PCR循环测序法检测K—ras和HCV5‘非编码区基因变异

建立一种简单，快速，可靠的ＤＮＡ序列分析方法，并利用此方法分析了Ｋ－ｒａｓ基因和ＨＣＶ５‘非编码区基因的变异情况。方法；ＰＣＲ循环测序法是将ＰＣＲ扩增与核酸序列分析相结合的一种研究方法。根据此技术原理，建立以ＰＣＲ扩增引物为测序引物，利用Ｔａｑ ＤＮＡ聚合酶，荧光标记的２’３‘－双脱氧核苷三磷酸直接进行ＰＣＲ扩增产物序列分析的方法。     

中国人新SRY基因突变类型—Codon76CGC→CCC的发现

应用聚合酶链反应（ＰＣＲ）体外快速扩增６例４６，ＸＹ女性性反转综合征患者的ＳＲＹ基因片段，并用一种简单准确的ＰＣＲ产物直接顺序进行序列分析，发现一种Ｃｏｄｏｎ７６ＣＧＣ→ＣＣＣ的新突变类型，对该直接顺序法的关键和应用进行了讨论。     

Crouzon综合征FGFR2基因第9外显子突变的研究

目的：研究Ｃｒｏｕｚｏｎ综合征的病因。方法：应用聚合酶链反应－－单链构象多态（ＰＣＲ－ＳＳＣＰ）技术结合ＰＣＲ产物直接测序方法对６例Ｃｒｏｕｚｏｎ综合征家系（２１名患者，１５名正常人）的成纤维细胞生长因子受体２（ＦＧＥＲ２）基因第９外显子进行了分析。结果：ＳＳＣＰ检测发现５种异常泳动变位，ＤＮＡ直接测序证实为种突变类型，Ｔｙｒ３４０Ｈｉｓ，Ｃｙｓ ３４２Ｔｒｐ，Ｃｙｓ ３４２ Ｔｙｒ及３４４Ａｌａ     

PCR循环测序法检测K-ras和HCV 5'非编码区基因变异

目的：建立一种简单、快速、可靠的ＤＮＡ序列分析方法，并利用此方法分析Ｋｒａｓ基因和ＨＣＶ５′非编码区基因的变异情况。方法：ＰＣＲ循环测序法是将ＰＣＲ扩增与核酸序列分析相结合的一种研究方法。根据此技术原理，建立了以ＰＣＲ扩增引物为测序引物，利用ＴａｑＤＮＡ聚合酶、荧光标记的２′，３′双脱氧核苷三磷酸（ｄｄＮＴＰ）直接进行ＰＣＲ扩增产物序列分析的方法。应用该方法对人肺癌组织中的Ｋｒａｓ癌基因和丙型肝炎病毒５′非编码区（ＨＣＶ５′ＮＴＲ）进行了序列测定。结果：肺癌组织中的Ｋｒａｓ基因第１外显子第３５位碱基发生点突变（ＧＧＴ→ＧＡＴ）；属于高度保守区的ＨＣＶ５′ＮＴＲ存在基因变异。结论：ＰＣＲ循环测序法具有简单、快速、结果可靠等特点，为基因突变的检测和病原体的核酸序列分析提供了一个快速实用的方法。     

多聚酶链反应产物HindⅢ酶切方法探讨

多聚酶链反应（ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅｃｈａｉｎｒｅａｃｔｉｏｎ，ＰＣＲ）是当代分子生物学的重要技术。在对ＰＣＲ产物进行限制酶消化时，由于限制酶需一定的反应条件，往往需对ＰＣＲ产物进行纯化。我们在应用ＨｉｎｄⅢ酶切ＰＣＲ产物时，采用了纯化后酶切及直接酶切两种方法。经比较，二法结果无差异。由于直接酶切法省去了纯化过程的繁琐步骤，提高了实验效率，故我们认为应用ＨｉｎｄⅢ酶切ＰＣＲ产物时可采用直接酶切法。１　材料和方法１．１　材料１．１．１　样本　正常人外周血取自健康献血员。１．１．２　引物　引物顺序为Ｃ…     

