HLA-B和-DRB1、HLA-DQB1和-DPB1座位基因重组的分析

目的：探讨2个家系人类白细胞抗原(HLA)座位的重组情况。方法：采集家系成员的外周血，提取基因组DNA，采用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针技术(PCR-SSO)和二代测序技术检测HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1和-DPB1座位，通过家系遗传分析确定个体HLA单体型。结果：家系1中单体型HLA-A*11:01～C*03:04～B*13:01～DRB1*12:02～DQB1*03:01～DPB1*05:01:01G与HLA-A*03:01～C*04:01～B*35:03～DRB1*12:01～DQB1*03:01～DPB1*04:01:01G在HLA-B和HLA-DRB1座位间进行了交换，形成HLA-A*11:01～C*03:04～B*13:01～DRB1*12:01～DQB1*03:01～DPB1*04:01:01G。家系2中单体型HLA-A*02:06～C*03:03～B*35:01～DRB1*08:02～DQB1*04:02～DPB1*13:01:01G与HLA-A*11:01～C*07:02～B*38:02～DRB1*15:02～DQB1*05:01～DPB1*...     

四川骨髓库人群HLA-DQA1和DQB1等位基因及其单体型分布研究

目的探索四川骨髓库人群HLA-DQA1和DQB1等位基因及HLA-DQA1～DQB1单体型分布。方法 2018年2月—2019年2月,四川骨髓库收集664(人)份造血干细胞捐献志愿者样本,利用NGS技术对其进行基因测序,使用Type Stream~(TM )Visual 1.3.0软件对HLA-DQA1和DQB1进行高分辨率分型,使用Arlequin 3.1软件的EM算法计算HLA-DQA1和DQB1等位基因频率和HLA-DQA1～DQB1连锁不平衡参数。结果本组人群检测到16种HLA-DQA1和25种HLA-DQB1,DQA1~*01∶02、DQA1~*03∶02、DQB1~*03∶01∶01G、DQB1~*03∶03、DQB1~*05∶02和DQB1~*06∶01为高频等位基因。与美洲印第安人、非洲黑人和西班牙高加索人相比,四川骨髓库人群HLA-DQA1等位基因种类最多,高频等位基因频率差异较大(P0.05),DQA1~*05∶06、DQA1~*05∶08和DQA1 ~* 06∶01为其特有的等位基因。本研究检测24种可用于人群调查且连锁不平衡差异具有统计学意义的HLA-DQA1～DQB1单体型(P0.05)。结论四川骨髓库人群HLA-DQA1等位基因多态性程度高,高频等位基因分布相对集中,HLA-DQA1～DQB1单体型种类较多。     

恶性血液病患者造血干细胞移植前PRA、MICA抗体水平分析

目的分析恶性血液病患者造血干细胞移植前PRA-Ⅰ、Ⅱ类及MICA抗体阳性率和特异性频率。方法应用LSA方法检测恶性血液病患者PRA-Ⅰ、Ⅱ类及MICA抗体,并以已发表文献天然抗体阳性率及特异性频率作为参考,比较分析。结果男性恶性血液病患者抗体阳性率分别为Ⅰ类(56.1%,37/66)、Ⅱ类(45.5%,30/66)、MICA(12.1%,8/66);女性患者阳性率分别为Ⅰ类(77.6%,52/67)、Ⅱ类(53.7%,36/67)、MICA(16.5%,11/67)。恶性血液病患者抗体特异性频率与天然抗体相比明显升高的分别为:A~*23∶01,A~*68∶02,B~*44∶03,B~*57∶01,B~*58∶01,C~*03∶04,DRB1~*16∶01,DRB1~*16∶02,DRB1~*04∶03,DRB1~*04∶01,DQA1~*02∶01,DQB1~*03∶01,DQA1~*03∶02,DQB1~*03∶03,DPA1~*02∶02,DPB1~*05∶01,DPA1~*01∶03和DPB1~*01∶01。结论恶性血液病男性患者PRA-Ⅱ类、MICA抗体阳性率显著高于天然抗体组;女性患者PRA-Ⅰ、Ⅱ类、MICA抗体阳性率均显著高于天然抗体组。从抗体特异性来看,恶性血液病患者既存在天然抗体,也存在非天然抗体,而后者更容易成为DSA。因此,恶性血液病患者在造血干细胞移植前检测PRA-Ⅰ、Ⅱ类和MICA抗体有重要意义。     

