二代测序辅助诊断鹦鹉热衣原体肺炎3例报道并文献复习

鹦鹉热衣原体肺炎是一种由鹦鹉热衣原体感染引起的人畜共患病,通过受感染的鸟类传播。由于病原学培养及血清学诊断困难,其误诊和漏诊时有发生,大规模流调也难以开展。本文报道浙江大学医学院附属杭州市第一人民医院收治的3例鹦鹉热衣原体肺炎患者,其中2例有病情快速进展,重症化趋势。均有禽类、鸟类接触史,临床表现有咳嗽咳痰、呼吸困难、呼吸衰竭,1例行高流量呼吸支持治疗,最终通过宏基因二代测序（mNGS）技术辅助诊断鹦鹉热衣原体肺炎,3例患者经治疗好转出院。本文提示病原学诊断在鹦鹉热衣原体肺炎中具有重要地位,而mNGS对于诊断这种少见复杂的感染性疾病是有效的补充手段。     

基于宏基因组二代测序诊断15例鹦鹉热衣原体肺炎临床特征与诊治分析

目的 探讨和分析少见鹦鹉热衣原体肺炎的临床特征、诊治及预后,以期提升临床相关学科领域对该病的认识。方法 回顾性研究赣南医学院第一附属医院2017年1月至2022年12月确诊的15例鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床资料,总结并分析该病的临床特征、诊断与鉴别要点,同时检索国内外文献资料对鹦鹉热衣原体肺炎的最新诊疗进展予以系统性讨论。结果 纳入本研究的15例鹦鹉热衣原体肺炎患者中,男性10例（66.67％）,女性5例（33.33％）,年龄62（32～79）岁,禽类接触史14例（93.33％）,基础疾病史8例（53.3％）,转化为重症肺炎5例（33.33％）。15例患者中,白细胞计数（white blood cell count,WBC）正常8例（53.3％）,WBC升高5例（33.3％）,WBC减低2例（13.3％）;血红蛋白（hemoglobin,HGB）正常9例（60.0％）,减低6例（40.0％）;中性粒细胞百分比（neutrophils,NE）升高13例（86.7％）;所有患者（100.0％）C反应蛋白（C-reactive protein,CRP）均显著升高;13例（86.67％）患者降钙素原（procalcitonin,PCT）升高;12例（80.0％）患者乳酸脱氢酶（lactate dehydrogenase,LDH）升高;11例（73.33％）肝功能异常;8例（53.33％）肾功能异常;6例（40.0％）凝血功能异常;13例（86.7％）电解质紊乱。此外,11例（73.33％）患者动脉血气分析显示不同程度血氧分压降低,8例（53.33％）氧合指数（oxygenation index,OI）低于300 mmHg,4例（26.67％）患者无明显呼吸困难,未进行动脉血气分析检查。本研究所有患者均已完善经支气管镜检查,并获取支气管肺泡灌洗液（bronchoalverolar lavage fluid,BALF）行宏基因组二代测序（metagenomic next-generation sequencing,mNGS）检测,检出的病原体除鹦鹉热衣原体外,所有患者均合并多种病原体感染。15例患者均已完善肺部电子计算机断层扫描（computed tomography,CT）等影像学检查,单侧肺部实变7例（46.67％）,双侧实变8例（53.33％）;9例（60.0％）患者伴有胸腔积液,部分患者可以表现出多种影像学表现,包括实变影、磨玻璃影、团块样实变影、反晕征、纵隔和肺门淋巴结肿大等。15例鹦鹉热衣原体肺炎患者在确诊后均予规范抗感染治疗,其中5例重症肺炎患者中2例患者予体外膜肺氧合（extracorporeal membrane oxygenation,ECMO）辅助治疗,所有患者均未见治疗相关不良反应或不良事件,平均住院日为13.9 d。本研究所有患者未见死亡,均好转出院。结论 鹦鹉热衣原体肺炎临床特征及表现缺乏特异性,易出现重症化,经支气管肺泡灌洗液予mNGS检测可精准确诊,早期予四环素类及喹诺酮类抗生素可最大程度改善患者预后。     