骨髓增生异常综合征患者N－ras原癌基因突变的研究

应用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ及直接测序法研究ＭＤＳ患者Ｎ－ｒａｓ原癌基因点突变。检测２６例（２８例次），发现Ｎ－ｒａｓ原癌基因第１外显子突变者１４例（５０％），统计表明Ｎ－ｒａｓ原癌基因突变与ＭＤＳ白血病转化及患者生存期缩短均有相关性（Ｐ＜０．０５），对预测ＲＡ、ＲＡＳ转化白血病有参考价值。对１例发现突变的标本进行直接测序证实为１２密码子第２碱基的Ｇ→Ａ转换。     

中国人丙型肝炎病毒囊膜蛋白2HVR1 cDNA的序列分析

目的：了解中国ＨＣＶ流行株高变区１（ＨＶＲ１）的特点。方法：对来自山东（ＳＤ）、上海（ＳＨ）两地患者血清ＲＮＡ进行逆转录－巢式ＰＣＲ，扩增ＨＣＶ囊膜蛋白２基因片段，用ＰＣＲ直接测序法对该片段进行序列测定。结果：（１）扩增片段（命名为Ｐ３８８）对应于日本ＨＣＶ－Ｊ株序列核苷酸１４３９￣１８２６位（氨基酸位３７１￣４９８）；（２）中国人ＨＣＶ ＨＶＲ１位于氨基酸位３８４￣４１０，与发表的ＨＣＶⅡ型ＨＶ     

聚合酶链反应技术在腓骨肌萎缩症基因诊断中的应用

目的 探讨应用聚合酶链反应（ＰＧＲ）技术建立中国人腓骨肌萎缩症（ＣＭＴ）基因诊断的方法。方法 分别应用ＰＣＲ－双酶切、聚合酶链反应－单链构象多态性分析（ＰＣＲ－ＳＳＣＰ）、聚合酶链反应－变性梯度凝胶电泳（ＰＣＲ－ＤＧＧＥ）或ＰＣＲ直接测序等方法对３２个确诊的ＣＭＴ家系进行了ＰＭＰ２２、ＭＰＺ、Ｇx３２等致病基因的突变检测。结果 ２１．９％的ＣＭＴ家系患者有Ｇx３２、ＭＰＺ和ＰＭＰ２基因的突变。ＰＣＲ－ＳＳＣＰ检测到１０个家系有异常泳带,经ＰＣＲ测序证实有５个为多态;另５个为与疾病相关的致病的点突变,即４个Ｇx３２和１个ＭＰＺ基因的点突变。PCR-双酶切诊断了２个包含ＰＭＰ２２基因在内的大片段重复突变的ＣＭＴ１Ａ型家系。ＰＣＲ－ＤＧＧＥ仅１个家系患者异常泳带,该结果也可经ＰＣＲ－ＳＳＣＲ方法检出。结论 ＰＣＲ－ＳＳＣＰ和ＰＣＲ－双酶切可作为Ｇx３２、ＭＰＺ、ＰＭＰ２２基因的点突变和ＣＭＴ１Ａ的大片段重复突变的初筛的方法,而ＰＣＲ－ＤＧＧＥ方法用于Ｇx３２基因的突变检测不理想,点突变应经ＤＮＡ测序证实。     

骨髓增生异常综合征患者N—ras原癌基因突变的研究

应用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ及直接测序法研究ＭＤＳ患者Ｎ－ｒａｓ原癌基因点突变。检测２６例（２８例次），发现Ｎ－ｒａｓ原癌基因第１外显子突变者１４例（５０％），统计表明Ｎ－ｒａｓ原癌基因突变与ＭＤＳ白血病转化及患者自下而上期缩短均有相关性（Ｐ〈０．０５），对预测ＲＡ、ＲＡＳ转化白血病有参考价值。对１例发现突变的标本进行直接测序证实为１２密码子第２碱基的Ｇ→Ａ转换。     

