不同地域东亚钳蝎蝎毒的双向电泳鉴定

摘要 目的利用蛋白质组学中双向电泳技术,定性鉴定、分析不同地域东亚钳蝎蝎毒活性的差别,探索不同产地蝎毒的蛋白质组成及功能差异。方法将不同产地的冷冻干燥蝎毒粉经溶解、除盐、浓缩后测定蝎毒蛋白质含量,进行定量的蝎毒鉴定。采用pH梯度等电聚焦和SDS PAGE凝胶电泳技术分离蝎毒蛋白质。银染后通过凝胶成像系统获得双向电泳凝胶图谱,用PD Quest图像分析软件比较分析,确定差异的特征蛋白点,从而定性鉴定不同产地蝎毒。结果获得3个样品的蛋白质指纹图谱。分别检测出80,69和77个点,特征差异蛋白点依次为56,46和55个。结论不同产地的东亚钳蝎蝎毒通过双向电泳分离蛋白后,表现出明显不同的蛋白点分布。     

六味地黄丸对兔退变椎间盘髓核及纤维环的保护作用

目的探讨六味地黄丸对兔退变椎间盘髓核及纤维环细胞的保护作用。方法选择8月龄成年新西兰兔6只利用异常应力负荷及椎间失稳法建立新西兰兔腰椎椎间盘退变模型,病理切片确认模型成功后,取椎间盘分离软骨终板,将髓核及纤维环组织进行细胞培养,将生长良好的细胞随机分为对照组、损伤组与含药组。对照组细胞培养用胎牛血清体积分数为0.01的DMEM培养基;损伤组给予体积分数为0.01的胎牛血清与浓度为5μg/L的TNF-a混合的DMEM培养基;含药组为体积分数为0.01的六味地黄丸含药血清加体积分数为0.01的胎牛血清与浓度为5μg/L的TNF-a混合的DMEM培养基。使用细胞增殖—毒性检测试剂盒(CCK-8)检测各组兔退变椎间盘细胞增殖的影响。实时荧光定量PCR检测聚集蛋白聚糖、Ⅱ型胶原、基质金属蛋白酶-13基因的表达差别。结果对照组椎间盘细胞初期正常生长,增殖良好,随着时间延长,细胞数量减少,凋亡细胞数量增多,细胞外基质胶原减少,细胞形态变化快。损伤组能够明显抑制椎间盘软细胞的增殖,细胞及细胞外基质胶原数量减少明显,同时间点比较,细胞凋亡数量增多,与正常组比较差异有统计学意义(P<0.05),而含药组细胞增殖缓慢,细胞数量下降缓慢,细胞凋亡数量减少,细胞外基质胶原成分下降不明显,3组之间比较差异有统计学意义(P<0.05)。与对照组比较,损伤组椎间盘细胞蛋白聚糖、Ⅱ型胶原mRNA表达下调增加,基质金属蛋白酶-13基因表达上调明显。与损伤组比较,而六味地黄丸含药血清组椎间盘细胞蛋白聚糖、Ⅱ型胶原mRNA表达上调,基质金属蛋白酶-13基因表达下调,3组比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论六味地黄丸含药血清能够抑制TNF-a诱导的兔退变椎间盘细胞损伤,起到延缓椎间盘损伤的作用。其机制可能与上调蛋白聚糖及Ⅱ型胶原表达及下调基质金属蛋白酶表达有关。     

小分子药物kartogenin保护终板软骨退变的实验研究

目的：研究小分子药物kartogenin（KGN）对终板软骨组织细胞外基质分泌的影响,探讨其在终板软骨以及椎间盘退变中的作用。方法：建立大鼠椎间盘体外器官退变模型,分为对照组、退变组（穿刺注射生理盐水）、KGN处理组（穿刺注射100nmol／LKGN）,利用HE染色观察终板软骨及椎间盘形态,番红一固绿染色观察终板软骨细胞外基质的分泌。通过Realtime—PCR评价三组终板软骨组织中Ⅱ型胶原、蛋白多糖、SOX-9的表达变化,Westernblot检测Ⅱ型胶原、SOX-9蛋白表达变化。结果：HE染色结果显示与对照组比较,退变组椎间盘髓核消失,终板软骨减少,发生明显退变,KGN处理组椎间盘结构较完整;番红一固绿染色可见实验组较对照组终板软骨细胞外基质分泌增多。Reahime-PCR结果显示退变组终板软骨组织Ⅱ型胶原、蛋白聚糖及SOX-9表达明显下调,KGN处理组中终板软骨组织Ⅱ型胶原、蛋白聚糖及SOX-9表达上调;Westernblot结果显示实验组软骨细胞中Ⅱ型胶原、SOX-9蛋白表达明显增高。结论：体外穿刺及培养能够诱导椎间盘及终板软骨的退变,小分子药物KGN能够促进终板软骨细胞外基质的分泌从而保护终板软骨及椎间盘的退变。     

