聚合酶链反应诊断结核性腹膜炎的评价

目的评价聚合酶链反应（ＰＣＲ）方法对结核性腹膜炎的诊断价值。方法用ＰＣＲ技术检测３０例结核腹水中结核分支杆菌ＤＮＡ，并与腹水涂片抗酸染色及酶联免疫吸附试验（ＥＬＩＳＡ）检测腹水中抗ＰＰＤ抗体进行比较。结果ＰＣＲ的阳性率为６０％，特异性９４．４％；ＥＬＩＳＡ法阳性率６３．３％，特异性７２．２％；涂片镜检均为阴性。结论ＰＣＲ在诊断结核性腹膜炎具有较高的敏感性和特异性，优于ＥＬＩＳＡ法及涂片镜检，如与ＥＬＩＳＡ技术结合可进一步提高检测的敏感性和特异性。     

AmpliSensor—聚合酶链反应定量检测肺结核患者外周血结 …

目的 探讨ＡｍｐｌｉＳｅｎｓｏｒ－聚合酶链反应定量检测外周血中结核分支杆菌ＤＮＡ在肺结核的应用价值。方法 采用ＱｌＡａｍｐ和ＡｃｕＰｕｒｅ法提取，制备全血中模板ＴＢ－ＤＮＡ，应用ＡｍｐｌｉＳｅｎｓｏｒ－ＰＣＲ定量检测，并与ＩＳ６１１０－单管巢式聚合酶链反应（ＳＮ－ＰＣＲ）作比较。结果２００例肺结核患者的血液标本中，两种方法测得结核分支杆菌ＤＮＡ的阳性率分别为６０．５％、６３．５％。８５例非结核肺病     

结核性腹膜炎的实验室诊断

目的评价聚合酶链反应（ＰＣＲ）结合Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交技术及酶联免疫吸附试验（ＥＬＩＳＡ）对结核性腹膜炎的诊断价值。方法用ＰＣＲ结合地高辛标记核酸探针Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交技术检测４２例结核性腹水中结核分支杆菌ＤＮＡ，并与常规细菌学检测及ＥＬＩＳＡ对比。引物来自结核分支杆菌特异重复插入序列ＩＳ６１１０。特异性通过杂交及限制性内切酶ＳａｌⅠ酶切证实。同时比较了Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交检测与凝胶电泳检测的敏感性。结果ＰＣＲ的敏感性为６９％，ＥＬＩＳＡ为７１％，培养为９％，涂片镜检均为阴性。并发现杂交较凝胶电泳检测更敏感。结论ＰＣＲ和ＥＬＩＳＡ法对结核性腹膜炎有较高的诊断价值，但前者更具有特异性。将Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交技术与ＰＣＲ技术结合，可进一步提高检测的敏感性和特异性。     

PCR结合索氏转移杂交在结核病诊断中的应用

利用Ｈｅｒｍａｎｓ引物扩增插入序列ＩＳ９８６所得之２４５ｂｐ片断是一结核分支杆菌复合体特异性片断，采用随机引物法将地戈辛标记该片断。将纯化结核分支杆菌ＤＮＡ经聚合酶链反应（ＰＣＲ）扩增，索氏转移后与该探针杂交，检测灵敏度可达１ｆｇＤＮＡ。通过对７９例痰标本、１４例结核性胸腔积液及２６例结核性关节腔积液的ＰＣＲ和ＤＮＡ索氏杂交试验比较，认为采用２４５ｂｐ探针，将ＤＮＡ索氏转移杂交与ＰＣＲ体外扩增相结合，不仅提高了结核病基因诊断的敏感性，同时也提高了诊断的特异性。     