用PTVS检测t（14；18）PCR产物的DNA序列

为确定聚合酶链反应（ＰＣＲ）和地高辛（ＤＩＧ）系统检测ｔ（１４；１８）的特异性，我们采用ＰＧＥＭ－Ｔｖｅｃｔｏｒ系统（ＰＴＶＳ）和双脱氧链终止技术克隆并测定了ＲＬ细胞系和一个ＮＨＬ患者－Ａｍｂｒｏｓｅｎ的ｔ（１４；１８）ＰＣＲ产物的ＤＮＡ序列。结果表明两者的ＰＣＲ扩增产物均为ｂｃｌ－２－ＪＨ融合基因片段，证实ＰＣＲ－ＤＩＧ系统是一种特异的检测ｔ（１４；１８）的方法。同时还表明用ＰＴＶＳ对ＰＣＲ。产物进行克隆测序优于直接用双脱氧法测序。     

人原发性食管癌组织中多种抑癌基因的研究

应用ＰＣＲ扩增与直接测序技术，分析１０例食管癌和癌旁组织标本中多个抑癌基因ｐ５３、Ｒｂ、ＡＰＣ和ＭＣＣ的突变与丢失。结果：１０例中６例有ｐ５３基因突变；５例有Ｒｂ基因改变；３例有ＡＰＣ改变；３例有ＭＣＣ基因改变；８例食管癌标本中至少有一种抑癌基因有改变；６例至少有两种或多种抑癌基因改变，１例癌旁组织中也有两个抑癌基因改变。结果表明，食管癌癌变与多个抑癌基因变化的累积有关。     

2.2.15细胞中HBV DNA前C和C区PCR扩增及其产物测序

应用聚合酶链反应（ＰＣＲ）及其扩增产物的直接测序技术对２．２．１５细胞中乙型肝炎病毒（ＨＢＶ）基因前Ｃ和Ｃ区进行测序。结果表明，根据ａｙｗ亚型ＨＢＶ基因设计的引物能够扩增２．２．１５细胞中ＨＢＶＤＮＡ扩增产物位于２２１－２９８碱基对之间，而对ａｄｒ亚型ＨＢＶＤＮＡ无扩增作用，说明ＰＣＲ扩增是特异性的，所测到的１３２个碱基序列与ａｗｙ１亚型ＨＢＶＤＮＡ完全符合，提示２．２．１５细胞中ＨＢＶＤＮＡ属ａ     

I型糖尿病合并肺癌患者HLA—DQA1启动子的核苷酸序列

应用聚合酶链反应产物与序列特异性寡核苷酸探针杂交（ＰＣＲ／ＳＳＯＰ），ＰＣＲ产物单链的构象（ＰＣＲ／ＳＳＣＰ）和ＰＣＲ直接测序等方法，鉴定１例Ｉ型糖尿病合并肺癌患者ＨＬＡ－ＤＱＡ１等位基因及ＤＱＡ１启动子核苷酸序列。结果显示该患者携带ＨＬＡ－ＤＱＡ１０５０１／ＤＱＡ１０３０１等位基因；启动子区核苷酸序列第一位１５５位为Ｇ／Ａ杂合型，且－１６１至－１６３ｂｐ发生ＣＡＡ碱基缺失突变。该突变可能影响顺序     

一种简便快速的DNA序列分析法

采用聚合酶链反应（ＰＣＲ）进行了ＤＮＡ序列分析。该分析法在进行ＰＣＲ产物和ＧＣ含量较高的ＤＮＡ模板测序时，能防止模板的ＤＮＡ片段迅速复性，消除ＰＣＲ产物中剩余的扩增引物和脱氧核苷酸（ｄＮＴＰ）的影响，促使ＴａｑＤＮＡ聚合酶有效地通过模板中ＧＣ富含区和二级结构区域。本法系一简便、快速、准确的ＤＮＡ序列分析法。     