脑脊液S-100B与儿童病毒性脑炎脑脊液蛋白组学关系的研究

目的分析病毒性脑炎(VE)患儿和对照组儿童脑脊液(CSF)蛋白质组的表达差异,筛选VE特异性蛋白,探讨其与VE的关系,为VE的早期诊断提供线索。方法以三氯醋酸/丙酮沉淀法提取VE患儿和对照组儿童CSF总蛋白,固相pH梯度二维聚丙烯酰胺凝胶电泳(2-DE)技术分离蛋白质,应用双向电泳凝胶分析软件(PDQuest 7.3.1)对2-DE凝胶进行量化比较分析,识别差异表达明显的蛋白质点,应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)得到肽质量指纹图谱(PMF),在Mascot数据库中进行蛋白质匹配,鉴定部分差异蛋白质。结果VE患儿和对照组CSF蛋白2-DE凝胶图谱上分别平均显示442和401个点,有23个点蛋白质表达存在2倍以上的差异,选取5个表达明显上调的蛋白质点进行质谱鉴定,成功鉴定出钙结合蛋白S100B。结论钙结合蛋白S100B在VE患儿和无中枢神经系统病变的对照组儿童CSF的蛋白表达上存在明显差异,可能是VE密切相关的疾病特异性蛋白,并有可能成为VE诊断的分子标志物。     

在固相pH梯度4~7范围内海洛因成瘾者血浆蛋白质组分析(英文)

目的比较鉴定海洛因成瘾者和正常人血浆蛋白质组差异,为研究海洛因成瘾相关血浆蛋白提供线索。方法海洛因成瘾者(n=5)和正常对照者(n=5)血浆蛋白经剔除白蛋白和免疫球蛋白IgG后,以固相pH梯度4~7胶条等电聚焦为第一向,SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳为第二向,进行蛋白双向电泳。图像分析软件Image Master Elit 5.0分析蛋白质2维图谱。手工挖取组间相差1.5倍的差异点,串联质谱分析鉴定。结果每张图谱平均检测到350±21个蛋白(亚基)斑点,其中5个蛋白点在2组图谱中差异1.5倍以上,鉴定结果分别为γ纤维蛋白原、人α1B糖蛋白、α1-抗胰蛋白酶原、视黄醇结合蛋白载体蛋白四聚体单体和铜蓝蛋白。结论海洛因成瘾者血浆与正常人血浆对比存在蛋白质组差异。某些差异蛋白可能与海洛因成瘾造成的神经损伤相关。     

ONO-AE-248诱发中性粒细胞非凋亡性程序化死亡的蛋白质组学分析方法的建立

目的:建立双向电泳技术和质谱技术在探索ONO-AE-248诱发的中性粒细胞(neutrophil,PMN)非凋亡性程序化死亡的分子机理研究中的应用,为深入认识“非凋亡性程序化死亡“这种新的死亡方式提供新的有效的研究途径.方法:将采用梯度离心法分离的,人正常PMN,分为正常对照组和实验组,实验组用ONO-AE-248刺激12小时建立非凋亡性坏死模型,提取对照组和实验组全蛋白,双向电泳分离蛋白质,采用PDQuest 2-DE软件分析找出两组间差异表达的蛋白质斑点,用基质辅助激光解吸电离飞行时间串联质谱(MALDI-TOF-MS)进行鉴定.结果:双向电泳图谱显示:ONO-AE-248诱导的人PMN非凋亡性程序化细胞死亡与PMN的自发性凋亡的蛋白质组存在差异显著,质谱鉴定初步得到其中12种差异表达的蛋白质.结论:双向电泳和质谱鉴定技术可以有效的分离和分析ONO-AE-248诱发的PMN非凋亡性坏死的蛋白质组,为进一步探索“非凋亡性程序化死亡“方式提供了新的方法和途径,为丰富细胞死亡方式带来了新的前景.     

