DNA甲基化与胶质瘤

DNA甲基化在胶质瘤的发生、发展中起重要作用。多条重要通路相关基因启动子区域的CpG岛甲基化,其甲基化发生频率与胶质瘤的发生发展、组织类型和病理分级密切相关。某些基因的DNA甲基化可为胶质瘤的早期诊断提供分子生物学标志物,同时由于DNA甲基化具有可逆性,可以为胶质瘤基因治疗提供新的靶点,还可以用来评价预后。     

脊索瘤分子标志物和治疗靶点的研究进展

脊索瘤是一种罕见的、残留脊索组织来源的恶性肿瘤。由于目前缺乏有效的治疗手段, 脊索瘤容易出现局部复发和远处转移, 多数患者的预后较差。近年来脊索瘤相关基因组学的研究发现, 脊索瘤基因组的特点在于染色体畸变及基因拷贝数变异常见, 而基因突变负荷相对较低。并且发现了若干分子和信号通路(如Brachyury基因、染色质重构相关基因、PI3K/AKT/mTOR信号通路、CDKN2A基因等)在脊索瘤的发生、发展中发挥重要作用, 为脊索瘤的诊断和预后评估提供了指导, 并有望成为脊索瘤治疗的分子靶点。     

胶质瘤MGMT启动子甲基化定量检测的MS-HRM方法建立及评估

目的建立甲基化特异高分辨率溶解曲线(Methylation sensitive high resolution melting curve,MS-HRM)定量检测胶质瘤MGMT基因启动子甲基化的方法,用于指导胶质瘤患者术后化疗及预后判断。方法从标本库随机选取胶质瘤组织37例,提取DNA进行甲基化修饰,应用MS-HRM方法和甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,MSP)进行MGMT基因启动子区甲基化检测。结果 MSP方法检测显示部分甲基化标本29例(78.4%),较甲基化(13.5%)和未甲基化(8.1%)差异显著。MS-HRM发现MGMT基因启动子甲基化水平在10%~25%和25%~50%的标本分别有14例(37.8%)和17例(49.5%)。结论成功建立MS-HRM检测胶质瘤MGMT启动子甲基化的方法,该方法特异性高、灵敏度强和可重复性,有望应用于临床胶质瘤MGMT启动子甲基化高通量定量检测,以指导个体化治疗。     

儿童青少年注意缺陷多动障碍外周血全基因组DNA甲基化研究

目的 应用甲基化芯片技术对注意缺陷多动障碍（ADHD）患儿DNA甲基化特征进行研究, 探讨 DNA 甲基化在 ADHD 发病机制中的作用。方法 于 2018 年 10 月至 2019 年 5 月选取在首都医科大 学附属北京安定医院门诊确诊的 8 例 8～16 岁的儿童青少年 ADHD 患儿作为 ADHD 组;招募 8 名年龄、 性别与 ADHD 组匹配的健康儿童青少年作为对照组。采用 Illumina Infinium Methylation EPIC Bead Chip 芯片（850K 芯片）技术对受试者进行全基因组 DNA 甲基化检测,分析和筛选差异甲基化位点。采用 gene ontology（GO）富集分析和 pathway 分析对筛选基因进行功能分类和通路分析。结果 与对照组比较, ADHD 组共有 2 068 个 CpG 位点甲基化水平发生改变,差异有统计学意义（P＜ 0.05）。其中有 842 个高 甲基化位点,1 226 个低甲基化位点,对应 468 个高甲基化基因如 GPR88、ARHGEF10 等,对应 705 个低 甲基化基因如 SKI、PMP2、PRR12、EBF3、BRSK2 等。GO 富集分析显示,差异甲基化基因参与生物学过 程富集于系统发育、神经系统发育以及细胞黏附等。pathway 分析显示,差异甲基化基因与钙黏蛋白信 号通路、神经元系统、Wnt 信号通路、谷氨酸能突触等信号通路相关。结论 DNA 甲基化的异常参与了 ADHD 的发生发展,检测出的差异甲基化基因可能成为 ADHD 的生物标志物或预测因子,差异甲基化基 因相关的信号通路可能与 ADHD 的发病机制相关。     

