2016-2017年我国甲型流感病毒H3N2亚型HA和NA基因的分子特征分析

目的探讨2016-2017年我国甲型流感病毒H3N2亚型血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因的分子特征,为甲型流感病毒H3N2亚型的防控提供科学依据。方法从全球共享禽流感数据库(GISAID)中获得我国2016~2017年分离的525株甲型流感病毒H3N2亚型病毒和13株H3N2亚型参考株的HA和NA基因序列。应用MEGA 6.0软件分析HA和NA的分子进化特征、氨基酸位点和耐药位点的变异情况。结果进化树分析显示13株参考株之间HA和NA氨基酸的同源性均为96.9%~99.1%。2016-2017年我国甲型流感病毒H3N2亚型的病毒株HA和NA氨基酸序列之间同源性均为96.3%~100%,HA和NA的优势亚分支均为3C.2a.1,相当一部分毒株分型不够明确。HA氨基酸变异分析显示9株发生N121E突变,103株发生N121K的突变且主要来源于2017年的香港毒株;182株发生G/R142K突变;A/Hong_Kong/3079/2017-HA和A/Guangdong-Chengguan/1383/2017-HA均发生A128I突变;NA蛋白仅3株(A/Hunan-Suxian/1980/2016-NA、A/Hunan-Yuhua/11799/2016-NA和A/Ningxia-Yuanzhou/1657/2016-NA)发现H275Y耐药位点突变。结论 2016-2017年我国甲型流感病毒H3N2亚型的HA和NA蛋白与参考株间存在一定的差异,优势亚型均为3C.2a.1;与病毒的毒力及药物相关的部分关键氨基酸位点发生变异。应密切关注H3N2病毒的分子特征,为其防控提供参考。     

吉林省2018-2020年甲型H3N2亚型流感病毒耐药基因分析

目的 掌握2018-2020年吉林省内H3N2亚型流感流行株对金刚烷胺类药物以及神经氨酸酶抑制剂类药物的耐药情况,为流感的临床治疗及预防控制提供参考依据.方法 选取甲型H3N2亚型流感毒株34株,对M2和NA基因进行PCR扩增,测序后对耐药位点进行分析.结果 2018-2020年吉林省分离到流感毒株981株,其中甲型流...     

新余市甲型流感病毒M基因进化及金刚烷胺类耐药性分析

目的分析新余市2013年-2015年甲型流感病毒M基因进化及金刚烷胺类耐药情况,为临床治疗和疾病防控提供依据。方法随机选择30株甲型流感病毒,经核酸提取、one-step RT-PCR扩增M基因片段和双向序列测定,通过DNAStar5.0和Mage5.0序列分析软件获得有关数据。结果在M基因上,16株H3N2毒株、14株新型H1N1毒株核苷酸序列的同源性分别99.2%、98.8%,且与相应的疫苗推荐株高度同源,H3N2毒株与新型H1N1毒株与相应的疫苗推荐株相比较,大部分(13/16)H3N2毒株未发生变异,所有新H1N1毒株均发生1~2个氨基酸替换;30株新余市甲型流感毒株M2蛋白第31位氨基酸位点均由丝氨酸(S)突变为天冬酰胺(N)。结论新余市2013年至2015年甲型流感毒株相同亚型间M基因同源性较高,30株甲型流感毒株均具有金刚烷胺类药物抗性,对流感病毒耐药性问题应该给予重视。     

江西省2009年至2012年甲型H3N2流感病毒耐药性分析

目的：分析江西省2009-2012年甲型H3N2流感病毒M2以及NA基因的特点,掌握其耐药情况,为临床治疗和疾病控制提供参考。方法从江西省流感监测网中随机选择19株甲型H3N2流感病毒,经核酸提取和one-step RT-PCR扩增M以及NA基因片段,双向序列测定,采用DNAStar5.0和 Mage4.0序列分析软件分析M2以及NA基因特征以及耐药性位点。结果19株毒株M2基因31位氨基酸均由丝氨酸(S)突变为天冬酰胺(N);所有毒株NA蛋白催化活性位点和辅助位点均未发生氨基酸替换。结论19株毒株均对金刚烷胺类药物耐药,对流感病毒神经氨酸酶抑制剂药物均敏感,但仍应加强对流感病毒的耐药性监测。     

