宁波市季节性H1N1流感毒株耐药性研究

目的:掌握宁波流感监测网分离到的H1N1流感毒株耐药情况,了解其NA基因片段变异情况。方法:从宁波流感监测网中随机选取了45株H1N1流感毒株,利用RT-PCR方法扩增M2和NA基因片段并测序,用计算机软件分析结果。结果:流感毒株2005年耐烷胺类率为54.5%,2006年为100%,2007年为100%,2008年为81.8%,2009年为9%,而耐达菲率2005年-2007年都为0%,2008年为18.1%,2009年为90.9%。结论:宁波H1N1流感毒株耐烷胺类率呈先上升后下降趋势,而耐达菲率呈上升趋势。     

2008-2012年江西省甲型H3N2流感病毒HA1基因特征及与疫苗株差异分析

目的掌握2008-2012年江西省甲型H3N2亚型流感病毒HA1基因特征,在分子水平了解WHO甲3型疫苗推荐株对江西省甲3亚型流感病毒预防效果。方法采集监测医院和疑似流感疫情的流感样病例鼻咽拭子标本进行流感病毒分离,对分离到的甲3型流感病毒毒株进行核酸的提取,扩增病毒HA1基因后进行核苷酸序列测定并对HA1基因特性进行分析。结果 2008-2012年共分离到甲3型流感病毒553株,对其中23株毒株进行HA1基因序列测定,各年份的毒株HA1序列分别与当年WHO对北半球推荐的疫苗株进行比对,结果为2008-2012年氨基酸同源性分别为98.4%~99.1%、96.6%~98.4%、97.2%~98.4%、96.2%~97.2%和96.6%~98.1%;抗原决定簇区氨基酸平均变异数分别为1.3个、3.2个、1.4个、3个和2.5个;其中2009年有3株在2个抗原决定簇区发生了4~5个的氨基酸替换。结论2008-2012年甲型H3N2亚型流感病毒分离株HA1基因在不断发生变异,疫苗对我省2008年度、2010年度和2012年度的甲型H3N2亚型流感保护效果良好,在2011年度保护效果存在滞后现象,对2009年甲型H3N2亚型流感保护效果较差。     

2000-2007年佛山市甲1亚型(H1N1)流感病毒监测情况及其HA1基因的变异

目的分析2000-2007年佛山市甲1亚型(H1N1)毒株流行情况及其HA1基因变异情况。方法用MDCK细胞分离流感病毒,采用血球凝集抑制试验进行型别鉴定,选取每年2~4株甲1亚型毒株的细胞培养物提取病毒核酸,进行HA1基因的逆转录,对其核苷酸和氨基酸序列及亲缘关系进行分析。结果病毒分离结果显示2000-2007年间甲1亚型流感病毒在佛山市人群中的流行是间断性的,只在2000、2001、2005、2006年4个年份分离到甲1亚型流感毒株。毒株的HA1区氨基酸序列与流感疫苗推荐株A/New Caledonia/20/99和A/Solomon Islands/3/2006相比,同源性分别为97.2%~99.7%和97.2%~98.5%。氨基酸残基平均替换数随年份的推移而增加,只有2006年的毒株在抗原决定簇发生了替换。结论与疫苗株比较,佛山市的甲1亚型流感毒株抗原性已逐渐发生了改变,应密切注意疫苗对毒株的免疫效果。     

2015年盐城市甲型H3N2亚型流感病毒HA1基因分子进化特征分析

目的了解盐城市2015年甲型H3N2流感病毒分离株表面血凝素HA1基因分子进化特征。方法对哨点医院流感样病例标本进行核酸检测、病毒分离;选取甲型H3N2毒株,采用一步法RT-PCR扩增其HA1区,并进行序列分析,采用DNAStar软件包中MegAlign进行核苷酸及氨基酸同源性分析,以MEGA6.0软件进行序列比对及基因种系进化特征分析。结果 2015年盐城市流感样病例(ILI)监测样本中流感病毒核酸阳性率为8.36%,乙型、甲型H3N2、新甲H1N1型交替流行。抽取的7株甲型H3N2分离株,其HA1基因核苷酸同源性为98.7%~100.0%,氨基酸同源性为97.9%~100.0%;其HA1区氨基酸位点变异呈散在性分布,均未发生氨基酸的丢失和插入,氨基酸突变主要位于抗原决定簇的A、B和C区。除A/JSYC/11025/2015外,其余6株新增2个糖基化位点,其中158aa位点位于抗原决定簇B区。结论 2015年盐城市流感流行以甲型H3N2和乙型Yamagata系为主,具有典型的冬、夏双高峰特点。病毒HA1区基因特性逐渐发生变异,可能导致抗原变化,应进一步加强流感病原学监测。     

