基于网络药理学探讨瓜蒌薤白半夏汤治疗COPD的作用机制

目的 利用网络药理学方法及分子对接技术探讨瓜蒌薤白半夏汤治疗慢性阻塞性肺疾病(COPD)的相关作用机制。方法 在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中获取瓜蒌薤白半夏汤的主要化学成分及对应靶点,在人类基因数据库(GeneCards)、药物银行(DrugBank)及人类孟德尔遗传数据库(OMIM)中获取COPD的治疗靶点;获取交集基因后,利用Cytoscape软件构建药物-成分-靶点网络关系图;利用蛋白质相互作用数据库(STRING)建立蛋白互作网络(PPI),并利用Cytoscape软件中CytoNCA插件进行拓扑分析筛选核心靶点;利用R语言软件进行基因本体论(GO)生物学功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,并绘制条形图;最后通过Autodock软件进行活性成分和核心靶点分子对接验证。结果 瓜蒌薤白半夏汤共筛选出30个活性成分和411个潜在靶点,共获得COPD潜在治疗靶点2 366个,二者交集靶点共139个;PPI核心网络计算出丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)3、MAPK1、JUN、TP53、FOS、雌激素受体α(ESR1)等14个核心靶点;GO富集分析生物学...     

基于网络药理学及分子对接研究石菖蒲-郁金药对治疗冠心病合并焦虑/抑郁的作用机制

目的 基于网络药理学及分子对接研究石菖蒲-郁金药对治疗冠心病合并焦虑/抑郁的作用机制。方法 通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)、GeneCards数据库筛选药物活性成分、靶点及疾病靶点,取两者交集靶点,使用Cytoscape软件绘制药对-活性成分-靶点网络图,通过STRING数据库绘制蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,利用Metascape数据库进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,利用Autodock vina软件进行分子对接。结果 石菖蒲-郁金中筛选得到7个活性成分,与冠心病合并焦虑/抑郁的交集靶点共100个。主要活性成分为山奈酚、柚皮素、β-谷甾醇等,PPI网络发现视黄醇类Ⅹ受体α(RXRA)、蛋白激酶B(AKT)1、丝裂原激活的蛋白激酶(MAPK)3、转录因子AP-1(JUN)、MAPK1等可能是石菖蒲-郁金治疗冠心病合并焦虑/抑郁的关键靶点。GO和KEGG富集分析显示,生物过程主要涉及调节细胞对转化生长因子β刺激的反应、细胞周期相变的负调控等,信号通路主要涉及磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)-AKT、肿瘤坏死因子(TNF)等。分子对...     

基于网络药理学探讨清痰化瘀方治疗冠心病痰热瘀结证的作用机制

目的运用网络药理学探讨清痰化瘀方治疗冠心病痰热瘀结证的作用机制。方法从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出清痰化瘀方的化学成分和潜在靶点,利用DrugBank、治疗靶点数据库(TTD)、DisGeNET、美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库筛选冠心病靶点,将疾病靶点与药物靶点进行Venn分析,筛选二者共同靶点,应用String数据库构建蛋白-蛋白相互作用网络,并通过DAVID(6.8)数据库对共同靶点进行基因本体(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,运用Cytoscape 3.5.1构建"中药-化合物-共同靶点-疾病"网络,预测其作用机制。结果通过筛选获得清痰化瘀方101种化学成分和253个作用靶点,共同靶点112个,获得640条生物学过程和108条信号通路。通过对112个靶蛋白进行PPI分析发现,肿瘤坏死因子(TNF)、蛋白激酶(AKT1)、白介素-6(IL-6)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)3、MAPK8、血管内皮生长因子A(VEGFA)、原癌基因蛋白(FOS)等靶蛋白度值较大,KEGG通路富集结果显示,清痰化瘀方治疗冠心病的较多...     

