蛋白质芯片技术在肿瘤检测中的应用

蛋白质芯片技术在肿瘤研究领域中进展最快.随着肿瘤细胞的发生,肿瘤患者体内某些蛋白质会发生上调或下调,或产生新的与肿瘤关联的异常蛋白,而蛋白质芯片技术可以描绘出患者体液中所有蛋白质表达情况.     

SELDI蛋白质芯片技术在肿瘤蛋白质组学研究中的应用

SELDI蛋白质芯片技术是结合色谱学，层析原理和SEIDI-TOF-MS技术制成的新一代生物芯片，是目前肿瘤蛋白质组学研究的重要工具之一。它的优点是能洞察肿瘤细胞、组织和生物体蛋白质含量的细微变化，且能精确分析某一特定蛋白质的理化性质。作者就SELDI蛋白质芯片联合二维电泳、激光捕获显微切割等技术在肿瘤蛋白质组学研究中所应采取的策略，SELDI蛋白质芯片在肿瘤蛋白质组学研究中的临床应用如筛选肿瘤标志蛋白、预测肿瘤转移和预后等作一综述。     

蛋白质芯片技术在肿瘤标志物筛选及鉴定中的应用

蛋白质芯片技术具有快速、并行、自动化和高通量等特点,能同时对全基因组水平上千种蛋白质进行分析,是蛋白质组学研究的重要手段。蛋白质芯片技术在揭示基因与疾病的关系上优于DNA芯片,已在研究蛋白质的性质、特征、辩识、功能及生物标志物等方面搭起快速准确的桥梁,尤其在肿瘤标志物的筛选和鉴定上取得很大进展。     

食管癌淋巴结转移的蛋白质组学

目的:对河南省林州地区食管癌高发区食管鳞癌患者(食管癌组)和健康人血清(对照组)蛋白质组进行比较研究,确立食管癌的蛋白质指纹诊断模型,并筛选与食管癌淋巴结转移相关的蛋白质.方法:采用IMAC3芯片及表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)检测61例食管癌患者和50例健康人血清,用Bio-Marker Wizard软件对芯片检测得到的蛋白质相对含量进行处理及方差分析.并对25例发生淋巴结转移的食管癌患者(转移组),36例无淋巴结转移患者(未转移组)与对照组进行了对比分析.结果:以相对分子质量(Mr)为9 439.58、6 627.21、2 867.65、4 494.08、7 762.68、6 835.32、4 095.94 7种蛋白质组建立的决策树模型,对食管癌测试的准确率、敏感度和特异度分别为85.6%、88.5%和82.0%.转移组、未转移组与对照组3组相比,有15种蛋白差异有统计学意义.其中转移组和未转移组相比有2种蛋白差异有统计学意义(Mr分别为11 742.48、9 294.44).结论:以上述7种蛋白质建立的诊断模型用于食管癌的诊断,具有较高灵敏度和特异度;筛选出2种与食管癌转移密切相关蛋白质,后者为进一步建立食管癌转移相关肿瘤标志物提供了重要线索.     

转移负相关新基因C14orf106的生物信息学分析

目的研究肿瘤原发灶和转移灶的基因表达差异,并采用生物信息学方法对1条卵巢癌肝转移灶低表达基因C14orf106进行初步分析。方法分别制备卵巢癌原发灶和肝转移灶组织标本mRNA,线性扩增后与人类寡核苷酸芯片杂交,通过信号扫描、处理后获得两者的表达差异基因。并用生物信息学方法对1条无功能研究的新基因C14orf106进行初步分析,预测了它的基因结构、染色体定位、编码蛋白质的理化性质、亚细胞定位、蛋白质功能域等信息。并对多物种中的相似性蛋白进行了系统进化分析。结果人类寡核苷酸芯片发现了共272条差异表达基因。对转移负相关新基因C14orf106的上述性质进行了有效的预测,基本明确了该基因编码蛋白为一核蛋白,可能参与了肿瘤转移抑制基因的转录活化及促进表达。结论生物芯片技术是一种研究肿瘤转移基因表达差异的有效的高通量研究方法。通过生物信息学分析,表明新基因C14orf106是一个有肿瘤转移研究价值的新靶点。     

