海南汉族居民胃十二指肠疾病与幽门螺杆菌cagA,vacA和babA2基因型的关系

目的 调查海南汉族慢性胃炎、消化性溃疡、胃癌患者中幽门螺杆菌(Helicobacter pylori, H.pylori) babA2、cagA、vacA基因型和亚型的分布，探讨H.pylori基因型差异与临床感染结局的关系。方法 自176例胃十二指肠疾病患者的胃镜活检胃黏膜标本中分离幽门螺杆菌菌株,提取幽门螺杆菌DNA,用聚合酶链反应检测H.pylori的cagA、vacA（vacAs1/ vacAs2/ vacAm1/ vacAm2）及babA2基因型。 结果 176例患者中H.pylori cagA的阳性率72.72%（128/176）；babA2 54.55%（96/176）；vacAs1 73.30%（129/176）；vacAm2 67.05%（118/176）；vacAs1/cagA 65.34%（115/176）；vacAs1/babA2 51.70%（91/176）；cagA/babA2 50.00% (88/176)；vacAs1/cagA/babA2 51.14% (90/176)。慢性萎缩性胃炎、消化性溃疡和胃癌患者中vacAs1、cagA、cagA/ vacAs1基因型阳性率明显高于慢性浅表性胃炎患者(P<0.05)。其他基因型在各疾病间分布的差异无统计学显著性意义(P>0.05)。结论 海南汉族H. pylori感染的优势基因型为cagA, vacAsl, vacAm2, cagA/vacAs1。慢性萎缩性胃炎、消化性溃疡、胃癌患者中vacAs1、cagA 、cagA/vacAs1基因型更多见。未发现babA2基因型与H.pylori临床感染结局的相关性。 【关键词】 幽门螺杆菌 cagA基因 vacA基因 babA2基因 聚合酶链反应     

幽门螺杆菌vaeA cagA基因亚型与抗生素耐药的关系

[仇军文,胡家露,吴开春,彭道荣,施炳龙,季万胜,樊代明.世界华人消化杂志,2001;9(7):739-742] 目的研究幽门螺杆菌(H.pylori)cagA vacA基因亚型及其与抗生素耐药的关系.方法用琼脂稀释法测定50例H.pylori 临床分离株对克拉霉素,阿莫西林,替硝唑,甲硝唑的最低抑菌浓度(MIC),并计算MIC50和MIC90值.用多重PCR鉴定H.pylori菌株的vacA(sla,slb,s2,ml,m2)及cagA的型别.结果克拉霉素,阿莫西林,替硝唑,甲硝唑对H.pylori的MIC52和MIC90分别为:＜0.01 6 mg@L-1,0.016 mg@L1;0.016 mg@L-1,0.047 mg@L-1;16.000 mg@L-1,52.000 mg@L :25.140 mg@L -1 ,76.800 mg@L-1.H.pylori菌株对克拉霉素,阿莫西林,替硝唑,甲硝唑的耐药率分别为0%,0%,20%和38%.在对替硝唑敏感的H.pylori菌株中,vacA sla,slb和s2型分别占50.0%,42.5%和7.5%;vacA ml和m2型占60.0%和40.0%;vacA sla/ml,slb/ml,sla/m2,slb/m2和s2/m2型分别占32.5%,27.5%,17.5%,15.0%和12.5%;cagA-和cagA型为87.5%和12.5%.在对替硝唑敏感的H.pylori菌株中,vacA sla,slb和s2型分别占50.0%,40.0%和10.0:vaccAml和m2型占40.0%和60.0%;vacA sla/ml,slb/ml,sla/m2,slb/m2和s2/m2型分别占20.0%.,20.0%,30.0%.20.0%和10.0%;cagA+和cagA-型为80.0%和20.0%.结论 H.pylori菌株对甲硝唑的耐药率明显高于H.pylori 对克拉霉素,阿莫西林,替硝唑的耐药率,不同cagA vacA基因亚型的H.pylori菌株对替硝唑的耐药率无显著差异. (潘伯荣)     