TRIM38基因非CpG岛DNA甲基化与胶质母细胞瘤临床预后的关系

目的 探讨免疫基因TRIM38非CpG岛DNA甲基化在胶质母细胞瘤（GBM）中改变模式和临床意义。方法 利用公共数据库,比较TRIM38甲基化在GBM与非肿瘤脑组织（NTB）中的差异程度,并通过统计分析探讨该基因甲基化水平与基因表达、病人预后、生物学背景的关系。结果 纳入3组GBM（共509例）和3组NTB（共37例）样本。TRIM38基因非CpG岛DNA甲基化位点在GBM中呈低甲基化改变（P<0.05）,而其基因表达呈现高表达改变（P<0.05）,并且甲基化与基因表达呈显著负相关（P<0.05）。TRIM38低甲基化病人生存时间明显短于高甲基化组（P<0.05）,甲基化水平是独立的预后影响因子（P<0.05）。TRIM38低甲基化GBM样本可能富集免疫调节及Toll样受体通路相关的基因簇。结论 TRIM38可能在GBM中通过非CpG岛低甲基化介导的基因异常表达上调,参与肿瘤发生、发展;TRIM38非CpG岛甲基化可能作为指导GBM预后评价的潜在生物标记物;TRIM38甲基化导致的预后差异很可能与Toll样受体通路及免疫调节的差异有关。     

活动节段脊柱脊索瘤生物学行为研究进展

脊索瘤是临床少见的原发性低度恶性骨肿瘤,源自残留的胚胎脊索或迷走的脊索组织,好发于中轴骨,具有局部侵袭性、复发率高、预后差,以及对放射治疗和药物化疗不敏感等特点,使其临床治疗存在巨大挑战。位于活动节段的脊柱脊索瘤由于脊柱特有的解剖学特点而具有其独特特点,本文通过回顾近年国内外相关文献,对脊索瘤生物学行为特点进行概述,以期为脊索瘤治疗提供新的思路。     

胶质瘤患者抑癌基因RASSF1A启动子区甲基化研究

目的探讨RASSF1A抑癌基因在胶质瘤组织及脑正常组织中甲基化程度及与临床特征的关系。方法46例脑胶质瘤组织及6例脑正常组织采自手术患者。用甲基化特异性聚合酶链反应（MS—PCR）方法检测46例胶质瘤（其中包括星形细胞瘤19例，室管膜瘤16例，胶质母细胞瘤11例）及6例脑正常组织中RASSF1A基因甲基化状态。并对RASSF1甲基化发生率与临床各因素之间的关系进行分析。结果（1）46例脑胶质瘤组织DNA标本中RASSF1A基因甲基化发生率为65．2％（30／46）；6例脑正常组织中RASSF1A基因启动子未发生甲基化；RASSF1A在胶质瘤和脑正常组织之间发生甲基化率比较差异有显著性，（P=0．017，P〈0．05）。在46例脑胶质瘤中RASSF1A有30例发生甲基化，其中低级别组14例（14／26），高级别组16例（16／20），两组之间甲基化率比较无明显差异，（P〉0．05）。其中星形细胞瘤，室管膜瘤，胶质母细胞瘤甲基化发生频率分别为63．2％（12／19），68．8％（11／16），63．6％（7／11）。在各组之间甲基化发生率比较均无统计学意义，（P〉0．05）。②RASSF1A基因甲基化程度与脑胶质瘤病理分型、肿瘤大小之间无显著相关性。结论RASSF1A在胶质瘤中有甲基化发生，在脑正常组织中未发生甲基化，检测胶质瘤中RASSF1A基因启动子区甲基化情况对临床判断肿瘤发生发展有指导意义。     

