分枝杆菌分子鉴定中常用的靶基因序列的研究进展

分枝杆菌种类繁多,至2000年底已发现有128种分枝杆菌,包括结核分枝杆菌复合群（MTBC,包括结核分枝杆菌、牛分枝杆菌、非洲分枝杆菌、田鼠分枝杆菌）,麻风分枝杆菌以及其他非结核分枝杆菌（nontuberculous mycobacteria,NTM）。近年来,非结核分枝杆菌感染有逐渐增加的趋势,据1990年、2000年第二次全国结核病流行病学抽样调查资料显示我国NTM的培养分离率由4.9%上升至11.1%。我院从1998—2004年NTM的感染占分枝杆菌属培养阳性率的1.5%上升至3.0%^[1]。     

非结核分枝杆菌感染的分子生物学诊断技术研究进展

<正>非结核分枝杆菌(nontuberculosis mycobsteria,NTM)是一类环境生长菌,属于条件致病菌,目前世界发现的NTM有150多种,对人类有致病性的仅占少数[1]。但是随着诊断技术的提高、人们对NTM感染的重视及艾滋病的流行等因素影响,近年来NTM感染明显增加,NTM主要引起肺部疾患,也可引起颈部淋巴结炎、皮肤感染等,NTM与结核分枝杆菌在临床上引起的疾病症状、影像学表现及病理改变上都很相似[1],但是两者对抗结核药物敏感性不     

分枝杆菌快速鉴定分子技术研究进展

传统的分枝杆菌菌种鉴定方法步骤繁琐,操作费时,已不能满足目前临床诊治的需要.因此,各种分子鉴定方法不断涌现.应用于分枝杆菌的临床实验室诊断.包括DNA测序、多重聚合酶链式反应、聚合酶链式反应一限制性酶切片段长度多态性分析、核酸探针杂交、线性探针分析、基因芯片、焦磷酸测序等多种分析技术,这些技术都可快速鉴定菌种,且具有较高的敏感性和特异性.     

钩虫鉴定的分子生物学研究进展

目前钩虫病仍然在中低等收入的热带和亚热带国家流行,对社会经济及公众健康造成极大影响。感染钩虫虫种确切的检测及鉴定对于治疗药物的选择、流行病学研究及防治措施的制定意义重大。本文重点介绍发展迅速的分子生物学钩虫虫种鉴定方法的最新研究进展,以指导将来在实际工作中的应用。     

非结核分枝杆菌肺病的研究进展

近年来,全球非结核分枝杆菌肺病的患病率呈上升趋势,已成为常见病,且对人类健康造成了威胁.非结核分枝杆菌(NTM)主要累及肺脏,NTM肺病缺乏特异性临床表现和体征,与其他疾病鉴别困难.很多临床医师常忽略NTM肺病的存在,常出现误诊或者漏诊.该文从NTM肺病的定义、流行病学特征及危险因素、发病机制及病理变化、诊治及预防等方...     

结核分枝杆菌基因组学研究进展

大多数分枝杆菌普遍存在于地球的土壤和水中，其中绝大多数对人和动物无毒、无害。很多分枝杆菌由于能够固氮、分解其它有机物供其它微生物代谢使用，所以它们对其它生物是有益的，只有少数几种分枝杆菌对人和动物致病。从历史上来看，微生物被划分为分枝杆菌是由于它们生长非常缓慢并且具有抗酸染色的特性。这些特性对分类非常重要，但这些性质的内在确切机制仍不十分清楚。自从两种重要的致病分枝杆菌一麻风分枝杆菌和结核分枝杆菌被分离后，对分枝杆菌的化学组成、细胞壁结构、代谢能力、抗原决定成份、致病机制等有了一些了解。     

铜陵地区结核与非结核分枝杆菌菌型鉴定及耐药性分析

目的通过检测本地区分枝杆菌感染菌株类型以及耐药性,制订化疗方案提供依据。方法采取两种试剂鉴定菌株,绝对浓度法检测药敏耐药性。结果 80株分枝杆菌中人型结核分枝杆菌58例,占72.5%;牛型结核分枝杆菌15例,占18.8%;非结核分枝杆菌7例,占8.7%。结核分枝杆菌复合群耐多药率9.6%。非结核分枝杆菌耐多药率85.7%。牛型结核分枝杆菌对药物敏感性大于人型结核分枝杆菌,人型结核分枝杆菌对药物敏感性大于非结核分枝杆菌。耐药以耐R、H、TH1321、Rtf、PAS多见。结论本地区肺部感染分枝杆菌菌株以结核分枝杆菌复合群为主,耐多药率及非结核分枝杆菌感染率略高于全国水平。     