中国南方汉族人群HLA-DPA1、-DPB1及-DQA1基因多态性的研究

目的调查中国南方汉族人群HLA-DPA1、-DPB1和-DQA1等位基因多态性。方法 2017年6月-12月应用PCR-SBT测序分型法对1 000名健康无血缘关系的南方汉族人群外周血样(于2016年8月-2017年5月收集)进行HLA-DPA1、-DPB1和-DQA1基因测序分型。HLA-DPA1和-DPB1基因采用自行设计的引物同步扩增检测第2、3外显子,HLA-DQA1检测第1～4外显子。电泳序列导入uTYPE 7.2 HLA分析软件判定基因型。采用直接计数法计算等位基因的分布频率。结果在1 000人份南方汉族无关个体HLA-DPA1、-DPB1和-DQA1测序分型所获的序列中,无背景信号和杂峰。共检出6种HLA-DPA1等位基因,频率由高到低依次为DPA1~*02∶02 (0.541)>DPA1~*01∶03 (0.340)>DPA1~*02∶01 (0.095)>DPA1~*04∶01 (0.021)>DPA1~*02∶07 (0.003)>DPA1~*01∶04 (0.002);共检出HLA-DPB1等位基因33种,频率较高的前4种等位基因依次为DPB1~*05∶01(0.401)、DPB1~*02∶01(0.165)、DPB1~*04∶01(0.085)、DPB1~*02∶02(0.071);共检出19种HLA-DQA1等位基因,频率较高的前4种等位基因依次为DQA1~*01∶02(0.196)、DQA1~*03∶02(0.144)、DQA1~*01∶03(0.087)和DQA1~*06∶01(0.085)。结论本文获得了南方汉族人群HLA-DPA1、-DPB1和-DQA1基因多态性数据,可为人类学、群体遗传学、疾病关联研究等提供重要参考数据。     

新疆塔吉克族人群HLA-A、B、DRB1等位基因遗传多态性分析

目的研究新疆塔县自治区的塔吉克族人群的HLA等位基因的分布和多态性。方法采用PCR-SSP的方法对500份地处海拔3 000 m以上的塔吉克族聚居地无血缘关系的塔吉克族人群血液标本进行HLA-A、B、DRB1位点等位基因分型分析,并对分型结果做统计学分析。结果 500份标本中HLA-A、HLA-B、HLA-DRB1座位分别检出17、25、13个等位基因,HLA-A频率较高的等位基因为A*02、A*03、A*24,频率分别为24.73%,15.31%和14.82%;HLAB频率高的有B*51、B*35、B*52,频率分别为20.88%,13.73%和12.65%;HLA-DRB1频率高的有DRB1*13、DRB1*04、DRB1*15,频率分别为15.98%,14.02%和13.63%,并将结果与中国南北方汉族人和回族及维吾尔族等位基因频率的对比。结论获得了中国新疆塔吉克族人群HLA-A、B、DRB1等位基因的分布特征,新疆塔吉克人群等位基因频率分别最高的前5位是A*02、A*03、A*24、A*01、A*11、B*51、B*35、B*52、B*27、B*13、DRB1*13、DRB1*04、DRB1*15、DRB1*09、DRB1*07。塔吉克族人群A*03、A*01、B*52、B*27和DRB1*13的等位基因频率明显较高。     

中华骨髓库造血干细胞捐献志愿者HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1高分辨等位基因频率分析

