太子参-牡丹皮药对治疗糖尿病心肌病网络药理学机制探讨

目的：探究太子参-牡丹皮药对治疗糖尿病心肌病的作用机制。方法：利用网络药理学方法,借助中药系统药理学分析平台（TCMSP）、Pubchem网站、Swiss Target Prediction数据库预测活性成分候选靶点。通过Disgenet和GeneCards数据库筛选出糖尿病心肌病的靶点基因,利用Venny图取中药与疾病的交集靶点,通过STRING数据库建立蛋白互作网络图,并通过Cytoscape 3.9.0软件对网络图进行优化,筛选出核心靶点。利用Metascape数据库对交集靶点进行GO分析和KEGG富集分析。结果：中药共筛选出19个活性成分,277个作用靶点,糖尿病心肌病筛选出疾病靶点2424个,通过韦恩图得出交集靶点109个。通过药物-活性成分-靶点网络图分析可得山奈酚、槲皮素、刺槐素、木犀草素对疾病的治疗可能发挥重要作用。通过PPI网络图可知核心靶点为TNF、AKT1、SRC、TP53、EGFR等。根据KEGG分析,预测该药对主要通过干预癌症、MAPK、PI3K-Akt等信号通路发挥对糖尿病心肌病的治疗作用。结论：太子参-牡丹皮药对可通过多种活性成分、多靶点、多途径对糖尿病心...     

白鲜皮“异病同治”皮炎、湿疹和银屑病的作用机制预测

目的 通过网络药理学和分子对接技术分析白鲜皮“异病同治”皮炎、湿疹、银屑病的分子靶点及其相关作用机理。方法 运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索并筛选白鲜皮的主要活性成分,并运用STP数据库预测有效成分的作用靶点。借助TTD、OMIM、DrugBank、GeneCards、DisGeNET数据库获取治疗皮炎、湿疹、银屑病的有关靶点,借助Venny软件获取皮炎、湿疹、银屑病的相同靶点以及与白鲜皮有效成分作用靶点的交集靶点。利用Cytoscape绘制网络图,STRING数据库构建白鲜皮治疗皮炎、湿疹、银屑病的相同靶基因的蛋白互作网络图。运用Metascape数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并运用R语言进行可视化处理。通过Discovery Studio 2019 Client、AutoDock Tools、PyMOL进行分子对接和可视化。结果 经筛选白鲜皮有效成分15个,与皮炎、湿疹、银屑病相同靶点的交集靶点共64个。白鲜皮活性成分治疗皮炎、湿疹、银屑病的核心靶点依次为肿瘤坏死因子(TNF)、Toll样受体4(TLR4)...     

基于网络药理学研究培元化瘀解毒方治疗胃癌的作用机制

目的 探讨培元化瘀解毒方治疗胃癌的网络药理学作用机制。方法 利用中医药数据库和文献检索筛选培元化瘀解毒方的生物活性成分,预测其作用靶点,从疾病数据库检索胃癌相关靶点,构建药效分子-靶点网络及蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,然后进行KEGG分析、GO富集分析。结果 检索获得培元化瘀解毒方中药的有效活性成分206种,药效分子靶点基因211个,有对应靶点信息的有效成分132个,对应关系1 131个;检索得到胃癌靶点184个;通过PPI对药物靶点进行扩增得到3 592个直接或间接靶点,与疾病靶点取交集得到144个靶点。PPI分析表明,排名靠前的靶点与胃癌密切相关,富集分析也显示这些靶点在癌症通路中被富集。结论 本研究初步揭示了培元化瘀解毒方在胃癌治疗中的有效成分、潜在靶点及可能的作用机制,为中西医结合治疗胃癌提供参考。     