转移负相关新基因C140rf106的生物信息学分析

目的研究肿瘤原发灶和转移灶的基因表达差异，并采用生物信息学方法对1条卵巢癌肝转移灶低表达基因C140rf106进行初步分析。方法分别制备卵巢癌原发灶和肝转移灶组织标本mRNA，线性扩增后与人类寡核苷酸芯片杂交，通过信号扫描、处理后获得两者的表达差异基因。并用生物信息学方法对1条无功能研究的新基因C140rf106进行初步分析，预测了它的基因结构、染色体定位、编码蛋白质的理化性质、亚细胞定位、蛋白质功能域等信息。并对多物种中的相似性蛋白进行了系统进化分析。结果人类寡核苷酸芯片发现了共272条差异表达基因。对转移负相关新基因C140rf106的上述性质进行了有效的预测，基本明确了该基因编码蛋白为一核蛋白，可能参与了肿瘤转移抑制基因的转录活化及促进表达。结论生物芯片技术是一种研究肿瘤转移基因表达差异的有效的高通量研究方法。通过生物信息学分析，表明新基因C140rf106是一个有肿瘤转移研究价值的新靶点。     

蛋白质组学技术及其临床应用研究

蛋白质组学（proteomics）是指根据蛋白质种类、数量、局部存在的时间、空间上的变化来研究表达于细胞、组织及个体中的全部蛋白质,并从其结构和功能的角度应用各种技术手段综合分析生命活动的一门科学。运用蛋白质分离技术、蛋白质鉴定技术,结合生物信息学对蛋白质组进行研究,可以从整体的角度分析细胞内动态变化的蛋白质组成、表达水平与修饰状态,了解蛋白质之间的相互作用与联系,揭示蛋白质功能与细胞生命活动规律。将其应用于临床,为从整体水平研究临床疾病开辟了更广阔的前景,有助于各种疾病的早期发现和治疗。     

蛋白质芯片技术在肿瘤检测中的应用

蛋白质芯片技术在肿瘤研究领域中进展最快。随着肿瘤细胞的发生，肿瘤患者体内某些蛋白质会发牛上调或下调，或声生新的与肿瘤关联的异常蛋白，而蛋白质芯片技术可以描绘出患者体液中所有蛋白质表达情况。根据正常与异常的蛋白质表达谱的差异，从而建立肿瘤的指纹谱，指纹谱的优点是不受任何单个肿瘤标志物的特异性灵敏度的限制，可以及早地反映肿瘤的发生、发展状况。对肿瘤的早期诊断、病情监测、     

磷酸化蛋白质组学技术及其在肿瘤研究中的应用

磷酸化蛋白质组是指机体细胞在特定时间和空间上表达的所有磷酸化蛋白质;磷酸化蛋白质组学是在整体水平上研究磷酸化蛋白质在细胞中的组成成分、表达水平、修饰状态及相互作用规律的学科.近年来,磷酸化蛋白质学技术已广泛应用于肿瘤研究,为阐明肿瘤的发生机制,提高肿瘤的诊治水平提供了重要信息.     

SELDI蛋白质芯片技术在肺癌早期诊断中的研究进展

随着人类基因组计划的完成,分子医学的研究领域已转移到蛋白质组学研究。蛋白质组学为发现肿瘤诊断标志物及可能的新型治疗靶分子提供了可能,肿瘤发生早期的蛋白质变化有可能成为临床早期诊断指标。表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术是一种操作简单、敏感性高、特异性强的高通量蛋白组学方法,是基于蛋白质芯片和质谱技术联用的多种肿瘤标志物筛选的分析平台。现主要对SELDI蛋白质芯片技术在肺癌早期诊断中的应用研究现状予以简要综述。     

微流控芯片在肿瘤仿生模型构建中的应用

微流控芯片是一种在微米尺度下对流体进行精确操控的新技术,已被证明是对哺乳动物细胞及其微环境进行操控的理想平台.本文拟围绕肿瘤转移过程中的一些关键环节,对微流控芯片在肿瘤仿生模型构建中的应用作一综述.目前,基于微流控芯片技术构建的肿瘤仿生模型主要包括:肿瘤原发灶模型、肿瘤细胞诱导血管新生模型、肿瘤细胞内渗模型、肿瘤细胞外渗模型、肿瘤多器官转移模型等.相对于传统的体外研究方法,这些仿生模型很大程度上再现了体内的肿瘤微环境,逐渐成为肿瘤研究极重要的平台.     