河南省363株非结核分枝杆菌分离鉴定及耐药分析

目的 了解河南省结核病患者中非结核分枝杆菌(NTM)分布情况及其耐药性,为其临床诊治提供支持。方法采用传统PNB/TCH生长试验对分枝杆菌培养阳性标本初步鉴定。用探针熔解曲线法和PCR产物测序鉴定NTM菌种,采用比例法检测分离菌株的抗结核药物敏感性。结果 从PNB/TCH生长试验结果阳性的404株菌株中,鉴定出NTM菌株363株,其中357株为单一感染,6株为混合感染。363株菌株中,胞内分枝杆菌273株(74.93%),堪萨斯分枝杆菌34株(9.37%),脓肿分枝杆菌21株(5.79%),鸟分枝杆菌11株(3.03%),其他25株(6.89%)。其中南阳、洛阳、平顶山、濮阳、开封、许昌、郑州、周口和驻马店等地市胞内分枝杆菌比例都高于50%;安阳、鹤壁和商丘等地市堪萨斯分枝杆菌比例较高。河南省NTM总分离率为3.93%。18个地市中鹤壁市NTM分离率最高为11.20%,其次为南阳10.23%;分离率最低的为周口1.11%,其次为商丘1.21%,差异有统计学意义(χ²=135.604,P<0.001)。结论 河南省NTM分离以胞内分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌、脓肿...     

湖南省525株非结核分枝杆菌临床分离株的菌种鉴定与流行特征

目的 对2019-2020年湖南省分离的非结核分枝杆菌(NTM)进行菌种鉴定,并分析其分布特征,为非结核分枝杆菌病的防治提供基础科学依据。方法 收集2019-2020年湖南省胸科医院疑似结核病患者分离到的分枝杆菌临床分离株,通过MPB64蛋白免疫胶体金法、PNB(对硝基苯甲酸)培养基生长试验进行结核分枝杆菌复合群和NTM鉴定,应用16S rRNA和Hsp65测序分析法对NTM菌株进行菌种鉴定。结果 共收集到6 515份分枝杆菌阳性培养物,初步鉴定为NTM共525株,占比8.06%,其中分离于男性患者285株,占比54.29%;女性患者240株,占比45.71%;人群分布以农民为主,共367株,占比69.90%;年龄分布以40岁以上中老年患者最多,共402株,占比76.57%。2019-2020年NTM菌种分布达27种,菌种分布位列前4者分别为脓肿分枝杆菌(190株,36.19%)、胞内分枝杆菌(174株,33.14%)、鸟分枝杆菌(64株,12.19%)、戈登分枝杆菌(47株,8.95%);其它50株(9.52%)包含23种NTM。脓肿分枝杆菌主要在郴州市、湘西自治州地区、衡阳市和永州市等地区流行;胞内分枝杆菌主要在郴州市、岳阳市和湘潭市流行。结论 2019-2020年湖南地区分枝杆菌中NTM检出率仍保持较高水平,以脓肿分枝杆菌、胞内分枝杆菌、鸟分枝杆菌和戈登分枝杆菌为主;感染人群以男性、中老年、农民为主。     

应用多重PCR方法快速鉴定结核分枝杆菌复合群与非结核分枝杆菌的研究

目的 建立并评估快速鉴定结核分枝杆菌复合群（MTBC）与非结核分枝杆菌（NTM）的多重PCR方法。 方法 应用分别针对MTBC的oxyR-ahpC基因间隔区、MTBC和NTM的rpoB基因可变区的3对分枝杆菌特异性引物进行多重PCR扩增,扩增产物分别为473 bp、235 bp和136 bp。应用该多重PCR方法对6株MTBC标准株、50株NTM标准株、312株MTBC临床分离株和300株NTM临床分离株进行了初步菌种鉴定。 结果 经多重PCR 扩增后进行凝胶电泳,MTBC标准株473 bp和235 bp片段均可见,NTM标准株仅见136 bp片段。312株MTBC临床分离株中,310株扩增出473 bp和235 bp片段,敏感度为99.36%（310/312）,特异度为99.32%（294/296）;300株NTM临床分离株中,294株扩增出136 bp片段,敏感度为98.00%（294/300）,特异度为100.00%（310/310）。 结论 该多重PCR方法可检测并鉴别MTBC及NTM,具有高度的特异度和敏感度,有可能作为鉴别MTBC与NTM的有价值的检测手段。     

非结核分枝杆菌感染特点与药物选择研究进展

非结核分枝杆菌亦称非典型分枝杆菌,指结核杆菌以外(不包括麻风杆菌)的分枝杆菌,由该菌感染所致疾病叫非结核分枝杆菌病。近年来,随着引起免疫功能低下的疾病不断增多及艾滋病的流行,结核病和非结核分枝杆菌引起的感染性疾病发病率有所上升,严重威胁着人类的健康和生命安全。     

MIRU-新的结核分枝杆菌基因型分型方法简介

结核病目前仍然是危害人类健康的重要传染病之一。由于结核病具有潜伏感染的特点，传统的流行病学方法不能很好地揭示其传播规律。分子生物学与流行病学研究方法相结合产生的分子流行病学在这方面有着不可替代的优势。从20世纪90年代开始它已广泛应用于结核病爆发流行，传染源的寻找和追踪，     

