TBX5 基因靶序列单核苷酸多态性 与先天性心脏病的关系

目的 探讨TBX5 基因3'' 非翻译区靶序列SNPs 与先天性心脏病（CHD）遗传易感性的关系, 为CHD 的分子机制研究提供线索。方法 利用HaploView 软件筛选TBX5 基因3'' 非翻译区功能性单核苷酸 多态性（SNP）,并应用高分辨率熔解曲线检测TBX5 基因3'' 非翻译区SNP。采用病例对照研究分析SNP 位 点与CHD 的关联。结果 HaploView 软件筛选出TBX5 基因3'' 非翻译区有意义的标签SNP rs883079,高分 辨率熔解曲线法成功检测该SNP位点（rs883079）的G/G、G/A及A/A 3种基因型。TBX5 基因rs883079（ G>A） 位点等位基因或基因型分布频率比较,差异有统计学意义（P <0.05）;与CHD 易感性关联,A 是CHD 的危 险等位基因,A/A 为CHD 的危险基因型（P <0.05）。结论 TBX5 基因rs883079 位点SNP 与CHD 有关系, rs883079（G>A）携带突变纯合子基因型A/A 个体患CHD 的危险性升高。     

HMGB1基因SNP位点实时荧光PCR检测方法的建立

目的建立基于Taq Man探针实时荧光PCR技术的高迁移率族蛋白1(high mobility group box-1 protein,HMGB1)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)检测方法。方法收集2014年4月在深圳口岸医院体检的健康人群样本20份,选择HMGB1基因上的2个SNP位点设计常规PCR和实时荧光PCR扩增引物和Taq Man探针,采用基因测序和实时荧光PCR方法对样本进行SNP分型。结果实时荧光PCR方法SNP分型结果显示,在20份样本中的HMGB1基因rs1412125位点检测到TT基因型11例,CC基因型1例,TC基因型8例;HMGB1基因rs3742305位点检测到GG基因型15例,GC基因型5例,未发现CC基因型。这一结果与基因测序方法结论完全一致。结论基于Taq Man探针技术的实时荧光PCR方法进行HMGB1基因SNP分型简单、快速、高效,可用于人群大规模样本的SNP筛查,具有广泛应用的价值。     

分子信标实时PCR检测瘢痕相关p53基因SNP方法的建立

目的建立分子信标实时PCR检测病理性瘢痕相关p53基因第72密码子单核苷酸多态性的新方法。方法采集瘢痕疙瘩患者外周血28例,提取DNA并用分子信标PCR检测p53基因多态性。设计一对p53基因第72密码子单核苷酸多态性荧光分子信标探针,荧光定量PCR检测该位点单核苷酸(SNP),并与反向斑点杂交法,DNA直接测序等方法比较。结果定量荧光PCR荧光分子信标检测的结果与测序结果吻合率达到100%,高于反向斑点杂交法且简便快捷。结论分子信标实时PCR检测技术适合临床p53基因第72密码子单核苷酸多态性快速诊断。     

ABCG2基因单核苷酸多态性研究进展

ABCG2是一种ATP结合转运蛋白,在人的正常细胞和肿瘤组织中均有表达,具有抑制消化道吸收某些外源性物质,参与形成血脑、胎血屏障等生理功能。同时ABCG2也是新的药物排出泵,是肿瘤多药耐药的重要机制之一。ABCG2基因的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）可能影响ABCG2蛋白的表达与功能,与疾病的易感性及药动学等相关。ABCG2单核苷酸多态性的研究成为新的研究热点,本文就近年来国内外关于ABCG2基因SNP的研究进行综述。     

单核苷酸多态性的研究进展

单核苷酸多态性（ＳＮＰ）是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的一种ＤＮＡ序列多态性。ＳＮＰ现象在人类基因组中广泛存在,并具有很高的信息含量。目前已发现数万个ＳＮＰ标记,且有多个生物医学网站开辟了专页对其加以介绍。随着对ＳＮＰ检测和分析技术进一步发展,尤其是与ＤＮＡ芯片等技术的结合,它已成为第三代遗传标记,初步满足对疾病相关基因定位研究的需要,尤其是对多基因遗传病高精度基因定位的要求,并将最终     