2004～2006年江西省甲3亚型流感疫苗预防效果的基因分析

[目的]了解江西省2004～2006年分离的甲3亚型流感病毒株HA1基因变异特征,分析WHO甲3亚型疫苗推荐株对江西省甲3亚型流感的预防效果. [方法]采集监测医院和疑似流感疫情的流感样病例鼻咽拭子标本进行流感病毒分离,对分离到的H3型流感病毒进行核酸提取,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒HA1基因后进行核苷酸序列测定,用DNAStar5.0、BioEdit(Version5.0)、Mage生物软件对测序结果进行分析处理,推导出氨基酸序列,进行基因特性分析. [结果]21株甲3亚型流感病毒HA1区域核苷酸序列长度均为960 bp,未发现核苷酸的丢失和插入,平均点突变率为1.09%.2004年甲3亚型流感病毒分离株与当年WHO疫苗推荐株HA1区相比较,不同毒株氨基酸的同源性是97.8%～98.8%,抗原决定簇区的氨基酸变异数平均为3.17个,但有毒株已出现在2个抗原决定簇区4个氢基酸替换.2005年甲3亚型流感病毒分离株与当年疫苗推荐株HA1区相比较,不同毒株氨基酸的同源性是98.4%～99.1%,抗原决定簇区的氨基酸变异数平均为20个.2006年甲3亚型流感病毒分离株与当年疫苗推荐株的HA1区相比较,不同毒株氨基酸的同源性是98.1%～98.4%,在2个抗原决定簇区的氨基酸变异数平均为5.71个. [结论]2004年、2005年和2006年分别根据WHO推荐疫苗株生产的疫苗,对我省2004年度的甲3亚型流感总体上有较好的预防效果,但毒株的变异在增强:对2005年度的甲3亚型流感上有良好的预防效果;对2006年度的甲3亚型流感预防效果不 够理想. 比较,不同毒株氨基酸的同源性是98.4%～99.1%,抗原决定簇区的氨基酸变异数平均为20个.2006年甲3亚型流感病毒分离株与当年疫苗推荐株的HA1区 比较,不同毒株氨基酸的同源性是98.1%～98.4%,在2个抗原决定簇区的氨基酸变异数平均为5.71个. [结论]2004年、2005年和2006年分别根据WHO推荐疫苗株生产的疫苗,对我省2004年度的甲3亚型流感总体上有较好的预防效果,但毒株的变异在增强:对2005年度的甲3亚型流感上有良好的预防效果;对2006年度的甲3亚型流感预防效果不 够理想. 比较,不同毒株氨基酸的同源性是98.4%～99.1%,抗原决定簇区的氨基酸变异数平均为20个.2006年甲3亚型流感病毒分离株与当年疫苗推荐株的HA1区 比较,不同毒株氨基酸的同源性是98.1%～98.4%,在2个抗原决定簇区的氨基酸变异数平均为5.71个. [结论]2004年、2005年和2006年分别根据WHO推荐疫苗株生产的疫苗,对我省2004年度的甲3亚型流感总体上有较好的预防效果,但毒株的变异在增强:对2005年度的     