目的分析中华骨髓库造血干细胞捐献者HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1 5位点在高分辨基因分型水平上的等位基因频率特征。方法根据718名中华骨髓库捐献者HLA5位点高分辨分型数据,运用直接计数法计算各位点基因频率。结果在718名捐献志愿者中,共检出28个HLA-A等位基因、61个HLA-B等位基因、30个HLA-C等位基因、40个HLA-DRB1等位基因、18个HLA-DQB1等位基因;其中HLA-A位点最常见等位基因为A*1101(21.66%)、A*2402(16.37%)、A*0201(13.79%);HLA-B位点最常见等位基因为B*4001(11.49%)、B*4601(9.54%);HLA-C位点最常见等位基因为Cw*0702(15.74%)、Cw*0102(15.32%)、Cw*0304(11.56%);HLA-DRB1位点最常见等位基因为DRB1*0901(14.69%)、DRB1*1501(12.40%)、DRB1*0701(9.89%);HLA-DQB1位点最常见等位基因为DQB1*0301(20.54%)、DQB1*0303(15.81%)、DQB1*0601(10.79%)。结论本研究在高分辨基因分型水平提供了一套有关中国人群HLA-A,-B,-C,-DRB1和-DQB1 5位点基因频率数据。     

广西造血干细胞骨髓库HLA-A、B、DRB1高分辨等位基因多态性研究

目的研究广西地区人群造血干细胞捐献志愿者的HLA-A、B、DRB1位点在高分辨水平上的等位基因多态性、基因频率及单体型分布特征。方法应用PCR-直接测序法(PCR-SBT)对中国造血干细胞捐献者资料库(CMDP)广西分库,3 431名无个体血缘关系健康供者的HLA-A、B、DRB1等位基因进行高分辨分型。结果共检出HLAA等位基因43个,B等位基因80个和DRB1等位基因42个,HLA-A-B-DRB1单体型检测到1507种。其中频率0.05的常见等位基因,包括5种HLA-A∶A~*11∶01,A~*24∶02,A~*02∶03,A~*02∶07,A~*33∶03;6种HLA-B∶B~*46∶01,B~*40∶01,B~*15∶02,B~*58∶01,B~*13∶01,B~*38∶02;7种HLA-DRB1∶DRB1~*15∶01,DRB1~*16∶02,DRB1~*09∶01,DRB1~*03∶01,DRB1~*12∶02,DRB1~*14∶54,DRB1~*15∶02。487条HLA-A-B单体型中,79条单体型呈现显著的正连锁不平衡(ALD0,HF≥1.09×10-4,χ23.84),5条表现为强连锁不平衡(RLD0.40),18条单体型的频率0.01;597条HLA-B-DRB1单体型中,68条单体型呈现显著的正连锁不平衡(ALD0,HF≥1.09×10-4,χ23.84),8条表现为强连锁不平衡(RLD0.40),16条单体型的频率高于0.01;1 507条HLA-A-B-DRB1单体型中,统计分析三座位单体型最常见的是A~*33∶03-B~*58∶01-DRB1~*03∶01(0.058 8)。结论广西地区人群HLA-A、B、DRB1位点在高分辨水平上获得等位基因频率、单体型分布数据及相关遗传参数,为今后开展临床造血干细胞移植、中国人群CWD表的制订和骨髓库最适库容的评估等研究及相关疾病研究提供本地区信息。     

山东半岛地区慢性肾衰竭患者HLA-A、B、DRB1等位基因多态性研究

目的 探讨山东半岛地区汉族人群HLA-A、B、DRB1等位基因与慢性肾衰竭(CRF)的相关性。方法 采用序列特异性寡核苷酸探针-聚合酶链式反应法(PCR-SSO)对山东半岛地区汉族人群880例CRF患者进行HLA-A、B、DRB1等位基因分型,与865名无血缘关系造血干细胞志愿捐献的健康汉族个体等位基因频率进行比较,分析HLA基因多态性与CRF的相关性。结果 CRF患者组共检出HLA-A等位基因33个,HLA-B等位基因76个,HLA-DRB1等位基因39个;DRB1^*11∶01(6.70%vs 4.45%)和DRB1^*12∶02(8.69%vs 5.90%)等位基因频率显著高于对照组(Pc<0.05);B^*15∶11等位基因频率显著低于对照组(1.82%vs 3.64%,Pc<0.05);CRF患者组三座位单体型A^*30∶01-B^*13∶02-DRB1^*07∶01(16.61%vs 7.61%)、A^*33∶03-B     

