m6A修饰相关lncRNA与宫颈癌的预后不良及免疫治疗的相关性分析

  目的   本研究旨在通过挖掘宫颈癌TCGA数据库,分析N6-甲基腺嘌呤（N6-methyladenosine, m6A）修饰相关长链非编码RNA（lncRNA）与宫颈癌预后不良及免疫治疗的相关性,从而有效地评估宫颈癌患者的预后和宫颈癌免疫治疗的可行性。   方法   基于TCGA数据库宫颈癌样本,利用生物信息学的方法鉴定与宫颈癌预后相关的m6A修饰相关lncRNA,并以此构建宫颈癌的预后风险模型。   结果   从304例患者样本中筛选出343个m6A修饰相关lncRNA,通过单因素Cox回归分析得到26个m6A修饰相关lncRNA与宫颈癌患者预后相关,并利用Lasso回归分析得到7个m6A修饰相关lncRNA（DLEU1、AC099850.4、DDN-AS1、EP300-AS1、AC131159.1、AL441992.2、AL021707.6）用以构建预后风险模型。Kaplan-Meier曲线显示低风险组的OS高于高风险组（P<0.001）;ROC曲线下面积（AUC）表明本风险模型准确性高、可信度强;多因素Cox分析显示风险评分是评估宫颈癌患者预后的独立因素。TIDE评分预测高风险组接受免疫治疗后获益更大。免疫检查点PD1与DDN-AS1等m6A修饰相关lncRNA表达相关,且在高风险组中表达更高（P<0.05）。   结论   基于上述7个m6A修饰相关lncRNA构建的预后风险模型能够有效预测宫颈癌患者的预后,并能评估以PD1为靶点的免疫治疗疗效。     

染色质调节因子相关的lncRNA肾透明细胞癌预后模型的构建和验证

目的 构建染色质调节因子（CR）相关长链非编码RNA（lncRNA）的肾透明细胞癌（ccRCC）预后模型,提高ccRCC的预后管理。 方法 从TCGA数据库下载ccRCC的转录组数据和临床数据,并通过“caret”R包将ccRCC样本以7∶3的比例分为训练集（166例）和验证集（71例）。基于“DESeq2”R包筛选出差异表达的CR及相关的lncRNA。构建CR与lncRNA的共表达网络,并筛选出相关系数|rs|＞0.3且P＜0.05的差异lncRNA。利用单因素Cox、Lasso和多因素逐步Cox回归分析,构建CR相关的lncRNA预后模型。计算训练集和验证集样本的风险评分,根据风险评分的中位数将ccRCC患者分为高、低风险组。K-M曲线和受试者操作特征（ROC）曲线评价模型,单因素和多因素Cox回归分析评估风险评分的独立预测性能。“DynNom”和“shiny”R包开发在线预测工具。单样本基因集富集分析探索风险评分与免疫微环境及免疫检查点的关系。 结果 本研究最终纳入237个肿瘤样本和72个癌旁正常组织样本,鉴定了1 025个CR相关的lncRNA,最终筛选得到7个CR相关lncRNA（DUXAP8、AC026462.3、LINC01460、AL592494.1、AL353804.2、AC012462.1、AC009518.1）构建预后模型,并将其开发成在线工具（https://xzlmodelshiny.shinyapps.io/DynNomapp/）。高危组患者的生存率低于低危组（P＜0.05）,ROC曲线表明模型预测效能较好,单因素分析和多因素分析中风险评分的HR值分别为4.058（95%CI：2.530~6.508,P＜0.001）和3.096（95%CI：1.887~5.080,P＜0.001）。高风险组MDSC和Tregs细胞等免疫抑制细胞的浸润比例高于低风险组,趋化因子、免疫检查点及副炎症等通路的富集水平高于低风险组（P＜0.05）。此外,风险评分与免疫检查点TNFRSF25和TNFSF14呈正相关（r＞0.3,P＜0.05）。 结论 本研究构建的CR相关的lncRNA风险模型可独立有效地预测ccRCC患者的预后。     

