传易感性。方法收集赤峰市蒙医中医医院和红山区妇幼保健所2014年6月~2016年12月哮喘组儿童129例,平均年龄6.2岁;正常体检对照组儿童130例,平均年龄6.0岁。采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)检测所有研究对象的三个多态性位点的基因型,进行病例对照研究分析。结果哮喘组-574T/G(Rs1051746)位点基因多态性的T等位基因明显高于对照组,差异有统计学意义(OR=0.239,95%CI 0.067~0.858,P0.05)。哮喘组Tim-3启动子区-1516G/T(Rs10053538)位点基因多态性与对照组比较OR=0.835,95%CI 0.371~1.883,P=0.664;哮喘组外显子-882C/T(Rs4704853)位点基因多态性与对照组比较,差异无统计学意义(OR=0.326,95%CI0.33~3.172,P=0.310)。结论Tim-3基因-574T/G(Rs1051746)位点与蒙古族儿童哮喘易感性相关,为内蒙古地区儿童哮喘的发病机制研究提供参考。     

TIM-3基因启动子区-1516G/TRs153538和外显子区-882C/TRs474853,-574T/GRs151746位点多态性与蒙古族儿童哮喘的关系研究

目的 探讨哮喘免疫调节基因T细胞免疫球蛋白黏蛋白域3(Tim-3)启动子区多态性位点-1516G/T(Rs10053538)和外显子区多态性位点-882C/T(Rs4704853),-574T/G(Rs1051746)与内蒙古地区蒙古族儿童哮喘的遗传易感性。方法收集赤峰市蒙医中医医院和红山区妇幼保健所2014年6月～2016年12月哮喘组儿童129例,平均年龄6.2岁; 正常体检对照组儿童130例,平均年龄6.0岁。采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)检测所有研究对象的三个多态性位点的基因型,进行病例对照研究分析。结果 哮喘组-574T/G(Rs1051746)位点基因多态性的T等位基因明显高于对照组,差异有统计学意义(OR=0.239,95%CI 0.067～0.858,P<0.05)。哮喘组Tim-3启动子区-1516G/T(Rs10053538)位点基因多态性与对照组比较OR=0.835,95%CI 0.371～1.883,P=0.664; 哮喘组外显子-882C/T(Rs4704853)位点基因多态性与对照组比较,差异无统计学意义(OR=0.326,95%CI0.33～3.172,P=0.310)。结论 Tim-3基因-574T/G(Rs1051746)位点与蒙古族儿童哮喘易感性相关,为内蒙古地区儿童哮喘的发病机制研究提供参考。     

云南汉族人群Tim-1基因多态性与系统性红斑狼疮关联性研究

目的探讨Tim-1启动子区-416G〉C和-1454G〉A位点基因多态性与云南高原地区汉族人群系统性红斑狼疮（SLE）的遗传易感性有无关联。方法采用PCR-RFLP方法对132名云南汉族SLE病人和120名健康体检者Tim-1启动子区多态性位点-416G〉C和-1454G〉A的基因多态性进行检测,同时采用间接免疫荧光法检测其抗双链DNA抗体、抗Sm抗体、抗RNP抗体三种自身抗体。结果 SLE组和对照组Tim-1启动子区多态性位点-416G〉C的基因型及等位基因频率差异均无统计学意义（P〉0.05）,而-1454G〉A位点的基因型及等位基因频率在SLE组与对照组中的差异均有统计学意义（P〈0.05）;SLE组和对照组三种SLE相关自身抗体检测阳性率差异有统计学意义（P〈0.05）;SLE组两个位点不同基因型中三种自身抗体检测阳性率的差异均无统计学意义（P〉0.05）。结论云南汉族人群Tim-1启动子区-416G〉C和-1454G〉A位点存在单核苷酸多态性变异,且-1454G〉A位点多态性变异与SLE遗传易感性相关,但两位点不同基因型不会影响SLE相关自身抗体的表达。     