基于网络药理学及分子对接探究党参治疗射血分数保留性心力衰竭的分子机制

目的:基于网络药理学及分子对接预测党参治疗射血分数保留性心力衰竭的相关靶点及信号通路,探讨其发挥治疗作用的潜在机制。方法:利用中药系统网络药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索党参的有效成分;通过Swiss Target Prediction数据库预测其潜在靶点;通过检索DisGeNET数据库获得射血分数保留性心力衰竭的相关靶点后,构建“药物-疾病”共同靶点韦恩图;使用Cytoscape 3.7.2软件构建“党参-有效成分-潜在靶点”网络;利用STRING数据库构建靶蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图;借助Cytoscape软件获取核心成分、关键靶点;利用Metascape数据库进行基因本体(GO)功能与京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;采用分子对接将核心成分与关键靶点进行结果验证。结果:筛选获得党参作用于射血分数保留性心力衰竭有效成分16个,疾病共同靶点116个,关键靶点5个;GO功能富集获得党参治疗射血分数保留性心力衰竭生物学过程主要富集在丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)级联反应的正调控、循环系统过程、激素水平的调节、调节离子传输、细胞对氮化合物的反应等;KEG...     

柴胡加龙骨牡蛎汤“异病同治”冠心病和焦虑症的网络药理学作用机制

目的 应用网络药理学和分子对接方法探讨柴胡加龙骨牡蛎汤“异病同治”冠心病和焦虑症的作用机制。方法 利用TCMSP、BATMAN-TCM数据库获得柴胡加龙骨牡蛎汤的活性成分及对应靶点,结合GeneCards数据库获取冠心病和焦虑症相关的疾病靶点;对药物与疾病靶点映射得到的柴胡加龙骨牡蛎汤治疗冠心病和焦虑症的共有靶点,通过STRING平台构建蛋白互作网络;运用R语言对共有靶点进行基因本体(GO)富集分析与京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;采用 Cytoscape3.7.1软件构建“活性成分-靶点-通路”网络;应用Auto Dock vina软件对PPI网络中关键靶点与主要活性成分进行分子对接。结果 网络分析结果显示,柴胡加龙骨牡蛎汤中74个有效活性成分参与调控92个共有靶点,通过调节丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、白细胞介素17(IL-17)信号通路、5-羟色胺能突触、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)、蛋白激酶B(Akt)等121条信号通路实现对冠心病和焦虑症“异病同治”的作用。结论 现有研究初步揭示了柴胡加龙骨牡蛎汤“异病同治”冠心病和焦虑症多成分、多靶点、多通路的作用机制,可能为后续深入研究提供新方向。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨四妙勇安汤治疗冠心病的作用机制

目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨四妙勇安汤治疗冠心病(CHD)的潜在作用机制。方法:应用中药系统药理学技术平台(TCMSP)筛选四妙勇安汤的药物有效活性成分及作用靶点,应用全球蛋白质资源(UniProt)数据库对基因标准化处理。通过GeneCards数据库和在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库检索冠心病的有关靶点,将药物有效活性成分靶点与冠心病的相关靶点进行映射,取交集即为四妙勇安汤治疗冠心病的潜在靶点。使用Cytoscape 3.7.2软件构建四妙勇安汤治疗冠心病的“药物-成分-疾病-靶点”网络图,运用生物分子功能注释系统(STRING)数据库及Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络图,并筛选核心靶点。利用DAVID数据库对得到的交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并利用AutoDock及PyMOL等软件进行分子对接验证及结果的可视化分析。结果:共得到四妙勇安汤治疗冠心病的活性成分127个、相关靶点137个、交集靶点120个。四妙勇安汤治疗冠心病的生物过程涉及对缺氧的反应、一氧化氮生物合成过程的...     

基于网络药理学与分子对接探讨失笑散治疗冠心病的作用机制

目的:基于网络药理学及分子对接技术探讨失笑散治疗冠心病的作用机制。方法:收集TCMSP及BATMAN-TCM、HERB数据库,分别检索蒲黄和五灵脂的化学成分及靶点,运用Cytoscape 3.9.0软件构建药物-活性成分-潜在靶点网络图。通过GeneCards、OMIM、TTD数据库筛选冠心病相关的靶点。利用Venny图获取疾病-药物交集靶点,并将其上传至STRING数据库,进一步通过Cytoscape 3.9.0软件绘制核心蛋白-蛋白互作(PPI)网络图。采用Metascape平台对交集靶点进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。利用AutoDockTools-1.5.7软件对核心成分与核心靶点进行分子对接,采用PyMOL软件进行可视化。结果:经筛选后获得失笑散核心成分为槲皮素、山柰酚、异鼠李素等;核心靶点包括蛋白激酶B(AKT1)、细胞肿瘤抗原p53(p53)、热休克蛋白90α家族A类成员1(HSP90AA1)等。KEGG通路富集的主要通路为环磷酸腺苷(cAMP)信号通路、核因子-κB(NF-κB)信号通路等。分子对接验证显示：多数核心成分与核心靶点具有...     