西安地区幽门螺杆菌cagA、cagE、vacA基因型与上消化道疾病的关系

目的:探讨西安地区就医人群幽门螺杆菌(HP)菌株vacA、cagA、cagE基因型与上消化道疾病的关系。方法:选取胃粘膜活检组织中分离培养到幽门螺杆菌的消化性溃疡58例,慢性胃炎30例,采用标准酚-氯仿抽提法提取HP基因组DNA,检测幽门螺杆菌cagA、cagE、vacA在消化性溃疡及慢性胃炎患者胃组织中的表达。结果:88株幽门螺杆菌中cagA的阳性率为100%,cagE的阳性率为100%,vacA s1/m-的阳性率为17.0%,vacA s1/m1a的阳性率为2.3%,vacA s1/m1a+m1b的阳性率为1.1%,vacA s1/m1a+m2的阳性率为1.1%,vacA s1/m2的阳性率为55.7%,vacA s1/m1b+m2的阳性率为1.1%,vacA s1/m1b的阳性率为17.0%,vacA s2/m2的阳性率为2.3%。结论:西安地区就医人群培养分离的HP菌株中,cagA和cagE阳性率均为100%,与本地区疾病类型和严重程度不相关,不能作为西安地区HP毒力强弱的标志。西安地区就医人群幽门螺杆菌菌株的vacA基因型以s1/m2为主,但vacA各基因亚型均与临床结局无相关性。     

Dominant cagA/vacA genotypes and coinfection frequency of H. pylori in peptic ulcer or chronic gastritis patients in Zhejiang Province and correlations among different genotypes, coinfection and severity of the diseases

Background Almost half of the world’s population suffer from the Helicobacter pylori (H. pylori) infection, but only some individuals develop gastric diseases with clinical symptoms. One reason for the phenomenon may be the different pathogenicity of infected H. pylori strains. The presence of cytotoxin-associated gene A (cagA) and expression of vacuolating cytotoxin activity encoded by vacuolating cytotoxin gene A (vacA) are considered the two major virulent markers of H. pylori. The aim of this study was to detect dominant cagA/vacA genotypes and coinfection frequency of H. pylori in patients with peptic ulceration (PU) or chronic gastritis (CG), and to determine correlations among different cagA/vacA genotypes, coinfection and severity of the diseases. Methods For each of 139 patients in Zhejiang Province who had been diagnosed as PU or CG based on clinical symptoms and gastroscopy, two gastric biopsy specimens (one from antrum and the other from corpus) for H. pylori isolation were taken by two different disinfected biopsy forceps. One hundred and fifty-six H. pylori strains were isolated from both the antrum and corpus biopsy specimens of 78 patients (36 PU and 42 CG). PCRs were performed to detect cagA genes, and signal (s) and middle (m) regions of vacA genes in the H. pylori isolates. The amplified fragments of dominant vacA gene s and m subtypes from representative H. pylori isolates were sequenced after TA cloning. Dominant cagA/vacA genotypes of the H. pylori isolates, coinfection frequency and correlations among the different genotypes, coinfection and severity of the diseases were determined.Results Of the H. pylori strains isolated from the antrum specimens, 96.2% were cagA gene positive, as were 97.4% of the H. pylori strains isolated from the corpus specimens. Only one s region subtype (s1a) and four m region subtypes m1, m2, m1b and m1b-m2 of vacA gene were found. The proportions of vacA gene subtypes s1a/m1, s1a/m2, s1a/m1b and s1a/m1b-m2 in the 83 strains isolated from the antrum specimens were 7.2%, 61.5%, 30.1% and 1.2%, respectively, while those in the other 84 strains isolated from the corpus specimens were 9.5%, 58.3%, 28.6% and 3.6%, respectively. s1a/m2 (58.3% vs 30.1%, χ2=13.47, P&lt;0.01) and then s1a/m1b (28.6% vs 9.5 %, χ2=9.88, P&lt;0.01) were the dominant vacA gene subtypes in the H. pylori isolates. The dominant H. pylori genotype was cagA+s1a/m2 (59.0% from antrum specimens and 57.1% from corpus specimens), and followed by cagA+s1a/m1b (28.9% from antrum specimens and 27.4% from corpus specimens). Sixteen of 78 patients (20.5%) were infected with two or three H. pylori strains with different genotypes. However, no statistically significant differences among cagA occurrence, the different vacA subtypes and PU or CG could be found (each P&gt;0.05). Similarities of the nucleotide sequences from vacA gene s region PCR products of six isolates and from vacA gene m region PCR products of four isolates were 93.2% to 98.3% and 93.8% to 97.6%, respectively, compared to the reported corresponding sequences.Conclusions The dominant genotypes of H. pylori in PU or CG patients in Zhejiang area may be cagA+ s1a/m2 and cagA+ s1a/m1b. Numerous coinfections with different H. pylori strains in PU or CG patients indicate diversity of the infected H. pylori origins. s and m regions of vacA gene from different H. pylori isolates show high nucleotide sequence similarities. cagA gene positive rate, different vacA gene subtypes and coinfection with different H. pylori strains are not closely associated with severity of the diseases.     