基于 TCGA 数据库确定低级别胶质瘤免疫 相关lncRNA并构建预后模型

目的 筛选低级别胶质瘤(LGG)预后相关的免疫lncRNA,构建免疫相关lncRNA 预后风险模型。方法 从 公共数据库 TCGA 下载 LGG转录组数据及相应的临床信息,用 R 语言以共表达法获取免疫相关lncRNA,单因素和多 因素 Cox回归分析筛选得到有预后价值的免疫相关lncRNA,并以其构建风险模型。根据风险值将患者划分为高风险 组和低风险组,采用 Kaplan-Meier法进行生存分析并绘制生存曲线图,使用 ROC曲线对风险模型的准确性进行评估。 同时采用单因素和多因素 Cox回归法分析风险评分和其它临床因素与 LGG患者生存预后的关系。通过 Cibersort软件 计算22种免疫浸润细胞在高、低风险分组中的相对比例。最后对风险模型中4个lncRNA 与主要的免疫检查点分子进 行相关性分析。结果 通过免疫基因-lncRNA 共表达网络筛选出79个免疫相关lncRNA,利用单因素 Cox回归筛选出 8个有预后价值的免疫相关lncRNA,基于 多 因 素 Cox回 归 分 析 最 终 确 定 4 个 关 键lncRNA(RFPL1S、AC145098.1、 AC090559.1、TGFB2-AS1),并构建风险模型。根据中位风险值将患者分为高风险组和低风险组,生存分析显示两组生 存时间存在显著差异(P<0.01),预后风险模型曲线 AUC值为0.788。多因素 Cox回归分析显示患者年龄、肿瘤级别和 风险分数均是预后不良的独立危险因素。Cibersort法分析结果显示高风险组 LGG 患者肿瘤中有较多的单核细胞和 M2型巨噬细胞浸润。相关性分析显示模型中的4个lncRNA 与 PD1、PD-L1、CD47及 CTLA4之间存在较强的相关性 (均P<0.05)。结论 通过生物信息分析技术成功构建基于lncRNA 表达水平的 LGG患者预后模型,所确定的4个关键lncRNA 有望成为判断 LGG患者预后的指标和潜在治疗靶点。     

CRP/Alb、泛免疫炎症值对PD-1/PD-L1抑制剂治疗晚期非小细胞肺癌患者预后的评估价值

目的 探讨在接受一线使用PD-1/PD-L1抑制剂联合化疗治疗前C反应蛋白与白蛋白比值(C-reactive protein to serum albumin ratio,CRP/Alb)、泛免疫炎症值(pan-immune-inflammation value,PIV)在晚期非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者预后中的评估价值。方法 回顾性分析2018年11月~2021年12月在徐州医科大学附属医院确诊为晚期NSCLC一线使用PD-1/PD-L1抑制剂联合化疗方案治疗的85例患者的临床资料,采用受试者工作特征(receiver operator characteristic,ROC)曲线分析确定CRP/Alb、PIV的最佳截断值,COX比例风险回归模型进行单因素和多因素分析。结果 本研究共纳入85例晚期NSCLC患者,CRP/Alb的最佳截断值为0.38,高、低CRP/Alb组晚期NSCLC患者在吸烟史、高血压病史方面比较,差异均有统计学意义(P均＜0.05);PIV的最佳截断值为666.77,高、低PIV组晚期NSCLC患者在ECOG-PS评分方面比较,差异有统计学意义(P＜0.05)。高CRP/Alb组和高PIV组患者的疾病控制率(disease control rate,DCR)和无进展生存期(progression-free survival,PFS)均较低CRP/Alb组和低PIV组有所降低,差异有统计学意义(P＜0.05)。单因素和多因素COX回归分析结果显示,高CRP/Alb、高PIV是一线使用PD-1/PD-L1抑制剂联合化疗方案治疗晚期NSCLC患者PFS不良预后的预测因素。结论 高CRP/Alb、高PIV与晚期NSCLC患者较差的PFS相关,其可能是晚期NSCLC患者一线免疫联合化疗方案治疗的潜在有价值的预后因素。     

铜死亡相关性lncRNA在甲状腺癌中的表达模式以及预后价值

目的 探索与铜死亡相关的lncRNA在甲状腺癌(thyroid carcinoma, THCA)中的表达模式及预后价值。方法 基于TCGA数据集，通过共表达获得相关的lncRNA。将THCA患者随机分成训练集和验证集，基于Cox和LASSO回归分析确定预后关键基因，采用验证集和整个列队对独立预后基因进行验证，同时通过实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)验证关键基因在THCA中的表达情况。最后对风险模型进行富集分析、肿瘤微环境分析、免疫相关性分析以及药物敏感性分析。结果 12个铜死亡基因通过共表达获得1 270个相关的lncRNA。在16个与铜死亡预后相关的基因中，TMEM220-AS1、LINC01711和AC003086.1被确定为关键基因。风险评分在训练集和整个列队中均展示出良好的预测性能，并且qPCR结果与生信结果一致。高低风险组的患者在生物学功能、免疫细胞浸润程度以及免疫检查点均存在明显的不同。此外，风险评分与THCA的药物敏感性显著相关。结论 本研究证明了铜死亡相关性lncRNA在THCA中存在显著差异表达，并且3个关键的lncRNA在预测THCA的预后和生存方面具有一定价...     

