应用基因芯片筛选不同胶质瘤细胞相关基因

目的 应用高密度寡核苷酸(Oligo)基因芯片技术筛选不同胶质瘤细胞相关基因.方法 提取星形胶质细胞瘤CHG-5细胞株(WHO分级Ⅱ级)、星形胶质细胞瘤U373细胞株(WHO分级Ⅲ级)、星形胶质细胞瘤SHG-44细胞株(WHO分级Ⅳ级)和神经胶质细胞U257细胞株的总RNA并逆转录为cDNA,其中cy5、cy3的dNTP分别掺入不同胶质瘤细胞和神经胶质细胞的cDNA,混合后杂交含22000个人类基因人类高密度Oligo基因芯片,经过洗片和扫描,获得荧光信号图像并用计算机分析,抽取4种差异表达基因用聚合酶链反应(PCR)验证它们不同胶质瘤细胞和神经胶质细胞中的差异表达.结果 从22000条基因中筛选出差异表达基因242条,其中123条表达上调,119条表达下调,包括细胞凋亡、细胞周期蛋白、细胞骨架和运动蛋白等相关基因.结论 基因芯片技术的胶质瘤基因表达谱分析能够高通量筛选胶质瘤相关基因,并高效对基因功能进行研究,有助于认识肿瘤发病机制.     

人脑胶质瘤差异表达的基因韵获得及一条全长新基因的克隆

目的 运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因，并对其中一条基因进行了初步的研究。方法 抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针，经杂交、洗涤后，通过计算机观察两者表达谱的差异情况，对681F05克隆子进行了Nozxhem blot，5’RACE和生物信息学分析。结果通过4次基因芯片筛选，获得15条与胶质瘤相关的新基因，经Northem blot证实681F05基因在人正常脑组织中低表达，而在人脑胶质瘤中高表达。BLASTn和BLASTx分析显示，它们编码蛋白与线虫Cyp-10蛋白同源性分别为52％和72％。cDNA序列分析发现这两上克隆是同一个基因[命名为cyclophilin-like gene(PPIL-3)]的两个不同的剪切体(PPIL3a和PPIL3b)。结论 基因芯片筛选正常脑组织与人脑胶质瘤差异表达的基因具有样品用量少，高质量，高速度。高敏感等特性。681F05基因可能是与人脑胶质瘤形成有关的一条全长新基因。     

人脑胶质瘤差异表达的基因的获得及一条全长新基因的克隆

目的运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因,并对其中一条基因进行了初步的研究。方法抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针,经杂交、洗涤后,通过计算机观察两者表达谱的差异情况,对681F05克隆子进行了Northernblot,5’RACE和生物信息学分析。结果通过4次基因芯片筛选,获得15条与胶质瘤相关的新基因,经Northernblot证实681F05基因在人正常脑组织中低表达,而在人脑胶质瘤中高表达。BLASTn和BLASTx分析显示,它们编码蛋白与线虫Cyp10蛋白同源性分别为52%和72%。cDNA序列分析发现这两上克隆是同一个基因[命名为cyclophilinlikegene(PPIL3)]的两个不同的剪切体(PPIL3a和PPIL3b)。结论基因芯片筛选正常脑组织与人脑胶质瘤差异表达的基因具有样品用量少,高质量,高速度,高敏感等特性。681F05基因可能是与人脑胶质瘤形成有关的一条全长新基因。     

人脑胶质瘤中全长新基因PPIL3的获得及染色体定位和表达谱分析

目的运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因，并对其中一条基因进行研究。方法抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针，经杂交、洗涤后，通过计算机观察两者表达谱的差异情况，对6811705克隆子进行Northern blot，逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR），染色体定位和生物信息学分析。结果通过4次基因芯片筛选，获得15条与胶质瘤相关的新基因，经Northern blot证实6811705基因在人正常脑组织中低表达，而在人脑胶质瘤中高表达。PPIL3基因位于染色体2q33区段的STS marker stSG2762和SHGC-3074之间。BLASTn和BLASTx分析显示，它们编码蛋白与线虫Cyp-10蛋白同源性分别为52％和72％。cDNA序列分析发现这两上克隆是同一个基因[命名为eyelophilin-like gene（PPIL3）]的两个不同的剪切体（PPIL3a和PPIL3b）。结论基因芯片筛选正常脑组织与人脑胶质瘤差异表达的基因具有样品用量少，高质量，高速度，高敏感等特性。6811705基因可能是与人脑胶质瘤形成有关的一条全长新基因。     

全长新基因PPIL3的获得及在人脑胶质瘤中的表达

目的 运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因,并对其中1条基因进行初步研究.方法 抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针,经杂交、洗涤后,通过计算机观察两者表达谱的差异情况,对681F05克隆子进行Northern blot,原位杂交和生物信息学分析.结果 通过4次基因芯片筛选,获得15条与胶质瘤相关的新基因,经northern blot证实681F05基因在人正常脑组织中低表达,而在人脑胶质瘤中高表达.原位杂交得到相同的结果.BLASTn和BLASTx分析显示,它们编码蛋白与线虫Cyp-10蛋白同源性分别为52%和72%.cDNA序列分析发现这两上克隆是同一个基因(命名为cyclophilin-like gene (PPll3))的两个不同的剪切体(PPIL3a和PPll3b).结论 基因芯片筛选正常脑组织与人脑胶质瘤差异表达的基因具有样品用量少,高质量,高速度,高敏感等特性.681F05基因可能是与人脑胶质瘤形成有关的一条全长新基因.     