抗－HBe阳性患者乙肝病毒前核心基因的扩增与克隆

本文采用聚合酶链反应（ＰＣＲ）方法从９例抗－ＨＢｅ阳性的乙肝患者血清中扩增了含ＰｒｅＣ和Ｃ基因的ＤＮＡ片段，并分别与载体ｐＵＣ１８相连接，成功地克隆入大肠杆菌中，为后续的ＤＮＡ测序及分析ＰｒｅＣ基因突变打下了基础。并建立了快速、简便的ＰＣＲ直接筛选和鉴定阳性克隆的方法。     

Ⅰ型糖尿病合并肺癌患者HLA－DQA_1启动子的核苷酸序列

应用聚合酶链反应产物与序列特异性寡核苷酸探针杂交（ＰＣＲ／ＳＳＯＰ）、ＰＣＲ产物单链构象分析（ＰＣＲ／ＳＳＣＰ）和ＰＣＲ直接测序等方法，鉴定１例Ⅰ型糖尿病合并肺癌患者ＨＬＡ－ＤＯＡ_１等位基因及ＤＱＡ_１启动子核苷酸序列。结果显示该患者携带ＨＬＡ－ＤＱＡ_１（０５０１）／ＤＱＡ_１（０３０１）等位基因；启动子区核苷酸序列第－１５５位为Ｇ／Ａ杂合型，且一１６１至一１６３ｂｐ发生ＣＡＡ碱基缺失突变。该突变可能影响顺式调控元件与反式因子的相互作用，并在转录水平调控ＨＬＡ－ＤＱＡ_１的表达。这种突变是否与肺癌发病相关，有待深入研究。     

肺癌p53基因突变与蛋白表达关系的研究

目的 以测序结果为标准,探讨免疫组织化学和聚合酶链反应－单链构象多态性（ＰＣＲ－ＳＳＣＰ）两种方法用于检测肺癌ｐ５３基因突变的敏感性及优缺点。方法 用免疫组织化学,ＰＣＲ－ＳＳＣＰ和ＰＣＲ产物直接测序检查３０例肺癌标本的Ｐ５３蛋白和基因改变,结果 ３０例肺癌标本经测序共检出２２例突变,突变位于第５外显子８例（３６％）,位于第６外显子２例（９％）,位于第７外显子７例（３２％）,位于第８外显子５例（２     

抗－HBe阳性患者乙肝病毒前核心基因的扩增与克隆

本文采用聚合酶链反应（ＰＣＲ）方法从９例抗－ＨＢｅ阳性的乙肝患者血清中扩增了含ＰｒｅＣ和Ｃ基因的ＤＮＡ片段，并分别与载体ｐＵＣ１８相连接，成功地克隆入大肠杆菌中，为后续的ＤＮＡ测序及分析ＰｒｅＣ基因突变打下了基础。并建立了快速、简便的ＰＣＲ直接筛选和鉴定阳性克隆的方法。     

桂北五步蛇纤溶酶金属蛋白酶基因的克隆和序列分析

目的：克隆桂北五步蛇纤溶酶金属蛋白酶基因,并对其进行序列分析。方法：从桂北五步蛇毒腺中抽提总ＲＮＡ,采用一步法（ＲＴ－ＰＣＲ和ＰＣＲ在同一管内进行）扩增出纤溶酶金属蛋白基因,利用平端连接的方法将ＰＣＲ扩增产物克隆至ｐＧＥＭ－Ｔ Ｅａｓｙ载体,挑选白色菌落,用酶切和ＰＣＲ法对其进行鉴定,直接利用纯化ＰＣＲ产物进行测序或提取阳性菌落进行测序。结果：ＲＴ－ＰＣＲ和ＰＣＲ扩增得到一６００ｂｐ产物,并被克隆     

应用双链DNA循环测序技术检测Dystrophin基因内点突变

应用双链ＤＮＡ循环测序技术检测Ｄｙｓｔｒｏｐｈｉｎ基因内点突变吴志英，王柠，邓余，余龙，慕容慎行关键词：ＰＣＲ，ＤＮＡ测序，点突变本研究采用ＰＣＲ扩增产物直接测序方法──双链ＤＮＡ循环测序技术［１］。检测基因内点突变，操作简单，费时短，只需１～２天即...