江苏7地市汉族人群HLA-DQB1等位基因多态性分析

目的分析来自中华骨髓库江苏分库7地市汉族人群HLA-DQB1基因多态性。方法采用聚合酶联反应-直接测序分型(PCR-SBT)技术,对2010年1月—2017年12月中华骨髓库江苏分库4973名志愿者的HLA-DQB1位点进行基因分型,分别计算7地市DQB1基因频率并比较分析。结果江苏汉族人群共检测出24种DQB1等位基因,其中徐州16种,淮安18种,盐城19种,扬州19种,镇江20种,南京18种,常州13种。常见的DQB1等位基因分布在徐州为:DQB1~*06∶01、03∶01、06∶09等;淮安:DQB1~*03∶03、03∶01、06∶01等;盐城:DQB1~*02∶02、02∶01、06∶09等;扬州:DQB1~*02∶02、03∶03、06∶01等;镇江:DQB1~*03∶03、02∶02、03∶01等;南京:DQB1~*03∶03、03∶01、06∶01等;常州:DQB1~*03∶03、03∶01、06∶01等。结论徐州、淮安、盐城、扬州的DQB1基因多态性更偏向我国北方,常州的DQB1基因多态性更偏向我国南方,而镇江、南京介于南方、北方之间。由此为研究江苏汉族人群基因遗传学及DQB1与疾病相关性提供了重要的基础资料。     

深圳地区人群乙型肝炎病毒携带者HLA-DRB1 等位基因多态性及关联性分析

目的　研究深圳地区人群乙型肝炎病毒携带者人类白细胞抗原（human leukocyte antigen,HLA）DRB1 的等位 基因多态性分布特征,探讨乙型肝炎病毒携带与HLA-DRB1 等位基因之间的关联性。方法　采用聚合酶链反应- 直接 测序分型技术（PCR-SBT）对163 例深圳地区乙型肝炎病毒携带者（携带组）和314 例健康人群（对照组）进行HLADRB1 等位基因的检测,运用统计学方法比对分析两组人群的基因分型结果。结果　对照组检出的HLA-DRB1 等位基 因有32 种,其中占比大于5% 的基因型有6 种,分别为HLA-DRB1*09:01（16.40%）,12:02（11.15%）,15:01（9.87%）, 08:03（8.91%）,11:01（6.05%）和04:05（5.10%）;携带组中检出的HLA-DRB1 等位基因有28 种,其中占比大于5% 的基因型有6 种,分别为HLA-DRB1*09:01（20.55%）,12:02（14.72%）,15:01（9.20%）,03:01（7.06%）、08:03（5.52%） 和11:01（5.21%）。其中,携带组中HLA-DRB1*03:01 检出率高于对照组,差异有统计学意义（P=0.010）。结论　深 圳地区人群感染乙肝病毒的机会与HLA-DRB1*03:01 呈正相关。     

四川骨髓库汉族人群HLA-DPB1与rs9277534等位基因频率及其连锁关系的分析

目的探讨四川骨髓库汉族人群HLA-DPB1和rs9277534等位基因分布及其之间的连锁关系。方法从四川骨髓库中随机选取200例无血缘关系的四川汉族志愿者标本,采用PCR-SBT方法对其HLA-DPB1等位基因分型,Taq Man探针法对其rs9277534等位基因分型并通过测序验证结果。利用Arlequin 3.1软件计算HLA-DPB1与rs9277534之间的连锁不平衡参数。结果本组四川骨髓库汉族人群中的DPB1等位基因:以DPB1*05∶01∶01G频率为最高:0.412 5(165/400);rs9277534等位基因:A和G的频率分别为0.4(160/400)和0.6(240/400),AA、GG、AG基因型频率分别为0.165(33/200)、0.375(75/200)和0.46(92/200)。有10种HLA-DPB1等位基因型与rs9277534等位基因A、G之间存在连锁不平衡,DPB1*04∶02∶01G、DPB1*02∶01∶02G、DPB1*02∶02∶01G和DPB1*17∶01∶01G与rs9277534A完全连锁,DPB1*05∶01∶01G、DPB1*03∶01∶01G、DPB1*13∶01∶01G、DPB1*14∶01∶01G和DPB1*21∶01与rs9277534G完全连锁。DPB1*04∶01∶01G与rs9277534A等位基因之间呈高度连锁不平衡(|D'|=0.95,P0.01)。结论四川骨髓库汉族人群的HLA-DPB1部分等位基因与rs9277534A/G等位基因连锁,对临床选择造血干细胞移植供者有参考价值。     

