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1.
目的:基于网络药理学筛选参竹心康方主要活性化合物,预测参竹心康方在对于慢性心力衰竭治疗中的潜在作用靶点及信号通路,对其作用机制进行研究。方法:主要利用TCMSP平台并结合ETCM数据库检索参竹心康方各中药的化学成分及活性成分作用靶点;通过DisGeNET、DrugBank、OMIM、GeneCards数据库获取慢性心力衰竭的主要靶点;运用Cytoscape软件系统构建“药物-活性成分-靶点”网络及PPI网络,筛选核心靶点。采用Metascape数据平台对交集靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果:得到参竹心康方有效成分158个、药物靶点1688个、慢性心衰靶点1913个,最终获得参竹心康方作用于慢性心衰的关键靶点206个,KEGG通路204条。结论:参竹心康发治疗慢性心衰主要成分为槲皮素、山奈酚、木犀草素、黄芩苷、异鼠李素,关键靶点为AKT1、VEGFA、IL6、TNF、TP53,关键通路涉及PI3K-Akt信号通路、JAK-STAT信号通路、钙信号通路、cAMP信号通路、cGMP-PKG信号通路等。  相似文献   

2.
目的:分析新风胶囊(XFC)“异病同治”类风湿关节炎(RA)和骨关节炎(OA)的分子机制。方法:TCMSP数据库筛选XFC的活性成分及靶点,疾病数据库中筛选RA和OA的靶点,构建药物-成分-靶点网络。构建交集靶点的蛋白互作网络,进行功能富集分析和分子对接。绘制XFC治疗RA和OA信号通路。结果:共鉴定103种化合物和217个靶点,槲皮素、蜈蚣素、山柰酚、谷甾醇α1、芒柄花黄素、雷公藤甲素、豆甾醇、山海棠二萜内酯A等11个化合物与≥30个靶基因相关联,其中9个靶基因(STAT3、MAPK14、NR3C1、JUN、FOS、MYC、TNF、RELA和MAPK1)是网络中的核心靶基因。富集分析表明IL-17、TNF、Th17、Toll和NF-κB信号通路可能是关键信号通路。分子对接表明山海棠二萜内酯A、槲皮素、雷公藤甲素、谷甾醇α1、蜈蚣素与NR3C1、FOS、STAT3、MAPK1和TNF靶点具有良好的结合活性。结论:XFC “异病同治”RA与OA的机制与抗炎、免疫调节、减少骨破坏等相关,具有多系统、多成分、多靶点的作用。  相似文献   

3.
目的 采用网络药理学探究芍药甘草汤治疗慢性萎缩性胃炎(CAG)的作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库、文献挖掘整理芍药甘草汤化学成分;利用GeneCards、OMIM、DrugBank、TTD数据库收集CAG的相关靶点;利用Venn图筛选交集靶点,由Cytoscape软件构建“活性成分-疾病靶点”网络,由String数据库和Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;利用Metascape数据库进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析;利用AutoDock软件进行分子对接。结果 筛选出芍药甘草汤有效活性成分103个,与CAG相关靶点76个,重要活性成分包括槲皮素、山奈酚、柚皮素、甘草查尔酮A,核心靶点包括丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、肿瘤抑制因子p53(TP53)、肿瘤坏死因子(TNF)等,KEGG通路主要富集于白细胞介素-17(IL-17)、TNF、缺氧诱导因子1(HIF-1)等通路。分子对接结果显示化合物与关键靶点有较好的结合能力。结论 芍药甘草汤可通过多成分、多靶点、多通路发挥对CAG的治疗作用。  相似文献   