聚合酶链反应－单链构象多态性用于耐利福平结核分支杆菌rpoB基因突变的研究

目的研究结核分支杆菌ｒｐｏＢ基因突变及其与利福平（ＲＦＰ）耐药性的关系。方法以参考菌株结核分支杆菌Ｈ３７Ｒｖ为对照，用聚合酶链反应－单链构象多态性（ＰＣＲ－ＳＳＣＰ）方法分析了４０株结核分支杆菌临床分离株。ＰＣＲ－ＳＳＣＰ方法由ＰＣＲ扩增和扩增产物ＤＮＡ单链多态性分析组成。结果两对引物ＰＣＲ扩增产物分别为４１１和２５８ｂｐ，其敏感性分别为５ｐｇ／μｌ、５００个菌／ｍｌ和１ｐｇ／μｌ、５００个菌／ｍｌ；均为属特异性。４０株结核分支杆菌临床分离株２５８ｂｐ扩增片段ＳＳＣＰ图谱的特点：以参考菌株结核分支杆菌Ｈ３７Ｒｖ为对照，１０株敏感株均无区别；单耐ＲＦＰ或包括ＲＦＰ多种抗结核药３０株，除３株外，其余２７株ＳＳＣＰ图谱有明显的区别；检测阳性率为９０％，特异性为１００％。结论ＰＣＲ－ＳＳＣＰ方法可检测出耐ＲＦＰ结核分支杆菌ｒｐｏＢ基因突变；该基因是ＲＦＰ的药物靶编码基因，它的突变与ＲＦＰ耐药性有密切关系，这有助于结核分支杆菌耐药性的快速检测和研究     

巢式聚合酶链反应检测支气管内膜结核患者活检组织中结核 …

目的 了解巢式聚合酶链反应（ＮＰＣＲ）技术对支气管内膜结核的诊断价值。方法 应用巢式聚合酶链反应（ＮＰＣＲ）对６７份支气管内膜活检组织进行结核分支杆菌ＤＮＡ检测。并与病理检查,刷检涂片,支气管镜检后痰涂片和痰培养结果比较,对照为４３例支气管肺癌患者,结果６７例支气管内膜结核活检组织病理检查,刷检涂片,支气管镜检“激惹”后痰涂片,镜检术后痰培养及ＮＰＣＲ检测阳性率分别为１３％,１９％,２２％,１５％     

结核分支杆菌利福平耐药基因突变的研究

目的了解我国结核分支杆菌耐利福平（ＲＦＰ）分离株ｒｐｏＢ基因突变情况，建立快速检测结核分支杆菌耐药基因型的分子药敏试验方法。方法通过聚合酶链反应－单链构象多态性（ＰＣＲ－ＳＳＣＰ）和ＰＣＲ－直接测序法（ＰＣＲ－ＤＳ）分析５０株结核分支杆菌临床分离株的ｒｐｏＢ基因。结果３株结核分支杆菌药物敏感株和２株非ＲＦＰ耐药株中，仅１株ｒｐｏＢＳＳＣＰ图谱异常的药物敏感株出现５３１位密码子ＴＣＧ→ＴＴＧ突变。４５株ＲＦＰ耐药株中，１０株ＳＳＣＰ和ＤＳ分析均未见ｒｐｏＢ突变，３５株ＳＳＣＰ和ＤＳ分析异常，其中１４株为５３１位密码子ＴＣＧ→ＴＴＧ或ＴＧＧ或ＴＡＣ突变，１４株为５２６位ＣＡＣ→ＴＡＣ或ＧＡＣ或ＣＣＣ或ＣＴＣ或ＧＴＣ突变，２株为５１６位ＧＡＣ→ＧＴＣ或ＴＡＣ突变，２株为５１６位和５２６位及５１５位和５１６位密码子双点突变，３株ｒｐｏＢ序列与结核分支杆菌不同。结论大多数结核分支杆菌耐ＲＦＰ是由于其ｒｐｏＢ基因突变所致，采用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ和ＰＣＲ－ＤＳ方法可快速测定结核分支杆菌ＲＦＰ耐药基因型     