运用网络药理学-分子对接探究大黄治疗支气管哮喘的作用机制

目的 采用网络药理学-分子对接探讨大黄治疗支气管哮喘（简称哮喘）的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）及SwissTargetPrediction数据库获取大黄的主要活性成分和作用靶点;利用GeneCards、DisGeNET数据库检索哮喘的潜在靶点;将获得的大黄成分靶点与哮喘靶点输入到Venny2.1在线软件得到大黄治疗哮喘的交集靶点;采用Cytoscape3.9.1软件绘制“大黄-活性成分-靶点-哮喘”相互作用网络图;对交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析;利用Metascape进行基因本体（GO）及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;使用AutoDock1.5.6软件对大黄核心成分与靶蛋白进行分子对接验证。结果 收集到大黄有效活性成分16个,所对应基因靶点250个,哮喘基因靶点8 400个,大黄和哮喘共同靶点为171个。PPI结果显示,大黄中的丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、连环蛋白β1(CTNNB1)、表皮生长因子受体（EGFR）、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(CASP3)、缺氧诱导因子1A(...     

半夏泻心汤治疗化疗性肠黏膜炎的作用机制探讨

目的：基于网络药理学,探讨半夏泻心汤治疗化疗性肠黏膜炎（CIM）的潜在分子作用机制,为其临床应用及研发提供参考。方法：采用TCMSP数据库检索获取半夏泻心汤的有效活性成分及其潜在的作用靶点,运用GeneCards、OMIM、TTD、Drugbank数据库检索CIM相关靶点,将两者取交集,获得半夏泻心汤治疗CIM的潜在靶点,通过CytoScape 3.6.1软件绘制“半夏泻心汤-活性成分-CIM靶点”网络图,利用STRING 11.0数据库构建交集靶点的蛋白互作网络图,筛选出网络中的关键蛋白。利用DAVID数据库对核心靶点进行GO和KEGG富集分析。最后,利用PDB平台将半夏泻心汤关键化学成分与核心靶点进行分子对接。结果：筛选共获得275种活性成分,99个半夏泻心汤治疗CIM靶点,富集分析后得到564个GO相关条目,115条相关信号通路。分子对接结果证明,半夏泻心汤主要活性成分与核心靶点EGFR、TNF、IL6具有较好的亲和力。结论：半夏泻心汤可能通过TNF、EGFR、IL6作用靶点发挥治疗CIM的作用,山奈酚、槲皮素、黄芩素可能是其发挥作用的主要活性成分。     

应用网络药理学探讨菟丝子治疗多囊卵巢综合征伴胰岛素抵抗的可能机制

目的：挖掘中药菟丝子用于防治多囊卵巢综合征（PCOS）伴胰岛素抵抗（IR）的潜在作用机制。方法：通过多个数据库检索菟丝子成分与靶点及PCOS、IR相关疾病靶点,在Uniprot中对筛选并去重后的靶点进行校准,取成分与疾病靶点的交集基因,在Cytoscape创建菟丝子“活性成分-PCOS-IR”网络与PPI网络;基于Metascape对菟丝子治疗PCOS-IR的靶点用GO和KEGG富集分析预测其作用机制。结果：初步获得菟丝子29种化学成分,经筛选、留存13种主要活性成分,主要为黄酮类物质,包括槲皮素、芹菜素、山奈酚、异鼠李素、β-谷甾醇、芝麻素、苦参碱、紫云英苷、金丝桃苷等。共收集764个PCOS、IR相关疾病靶点,与活性成分靶点进行比对,获得104个交集基因,PPI网络分析结果显示这些基因主要与脂质反应、生殖结构发育、细胞凋亡、类固醇激素受体活性等生物进程有关,它们的分子功能主要与核受体活性、BH3结构域结合、IR结合等相关,主要富集在膜筏、囊泡腔、细胞器外膜、蛋白激酶复合体等部位。结论：菟丝子通过多成分、多靶点以及多途径参与PCOS伴IR调控机制,其中13种主要成分可能为其药效物质基...     