C反应蛋白基因单核苷酸多态性与脓毒症易感性及其严重程度的关系

【】目的：研究C反应蛋白(CRP)基因rs1205位点(+1846 C>T)和rs3093062位点(?409G > A)单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)与脓毒症易感性及其严重程度的关系。方法：采用直接测序法检测125例脓毒症患者和125例健康对照组CRP基因rs1205位点和rs3093062位点基因型,采用酶联免疫吸附法(ELISA)检测受试者血清CRP蛋白水平。结果：CRP基因rs1205位点TT基因型是脓毒症的危险因素(OR=3.02,95%CI=1.18-7.87,P=0.01)。CRP基因rs3093062位点GA和AA基因型是脓毒症的危险因素(OR=2.68,95%CI=1.19-4.83,P<0.01;OR=4.18,95%CI=1.59-11.29,P<0.01)。不同性别、年龄受试者CRP基因rs1205位点和rs3093062位点基因型频率之间的差异没有统计学意义(P>0.05)。CRP基因rs1205位点TT基因型以及rs3093062位点AA基因型患者脓毒症较为严重(P>0.05)。CRP基因rs1205位点和rs3093062位点突变型受试者血清CRP蛋白水平较高,差异有统计学意义(P<0.05)。结论：CRP基因rs1205位点+1846 C>T突变和rs3093062位点?409G > A突变与脓毒症易感性及其严重程度相关。     

CMTM5基因rs723840单核苷酸多态性与阿司匹林治疗下血小板高反应性的相关性研究

目的:探讨趋化素样因子超家族成员5 ( CKLF-like MARVEL transmembrane member 5, CMTM5 )基因rs723840单核苷酸多态性与阿司匹林治疗下血小板高反应性的相关关系. 方法:采用临床单组观察试验研究设计方法,共入选210例北京大学第一医院老年内科住院患者,采用光学比浊法测定0. 5 g/L花生四烯酸( arachidonic acid,AA)诱导的血小板聚集率(platelet aggregation ratio,PR),阿司匹林治疗下血小板高反应性(high on aspirin platelet reactivity,HAPR)定义为PR≥3/4 PR界值. 将入选患者按照PR分为HAPR组和非血小板高反应性组( No-HAPR). 采用焦磷酸测序法测定CMTM5基因rs723840单核苷酸多态性在HAPR组和No-HAPR组的基因型及等位基因分布频率,采用卡方检验统计分析基因型与等位基因在两组间的差异. 结果:CMTM5基因rs723840多态在两组间基因型分布频率皆符合Hardy-Weinberg平衡定律,3种基因型( CC型、CT型和TT型)分布频率在HAPR组和No-HAPR组分别为48. 4%、51. 6%、0. 0%和73. 7%、22. 9%、0. 034%, 3种基因型在两组间分布频率差异存在统计学意义(P=0. 004),C、T等位基因分布频率在两组间差异亦有统计学意义(P=0. 031,OR=2. 002,95% CI:1. 056~3. 793). Logistic回归校正了年龄、性别、体重指数、吸烟、高血压、糖尿病及高脂血症等冠心病易患因素后, CMTM5基因rs723840单核苷酸多态性仍与冠心病患者HAPR的发生存在显著相关性. 结论:CMTM5基因单核苷酸多态位点rs723840与冠心病患者血小板高反应性发生存在显著相关性.     

IL-17基因启动子区单核苷酸多态性与儿童哮喘的关系

目的探讨IL-17基因启动子区单核苷酸多态性（SNP）与儿童哮喘及患儿血清总IgE水平之间的关系。方法提取287例哮喘患儿和217例健康儿童外周血基因组DNA,采用PCR-LDR技术检测了IL-17基因启动子区的4个SNPs位点（rs4711998、rs8193036、rs3819024和rs2275913）,与GenBank公布的IL-17基因序列（NT₀07952.15 GI:224514668）比较,分析其在两组儿童中的基因型及等位基因频率的分布,以及哮喘患儿血清总IgE水平及其在不同基因型中的差异。结果两组rs4711998位点基因型分布差异有统计学意义（P=0.03）,哮喘组GG纯合子基因频率为9.6%,明显高于健康对照儿童组（4.1%）;rs8193036、rs3819024、rs2275913三个SNP位点的基因型分布在两组间差异无统计学意义。哮喘组血清总IgE水平在4个SNP位点基因型间的分布差异均无统计学意义。结论 IL-17基因启动子区SNP rs4711998可能是儿童哮喘易感位点,其中rs4711998 GG纯合子基因型与哮喘发病密切相关。     