HAPLN3基因在肾透明细胞癌中的表达及其与预后、免疫的关系

目的 探讨透明质酸和蛋白多糖链接蛋白家族基因成员3（HAPLN3）在肾透明细胞癌（ccRCC）中的表达及其与预后、免疫的关系。方法 利用多个公共数据库分析HAPLN3在ccRCC中的差异表达、预后价值，以及与肿瘤微环境、免疫细胞浸润、免疫检查点及免疫检查点阻断反应评分（TIDE）等的相关性，并行富集分析HAPLN3在ccRCC中的潜在作用机制。通过免疫组织化学法检测HAPLN3蛋白在癌组织和癌旁组织中的表达，采用实时荧光定量聚合酶链反应（qRT-PCR）和Western blotting检测ccRCC细胞株（OS-RC-2、ACHN）HAPLN3 mRNA和蛋白的表达。细胞转染siRNA沉默HAPLN3，用qRT-PCR检测不同ccRCC细胞株中HAPLN3基因沉默的有效性。采用CCK-8法检测HAPLN3基因表达降低对不同ccRCC细胞株增殖的影响。结果 生物信息学分析结果表明，ccRCC中HAPLN3 mRNA相对表达量高于正常肾脏组织（P <0.05），在不同WHO/ISUP分级的ccRCC中发现G4组HAPLN3 mRNA相对表达量高于G3组（P <0.05）。生存分析结果表明，HAPLN3高表达组总体生存率（OS）低于低表达组（P <0.05），且G4组OS也低于G3组（P <0.05）。单因素Cox回归分析结果表明，HAPLN3高表达［HR=1.548（95% CI：1.325，1.801）］、高龄［HR=1.029（95% CI：1.016，1.042）］、高pT分期［HR=1.923（95% CI：1.632，2.265）］、高pN分期［HR=3.425（95% CI：1.818，6.456）］、高pTNM分期［HR=1.867（95% CI：1.638，12.12）］、高Grade分级［HR=2.291（95% CI：1.870，2.806）］是ccRCC患者不良预后的影响因素（P <0.05）；多因素Cox回归分析结果表明，HAPLN3高表达［HR=1.430（95% CI：1.144，1.789）］、高龄［HR=1.006（95% CI：1.006，1.043）］、高pTNM分期［HR=1.661（95% CI：1.205，2.289）］、高Grade分级［HR=1.486（95% CI：1.070，2.065）］是ccRCC患者不良预后的独立影响因素（P <0.05）。HAPLN3 mRNA相对表达量与B淋巴细胞、CD4⁺ T淋巴细胞、CD8⁺ T淋巴细胞、中性粒细胞、巨噬细胞、树突状细胞浸润呈正相关（r_s =0.284、0.532、0.584、0.617、0.323和0.620，均P =0.000）。G4组CTLA4、LAG3、PDCD1、TIGIT mRNA相对表达量和TIDE评分高于G3组（P <0.05）。GESA富集分析结果表明，HAPLN3在ccRCC中与多条免疫及肿瘤通路相关。癌组织HAPLN3阳性表达率高于癌旁组织（P <0.05）。OSRC-2、ACHN细胞HAPLN3 mRNA和蛋白相对表达量高于HK-2细胞（P <0.05）。si-NC组、si-HAPLN3组不同时间点OS-RC-2、ACHN细胞的OD值比较，采用重复测量设计的方差分析，结果 ①不同时间点OS-RC-2、ACHN细胞的OD值有差异（F =481.158和292.321，均P =0.000）；②两组OS-RC-2、ACHN细胞的OD值有差异（F =27.471和255.219，均P =0.002）；③两组OS-RC-2、ACHN细胞的OD值变化趋势有差异（F =20.799和11.301，P =0.017和0.040）。结论 HAPLN3在ccRCC中表达上调，并与肿瘤细胞增殖相关，可能是ccRCC患者的独立预后标志物，并有作为免疫治疗靶点的潜在价值。     