4.
目的:从网络药理学和分子对接的角度探讨白花蛇舌草干预骨肉瘤的分子作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)预测白花蛇舌草的活性成分及相关靶基因;通过GEO-NCBI等数据库获得骨肉瘤相关的基因。将骨肉瘤相关基因和白花蛇舌草药物成分靶基因进行交集,得到白花蛇舌草干预骨肉瘤的共同靶基因。采用Cytoscape 3.8.1软件构建白花蛇舌草有效成分-骨肉瘤靶基因调控网络;将共同靶基因导入STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;运用DAVID在线数据库及R语言对共同靶点进行GO富集分析和KEGG富集分析;用Cytoscape 3.8.1软件筛选出白花蛇舌草干预骨肉瘤的核心靶点,然后将核心靶点与对应的白花蛇舌草活性成分进行分子对接以验证活性成分与核心靶点的结合能力。结果:共筛选出白花蛇舌草5个有效成分(MOL001659多孔甾醇、MOL001670 2-甲氧基-3-甲基-9,10蒽醌、MOL000449豆甾醇、MOL000358β-谷甾醇、MOL000098槲皮素)及其对应的靶基因共169个,3 178个骨肉瘤相关基因;靶基因和骨肉瘤相关基因交集得到白花蛇舌草干预骨肉瘤的预测靶点98个;经过PPI拓扑分析,提示相互作用紧密的8个核心基因分别是雌激素受体1(ESR1)、JUN、RAC-α丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶(AKT1)、G1/S特异性细胞周期蛋白-D1(CCND1)、FOS、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)和细胞肿瘤抗原p53(TP53)与MYC;GO富集分析得到P0.05的结果共计2 205条,其中生物进程(BP)结果 2 037条,细胞组分(CC)结果 39条,分子功能(MF)结果 129条;KEGG富集分析得到P0.05的结果共有155条,包括IL-17、细胞凋亡、肿瘤坏死因子、p53、细胞衰老等通路。分子对接结果显示AKT1、CCND1、FOS、MAPK1、TP53、MYC与槲皮素,ESR1与2-甲氧基-3-甲基-9,10蒽醌,JUN与β-谷甾醇之间亲和力均小于-7 kcal/mol,亲和力较高,显示出较好的结合能力。结论:白花蛇舌草可通过多个不同成分作用于骨肉瘤多个靶点,进而调控多条通路干预骨肉瘤发生发展过程,这可为白花蛇舌草临床应用和开发提供参考。  相似文献   

5.
目的:基于网络药理学阐明附子甘草配伍对慢性心力衰竭的作用机制。方法:通过数据库 TCMSP、TCM、STITCH 以及 OMIM、 GeneCard 从附子甘草配伍的化学成分、成分靶点以及疾病靶点分别进行检索。再对相关疾病靶点和药物潜在靶点进行分析,制作韦恩图,筛选出共同交集。分别在 David 数据库和 Bioconductor 数据库中对合并所得的候选靶点进行 GO 富集分析和 KEGG 通路注释分析。结果:本研究共筛选出附子甘草配伍中 81 个化合物,对应的成分靶点 169 个。同时通过对慢性心力衰竭的检索得到 8668 个对应靶点,通过制作韦恩图了解到附子甘草配伍药对的潜在靶点与慢性心力衰竭的潜在靶点共有 154 个交集,5 条相关的信号通路。结论:附子甘草配伍治疗慢性心力衰竭的作用机制可能与调节 AKT、 MAPK 等相关信号通路有关,其中 AKT 是其主要信号通路。且附子甘草配伍的治疗慢性心力衰竭作用与细胞凋亡、IL-6、TNF 等细胞因子的表达密切相关,表示细胞凋亡、IL-6、TNF 可能是附子甘草配伍治疗慢性心力衰竭的重要作用靶点。  相似文献   

