玉树州鼠疫自然疫源地鼠疫菌耐药及耐消毒剂相关基因的检测

目的检测分析玉树州鼠疫疫源地内分离鼠疫菌携带耐药基因及耐消毒剂基因的情况,为指导该疫源地鼠疫防治中合理使用抗菌药物和消毒剂提供参考依据。方法选取该疫源地境内1954年-2016年分离的236株鼠疫菌,采用PCR法检测磺胺类耐药相关基因(Sul1、Sul2)、氨基糖苷类耐药相关基因(StrA、StrB)、β-内酰胺类耐药相关基因(TEM、CTX-M)及耐消毒剂基因(qacEΔ1-sul1)。结果 PCR结果显示,236株鼠疫菌中未检测到6个耐药相关基因和1个耐消毒剂基因。结论玉树州鼠疫疫源地内分离鼠疫菌尚未发现携带耐药及耐消毒剂相关基因。     

青藏高原鼠疫自然疫源地鼠疫耶尔森菌病原学研究

目的:了解青藏高原鼠疫自然疫源地鼠疫耶尔森菌（简称鼠疫菌）病原学特征。方法:以青藏高原1954-2016年不同地区及宿主、媒介体内分离的1 378株鼠疫菌作为实验对象,采用常规技术与分子生物学技术对其进行表型特征、质粒谱、基因组分型等研究,并对青藏高原鼠疫菌病原学、地理分布等特征进行探讨。结果:青藏高原鼠疫菌含6个生化...     

河北省鼠疫自然疫源地鼠疫耶尔森菌变异性研究进展

在河北省鼠疫自然疫源地流行初期分离的鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)毒力较强,脱氮能力稳定,质粒种类丰富,但在流行末期分离的鼠疫菌往往毒力较弱,脱氮能力不稳定,质粒易缺失。鼠疫菌的形态学在自然界中存在较大差异。该文通过探讨河北省鼠疫菌的生物学、生化、质粒和毒力变异情况,揭示鼠疫静息期存在的机制。     

内蒙古自治区鼠疫自然疫源地鼠疫耶尔森菌的耐药性分析

目的:了解内蒙古自治区鼠疫自然疫源地鼠疫耶尔森菌（鼠疫菌）对11种抗生素的耐药情况,为科学有效地选择抗生素治疗鼠疫提供理论依据。方法:收集137株分离自内蒙古自治区鼠疫自然疫源地不同时间、不同地区、不同宿主和媒介的鼠疫菌,采用美国临床和实验室标准协会（Clinical and Laboratory Standard I...     

鼠疫耶尔森菌在自然疫源地保存机制的研究进展

通过阐明鼠疫的起源,分析鼠疫耶尔森菌（鼠疫菌）在鼠疫自然疫源地内的保存学说,描述动物间鼠疫流行特征和20世纪70年代的灭鼠拔源工作带给我们的启示,揭示鼠疫菌在自然界保存机制的研究进展情况,提出在鼠疫流行间歇期内,鼠疫菌主要以基因突变的方式长期保存在自然界中,形成鼠疫菌-宿主-媒介三位一体的鼠疫生态系统的新学说,为我国鼠疫的防治提供科学的参考依据。     

丽水市莲都区鼠疫疫源地耶尔森菌的分离及鉴定

目的了解丽水市莲都区鼠疫疫源地鼠类携带耶尔森菌的类型、毒力基因、生物型以及抗生素敏感等情况。方法利用常规耶尔森菌分离方法从635份鼠类肠道内容物中分离耶尔森菌,对检获的小肠结肠炎耶尔森菌、假结核耶尔森菌进行生物分型试验、抗生素敏感试验和毒力基因检测。结果共检获26株耶尔森菌,其中小肠结肠炎耶尔森菌检出率为2.83%(18/635),均为生物1A型非致病性菌株;假结核耶尔森菌检出率为0.31%(2/635),中间型耶尔森菌检出率为0.31%(2/635),弗氏耶尔森菌检出率为0.47%(3/635),克氏耶尔森检出率为0.16%(1/635)。18株小肠结肠炎耶尔森菌中,2株对庆大霉素耐药,4株对复方新诺明耐药。2株假结核耶尔森菌均对庆大霉素耐药,1株同时对头孢曲松和复方新诺明耐药。结论莲都鼠疫监测点鼠类携带耶尔森菌种类多,以小肠结肠炎耶尔森菌为主,对耶尔森菌的监测要进一步加强,以评估鼠疫暴发的危险度。同时,应警惕耶尔森菌引起的肠道传染病。     