基于TCGA数据构建乳腺癌上皮间质转化相关lncRNA的预后模型

目的：通过生物信息学分析,探讨上皮间质转化（EMT）相关的长链非编码RNA(lncRNA)在乳腺癌中的预后作用。方法：从TCGA数据库下载乳腺癌的转录组数据及临床信息,在MSigDB数据库下载EMT相关基因的数据集,然后利用差异分析、共表达分析、Cox回归分析、Lasso回归分析、生存分析等生物信息学方法,构建乳腺癌中EMT相关lncRNA的风险特征,并进一步检验其预测效能。结果：乳腺癌肿瘤组和正常组有311个差异表达的EMT相关基因（P<0.05）,与这些基因存在共表达关系的lncRNA有315个（皮尔逊相关系数r=0.7,P<0.001）,其中,与预后可能相关的lncRNA有16个（P<0.05）。进一步行Lasso回归分析及多因素Cox回归分析,最终得到基于9个lncRNA表达水平的风险评分公式,根据风险评分的中位数将患者分为高、低风险组,生存分析结果显示,相比于低风险组,高风险组患者的总生存期更低(P<0.001)。ROC曲线结果表明,风险评分预后模型对乳腺癌的3、5、10年生存期具有较好的预测效能,Cox回归分析结果进一步表明该模型可以作为一个独立的预...     

肺腺癌失巢凋亡相关lncRNA预后模型的建立与验证

目的：构建基于失巢凋亡相关长链非编码RNA(lncRNA)的肺腺癌(LUAD)预后模型,探究LUAD潜在的治疗靶点。方法：从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载LUAD转录组和临床数据,从GeneCards网站获取失巢凋亡相关基因,利用共表达分析、差异分析筛选差异基因。通过Cox回归分析及Lasso回归分析构建预后模型,并进一步检验其有效性。对样本进行基因集富集分析(GSEA)及免疫相关性分析。结果：基于800个差异表达基因构建了一个由8个失巢凋亡相关lncRNA组成的预后模型,生存分析结果显示,高风险组总生存期比低风险组低(P<0.05);Cox回归分析和ROC曲线验证了该模型的准确性;GSEA分析表明,低风险组多富集于免疫相关信号通路;免疫相关性分析结果显示,该预后模型与多种免疫细胞、免疫功能和免疫检查点有关。结论：基于8个失巢凋亡相关lncRNA构建的LUAD预后模型有良好的预测效能,并为LUAD的治疗提供了参考。     

微RNA-200家族对程序性死亡配体1的调控及其在非小细胞肺癌中的临床意义

目的 探讨非小细胞肺癌（NSCLC）免疫检查点分子程序性死亡配体1（PD-L1）的表达及其与miRNA-200家族之间的调控关系,阐明PD-L1在NSCLC中的临床意义及调控机制。方法 选取138例NSCLC患者癌组织及配对的癌旁组织标本,采用免疫组织化学染色检测PD-L1表达,qRT-PCR检测miRNA-200家族（miRNA-200a、miRNA-200b、miRNA-200c、miRNA-429、miRNA-141）的表达水平。培养肺癌A549细胞,通过转染miRNA-200家族5个miRNA模拟物使其过表达,采用蛋白质印迹法检测miRNA-200家族过表达对PD-L1表达的影响,CCK-8实验检测miRNA-200家族过表达对A549细胞增殖活性的影响,荧光素酶报告基因实验验证miRNA-200家族对PD-L1的调控作用。结果 138例NSCLC患者癌组织PD-L1总阳性率为58.7%（81/138）,高于癌旁组织（3.6%,5/138）,差异有统计学意义（P<0.05）;PD-L1表达水平与患者性别、年龄、肿瘤大小、组织学类型无关,而与淋巴结转移、脉管侵犯、临床TNM分期有关（P均<0.05）。NSCLC癌组织中miRNA-200家族表达水平均低于癌旁组织（P均<0.01）,且PD-L1表达阳性的患者具有更低水平的miRNA-200家族表达水平（P均<0.01）。A549细胞过表达miRNA-200家族能下调PD-L1的表达（P均<0.01）,且抑制癌细胞增殖活性（P均<0.01）。荧光素酶报告基因实验证实miRNA-200家族直接负调控PD-L1的表达（P均<0.01）。结论 PD-L1高表达预示NSCLC患者预后不良。PD-L1是miRNA-200家族的靶基因,miRNA-200家族表达水平低可能是NSCLC患者高表达PD-L1的重要原因。     