聚合酶链反应－冷单链构象多态性快速检测结核分支杆菌rpoB基因突变

目的评估ｒｐｏＢ基因突变检测在结核分支杆菌利福平耐药性测定中的应用价值。方法采用聚合酶链反应－冷单链构象多态性（ＰＣＲ－冷ＳＳＣＰ）方法对８７株结核分支杆菌临床分离株及有药敏结果的２２份相应肺结核患者痰标本进行分析。结果ＰＣＲ扩增ｒｐｏＢ基因的敏感性为１００ｐｇＤＮＡ及５０００个菌体，属于分支杆菌特异。所有分离菌的ｒｐｏＢ基因ＰＣＲ扩增均为阳性。采用套式ＰＣＲ可使扩增敏感性提高１００倍。与传统药敏试验方法相比，ＰＣＲ－冷ＳＳＣＰ对８７株结核分支杆菌临床分离菌利福平耐药性的检测敏感性和特异性分别为８９．６％及１００％。２２份涂阳培阳痰标本中套式ＰＣＲ扩增阳性的６份均为高度利福平耐药，其ＳＳＣＰ结果也与相应分离株的药物敏感性试验相符。结论ＰＣＲ－冷ＳＳＣＰ检测结核分支杆菌ｒｐｏＢ基因突变快速、简便、易行，适用于结核分支杆菌分离株利福平耐药性的快速测定。如进一步提高引物增特异性及敏感性，该技术可望用于临床标本直接检测     

聚合酶链反应和DNA探针联合检测临床标本中结核杆菌的研究

目的为提高聚合酶链反应（ＰＣＲ）检测未培养临床标本中结核杆菌的敏感性和特异性，方法，首先通过琼脂糖凝胶电泳检测ＰＣＲ扩增产物，然后用Ｓｏｕｔｈｅｒｎ法转移到至膜上，与地高辛标记的人型结核杆菌ＤＮＡ探针杂交。结果ＰＣＲ电泳检测的灵敏度为１ｐｇ而ＤＮＡ探针检测将灵敏度提高到１００ｆｇ。２４种受试菌株中，只有结核分支杆菌复合体和蟾分杆菌有２４５ｂｐ扩增带，其中牛型结核分支杆菌与１８８ｂｐ探针不杂交，对２     

肺癌患者血和组织中结核分支杆菌感染的研究

我们采用巢式聚合酶链反应 (Ｎ ＰＣＲ)和原位ＰＣＲ(ＩＳ ＰＣＲ)检测肺癌患者血和组织中结核分支杆菌ＤＮＡ (ＴＢ ＤＮＡ) ,以探讨结核分支杆菌感染和肺癌的关系。材料与方法　收集经手术切除病理证实的原发性肺癌组织标本 5 5份 (其中新鲜组织 2 3份 ,蜡块 32份 ) ,自身对照组织 2 0份 ,胎肺组织 10份为阴性对照 ,肺结核、冻干卡介苗为阳性对照 ,同时取血标本 ,并进行相关流行病学调查。切取肺组织制成 2～ 3张 7μｍ厚的石蜡切片 ,为避免交叉污染 ,每一蜡块切完后 ,均用 75 %的酒精擦洗切片刀 ,酒精灯烧烤镊子。石蜡包埋组织、新鲜组织…     

Diagnosis of tuberculosis lymphadenitis using a polymerase chain reaction on peripheral blood mononuclear cells

Providing prompt and precise laboratory confirmation of a clinical diagnosis of tuberculous lymphadenitis is difficult given the paucibacillary nature of lymph node specimens. In this study carried out in Karachi, Pakistan, a polymerase chain reaction (PCR) assay aimed at detecting Mycobacterium tuberculosis DNA in peripheral blood mononuclear cells (PBMC-PCR) was standardized and compared with standard M. tuberculosis diagnostic techniques or a lymph node PCR (LN-PCR) for the diagnosis of tuberculosis lymphadenitis. Thirty-seven (77%) specimens from 48 patients with clinical or diagnosis of tuberculosis lymphadenitis were positive by cytology [17/48 (35%) with no acid fast bacilli (AFB) (suggestive), and 20/48 (42%) with AFB (positive) in direct smears], 30 (63%) by PBMC-PCR, 16 (33%) by LN-PCR, and 13 (27%) by culture. All controls were negative, with the exception of one false-positive LN-PCR. These data suggest the PBMC-PCR may be helpful in the diagnosis of tuberculous lymphadenitis.     