基因芯片技术在研究中药分子作用机制中的应用

目的：探讨罗勒多糖抑瘤作用和机制以及基因芯片技术在中药分子作用机制研究中的应用。方法：建立荷NuTu-19卵巢癌大鼠模型及相应对照,观察中药罗勒多糖对荷瘤鼠肿瘤生长及转移行为的影响;同时提取肿瘤组织总RNA,用RT-PCR逆转录合成cDNA,分别用Cy3-dUTP、Cy5-dUTP标记对照组和药物组cDNA,与含有2000点的大鼠基因表达谱芯片杂交,杂交芯片扫描结果用ImaGene3．0软件进行分析统计。结果：对照组与药物组之间共有168条差异表达基因,经归类分析,表达差异基因主要为：①肿瘤转移相关基因;②与免疫应答有关的基因;③与细胞能量代谢有关的酶类;④与药物代谢及敏感性有关酶类的基因;⑤与信号转导以及转录过程有关的基因等。结论：罗勒多糖可能通过多种作用途径抑制肿瘤生长及转移,基因芯片技术可从基因水平解释中药的可能作用机制,并为进一步确切机制的研究提供重要信息。     

运用SELDI蛋白质芯片技术检测Vero细胞感染HSV-1后蛋白质的差异表达

目的运用SELDI(Surface Enhanced Laser Desorption/Ionization)蛋白质芯片技术检测Vero细胞感染HSV-1后蛋白质的差异表达,从而为从蛋白质水平研究HSV-1感染的致病机制奠定基础。方法常规培养Vero细胞,感染HSV-1,孵育12 h、24 h、48 h后用细胞裂解液裂解细胞。裂解上清经蛋白定量后应用IMAC3(固定金属亲和)和WCX2(弱阳离子交换)芯片,SELDI-TOF-MS技术检测细胞感染HSV-1前后蛋白质表达的差异。结果感染24 h细胞出现明显细胞病变效应(CPE),感染12 h质谱分析即可见蛋白的差异表达。共19个蛋白表达水平发生变化,其中IMAC3芯片发现差异峰9个,WCX2芯片发现差异峰10个。结论 SELDI蛋白质芯片技术检测Vero细胞感染HSV-1后蛋白质的差异表达方法简便,敏感性高,从而为从蛋白质水平研究HSV-1感染的致病机制,HSV-1与宿主细胞的相互作用,及抗感染治疗靶位的寻找奠定了一定的基础。     

蛋白质组学及蛋白质芯片在肿瘤研究中的应用前景

肿瘤是由环境和遗传因素相互作用的多基因、多蛋白质参与的疾病,研究主要集中在肿瘤相关基因的克隆和功能分析、信号传导通路以及细胞周期调控等三大领域。蛋白质是生命活动的执行者和体现者,研究不同时期、不同条件下细胞内蛋白质的变化,具有重要价值。蛋白质组学（proteomics）和蛋白质芯片技术,可全面、动态、定量地分析比较正常与癌变标本中蛋白质种类和数量的改变,不仅有助于肿瘤发病机制的阐明,还能筛选和鉴定蛋白质特异性标记和特异性抗原,在肿瘤的早期诊断、治疗和新药研制方面,具有广阔的应用前景。     