LINC00638在结肠癌中的表达及对结肠癌细胞功能的研究

目的 探讨LINC00638在结肠癌中的表达及其临床意义,并进一步探究LINC00638对结肠癌细胞生物学功能的影响。方法 通过癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库初步比较LINC00638在正常结肠组织和结肠癌组织中的表达差异,探究其与患者临床病理特征的关系。通过Kaplan-Meier生存分析进一步探究LINC00638表达对结肠癌患者预后的影响。通过GEPIA数据库和高通量基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)进一步验证LINC00638表达对结肠癌患者预后的影响。采用单因素和多因素COX回归分析探究LINC00638、临床病理相关因素对结肠癌患者预后的影响。应用小干扰RNA(siRNA)沉默HCT116细胞和DLD1细胞中LINC00638的表达,通过CCK-8实验、集落形成实验、划痕实验、Transwell实验探究LINC00638对结肠癌细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响。结果 LINC00638在结肠癌组织中表达水平明显升高,并且其表达量与结肠癌患者的淋巴结转移和TNM分期密切相关。Kaplan-Meier生存曲线分析结果显示,LINC00638表达水平越高,结肠癌患者预后越差(P＜0.05)。COX回归分析结果显示,LINC00638、年龄和TNM分期可以作为结肠癌患者的独立预后因素。细胞功能实验结果表明,与对照组比较,敲低组细胞的增殖、迁移和侵袭能力显著降低(P＜0.05)。结论 LINC00638在结肠癌中高表达,并且其表达水平越高,结肠癌患者预后越差。敲低LINC00638后可以抑制结肠癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力。     

人类脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1在三阴性乳腺癌中的表达研究

目的 检测人类脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1(apurinic/apyrimidinic endonuclease/redox effector factor1,APE-1/REF-1)在乳腺癌中的表达,分析其与乳腺癌的临床病理特征的关系,及APE-1对三阴性乳腺癌患者预后的影响。方法 采用免疫组化Envision两步法检测323例乳腺癌中APE-1蛋白的表达,其中108例为三阴性乳腺癌。计数资料采用χ²检验和Fisher精确检验。采用Kaplan-Meier法进行生存分析及Log-rank检验进行生存率的比较,并用COX比例风险回归模型进行多因素分析。结果 APE-1在乳腺癌组织较癌旁组织有更高的表达,且在非三阴性乳腺癌中与肿瘤大小、腋窝淋巴结状态、临床分期、雌激素受体、人类表皮生长因子2型受体的表达显著相关(P<0.05)。在三阴性乳腺癌中,APE-1表达与肿瘤大小(P=0.006)呈正相关,且APE-1低表达组有较好的生存率(P=0.007)。腋窝淋巴结阳性的三阴性乳腺癌患者中,APE-1低表达组有较好的预后(P=0.042)。结论 APE-1是影响三阴性乳腺癌患者预后的独立因子,可能成为三阴性乳腺癌的潜在治疗靶点。     

系统免疫炎性指数联合预后营养指数判断胃癌预后的价值分析

目的 探讨系统免疫炎性指数(systemic immune-inflammation index, SII)和预后营养指数(prognostic nutritional index, PNI)与胃癌临床病理因素及预后的关系,进一步讨论两者联合COSII-PNI的预后意义。方法 回顾性收集2014年1月～2017年1月就诊于蚌埠医学院第一附属医院初治的178例胃癌患者的临床资料,采用受试者工作特征(receiver operator characteristic, ROC)曲线确定SII、PNI预测预后的最佳截断值,χ2检验分析SII、PNI与胃癌临床病理特征的关系,Spearman秩相关法分析变量的相关性,Kaplan-Meier法制生存曲线,COX比例风险模型估判SII及PNI的预后价值。结果 SII、PNI均与肿瘤直径、浸润深度、淋巴结转移、pTNM分期、是否贫血相关(P＜0.05),且SII与年龄、位置、大体分型相关(P＜0.05),PNI与SII呈显著负相关(r=-0.545,P＜0.001),低SII组、高PNI组患者5年总生存率分别高于高SII组、低PNI组(P＜0.05)。多因素COX回归分析显示,SII、浸润深度、淋巴结转移、pTNM分期、是否辅助化疗为影响预后的独立危险因素(P＜0.05),新型评分系统COSII-PNI实现了良好的预后分层(P＜0.05)。结论 高SII和低PNI是胃癌侵袭性生物学和不良预后的有力指标,新型评分系统COSII-PNI极具潜在的预后判断价值。     