6.
目的应用网络药理学技术探讨治伤风颗粒治疗感冒的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和药物靶点信息数据库(DrugBank)检索治伤风颗粒的化学成分及作用靶点;基于GeneCards数据库检索“感冒”的靶点,取药物与疾病靶点交集,应用Cytoscape软件构建“活性成分-靶点-疾病”网络。应用STRING数据库建立蛋白质互作(PPI)网络,应用R软件进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果通过筛选共得到治伤风颗粒有效成分146种,药物靶点280个,疾病靶点1 418个,提取出两者的共同靶点117个。将药物与靶点导入Cytoscape软件,分析得出槲皮素、山奈酚和木犀草素等为中药中度值较高的活性成分,无水咖啡因为西药中度值最高的活性成分。STRING数据库分析得出IL-6、AKT1、INS、VEGFA、MAPK8等属于感冒的关键靶点。GO分析显示生物过程(BP)、细胞组分(CC)和分子功能(MF)3个方面的富集条目。KEGG通路富集分析筛选得出TNF信号通路、IL-17信号通路等20条信号通路,并绘制了“通路-靶点”关系图。结论基于网络药理学分析筛选出了治伤风颗粒治疗感冒的活性成分、作用靶点和通路,初步得出了其作用机制,为该药的深入研究提供了一定的依据。  相似文献   

7.
目的 探讨基于网络药理学的肝积汤活性成分、治疗靶点及分子机制。方法肝积汤的活性成分及作用靶点从TCMSP数据库筛选,肝癌相关靶点从GeneCard数据库获取,运用String数据库对共同靶点做蛋白互作网络分析,GO和KEGG富集分析采用Bioconductor生物信息软件包进行,“成分-靶点-通路”网络图采用Cytoscape制作。结果 从 TCMSP 中获得肝积汤有效活性成分 80种以及249 个药效分子靶点。与检索到的885 个肝癌相关靶点取交集,得到95个共同靶点。蛋白互作网络分析显示有TP53、VEGFA、AKT1等15个核心靶点。GO 功能分析表明,这些靶点主要富集在细胞对化学应激的反应,细胞对氧化应激的反应,对脂多糖反应等;涉及细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶全酶复合物、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶复合物,蛋白络氨酸激酶等,主要涉及DNA结合转录因子结合、RNA聚合酶Ⅱ特异性DNA结合转录因子结合、泛素样蛋白连接酶结合。KEGG 富集分析结果显示,肝积汤作用靶点富集在相关肝癌发生与发展的通路上,如PI3K-Akt信号通路、乙型肝炎病毒信号通路、人巨细胞病毒感染信号通路。结论 槲皮素、木犀草素、山柰酚等可能为肝积汤治疗肝癌的关键成分,TP53、VEGFA、AKT1等为核心靶点,PI3K-Akt、乙型肝炎病毒、人巨细胞病毒感染等通路为主要作用的通路。  相似文献   

8.
目的:通过网络药理学方法探讨抗病毒颗粒治疗甲型流感的潜在作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库平台(TCMSP)检索抗病毒颗粒中9种药物的有效化合物和作用靶点。利用GeneCards、DisgeNet、TTD和DrugBank数据库获取甲型流感相关靶点,找到抗病毒颗粒治疗甲型流感的潜在作用靶点。通过DAVID数据库对关键靶点进行GO和KEGG富集分析。利用STRING和Cytoscape构建中药有效成分-靶点-通路-疾病药理网络并进行可视化展示;进一步构建甲型流感小鼠模型,观察抗病毒颗粒对肺组织病理和小鼠血清白细胞介素-2(IL-2)、IL-10、IL-1β、IL-6水平的影响。结果:筛选得到抗病毒颗粒活性成分74种,作用靶点260个,甲型流感相关靶点1 379个,其中包括IL-1β、IL-6、肿瘤坏死因子(TNF)、IL-10等药物与疾病共同关键靶点30个;获得GO生物过程366条(P<0.05)和KEGG富集信号通路136条,涉及IL-17信号通路、TNF信号通路、Th17信号通路等。体内实验发现,阳性药组(奥司他韦)和抗病毒颗粒组均可显著缓解甲型流感小鼠肺组织损伤程度,能够升高IL-2、IL-10表达水平,抑制IL-1β、IL-6的表达。结论:抗病毒颗粒可以抑制甲型流感小鼠机体过激的免疫炎症反应,其作用机制可能与调控IL-17、TNF、Th17等信号通路有关。  相似文献   