候选基因单核苷酸多态性与天津汉族人群甲状腺功能减退症相关性研究

Objective: To explore the relationship between the candidate single nucleotide polymorphism (SNPs) regulating thyroid function and the hypothyroidism(HT) susceptibility of Tianjin Han population, and to search the SNP loci which affecting the thyroid function. Methods: A case-control study was used and a total of 336 HT patients and 328 normal individuals were interviewed with 5 ml venous blood in Tianjin. The 8 SNP loci located in PTC, VAV3, FOXE1, KIT, CCBE1 genes were genotyped with Sequenom MassARRAY Technology. Results: Results of the alleles of gender stratification analysis showed that only rs4915077 in VAV3 gene was associated with HT, P=0.027 in male. However,among female the rs1472565 in VAV3 gene, rs17827152 in KIT gene and rs4940904 in CCBE1 were associated with HT susceptibility, and P values were 0.001, 0.012 and 0.023, respectively. Results of the genotypes of gender stratification analysis showed that only rs17827152 in KIT gene was associated with HT susceptibility, and P value was 0.034 in female. The logistic regression analysis showed that rs4915077 in VAV3 gene was statistically significant (P=0.04), and the partial regression coefficient was -0.544 in male population. In female, only rs17827152 in KIT gene was statistically significant (P=0.011), and the partial regression coefficient was -0.723. Conclusion: Rs4915077 in VAV3 gene is associated with HT susceptibility in Tianjin Han male and rs1472565 in VAV3 gene, rs17827152 in KIT gene and rs4940904 in CCBE1 are associated with HT susceptibility in female population.     

血管紧张素原基因多态性与原发性高血压之间的关系

目的探讨血管紧张素原（AGT）基因T704C单核苷酸多态性与原发性高血压之间的关系，寻找可能与高血压有关的遗传标记。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）的方法检测中国北方汉族人群AGT基因T704C单核苷酸多态性。结果在研究人群中，AGT基因T、C等位基因频率分别为0．63和0．37，其中患原发性高血压病组T、C等位基因频率分别为0．59和0.41。CC基因型组的原发性高血压患病率达50．00％，明显高于TC基因型组（17.02%）和TT基因型组（16.76%）（P〈0．05），此趋势在男性人群中表现更明显（P〈0．01）。突变纯合型（CC）与杂合子（TC）、野生型（TT）相比，SBP和DBP值显著升高（P〈0．01）。结论携带AGT基因突变纯合子CC基因型个体可能有较高的原发性高血压患病倾向，且在男性人群此趋势更加明显。     

KLOTHO的3个SNP位点分布与几种疾病相关性的研究

目的分析汉族人群Klotho基因3个单核苷酸多态性位点（G-395A，F352V，C370S）与几种疾病的相关性。方法选择无亲戚关系的病人161例及正常健康人55例，提取血白细胞基因组DNA，采用等位基因特异性引物PCR技术检测Klotho基因3个SNP位点的基因型，并用SAS统计软件对所得数据进行分析。结果3个位点存在多态性，均出现2种基因型。G-395A与糖尿病有关（P〈0．002）；F352V与高血压和冠状动脉硬化性心脏病有关（分别为：P=0．0120和P〈0．0001）；C370S与冠状动脉硬化性心脏病有关（P〈0．0001）。G-395A多态性中的AA基因型可能易患高血压，GG基因型可能对患冠状动脉硬化性心脏病，糖尿病有保护性作用。F352V多态性中的VV和FF可能是高血压和冠状动脉硬化性心脏病的易患基因型，而FV基因型具有保护作用，VV基因型可能易患糖尿病。C370S基因型中，CC和SS是冠状动脉硬化性心脏病易患基因型，而CS基因型具有保护作用。结论该研究发现在中国汉族人群中，启动子区G-395A多态性中的AA基因型易患高血压，GG基因型可能对患冠状动脉硬化性心脏病，糖尿病有保护性作用。对于编码区的F-352V和C370S多态性，杂合子对患冠状动脉硬化性心脏病有保护作用。     

APE1单核苷酸多态性与肺癌易感性关系的研究

目的探讨中国重庆汉族人群脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1(APE1)基因单核苷酸多态性与肺癌易感性的关系。方法采用病例对照研究,应用相对的两对引物-聚合酶链反应(PCR-CTPP)技术检测455例肺癌患者和443例健康人APE1-141T/G和APE1 148Asp/Glu单核苷酸多态性(SNP)。结果 APE1-141G/G基因型相对于T/T基因型,显著减少了患肺癌的风险(OR=0.62;95%CI为0.42～0.91);单倍体分析中,APE1-141T/148Glu单倍体相对于-141T/148Asp单倍体,显著增加了患肺癌的风险(OR=1.28,95%CI为1.01～1.62)。结论 APE1基因与中国重庆汉族人群肺癌易感性密切相关,APE1-141T/148Glu单倍体可能是肺癌的重要遗传易感因素。     