海口地区胃十二指肠疾病患者幽门螺杆菌vacA基因亚型分析

目的 探讨幽门螺杆菌(H.pylori)vacA基因亚型在海口地区胃十二指肠疾病患者中的分布.方法 从176例胃十二指肠疾病患者胃黏膜标本中分离培养H.pylori,PCR法测定vacA基因亚型.结果 176例患者中的基因型vacAs1 78.98%(139/176),vacAs2 15.34%(27/176),vacAm1 28.41%(50/176),vacAm2 71.59%(126/176);vacA亚型组合形式为:vacAs1/ml 28.41%(50/176),vacAs1/m2 56.25%(99/176),vacAs2/m2 15.34%(27/176),未发现va-cAs2/ml型菌株;消化性溃疡、胃癌、慢性萎缩性胃炎患者H.pylori的vacAs1、vacAm2、vacAs1/m2基因型阳性率高于慢性浅表性胃炎患者(均P<0.01),其余基因型在不同类型疾病中的分布无统计学差异(P>0.05).结论 海口地区胃十二指肠疾病患者H.pylori菌株的优势基因型为vacAs1、vacAm2、vacAs1/m2;在消化性溃疡等严重疾病患者中多见.     

幽门螺杆菌vacA及cagA基因型与胃疾病的关系

目的探讨幽门螺杆菌(Hp)vacA、cagA基因型与胃疾病的关系。方法选取105例胃疾病病人,包括慢性浅表性胃炎(CSG)45例,慢性萎缩性胃炎(CAG)48例,胃癌(GC)12例。于胃窦处取3块胃黏膜,分别进行快速尿素酶反应、病理检查和聚合酶链反应(PCR)。提取胃黏膜基因组DNA,用6对引物检测Hp vacA、cagA基因的表达。结果快速尿素酶反应、病理检查均阳性的标本57例,Hp的阳性率为54.2%(57/105)。Hp vacA s1/m2、s1/m1、s2/m1、s2/m2的阳性率分别为53%(30/57)、18%(10/57)、8%(5/57)、21%(12/57);Hp cagA的阳性率为89%(51/57)。vacA、cagA基因型在CSG、CAG和GC之间差异无显著性(P>0.05)。结论Hp菌株的优势基因亚型为Hp cagA、vacA s1/m2;Hp vacA、cagA基因与特定胃疾病间无显著相关性,不能预示Hp感染的临床结果。     

幽门螺杆菌阳性胃癌中vacA基因型的分布及其与MEX3A表达的关系

目的 探讨辽宁地区幽门螺杆菌(H.pylori)阳性胃癌患者的癌组织中细胞空泡毒素基因A (vacA)优势基因型分布及其与肌肉增生蛋白3A (MEX3A)表达的关系。方法 选择2011年至2014年沈阳医学院附属中心医院外科手术切除的胃癌石蜡包埋病理标本98例,利用GT pure^TM FFPE tissue DNA Extraction Kit提取DNA;利用PCR检测不同vacA基因型分布情况,用免疫组织化学染色法检测胃癌组织中MEX3A蛋白的表达情况,并分析二者的关系。结果 在H.pylori阳性胃癌中vacA s1、vacA m1、vacA s1m亚型分布高于其他vacA亚型(P <0.05),其中,vacA m1亚型与MEX3A表达密切相关(P <0.05)。MEX3A表达情况与肿瘤分化程度有关,差异有统计学意义(P <0.05)。结论 在辽宁地区H.pylori阳性胃癌患者的癌组织中,vacA m1为优势基因亚型,且表达与MEX3A有关,可能通过参与转录后调控相关细胞信号通路而影响胃癌发生、发展。     