肿瘤的进化与异质性及其在转移中的意义

 肿瘤转移是恶性肿瘤最主要的生物学特性之一,也是导致患者死亡的主要原因。肿瘤的转移潜能是肿瘤异质性的表现之一,而异质性则起源于肿瘤细胞本身及宿主微环境在进化上的差异。这些进化上的差异除了传统理论所认为的基因突变之外,还包括表观基因组学调控、蛋白质修饰等非基因水平方面的改变。本文将结合“种子与土壤”理论,从肿瘤进化与异质性的角度,综述肿瘤细胞自身和癌周环境对肿瘤转移的影响,以期推动肿瘤转移的研究及拓展诊疗思路。     

应用蛋白质芯片检测骨性关节炎患者基质金属蛋白酶-13的初步研究

目的:探讨应用蛋白质芯片技术检测骨性关节炎(OA)患者关节液和血清中基质金属蛋白酶-13(MMP-13)的方法.方法:应用低密度蛋白质芯片方法同时检测32例OA患者关节液和血清中MMP-13表达水平,24例正常关节作为对照组,进行蛋白质芯片荧光强度的对比研究.结果:OA患者关节液和血清中的MMP-13在蛋白质芯片上的荧光强度明显高于对照组关节液的荧光强度(P<0.001).OA患者关节液中MMP-13在蛋白质芯片上的荧光强度明显高于其血清的荧光强度(P<0.001).结论:OA患者关节液和血清中MMP-13表达明显高于对照组.应用低密度的蛋白质芯片技术检测OA患者关节液及血清中MMP-13的水平具有一定临床应用价值.     

鼻咽癌转移相关分子标志物的研究进展

鼻咽癌是常见的恶性肿瘤之一,肿瘤浸润及转移与治疗效果和预后密切相关.肿瘤转移的研究已经深入到分子水平,关于鼻咽癌转移的分子机制有大量的研究.本文对肿瘤转移抑制基因、肿瘤转移促进基因、血管内皮生长因子-C、EB病毒相关基因及蛋白与鼻咽癌转移的关系作一综述.     

Dicer与肿瘤的关系研究进展

Dicer酶是RNaseⅢ家族成员,是miRNA成熟的关键酶,Dicer表达水平直接影响着miRNA的表达及其靶基因的调控能力,进而调节生物体的生命活动.大量研究表明,Dicer表达水平及其活性变化与肿瘤的发生发展、侵袭转移及预后明显相关,但其在不同肿瘤中的表达差异并不完全一致,说明Dicer的表达具有肿瘤的特异性.本文探讨了近几年来对Dicer在肿瘤中的研究进展,以期带来肿瘤分子治疗的新方法.     

蛋白质组学在肝癌研究中的应用

蛋白质组学以细胞组织或器官表达的所有蛋白质为研究对象,通过双向凝胶电泳生物质谱技术及生物信息学等方法,达到分离、鉴定、分析蛋白质的目的.在我国肝癌死亡率高,位居第二,预后差.以蛋白质组学的方法,通过比较肿瘤与正常肝组织之间蛋白质组的表达差异,发现新的肝癌肿瘤标志物,寻找与肝癌发生、发展、转移的相关蛋白,为肝癌治疗提供新的靶点.     

采用组织芯片技术检测P-选择素在食管鳞癌中的表达及意义

目的　了解P 选择素在食管癌及区域淋巴结中的表达 ,探讨其与食管癌侵袭转移的关系 ;探讨组织芯片技术在肿瘤研究中的价值。方法　应用组织芯片技术结合免疫组化检测食管鳞癌与正常食管上皮组织中P 选择素的表达情况。结果　P 选择素在食管癌组织 ,正常食管组织中表达率分别为 5 9.3 % ,12 .5 % (P <0 .0 5 ) ;在转移淋巴结 ,非转移淋巴结中表达率分别为 92 .9% ,3 1.3 % (P <0 .0 5 ) ;P 选择素过度表达与食管鳞癌病理分级 ,TNM分期及淋巴结转移呈显著相关性。结论　P 选择素在食管鳞癌组织中表达率明显升高 ,说明其与食管癌的侵袭转移有一定关系。组织阵列技术是研究肿瘤基因改变的一种新方法 ,具有高效 ,简便及标准化的特点 ,因此目前具有其他方法无法取代的应用前景。