基于网络药理学及分子对接探讨三黄泻心汤治疗脓毒症心功能障碍的作用机制研究

目的:运用网络药理学及分子对接探讨三黄泻心汤对脓毒症心功能障碍治疗的作用机制。方法:通过文献检索搜集三黄泻心汤中相关有效成分;通过Swiss Target Prediction、有机小分子生物活性数据库(PubChem)、中药系统药理学数据库(TCMSP)预测三黄泻心汤的潜在作用靶点;运用人类基因数据库(GeneCards)和人类孟德尔遗传数据库(OMIM)检索脓毒症心功能障碍相关的疾病靶点。利用Cytoscape 3.8.2软件构建“药物-成分-靶点”网络,使用蛋白质相互作用分析数据库(STRING)构建交集蛋白间相互作用关系网络;借助注释、可视化和综合发现数据库(DAVID)在线工具进行基因的基因本体(GO)功能富集和京都基因及基因组百科全书(KEGG)通路分析;利用AutoDockVina、PyMOL软件进行有效成分与关键靶点的分子对接。结果:通过筛选获得三黄泻心汤13种主要有效成分和潜在作用靶点511个,有效成分与疾病相关共同靶点51个,主要涉及细胞凋亡、蛋白磷酸化、炎症反应等生物过程,并可能通过磷酸肌醇-3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)...     

基于网络药理学探讨滋肾活络方改善高血压左室肥大的物质基础和作用机制

目的基于网络药理学预测滋肾活络方改善高血压左室肥大的物质基础和作用机制。方法利用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)获取滋肾活络方所含化合物成分,筛选潜在活性成分;整合Swiss Target Prediction、The Human Phenotype Ontology(HPO)、DisGeNET数据库预测和筛选滋肾活络方改善高血压左室肥大作用靶点,以Cytoscape软件构建"单味药-活性成分-作用靶点"网络。STRING数据库进行靶点蛋白相互作用网络构建和分析,应用Ledock软件进行活性成分分子和关键靶点分子对接验证。采用Metascape数据库富集分析作用靶点涉及的功能及通路。结果滋肾活络方的38个活性成分作用于高血压左室肥大相关靶点47个,主要通过调控钙信号、肾上腺素能受体信号、5-羟色胺能突触、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号和过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路等改善高血压左室肥大。结论滋肾活络方通过多个成分作用于多个靶点,多途径改善高血压左室肥大。     

基于网络药理学、微阵列数据分析和分子对接探究四君子汤治疗缺血性心力衰竭的作用机制

目的:通过网络药理学、微阵列数据分析和分子对接探讨四君子汤治疗缺血性心力衰竭的作用机制。方法:采用R软件对GEO数据库中下载的缺血性心力衰竭(HF)的微阵列数据进行分析;借助中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)数据库获取四君子汤中4味中药的化学成分和作用靶点,利用网络药理学的方法获取四君子汤有效成分与心力衰竭的匹配靶点;通过Cytoscape(v 3.2.1)软件和STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络;在R软件上使用clusterProfiler(v3.8)和DOSE(v3.6)软件包进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。最后,借助AutoDockTool、PyMOL软件进行预处理及分子对接。结果:通过对微阵列数据的分析,获得关于心力衰竭的371个差异表达基因(DEGs)。共筛选出四君子汤有效成分136种,活性成分所涉及的相关靶点4 134个,对9个匹配靶点和5个重要化学成分进行后续分析,构建了“四君子汤-心力衰竭”PPI网络。通过GO生物过程、KEGG富集分析,得到细胞对酸性化学物质的反应、有机羟基化合物转运、轴突再生、神经元投...     