甲型H1N1流感重症患者病毒血凝素和神经氨酸酶基因特性分析

目的 通过分析2009-11-02～12-04期间北京市6例甲型H1N1流感重症患者咽拭子中病毒的血凝素、神经氨酸酶基因特性,了解其基因进化特点,以期对下一步甲型H1N1流感的防控和重症的治疗提供理论依据.方法 使用实时荧光PCR方法,检测重症患者样本为甲型H1N1流感病毒阳性样本,利用测序引物扩增血凝素、神经氨酸酶基因,测定核苷酸序列,利用生物信息软件拼接序列;分析重要基因位点,对其进行基因进化、耐药性分析.结果 6件测定样本血凝素、神经氨酸酶基因与疫苗株A/California/07/2009(H1N1)核苷酸、氨基酸的同源性分别为99.2%及99.5%,有8个血凝素基因的氨基酸发生替换,为65、100、145、185、216、220、338及391位,其中145位位于抗原决定簇A区,220位位于抗原决定簇D区,同时是受体结合位点的后壁;有5个神经氨酸酶基因的氨基酸发生了替换,为59、106、232、248及365位,其中106、232、248位位于酶活性区域;未发生神经氨酸酶基因275位H→Y的替换.结论 北京市甲型H1N1流感重症患者病毒血凝素和神经氨酸酶基因与疫苗株A/California/07/2009(H1N1)高度同源,部分血凝素基因、神经氨酸酶基因有氨基酸替换,但其作用不清.所有测定样本未发生对达菲类药物的耐药性突变.     

2013～2016年东部沿海地区甲型H1N1流感病毒分子特征分析

摘要：目的：通过分析东部沿海地区（江苏、浙江和上海）甲型H1N1流感病毒［A(H1N1) pdm09］的分子特征,为防控A(H1N1) pdm09流感提供科学依据。 方法：从GISAID数据库中获得江浙沪地区2013～2016年分离的A(H1N1) pdm09病毒株和WHO推荐疫苗株的血凝素（HA）和神经氨酸酶（NA）基因序列。运用MEGA6.0软件分析HA和NA的分子特征、关键氨基酸位点和耐药位点的变异情况。 结果：进化树分析显示江浙沪地区A(H1N1) pdm09病毒株与WHO参考株的HA、NA基因序列差异较小,与WHO推荐疫苗株A/California/07/2009(H1N1)间的同源性分别为97.0%～99.5%和97.9%～99.6%;与WHO推荐疫苗株A/South_Africa/3626/2013(H1N1)间的同源性分别为98.0%～99.8%和98.6%～99.9%。病毒氨基酸变异分析显示70株A(H1N1)pdm09病毒的HA蛋白均发生83位(P83S)、203位(S203T)和321位(I321V)突变,且2016年分离株出现A195V突变;HA的裂解位点未发生变异,仍为IQSR↓GLF;2013年有2株NA蛋白出现H275Y耐药位点的变异。 结论：2013～2016年东部沿海地区A(H1N1) pdm09流感病毒的HA和NA蛋白与WHO推荐疫苗株具有高度同源性,关键的氨基酸位点发生变异与病毒的毒力及对药物的敏感性相关,因此我们要密切关注A(H1N1) pdm09病毒,防止其再次发生暴发。     

32例甲型H3N2流感病毒感染严重急性呼吸道感染病例病毒全基因组分析

目的了解北京地区严重急性呼吸道感染(SARI)病例中甲型流感病毒进化特征。方法选择2014-2016年SARI病例分离A(H3N2)亚型流感病毒毒株32株,提取病毒RNA,使用Ion Torrent PGM二代测序仪进行了病毒全基因组测序。使用Mega、Consurf等软件对毒株各个基因进行了分子进化分析和分子特征分析。结果 18株2014-2015年流行季毒株的血凝素(HA)基因属于3C.3a分支,而14株2015-2016年流行季毒株HA基因属于3C.2a分支。在32株测定株HA基因中共发现7个氨基酸位点变异,其中2个位于抗原决定簇。对神经氨酸酶基因和基质蛋白基因进行分析显示,所有的测定株均对M2离子通道抑制剂药物耐药,而对神经氨酸酶抑制剂药物敏感。结论 2014-2016年SARI病例分离A(H3N2)亚型毒株的基因特征与同时期北京地区流行株基本一致。两个流行季间出现了较为明显的抗原漂移,相对于同流行季疫苗株存在一定程度的变异。     