江苏宿迁地区汉族人群DNMT3B基因启动子区-149C>T和-579G>T多态性与食管癌易感性的分析

目的 分析江苏宿迁地区汉族人群DNA甲基转移酶3B(DNMT3B)基因启动子区-149C>T和-579G>T单核苷酸多态性(SNP)与食管癌(EC)易感性的关系。方法 利用限制性片段长度多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)技术分析246例食管癌患者及240例健康对照者的DNMT3B启动子区-149C>T和-579G>T位点的基因型。结果 在-149C>T位点中,食管癌组和对照组的基因型TT与CT比较差异无统计学意义(χ2=0.089,P>0.05)。在-579G>T位点中,食管癌组和对照组的基因型TT与GT+GG比较差异无统计学意义(χ2=0.649,P>0.05)。在年龄和性别分组中,两位点在食管癌组和对照组间基因型频率差异均无统计学意义(χ2=0.044～0.876,P值均>0.05)。结论 DNMT3B基因启动子区-149C>T和-579G>T与食管癌遗传易感性无相关性。     

云南汉族人群Tim-3启动子区-1516G>T位点多态性与系统性红斑狼疮关联性研究

目的探讨T细胞免疫球蛋白域和黏蛋白域蛋白(Tim)-3启动子区-1516GT位点基因多态性与云南高原地区汉族人群系统性红斑狼疮(SLE)的遗传易感性及其相关自身抗体的表达有无关联。方法采用限制性片段长度多态性聚合酶链反应方法对132例云南汉族SLE患者和120例健康体检者Tim-3启动子区多态性位点-1516GT的基因多态性进行检测,同时采用间接免疫荧光法和线性免疫印迹法检测其双链DNA抗体、Sm抗体、核糖核蛋白抗体三种自身抗体。采用直接计数法计算基因型和等位基因频率,进行Hardy-Weinberg平衡检验,基因型和等位基因频率的组间比较、各自身抗体和基因型的相关性比较均采用χ2检验。结果云南汉族人群Tim-3启动子区多态性位点-1516GT的基因型GG、GT、TT在SLE组频率为:0.818 2、0.181 8、0.0000,在对照组频率为:0.916 7、0.075 0、0.008 3,其基因型和等位基因频率在两组间差异有统计学意义(P0.05)。结论云南汉族人群Tim-3启动子区-1516位点存在单核苷酸多态性变异,且其多态性变异与系统性红斑狼疮遗传易感性相关,但其不同基因型可能不会影响SLE相关自身抗体的表达。     

IL-6基因启动子区域-572C>G和-174G>C多态性与江苏宿迁汉族人群冠心病的相关性

目的 探讨白细胞介素6(interleukin-6,IL-6)基因启动子区域-572C>G和-174G>C基因多态性与宿迁汉族人群冠心病(coronary heart disease,CHD)的关系。方法 参考2010卫生部CHD诊断标准(WS319-2010),选择2017年1～12月在宿迁市第一人民医院心内科确诊的CHD患者,应用聚合酶链-限制性片段长度多态性(Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)方法检测266例CHD患者和192例体检健康人群(对照组),分析其IL-6-572C>G和IL-6-174G>C基因多态性,并进行Hardy-Weinberg平衡检验,检测血糖、血脂等生化指标。结果 IL-6-572C>G基因型和等位基因频率在两组间分布差异有统计学意义(χ2=11.1,19.5,22.4,均P<0.05),CHD组GG型和CG型OR值分别是CC型的4.88倍(95%CI:2.31～10.31)和1.96倍(95% CI:1.32～2.91); -174G>C基因型和等位基因频率在两组间分布差异无统计学意义(χ2=0.024,0.027,均P>0.05)。结论 IL-6-572G等位基因可能是宿迁汉族CHD的易感基因,IL-6-174G>C基因多态性可能与宿迁汉族人群CHD没有相关性。     

云南汉族人群Tim-1外显子4上5509-5511delCAA基因多态性与类风湿关节炎关联性研究

目的探讨T细胞免疫球蛋白域黏蛋白域蛋白(Tim)-1外显子4上的5509-5511delCAA基因多态性与云南高原地区汉族人群类风湿关节炎(RA)的遗传易感性有无关联。方法采用PCR-DNA测序法对196例云南汉族RA患者和190例健康体检者Tim-1外显子4上的5509-5511delCAA基因多态性进行检测,同时采用ELISA法和间接免疫荧光法检测其类风湿因子(RF)、抗环瓜氨酸肽(CCP)、抗角蛋白抗体(AKA)3种自身抗体。结果 RA组和对照组Tim-1外显子4上多态性位点5509-5511delCAA的基因型及等位基因频率差异有统计学意义(P0.05);RA组Tim-1外显子4上5509-5511delCAA位点不同基因型中3种自身抗体,RF、CCP阳性率检测的差异无统计学意义(P0.05),而AKA阳性率检测的差异有统计学意义(P0.05)。结论云南汉族人群Tim-1外显子4上的5509-5511delCAA位点存在多态性变异,且其多态性变异与RA遗传易感性相关,其不同基因型不会影响RA相关自身抗体RF、CCP的表达,而对AKA的表达有影响。     