ANXA7基因mRNA水平在神经胶质瘤中的研究

目的研究ANXA7基因mRNA水平与神经胶质瘤的相关性。方法选择神经胶质瘤患者70例,健康对照组24例。提取脑组织mRNA,设计定量PCR引物与探针,经PCR扩增进行荧光定量分析。结果定量PCR检测结果显示,24例正常脑组织ANXA7基因mRNA水平高于70例神经胶质瘤患者(p=0.001);同时高级别神经胶质瘤患者ANXA7基因mRNA水平低于低级别组(P=0.01)。最后我们采用DNA甲基化特异性PCR技术(MS-PCR)检测70例神经胶质瘤患者ANXA7启动子区甲基化水平,并与其mRNA水平进行相关性分析,结果显示高甲基化组ANXA7基因mRNA水平显著低于低甲基化组(p=0.003)。结论 ANXA7基因表达降低与ANXA7基因启动子区甲基化水平有一定相关性,与神经胶质瘤的发生发展密切相关,为疾病进展的早期监测提供分子理论依据。     

胶质母细胞瘤FMOD基因非CpG岛DNA甲基化水平与病人预后的关系

目的 探讨纤调蛋白（FMOD）基因非CpG岛区域DNA甲基化在人脑胶质母细胞瘤（GBM）中的改变模式以及与基因表达、临床预后的关系。方法 检索国癌症基因组图谱计划数据库（TCGA）和国国立卫生院下属基因表达数据库（GEO）下载人脑GBM组织基因表达芯片GSE36278、GSE22891及GSE50923。分析FMOD基因的CpG探针[cg26987645和cg03764585,均来自人类全基因组DNA甲基化芯片（Infinium HumanMethylation 27 k和450 k BeadChips）,均位于非CpG岛区域（www.illumina.com）]β值（与甲基化水平呈正相关）。结果 与非肿瘤组织相比,GBM组织FMOD基因非CpG岛区域探针cg26987645和cg03764585的β值均显著下降,提示GBM组织FMOD基因发生特异性低甲基化。将CpG岛区域探针cg26987645和cg03764585的β值与mRNA数据进行关联分析发现,DNA甲基化水平与FMOD基因表达水平呈显著负相关（P<0.001）。Cox回归分析显示,随FMOD基因CpG岛区域探针cg26987645和cg03764585的β值增加,GBM病人生存期显著延长（P<0.05）。FMOD基因非CpG岛cg03764585和cg26987645探针分析显示,非G-CIMP亚型病人甲基化水平较G-CIMP亚型病人明显降低（P<0.05）,而FMOD基因表达水平明显增高（P<0.05）。结论 本文结果提示,GBM组织FMOD基因非CpG岛区域呈低甲基化表现,与FMOD基因表达和病人生存预后均呈明显负相关。     

颅内脊索瘤临床与病理研究现状

脊索瘤是一种较为少见的肿瘤,呈缓慢的侵袭性生长,可以发生在颅底斜坡、鞍区,也可发生在脊椎骶尾部。在人类胚胎发育的第四周时即出现脊索结构1,随着胚胎的发育,脊索逐渐退化,但位于颅底蝶枕部及脊椎骶尾部的部分脊索组织不完全退化而残留下来,以往认为该肿瘤来源于胚胎残余。有作者认为这种残留的组织在一定条件的作用下,如刺激和创伤2或激素水平增高,如人-β绒毛膜促性腺激素3.4等因素的影响可能发生肿瘤性增殖而形成脊索瘤。Ribbert于1894年最早提出了脊索瘤的诊断,1903年Grahl首次对颅底脊索瘤进行了描述。本文将颅内脊索瘤的临床特点…     

颅底脊索瘤的研究进展

颅底脊索瘤是源于骨组织的一种罕见肿瘤,多见于中年人,男性略占多数。脊索瘤的临床表现不一,主要为颅压增高和肿瘤局部压迫症状。对于较大或者粘连程度较重的肿瘤,首选开颅手术治疗,术后辅助放疗以延长患者无疾病生存时间。脊索瘤的分子病理学和基因学研究,诸如生长因子类、基质金属蛋白酶类等及其基因位点,是目前研究的热点。最新发现的brachyruy homolog基因,可能与脊索瘤的发生、发展相关。     