运用二代测序技术确认PCR-SSOP法检出的HLA罕见等位基因

目的：确认PCR-序列特异性寡核苷酸探针（SSOP）法检出的4例磁珠探针HLA基因分型结果格局异常和3例模棱两可结果样本的HLA真实基因型。方法：对HLA高分辨组织配型血样采用PCR-SSOP法检出的4例磁珠探针HLA基因分型结果格局异常和3例模棱两可结果进一步采用PCR-直接测序分型（SBT）技术和二代测序（NGS）技术复检确认。结果：采用PCR-SSOP方法检出4例磁珠探针HLA基因分型结果格局异常的样本，加做SBT及NGS两种方法复检后结果显示，样本1的HLA-A分型结果与已知基因型不完全匹配，NGS分析显示，该等位基因与同源性最接近的等位基因A*31:01:02:01在第2外显子154位G>A变异，导致28位编码氨基酸由缬氨酸变为蛋氨酸（p.Val28Met），样本2的HLA-C结果为C*03:119, 06:02，样本3的HLA-C结果为C*03:03, 07:137，样本4的HLA-B结果为B*55:02,55:12。采用PCR-SSOP方法检出3例模棱两可结果样本，加做SBT及NGS两种方法复检后结果显示，样本5的HLA-B结果为B*15:58, 38:02，样本6...     

四川骨髓库汉族人群HLAD-RB1~*14等位基因分布

目的研究四川骨髓库中四川籍汉族人群HLAD-RB1*14等位基因分布。方法在四川骨髓库8934名四川汉族造血干细胞捐献志愿者中随机筛选107例中低分辨为DRB1*14的样本,以PCR-SBT分型技术检测DRB1位点的第2外显子以鉴定HLAD-RB1*14等位基因。结果共检出6种DRB1*14等位基因,包括DRB1*140101/1454(56.0%),DRB1*1403(1.8%),DRB1*1404(11.0%),DRB1*140501(27.5%),DRB1*140701(1.8%)和DRB1*1425(1.8%);其中最主要的DRB1*140101/1454频率与美国亚裔/太平洋岛民接近,而与高加索人、非洲裔美国人、西班牙裔及韩国人和中国北方汉族中的分布有显著性差异;DRB1*140501和DRB1*1404则与中国北方汉族分布类似;本研究未检到的等位基因在四川汉族DRB1*14阳性个体中的频率低于3%。结论四川汉族人群HLA-DRB1*14等位基因呈现多样性并存在自身特点。     

中国汉族人群人类白细胞抗原DRB1~* 04等位基因多态性

目的研究中国南方和北方汉族人群的人类白细胞抗原(HLA)-DRB1*04等位基因多态性。方法采用PCR-SBT对104名南方和168名北方汉族无偿献血者的HLA-DRB1*04基因做高分辨分型,并采用高分辨PCR-SSP对其中的DRB1*0406/0449模棱两可等位基因做精确分型,进而采用卡方检验对南北方汉族群体的DRB1*04等位基因与其他不同种群的分布情况做比较。结果56个DRB1*0406/0449模棱两可等位基因的分型结果全部为DRB1*0406。南方汉族无偿献血者共检出5种DRB1*04基因,最常见的为DRB1*0405(47.32%)、DRB1*0406(24.24%)和DRB1*0403(16.35%),北方汉族无偿献血者共检出10种DRB1*04等位基因,以DRB1*0405(40.48%)、DRB1*0406(18.45%)和DRB1*0403(17.26%)常见。中国南方、北方汉族人群HLA-DRB1*04等位基因的总体分布格局与高加索人、非裔美国人、西班牙人和亚洲/太平洋岛民存在明显差异,而与韩国人非常接近。结论中国南北汉族人群HLA-DRB1*04等位基因的总体分布格局不同,但主要等位基因DRB1*0405、DRB1*0406和DRB1*0403的分布无明显差异;不同种群的DRB1*04等位基因的分布各具特色。     