2015-2019年湖北省甲型H1N1流感病毒流行和进化分析

目的了解2015 — 2019年湖北省甲型H1N1流感病毒流行和进化特征、抗原表位和耐药位点突变情况。方法在中国流感监测信息系统下载流感病毒核酸检测阳性率并划分流行高峰,选取2015 — 2019年湖北省39株经实时荧光PCR检测阳性后病毒分离培养的甲型H1N1流感病毒株并测序,另在全球流感共享数据库下载13株湖北省毒株序列,采用生物信息学软件分析其进化簇分布、抗原表位和耐药突变位点,通过三维建模,分析其突变位点结构。结果2015 — 2019年湖北省甲型H1N1流感病毒每年流行高峰持续长达11～14周,流行强度逐年增加,在血凝素（HA）、神经氨酸酶（NA）进化树6B簇内进化出6B.1A到6B.1A7等多个分支,发现12处HA抗原表位突变位点和2处NA基因耐药位点,其中毒力标签D222G和耐药位点I223V三维模拟结构差异明显。结论2015 — 2019年甲型H1N1流感病毒流行强度不断提高,进化出多个分支簇,零星检出毒力标签和耐药突变位点,该分析有助于提高湖北省流感病毒流行病学和基因进化监测水平。     

2013年宜春市甲型H1N1流感病毒分离鉴定及HA基因分子进化分析

目的 对2013年江西省宜春市甲型H1N1流感病毒HA基因序列及其编码的氨基酸序列进行分子进化分析,为防控甲型H1N1流感大流行和常规监测提供科学根据。方法 随机选择11株2013年宜春市疾病预防控制中心流感监测实验室分离到的甲型H1N1流感病毒毒株,提取病毒RNA,One-step RT-PCR扩增HA基因并双向测序。以世界卫生组织疫苗推荐株A/California/07/2009(H1N1)(GenBank:CY121680)和几株国内外近几年分离的流感甲型H1N1毒株的HA基因为参考序列,采用DNAStar 7.0和Mega 5.0软件对HA基因及其编码的氨基酸序列进行比对,绘制分子进化树,进行HA变异分析。结果 2013年宜春市11株所测甲型H1N1流感病毒与疫苗推荐株亲缘性较近,进一步参考几株国内外近几年分离到的流感甲型H1N1毒株,HA没有发生较大变异;其HA基因序列二硫键、糖基化位点未发生变异;尽管有7株毒株同时在抗原决定簇区A区和受体结合位点130环或其附近发生单个位点氨基酸替换变异,但未形成流行病学变异新种。结论 目前的甲型H1N1流感疫苗仍对人群有保护作用,而抗原决定簇和受体结合位点的变异提示仍需要密切关注甲型H1N1流感的再次流行。     

新余市甲型H1N1流感病毒H275Y突变监测

目的分析2013年-2014年新余市甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶(NA)第275位氨基酸变异情况,掌握甲型H1N1流感病毒耐药特性。方法收集新余市流感监测哨点医院的流感样病例的咽拭子标本,采用狗肾传代细胞(MDCK)对标本进行病毒分离,随机选择15株甲型H1N1流感病毒进行核酸提取,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒NA基因部分片段,应用限制性内切酶片段长度多态性分析(RFLP)方法进行酶切分析。结果新余市15株甲型H1N1流感病毒中,仅有A/江西渝水/SWL1220/2014(H1)发生了H275Y突变,它具有Oseltamivir耐药性。结论新余市绝大多数甲型H1N1流感毒株对Oseltamivir敏感,但仍有必要持续监测和防范Oseltamivir耐药毒株的出现。     