浙江省幽门螺杆菌cagA、vacA基因型的流行病学研究

目的 调查浙江地区幽门螺杆菌(helicobacter pylori,Hp)基因型的分布及其与临床疾病的关系.方法 采用特异引物聚合酶链反应(PCR)分析262株幽门螺杆菌的vacA基因多态性分布特点,并对其进行初步统计分析.结果 浙江8个地区分离培养的Hp菌株262株,VacA m1b基因型占27.10%(71/262);VacA m2基因型占64.89%(170/262);VacA m1b-m2基因型占4.20%(11/262);不同地区间VacA s区基因型和VacA m区基因型分布差异无统计学意义(P＞0.05).慢性胃炎分离株中VacA m1b基因型占26.47%(27/102);VacA m2基因型占66.67%(68/102);VacA m1bm2基因型占2.94%(3/102).消化性溃疡分离株中VacA m1b基因型占29.41%(40/136);VacA m2基因型占61.76%(84/136);VacA m1bm2基因型占3.68%(5/136).胃癌分离株中VacA m1b基因型占16.67%(4/24);VacA m2基因型占75.00%(18/24);VacA m1bm2基因型占4.17%(1/24).不同临床疾病间VacA m区基因型分布差异无统计学意义(P＞0.05).结论 浙江8个地区Hp菌株的优势基因型为cagA 、vacAs1/m2,vacA的s区和m区的分布与分布个体的临床类型无关.     

西安地区幽门螺杆菌vacA基因型与致病性研究

目的:探讨幽门螺杆菌菌株vacA基因型与上消化道疾病的关系。方法:从胃十二指肠疾病患者的胃粘膜活检组织中分离培养到幽门螺杆菌88株。按标准酚-氯仿抽提法提HP基因组DNA。用PCR扩增反应及鉴定,用卡方检验分析vacA在不同胃十二指肠疾病中幽门螺杆菌的差异。结果:88株幽门螺杆菌中vacA s1/m-的阳性率为17.0%,vacA s1/m2的阳性率为55.7%,vacA s1/m1a+m2的阳性率为1.1%,vacA s1/m1a的阳性率为2.3%,vacA s1/m1a+m1b的阳性率为1.1%,vacA s1/m1b+m2的阳性率为1.1%,vacA s1/m1b的阳性率为17.0%,vacA s2/m2的阳性率为2.3%。结论:西安地区幽门螺杆菌菌株的vacA基因型以s1/m2为主,但vacA各基因亚型均与临床结局无相关性。     

盐城市幽门螺杆菌感染及vacA和cagA基因型的流行特征及其与常见胃肠疾病的关系

目的：研究盐城市幽门螺杆菌（Helicobacter pylori,Hp）感染的流行特征,并探讨Hp的vacA和cagA基因型与常见胃肠疾病的关系。方法：取江苏盐城确诊的1 892例常见胃肠疾病的近幽门胃黏膜组织,培养菌株,提取基因组DNA,采用PCR法检测Hp的vacA和cagA基因型。结果：2 682例消化病患者,胃肠疾病确诊率为70.54%,发病率男性高于女性（P < 0.01）;1 892例样本,胃肠疾病Hp总感染率为41.81%,良性胃肠疾病Hp感染率之间无差异（P > 0.05）,胃癌低于良性胃肠疾病,差异显著（P < 0.05）;各县区Hp的临床感染,市区感染率低于其他县区（P < 0.05）,而各县区无差异（P > 0.05）;Hp基因型中,cagA阳性率盐城地区为88.85%,各市县区无差异（P > 0.05）,响水达95.92%,与最高的射阳相比较,差异显著（P < 0.05）;vacA阳性率各县市区无差异（P > 0.05）;cagA和vacA均为阳性、cagA阳性而vacA阴性、cagA阴性而vacA阳性三者各县市区比较,均无差异（P > 0.05）。盐城市Hp的vac基因亚型中,各市县区均无差异（P > 0.05）。胃溃疡、复合性溃疡、胃癌和胃淋巴瘤与其他胃肠病之间,Hp的cagA阳性率比较,有差异（P < 0.05）,Hp的vacA阳性率比较,差异亦显著（P < 0.01）,Hp的cagA和vacA均为阳性比较,差异显著（P < 0.01）,而Hp的cagA阳性和vacA阴性的比率及Hp的cagA阴性和vacA阳性的比率比较,差异无意义（P > 0.05）,各种胃肠病Hp感染的vac基因亚型,各种胃肠病之间经统计学处理无差异（P > 0.05）;s1b阳性率经统计学处理无差异（P > 0.05）。结论：盐城胃肠疾病发病率男性高于女性;盐城地区市区Hp感染率低于其他县区;盐城地区Hp的vacA和cagA亚型以cagA 、vacA均阳性和cagA阴性而vacA阳性两种形式存在。     