中国鼠疫自然疫源地分型研究Ⅳ.鼠疫耶尔森菌生物型生物学特征的探讨

鼠疫菌生物型是鼠疫菌起源进化遗传性状最稳定的生物学标准,是鼠疫起源进化普系的“活化石”,也是该菌起源进化最具代表性的模式.依据其对甘油和阿拉伯糖的酵解和还原硝酸盐的能力,鼠疫菌可分为4种生物型,即古典型(甘油酵解阳性,阿拉伯糖酵解阳性,硝酸盐还原阳性)、中世纪型(甘油酵解阳性,阿拉伯糖酵解阳性,硝酸盐还原阴性)、东方型(甘油酵解阴性,阿拉伯糖酵解阳性,硝酸盐还原阳性)和田鼠型(甘油酵解阳性,阿拉伯糖酵解阴性,硝酸盐还原阴性).前三种生物型与人类历史3次鼠疫大流行相对应,最后一种生物型对人不致病,但能造成田鼠鼠疫并在其自然疫源地内流行.目前中国鼠疫自然疫源地有4种鼠疫菌生物型.     

中国鼠疫自然疫源地分型研究Ⅳ.鼠疫耶尔森菌生物型生物学特征的探讨

鼠疫菌生物型是鼠疫菌起源进化遗传性状最稳定的生物学标准, 是鼠疫起源进化普系的“活化石”, 也是该菌起源进化最具代表性的模式.依据其对甘油和阿拉伯糖的酵解和还原硝酸盐的能力, 鼠疫菌可分为4种生物型, 即古典型(甘油酵解阳性, 阿拉伯糖酵解阳性, 硝酸盐还原阳性)、中世纪型(甘油酵解阳性, 阿拉伯糖酵解阳性, 硝酸盐还原阴性)、东方型(甘油酵解阴性, 阿拉伯糖酵解阳性, 硝酸盐还原阳性)和田鼠型(甘油酵解阳性, 阿拉伯糖酵解阴性, 硝酸盐还原阴性).前三种生物型与人类历史3次鼠疫大流行相对应, 最后一种生物型对人不致病, 但能造成田鼠鼠疫并在其自然疫源地内流行.目前中国鼠疫自然疫源地有4种鼠疫菌生物型.     

河北省鼠疫自然疫源地鼠疫菌生物学特征的研究概述

为进一步研究河北省鼠疫疫源地的结构和性质,通过查阅大量资料,对该疫源地分离的鼠疫菌株的生物学特征做了总结,分别从生化特征、营养需求、质粒特征、毒力因子、毒力和毒素几方面进行介绍,发现河北省分离的鼠疫菌属于B群鄂尔多斯高原型,营养需求表现为对甘氨酸的半依赖和对色氨酸的营养依赖,含有4种质粒,其中13×106质粒是内蒙古长爪沙鼠疫源地所特有,有的菌株缺失45×106质粒,全部菌株表现为F1抗原和鼠疫菌素（PstⅠ）阳性,而鼠疫菌色素沉着（Pgm）和VW抗原阳性仅占一定比例,表现为遗传的不稳定性,中等毒力。     