9.
目的探讨桂枝茯苓丸治疗宫颈癌的有效活性成分及作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)选取桂枝茯苓丸中各药物的化学成分,筛选活性成分及潜在靶点。通过Gene Cards数据库挖掘宫颈癌的疾病靶点,依据药物靶点与疾病靶点构建桂枝茯苓丸有效成分靶点与疾病靶点的韦恩图、化合物-靶点网络调控图、PPI网络图,同时进行GO富集分析及KEGG通路富集分析。结果桂枝茯苓丸中共494个化合物,筛选出85个活性化合物,对应宫颈癌83个靶点,分析数据表明,桂枝茯苓丸治疗宫颈癌的核心有效活性成分依次为槲皮素、β谷甾醇、山奈酚、黄芩苷、红景天苷、豆甾醇、谷甾醇等,其治疗宫颈癌的核心靶点依次为PGR、NCOA2、PTGS1、CHRM1、NR3C2等;依据CS值发现的关键节点涉及IL-6、EGFR、MAPK8、CASP3、VEGF、MYC等;主要涉及反应依次为对酮的反应、类固醇激素的反应、细胞对化学应激的反应等;细胞过程主要涉及的部分依次为膜筏、膜微区、膜区、核染色质等;分子过程主要涉及的反应依次为DNA结合转录因子结合、RNA聚合酶Ⅱ特异性DNA结合转录因子结合、DNA结合转录激活物活性等;主要涉及关键信号通路依次为糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、PI3K-Akt、MAPK等。结论桂枝茯苓丸可通过多靶点途径发挥治疗宫颈癌的作用,其治疗机制与调控核心相关蛋白、基因及信号通路密切相关,为基础研究提供参考。  相似文献   

10.
目的:探讨坤泰胶囊治疗卵巢早衰的主要活性成分、核心靶点、相关通路等药理学作用机制。方法:用TCMSP与BATMAN-TCM两大数据库获取药物成分及对应靶点,在Uniprot数据库中进行靶点蛋白名称的标准化处理;用GeneCards与OMIM两大数据库获取疾病靶点;用Venny 2.1.0平台获得药物与疾病的交集靶点;用Cytoscape3.8.0对“药物-活性成分-相关靶点”与“蛋白与蛋白相互作用(PPI)”进行可视化展示;用DAVID数据库获得GO富集分析及KEGG通路分析相关数据,用Bioinformatics平台进行可视化展示;最后,用Autodock tools与Autodock Vina两大软件对核心药物活性成分与核心靶点进行分子对接验证,使用Pymol软件对对接结果进行可视化展示。结果:最终得到坤泰胶囊的药物成分80个、潜在靶点蛋白219个,卵巢早衰相关靶点2497个;GO富集分析共得到1012个条目,KEGG通路分析共检索到169条通路;分子对接结果表明,主要药物活性成分能与核心靶点蛋白稳定的结合。结论:坤泰胶囊通过槲皮素、β-谷固醇、山萘酚等药物成分作用于TP53、AK...  相似文献   

11.
目的 基于网络药理学探讨小柴胡汤治疗胃食管反流病(GERD)合并失眠的潜在作用机制。方法 通过在线数据库筛选小柴胡汤的活性成分、药物靶点以及GERD和失眠的疾病靶点;取药物靶点和疾病靶点的交集,利用STRING数据库分析交集靶点的相互作用;通过Cytoscape软件构建和分析“活性成分-靶点”“药物-活性成分-共同靶点-疾病”、蛋白质相互作用(PPI)网络;通过DAVID数据库对交集靶点进行基因本体(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;通过BioGPS对核心靶点进行基因定位,结合Cytoscape构建“成分-靶点-通路-器官/组织”网络;使用AutoDockVina进行主要活性成分与核心靶点的分子对接。结果 小柴胡汤治疗GERD合并失眠的主要活性成分包括槲皮素、山奈酚、黄芩素等多种化合物,关键靶点包括丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、白细胞介素-1B(IL-1B)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、肿瘤蛋白53(TP53)等,与RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、炎症应答、信号转导等生物过程相关,涉及的通路包括癌症途径、AGE-RAGE信号...  相似文献   