结核分枝杆菌IS6110序列在石蜡组织中的检测、克隆与测序

目的：探讨套式-聚合酶链反应（Nested-PCR)检测石蜡组织中结核分枝杆菌的特异性和敏感性。方法：采用套式-PCR检测石蜡包埋组织中结核菌复合体特异插入序列IS6110，并对部分标本的PCR产物进行克隆和测序。结果：31例结核标本石蜡组织检出结核菌DNA共28例，套式-PCR的敏感度为90.3%,特异度为100%。阳性预测值为100%。随机选取两例PCR产物没是序结果与结核菌标准株H37Rv同源性分别为97%和95.3%。结论：套式-PCR检测常规石蜡包埋组织中结核菌IS6110序列具有特异性强和敏感性高的特点，可应用于临床诊断，尤其是对那些常规苏木精-伊红染色和抗酸染色无法确诊的病例更具意义。     

套式聚合酶链反应快速诊断结核性心包炎

快速诊断结核性心包炎以便及早抗痨治疗防止缩窄性心包炎的发生。应用套式聚合酶链反应（Ｎｅｓｔｅｄ－ ＰＣＲ） 、直接涂片、培养对８３ 例心包积液标本进行结核菌检测。结果：结核性心包积液Ｎｅｓｔｅｄ － ＰＣＲ阳性率为７２ ．５ ％ 、培养阳性率为１９ ．６ ％ 、涂片镜检阳性率为２３ ．５ ％ 。非结核性心包积液无１ 例阳性。Ｎｅｓｔｅｄ－ ＰＣＲ特异性好、敏感性强并可能避免一般聚合酶链反应（ＰＣＲ） 所出现的假阳性     

Simultaneous use of two PCR systems targeting IS6110 and MPB64 for confirmation of diagnosis of tuberculous lymphadenitis

PCR has emerged as a powerful technique for detection of various pathogens including Mycobacterium tuberculosis. In present study, eighty one samples of lymph node biopsies from clinically suspected cases of tuberculous lymphadenitis were examined for AFB, culture on L?wenstein Jensen medium and simultaneous use of two PCRs targeting IS6110 and MPB64. Positivity with M. tuberculosis culture and AFB was 13.6% and 28.4% respectively. All samples culture positive for nontuberculous mycobacteria were negative by both PCR systems. Higher proportion of positive results were observed with PCR targeting IS6110 by which 56 of 81 (69.1%) samples showed positive results as compared to PCR targeting MPB64 by which 39 of 81 (48.2 %) samples showed positive results. When combined, 63 out of 81 (77.8%) samples were detected positive for M. tuberculosis DNA. However, 7/81 (8.6 %) samples remained negative by IS6110 but positive by MPB64 method. Thus our data suggest that the use of one additional PCR (other than IS6110 system) can reduce false negativity of PCR results in the samples harboring zero copy of IS6110 element which is known to exist in Indian population.     