浙江省流行性感冒病毒监测与HA1基因分析

目的了解浙江省流感病毒变异情况和WHO推荐流感疫苗株对我省人体的保护情况。方法对浙江省近两年分离到的甲3型流感病毒进行核酸提取、病毒血凝素HA1基因核苷酸序列测定,与WHO推荐疫苗株进行对比。结果近两年分离到的甲3型流感病毒株HA1区域的核苷酸序列长度均为987bp,未发现核苷酸的丢失和插入,相应的点突变率为0.8~1.3%,推导的氨基酸序列长度均为329个。2003年分离的毒株与同期WHO推荐使用的疫苗株A/Moscow/10/99相比,核苷酸同源性只有95.6%~95.9%,氨基酸总变异达20个,发生在抗原决定簇A、B区的有6个位点。2004年分离的毒株与同期WHO推荐使用的疫苗株A/fujtan/411/2002(A/Kumamoto/102/2002,A Wyoming/3/2003)相比,核苷酸同源性达98.6%~99.1%,仅发生3~6个氨基酸的变异,基因进化树上,我省2003、2004年分离的毒株都属于同一类性状的毒株,与2004年WHO推荐疫苗株接近,远离2003年推荐疫苗株。结论我省甲3型流感病毒的抗原性已发生漂移。2003年WHO推荐使用的流感疫苗株对我省甲3型流感的预防效果不够理想,2004年推荐使用的疫苗株对我省甲3型流感的预防效果较好。     

2008-2012年江西省乙型流感病毒HA1基因特性分析

摘要:目的　了解2008-2012年江西省分离的B型流感病毒株HA1基因变异特征。方法　采集监测医院和疑似流感疫情的流感样病例鼻咽拭子标本进行流感病毒分离,对分离到的B型流感病毒进行核酸的提取,采用逆转录－聚合酶链反应（RT-PCR）扩增病毒基因后进行核苷酸序列测定,用DNAStar5.0、Mage对测序结果进行分析处理,推导出氨基酸序列,进行基因特性分析。结果　10株Yamagata系B型毒株HA1基因之间的同源性为97.5%～100.0%,14株Victoria系B型毒株HA1基因之间的同源性为97.0%～99.9%。我省2008年分离的Yamagata系流感病毒与疫苗株间有5～7个变异,2009-2011年分离的Victoria系流感病毒与疫苗株间有5～7个变异,2012年分离的Yamagata系流感病毒与疫苗株间有1～4个变异,其中最多只有1个变异位于抗原决定簇。结论　2008-2012年江西省B型流感HA1基因未发生明显变异,WHO推荐的B型流感疫苗株对我省流行的B型流感具有保护作用。     

浙江省近几年甲3型流行性感冒病毒株HA1基因特性分析

为了研究近几年浙江省甲3 型流行性感冒 (流感 )流行株血凝素 (HA)基因的特性 ,阐明HA基因的变异与流感流行的关系。对浙江省 1998～ 2 0 0 2年流感流行期间分离的甲3 型代表性毒株 ,提取病毒核糖核酸 (RNA) ,采用逆转录 聚合酶链反应 (RT PCR)扩增病毒HA1基因 ,纯化产物进行核苷酸序列测定 ,并用DNAMAN和BioEdit软件作分析处理。结果显示 :浙江省近几年流感流行期间分离到的甲3 型流感病毒中的 8株代表毒株 ,其在HA1区域的核苷酸长度均为 987bp ,由此推导的氨基酸数为 32 9个。A/浙江 / 2 5 / 98与当时世界卫生组织 (WHO)推荐的流感疫苗株A/武汉 / 35 9/ 95株在HA1区域的核苷酸同源性为 97 4 % ,氨基酸同源性仅为 94 8% ;HA1区的抗原性已发生了一定的变异。A/浙江 / 11/ 0 2株与同期WHO推荐的流感疫苗株A/莫斯科 / 10 / 99相比 ,两者的氨基酸同源性仅为 96 1% ;且氨基酸的改变发生在抗原决定簇A区和B区的有 4个位点 ,与 1998年的流行株A/浙江 / 2 5 / 98的氨基酸同源性也只有 96 1%。说明A/浙江 / 11/ 0 2株与A/莫斯科 / 10 / 99和A/浙江 / 2 5 / 98株相比 ,其HA1区的抗原性也发生了变化 ,在基因进化树上远离A/莫斯科 / 10 / 99株和A/浙江 / 2 5 / 98株。表明由于甲3 型流感病毒HA1区域的抗原漂移导     