丝素蛋白来源的一体化纤维环-髓核支架的制备与评估

目的 评估以丝素蛋白为材料构建的一体化纤维环-髓核双相支架作为组织工程椎间盘支架的可行性。方法 以丝素蛋白溶液为原料, 分别采用石蜡球致孔法和相分离法制备三维多孔一体化纤维环-髓核支架。采用体视显微镜、 扫描电镜观察支架内部结构, 测定双相支架纤维环相和髓核相的孔径、 孔隙率及一体化压缩弹性模量; 分离培养兔纤维环细胞和髓核细胞, 接种至双相支架的相应部位, 体外培养 48 h, 扫描电镜、 死活 （Live/dead） 细胞染色评价支架与细胞的生物相容性; CCK-8 检测细胞的增殖活性。结果 体视显微镜和扫描电镜可见双相支架纤维环相和髓核相均呈相互连通的多孔结构, 孔隙高度连通, 纤维环髓核交接区域结合紧密; 纤维环相孔径为 （220.0±23.1）μm, 髓核相孔径为 （90.0±17.8） μm; 孔隙率分别为 91%和 93%; 一体化支架压缩弹性模量为 （150.7±6.8） kPa。扫描电镜可见均匀地黏附在支架表面, 细胞周围有细胞外基质分泌; Live/dead 染色显示细胞在支架上活性良好, 无死细胞;CCK-8 增殖分析显示纤维环细胞和髓核细胞均具有良好的增殖活性。结论 以天然丝素蛋白构建一体化纤维环髓核双相支架, 具有良好的孔径、 孔隙率和细胞相容性, 一体化支架两部分结合紧密, 并且具有优越的力学性能, 是构建组织工程椎间盘的理想支架载体。     

急性淋巴细胞白血病白细胞的蛋白质组研究

目的:在建立人外周血白细胞蛋白质组分析方法的基础上,对健康志愿者和急性淋巴细胞白血病(ALL)患者白细胞的蛋白质组进行差异性分析,寻找与ALL相关的蛋白质。方法:收集10例健康志愿者和10例ALL患者外周血标本,分离白细胞,提取白细胞蛋白质,双向电泳分离蛋白质,PDQuest2D软件对双向电泳图谱进行差异分析,基质辅助的激光解析飞行时间质谱鉴定差异蛋白质。结果:利用PDQuest2D软件对健康志愿者与ALL患者外周血白细胞蛋白质双向电泳图谱进行差异分析,根据基质辅助的激光解析飞行时间质谱鉴定结果确定了与ALL相关的蛋白质有AnnexinA5、cytoskeleton14等。结论:经质谱鉴定和生物信息学分析,确定了蛋白质AnnexinA5、cytoskeleton14与ALL的发生有着密切的关系,为寻找该类型白血病的药物治疗靶点及早期诊断的分子标志物提供了良好的实验依据。     

甲基苯丙胺致PC12细胞的差异蛋白表达

目的探讨甲基苯丙胺(METH)作用于PC12细胞后的蛋白质表达变化。方法 METH2.5 mmol·L-1作用PC12细胞24 h后,提取细胞总蛋白质,丙酮沉淀法纯化蛋白,Braford法对蛋白质进行定量,并对蛋白质进行双向凝胶电泳,Image scannerⅢ透射扫描仪获取凝胶电泳图谱。应用Image Master 7.0软件对获得的双向凝胶电泳图谱进行差异性蛋白质点分析,并对相应差异蛋白点用高端基质辅助激光解析-飞行时间(MALDI-TOF)串联质谱仪进行差异蛋白质鉴定。结果应用双向凝胶电泳结合质谱分析技术,METH作用PC12细胞24 h后,共鉴定出18个差异表达蛋白质点,其中8个差异蛋白点在METH作用后表达增强,10个蛋白点表达减弱。这些蛋白质主要包括细胞骨架相关蛋白、分子伴侣、氧化应激和凋亡相关的蛋白以及与能量代谢相关的酶类。结论 METH诱导PC12细胞18个蛋白差异表达。     