长链非编码RNA CCAT1在支气管哮喘中的表达及对气道平滑肌细胞的影响

目的 探究长链非编码RNA(lncRNA)结肠癌相关转录因子1(CCAT1)对气道平滑肌细胞的影响。方法 选取2016年10月至2018年10月邯郸市中心医院收治的56例支气管哮喘急性发作期患儿,及56例同期健康体检儿童。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测支气管哮喘患儿和健康儿童血浆lncRNA CCAT1表达水平。Lipofectamine 2000^TM法构建lncRNA CCAT1过表达、低表达人气管平滑肌细胞系(分别记为pc-CCAT1组、si-CCAT1组),同时设置相应阴性对照(分别为pc-NC组、si-NC组),使用qRT-PCR进行验证;CCK-8实验、BrdU实验分别检测细胞活力、增殖能力,划痕实验检测细胞迁移能力,Western blot检测细胞中B细胞淋巴瘤2(Bcl-2)和Bcl-2相关X蛋白(Bax)表达。结果 哮喘组儿童血浆lncRNA CCAT1表达高于健康组(P<0.001),pc-CCAT1组细胞中lncRNA CCAT1表达水平高于pc-NC组(P<0.001),si-CCAT1组细胞中lncRNA CCAT1的表达水平低于si-NC组(P<0.05)。48、72、96小时,pc-CCAT1组细胞的OD值高于pc-NC组(P<0.001),si-CCAT1组细胞的OD值低于si-NC组(P<0.001)。与pc-NC组相比,pc-CCAT1组BrdU阳性细胞百分比、细胞迁移率、Bcl-2蛋白表达升高(P<0.05),Bax蛋白表达降低(P<0.05);与si-NC组相比,si-CCAT1组BrdU阳性细胞百分比、细胞迁移率、Bcl-2蛋白表达降低(P<0.05),Bax蛋白表达升高(P<0.001)。结论 支气管哮喘患儿血浆CCAT1表达上调,lncRNA CCAT1参与气道平滑肌细胞的增殖、迁移和凋亡过程。     

肺腺癌中免疫相关lncRNA的筛查表达与预后分析

目的 筛查肺腺癌免疫相关lncRNA,并分析其在肺腺癌中的表达及对患者预后的影响.方法 自美国TCGA数据库筛选肺腺癌患者的转录数据和临床资料;使用美国Cytoscape软件3.5.0构建免疫-lncRNA共表达网络获得免疫相关的lncRNA;采用单变量Cox回归分析分配风险评分,筛选预后相关的lncRNA,Graph...     

冠心病患者血清lncRNA H19、CHAST的表达水平及临床意义

目的 探讨冠心病(coronary heart disease,CHD)患者血清长链非编码RNA(lncRNA) H19、CHAST的表达水平及临床意义。方法 选取2021年6月~2022年5月在笔者科室住院的冠心病患者135例,其中急性冠状动脉综合征76例,慢性冠状动脉综合征59例,选取同期住院且经冠状动脉造影排除CHD的对照组62例。采用实时荧光定量PCR(RT-PCR)法测量各组血清lncRNA H19、lncRNA CHAST的表达水平,同时检测各组血清超敏C反应蛋白(high sensitivity C-reactive protein,hs-CRP)、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)、白细胞介素(interleukin,IL)-6、低密度脂蛋白(low density lipoprotein,LDL)、高密度脂蛋白(high density lipoprotein,HDL)等指标。采用 ROC 曲线分析血清lncRNA H19、lncRNA CHAST表达水平对 CHD 的诊断价值;Pearson相关性分析评估lncRNA H19、lncRNA CHAST表达水平与hs-CRP、TNF-α、IL-6、LDL、HDL 等因素的相关性;Logistics回归分析CHD的危险因素。结果 CHD组血清lncRNA H19、lncRNA CHAST表达水平较对照组升高(P < 0.05)。CHD组hs-CRP、IL-6、TNF- α、LDL水平高于对照组(P<0.05),HDL水平低于对照组(P<0.05),lncRNA H19、lncRNA CHAST表达水平与hs-CRP、IL-6、TNF-α、LDL等指标呈正相关(P<0.05),与HDL呈负相关(P<0.05)。lncRNA H19、lncRNA CHAST为CHD的危险因素,且两者能较好的诊断CHD。结论 lncRNA H19、lncRNA CHAST为CHD发病的危险因素,可作为诊断CHD的血清指标,且二者联合诊断CHD的价值更高。     