中国镇江地区幽门螺杆菌vacA基因型状况及其与胃十二指肠疾病关系的研究

目的：调查中国镇江地区幽门螺杆菌（H．pylori）vacA基因型状况及其与胃十二指肠疾病关系。方法：在微氧环境下取胃黏膜标本中分离培养出H．pylori共36株,以聚合酶链反应（PCR）方法检测其基因组DNA中vacA基因型。结果：36株H.pylori临床株中vacA信号序列类型中sla、s2所占比例分别为83．3％、13．9％,未发现slb型。vacA中间序列类型中m1、m2所占比例分别为16．7％、75％。分别有1株和3株vacA信号序列和中间序列未能分型。基因型组合sla／m2、sla／m1、s2／m2所占比例分别为61．1％、19．4％、8．3％。Hpylori菌株vacA各基因型在胃炎、胃溃疡、十二指肠溃疡和胃癌四组疾病中的分布差异均无显著性（P〉0．05）。结论：sla、m2和sla／,m2分别是中国镇江地区Hpylori菌株vacAs、m区及其组合的优势基因型。但本研究未能证实H．pylori菌株vacA基因型与胃十二指肠疾病的相关性。     

人胃黏膜幽门螺杆菌基因亚型检测与胃疾病

目的 探讨利用胃黏膜直接提取DNA检测幽门螺杆菌(Hp)基因亚型,以进行临床Hp感染判定的可行性,并进而探讨各基因亚型Hp感染与胃疾病的关系.方法 选取已知病理诊断的胃黏膜活检标本217例,进行细菌培养,同时提取黏膜Hp-DNA及菌种DNA,利用聚合酶链反应分别检测幽门螺杆菌ureB、cagA、vacA、iceA和baba2基因亚型.结果 胃黏膜来源HP-DNA与菌种来源Hp-DNA检测ureB、cagA、vacAs1、vacAm1b、vacAm2、iceA1、iceA2和baba2亚型,两者符合率分别为74.23%,73.39%,93.69%,62.16%,78.16%,89.13%,88.37%和75%,差异均无统计学意义(P＞0.05).各疾病组间,幽门螺杆菌ureB、cagA、vacAs1、vacAm1b、iceA1、iceA2和baba2亚型分布频率差异均无统计学意义(P＞0.05);vacA s1m1基因型在浅表性胃炎组(22.22%)分布频率最高,与萎缩性胃炎组(5.71%)相比,差异有统计学意义(x2=8.416,P=0.004);vacA slm2基因型在萎缩性胃炎组(47.14%)分布频率最高,与浅表性胃炎组(18.89%)相比,差异有统计学意义(x2=13.336,P=0.000).结论 胃黏膜直接提取DNA检测Hp基因型可以用于Hp感染的快速诊断.VacA s1m1基因型与浅表性胃炎相关,VacA s1m2基因型与萎缩性胃炎相关.     

PCR方法测定幽门螺杆菌vacA基因型和cagA基因

目的建立幽门螺杆菌vacA基因型和cagA基因的PCR测定方法.方法应用多聚酶链反应方法对62例慢性胃炎、消化性溃疡和胃癌患者分离获得幽门螺杆菌菌株的vacA基因型和cagA基因进行测定.结果62株幽门螺杆菌菌株均具有vacA基因,所有菌株的vacA基因型均为sla/m2型.cagA基因的总阳性率为56.45%;慢性胃炎、消化性溃疡和胃癌患者分离获得幽门螺杆菌的cagA基因阳性率分别为55.56%、54.17%和63.64%(P＞0.05).结论本研究建立的PCR测定幽门螺杆菌vacA基因型和cagA基因方法敏感性高、特异性强.     