12.
摘要:目的:应用网络药理学方法及分子对接技术,探讨泽泻发挥抗炎作用的活性成分及其对应靶点和相关通路。方法:通过TCMSP筛选出泽泻的活性成分,运用SwissTarget Prediction 数据库预测活性成分相关靶标,同时采用GeneCards数据库得到炎症相关靶点,再将获得的活性成分靶点和炎症靶点导入VENNY2.1得到药物治疗疾病的潜在靶点;再运用STRING数据库、Cytoscape3.7.1软件构建简化后的药物治疗疾病的靶蛋白互作图(PPI)并筛选关键靶点。利用DAVID数据库对关键靶点进行GO功能富集分析和KEGG信号通路分析,再用Cytoscape3.7.1软件构建“化合物-靶点-通路”图并筛选核心成分与核心靶点。最后运用AutoDock Vina和Pymol将核心成分与核心靶点进行分子对接。结果:获得10个药物活性成分,得到相关潜在靶点284个,疾病潜在靶点11414个,药物治疗疾病的相关靶点260个,有SRC、HSP90AA1、PIK3CA、MAPK1、AKT1、LCK、FYN、JAK1、PLCG1、JAK1等关键靶点58个;涉及PI3K-Akt信号通路、ErbB信号通路、FoxO信号通路等133条通路。结论:泽泻发挥抗炎的作用机制可能是一方面通过调控PIK3、AKT、m-TOR等相关蛋白,激活PI3K-Akt信号通路,从而抑制细胞凋亡;另一方面可能通过调控EGFR相关蛋白,介导ErbB信号通路,从而干预炎症细胞生长。本研究基于网络药理学方法和分子对接技术,阐释了泽泻通过多种成分、多靶点、多信号通路发挥抗炎作用与机制,为该药的进一步研究提供了有益参考和科学依据。  相似文献   

13.
目的利用网络药理学方法探索桃红四物汤治疗股骨头坏死的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、GeneCards、OMIM、Drugbank数据库获取桃红四物汤治疗股骨头坏死活性成分与靶点,构建活性成分-靶点互作网络,绘制蛋白互作(PPI)网络并进行分子对接,最后行GO富集和KEGG通路富集分析。结果从桃红四物汤中筛选出活性成分69个,作用于股骨头坏死的主要活性成分为槲皮素、山奈酚、木犀草素;关键靶点为血管内皮生长因子(VEGF)、白细胞介素-6(IL-6)及成骨细胞特异性转录因子2(Runx2)。分子对接服务器分析发现,桃红四物汤的活性成分与关键靶点能够紧密结合。GO富集分析显示,分子功能主要包括转录因子结合、类固醇激素受体活性、蛋白激酶结合等方面。生物过程主要涉及到细胞因子介导的信号通路、对类固醇激素的反应及细胞凋亡信号通路等生物学过程,细胞组成主要包括核转录因子复合体、蛋白激酶复合体、蛋白质-DNA复合物等。KEGG富集分析获取相关信号通路为VEGF、Janus激酶/信号转导与转录激活子(JAK/STAT)及核转录因子-kappa B(NF-κB)信号通路。结论桃红四物汤治疗股骨头坏死的作用机制在于应用槲皮素、山奈酚、木犀草素等活性成分,以VEGF、IL-6及Runx2为靶点,通过VEGF、JAK/STAT及NF-κB信号通路参与治疗股骨头坏死。  相似文献   