青岛地区哮喘患者IL-6基因启动子-634C/G位点多态性研究

目的:了解白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)基因启动子区域单核苷酸多态位点-634C/G与青岛地区汉族人群过敏性哮喘的相关性.方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析方法对青岛地区479例健康个体和481例过敏性哮喘患者IL-6基因启动子-634C/G多态性进行观察.结果:过敏性哮喘组与健康对照组CC、CG和GG基因型以及C和G等位基因频率分布均无统计学差异,携带GG、CG、CC基因型个体哮喘患病风险依次递增.结论:IL-6基因启动子-634C/G位点多态性与青岛地区人群过敏性哮喘发生无相关性,但携带CC等位基因型的个体过敏性哮喘的发病风险可能增加.     

儿童哮喘与白三烯受体1及C4合成酶基因多态性的关系

目的探讨白三烯受体1(CYSLTR1)和白三烯C4合成酶(LTC4S)基因多态性与上海儿童哮喘及其严重程度之间的关系。方法 2006年9月至2009年8月本院儿科住院及门诊儿童哮喘患者72例,男39例,女33例,平均年龄(5.1 1.6)岁。根据哮喘发作程度分为间歇和轻度发作组44例、中重度发作组28例。健康对照组成人95例,男50例,女45例。应用连接酶检测反应(LDR)技术,对CYSLTR1的927T/C位点和LTC4S的444A/C位点基因多态性进行分析。结果①哮喘组和对照组927T/C位点基因型、等位基因频率比较(χ2=0.178,0.04,P(0.05)、444A/C位点基因型、等位基因频率比较(χ2=1.14,1.065,P(0.05)差异均无统计学意义。②927T/C和444A/C位点基因型频率在哮喘各组中的分布比较(χ2=0.927,1.138,P(0.05)差异均无统计学意义。结论在上海哮喘儿童中,CYSLTR1的927T/C位点和LTC4S的444A/C位点基因多态性可能不是其发病和严重程度的主要基因危险因素。     

CD40-1C/T基因多态性与儿童哮喘的相关性分析

目的 研究CD40基因5′非翻译区-1位点C/T多态性在本地区哮喘儿童人群中的分布,探讨其与哮喘发病风险之间的关系.方法 以134例哮喘患者作为研究对象,儿童门诊健康体检者113名作为对照组.应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测哮喘组和对照组CD40-1C/T位点的基因型及等位基因频率;采用免疫比浊法测定血清总IgE水平.分析该基因多态性与儿童哮喘发病风险及IgE水平之间的关系.结果 哮喘组和对照组之间C与T等位基因频率分布差异无统计学意义(P>0.05);CC基因型与CT+TT基因型之间的分布差异有统计学意义(P<0.05),CC基因型的发病风险是CT+TT基因型的1.75倍[95%可信区间(CI):1.01~3.04].哮喘组IgE水平在CC与CT、TT基因型间差异有统计学意义(P<0.05).结论 CD40基因5′非翻译区-1位点CC基因型可能与本地区儿童哮喘的发生有关.     

2型糖尿病患者IL-18基因启动子区-607C/A和-137G/C位点多态性与颈动脉粥样硬化的相关性研究

目的 探讨2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)患者IL-18基因启动子区-607C/A和-137G/C位点多态性与颈动脉粥样硬化(carotid atherosclerosis,CAS)的相关性研究.方法 收集2018年1月～2019年12月宝鸡市中心医院收治的375例T2DM患者为...     