云南地区肾移植受者HLA基因分布频率分析

目的 探讨云南地区肾移植受者人类白细胞抗原(HLA)-A、B、DRB1和DQB1位点等位基因分布频率.方法 收集2017年6月至2020年11月该院1251例肾移植受者HLA基因检测结果,分析HLA-A、B、DRB1和DQB1位点等位基因分布频率.结果 HLA-A位点检出等位基因17种,其中A*11、A*02和A*24分布频率较高,分别为0.3145、0.2802和0.1930.HLA-B位点检出等位基因31种,其中B*15、B*40和B*46分布频率较高,分别为0.1926、0.1199和0.1199.HLA-DRB1位点检出等位基因14种,其中DRB1*12、DRB1*04、DRB1*09分布频率较高,分别为0.2178、0.1399和0.1171.HLA-DQB1位点检出等位基因7种,其中DQB10301、DQB1*05和DQB1*06分布频率较高,分别为0.2866、0.2010和0.1671.结论 云南地区肾移植受者HLA-A、B、DRB1和DQB1位点中,A*11、B*15、DRB1*12和DQB10301分别为分布频率最高的等位基因,符合南方汉族人群H LA基因多态性的分布特征.     

中医瘀血体质与HLA—Ⅱ类基因相关性研究

目的：研究中医瘀血体质与HLA—Ⅱ类基因（DPB1、DRB1、DQB1）多态性的关系。方法：采用PCR—SBT（sequence—basedtyping）分型方法对正常体质、瘀血体质人群样本进行DPB1、DRB1、DQB1基因分型。比较组间各等位基因表型频率（PD并计算相对危险度（RR）。结果：与正常质组比较，瘀血质组DRB1＊15011、DRB1＊04051、DQB1＊05021表型频率显著降低（P=0．04、0．01、0．05）；DRB1＊1405、DRB1＊14071、DQB1＊03032、表型频率显著升高（P=0．04、0．02、0．02）。结论：HLA基因与中医体质类型有一定关联，为中医体质的免疫遗传学研究提供依据。     

云南地区人群HLA-A、B、DRB1等位基因遗传多态性的分析

目的了解中国造血干细胞捐献者资料库云南省分库HLA-A、B、DRB1基因多态性,分析云南地区人群HLA-A、B、DRB1等位基因频率特征。方法采用流式序列特异性寡核苷酸探针(PCR-sequence specific oligonucleotide probes,PCR-SSOP)结合直接测序法(PCR-sequence based typing,PCR-SBT)方法,对来自中国造血干细胞捐献者资料库云南分库的1 000名无血缘关系的捐献者进行基因分型,运用方根法计算HLA-A、B、DRB1基因频率,并与其他人群进行比较。结果在云南地区人群中共检出68种HLA基因特异型。其中HLA-A位点18个,HLA-B位点37个,HLA-DR位点13个。A*11(34.66%)、A*02(34.2%)和A*24(19.63%)3个等位基因为云南分库捐献者HLA-A座位的主要等位基因;B*46(12.83%)、B*40(60)(10.9%)和B*15(62)(9.78%)为HLA-B座位的主要等位基因;HLA-DRB1座位以DRB1*12(16.7%)、DRB1*15(16.46%)、DRB1*09(13.46%)和DRB1*04(12.77%)4个等位基因频率为高。最常见的A-B-DRB1单倍型是A*02-B*46-DRB1*09,频率是3.76%。结论云南地区人群的HLA基因多态性与南方汉族接近,但有其自身的一些特点。有必要在本地区开展造血干细胞捐献者的招募工作。     