流感病毒变异及流感监测技术

流感与禽流感病毒的类型繁多，极易产生变异，其监测技术是预防和控制流感流行的重要途径。本文对不同流感病毒的变异类型及其机制进行了分析，介绍了流感病毒监测的常用技术，讨论了生物学技术和地理信息系统监测技术及其应用前景。     

Peramivir for the treatment of influenza

Peramivir (BioCryst Pharmaceuticals) is a novel investigational intravenous neuraminidase inhibitor that exhibits potent antiviral activity against influenza A and B viruses. Peramivir is created by a structure-based drug design and consists of a cyclopentane backbone with a positively charged guanidinyl group and lipophilic side chains. Peramivir was made available in the USA through the Emergency Investigational New Drug regulations and under an Emergency Use Authorization for hospitalized patients with known or suspected influenza during the 2009 H1N1 influenza pandemic. In trials involving ambulatory adult subjects, intravenous peramivir is safe and has a pharmacokinetic profile that supports once-daily dosing. The drug is licensed in Japan and South Korea and is currently undergoing Phase III trials in the USA. Viral resistance mechanisms to peramivir have not been fully delineated and ongoing surveillance is important. Given the serious health threat of influenza at all ages and limitations in vaccine delivery, peramivir is a promising addition to the currently limited treatment options for the treatment of severe influenza infection.     

广西流感与人禽流感监测网络的建立和运行效果

目的 建立广西流感与人禽流感监测网络并了解运行效果.方法 对广西2004-2006年哨点医院流感样病例监测数据、流感样病例爆发疫情监测数据、实验室病原学监测数据进行分析.结果 2004-2005年度监测医院流感样病例每周平均为291.72例,就诊百分比为18.39%;2005-2006年度监测医院流感样病例每周平均为158.59例,就诊百分比为8.16%.2004-2005年度检测流感样病例标本280份,分离出15株毒株,阳性率5.36%,其中H1N1亚型13株(86.67%),H3N2亚型2株(13.33%);2005-2006年度检测流感样病例标本3115份,分离出381株毒株,阳性率12.23%,其中H1N1亚型40株(10.50%),H3N2亚型115株(30.18%),B型为226株(59.32%).结论 广西流感与人禽流感监测网络已建立并能提供可靠的监测数据.     

禽流感的再认识

近年来，高致病禽流感H5N1亚型在亚洲造成禽类流感流行和人禽流感病的发生，给各国带来严重的经济损失。故，本着防止该病在世界范围内大流行的宗旨，本文对其流行病学、病原学、临床特征、治疗与预防进行了再认识。     

The virosomal adjuvanted influenza vaccine

Importance of the field: The protection conferred by influenza vaccines varies for several reasons, for example the age or degree of immune depression of the recipient. All currently available seasonal influenza vaccines are safe and substantially effective in preventing influenza in healthy people. However, elderly people and patients with chronic diseases or immune system defects need a more effective vaccine to avoid serious risks from influenza and its complications. Research has been undertaken to improve the efficacy of vaccination. Recent research includes the use of new adjuvants or antigen-presenting strategies.

Areas covered in this review: The virosomal adjuvanted subunit influenza vaccine has been studied in groups for whom vaccination is recommended. We describe virosomal technology, including production and mode of action, as well as the available efficacy, immunogenicity and safety data, with the aim of understanding the benefits of this vaccine's use.

What the reader will gain: A review of published data on efficacy, immunogenicity and safety from sponsor- and investigator- driven studies, focusing on recent publications.

Take home message: The vaccine was generally very immunogenic and safe in all investigated populations. Its ability to induce protective antibody titers has been shown to exceed that of conventional influenza vaccines in elderly people and individuals with little or no prior exposure to the viral strains.     