14.
目的:研究并验证槲皮素治疗脊髓损伤(SCI)的疗效及可能的作用机制。方法:通过网络药理学方法,检索中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)数据库、GeneCards、DisGeNET数据库及OMIM数据库,筛选槲皮素治疗SCI的相关靶点,构建Venn图,得到槲皮素-SCI关键靶点,进一步将关键靶点基因输入STRING数据库,构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)。将关键靶基因输入Metascape数据库进行GO及KEGG富集分析。使用AutodockTools软件进行分子对接。最后通过体外细胞试验进行验证。结果:通过筛选,共得到259个槲皮素-SCI关键靶点;通过度值、中介中心度及接近中心度值筛选,最终纳入了槲皮素作用于SCI的关键靶基因10个,分别为AKT1、VEGFA及TP53等基因。槲皮素可以与靶点蛋白AKT1、VEGFA和TP53自发结合。GO生物学过程分析结果表明,槲皮素可能通过凋亡信号通路参与治疗SCI。体外细胞试验结果表明,槲皮素通过抑制细胞凋亡增加双氧水(H2O2)处理的PCP12细胞的细胞活力。结论:槲皮素可能通过抑制细胞凋亡治疗SCI,提示槲皮素对治疗SCI可能有一定的应用前景。  相似文献   

15.
目的 利用网络药理学方法探讨清胃散治疗牙周炎的机制。方法 通过数据库和文献检索筛选清胃散的活性成分及靶点、牙周炎相关疾病靶点,利用STRING 数据库构建靶点互作用网络,利用Cytoscape 3.8.1软件构建成分-靶点-疾病网络,利用Bioconductor软件包进行关键靶点的基因本体论(Gene Ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。结果 检索得到25个活性成分及其113个关键靶点;GO功能富集分析得到包括DNA结合转录激活因子、RNA聚合酶Ⅱ、细胞因子受体结合、受体配体活性、泛素样蛋白连接酶结合等在内的129个分子功能条目;KEGG 通路富集分析得到,包括晚期糖基化终产物及其受体(advanced glycation end products/receptor for advanced glycation end products, AGE/RAGE)信号通路、流体剪切应力和动脉粥样硬化、TNF信号通路、IL-17信号通路、凋亡在内的150条信号通路。结论 清胃散治疗牙周炎的机制具有多靶点、多通路的特点,其中与炎症反应、细胞凋亡最为密切。  相似文献   

16.
基于网络药理学技术探讨三七治疗骨关节炎(Osteoarthritiis,OA)的主要有效物质,并探讨三七治疗OA的潜在作用机制。方法:使用TCMSP、HIT以及PubChem数据库检索三七的有效活性成分及靶点;使用TTD和GeneCards数据库构建OA靶点。使用DAVID数据库对三七-OA靶点进行GO和KEGG通路富集分析,使用STRING构建蛋白蛋白网络(PPI),使用Cytoscape3.7.1软件构建三七-活性成分-靶点-疾病网络图,并根据自由度找出关键基因。结果:从三七中共筛选出8个有效成分,与OA共同作用靶点88个,其中最主要的三个活性成分为β-谷甾醇、人参皂苷Rh2以及槲皮素。GO富集结果表明三七治疗OA主要涉及炎症反应、衰老、缺氧等生物学过程;KEGG分析显示三七治疗OA主要通过TNF信号通路、衰老以及Toll样受体相关通路等;前3位关键基因分别为IL6、TNF、AKT1。结论:本研究利用网络药理学的方法,初步揭示了三七对于OA的主要活性成分、治疗靶点及相关信号通路,为进一步深入研究其作用机制提供了参考。  相似文献   

17.
目的 探讨罗布麻的抗衰老作用机制。方法 利用网络药理学预测罗布麻抗衰老相关的活性成分、作用靶点、分子功能、信号通路;利用衰老小鼠模型对罗布麻的抗衰老作用及其关键靶点进行验证。结果 网络药理学预测得到罗布麻抗衰老相关的9个活性成分、85个关键靶点、116个分子功能和163条信号通路;动物模型验证了罗布麻减轻D-半乳糖导致的小鼠衰老表型,下调p53的表达。结论 罗布麻含有多种活性成分,可通过调控p53等靶点发挥其抗衰老作用。  相似文献   