1例基因芯片筛选青少年特发性脊柱侧凸骨髓间充质干细胞成脂分化相关差异表达基因

[目的]应用基因芯片技术筛选青少年特发性脊柱侧凸(AIS)骨髓间充质干细胞(hBMSCs)成脂分化相关的差异表达基因.[方法]收集AIS及同性别年龄正常对照骨髓标本,密度梯度离心法分离MSCs并培养传代,取第3代MSCs进行成脂诱导2周后,提取各标本的总RNA,反转录成cDNA,并以两种荧光Cy5和Cy3标记后作为探针与人类全基因组表达谱基因芯片杂交,扫描芯片荧光信号图像后用基因图像分析软件进行数字化处理和分析.[结果]筛选出显著表达差异基因1 380条,其中表达上调基因874条,表达下调基因506条.[结论]AIS来源MSCs成脂分化相关差异表达的1 380条基因可能参与了AIS的发生和发展.     

全长新基因人核糖体蛋白L14.22在人脑胶质瘤中的研究与体外表达

目的运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因。方法抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针,经杂交、洗涤后,通过计算机观察两者表达谱的差异情况,对507E08克隆子进行了Northern blot,生物信息学分析,蛋白表达和氨基酸测序。结果通过4次基因芯片筛选,获得15条与胶质瘤相关的新基因,经Northern blot 证实507E08基因在人正常脑组织中低表达,而在人脑胶质瘤中高表达。原位杂交得到相同的结果。BLASTn和BLAST分析显示,507E08基因为全长新基因,长度为2 002 bp,共编码203个氨基酸。本基因命名为人核糖体蛋白L14．22。经原核表达,在SDS-PAGE胶上获得一条22×103的条带,氨基酸序列分析显示,结果N-端15个氨基酸与序列所示的N-端15个氨基酸残基完全相同。结论基因芯片筛选正常脑组织与人脑胶质瘤差异表达的基因具有样品用量少,高质量,高速度, 高敏感等特性。507E08基因可能是与人脑胶质瘤形成有关的一条全长新基因。     

人粘连蛋白基因在胰腺癌中的表达

目的：探讨人粘连蛋白（FN）基因在胰腺癌发生和转移中的作用。方法：应用博道4096型cDNA基因芯片和原位杂交技术检测18例胰腺癌标本、8例慢性胰腺炎组织FN基因表达。结果：FN基因在18例胰腺癌基因芯片检测中表达显著增高（Cy5/Cy3＞2．0，P＜0．01），伴有区域淋巴结转移时增高更加明显；在慢性胰腺炎中的表达与正常组织比较差异无显著性（Cy5/Cy3＜2．0，P＞0．05），与原位杂交结果相同。结论：基因芯片技术能够为胰腺癌的相关基因分析提供特异和可靠的数据；人胰腺组织中FN基因表达升高可能与胰腺癌的发生和转移有关。     

人脑胶质瘤中全长新基因PPIL3的生物信息学研究

目的 应用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因,并对其中1条基因进行初步研究.方法 抽提正常成人脑组织与人腩胶质瘤组织中的mRNA制备探针,经杂交、洗涤后,通过计算机观察两者表达谱的差异,对681 F05克隆子进行Northern blot和生物信息学分析.结果 通过4次基因芯片筛选,获得15条与胶质瘤相关的新基因,经Northern blot证实681F05基因在人正常脑组织中低表达,而在人脑胶质瘤中高表达.BLASTn和BLASTx分析显示,它们编码蛋白与线虫Cyp-10蛋白同源性分别为52%和72%.cDNA序列分析发现此两个克隆是同一个基因[命名为cyclophilin-like gene(PPIL3)]的两个不同的剪切体(PPIL3a和PPIL3b).结论 基因芯片筛选正常脑组织与人脑胶质瘤差异表达的基因具有样品用量少、高质量、高速度、高敏感等特性.681F05基因可能是与人脑胶质瘤形成有关的一条全长新基因.