鹦鹉热衣原体肺炎合并横纹肌溶解5例临床分析

为探讨鹦鹉热衣原体肺炎合并横纹肌溶解(RM)患者的临床特征及治疗方法, 收集我院2020年1月至2021年11月经宏基因组二代测序(mNGS)确诊的鹦鹉热衣原体肺炎患者的病例资料, 对合并RM患者的一般情况、临床表现、实验室检查、胸部CT表现及诊疗过程进行总结分析。21例鹦鹉热衣原体肺炎患者中10例(47.6%)血肌酸激酶(CK)升高, 5例(23.8%)合并RM。5例鹦鹉热衣原体肺炎合并RM患者均为重症, 主要临床表现为高热、气促、头痛、肌肉酸痛, 2例继发急性肾损伤(AKI)及神志改变。所有患者肌酶谱(CK、肌红蛋白、乳酸脱氢酶)、炎症指标(高敏C反应蛋白、白细胞介素6)及D-二聚体均明显升高。5例患者胸部CT表现以肺大片实变为主, 1例合并磨玻璃改变, 2例并发少量胸腔积液。患者入院后经mNGS检查很快确定诊断并及时予针对性治疗, 除1例因多脏器功能衰竭死亡外, 其余4例患者好转出院。提示鹦鹉热衣原体肺炎容易继发RM, 早发现、早治疗可有效改善患者预后。     

8例鹦鹉热衣原体肺炎的诊治体会

目的 总结鹦鹉热衣原体肺炎的临床特点及诊治方法。方法 回顾性分析2022年1月至2022年4月南京梅山医院呼吸科收治的8例鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床资料、诊治经过。结果 8例患者均高热起病,伴其他临床特征如下:8例咳嗽、1例胸痛、4例肌肉酸痛、1例腹泻、1例呼吸困难、2例乏力;8例患者均有鸟类/家禽接触史:2例养鸽子,3例养鸡,1例养鹦鹉,1例运输家禽、1例邻居养鸽子;实验室检查可见淋巴细胞计数降低、C反应蛋白升高,谷丙转氨酶升高、低钠血症;胸部CT示8例患者单肺病变居多且以下肺为主,主要胸部CT影像学表现是磨玻璃影、实变影、支气管空气征及细网格征;8例患者均收集肺泡灌洗液(BALF)进行宏基因组二代测序(mNGS)进行检测,mNGS检测出鹦鹉热衣原体(39～757条),确诊为鹦鹉热衣原体肺炎,调整抗生素为米诺环素、莫西沙星治疗后患者均好转出院。结论 鹦鹉热衣原体肺炎以发热、咳嗽为主要临床表现,鸟类/家禽接触史是重要诊断线索,对疑似患者肺泡灌洗液mNGS检测能明确诊断,米诺环素为治疗首选。     

重症鹦鹉热衣原体肺炎四例及文献复习

社区获得性肺炎由鹦鹉热衣原体感染引起约占1%[1],鹦鹉热衣原体肺炎临床表现无特征性,部分患者可表现为重症,进展迅速,如不能及时明确病原体,可导致多脏器功能衰竭,危及生命。宏基因组二代基因测序（mNGS）是一种精准诊断病原体的检测技术,能够快速从患者体液、病变组织中检测到病原体信息,已越来越多地用于感染性疾病的病原体诊断。本研究通过4例重症鹦鹉热衣原体肺炎的临床特点进行回顾性分析,探讨肺泡灌洗液宏基因组二代测序技术对疾病的快速诊断及指导治疗的意义。     

鹦鹉热衣原体肺炎2例报告及文献复习

目的:分析鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床表现、诊断方法和治疗过程,提高临床医生对该病的认识,以进一步提高其临床诊治效率并改善其预后.方法:收集2例鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床资料,对诊治经过进行总结,分析患者的感染指标、氧合功能和肺部影像学的动态变化,对比培养法、血清学方法和宏基因组二代测序技术(mNGS)等病原学诊断方法,...     