二烯丙基二硫诱导人胃癌MGC803细胞分化的差异蛋白质分析

目的研究二烯丙基二硫(diallyl disulfide,DADS)诱导人胃癌MGC803细胞分化过程中蛋白质的差异表达。方法用固相pH梯度双向凝胶电泳分离DADS处理前后人胃癌MGC803细胞总蛋白,凝胶经过银染后用PDQuest软件进行分析,差异蛋白质点经胶内原位酶解,用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)测定肽质量指纹图(PMF),将所得的数据进行生物信息学处理。结果 DADS处理MGC803细胞前后的总蛋白质的双向电泳银染图谱,经扫描成像及PDQuest软件分析,对照组与处理组蛋白质点与平均匹配率分别为(576±14)个和(583±4)个与76%和70%,421个匹配,200个未被匹配。经相关数据库查询,在初步鉴定的差异蛋白质点中,发现24个与细胞分化、肿瘤转移、细胞凋亡、细胞周期、细胞免疫及代谢等相关的蛋白质,如gastric mucin、nM23、CDC2、uPAR、LIMK、RORα、MHC DR-beta-1 chain、TCR等,这些蛋白质可能在胃癌的发生发展中起着潜在的作用。结论 DADS可能通过多种途径诱导MGC803细胞分化。蛋白质组差异表达的初步分析为进一步研究胃癌分化的相关蛋白质及标记物奠定一定基础。     

Ⅰ期非小细胞肺癌相关血清差异表达蛋白的研究

目的:寻找Ⅰ期非小细胞肺癌(NSCLC)与健康人血清的差异表达蛋白.方法:收集天津市胸科医院经手术、病理证实的6例Ⅰ期NSCLC患者血清,等量混合后设为肺癌组;同期15例健康体检血清,等量混合后设为健康对照组.利用双向凝胶电泳(2-DE)和基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)分离、筛选和鉴定2组间的差异表达蛋白.结果:成功获得了2组的双向凝胶电泳图谱,PDquest软件分析显示,2组间差异大于2倍的蛋白质点共有128个,质谱鉴定后确定了10种蛋白质,其中7种表达量上调,分别为α1-酸性糖蛋白、C1酯酶抑制物、血管紧张素原、转铁蛋白、转甲状腺素蛋白、间-α-胰蛋白酶抑制剂重链H2及无花果酶-3;3种表达量下调,分别为纤连蛋白、补体C4-A及补体C3.结论:应用2-DE及MALDI-TOF-MS在Ⅰ期NSCLC血清中鉴定出4种与肿瘤关系密切的差异表达蛋白,可作为开发NSCLC早期诊断标志物的候选蛋白.     

姜黄素对人正常肝细胞角蛋白1和内质网蛋白19表达的影响

目的应用双向凝胶电泳、质谱技术和蛋白免疫印迹研究姜黄素(Curcumin,CUR)对人正常肝细胞蛋白质组的影响。方法随机将人正常肝细胞L-02分成两组,对照组不作任何处理,姜黄素组以25μmol.L-1姜黄素处理L-02细胞24 h。用双向凝胶电泳建立姜黄素组和对照组的双向凝胶电泳图谱,并用Image Master 2D Platinum 6.0软件进行差异蛋白质组分析,所获得的明显差异蛋白质用MALDI-TOF-MS进行鉴定分析,最后用蛋白免疫印迹法进行验证。结果姜黄素作用于人正常肝细胞后,有2个蛋白质的表达发生明显变化,角蛋白1与内质网蛋白19表达均上调。结论上调角蛋白1和内质网蛋白19可能是姜黄素抗肿瘤、抗氧化作用的机制之一。     

中国实验小型猪冠心病模型的心肌组织蛋白质组学研究

目的研究中国小型猪冠心病模型心肌组织蛋白表达谱的改变情况。方法在建立中国小型猪冠心病模型基础上,应用双向电泳分离各组小型猪心肌组织总蛋白;通过图谱分析软件和基质辅助激光解析-飞行时间质谱技术分别进行差异比较和质谱鉴定及数据比对。结果小型猪冠心病模型组心肌组织与正常组相比共有14个差异蛋白点:13个上调点,1个特异表达点。这些差异点经胶内酶解、MAL-DI-TOF质谱分析及MASCOT搜索引擎检索,鉴定出HSPA8(Hsc70)、apolipoprotein A-IV(apoA-IV)、albumin及desmin4种蛋白。结论初步发现的差异蛋白可能与冠心病的发生、发展相关,但是还需要通过其它方法做进一步验证。     