贵州省2019年甲型H1N1流感重症或死亡病例毒株HA基因特性分析

目的 了解贵州省甲型H1N1流感重症或死亡病例毒株HA基因的分子特征,探讨其特异性分子位点,为流感防控提供科学依据。方法 采集2019年贵州省甲型H1N1流感重症或死亡病例的28份鼻咽拭子标本进行病毒株的分离,其中13株病毒的HA基因被扩增和测序,利用国家生物技术信息中心或全球禽流感数据共享倡议提供的参考序列和已有的轻症病例毒株序列对HA基因进行生物信息学分析。结果 2019年贵州省甲型H1N1流感重症或死亡病例毒株核苷酸和氨基酸同源性分别为98.0%～100.0%和97.9%～100.0%,分别处于不同次分支;与2019年和既往疫苗株相比,核苷酸和氨基酸同源性分别为98.2%～99.3%、97.1%～98.4%和98.1%～98.9%、97.5%～98.7%;与轻症病例相比,重症或死亡病例毒株共发生了12个位点的突变,其中V312I为共有的突变位点,抗原决定簇突变共涉及到3个区域,毒株QNZ2019YYX和BJ2019WXP发生了2个位点的突变。结论 2019年度疫苗株匹配性更高,部分毒株突变涉及到抗原决定簇的2个区域,可能为新的变异株,V3121位点可能为重症或死亡病例毒株的特异性...     

新余市2013年-2014年B型Yamagata系流感病毒HA1基因特性分析

目的了解2013年-2014年新余市Yamagata系乙型流感病毒的序列特性和变异特点,分析WHO推荐流感疫苗株对人体的保护情况。方法选取新余市2013年-2014年通过狗肾传代细胞(MDCK)培养分离到的Yamagata系乙型流感毒株9株,提取病毒RNA,反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增HA1基因片段,对序列进行处理和特性分析。结果 2013年-2014年的乙型流感病毒均为B型Yamagata系。9株流感毒株HA1区与疫苗推荐株B/Wisconsin/01/2010的核苷酸同源性为97.8%~99.4%,氨基酸替换数为3个~4个,其中8株均在3个相同的氨基酸位点发生变异;与代表株B/Yamagata/16/1988的核苷酸同源性为94.4%~96.2%。B/Jiangxi Yushui/1221/2014与疫苗株B/Massachusetts/02/2012的核苷酸同源性为99.3%,氨基酸替换数为3个。结论新余市2013年-2014年B型Yamagata系流感病毒都发生了抗原性变化,WHO推荐的2011年-2012年疫苗对88.89%的B型Yamagata系流感仍有预防效果,当年度的疫苗株能很好地预防另外11.11%流感的流行。     

CYP1A1、GSTT1、GSTM1基因与乳腺癌易感性的病例对照研究

目的探讨雌激素代谢通路相关基因CYP1A1、GSTT1、GSTM1与乳腺癌易感性的关系。方法采用聚合酶链反应(PCR)、限制性片段长度多态性(RFLP)及琼脂糖凝胶电泳法,对天津市360例正常女性和315例女性乳腺癌患者的CYP1A1、GSTT1、GSTM1基因及多态性进行检测,Logistic回归分析评估单基因、联合基因以及相关因素对乳腺癌的危险度。结果 CYP1A1基因、GSTT1基因、GSTM1基因在两组间分布频率有差异(χ2值分别为20.677,47.250,43.621,P=0.000)。基因型联合分析显示,随着携带危险基因型数目的增加,个体罹患乳腺癌的危险性增加(χ2=51.366,P=0.000)。多因素非条件Logistic回归分析结果显示,CYP1A1基因与体育锻炼、摄入肉类(每日多于150g)、摄入蔬菜(每日超过300g)的交互作用有统计学意义[OR(95%CI)分别为0.465(0.362～0.597)、1.559(1.344～1.808)、0.465(0.362～0.597)];GSTT1基因缺失、GSTM1基因缺失是乳腺癌的危险因素[OR(95%CI)分别为3.245(1.645～6.375)、2.462(1.818～3.334)],且GSTT1基因与体育锻炼、累计行经年数的交互作用有统计学意义[OR(95%CI)分别为1.546(1.113～2.147)、3.735(1.401～9.956)],GSTM1基因与哺乳期限、绝育手术的交互作用有统计学意义[OR(95%CI)分别为1.206(1.024～1.420)、1.690(1.353～2.111)]。结论雌激素代谢通路相关基因与乳腺癌发生有关,且其与雌激素暴露影响因素、生活方式等存在交互作用。     