鼠疫耶尔森菌rRNA基因识别特征研究

目的 分析鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)的rRNA基因识别特征.方法 通过比较基因组学方法,利用Clustal W软件,对目前已完成全基因组测序的9株鼠疫菌的rRNA基因序列进行分析,分别比对rRNA基因簇两侧的2000bp序列、基因簇内16S、23S、5S rRNA及16S～23S基因间隔区序列,以确定鼠疫菌rRNA基因的识别特征.结果 菌株D182038、D106004、Z176003和CO92分别有6个rRNA基因簇拷贝(6拷贝菌株),菌株91001、KIM、Nepa1516、Antiqua和Pestoides F分别有7个rRNA基因簇拷贝(7拷贝菌株).按照两侧2000bp序列不同,可将鼠疫菌rRNA基因簇分成13种类型,并可将6拷贝与7拷贝菌株进行区分;16S～23S rRNA基因间隔区含有4种不同种类和数量的tRNA基因,可将6拷贝菌株和7拷贝菌株分别进行区分;23S rRNA基因在不同菌株间及不同rRNA拷贝间的碱基突变数方差分析显示,各菌株间F=0.548,P=0.815>0.05;各拷贝间F=5.228,P<0.01.结论 鼠疫菌rRNA基因簇两侧序列、间隔区tRNA基因和23S rRNA基因可作为识别不同菌株和不同rRNA基因簇拷贝的指标,将鼠疫菌不同菌株进行分类.

Abstract：

Objective To study the identification characteristics of rRNA genes on Yersinia (Y.)pestis.Methods By means of comparative genomics,we compared the rRNA genome sequences of nine completely sequenced strains of Y. pestis isolated from China and other countries by Clustal W software.we also compared the 2000 bp sequence adjacent to the rRNA genes,rRNA genes and 16S-23S rRNA spacer region respectively to determine the identification features of rRNA genes for Y. pestis.Results There were 6 rRNA gene clusters in the strains of D182038,D106004,Z176003 and CO92 respectively(6 copies strain).There were 7 rRNA gene clusters in the strains of 91001,KIM,Nepa1516,Antiqua and Pestoides F(7 copies strain).According to the 2000 bp sequence,13 types of rRNA gene clusters could classify the strains between the 6 copies and 7 copies.There were 4 types of tRNA gene among the 16S-23S rRNA spacer region that could classify the strains among the 6 copies and 7 copies strains respectively.The number of point mutation among the 23S rRNA gene was statistically different in some copies under ANOVA analysis(F=0.548,P=0.815>0.05 among the strains and F=5.228,P<0.01 among the copies).Conclusion The 2000 bp sequence adjacent to the rRNA genes,tRNA gene and 23S rRNA gene sequence could serve as the identification sign of rRNA genes for classifing the strains of Y. pestis.     

鼠疫耶尔森菌和假结核耶尔森菌基因鉴别方法的建立及评价

目的 建立鼠疫耶尔森菌和假结核耶尔森菌基因鉴别方法。方法 依据鼠疫菌、假结核菌特有的基因组序列["疫岛(PeI)"和"假岛(PsI)"], 与已公布的12株鼠疫菌和4株假结核菌全基因序列进行比对, 设计特异性的引物, 对鼠疫菌、假结核菌和其他肠道细菌进行鉴定。结果 用52株鼠疫菌、57株假结核菌和其他肠道菌株进行验证, 结果显示, 5对鼠疫菌的鉴定引物中, 2对(PeI2和PeI11)仅在52株鼠疫菌中扩出目的条带, 另3对引物(PeI1、PeI3和PeI12)除鼠疫菌外在部分假结核菌株中也扩出目的条带;5对假结核菌鉴定引物中, 1对引物(PsI1)在52株鼠疫菌和57株假结核菌株中扩出目的条带, 4对引物(PsI7、PsI16、PsI18和 PsI19)仅在57株假结核菌株中均扩出目的条带, 在鼠疫菌中未扩出目的条带。结论 用鼠疫菌和假结核菌共有的PsI1序列、鼠疫菌特有的PeI2和PeI11序列及假结核菌特有的PsI7、PsI16、PsI18和 PsI19序列组成的基因鉴别方法, 可以用于鼠疫菌和假结核菌的基因快速鉴别。     

中国鼠疫自然疫源地分型研究Ⅲ.鼠疫耶尔森菌DFR/MLVA主要基因组型生物学特征

鼠疫菌基因组型与鼠疫生态地理景观型及其主要宿主、媒介密切相关,自然组合形成鼠疫生物群落,互相依赖,互相制约,相互适应,同步进化,维持鼠疫自然疫源性和生物群落的延续.鼠疫菌差异区段/多位点串联重复序列(DFR/MLVA)基因组型反映了鼠疫自然疫源地生物学特征.     