IFN-γ基因+874位点单核苷酸多态性与卵巢癌易感性的关系

目的：探讨人IFN-γ基因+874位点单核苷酸多态性（SNP）与卵巢癌易感性的关系,为卵巢癌的基因诊断提供依据。方法：采用PCR、克隆和测序技术,检测87例卵巢癌患者(病例组) 及86例正常女性（对照组）IFN-γ基因+874位点的基因型。结果：病例组和对照组基因型频数分布均符合Hardy-Weinberg 遗传平衡定律(P>0.05);病例组IFN-γ基因+874位点AA、AT和TT基因型频数分布与对照组比较差异无显著性(P>0.05);病例组中IFN-γ基因+874位点T等位基因与A等位基因频数分布与对照组比较差异具有显著性(P<0.05),T等位基因患卵巢癌的风险是A等位基因的1.80倍;TT基因型患卵巢癌的风险是AA型的2.99倍;病例组中上皮性卵巢癌与非上皮性卵巢癌之间基因型频数和等位基因频数分布比较差异均无显著性(P>0.05)。结论：IFN-γ基因+874位点T等位基因可能与卵巢癌的发生有关联,TT基因型可能是罹患卵巢癌易感基因型。     

载脂蛋白M基因单核苷酸多态性与慢性阻塞性肺疾病的相关性分析

目的 探讨载脂蛋白M（apoM）基因单核苷酸多态性（SNP）与慢性阻塞性肺疾病（COPD）的相关性,以期为COPD高危人群的筛查、早期诊断及治疗提供依据。方法 采用碱基淬灭探针技术检测分析256例COPD患者（COPD组）和248例健康对照（对照组）的apoM基因rs805264、rs707922及rs707921多态性位点。结果 COPD组和对照组apoM基因rs805264、rs707922及rs707921位点基因型频率分布符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律（P均>0.05）。COPD组rs805264位点的AA纯合子基因型频率低于对照组,GG+GA基因型频率高于对照组,差异有统计学意义（χ²=4.769,P=0.029）;COPD组rs707921位点的AA纯合子基因型频率低于对照组,CC+CA基因型频率高于对照组,差异有统计学意义（χ²=4.769,P=0.029）;两组rs707922位点的基因型频率分布差异无统计学意义（P>0.05）。COPD组和对照组apoM基因rs805264、rs707922及rs707921位点等位基因频率分布差异均无统计学意义（P均>0.05）。rs805264位点与rs707921位点及rs707922位点与rs707921位点呈强连锁不平衡（D''均>0.8,r²均>0.8）,rs805264位点与rs707922位点呈完全连锁不平衡（D''=1.000,r²=0.820）。结论 ApoM基因rs805264和rs707921位点SNP可能与COPD的易感性有关,而rs707922位点SNP可能与COPD无关。     

ABCB1基因位点G2677T／A单核苷酸多态性与氯吡格雷抵抗的相关性研究

目的研究ABCB1基因单核苷酸多态位点G2677T／A在中国汉族人群中的分布及其与氯吡格雷抵抗（elopidogrelresistance,cR）的相关性。方法患者人选后均给予氯吡格雷600mg和阿司匹林300mg负荷量治疗,并在服药前和服药后24h分别测定5vmol／L腺苷二磷酸诱导的血小板聚集率（PAR）,根据2次测定结果计算PAR变化值,PAR变化值小于或等于10％者定义为CR。采用焦磷酸测序法测定ABCB1基因G2677T／A单核苷酸多态位点在CR组和NCR组的基因型及等位基因分布频率。结果ABCB1基因G2677T／A多态性在CR组和NCR组基因型分布频率符合HaZy—Weinberg平衡。在CR组和NCR组中,ABCB1基因G2677T／A基因型频率分布差异无统计学意义（P〉0．05）;两组G、T、A等位基因的分布频率差异也无统计学意义（P〉0．05,OR=0．81—1．31,95％C／=0．38—4．2）。结论ABCB1基因单核苷酸多态位点G2677T／A与冠心病患者CR的发生无相关关系。     