基于网络药理学探讨络风宁3号方治疗心律失常的作用机制

目的 基于网络药理学预测络风宁3号方治疗心律失常的分子作用途径。方法 通过中药系统药理学数据库（TCMSP数据库）、ETCM数据库、DrugBank数据库检索络风宁3号方有效成分及作用靶点;其次使用Genecards数据库检索心律失常发病相关靶点,利用CytoScape3.7.2软件构建药物-有效成分-靶点基因网络;分别通过STRING和DAVID数据库,对交集靶点进行PPI分析和GO、KEGG富集分析。结果共得到络风宁3号方中有效成分120个、有效成分所对应的药物靶点239个、与心律失常相关的基因靶点1091个;两组靶点相互映射,最终得到交集靶点82个、关键靶点10个、KEGG通路116条。络风宁3号方中槲皮素、β-谷甾醇、山奈酚、汉黄芩素等主要有效成分可能通过作用于白细胞介素-6(IL-6)、血管内皮生长因子A (VEGFA)、蛋白激酶B1(AKT1)、肿瘤坏死因子（TNF）、基质金属蛋白酶9(MMP9)等靶标因子,调节磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K-Akt）信号通路、TNF信号通路、丝裂原激活蛋白激酶（MAPK）信号通路、Toll样受体（TLR）信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1...     

基于网络药理学和分子对接探讨苗药黑骨藤治疗阿尔茨海默病的作用机制

目的 运用网络药理学及分子对接技术，探究苗药黑骨藤治疗阿尔茨海默病(AD)的活性成分和潜在作用机制。方法 通过文献搜集苗药黑骨藤的化学成分，利用中药系统药理学数据库(TCMSP)和Swiss ADME数据库筛选黑骨藤的主要活性成分，采用Swiss Target Prediction和SEA数据库预测活性成分的作用靶点。通过GeneCards、OMIM数据库检索AD相关靶点，经Venny2.1.0获取成分-疾病交集靶点，结合STRING数据库和Cytoscape3.8.0软件对交集靶点进行蛋白互作(PPI)网络分析。再借助HIPLOT数据库对交集靶点进行基因本体(GO)分析和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。最后，利用AutoDock Tools1.5.6软件将潜在成分与核心靶点进行分子对接。结果 苗药黑骨藤的活性成分共24个，对应靶点574个，1 513个AD靶点，交集靶点159个；GO分析得到2 661条生物过程，587条分子功能，311条细胞成分；KEGG分析得到AD主要参与神经退行性疾病-多发性疾病途径、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、癌症中的蛋白多糖等相关通路。分子对接结...     

川芎抗动脉粥样硬化作用机制的网络药理学与分子对接技术研究

目的使用网络药理学与分子对接技术探究川芎抗动脉粥样硬化的作用机制。方法运用中药系统药理(TCMSP)数据库筛选川芎的活性成分及质控成分,通过Swiss Target Prediction预测药物靶点。在DrugBank和DisGeNET数据库筛选出动脉粥样硬化的相关靶点。通过STRING构建靶点蛋白互作网络,运用Cytoscape绘制网络并进行拓扑学分析。使用Omicshare对相关靶点进行GO富集分析与KEGG富集分析。运用DockThor进行分子对接。结果获得川芎抗动脉粥样硬化的167个相关治疗靶点,通过网络拓扑分析发现钙敏感受体、丝裂原活化蛋白激酶3等46个靶点为核心靶点。GO富集分析发现川芎在生物过程、分子功能、细胞组成多方面影响动脉粥样硬化的发生发展。KEGG通路富集分析发现,川芎可能通过调节神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路等多条代谢通路来发挥抗动脉粥样硬化的作用。结论运用网络药理学的方法证实了川芎抗动脉粥样硬化具有多途径、多靶点作用的特点。预测了川芎抗动脉粥样硬化的可能机制,为其后续基础研究提供了参考和理论依据。     