细粒棘球蚴囊液蛋白质组学的分析研究

目的分析细粒棘球绦虫幼虫生长环境即囊液的蛋白质构成情况,为深入了解棘球蚴的发育、代谢奠定基础。方法采用双向凝胶电泳分离蛋白质,经过图像分析标记,通过自动切胶仪切胶、回收,胶内酶解、纯化以及质谱分析技术分析蛋白样点的数据,最后结合生物信息学方法进行注解。结果在囊液二维电泳图谱上提取约30个蛋白斑点,成功获取21种蛋白的肽指纹图谱,利用生物信息学检索工具MASCOT进行了蛋白鉴定。结论通过建立细粒棘球蚴囊液的二维电泳图谱,初步鉴定出囊液中含人血清铁传递蛋白、人白蛋白、人β-血红蛋白3种蛋白,为从外界干扰囊液中蛋白质构成比方面寻找包虫病治疗的新方法提供了参考依据。     

Comparative and quantitative proteomic analysis of normal and degenerated human annulus fibrosus cells

相似文献   

Proteomic detection of changes in protein expression induced by cordycepin in human hepatocellular carcinoma BEL-7402 cells

The nucleoside analogue cordycepin (3 '-deoxyadenosine, 3 '-dA), one of the components of Cordyceps militaris, has been shown to inhibit the growth of various tumor cells. However, the probable mechanism is still obscure. In this study, the inhibition of cell growth and changes in protein expression induced by cordycepin were investigated in BEL-7402 cells. Using the MTT assay and flow cytometry, we found that cordycepin inhibits cell viability and induces apoptosis in BEL-7402 cells. Additionally, the proteins were separated using two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis, and eight proteins were found to be significantly affected by cordycepin compared to untreated control; among them, two were downregulated and six were upregulated. Of the eight proteins, six were identified with peptide mass fingerprinting using matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF-MS) after in-gel trypsin digestion. These proteins are involved in various aspects of cellular metabolism. It is suggested that the effect of cordycepin on the growth of tumor cells is significantly related to the metabolism-associated protein expression induced by cordycepin.     

Cerebrospinal Fluid Biomarkers for Major Depression Confirm Relevance of Associated Pathophysiology

Individual characteristics of pathophysiology and course of depressive episodes are at present not considered in diagnostics. There are no biological markers available that can assist in categorizing subtypes of depression and detecting molecular variances related to disease-causing mechanisms between depressed patients. Identification of such differences is important to create patient subgroups, which will benefit from medications that specifically target the pathophysiology underlying their clinical condition. To detect characteristic biological markers for major depression, we analyzed the cerebrospinal fluid (CSF) proteome of depressed vs control persons, using two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis and time-of-flight (TOF) mass spectrometry peptide profiling. Proteins of interest were identified by matrix-assisted laser desorption ionization TOF mass spectrometry (MALDI-TOF-MS). Validation of protein markers was performed by immunoblotting. We found 11 proteins and 144 peptide features that differed significantly between CSF from depressed patients and controls. In addition, we detected differences in the phosphorylation pattern of several CSF proteins. A subset of the differentially expressed proteins implicated in brain metabolism or central nervous system disease was validated by immunoblotting. The identified proteins are involved in neuroprotection and neuronal development, sleep regulation, and amyloid plaque deposition in the aging brain. This is one of the first hypothesis-free studies that identify characteristic protein expression differences in CSF of depressed patients. Proteomic approaches represent a powerful tool for the identification of disease markers for subgroups of patients with major depression.     

蚯蚓新型脱氧核糖核酸酶的相对分子质量测定

目的测定蚯蚓组织中一种新型脱氧核糖核酸酶(EWD3)的相对分子质量。方法采用凝胶过滤层析法、十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰氨凝胶电泳法(SDS-PAGE)和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法(MALDI-TOF-MS)3种方法测定一种新型蚯蚓脱氧核糖核酸酶(EWD3)的相对分子质量。结果凝胶过滤层析法、SDS-PAGE法和质谱法测定其相对分子质量分别为55080、58270和63460。结论凝胶过滤层析法和SDS-PAGE法可以常规粗略测定蛋白的相对分子质量,质谱法可以比较准确测定蛋白的相对分子质量,EWD3为单亚基蛋白,其相对分子质量约在55000￣65000之间。