恶性胶质瘤SPARC基因的甲基化状态及其表达水平分析

目的探讨胶质瘤组织中富含半胱氨酸的酸性分泌性糖蛋白（SPARC）基因甲基化状态和mRNA表达水平及两者相关性。方法2008年3月至2011年12月收集98例胶质瘤组织标本和98例正常脑组织标本（颅脑损伤患者术中切取）以及胶质瘤细胞系LN229,提取DNA和RNA,利用甲基化特异性聚合酶链反应（MSP）检测SPARC基因甲基化状态;利用实时荧光定量PCR检测SPARC基因mRNA表达水平。结果胶质瘤细胞系LN229中SPARC基因呈高度甲基化,其mRNA表达水平极低;去甲基化处理后,mRNA表达水平明显升高（P〈0．01）。胶质瘤组织中SPARC基因甲基化率（70．4％,69／98）明显高于正常脑组织（21．4％,21／98;P〈0．01）,但其mRNA表达水平明显低于正常脑组织（P〈0．01）。而且随着胶质瘤级别的增加,胶质瘤组织中SPARC基因甲基化率明显呈升高（P〈0．05）,但其mRNA表达水平却明显降低（P〈0．01）。伴有SPARC基因甲基化的胶质瘤组织SPARC基因mRNA表达水平明显低于非甲基化胶质瘤组织（P〈0．01）。然而,伴有SPARC基因启动子甲基化的胶质瘤患者生存期与非甲基化患者无统计学差异（P〉0．05）。结论胶质瘤组织中SPARC基因呈高甲基化状态,其mRNA呈低水平表达;SPARC基因mRNA表达水平受其甲基化的影响;SPARC基因高甲基化可能与胶质瘤的发生相关。     

胶质瘤的DNA甲基化研究新进展

DNA甲基化主要指DNA的5'-胞嘧啶甲基化,是真核生物DNA的一种最常见的修饰方式,也是一种重要的表遗传学机制.近年来,DNA甲基化与胶质瘤相关性研究表明,许多肿瘤相关基因启动子区域CpG岛高甲基化与胶质瘤的形成关系密切.     

ANXA7基因异常甲基化与神经胶质瘤发生相关性的研究

目的 研究ANXA7基因异常甲基化与神经胶质瘤发生的相关性.方法 采用硫化测序PCR(BS-PCR)引物以及DNA甲基化特异性PCR(MS-PCR)引物检测ANXA7基因在人脑神经胶质组织及正常脑组织中的表达差异,随后经PCR扩增进行电泳以及测序分析.结果 5例健康标本及5例神经胶质瘤患者标本DNA经硫化且BS-PCR测序分析,其健康标本甲基化率分别为1.5％、1％、1％、1.5％、1％,神经胶质瘤患者甲基化率分别为92％、78.5％、86％、56％、90％;MS-PCR分析结果显示:ANXA7基因在24例正常脑组织中呈完全非甲基化状态,在60例神经胶质瘤患者中其甲基化阳性率为46.67％(p=0.000);高级别神经胶质瘤患者甲基化阳性率(56.67％)高于低级别组(26.67％)(P=0.018).结论 ANXA7基因异常甲基化可能参与神经胶质瘤的发生发展.     

胶质瘤DNA甲基化与叶酸代谢

DNA甲基化是表观遗传学的主要表现形式,大量肿瘤抑制基因、细胞周期调控基因、DNA损伤修复基因、肿瘤侵袭相关基因等启动子区域甲基化,与胶质瘤的发生发展密切相关。叶酸作为甲基的供体参与体内甲基化与DNA合成过程,其缺乏和代谢异常与胶质瘤的发生发展有关。了解胶质瘤DNA甲基化与叶酸代谢,对胶质瘤的预防和治疗将产生积极作用。现就胶质瘤DNA甲基化与叶酸代谢的相关研究进展作一综述。     

颅底脊索瘤的综合治疗

颅底脊索瘤治疗棘手,手术治疗具有较高的致残率和致死率,术后复发率高;放射治疗对于颅底脊索瘤的治疗有一定的帮助。文献认为原发颅底脊索瘤首选根治性切除术,术后辅助放射治疗;复发颅底脊索瘤,以缓解患者症状为主,延长患者的生存期及提高生活质量。脊索瘤的基础研究,如络氨酸激酶受体家族、Brachyury等,将有助于靶向治疗等新的治疗手段应用于临床。     