基于网络药理学和分子对接探讨丹参抗放射性心肌纤维化的机制

目的:采用网络药理学和分子对接探讨丹参抗放射性心肌纤维化的分子机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)进行药物成分和相应靶点筛选,疾病靶点通过基因名片数据库(GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)和治疗靶点数据库(TTD)获得,在Venny 2.1.0平台上提取二者共同靶点。运用STRING数据库与Cytoscype 3.9.1软件建立蛋白互作(PPI)网络,对PPI网络行拓扑学分析得到的核心靶点导入Metascape数据库进行功能富集分析,经Cytoscype 3.9.1软件构建“活性成分-核心靶点-信号通路”网络。最后,利用AutoDockTools 1.5.6软件进行分子对接验证,可视化由PyMOL 2.2.0软件完成。结果:共获取药物活性成分59种,相应靶点137个,疾病靶点3 042个,交集靶点100个。PPI网络拓扑学分析所得的蛋白激酶B1(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、肿瘤蛋白p53(TP53)等22个核心靶点,主要通过TNF信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路、丝裂原激活蛋白激酶(MAPK)信号通路等途径发挥功能,与...     

基于网络药理学及分子对接探讨润肝养心方治疗心脏神经症的分子机制

目的:基于网络药理学和分子对接方法探讨润肝养心方治疗心脏神经症(CN)的物质基础和作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、有机小分子生物活性数据库(PubChem)、Swiss Target Prediction数据库检索并筛选出润肝养心方(麦冬、酸枣仁、柏子仁、炒白芍、当归、五味子、茯苓、炙甘草)的药物活性成分及作用靶点,利用基因名片数据库(GeneCard)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、DisGeNET数据库筛选CN疾病靶点,将药物和疾病靶点两者取交集后获得的共有靶点导入STRING数据库获得蛋白互作关系,应用Cytoscape 3.8.2软件构建蛋白质相互作用(PPI)网络;采用R语言ClusterProfiler程序包(3.18.0)对关键靶点进行基因本体(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,并利用Cytoscape 3.8.2构建关键靶点-功能-通路图及关键靶点中药药理调控网络;采用AutoDock Tools 1.5.6进行分子对接研究。结果:润肝养心方筛选得到活性成分146个、作用靶点245个、CN及润肝养心方共有靶点...     

基于网络药理学探讨人参-钩藤药对治疗原发性高血压的作用机制

目的基于网络药理学探究人参-钩藤药对治疗原发性高血压有效成分的靶基因及作用机制。方法通过中药系统药理学数据库(TCMSP)中药数据库检索人参-钩藤药对的化学成分和靶基因,以生物利用度(OB)>30%和类药性(DL)>0.18为条件筛选药对的潜在有效成分,并通过TCMSP数据库预测药对的潜在靶点。运用Uniprot数据库寻找到潜在靶点相对应的人类基因名称,通过GeneCards数据库检索原发性高血压的疾病靶点,与药对的潜在靶点相映射,绘制韦恩图,将映射找到的有效成分的靶基因导入Cytoscape 3.7.2构建疾病-药对-成分-靶点网络图。利用STRING数据库构建蛋白互作网络图选出核心靶标,最后将人参-钩藤药对治疗原发性高血压的有效靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果共获得人参-钩藤药对46个有效成分和176个有效靶点。GO分析发现,主要途径有调控核受体活性、转录因子活性、肾上腺素能受体活性、类固醇激素受体活性、G蛋白偶联胺受体活性等。KEGG通路富集分析发现,主要通路为丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、白细胞介素-17(IL-17)信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路等。结论人参-钩藤药对通过多种靶点、多种途径、多种信号通路协同发挥治疗原发性高血压的作用,为进一步药物作用机制的研究提供理论基础,并为指导临床提供依据。     

基于网络药理学和分子对接探讨巴戟天抗动脉粥样硬化的靶点及信号通路

[目的]应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及小分子药物靶点预测在线平台(Swiss Target Prediction)和疾病基因组数据库,结合分子对接技术,预测巴戟天抗动脉粥样硬化(As)的靶点及信号通路。[方法]通过中药网络药理学数据库及小分子药物靶点预测在线平台挖掘巴戟天的有效成分及其所对应的靶点,利用GeneCards、OMIM、Disgenet、UniProt收集并筛选As相关的疾病基因靶点,获取交集基因,将其导入String 11.5数据库中,构建疾病-药物蛋白互作分析(String-PPI)网络图,利用Cytoscape 3.9.1软件对关键靶点网络进行可视化;此外,运用Metascape网络在线平台进行GO、KEGG富集挖掘出其抗As的分子靶点,并通过KEGG数据库绘制通路图。最后,使用Autodock vina 1.1.2软件对核心化合物及核心靶点基因进行分子对接验证。[结果]通过以上数据库共收集得到包括β-谷甾醇和蒽醌在内的17个有效药物化合物、73个核心靶点和1 450个关键疾病基因;取交集后得到巴戟天治疗As的35个核心基因;经String-PPI...     