HE4蛋白与OPN蛋白对子宫内膜癌患者预后的影响

目的 探讨正常子宫内膜组、癌前病变组和子宫内膜癌（endometrial carcinoma,EC）组中人附睾分泌蛋白4（HE4）和骨桥蛋白（OPN）的表达和相关性,及其对EC手术预后的影响。方法 采用免疫组化（SP）法,检测分析2009年1月~2015年6月期间就诊于邯郸市中心医院的正常组、癌前病变组及癌组中HE4、OPN的表达情况,采用Kaplan-Meier生存分析法和Log-rank检验来评价各因素与EC患者生存时间的关系,并用COX风险模型进行多因素分析。结果 正常组、癌前病变组和癌组的子宫内膜组织中,HE4蛋白的阳性表达率逐渐升高分别为13.33%、32.00%、70.76%,OPN蛋白的阳性表达率也逐渐升高分别为10.00%、24.00%、63.74%,且组间比较差异有统计学意义（P < 0.05）。HE4蛋白及OPN蛋白的阳性表达率在手术-病理分期、组织学分级、肌层浸润深度及有无淋巴结转移组中比较,差异均有统计学意义（P < 0.05）。Spearman相关分析显示,EC中HE4蛋白的表达与OPN蛋白的表达呈正相关（r=0.397,P < 0.05）。Kaplan-Meier分析显示手术-病理分期、肌层浸润深度、淋巴结转移、HE4阳性表达及OPN阳性表达5个因素与预后相关（P < 0.05）,年龄、组织学分级、组织学类型与预后不相关（P > 0.05）。COX多因素逐步分析显示,手术-病理分期、组织学分级、肌层浸润深度、HE4阳性表达、OPN阳性表达是影响预后的显著因素,但组织学分级影响最不明显（P=0.049）。结论 HE4和OPN蛋白在EC中高表达且正相关,手术-病理分期晚、组织学分级高、肌层浸润深、HE4表达阳性、OPN表达阳性者预后差,HE4和OPN有望成为评价EC预后的重要标记。     

胃癌中lncRNA HOXA-AS2的表达及其对胃癌细胞生物学行为的影响

目的 分析lncRNA HOXA-AS2在胃癌组织中的表达水平及其对胃癌恶性生物学的影响。方法 采用qPCR方法检测胃癌组织和胃癌细胞系中lncRNA HOXA-AS2的表达水平;通过生物信息分析在线网站Kaplan-Meier Plotter 分析lncRNA HOXA-AS2对胃癌患者预后的影响;分析lncRNA HOXA-AS2表达水平与胃癌患者临床病理特征之间的关系;构建干扰lncRNA HOXA-AS2表达的细胞株,利用CCK-8、克隆形成实验、划痕实验、Transwell实验、分析下调lncRNA HOXA-AS2对胃癌细胞增殖能力,迁移能力,侵袭能力的影响。结果 与癌旁组织比较,胃癌组织中lncRNA HOXA-AS2的表达水平显著上调;与人正常胃黏膜细胞GES比较,胃癌细胞系中lncRNA HOXA-AS2的表达水平显著升高(P＜0.05);生存分析表明,lncRNA HOXA-AS2的高表达与胃癌患者的不良预后相关;lncRNA HOXA-AS2的表达水平与胃癌分期,淋巴结转移和分化程度相关(P＜0.05);转染siRNA的胃癌细胞中lncRNA HOXA-AS2的表达水平显著下降(P＜0.05),其细胞增殖、迁移和侵袭能力也显著下降(P＜0.05)。结论 lncRNA HOXA-AS2在胃癌中发挥癌基因的作用且与预后相关,下调lncRNA HOXA-AS2的表达可抑制胃癌细胞增殖、迁移和侵袭能力。     