Lack of correlation of vacA genotype, cagA gene of Helicobacter pylori and their expression products with various gastroduodenal diseases

目的　研究幽门螺杆菌vacA基因型、cagA基因 ,空泡形成细胞毒素和血清CagA抗体与胃十二指肠疾病的关系。　方法　应用多聚酶链反应方法对 6 2例慢性胃炎、消化性溃疡和胃癌患者分离获得幽门螺杆菌菌株的vacA基因型和cagA基因进行测定 ;应用Hela细胞方法测定体外空泡形成细胞毒素活性 ;应用酶免疫测定方法检测同一患者的血清CagA抗体。结果　 6 2株幽门螺杆菌菌株均具有vacA基因 ,所有菌株的vacA基因型均为sla/m2型。cagA基因的总阳性率为5 6 4 5 % ;慢性胃炎、消化性溃疡和胃癌患者分离获得幽门螺杆菌的cagA基因阳性率分别为 5 5 5 6 %、5 4 17%和6 3 6 4 % (P >0 0 5 )。空泡形成细胞毒素的阳性率为 37 10 % ,慢性胃炎、消化性溃疡和胃癌患者分离获得幽门螺杆菌菌株表达空泡形成细胞毒素的阳性率分别为 33 33%、2 9 17%和 6 3 6 4 % (P >0 0 5 )。慢性胃炎、消化性溃疡和胃癌患者血清CagA抗体分别为 70 37%、79 17%和 4 0 0 0 % (P >0 0 5 ) ,血清CagA抗体的总阳性率为 6 8 85 %。结论　幽门螺杆菌vacA基因型、cagA基因、空泡形成细胞毒素和血清CagA抗体不能预示H pylori感染个体将更可能发生何种类型胃十二指肠疾病。     

胃癌组织幽门螺杆菌vacA基因型的分布及其与CDX2表达的关系

目的筛查辽宁地区胃癌患者幽门螺杆菌(Helicobacte pylori,H.pylori)vacA优势基因型并了解其对CDX2表达的影响,为胃癌的发生机制及因型施治提供实验室依据。方法采用GT pureTMFFPE tissue DNA Extraction KIT试剂盒提取173例H.pylori阳性石蜡包埋胃癌组织的DNA;采用PCR检测H.pylori不同vacA基因型分布情况,采用免疫组化方法检测胃癌组织CDX2蛋白表达。结果在胃癌中vacAs1,vacAm1,vacAs1m1亚型分布高于其他亚型(P0.05),其中vacAm1,vacAs1m1与肿瘤分化程度密切相关,二者在高分化组的分布低于中低分化组(P0.05),vacAm1在男性患者中分布高于女性(P0.05);年龄大于60岁、高分化和肠型胃癌与CDX2的表达呈正相关(P0.01);CDX2的低表达与vacAm1,vacAs1,vacAs1m1基因型密切相关(P0.05)。结论 vacAm1,vacAs1与vacAs1m1是辽宁地区胃癌发生的优势基因型,vacAs1m1阳性的H.pylori患者及男性vacAm1 H.pylori阳性感染者可能抑制CDX2的表达进而促进胃癌的恶性分化。     

中国幽门螺杆菌vacA基因型标签序列与VacA活性关系的分子系统发育分析

目的探讨中国幽门螺杆菌vacA基因s、m和i区氨基酸序列分子系统发育关系及其对VacA活性的影响。方法从GenBank数据库中下载所有中国幽门螺杆菌VacA全长氨基酸序列,利用ClustalX 2.0和MEGA 5.05软件对vacA基因s、m和i区氨基酸序列及VacA全长氨基酸序列进行生物信息学分析,构建分子系统发育树。结果中国幽门螺杆菌无毒弱毒株vacA基因型全为s1/m2/i1型,而强毒株除Ch2菌株为m1-m2杂合型之外,全为s1/m1/i1型,s1型和i1型强相关。分子系统发育分析显示,中国幽门螺杆菌vacA基因s、m和i区氨基酸序列都呈现明显的地理特异性,其中m区分子系统发育树能够将VacA强毒株和无毒弱毒株分开,而s和i区分子系统发育树则不能将两者完全分开。结论 vacA基因m区氨基酸序列更适合作为中国幽门螺杆菌VacA的毒力标志。     