金鸡胶囊治疗盆腔炎的活性成分和作用机制预测

目的：运用网络药理学和分子对接技术预测金鸡胶囊治疗盆腔炎（pelvic inflammatory disease,PID）的潜在活性成分,并阐明其作用机制。方法：通过数据库和文献检索搜集金鸡胶囊中6味中药材的化学成分、作用靶点及疾病靶点;运用MCC算法对交集靶蛋白进行筛选得到核心靶蛋白;运用ClueGo和Metescape数据库对核心靶蛋白进行基因富集分析;通过构建“金鸡胶囊活性成分-核心靶点-关键通路图”反推测出关键活性成分和核心靶蛋白进行分子对接。结果：共收集到712种活性成分,化学成分作用靶点与盆腔炎疾病交集靶点有89个,其中化学成分14-去氧-12-甲氧基穿心莲内酯、穿心莲黄酮、甘草查尔酮A、远志酮I、千层纸素A和靶蛋白EGFR、PIK3CA、ESR1、AKT1、MTOR、MAPK1作为关键活性物质和核心靶点。分子对接表明,关键活性成分和核心作用靶点结合状况良好,结合自由能-9.65～-5.56Kcal/mol。结论：金鸡胶囊通过作用多靶点,多条通路治疗盆腔炎疾病。其中化合物14-去氧-12-甲氧基穿心莲内酯和甘草查尔酮A与靶蛋白ESR1、ATK1具有稳定的结合口袋,能够形成稳...     

基于网络药理学和分子对接探讨丹栀逍遥散治疗失眠障碍的作用机制

目的:基于网络药理学和分子对接分析丹栀逍遥散治疗失眠障碍的相关成分、靶点及通路,探讨其作用机制.方法:检索TCMSP数据库,获取丹栀逍遥散中各药物的活性成分及其靶点,在UniProt数据库中规范靶点名;在GeneCards、OMIM、TTD3个数据库中检索失眠障碍相关基因,筛选复方与疾病的交集靶点,将其导入String数据库,导出蛋白互作关系,并使用CytoscapeV3.8.0构建疾病-药物-成分-靶点网络和核心蛋白互作网络;利用Metascape平台分别对交集靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析;将核心成分与核心靶点进行分子对接验证.结果:共获得丹栀逍遥散活性成分102种,对应靶点147个,与失眠障碍交集靶点52个,其中核心成分12种,核心靶点7个;GO富集分析共得762条结果,其中主要涉及神经递质水平调节、肾上腺素受体活性以及突触膜的组成部分等;KEGG通路富集分析共获得61条通路,主要涉及:神经活性配体-受体相互作用通路;分子对接结果显示核心靶点与核心成分均能形成稳定结合.结论:初步获得丹栀逍遥散治疗失眠障碍的关键成分、关键靶点和关键通路,为临床使用和进一步研究提供参考.     

基于网络药理学和分子对接探究新风胶囊“异病同治”类风湿关节炎和骨关节炎作用机制

目的：分析新风胶囊（XFC）“异病同治”类风湿关节炎（RA）和骨关节炎（OA）的分子机制。方法：TCMSP数据库筛选XFC的活性成分及靶点,疾病数据库中筛选RA和OA的靶点,构建药物-成分-靶点网络。构建交集靶点的蛋白互作网络,进行功能富集分析和分子对接。绘制XFC治疗RA和OA信号通路。结果：共鉴定103种化合物和217个靶点,槲皮素、蜈蚣素、山柰酚、谷甾醇α1、芒柄花黄素、雷公藤甲素、豆甾醇、山海棠二萜内酯A等11个化合物与≥30个靶基因相关联,其中9个靶基因（STAT3、MAPK14、NR3C1、JUN、FOS、MYC、TNF、RELA和MAPK1）是网络中的核心靶基因。富集分析表明IL-17、TNF、Th17、Toll和NF-κB信号通路可能是关键信号通路。分子对接表明山海棠二萜内酯A、槲皮素、雷公藤甲素、谷甾醇α1、蜈蚣素与NR3C1、FOS、STAT3、MAPK1和TNF靶点具有良好的结合活性。结论：XFC “异病同治”RA与OA的机制与抗炎、免疫调节、减少骨破坏等相关,具有多系统、多成分、多靶点的作用。     