中国鼠疫自然疫源地分型研究Ⅲ．鼠疫耶尔森菌DFR／MLVA主要基因组型生物学特征

鼠疫菌基因组型与鼠疫生态地理景观型及其主要宿主、媒介密切相关,自然组合形成鼠疫生物群落,互相依赖,互相制约,相互适应,同步进化,维持鼠疫自然疫源性和生物群落的延续。鼠疫菌差异区段／多位点串联重复序列(DF形ML讼)基因组型反映了鼠疫自然疫源地生物学特征。其型别对认识鼠疫菌自然疫源地生物学具有重要意义。通过对鼠疫菌基因组型的鉴定,可实现对鼠疫菌的追踪溯源,追溯出所代表的鼠疫主要宿主、主要媒介及其生态地理景观型的生物学特征。因此。鉴定鼠疫菌基因组型、主要基因组型对中国鼠疫预防控制、应急反恐、生物安全、监测预报及软件技术平台体系建设具有实践和理论指导意义。     

鼠疫耶尔森菌对抗生素的耐药机制研究进展

鼠疫是由鼠疫耶尔森菌引起的人畜共患病。随着抗生素的发现和使用,人类的死亡率大幅降低,研究发现在多个国家地区出现对抗生素有不同程度耐药的变异菌株,这些变异菌株通过不同的耐药机制抵抗抗生素的作用,产生耐药性。鼠疫耶尔森菌不仅可以通过从其他细菌中获得耐药质粒的接合转移,也可以通过基因点突变抵制抗生素。本文从鼠疫耶尔森菌可感染人和多种动物、治疗鼠疫的抗生素、鼠疫耶尔森菌对抗生素的耐药机制等方面进行综述。     

中国鼠疫自然疫源地分型研究II.鼠疫自然疫源地分型方法研究

自然界千姿百态,自然地理环境变化万千,直接反映到鼠疫自然疫源地,进而影响到物种生存起源进化和遗传演化的发展.动物鼠疫在自然界的存在是以鼠疫菌、鼠疫宿主、鼠疫媒介之间食物链和空间接触为基础,在进化中形成鼠疫生物群落,并在一定鼠疫生物地理环境条件下自然组合形成鼠疫生物地理群落——即鼠疫自然疫源地.鼠疫生物地理群落受相应生态、生理、遗传诸多因素的影响,相互依赖,相互制约,相互适应,自然选择,同步进化,维持鼠疫自然疫源性,维护鼠疫生物群落的种族延续.从生态学视角看鼠疫自然疫源地,可以看做是依附于陆生生态系统中特殊的鼠疫生物群落,在进化历史的长河中形成了牢固的统一体“鼠疫生物地理群落超级有机体”.     

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌耐药基因及耐消毒剂基因研究

目的 了解临床分离的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)耐药性及β-内酰胺类耐药相关基因和耐消毒剂基因存在情况.方法 对临床分离的56株MRSA用K-B纸片扩散法测定对青霉素等16种抗菌药物的敏感性;采用聚合酶链反应(PCR)法检测β-内酰胺类耐药相关基因(mecA)及耐消毒剂基因qac(A/B).结果 56株MRSA对万古霉素、替考拉宁均敏感,对复方新诺明、呋喃妥因、利福平、四环素、左氧氟沙星、克林霉素、阿奇霉素的耐药率分别为17.9%、23.2%、82.1%、87.5%、89.3%、92.9%、96.4%,对红霉素、庆大霉素、阿米卡星、青霉素、氨苄西林/舒巴坦、头孢西丁、氨苄西林均耐药;共检出mecA基因54株(96.4%),qac(A/B)基因31株(55.4%).结论 临床分离的MRSA为多药耐药菌,qac(A/B)基因携带率很高.     