幽门螺杆菌VacA基因型与胃疾病

目的:探讨幽门螺杆菌(H.pylori)VacA基因型在各种胃肠疾病中的分布及关系.方法:从胃十二指肠疾病患者胃粘膜标本中分离培养H.pylori,PCR测定VacA基因型.结果:108株H.pylori菌株,VacA s1a阳性为85株(79%),VacA s1b阳性22株(20%),VacA m1阳性29株(27%),VacA m2阳性77株(71%),VacA s1a/m2阳性66株(61.1%),未发现s2型菌株.其中,慢性胃炎患者VacA s1a阳性率为65.4%(34/52),消化性溃疡患者VacA s1a阳性率为90%(36/40),胃癌患者VacA s1a阳性率为94%(15/16).结论:H.pylori菌株VacA基因型绝大多数为s1a/m2型,该型菌株存在于各种胃肠疾病中,无s2型.     

对中国4个不同地区幽门螺杆菌菌株的多位点序列分析研究

目的 了解国内4个不同地区(北京、上海、重庆和广州)收集的幽门螺杆菌(H.pylori)临床株的遗传背景和可能的来源.方法 从胃肠疾病患者黏膜标本中分离培养幽门螺杆菌,应用多位点序列分析(multilocus sequence typing, MLST)对鉴定阳性的菌株进行ST分型比较,并且以PCR方法测定vacA基因型.结果 30株临床分离的幽门螺杆菌菌株,vacAs1a阳性25株(83.3 %),vacA s1b阳性5株(16.7 %),vacA m2阳性为30株(100 %),未发现s2型菌株,其中标准株NCTC11637为vacAs1a/ m1型.共确定了28种ST型.结论 MLST作为幽门螺杆菌分型方法,分辨率高,结果准确,易于标准化.通过信息学分析可以将MLST分型、vacA基因型和遗传背景、临床来源结合起来,适于进行分子进化学研究.     

云南汉、白、纳西族人群幽门螺杆菌 vacA基因m混合亚型及iceA基因混合型的致病性研究

目的探讨云南白族、纳西族与汉族幽门螺杆菌（Hpylori）菌株含有vacA基因m混合亚型及iceA基因混合型的感染情况及其致病性。方法选取H．pylori相关慢性胃炎和消化性溃疡患者的胃黏膜,分离培养麒pylori菌株;用PCR方法检测云南白族、纳西族与汉族菌株的vacA基因亚型及iceA基因。结果云南109例Hpylori菌株的混合感染率为32．1％。iceA混合基因亚型的检出率明显高于vacA基因m混合亚型检出率（均P〈0．05）。其中白族混合感染率（67．7％）高于纳西族（20．0％）和汉族（12．1％）（均P〈0．001）;白族中iceA1＋iceA2的混合感染率（61．3％）明显高于纳西族（17.8％）和汉族（9．1％）（均P〈0.001）。云南菌株34例Hpylori混合感染患者中含vacA基因m混合亚型＋iceA混合基因型的混合感染与消化性溃疡有关;只含iceA混合基因亚型的混合感染与慢性胃炎有关。结论不同国家和地区的混合感染率差别很大,云南白族、纳西族与汉族Hpylori菌株含有vacA基因m混合亚型及iceA混合基因型者的混合感染具有多态性。汉族以vacA基因混合亚型来判断混合感染较敏感,白族、纳西族患者中以iceA基因混合亚型判断混合感染较敏感。云南Hpylori菌株含iceA基因亚型和含vacA基因m混合亚型以及白族菌株的vacA基因m区亚型的混合感染与麒pylor致病性有关;以iceA基因混合亚型判断混合感染较敏感。     

PCR方法测定幽门螺杆菌vacA基因型和cagA 基因

目的：建立幽门螺杆菌vacA基因型和cagA基因的PCR测定方法，方法：应用多聚酶链反应方法对62例慢性胃炎，消化性溃疡和胃癌患者分离获得幽门螺杆菌菌株的vacA基因型和cagA基因进行测定，结果：62株幽门螺杆菌菌株均具有vacA基因，所有菌株的 vacA基因型均为sla/m2型，cagA基因的总阳性率为56．45％，慢性胃炎，消化性溃疡和胃癌患者分离获得幽门螺杆菌的cagA基因阳性率分别为55．56％，54．17％和63．64％（P＞0．05），结论：本研究建立的PCR测定幽门螺杆菌vac A基因型和cagA基因方法敏感性高，特异性强。