基于数据库分析CCR基因对肾透明细胞癌预后的预测价值

目的 利用信息库资料探讨趋化因子受体家族对肾透明细胞癌(ccRCC)预后的预测价值。方法 下载并分析癌症基因组图谱(TCGA)的基因表达数据,筛选CC趋化因子受体(CCR)亚基因家族在正常组织与ccRCC组织中的差异表达基因。采用COX回归分析构建预后模型并进行相关功能学分析。结果 从TCGA数据库下载包括539例ccRCC组织和72例正常组织的基因转录组数据,筛选出11个差异表达的CCR家族基因。通过多因素Cox回归分析得到2个(CCR3与CCR10)与ccRCC预后相关的CCR基因,并以此构建预后模型。根据模型风险评分的中位值将训练集样本分为高风险组(n=184)与低风险组(n=197)。Kaplan-Meier生存分析结果显示,低风险组总生存率高于高风险组,差异有统计学意义(P<0.001)。结论 本研究构建的CCR基因预后模型可较好地评估ccRCC患者的预后并指导其个体化治疗。     

外周血MPVLR相关列线图模型预测结肠癌术后患者的预后

目的 构建与外周血平均血小板体积比淋巴细胞(mean platelet volume ratio lymphocyte,MPVLR)相关的列线图模型以个体化评估结肠癌术后患者的预后。方法 本研究纳入2014年1月~2016年11月就诊于笔者医院经病理确诊为结肠癌的261例患者。采用Kaplan-Meier生存曲线及Log-rank检验分析不同MPVLR水平组与患者预后的关系。采用多因素COX回归分析确定独立预后因素。采用R软件构建预测结肠癌术后患者预后的列线图模型。利用C-指数、校正曲线对模型进行验证。并与TNM分期比较。结果 生存分析结果显示,MPVLR高水平组的患者与生存率呈负相关(P＜0.001)。多因素COX回归分析结果显示,术前MPVLR水平、浸润深度、淋巴结转移、CEA是结肠癌术后患者的独立预后因素(P<0.05)。整合独立预后因素,建立了预测结肠癌术后患者生存率的列线图模型。C指数和校准曲线均提示列线图模型有较好的预测效果。与传统的TNM分期比较,列线图模型显示出更好的准确性。结论 成功建立了与MPVLR相关的列线图模型以个体化评估结肠癌术后患者3年、5年的生存率。该列线图模型可以作为TNM分期的补充,有助于临床医生评估患者的个体生存情况。     

胃癌间充质干细胞促进胃癌细胞PD-L1表达的特征观察

目的 探讨胃癌来源的间充质干细胞（GCMSC）促进胃癌细胞程序性死亡配体1（PD-L1）表达的具体特征,为进一步研究GCMSC促进肿瘤细胞PD-L1表达机制及胃癌的靶向治疗提供依据。方法 采用细胞贴壁法从胃癌组织中分离出GCMSC,流式细胞仪分析GCMSC表面标志物,采用成脂和成骨分化实验评价GCMSC的多向分化能力。流式细胞术分选PD-L1阴性和PD-L1阳性胃癌细胞。收集GCMSC条件培养基（GCMSC-CM）处理胃癌细胞,分别采用实时荧光定量聚合酶链反应（qRT-PCR）和Western blotting检测胃癌细胞PD-L1的mRNA和蛋白表达。采用酶联免疫吸附试验（ELISA）检测胃癌患者血清游离PD-L1和白细胞介素-8（IL-8）水平。结果 成功分离鉴定GCMSC,结果发现GCMSC-CM处理24、48和72 h后,SGC-7901细胞的PD-L1表达均上调（P <0.05）,GCMSC-CM处理MGC-803细胞 24、48和72 h后,MGC-803细胞PD-L1表达也上调（P <0.05）。然而,去除GCMSC-CM后48 h,SGC-7901和MGC-803的PD-L1表达又逐渐恢复。当IL-6或IL-8在GCMSC-CM中被阻断时,与GCMSC-CM组比较,这种促进作用被逆转,尤其是IL-8的作用更明显（P <0.05）。胃癌患者血清游离PD-L1与IL-8呈正相关（r =0.347,P <0.05）。流式细胞术结果显示,经GCMSC-CM再次处理后,PD-L1阳性胃癌细胞PD-L1表达能够再次升高（P <0.05）,而PD-L1阴性的胃癌细胞PD-L1的表达仍然不升高（P >0.05）。结论 GCMSC-CM促进胃癌细胞中PD-L1表达,并依赖GCMSC-CM的持续作用。胃癌细胞具有异质性,其PD-L1表达对GCMSC具有不同的反应性。