江苏徐州地区 1 954 例慢性乙型肝炎患者血清 HBV 耐药突变分析

目的：探讨江苏徐州地区HBV耐药基因突变分布特征及在评价抗病毒药物疗效中的作用。方法：2010年8月至2013年5月在徐州医学院附属医院就诊的门诊及住院慢性乙型肝炎（CHB）患者血清标本共1954份,采用核酸扩增技术结合荧光标记探针杂交方法检测血清HBVDNA,通过测序分析进行耐药突变的检测。结果：1954份标本共检测到病毒变异1079例,无变异875例,变异率55．22％。检测到变异频次2114例次,其中同一个位点变异≥5例的例次共有2036例次。变异率较高的位点有204位点（25．75％）、180位点（17．71％）、181位点（11．62％）,其中2044-180位突变335例次（17．14％）。拉米夫定相关变异1411例次（72．21％）,阿德福韦酯相关变异873例次（44．68％）,替比夫定耐药相关的204位点I变异294例次（15．05％）,恩替卡韦耐药必需的180M＋204V或者180M4-204V／I共204例次（10．44％）。未检出替诺福韦酯主要耐药位点rtA194T。结论：拉米夫定、阿德福韦酯耐药变异率相对较高,替比夫定、恩替卡韦经典耐药发生率相对较低,尚未发现替诺福韦酯耐药。     

应用线性探针分析快速检测耐利福平结核分支杆菌的rpoB基因突变

目的：检测上海地区耐利福平结核分支杆菌的rpoB基因突变,评估线性探针分析（LiPA)法快速检测突变位点的意义。方法：对58株结核分支杆菌rpoB基因片段进行PCR扩增及DNA测序,从中选取18株耐药株和10株敏感株并应用LiPA法检测其突变位点,结果：LiPA法准确地检测出18株耐药株中17株的rpoB基因突变,10株敏感株均无突变;LiPA法检测耐药菌的敏感性为94．4％,与药敏结果的符合率为96．4％,结论：LiPA法可用于耐利福平结核分支杆菌rpoB基因的快速检测,而且具有较高的敏感性。     

乙肝病毒核苷类似物耐药位点分析

目的:建立巢式PCR结合测序检测乙型肝炎病毒(HBV)耐药位点的方法,确定患者的HBV基因型和耐药突变情况。方法:采用特异性引物进行巢式PCR扩增HBV DNA,产物测序后,利用MEGA 3.1对测序结果进行分析判断有无耐药突变的产生。结果:100例乙肝病毒载量阳性患者共检出48例有耐药突变,其中概率最高的是rt204位点的YVDD 15例、YIDD 13例;拉米夫定组的耐药概率明显高于对照组;耐药组的ALT和HBV DNA水平明显高于非耐药组。结论:传统的核苷类似物如拉米夫定会产生耐药,耐药一旦发生肝功能和HBV DNA会明显升高,巢式PCR结合测序法可对患者体内的HBV耐药突变位点进行有效检测,有利于指导临床用药。     

反向杂交法检测乙型肝炎病毒3种核苷(酸)类似物耐药突变

目的 建立一种同时检测HBV 3种核苷(酸)类似物耐药突变的方法.方法 以基因库公布的981条HBV基因序列为基础,设计2对地高辛标记的通用引物,扩增HBV聚合酶的逆转录区.针对拉米夫定、阿德福韦和恩替卡韦10个耐药位点上的氨基酸替换形式,设计26条特异性寡核苷酸探针,包括I169T,V173L/G,L180M,A181T/V,T184G,S202I/G,M204V/I,Q215S,N236T,M250V/I/L,并固定于带正电荷的尼龙膜上.利用地高辛标记的靶DNA扩增产物与固定于膜上的特异性探针的反向杂交,检测HBV 3种核苷(酸)类似物的耐药突变.应用反向杂交法分别检测HBV野生和耐药标准株,以及40例患者血清标本,观察其检测特异性和准确性.结果 反向杂交法检测HBV野生和耐药标准株,有效地区分了1169T,V173L,L180M,A1811T,T184G,S202I,M204V,Q215S,N236T,M250V 10个耐药位点上的特异性探针.40例患者血清标本中,37例临床病例的耐药检测结果 与直接测序法一致.结论 反向杂交法可以快速,准确的检测出HBV3种核苷类似物耐药突变,有助于这3种药物耐药的诊断和个体化治疗.     