基于网络药理学与分子对接探讨桃红四物汤对血小板活化的作用机制

目的 采用网络药理学和分子对接技术探讨桃红四物汤对血小板活化的作用机制,为后续实验研究及临床应用提供参考。方法 首先通过TCMSP数据库获得桃红四物汤中的主要活性成分及其对应作用靶点信息;通过Gene Card、OMIM、TTD等数据库获得与血小板活化相关的靶点;其次利用Venny图将桃红四物汤中有效成分对应靶点基因与血小板活化靶点基因相映射,筛选两者之间的共有靶点,借助STRING平台及Cytoscape3.7.1软件,绘制交集基因蛋白互作（PPI）网络图;然后利用基因注释、可视化和综合发现数据库（David）对核心靶点进行基因本体（GO）生物功能富集分析及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,通过微生信云平台对富集结果可视化;最后借助AutoDockTools软件对核心成分及关键靶点基因进行分子对接,筛选出桃红四物汤中的重要成分及其作用于血小板活化过程中的重要靶点,为后续对核心成分抑制血小板活化作用进行实验验证提供重要依据。结果 按照一定条件共筛选出69个桃红四物汤有效成分及2 175个血小板活化的靶点,去除重复后获得44个桃红四物汤作用于血小板活化的有效成分和154个...     

菊花-密蒙花药对治疗角膜损伤的作用机制

目的：基于网络药理学与分子对接探讨菊花-密蒙花药对治疗角膜损伤的作用机制。方法：选用中草药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选出菊花-密蒙花的有效活性成分及相关作用靶点;在Genecards、OMIM、PharmGkb、DrugBank等疾病数据库检索出角膜损伤的靶点基因;再利用R软件将疾病的靶点基因与菊花-密蒙花的靶点基因进行交集分析并绘制韦恩图;运用Cytoscape构建“药物-成分-靶点”网络图;通过STRING网络平台和cytoscape软件构建蛋白质互相作用网络（PPI）,并用插件CytoNCA筛选核心靶点;利用metascape平台对角膜损伤治疗关键靶点进行GO(Gene Ontology)和KEGG(KyotoEncyclo pediaof Genesand Genomes)富集分析。通过PyMOL和Auto DockVina等软件,将菊花-密蒙花药对的活性成分和核心靶点进行分子对接,并根据其结合能判断亲和力大小。结果：共收集17个有效成分及586个药物靶点;角膜损伤疾病靶点2797个;药物成分和疾病的共有靶点146个;最终得到14个核心靶点：JUN、TP53、M...     

基于网络药理学的治伤风颗粒治疗感冒的作用机制探讨

目的应用网络药理学技术探讨治伤风颗粒治疗感冒的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和药物靶点信息数据库(DrugBank)检索治伤风颗粒的化学成分及作用靶点;基于GeneCards数据库检索“感冒”的靶点,取药物与疾病靶点交集,应用Cytoscape软件构建“活性成分-靶点-疾病”网络。应用STRING数据库建立蛋白质互作(PPI)网络,应用R软件进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果通过筛选共得到治伤风颗粒有效成分146种,药物靶点280个,疾病靶点1 418个,提取出两者的共同靶点117个。将药物与靶点导入Cytoscape软件,分析得出槲皮素、山奈酚和木犀草素等为中药中度值较高的活性成分,无水咖啡因为西药中度值最高的活性成分。STRING数据库分析得出IL-6、AKT1、INS、VEGFA、MAPK8等属于感冒的关键靶点。GO分析显示生物过程(BP)、细胞组分(CC)和分子功能(MF)3个方面的富集条目。KEGG通路富集分析筛选得出TNF信号通路、IL-17信号通路等20条信号通路,并绘制了“通路-靶点”关系图。结论基于网络药理学分析筛选出了治伤风颗粒治疗感冒的活性成分、作用靶点和通路,初步得出了其作用机制,为该药的深入研究提供了一定的依据。     