组织蛋白酶B基因启动子多态性与急性心肌梗死发病的关系

目的探讨急性心肌梗死(AMI)与组织蛋白酶B(CTSB)基因启动区rs1293312 T/C位点单核苷酸多态性(SNP)之间的关系及其相关危险因素。 方法采用病例-对照研究方法,选择2021年1月至12月于济宁医学院附属医院心内科住院的201例AMI患者(AMI组)和同期体检中心健康体检者204例(对照组);应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RELP)结合DNA测序后的序列比对进行数据统计;运用Hardy-Weinberg平衡检验后,应用χ²检验进行相关分析;利用多因素Logistic回归对多种危险因素以及该SNP位点与AMI发病进行关联性分析;利用SNPinfo数据库预测该SNP位点所影响的转录因子结合位点。 结果两组rs1293312 T/C位点SNP位点分别检测出3种基因型为CC、TC和TT,其基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(χ²＝0.57,1.68;均P>0.05)。CC、TC、TT基因型在AMI组[34(16.92%)、91(45.27%)、76(37.81%)]和对照组[37(18.14%)、89(43.63%)、78(38.23%)]间,以及C、T等位基因在AMI组[159(39.55%)、243(60.45%)]和对照组[163(39.95%)、245(60.05%)]间比较,均差异无统计学意义(χ²＝0.15,0.01;均P>0.05)。在5种不同遗传模式下进行Logistic回归分析发现,该SNP位点与AMI发病无关联性(均P>0.05)。 结论CTSB基因启动区rs1293312 T/C与AMI发病无关,但提供了CTSB基因启动区多态性的群体遗传学资料。     

DNMT3B基因启动子区-579G>T多态性与江苏宿迁地区人群胃癌易感性的分析

目的分析DNA甲基转移酶3B(DNMT3B)基因启动子区-579GT单核苷酸多态性(SNP)与江苏宿迁地区汉族人群胃癌(GC)易感性的关系。方法病例组为233例胃癌患者,对照组为208例体检健康者。提取外周血基因组DNA,利用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术检测DNMT3B启动子区-579GT位点的基因频率分布。结果 TT基因型与GT+GG基因型频率在胃癌组和对照组中差异有统计学意义(χ~2=6.517,P0.05)。按年龄分组后,年龄≥60岁的胃癌组和对照组人群间比较,TT与GT+GG基因型频率差异有统计学意义(χ~2=4.728,P0.05)。按性别分组后,2组间基因型频率差异均无统计学意义(χ~2=3.541,P0.05;χ~2=3.676,P0.05)。结论 DNMT3B-579GT与胃癌的遗传易感性有关联,可作为胃癌遗传易感性风险因素。     

5岁以下喘息患儿ADRβ2、ORMDL3基因SNP与API的相关性研究

目的 探讨肾上腺素能受体β2（ADRβ2）、血清类黏蛋白1样蛋白3（ORMDL3）基因单核苷酸多态性（SNP）与哮喘预测指数（API）阳性婴幼儿喘息的相关性。方法 将124例5岁以下喘息患儿分为API阳性组（66例）与API阴性组（58例）。选取儿童哮喘易感基因 SNP位点：ADRβ2 R16G、ORMDL3 rs12603332,采用 TaqMan 探针法对2组患儿进行基因分型,分别比较上述SNP位点在2组间的分布差异。结果 ORMDL3 rs12603332基因型在API阳性组与API阴性组之间的分布差异无统计学意义（² = 2.524,P > 0.05）。ADRβ2 R16G基因型在API阳性组以AA占比最高,AG次之,GG最少;在API阴性组以AG占比最高,GG次之,AA最少;API阳性组AA占比高于API阴性组（² = 25.358,P < 0.05）。ADRβ2基因型AG和GG是API阳性的保护因素,与AA比较,AG、GG是API阳性的概率分别为18.8%和6.4%。结论 ADRβ2 R16G基因型分布在API 阳性与阴性的5岁以下喘息患儿中存在差异,携带基因型AA 的喘息患儿或更具进展为哮喘的危险性。ADRβ2或可联合 API 作为预测儿童哮喘的临床指标。ORMDL3 rs12603332基因型或与API预测哮喘发生无一致性。     