母亲和新生儿GSTM1、GSTT1和细胞色素P_(450)1A1基因多态性与早产易感性关系

目的探讨母亲和新生儿GSTM1、GSTT1基因以及细胞色素P4501A1基因多态性对早产的影响。方法采用病例-对照调查方法,应用多重PCR和限制性内切酶PCR(RFLP-PCR)技术对早产母亲和对照母亲以及早产新生儿和对照新生儿GSTM1、GSTT1基因和CYP1A1基因MSPI位点多态性分别进行检测。结果GSTM1、GSTT1基因和CYP1A1基因MSPI位点多态性在早产母亲和对照母亲组中没有显著性差异(P>0.05);以上基因在早产新生儿和对照新生儿组中也没有显著性差异(P>0.05)。GSTM1与GSTT1联合基因型在母亲和新生儿的病例与对照组中也没有显著性差异(P>0.05);GSTT1缺失型和CYP1A1变异型联合基因在早产母亲组与对照母亲组中有显著性差异(χ2=4.683,P<0.05,OR=2.440)。结论携带GSTT1缺失型基因以及CYP1A1变异型基因的母亲,其发生早产的危险性增大。     

Niemann-Pick C1 Like 1研究新进展

Niemann-Pick C1 Like 1(NPC1L1)是肠道胆固醇吸收的关键蛋白,也是胆固醇吸收抑制剂依泽替米贝的分子作用靶点.NPC1L1的表达受一些核因子受体调控.敲除apoE-/-小鼠NPC1L1基因能显著抑制动脉粥样硬化的发生和发展,为动脉粥样硬化和冠状动脉性心脏病提供了新的治疗靶点.     

环境外暴露及GSTT_1、GSTM_1基因型对1-羟基芘作为多环芳烃暴露标志物的影响

目的研究多环芳烃(PAHs)暴露(环境空气暴露和吸烟)、GSTT1、GSTM1基因型对1-羟基芘(1-OHP)作为PAHs暴露标志物的影响。方法选取51名巡警作为研究组,48名内勤警察作为对照组,测定两组人群环境空气中的PAHS浓度以及尿中的1-OHP浓度,采用HPLC方法分析环境空气中PAHs浓度和研究对象尿样中的1-OHP;PCR方法测定GSTT1、GSTM1基因型。结果对照组环境PAHs浓度为12.79ng/m3,研究组为20.85ng/m3。研究组、对照组内部相同吸烟条件下GSTT1、GSTM1不同基因型人群尿中1-OHP浓度没有差别,相同基因型下的非吸烟人群中,对照组尿中1-OHP浓度均小于研究组,吸烟人群中没有发现同样的规律。按吸烟分层后,研究组、对照组内部吸烟者尿中的1-OHP浓度均大于非吸烟者,并且对照组吸烟者尿中1-OHP浓度大于研究组非吸烟者。结论PAHs暴露及吸烟是影响尿中1-OHP浓度的重要因素;在环境空气中PAHs浓度较低的情况下,吸烟对尿中1-OHP浓度的贡献更大。但GSTT1、GSTM1基因型不是影响尿中1-OHP浓度的主要因素。     

铜川市甲型流感监测流行情况

目的通过甲型流感监测,探索铜川市2009年9月-2010年1月该病流行趋势。方法实时荧光定量PCR方法 (Real-timePCR)。结果共监测476份样本,阳性184份,阳性率38.7%。结论 184份阳性标本中,甲型H1N1阳性样140份,阳性率76.1%。     