Diagnosis of tuberculous lymphadenitis using fine needle aspiration biopsy

Background: Tuberculous lymphadenitis is the commonest form of extrapulmonary tuberculosis. However, the optimal approach to diagnosis, employing biopsy by either fine needle aspiration (FNA) or surgical excision, remains uncertain. Aims: To evaluate the diagnostic value of biopsy using each of the component diagnostic modalities of FNA (microscopy, cytology and culture), and compare these with excision biopsy in the diagnosis of tuberculous lymphadenitis in a predominantly migrant population in Melbourne. Methods: A retrospective examination of tuberculous lymphadenitis cases presenting to Western Health over 12 years was conducted. Using a reference method of positive culture of Mycobacterium tuberculosis, the diagnostic sensitivities of each modality employed in FNA were determined. Results: Forty‐two subjects having FNA and 30 having excision biopsy as the initial investigation were compared. Among specimens obtained by FNA, sensitivity of microscopy was 18% (95% confidence interval (CI): 5–40%) and sensitivity of cytology was 38% (95% CI: 20–59%). For specimens obtained by excision biopsies, sensitivities for microscopy and histology were 17% (95% CI: 2–32%) and 96% (95% CI: 88–100%) respectively. Sensitivity of culture performed on FNA specimens was 86% (95% CI: 65–97%). Conclusions: Given the relatively high sensitivity of mycobacterial cultures from FNA, this study supports its routine use as the initial investigation in most patients with suspected tuberculous lymphadenitis. Microscopy and cytology add relatively little to the clinical utility of FNA.     

4种检测脑脊液结核分枝杆菌法对结核性脑膜炎诊断价值的探讨

目的探讨脑脊液抗酸杆菌涂片、3D、PhaB和PCR检测对结脑的诊断价值。方法检测60例结脑和30例非结脑患者脑脊液涂片、3D、PhaB和PCR阳性率,经统计学处理后,评价4种方法对结脑诊断的灵敏度、特异度。结果结脑组和其他组脑脊液涂片阳性率均为0,3D阳性率分别为23.3%和0,PhaB的阳性率分别是23.3%和26.7%,PCR的阳性率分别是6%和0,4种方法差异无统计学意义。脑脊液3D灵敏度为23.3%,特异度为100%,PhaB灵敏度为23.3%,特异度为73.3%,PCR的灵敏度10%,特异度为100%。结论脑脊液结核分枝杆菌涂片、3D、PhaB和PCR4种检测方法灵敏度低,积极寻找脑脊液结核分枝杆菌的检测方法和提高阳性率是实验室亟需解决的问题。     

高通量测定技术检测结核分枝杆菌耐利福平的研究

目的 基于焦磷酸测序(pyrosequencing)技术，建立耐利福平结核分枝杆菌快速检测方法，并探讨其临床应用价值。方法 设计一对聚合酶链反应(PCR)引物，其中一引物经生物素化修饰，PCR扩增含耐药决定区一297bp长的rpoB基因片段，借用链亲和素包被磁珠纯化单链PCR产物。设计2个正向测序引物，运用pyrosequencing技术对耐药决定区进行序列测定。通过对一系列10倍稀释的结核分枝杆菌H37Rv标准株DNA进行分析，评价所建立方法的检测敏感性。通过对已知耐药表型的结核分枝杆菌临床分离株进行分析，评价所建立方法的检测特异性。结果：PCR扩增后，可在2h内得到耐药决定区序列。所建立方法的检测灵敏度为50fg DNA／反应。在所分析的利福平敏感株中均未检测到耐药决定区突变，而在耐利福平菌株中均检测到耐药决定区突变。结论 所建立的方法具有自动化程度高和结果准确等特点，适用于对耐利福平结核分枝杆菌进行快速高通量检测。     

Amplisensor-聚合酶反应定量检测脑脊液中结核分支杆菌DNA的研究

目的　探讨Amplisensor-聚合酶反应 (Amplisensor-PCR)定量检测脑脊液中结核分支杆菌DNA(TB-DNA)对结核性脑膜炎的诊断价值。方法 采用Amplisensor-PCR对117例结核性脑膜炎患者及36例非结核性脑膜炎患者的脑脊液标本进行检测,并与PCR(凝胶电泳后,经溴化乙锭染色)、涂片、培养法比较。结果 Amplisensor-PCR的敏感性显著高于涂片及培养,阳性率分别为57.13%、1.7%、6.7% (P＜0.001)。结论 Amplisensor-PCR可以通过标准曲线划定检出下限,并可换算出标本中原始的靶DNA值,同时具有较高的特异性和敏感性,对结核性脑膜炎的诊断有一定的临床意义。