18.
目的:基于网络药理学方法探讨健脾益肾化浊方治疗多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome, PCOS)的有效成分及可能作用机制。方法:通过TCMSP数据库检索健脾益肾化浊方组成药物的活性成分,筛选有明确作用靶点的活性成分和作用靶点;通过Uniport数据库检索靶点信息,将各中药活性成分作用靶点转化成相对应的基因名称,并通过Cytoscape3.9.0软件构建活性成分网络图、中药-活性成分-基因靶点网络图;检索Gene Cards疾病数据库中PCOS相关靶点;制作健脾益肾化浊方活性成分靶基因和PCOS相关靶点韦恩图,筛选交集基因,通过String数据库构建蛋白相互作用网络(PPI);最后利用Meta scape数据库进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,用微生信作图。结果:筛选出健脾益肾化浊方活性成分94种,对应靶基因254个,PCOS疾病靶点1297个,两者交集靶点116个;其中MAPK1、MAPK3、AKT1、TP53、TNF、MAPK14、IL6、ESR1、EGRF、RB1可能是健脾益肾化浊方治疗PCOS的主要靶点。结论:健脾益肾化浊方的活性成分、关键...  相似文献   

19.
目的:采用UPLC-Q-TOF-MS/MS技术分析、鉴定甘麦大枣汤的主要化学成分,并在此基础上通过网络药理学及动物实验进一步对甘麦大枣汤抗抑郁的作用机制进行探讨。方法:根据采集到的质谱数据,通过PubChem数据库结合相关参考文献进行化学成分的鉴定。将鉴定出的化学成分输入SwissADME数据库,根据Pharmacokinetics、Druglikeness进行筛选。利用SuperPred和SwissTargetPrediction数据库预测筛选成分的相关靶点,同时在GeneCards、DrugBank等数据库搜索抑郁症相关疾病靶点。利用STRING数据库构建“成分-靶点”及PPI蛋白互作网络,筛选药效作用的核心靶点。采用Metascape数据库进行GO功能富集和KEGG通路富集分析。结果:共分析鉴定了95个化合物,包括黄酮类、萜类、有机酸类、氨基酸类以及其他类。进一步筛选了12个关键活性成分,40个活性成分与疾病交集靶点,通过网络拓扑分析获得TNF、SLC6A3、MAOB等16个核心靶点;富集分析发现甘麦大枣汤抗抑郁作用通路有神经营养相关通路、内分泌相关通路、炎症免疫相关通路等;动物...  相似文献   

20.
目的:采用网络药理学及分子对接方法探究赤茵合剂治疗慢性乙型肝炎(CHB)的潜在作用机制。方法:在TCMSP、Pubchem和SwissTargetPrediction在线数据库中筛选出赤茵合剂的有效活性成分和相对应的靶点。通过GeneCards、OMIM、DrugBank、TTD及PharmGkb数据库筛选出CHB的靶点,构建“赤茵合剂-有效成分-潜在靶点-CHB”网络图。利用STRING数据库,构建蛋白质与蛋白质之间的相互作用关系网络(PPI),利用Cytoscape3.7.2进行优化及筛选核心靶点,并进行聚类分析。借助Matescape在线平台数据库,分析潜在靶点的GO功能富集和KEGG通路结果。最后将有效成分与核心靶点进行分子对接。结果:赤茵合剂治疗CHB的活性成分152个,包括槲皮素、毛蕊异黄酮、木犀草素、山柰酚、丹参酮ⅡA、芒柄花黄素等;127个核心靶点,包括TP53、AKT1、PTGS2、TNF、IL6、JUN、STAT3、1L1B等;包含466条生物过程、55条细胞组分、107条分子功能。KEGG通路富集分析结果包含了Hepatitis B信号通路、PI3K-Akt信号通...  相似文献   

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