基于网络药理学和分子对接探讨白花蛇舌草治疗骨肉瘤的作用机制

目的:从网络药理学和分子对接的角度探讨白花蛇舌草干预骨肉瘤的分子作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)预测白花蛇舌草的活性成分及相关靶基因;通过GEO-NCBI等数据库获得骨肉瘤相关的基因。将骨肉瘤相关基因和白花蛇舌草药物成分靶基因进行交集,得到白花蛇舌草干预骨肉瘤的共同靶基因。采用Cytoscape 3.8.1软件构建白花蛇舌草有效成分-骨肉瘤靶基因调控网络;将共同靶基因导入STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;运用DAVID在线数据库及R语言对共同靶点进行GO富集分析和KEGG富集分析;用Cytoscape 3.8.1软件筛选出白花蛇舌草干预骨肉瘤的核心靶点,然后将核心靶点与对应的白花蛇舌草活性成分进行分子对接以验证活性成分与核心靶点的结合能力。结果:共筛选出白花蛇舌草5个有效成分(MOL001659多孔甾醇、MOL001670 2-甲氧基-3-甲基-9,10蒽醌、MOL000449豆甾醇、MOL000358β-谷甾醇、MOL000098槲皮素)及其对应的靶基因共169个,3 178个骨肉瘤相关基因;靶基因和骨肉瘤相关基因交集得到白花蛇舌草干预骨肉瘤的预测靶点98个;经过PPI拓扑分析,提示相互作用紧密的8个核心基因分别是雌激素受体1(ESR1)、JUN、RAC-α丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶(AKT1)、G1/S特异性细胞周期蛋白-D1(CCND1)、FOS、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)和细胞肿瘤抗原p53(TP53)与MYC;GO富集分析得到P0.05的结果共计2 205条,其中生物进程(BP)结果 2 037条,细胞组分(CC)结果 39条,分子功能(MF)结果 129条;KEGG富集分析得到P0.05的结果共有155条,包括IL-17、细胞凋亡、肿瘤坏死因子、p53、细胞衰老等通路。分子对接结果显示AKT1、CCND1、FOS、MAPK1、TP53、MYC与槲皮素,ESR1与2-甲氧基-3-甲基-9,10蒽醌,JUN与β-谷甾醇之间亲和力均小于-7 kcal/mol,亲和力较高,显示出较好的结合能力。结论:白花蛇舌草可通过多个不同成分作用于骨肉瘤多个靶点,进而调控多条通路干预骨肉瘤发生发展过程,这可为白花蛇舌草临床应用和开发提供参考。     

复方葶苈子汤治疗慢性肺源性心脏病的作用机制研究

目的：研究“复方葶苈子汤”治疗慢性肺源性心脏病的潜在靶点及作用机制。方法：通过中药系统药理学分析平台（TCMSP）、SwissADME数据库检索“复方葶苈子汤”的主要有效活性成分和作用靶点,利用Cytoscape3.9.1软件构建“药物-活性成分-交集靶点”网络图,借助GeneCards数据库获得慢性肺源性心脏病相关靶点,导入String11.5数据库构建蛋白质-蛋白质互相作用网络图并进行拓扑学分析,利用Metascape软件对“复方葶苈子汤”中起关键作用的靶蛋白进行基因本体GO分析及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析,并通过cytoscape3.9.1软件平台绘制GO和KEGG气泡图。结果：通过筛选得到复方葶苈子汤的有效成分114个,靶点599个,Genecards数据库获得慢性肺源性心脏病疾病靶点1667个,交集靶点246个,并绘制韦恩图。GO分析提示复方葶苈子汤治疗慢性肺源性心脏病可能参与激素反应、激酶活性的调节、蛋白质磷酸化的正向调控、细胞对氮化合物的反应等多项生物过程,涉及质膜筏、质膜蛋白复合物、黏着斑、初级溶酶体等细胞组分,体现蛋白激酶活性、蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶...     