碘摄入量及易感HLA基因与广西沿海地区Graves病的相关性研究

目的 研究碘摄入量及HLA-DQA1、DQB1、DRB1*09等位基因在广西沿海地区Graves病(GD)患者中的状况,及其与GD关系.方法 采用序列特异性引物-聚合酶链反应(PCR-SSP)和过硫酸铵消化-砷铈催化分光光度测定方法检测162例广西沿海地区GD怠者(GD组)及90例正常人(对照组)的尿碘浓度和HLA-DQA1、DQB1、DRB1*09的基因型,计算和比较各组间尿碘浓度和等位基因频率.结果 GD组HLA-DQA1*0301、DQA1*0501、DQB1*0303和DRB1*0901基因频率明显高于对照组(40.0%、32.7%、35.8%、29.6%vs 26.7%、13.3%、16.7%、12.2%,P<0.05或<0.01);按性别分层后,HLA-DQA1*0301在GD女性组中频率较对照女性组明显升高(44.1%vs 26.5%,P<0.05);GD男性和女性组HLA-DQA1*0501、DQB1*0303、DQB1*0901基因频率明显高于对照男性和女性组(33.3%、39.2%、29.4%vs 12.2%、17.1%、9.8%,均P<0.05;32.4%、34.2%、29.7% vs14.3%、16.3%、14.3%,均P<0.05);GD组尿碘中位数较对照组明显升高(448.7 μg/Lvs 219.6 μg/L,P<0.05).结论 HLA-DQA1*0501、HLA-DQB1*0303及HLA-DRB1*0901是广西沿海地区GD患者遗传易感基因;DQA1*0301是广西沿海地区女性GD患者遗传易感基因;而高碘是该地区的易感环境因素.     

西安骨髓库北方汉族人群HLA-DRB1高分辨多态性

目的了解西安骨髓库北方汉族人群HLA-DRB1基因高分辨多态性分布特点。方法从11755名北方汉族造血干细胞捐献者中随机抽取167名,采用PCR-SSP方法进行高分辨HLA-DRB1基因分型。结果共检出36种等位基因,DRB1*03、DRB1*07、DRB1*09、DRB1*16等未检出多态性,DRB1*03全部表现为0301,DRB1*07全部表现为0701,DRB1*09全部表现为090102,DRB1*16全部表现为160201。等位基因频率最高的前三位是DRB1*15(0.1677)、DRB1*09(0.1407)和DRB1*04(0.1317),等位基因高度集中,DRB1*15多态性以1501为主(87.5%),DRB1*04最具多态性,但很集中,27.27%表现为0405,36.36%表现为0406。结论西安骨髓库北方汉族人群中HLA-DRB1等位基因分布相对集中,多态性分布与白种人和黑人存在差异。     

HLA-DRB1基因全长序列分子克隆及测序方法的建立

目的建立可靠的HLA-DRB1等位基因全长序列的分子克隆和测序方法。方法设计、合成HLA-DRB1基因全长序列PCR引物和探索PCR反应体系,采用长距离PCR技术,对10份经PCR产物直接测序、基因型已知的标本,扩增HLA-DRB1基因5'-UTR区、6个外显子、5个内含子和3'-UTR区,全长约11 kb。PCR产物纯化后作长片段分子克隆,筛选阳性克隆,提取质粒DNA,采用自行设计的测序引物测序。结果 PCR扩增获得了特异性目的片段,克隆测序后获得了全部10种等位基因的全长序列。将HLA-DRB1等位基因全长序列划分为9个亚区,群体遗传学分析发现第2外显子的平均核苷酸变异率(π)8.653%,高于其他外显子,并且非同义突变率(dn)9.029%大于同义突变率(ds)7.846%。第5内含子的平均核苷酸变异率高达13.690%,DRB1*09∶01∶02和DRB1*07∶01∶01∶02这2个等位基因第5内含子的序列与其他等位基因序列差别较大。结论采用HLA-DRB1基因全长序列分子克隆及测序方法获得了HLA-DRB1基因各亚区多态性分布特点等基础资料。