9例鹦鹉热衣原体肺炎患者临床特征分析

目的 探讨鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床特征,以提高对该病的认识,以助精准诊断和治疗。方法 回顾性分析郑州大学第二附属医院2020年10月至2022年8月确诊的9例鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床资料。结果 9例患者中,男5例,女4例,7例患者有家禽类接触史,年龄为47～69岁,中位年龄为56岁,临床表现主要为高热9例、咳嗽9例、乏力9例、呼吸困难7例、肌肉酸痛5例、头痛4例等,1例迅速进展为呼吸衰竭。白细胞计数正常4例、轻度升高5例,中性粒细胞计数升高9例、淋巴细胞计数下降9例、C反应蛋白(CRP)升高9例,降钙素原(PCT)升高9例,天门冬氨酸氨基转移酶(AST)、丙氨酸氨基转移酶(ALT)升高5例。胸部CT均表现为斑片状实变影、其中9例伴有支气管充气征,累及单侧肺叶6例、双侧肺叶3例、胸腔积液6例。9例患者均由宏基因二代测序(mNGS)检出鹦鹉热衣原体核酸序列。治疗上7例使用多西环素治疗、2例使用阿奇霉素治疗、7例使用莫西沙星治疗,其中3例使用西维来斯他纳治疗急性呼吸窘迫综合征后呼吸衰竭症状明显好转。9例患者治疗后均好转出院。结论 鹦鹉热衣原体肺炎患者有明显肺部症状、病情进展较快、经验性抗...     

mNGS诊断鹦鹉热衣原体致重症社区获得性肺炎1例并文献复习

<正>鹦鹉热是由鹦鹉热衣原体感染所导致的罕见疾病,缺乏特异性临床表现及影像学特征,易误诊。本文报道佛山市第一人民医院收治的重症社区获得性肺炎1例,血液及痰液mNGS检测结果为鹦鹉热衣原体,予多西环素抗鹦鹉热衣原体治疗效果不佳,予多西环素+莫西沙星联合抗感染治疗后病情好转出院。该研究经医院伦理委员会批准,患者已签署知情同意书。1 病例资料患者男,主因“咳嗽咳痰发热5d”于2021年3月16日于佛山市第一人民医院全科医学科住院治疗。     

10例鹦鹉热衣原体肺炎的临床特征分析

目的 分析鹦鹉热衣原体肺炎的临床特征,以提高临床医生对该类疾病的早诊早治水平。方法 回顾性分析2020年3月至2022年4月重庆大学附属江津医院收治的经宏基因组二代测序(mNGS)诊断的10例鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床资料,收集患者基本情况、临床表现、实验室检查[WBC、淋巴细胞计数(LYM)、中性粒细胞百分比、C反应蛋白(CRP)、降钙素原(PCT)、红细胞沉降率(ESR)、Fe²⁺、AST、ALT、脑钠肽(BNP)、尿白蛋白]、影像学表现、mNGS检测结果、治疗及转归并总结归纳。结果 10例鹦鹉热衣原体肺炎患者中男6例,女4例,年龄47～90岁,中位年龄57.5岁;主要表现为发热10例(其中5例高热),咳嗽7例,相对缓脉7例,头痛5例,咯痰4例;80%的病例有明确鸟类或家禽类接触史。8例WBC正常,7例LYM降低,8例中性粒细胞百分比升高,9例CRP升高(5例>200 mg/L),6例PCT正常,10例血Fe²⁺降低。9例肺部表现为边界模糊的斑片实变影,1例表现为反晕征,所有患者病灶均累及胸膜,但胸腔积液者仅3例。10例患者均以支气...     

应用mNGS技术诊断鹦鹉热衣原体肺炎临床特征分析

目的 分析总结鹦鹉热衣原体肺炎患者临床特征,以提高该疾病早期诊断能力及救治水平。方法 回顾性分析空军军医大学第一附属医院、吉林大学第一医院二部、西安交通大学第二附属医院呼吸与危重症医学科于2018年1月-2022年1月经宏基因组二代测序（mNGS）方法确诊的14例鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床资料,分析总结其临床特点。结果 14例患者中仅2例有明确的鸟类或禽类接触史。所有患者均急性高热起病,10例伴呼吸道症状。白细胞计数正常13例,中性粒细胞百分比升高7例。所有患者超敏C反应蛋白、白细胞介素-6、血沉均显著升高。所有患者胸部CT均表现为斑片影和/或实变影,可累及不同肺叶,但所有患者肺下叶均受累。所有患者均经支气管肺泡灌洗液或外周血mNGS检查确诊。经多西环素、米诺环素、莫西沙星、阿奇霉素单药或两药联合方案,13例患者均好转出院,1例死亡。结论 高热伴胸部影像学异常应考虑鹦鹉热衣原体肺炎可能,其快速精准诊断有赖于m NGS技术,早期靶向抗生素治疗效果良好。     