中国鼠疫自然疫源地分型研究VIII鼠疫自然疫源地分型生物学研究基础理念

鼠疫是典型的自然疫源性人畜共患病。鼠疫自然疫源地的划分是认识和防制鼠疫的基础性工作。鼠疫生物地理群落(鼠疫自然疫源地)由生态地理景观型、宿主、媒介、鼠疫菌基因组型四要素组成,并在长期进化过程中存在复杂的相互关系。人类活动是影响鼠疫自然疫源地的重要因素。本文基于先前发表的系列论文,整合对鼠疫自然疫源地各要素的研究成果,集中论述鼠疫自然疫源地划分和认识中的若干重要理念,为鼠疫和其他人畜共患病的防疫和监控提供理论创新。     

广西鼠疫自然疫源地研究概述

鼠疫在广西有865年的流行史,经过53年的静息期后于2000年重新暴发,并首次分离到鼠疫杆菌,该菌株属滇闽居民区型,携带有4、6、45和65MD 4种质粒,具有明显的地理区域分布特征。广西目前共发现鼠疫染疫动物5种,有3个黄胸鼠鼠疫疫源县,鼠形动物有2目10科50种,室内优势鼠为褐家鼠,野外优势鼠为板齿鼠;媒介蚤有5科15属20种,以印鼠客蚤为优势蚤种。广西鼠疫疫情由暴发→扩散→初步遏制,控制效果显著,但形势依然严峻;具有广西特色的鼠疫疫区后期处理工作是广西鼠疫防治工作的特点和亮点,补充并完善后可推广应用。     

广西鼠疫自然疫源地调查研究

目的 查明广西隆林和西林县鼠疫自然疫源地主要宿主动物和媒介蚤类，确定该疫源地的性质和分布范围，为预防控制鼠疫提供科学依据。方法 运用流行病学方法对广西隆林和西林县的4个乡镇53个村屯展开调查，采集啮齿动物、指示动物和媒介蚤标本，检测鼠疫菌和鼠疫F1抗体。结果 该地区啮齿动物有2目3科10种，以黄胸鼠为优势鼠种；蚤类有6种，以印鼠客蚤为优势蚤种；从黄胸鼠体内分离出鼠疫菌25株，检测到F1抗体阳性血清31份。结论 综合地理、宿主动物、媒介蚤及病原体等因素分析认为，广西隆林和西林县存在黄胸鼠鼠疫自然疫源地。     

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌耐药基因及耐消毒剂基因的研究

目的对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)进行细菌耐药性分析及耐药基因和耐消毒剂基因的试验研究。方法对临床分离47株MRSA进行菌株鉴定、药敏试验和β-内酰胺类耐药相关基因(mecA),氨基糖苷类耐药相关基因[aac(6′)/aph(2″)、aph(3′)-Ⅲ、ant(4′,4″)],耐消毒剂基因[qac(A/B)]等主要耐药基因和耐消毒剂基因的检测。结果47株MRSA对抗菌药物氨苄西林/舒巴坦、头孢西丁、红霉素、苯唑西林、青霉素均耐药,其他抗菌药物耐药率分别为克林霉素(87.0%)、庆大霉素(91.3%)、利福平(28.3%)、四环素(76.1%)、复方新诺明(65.2%)、左氧氟沙星(71.7%)、呋喃妥因(0.0)、万古霉素(0.0);47株MRSA共检出mecA基因46株,aac(6′)/aph(2″)基因39株,aph(3′)-Ⅲ基因30株,ant(4′,4″)基因6株,qac(A/B)基因19株。结论MRSA为多重耐药菌,对氨基糖苷类耐药和耐消毒剂分别与携带氨基糖苷类耐药基因和耐消毒剂基因有关,临床医生应重视MRSA的诊断与治疗,加强MRSA的医院感染控制。