应用网络药理学探讨菟丝子治疗多囊卵巢综合征伴胰岛素抵抗的可能机制

摘要：【目的】 挖掘中药菟丝子用于防治多囊卵巢综合征（PCOS）伴胰岛素抵抗（IR）的潜在作用机制。【方法】 通过多个数据库检索菟丝子成分与靶点及PCOS、IR相关疾病靶点，在Uniprot对筛选并去重后的靶点进行校准，取成分与疾病靶点的交集基因，在Cytoscape创建菟丝子“活性成分—PCOS-IR”网络与PPI网络；基于Metascape对菟丝子治疗PCOS-IR的靶点用以GO和KEGG富集分析预测其作用机制。【结果】 初步获得菟丝子29种化学成分，经筛选，留存13种主要活性成分，主要为黄酮类物质，包括槲皮素、芹菜素、山奈酚、异鼠李素、β-谷甾醇、芝麻素、苦参碱、紫云英苷、金丝桃苷等。共收集764个PCOS、IR相关疾病靶点，与活性成分靶点进行，获得104个交集基因，PPI网络分析结果显示这些基因主要与脂质反应、生殖结构发育、细胞凋亡、类固醇激素受体活性等生物进程有关，它们的分子功能主要与核受体活性、BH3结构域结合、IR结合等相关，主要富集在膜筏、囊泡腔、细胞器外膜、蛋白激酶复合体等部位。【结论】菟丝子通过多成分、多靶点以及多途径参与PCOS伴IR调控机制，其中13种主要成分可能为其药效物质基础，它们通过AGE-RAGE信号通路、PI3K-Akt信号通路、JAK/STAT信号通路等发挥效应，以上数据为菟丝子进一步的临床应用及基础研究提供参考依据。     

丹参-莪术药对治疗癌性厌食的作用机制

目的：运用网络药理学和分子对接研究丹参-莪术治疗癌性厌食（cancer-related anorexia,CA）的作用机制。方法：通过TCMSP数据库、Uniprot数据库、PharmMapper数据库并结合相关文献筛选出靶点基因,并运用Genecards数据库、OMIM数据库对CA的对应靶点进行获取筛选。使用String数据库构建疾病与药物的交集靶点的蛋白互作网络,并将结果导入cytoscape3.8.2软件进行可视化分析。再将从String数据库得出的交集基因通过Metascape数据库进行GO富集分析和KEGG富集通路分析。采用Autodock软件进行分子对接,并利用pymol软件进行可视化处理。结果：共得到丹参靶点126个、莪术靶点54个,共同靶点25个,CA靶点1893个,疾病与药物交集靶点14个。蛋白互作结果显示MAPK1、ESR1为核心靶点。GO富集分析中生物学过程主要涉及细胞对有机环状化合物的反应、类固醇激素介导的信号通路、类固醇激素反应等;KEGG富集通路主要涉及Estrogen signaling pathway、TNF signaling pathway等。分子对...     

天南星-生姜药对治疗疼痛机制的网络药理学研究

目的：运用网络药理学方法,分析天南星-生姜药对治疗疼痛的潜在靶点和作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)检索出天南星和生姜的活性成分和靶点。以“pain”为关键词,通过Dis Ge Net数据库检索出和疼痛相关的靶基因,并得到共同的靶点。通过String数据库构建蛋白互作网络图(protein-protein interaction, PPI)并进行分析,筛选出重要靶点。通过DAVID网站对共同靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果：从天南星和生姜药对中共筛选出10个有效成分,药物与疾病有63个共同靶点,包括CNR1、ESR1、MAPK3、CYP3A4、JUN、HDAC1等。GO分析得出的生物学过程包括炎症反应过程、EKR1和EKR2级联的正向调控、RNA聚合酶II启动子转录过程、G蛋白偶联受体信号通路等。KEGG富集共得到53条通路,其中与疼痛关系较为密切的包括钙信号通路、胆碱能突触信号传递、雌激素信号通路、癌症途径、5-羟色胺能通路等。结论：天南星-生姜药中的豆甾醇、β-谷甾醇、二氢辣椒碱等有效成分可能通过作用于CNR1、ESR1、MAPK3、C...     