Preparing for pandemic influenza: revisit the basics

Aims and objectives. This paper attempts to address the global concern of the possible pandemic of influenza and avian influenza. In doing this, some unfounded beliefs related to influenza vaccines and antiviral treatment and prophylaxis are explored. This study also describes the essential measures for getting prepared. Background. Based on the current epidemiology, availability of vaccines, antiviral prophylaxis and treatment and experience from SARS outbreak, the authors suggested that basic infection control measures should be emphasized to prepare for the pandemic. These measures include personal and environmental hygiene, surveillance and infection control precautions and education. Conclusion. The authors provide evidence and explanations to demystify pandemic influenza and recommend measures that help to prevent cross infection. Relevance to clinical practice. Although the preparedness is everyone's business, nurses play a crucial and indispensable role in this exercise. With prepared personnel, facilities and good infection control practices, nosocomial spread of the disease and pandemic can be prevented.     

2007-2009年广西壮族自治区流行性感冒监测结果分析

目的监测广西流行性感冒(流感)流行状况和流感病毒优势株的变化,探索广西流感流行规律。方法在国家级哨点医院,对流感样病例进行逐日统计,对符合条件的流感样病例进行采样,采用细胞培养法分离鉴定流感病毒。结果2007-2009年广西流感监测医院的流感样病例以春、夏季高峰明显。2007-2009年广西流感监测医院的流感样病例数占门诊总病例数的年平均数分别为11.34%、12.45%和7.10%。2007年分离134株流感病毒,其中B型58株,A型H3N2亚型69株,H1N1亚型7株。2008年分离82株流感病毒,其中B型33株,A型H3N2亚型30株,H1N1亚型19株。2009年分离1737株流感病毒,其中B型192株,A型H3N2亚型176株,H1N1亚型74株,甲型H1N1295株。结论2007-2009年广西流感监测医院的流感样病例全年均有发生,以春、夏季为高发季节。2007、2008年的主要流行株都为H3N2亚型和B型流感毒株,2009年的主要流行株为甲型H1N1流感毒株。     

2002～2004年云南省流感监测结果分析

目的监测流感流行趋势,了解监测点正常人群流感的抗体水平。方法用鸡胚和MDCK细胞分离病毒,用血凝抑制试验半加敏法鉴定分离毒株和测定血清抗体。结果3年来云南省人群中流行的是A3型和B型流感毒株,正常人群对所有流感流行株抗体的总阳性率在15.33%～99.33%之间。结论不同型别的毒株表现出交替占优势的特征,人群流感抗体水平的消长与优势株的型别一致。     

一种基于流感哨点监测的流感预警分析方法

目的 探讨利用流行性感冒(流感)哨点监测网络数据开展流感流行的预警方法。 方法 选择流感监测质量较稳定的年份,计算各周相应的流感样病例(ILI)占哨点监测医院门诊就诊病例总数的比例(ILI%)和流感病毒检出阳性率及两者的相关性,利用流感病毒检出阳性率超过流行季峰值的40%界定流行高峰,换算出相应的ILI%预警阈值开展流感疫情预警工作。 结果 舟山市2010年全年门诊就诊的ILI%平均为1.62%(95%CI:1.43%~1.82%),流感病毒检出阳性率平均为26.77%(95%CI:20.06%~33.49%),流感高峰出现时的流感病毒检出阳性率界值为32.31%,换算成ILI%=1.73%作为流感疫情预警阈值。 结论 利用ILI%作为流感疫情的预警指标简单易行、灵敏特异,适用于建立运行流感样病例监测点的基层机构开展流感预警工作。     

2006-2007年浙江省杭州市聚集性流感样病例疫情特征

目的了解杭州市流行性感冒（流感）样病例疫情流行特点。 方法通过杭州市流感监测网络,收集整理流感样病例疫情资料;利用反转录-聚合酶链反应技术检测流感病毒。 结果2006-2007年共发生流感样病例疫情67起,流感样病例2703例,总罹患率为3.77%。各起疫情平均报告时间为5 d。2006年疫情平均持续时间为6 d,2007年为13 d, 差异有统计学意义（Iu/I=-4.37,IP/I＜0.05）。2006-2007年疫情发生时共采样186份,其中阳性126份,阳性率为67.74%。2006年流行株为B型, 2007年为A型H3亚型。 结论2006年及2007年杭州市流感流行表现为散发及局部暴发,2年流行的毒株不同。