重症鹦鹉热衣原体肺炎 1 例

鹦鹉热衣原体肺炎是一种较为少见的人畜共患病,肺部病变重,多合并急性呼吸衰竭及多器官功能受损,因 缺乏特发性,常被误诊或漏诊。该文对 1 例鹦鹉热衣原体肺炎的诊疗进行报道。     

1例莫西沙星治疗鹦鹉热衣原体肺炎的药学实践

目的 探讨临床药师在鹦鹉热衣原体肺炎治疗中发挥的积极作用.方法 临床药师采用循证药学的方法,结合临床数据,分析莫西沙星在鹦鹉热衣原体肺炎治疗中的作用,协助医生提出进行个体化治疗意见,并为患者提供全程药学监护.结果 通过文献查阅与药学监护,患者未改用鹦鹉热衣原体肺炎治疗的一线药物多西环素,而是继续使用莫西沙星,患者病情好...     

宏基因测序检出耶氏肺孢子菌的非HIV患者的临床分析

目的 总结并分析支气管肺泡灌洗液（bronchoalveolarlavagefluid,BALF）宏基因组二代测序（metagenomic next-generation sequencing,m NGS）检出低序列耶氏肺孢子菌（Pneumocystis jirovecii,PJ）的非HIV患者的危险因素、临床特点、治疗及预后。方法 回顾性分析2018年5月至2022年6月在宁波大学附属第一医院因不明原因肺炎行气管镜检查且BALF-mNGS检出PJ的13例非HIV患者的临床资料。结果 13例患者中,危险因素以使用糖皮质激素最为常见,最常见的症状是咳嗽、咳痰,12例患者有血感染指标异常,影像学特点以两肺弥漫性病变、多发磨玻璃影为主。12例患者接受抗PJ治疗,其中11例患者在治疗期间病情好转,1例因重症感染治疗无效死亡;1例患者未接受抗PJ治疗,在经验性抗感染治疗后好转。结论 经BALF-mNGS检出PJ的非HIV患者临床特点不典型,结合m NGS结果与宿主因素综合判断,有助于早诊、早治,改善患者的预后。     

老年社区获得性肺炎的临床特征分析

目的 分析老年社区获得性肺炎（community-acquired pneumonia,CAP） 的临床特征.方法 对118例老年CAP的临床表现、实验室检查、胸部影像学检查资料进行回顾性分析.结果 老年CAP具有发病隐匿,临床缺乏典型,肺部炎症体征不明显,86.4%（102例）患者伴有1种或多种基础性疾病,外周血白细胞升高患者较少,痰涂片培养结果72%有致病菌生长,胸部X线检查不典型等特点.另外,老年社区获得性肺炎转化为重症肺炎导致多脏器功能衰竭为其死亡的主要原因.结论 老年CAP常合并有基础性疾病,缺乏典型的临床表现,提高对CAP临床特点的认识,做到早期诊断,早期治疗.     

儿童非外伤性纵隔气肿的诊治及预后

目的：探讨儿童非外伤性纵隔气肿的病因、临床表现、治疗及预后。方法：总结回顾2011年1月～2015年12月湖南省人民医院儿童医学中心收治的非外伤性纵隔气肿住院儿童的临床资料,对病因及预后进行分析。结果：本研究纳入非外伤性纵隔气肿住院儿童33例,中位年龄30.0（IQR 14.0-69.0）m,中位住院天数13.0（9.5-19.5）d。病因诊断以重症肺炎最为常见,共22例（病原以呼吸道病毒感染常见,包括腺病毒8例,流感病毒4例）,其他诊断包括气道异物、支气管哮喘急性发作、自发性气胸等。临床表现以咳嗽、气促、发绀常见,常伴皮下气肿及气胸。大部分非外伤性纵隔气肿患儿需入住儿童重症监护病房（26/33,78.8%）,常需应用气管前筋膜切开引流减压（22/33,66.7%）,大部分患儿预后良好。在不同年龄组（<5y和5-14y）非外伤性纵隔气肿患儿的病因、临床表现、治疗及预后无统计学差异。结论：儿童非外伤性纵隔气肿发生病因以重症肺炎多见,尤其是呼吸道病毒感染。非外伤性纵隔气肿的治疗主要是原发病治疗及气管前筋膜切开减压治疗。     