基于网络药理学探讨心力康颗粒治疗慢性心力衰竭的作用机制

目的:基于网络药理学探讨心力康颗粒治疗慢性心力衰竭(CHF)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库和分析平台构建心力康颗粒的潜在靶点和CHF疾病靶点之间的相互作用网络。利用R x64 4.0.2软件基于基因本体(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)进行基因功能和通路富集分析。通过Cytoscape 3.8.0软件构建药物有效成分-靶点网络图和关键靶点蛋白相互作用(PPI)网络图。结果:心力康颗粒中的有效成分槲皮素、木犀草素、山柰酚、丹参酮ⅡA等可能通过雌激素受体1(ESR1)、CXC趋化因子配体8(CXCL8)、信号传导及转录激活蛋白3(STAT3)、淀粉样前体蛋白(APP)、视网膜母细胞瘤基因(RB1)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、肿瘤抑制因子p53(TP53)、致癌c端细胞周期蛋白D1(CCND1)、原癌基因(JUN)等9个关键基因靶点,调控磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)信号通路、流体剪切应力和动脉硬化通路、白细胞介素(IL)-17信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路及p53信号通路等发挥治疗CHF的作用。结论:心力康颗粒治疗CHF具有多成...     

基于网络药理学探讨加味导赤散治疗心脾积热证复发性口腔溃疡的活性成分及作用机制

目的 运用网络药理学的方法探讨加味导赤散治疗心脾积热证复发性口腔溃疡的活性成分及作用机制。方法 通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)、BATMAN-TCM数据库和文献挖掘获取加味导赤散主要活性成分,并用UniProt数据库矫正靶点,利用人类基因数据库GeneCards筛选复发性口腔溃疡的疾病靶点,采用Venny 2.1软件将药物靶点和疾病靶点取交集,获得加味导赤散治疗复发性口腔溃疡的作用靶点。通过STRING数据库和Cytoscape 3.8.2软件绘制蛋白相互作用(PPI)网络,使用DAVID 6.8数据库进行潜在基因的基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果 筛选得到加味导赤散90个活性成分,涉及93个共同靶点。主要活性成分为槲皮素、山奈酚、甘草查尔酮A、柚皮苷、异鼠李素等,与之相关的靶点为信号传导及转录激活因子3(STAT3)、肿瘤坏死因子(TNF)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、白细胞介素6(IL6)、细胞肿瘤抗原p53(TP53)、血管内皮生长因子-α(VEGFA)、转录因子p65(RELA)、丝裂原激活蛋白激酶(MAPK)1、...     

基于网络药理学及实验验证探讨稳心汤治疗冠心病心绞痛的作用机制

目的:基于网络药理学探讨稳心汤治疗气虚血瘀型冠心病心绞痛的潜在作用靶点及其分子机制,并结合大鼠心肌梗死模型深入探析其可能的作用机制。方法:将中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)获取的稳心汤中药物潜在相关靶点,与人类孟德尔遗传病数据库(OMIM)、药物数据库(DrugBank)、人类基因数据库(GeneCards)中筛选得到的冠心病心绞痛靶点取交集,并基于STRING数据库构建交集靶点蛋白互作网络图。根据Cytoscape 3.9.1软件构建稳心汤关键活性成分-疾病靶点网络,筛选出核心靶点。利用Metascape平台对药物与疾病交集靶点进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,筛选出稳心汤治疗气虚血瘀型冠心病心绞痛过程中可能参与的信号通路。构建大鼠心肌梗死模型,采用苏木精-伊红(HE)、马松(Masson)染色观察心脏炎症及纤维化情况,利用蛋白免疫印迹法(Western Blot)实验验证网络药理学富集分析结果。结果:共获取稳心汤与冠心病心绞痛交集靶点173个,包括白介素6(IL6)、肿瘤坏死因子(TNF)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(Akt1)等,KEGG...