Abstract：

Objective To obtain differentially expressed genes related to human glioma using cDNA microarray and study the characterization of one novel full-length gene. Methods Total RNA was extracted from human glioma tissues and normal brain tissues, and mRNA was used to make probes. After hybridization and washing procedure, the results of hybridization were scanned using computer system. One gene named 681F05 clone was subsequently analyzed by northern blotting and bioinformatic analysis. Results We obtained 15 differentially expressed genes to human glioma through 4 times hybridizations and scanning. Northern blotting analysis confirmed 681F05 clone was down-regulated in human brain tissue and up-regulated in human glioma tissues. The analysis of BLASTn and BLASTx showed that clone 681F05 isolated was two cDNA clones encoding two novel proteins which showed 52% and 72% identity to the cyclophilin isoform 10 of C. Elgans, respectively. Sequence analysis revealed these two cDNA clones were two different splicing variants of a novel cycophilin-like gene ( PPIL3a and PPIL3b). Conclusion cDNA microarray technology can be successfully applied to identify differentially expressed genes. The novel fulllength gene of human PPIL3 may be correlated with tumorigenesis of human glioma.     

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目的 利用基因芯片技术分析原发性下肢深静脉瓣膜功能不全(PDVI)所致大隐静脉曲张的基因表达谱和差异基因。方法 对10例PDVI所致的曲张大隐静脉和10例正常对照组织进行mRNA抽提，分别给予荧光素Cy5和Cy3标记以制备cDNA探针，并与含有1220个人类全长互补DNA的基因芯片进行杂交和分析。结果 在PVDI所致的曲张大隐静脉组织中共检测到21个差异基因，其中9个为上调基因，12个为下调基因。差异表达基因包括参与信号传导、细胞周期以及细胞生长、分化、代谢、增殖和凋亡的相关基因。结论 运用基因芯片技术筛选出的差异基因与PVDI所致大隐静脉曲张发病相关。     

胸腰椎骨折椎弓根内固定断裂与植骨融合方式的相关性分析

[目的]探讨胸腰椎骨折椎弓根螺钉内固定系统内固定术后,椎弓根螺钉断裂与植骨融合方式之间的关系,以探讨胸腰椎骨折植骨融合的最佳方式。[方法]回顾性研究1995年5月~2005年12月本院脊柱外科收治的胸腰椎骨折病人197例,其中A组单纯内固定(不植骨)患者14例,B组“H”形椎板植骨21例,C组横突间植骨67例,D组椎间、椎内联合横突间植骨95例。[结果]术后随访6~32个月,内固定断裂12例,其中A组4例,B组3例,C组5例,D组0例,4组中D组内固定断裂率显著低于其他3组(P<0.05)。[结论]椎间、椎体内联合横突间植骨重建脊柱三柱的稳定性,符合人体生物力学原理,能有效降低内固定断裂的发生。     

Study of the correlations between the volumes of the hypophysis, the epiphysis and the subfornical organ to the somatic weight and the volume of the hypothalamus in rodents]

The correlations between volume of the hypophysis, of the epiphysis and of the subfornical organ to body weight and volume of the hypothalamus were studied on 193 rodents belonging to 41 species. Concerning the volume of the hypophyseal lobes the regression slopes of Rodentia occupy an intermediate position between those of Isectivora and Prosimians studied by BAUCHOT. The volume of the epiphysis increases more rapidly with the weight of the body than that of the hypophyseal lobes, the volume of the subfornical organ increases on the contrary more slowly.     

Characteristics of the receptors in the isolated capsule of the hip in the cat

Summary The properties of the afferent fibres from the capsule of the hip joint have been studied in the cat in situ, in relation to joint rotation, and in an isolated capsule preparation which was opened and stretched directly with an actuator.In situ two types of afferent fibres were found, those having a full range of sensitivity and others having only a limited range in response to the joint rotation. When studied in isolated tissue the afferent fibres of the capsule were uniform in threshold and sensitivities, and no full range receptors were found. We conclude that the full range receptors which enter the articular nerve of the hip are spindle afferents and not capsule receptors. On the basis of these and previous results in animals and man the role of joint receptors in kinaesthesia and position sense is discussed.

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Résumé Les auteurs ont étudié les propriétés des nerfs afférents à la capsule de la hanche, chez le chat en imprimant à l'articulation des mouvements de rotation et sur des préparations de capsule isolée et ouverte en l'étirant directement grâce à un dispositif mécanique.In situ, on a trouvé deux types de nerfs afférents, les uns ayant en réponse à la rotation articulaire une étendue complète de sensibilité et les autres seulement une sensibilité limitée. Sur la capsule isolée les nerfs afférents sont indentiques en ce qui concerne le seuil et la sensibilité et on ne trouve aucun récepteur complet. On en conclut que les récepteurs de toute l'étendue de la sensibilité qui pénètrent les nerfs articulaires de la hanche sont des fibres en fuseau d'origine musculaire et non des récepteurs capsulaires. Sur ces bases et sur les résultats précédemment obtenus chez l'animal et chez l'homme, les auteurs discutent le rôle des récepteurs articulaires dans la cénesthésie et le sens des positions.