洗腿又方治疗骨关节炎的网络药理学研究

目的 通过生物信息学、网络药理学和分子对接探讨洗腿又方治疗骨关节炎的药理学机制。方法 从基因表达综合数据库(GEO)中获取骨关节炎滑膜的差异表达基因,使用TCMSP、HERB、TCMID等数据库搜集洗腿又方的活性成分及其作用靶点,并与疾病靶点取交集。通过STRING数据库及Cytoscape3.8.2软件对交集靶点进行蛋白互作和富集分析,最终将关键活性成分与关键靶点进行分子对接。结果 获得骨关节炎滑膜的差异表达基因2072个,洗腿又方的活性成分20种,其治疗骨关节炎的靶点30个,进一步通过蛋白互作筛选获得HIF1A、CASP8、RAF1等关键靶点,富集分析发现洗腿又方主要通过干预细胞周期、炎症和内分泌等信号通路治疗骨关节炎,分子对接结果显示,关键有效成分芹黄素、槲皮素分别与关键靶点HIF1A、CASP8有良好的对接活性。结论 本研究探讨了洗腿又方治疗骨关节炎的可能活性成分、靶点及作用通路,为其应用于骨关节炎的治疗提供了理论依据。     

基于网络药理学预测青风藤治疗类风湿关节炎的分子机制

目的运用网络药理学的方法探讨青风藤治疗类风湿关节炎的分子机制。方法通过TCMSP平台筛选青风藤活性成分及作用靶点;在GeneCards和OMIM数据库中获取类风湿关节炎靶基因。通过R语言对基因进行匹配运算并绘制韦恩图;在String平台生成成分-蛋白互作网络图;Cytoscape 3.6.1软件构建成分-靶点网络;通过R3.5.1软件进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果共筛选出6个活性成分和23个潜在作用靶点;GO功能富集显示,青风藤可以影响炎症因子的细胞信号转导等生物学过程。KEGG通路富集分析显示,青风藤可以通过调控P53等凋亡相关通路发挥抗类风湿关节炎的作用。结论青风藤可能通过作用于CASP3、JUN、OPRD1等关键靶点调控P53等信号通路,从而调控炎症细胞凋亡进而发挥治疗类风湿关节炎的作用。     

基于网络药理学探讨附子配伍甘草治疗慢性心力衰竭的作用机制

目的：基于网络药理学阐明附子甘草配伍对慢性心力衰竭的作用机制。方法：通过数据库 TCMSP、TCM、STITCH 以及 OMIM、 GeneCard 从附子甘草配伍的化学成分、成分靶点以及疾病靶点分别进行检索。再对相关疾病靶点和药物潜在靶点进行分析,制作韦恩图,筛选出共同交集。分别在 David 数据库和 Bioconductor 数据库中对合并所得的候选靶点进行 GO 富集分析和 KEGG 通路注释分析。结果：本研究共筛选出附子甘草配伍中 81 个化合物,对应的成分靶点 169 个。同时通过对慢性心力衰竭的检索得到 8668 个对应靶点,通过制作韦恩图了解到附子甘草配伍药对的潜在靶点与慢性心力衰竭的潜在靶点共有 154 个交集,5 条相关的信号通路。结论：附子甘草配伍治疗慢性心力衰竭的作用机制可能与调节 AKT、 MAPK 等相关信号通路有关,其中 AKT 是其主要信号通路。且附子甘草配伍的治疗慢性心力衰竭作用与细胞凋亡、IL-6、TNF 等细胞因子的表达密切相关,表示细胞凋亡、IL-6、TNF 可能是附子甘草配伍治疗慢性心力衰竭的重要作用靶点。