脊索样形态特征肿瘤的临床病理分析

目的探讨中枢神经系统内具有脊索样形态特征肿瘤的临床病理特征。方法对42例脊索瘤、6例脊索样脑膜瘤及2例第三脑室脊索样胶质瘤的临床资料和组织形态学资料进行回顾性分析。结果脊索瘤好发于颅底及骶尾部;镜下肿瘤组织呈分叶状结构,瘤细胞以条索状、簇状或单细胞结构漂浮在淡蓝色粘液样基质中,胞浆内可见空泡,瘤内可见液滴样细胞;瘤细胞细胞角蛋白（CK）、上皮膜抗原（EMA）及S-100表达阳性。脊索样脑膜瘤好发于幕上,与脑膜关系密切;组织学大部分类似于脊索瘤,但可找到典型的脑膜瘤结构;瘤细胞EMA、的和波形蛋白（Vim）表达阳性,CK及胶质纤维酸性蛋白（GFAP）阴性。第三脑室脊索样胶质瘤几乎只发生于第三脑室和下丘脑,组织学特点为条索状或簇状排列的上皮样细胞漂浮于粘液样基质中,伴淋巴细胞和浆细胞浸润及胶质细胞增生;肿瘤细胞GFAP、Vim和CD34表达阳性。结论中枢神经系统“脊索样”改变是脊索瘤、脊索样脑膜瘤及第三脑室脊索样胶质瘤共同的组织学特征,但三者组织形态、免疫表型及发病部位又各有特点。其诊断及鉴别诊断需对临床、组织学形态及免疫表型综合分析。     

经鼻内镜斜坡脊索瘤和脊索肉瘤的外科治疗

目的探讨经鼻内镜外科技术在斜坡脊索瘤和脊索肉瘤治疗中的应用、方法2002年11月～2006年2月对7例脊索瘤和2例脊索肉瘤行经鼻内镜手术，其中3例是复发病例、所有病例均有头痛，复视4例．视力障碍或失明3例，鼻塞、嗅觉减退或失嗅4例，面部麻木1例。肿瘤同时侵犯海绵窦和颈内动脉4例。岩尖区5例．寰枢椎2例．随访时间3～39个月。结果6例脊索瘤和1例脊索肉瘤术中内镜下及术后影像学证实完全切除，1例脊索瘤和1例脊索肉瘤次全切除．1例术后出现蛛网膜下腔出血。至随访期结束．7例病人无复发。1例带瘤生存。1例行脊索瘤次全切除的病人5个月后复发。结论经鼻内镜治疗斜坡脊索瘤和脊索肉瘤可以更好地辨认深部结构．视觉效果好，可以大范围切除病变。同时，可以简单迅速地到达斜坡区域。对斜坡脊索瘤和脊索肉瘤是一种较好的手术入路。     

脑胶质瘤SOX7基因的甲基化状态及临床意义

目的 探讨脑胶质瘤SOX7基因的甲基化状态及其与病人预后的关系。方法 收集2013年6月至2015年1月手术切除的胶质瘤标本131例,另取颅脑损伤内减压术中切除的正常脑组织标本32例作为对照。应用甲基化特异PCR及RT-PCR方法检测SOX7基因的甲基化状态及mRNA表达水平。采用Kplan-Meier法分析生存曲线。结果 胶质瘤SOX7基因甲基化率（71.8%,94/131）明显高于正常脑组织（32.4%,11/34;P<0.05）。高级别胶质瘤SOX7甲基化率（81.01%,64/79）明显高于低级别胶质瘤（57.69%,30/52）。胶质瘤SOX7 mRNA水平明显低于正常脑组织（P<0.05）。SOX7基因甲基化组生存期较非甲基化组明显缩短（P<0.01）。结论 胶质瘤SOX7基因甲基化率升高,SOX7在胶质瘤中表达水平下调,SOX7基因的甲基化状态与病人生存期密切相关。     

T10髓内、髓外硬膜下并发脊索瘤1例报告及文献复习

脊索瘤是起源于胚胎脊索结构残余组织的先天性肿瘤,多见于骶尾骨、颅底部及脊柱,发生于脊髓者少见,本文报告1例罕见的发生于胸髓且为髓内、髓外硬膜下并发的脊索瘤.