CYP1A1和GSTM1基因多态与肺癌发病关系的病例-对照研究

目的 探讨肺癌易感性标记物CYP1A1及GSTM1基因多态以及吸烟等其他环境暴露因素与肺癌发生的关系。方法 采用病例-对照研究的方法，收集原发性肺癌病例91例以及非肺部疾患的住院病例(对照)91例，所有的研究对象均采静脉血进行DNA抽提，并用PCR方法检测CYP1A1以及GSTM1基因多态，同时调查研究对象吸烟等其他环境暴露因素。应用Logistic回归分析方法进行单因素和多因素的分析。结果 无论是单因素分析还是多因素分析均未显示出CYP1A1和GSTM1基因多态与肺癌发病的关联。多因素分析结果表明：化程度的OR为0．63(95％CI：0．45～0．86)，吸烟量的OR为1．56(95％CI：1．14～2．14)，无抽油烟机的OR为3．77(95％CI：1．48～9．56)，食用动物油的OR为1．67(95％CI：1.25～2．24)，常吃胡萝卜的OR为0．47(95％CI：0．22～0．98)，饮酒的OR为6．58(95％CI：1.53～28．30)，家族肺癌史的OR为3．75(95％CI：1．64～8．58)。结论 CYP1A1和GSTM1基因多态与肺癌发病无明显的关联，吸烟、饮酒、食用动物油、家族肺癌吏以及无抽油烟机是肺癌的危险因素，而高化程度和常吃胡萝卜与降低肺癌风险有关。     

1起甲型H1N1流感暴发的调查

[目的]总结甲型H1N1流感暴发的经验、教训,为今后处理类似突发事件提供参考。[方法]采用现况调查的方法,对2009年10月发生在青岛某大学费县校区学生中的甲型H1N1流感暴发疫情进行调查。[结果]此次甲型H1N1流感暴发共发病16例,罹患率为0.28%。病例分布在2个年级、9个班,发病年龄为18-21岁,男生11例,女生5例,男女之比为2.20∶1。患者临床表现为发热、头痛、头晕、咳嗽、腰腿酸痛等症状。无明确与甲型H1N1流感病例和流感样病例接触史。[结论]这是1起发生在学校由甲型H1N1流感病毒感染引起的暴发疫情,控制措施及时有效。     

硫酸基转移酶SULT1E1、SULT1A1基因多态性与子宫平滑肌瘤易感性的关联研究

目的:探讨硫酸基转移酶SULT1E1、SULT1A1基因多态性对子宫平滑肌瘤易感性的影响。方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析法检测子宫平滑肌瘤组和对照组SULT1E1基因rs3736599位点、SULT1A1基因rs9282861位点的多态性情况。结果:①病例组和对照组SULT1E1 rs3736599位点基因型分布差异有统计学意义(P=0.032),携带突变A等位基因(基因型为A/A和A/G)女性发生子宫平滑肌瘤的风险是野生型纯合子G/G女性的3.497倍(P=0.034,OR=3.497,95%CI:1.12～10.91)。②病例组和对照组SULT1A1 rs9282861位点基因型分布差异无统计学意义。结论:硫酸基转移酶SULT1E1基因rs3736599多态性可能与子宫平滑肌瘤易感性相关,携带突变A等位基因可能是子宫平滑肌瘤的危险因素。     

Detection of CYP1A1 gene polymorphism using designed RFLP and distributions of CYP1A1 genotypes in Japanese

Isoleucine (Ile)-valine (Val) polymorphism, which is caused by a point mutation from A to G in exon 7, is reported to be associated with an elevated risk of lung cancer among Japanese. Because CYP1A1 catalyzes bioactivation of environmental procarcinogens, such as benzo[a]pyrene, it is very important to study the clinical meaning of Ile-Val polymorphism using an epidemiological study. In an epidemiological study, easy, economical, rapid and reliable identification of the CYP1A1 genotype is necessary. The present study shows that the new method, designed restriction fragment length polymorphism (designed RFLP), can detect Ile-Val polymorphism of CYP1A1 The Ile-Val polymorphism detected using this new method was consistent with that found by the allele-specific PCR amplifications (ASA) method in six cases tested. This new method detected Ile-Va1 polymorphism of CYP1A1 using 240 healthy Japanese who lived in the northern Kyusyu region. The frequency of the genotypes was as follows: Ile/Ile, 159 (66.2%); Ile/Val, 65 (27.1%); Val/Val, 16 (6.7%). The frequency of the Ile gene was 0.798 and that of the Val gene, 0.202. There was no difference in Ile-Val polymorphism based on sex or age. Racial differences influenced the distribution of this polymorphism, but Japanese regional differences did not. Since this new method, designed RFLP, is rapid, reliable and suitable for large-scale screening of polymorphisms, it may be used routinely to detect Ile-Val polymorphism of CYP1A1 Furthermore, it will help to evaluate the relationship between CYP1A1 polymorphism and individual sensitivity to xenobiotics that may affect the incidence of lung cancer.