西安市非结核分枝杆菌感染现状调查分析

目的 了解西安市结核病患者中非结核分枝杆菌感染情况。方法 收集西安市胸科医院检验科分离培养的分枝杆菌临床菌株,利用两步PCR方法及PCR产物直接测序的方法进行菌种鉴定。结果 经鉴定发现,收集的202株分枝杆菌中有195株为结核分枝杆菌,3株为牛结核分枝杆菌,2份为鸟分枝杆菌,1份为堪萨斯分枝杆菌,1份为灰色链霉菌,非结核分枝杆菌感染率为1.5%(3/201)。结论 西安市尚存在一定比例非结核分枝杆菌感染,进一步菌种鉴定有利于临床正确诊断和合理用药治疗。     

西安市非结核分枝杆菌感染现状调查分析北大核心CSCD

目的了解西安市结核病患者中非结核分枝杆菌感染情况。方法收集西安市胸科医院检验科分离培养的分枝杆菌临床菌株,利用两步PCR方法及PCR产物直接测序的方法进行菌种鉴定。结果经鉴定发现,收集的202株分枝杆菌中有195株为结核分枝杆菌,3株为牛结核分枝杆菌,2份为鸟分枝杆菌,1份为堪萨斯分枝杆菌,1份为灰色链霉菌,非结核分枝杆菌感染率为1.5%(3/201)。结论西安市尚存在一定比例非结核分枝杆菌感染,进一步菌种鉴定有利于临床正确诊断和合理用药治疗。     

40株非结核分枝杆菌菌种鉴定及其耐药情况分析

目的：对40株非结核分枝杆菌（ NTM）进行菌种鉴定,并观察其耐药情况。方法收集来源于肺结核患者痰标本的40株NTM,经Bactec MGIT960系统培养,应用基因芯片分型,采用绝对浓度法对其进行10种抗结核药物敏感性测试。结果40株NTM中,胞内分枝杆菌20株,龟分枝杆菌9株,堪萨斯分枝杆菌4株,戈登分枝杆菌3株,偶然分枝杆菌2株,浅黄分枝杆菌、土分枝杆菌各1株;其中,同时合并结核分枝杆菌复合群感染者3例,分别为龟分支杆菌2例、土分枝杆菌1例。 NTM对抗结核药物的总体耐药率100％。其中对10种所测试药物全部耐药9株,以龟分枝杆菌为主（占77．8％）;NTM对乙胺丁醇的敏感率为62．5％,高于其他药物（P均＜0．05）。结论40株NTM中胞内分枝杆菌比例最高,其次为龟分枝杆菌、堪萨斯和戈登分枝杆菌;NTM耐药情况严重,对乙胺丁醇敏感性较高。     

耐药性结核分枝杆菌的分子生物学研究现状

我国的结核病疫情和耐药情况都相当严重，耐多药结核患者采用目前标准的化疗方案治疗无效，而传统的药敏试验需要1～2个月时间，使耐药菌在局部播散。因此，耐药结核分枝杆菌（MTB）的快速鉴定对结核病的早期诊断、有效化疗和控制传播都有极其重要的意义。     

分枝杆菌的多相分类鉴定

20世纪80年代以来，细菌分类学取得了两个方面的巨大发展：其一是分子生物学技术的应用推动了细菌系统发育的研究，其二是多相分类（Polyphasic Taxonomy）的应用预示着分类单元一致性的到来，它们是现代细菌分类发展过程中重要的里程碑。多相分类的概念最初是由Colwell提出。     

应用气相色谱技术分析全细胞脂肪酸快速鉴定分枝杆菌

目的探讨应用气相色谱技术分析全细胞脂肪酸进行分枝杆菌菌种鉴定方法的准确性和实用性。方法应用美国MIDI公司开发的基于细胞脂肪酸成分鉴定细菌菌种的软件系统MIS4．0，对14株分枝杆菌参考菌株和727株分枝杆菌临床分离株进行菌种鉴定，同时采用传统方法对相同菌株进行菌种鉴定，比较两种方法的检测结果。结果(1)参考菌株鉴定：应用传统方法对所有菌株均获得正确鉴定结果，应用脂肪酸分析方法则除母牛分枝杆菌外，其他13株均获得正确鉴定结果。(2)临床分离株鉴定：传统方法鉴定为结核分枝杆菌、牛分枝杆菌的625株中，应用脂肪酸分析方法有45株鉴定为非结核分枝杆菌，对结核分枝杆菌鉴定的正确率为93％；对传统方法鉴定为非结核分枝杆菌的102株菌株，脂肪酸分析法亦全部鉴定为非结核分枝杆菌，但其中7株的菌种鉴定结果不同，其鉴定正确率为93％。(3)脂肪酸分析法对结核分枝杆菌鉴定错误者主要是将其鉴定为胃分枝杆菌、次要分枝杆菌和耻垢分枝杆菌，对非结核分枝杆菌则主要是将瘰疬分枝杆菌鉴定为戈登分枝杆菌。结论应用气相色谱技术分析全细胞脂肪酸进行分枝杆菌菌种鉴定，和传统鉴定方法结果具有良好的一致性，且可通过一次性实验操作将临床中常见的分枝杆菌鉴定到种，是一种准确度高、实用性强的分枝杆菌菌种鉴定方法。