成人重症腺病毒肺炎临床特征及预后

目的：探讨成人重症腺病毒肺炎的临床特征及预后情况。方法：回顾性分析2017年3月至2019年5月温州医科大学附属第一医院收治的成人重症腺病毒肺炎病例资料。结果：7例患者,均为男性,年龄23～50（35±10）岁。主要症状为发热（7/7）、呼吸困难（7/7）、咳嗽（7/7）、胸痛（1/7）。APACHE II评分5～20（10.1±5.0）分。实验室检查以白细胞正常、肌酶升高为主。腺病毒确诊方法：病原微生物高通量测序（mNGS）6例,抗原测定阳性1例。腺病毒血清型7型3例,55型2例,4型1例,不明1例。3例予气管插管呼吸机支持,1例气管切开呼吸机支持,无创呼吸机支持通气3例,机械通气时间5～46 d。治疗包括静脉丙种球蛋白应用7例,更昔洛韦和利巴韦林抗病毒治疗3例。6例好转出院,1例死亡。结论：成人重症腺病毒肺炎易发生于中青年男性,mNGS可快速确定病原菌,处理以对症支持治疗为主。     

22例重症甲型H1N1流感的临床特点

目的分析重症甲型H1N1流感患者临床特点。方法收集2009年11月1日～2010年2月6日住院的重症甲型H1N1流感患者22例的临床资料,从患者性别、年龄分布、是否接种疫苗、临床特征、主要并发症及治疗效果等方面进行分析。结果①所有患者均未接种疫苗;②重症患者中青壮年比例最高,特别是体重偏胖的青壮年;③发病症状重,并发症多;主要并发症有脑炎、肺炎,而以重症肺炎居多,危重患者多有肝功、肾功能、心肌酶异常,死亡患者死因主要为重症肺炎,呼吸衰竭;④治疗效果：单纯重症患者治疗效果较好,危重症患者病死率较高。结论体重偏重的青壮年、孕妇、有基础病变者是重症、危重症甲型H1N1流感的高危人群,危重者病死率高,流行季节高危人群应及时接种疫苗。     

关于中医药防治新型冠状病毒肺炎的几点思考

2019年底以来,我国武汉地区陆续出现新型冠状病毒肺炎患者,以发热、乏力、干咳为主要临床表现,少数患者伴有鼻塞、流涕、咽痛和腹泻等症状。认为隔离仍然是预防本病最重要的措施,治疗当分轻重。医者在临床治疗中应发挥中医辨证论治的特色和优势,重视中医温病学的理论和方法。另外,也应重视中医药中针对病原体的有效方药或成分的研究。      

肉鸡鹦鹉热衣原体的分离和鉴定

目的 确定鹦鹉热衣原体是否为导致肉鸡发生严重呼吸道疾病的主要病原。方法 对2001～2002间北京、天津地区肉鸡流行的严重呼吸道疾病的鸡群进行血清学测定。取发病鸡的心、肺、肾脏组织固定、切片、染色：发病鸡肺脏组织液接种7dSPF鸡胚，收集4～9d死亡鸡胚的卵黄囊膜，分别用碘染色、衣原体荧光染色；青霉素、磺胺嘧啶钠抑制分离的病原，观察SPF鸡胚发育。分离病原注射15d商品肉鸡，复制病变。结果发病肉鸡血清抗体出现10％-30％阳性，分离病原荧光染色阳性，人工感染肉鸡后可以复制病变。结论 从肉鸡分离的病原可能是鹦鹉热衣原体，与大肠埃希菌混合感染是造成肉鸡呼吸困难、死亡升高的主要因素。     

小儿支原体肺炎的临床分析及不同治疗方式的观察

目的：探讨儿童支原体肺炎的临床特点、诊断及其治疗方法。方法选择2012年2月～2013年6月期间的肺炎支原体感染的64例患儿做为研究对象,总结支原体肺炎的临床表现尤其是肺外临床表现,以及应用大环内脂类抗生素治疗肺炎支原体肺炎的转归情况。结果肺炎支原体肺炎除临床表现不典型外,可引起多器官、多系统的损害,应用大环内脂类抗生素可有效缩短疗程。结论支原体感染可涉及各种器官及组织,极易漏诊或误诊,早期诊断及治疗具有重要意义。