华南地区人群FAS/FASL基因单核苷酸多态性研究

目的 研究细胞表面诱导凋亡因子(FAS)及其配体(FASL)基因启动子区单核苷酸多态(SNP)FAS-1377G/A、FAS-670A/G和FASL-844T/C在华南地区人群中的分布,并比较他们在不同地区人群之间的分布差异.方法 采用聚合酶链式反应-限制性酶切片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测FAS和FASL基因启动子区多态基因型,比较不同人群间等位基因频率分布差异.结果 华南地区人群FAS-1377位G和A等位基因分布频率分别为48.61%、51.39%;FAS-670位A和G等位基因分布频率分别为59.03%、40.97%;FASL-844位T和C等位基因分布频率分别为27.67%、72.33%.3个多态位点基因型分布均符合哈迪-温伯格定律(Hardy-Weinberg).华南地区人群FAS-1377等位基因频率与不同国家及中国不同地区人群差异均有统计学意义,FASL-844等位基因频率与印度、埃及、伊朗和突尼斯人群差异有统计学意义(P<0.05),而FAS-670A/G未发现显著差异.结论 FAS/FASL基因在华南地区人群中存在FAS-1377G/A、FAS-670A/G和FASL-844C/T多态性,其中,FAS-1377 G/A和FASL-844T/C在不同人群中基因分布频率存在显著性差异.     

FAS/FASL基因单核苷酸多态与肿瘤易感性的关系研究进展

肿瘤坏死因子受体超家族6基因(TNFRSF6,又称FAS)及其配体(FASL)在细胞凋亡中具有重要的调节作用.FAS/FASL基因启动子区突变,会导致凋亡通道调节异常,可能促进肿瘤的发生.本文综述FAS/FASL基因单核苷酸多态(SNPs)的分布、功能及其与肿瘤易感性的关系,发现FAS-1377G等位基因在亚洲人群中分布频率低于欧美人群;FAS-670A等位基因在不同人群中的分布频率没有明显差异;而FASL-844C等位基因在不同人群中分布频率有一定差异但没有明显的地区规律性;FAS-1377G/A、FAS-670A/G和FAS-844T/C对不同人群、不同肿瘤易感性结果不一致.这些结果为不同人群和个体之间对肿瘤易感性不同提供了生物学依据.     

IL-18基因启动子单核苷酸多态性与SLE相关性研究

目的研究浙江地区汉族人群SLE患者和健康对照者白细胞介素18(interleukin-18,IL-18)基因启动子多态性分布,探讨其与SLE的相关性。方法用序列特异性引物聚合酶链反应(PCR-sequence specificprimer,PCR-SSP)方法检测46例SLE患者、198健康人群IL-18基因启动子区的–607C/A、-137G/C多态位点,并进行多态性分析。结果 SLE组与健康对照组-607C/A、-137G/C多态性位点的等位基因频率和基因型频率间差异未达到统计学显著的水准(P>0.05)。结论浙江地区汉族人群IL-18基因启动子多态性可能与SLE的易感性无关。     

脂联素基因单核苷酸多态性(SNP276)与新疆地区维吾尔族2型糖尿病相关性研究

目的:研究脂联素基因单核苷酸多态性276G→T与新疆地区维吾尔族人2型糖尿病之间的关系。方法:采用1:1病例—对照研究方法,以聚合酶链式反应—限制性内切酶长度多态性(PCR-RFLP)技术,对120例2型糖尿病患者和120例正常对照者脂联素基因SNP276多态性位点进行基因分型,并通过酶联免疫法对样本血清脂联素水平进行检测。结果:病例组血清脂联素水平为(5.03±3.88)ug/ml,正常对照组为(7.20±5.31)ug/ml;病例组与对照组脂联素水平比较差异有统计学意义(p=0.0000)。SNP276多态性位点的基因型频率在病例组和正常对照组中的分布无显著差异,但等位基因频率在两组中的分布有显著差异(p=0.049),三种基因型血清脂联素水平相比,差异有统计学意义(p=0.0000),TT型明显高于GG及GT型;结论:①脂联素基因SNP276多态性位点与新疆地区维吾尔族人群2型糖尿病相关。②病例组与对照组血清脂联素水平比较差异有统计学意义。③SNP276多态性位点与血清脂联素水平明显相关。     

纳米金检测单核苷酸多态性的应用进展

单核苷酸多态性(single nucleoride polymorphism,SNP)与疾病发生的关系的重要性日益受到重视,探讨SNP与各种疾病发生的相关性研究已见于大量报道。传统的检测SNP的方法操作复杂,费时费力,假阳性高,新的SNP检测方法不断出现并应用。纳米金法是目前较为成熟的检测技术,文中介绍几种常见的SNP检测方法。