育龄妇女亚甲基四氢叶酸还原酶~MTHFR基因C677T，A1298C位点多态性与HR-HPV感染的相关性研究

目的　探讨育龄妇女亚甲基四氢叶酸还原酶（MTHFR）C677T,A1298C基因多态性与高危型人乳头瘤病毒（HR-HPV）感染的相关性。方法　收集2017年11月～2019年12月期间来天津市宝坻区人民医院孕检的育龄妇女所做HR-HPV及 MTHFR 多态性（包括C677T和A1298C）检测的样本资料共1 130例,比较MTHFR各代谢型之间HR-HPV的阳性率。结果　在MTHFR的三种代谢型中,弱代谢型是HR-HPV优势型别52型（χ2=4.764,P=0.029,OR=1.771,95%CI:1.054~2.975）、16型（χ2=4.304,P=0.038,OR=1.922,95%CI:1.027~3.599）及多重感染（χ2=3.985,P=0.046,OR=1.479,95%CI:1.005~2.176）的易感型别。结论　MTHFR 代谢活性受C677T和A1298C位点基因的双重影响,其中的弱代谢型是HR-HPV优势型别52型和16型,以及多重感染的易感型别。     

Endothelin receptor A -231 G>A polymorphism: no linkage to primary pediatric headache

OBJECTIVE: To assess whether the biallelic -231 G>A polymorphism of the endothelin type A receptor (EDNRA) gene, previously shown to be a marker of increased risk for developing migraine, has a role in the susceptibility to primary pediatric headache. BACKGROUND: Several studies suggest that endothelin has a role in migraine. A recent association study has shown that the biallelic -231 G>A polymorphism of the EDNRA gene is associated to migraine in an elderly population. METHODS: A total of 126 consecutive unrelated pediatric patients affected by primary headache, classified according to the International Headache Society criteria in migraine (migraine with aura, n = 3; migraine without aura, n = 80), and tension-type headache (episodic tension-type headache, n = 36; chronic tension-type headache, n = 7) patients, were recruited to the study. Sixty-seven healthy blood donors were used as a control group. Genomic DNA was extracted from buccal swabs or blood samples and analyzed by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) for the above-mentioned polymorphism. Allele and genotype frequencies for primary headache patients were analyzed in comparison with the control group. RESULTS: No significant differences were found in the distribution of the EDNRA -231 G>A polymorphic variant when considering both genotype (migraine chi2 = 2.78, P = .25; tension-type headache chi2 = 3.58, P = .17) and allelic frequencies (migraine chi2 = 1.48, P = .22; tension-type headache chi2 = 0.39, P = .56). Furthermore, no significant genotype-related difference was found in relation to clinical features, such as age at onset, frequency, and length of the attacks. CONCLUSIONS: Our study shows that the -231 G>A polymorphism in the EDNRA gene is neither associated with primary juvenile headache nor significantly correlated with main clinical features characteristic of the headache pathology in pediatric settings.     

Estimation of warfarin maintenance dose based on VKORC1 (-1639 G>A) and CYP2C9 genotypes

BACKGROUND: CYP2C9 polymorphisms are associated with decreased S-warfarin clearance and lower maintenance dosage. Decreased expression of VKORC1 resulting from the -1639G>A substitution has also been implicated in lower warfarin dose requirements. We investigated the additional contribution of this polymorphism to the variance in warfarin dose. METHODS: Sixty-five patients with stable anticoagulation were genotyped for CYP2C9 and VKORC1 with Tag-It allele-specific primer extension technology. Plasma S-warfarin concentrations and warfarin maintenance dose were compared among patients on the basis of the VKORC1 -1639G>A genotype. RESULTS: Eighty percent of CYP2C9*1/*1 patients stabilized on <4.0 mg/day warfarin had at least 1 VKORC1 -1639A allele. Mean warfarin doses (SD) were 6.7 (3.3), 4.3 (2.2), and 2.7 (1.2) mg/day for patients with the VKORC1 -1639GG, GA, and AA genotypes, respectively. Steady-state plasma concentrations of S-warfarin were lowest in patients with the VKORC1 -1639AA genotype and demonstrated a positive association with the VKORC1 -1639G allele copy number (trend P = 0.012). A model including VKORC1 and CYP2C9 genotypes, age, sex, and body weight accounted for 61% of the variance in warfarin daily maintenance dose. CONCLUSIONS: The VKORC1 -1639A allele accounts for low dosage requirements of most patients without a CYP2C9 variant. Higher plasma S-warfarin concentrations corresponding to increased warfarin maintenance dosages support a hypothesis for increased expression of the VKORC1 -1639G allele. VKORC1 and CYP2C9 genotypes, age, sex, and body weight account for the majority of variance in warfarin dose among our study population.