反向杂交法检测乙型肝炎病毒3种核苷(酸)类似物耐药突变

目的 建立一种同时检测HBV 3种核苷(酸)类似物耐药突变的方法.方法 以基因库公布的981条HBV基因序列为基础,设计2对地高辛标记的通用引物,扩增HBV聚合酶的逆转录区.针对拉米夫定、阿德福韦和恩替卡韦10个耐药位点上的氨基酸替换形式,设计26条特异性寡核苷酸探针,包括I169T,V173L/G,L180M,A181T/V,T184G,S202I/G,M204V/I,Q215S,N236T,M250V/I/L,并固定于带正电荷的尼龙膜上.利用地高辛标记的靶DNA扩增产物与固定于膜上的特异性探针的反向杂交,检测HBV 3种核苷(酸)类似物的耐药突变.应用反向杂交法分别检测HBV野生和耐药标准株,以及40例患者血清标本,观察其检测特异性和准确性.结果 反向杂交法检测HBV野生和耐药标准株,有效地区分了1169T,V173L,L180M,A1811T,T184G,S202I,M204V,Q215S,N236T,M250V 10个耐药位点上的特异性探针.40例患者血清标本中,37例临床病例的耐药检测结果 与直接测序法一致.结论 反向杂交法可以快速,准确的检测出HBV3种核苷类似物耐药突变,有助于这3种药物耐药的诊断和个体化治疗.     

反向杂交法检测乙型肝炎病毒3种核苷(酸)类似物耐药突变

目的 建立一种同时检测HBV 3种核苷(酸)类似物耐药突变的方法.方法 以基因库公布的981条HBV基因序列为基础,设计2对地高辛标记的通用引物,扩增HBV聚合酶的逆转录区.针对拉米夫定、阿德福韦和恩替卡韦10个耐药位点上的氨基酸替换形式,设计26条特异性寡核苷酸探针,包括I169T,V173L/G,L180M,A181T/V,T184G,S202I/G,M204V/I,Q215S,N236T,M250V/I/L,并固定于带正电荷的尼龙膜上.利用地高辛标记的靶DNA扩增产物与固定于膜上的特异性探针的反向杂交,检测HBV 3种核苷(酸)类似物的耐药突变.应用反向杂交法分别检测HBV野生和耐药标准株,以及40例患者血清标本,观察其检测特异性和准确性.结果 反向杂交法检测HBV野生和耐药标准株,有效地区分了1169T,V173L,L180M,A1811T,T184G,S202I,M204V,Q215S,N236T,M250V 10个耐药位点上的特异性探针.40例患者血清标本中,37例临床病例的耐药检测结果 与直接测序法一致.结论 反向杂交法可以快速,准确的检测出HBV3种核苷类似物耐药突变,有助于这3种药物耐药的诊断和个体化治疗.     

1例多药耐药慢性乙型肝炎患者乙型肝炎病毒基因突变的5年动态分析

目的 动态检测乙型肝炎患者HBV逆转录酶基因和前C及基本核心启动子(BCP)区基因突变,分析基因突变与核苷(酸)类似物耐药、HBeAg阴转的关系.方法 收集1例在我院14次住院治疗患者血清18份,提取DNA,采用巢式PCR法扩增HBV靶基因片段,对PCR产物进行DNA双向测序,NTI软件对比分析结果,分析逆转录酶基因12个耐药位点和前C/BCP区6个位点上的突变情况,结合临床资料解析突变意义.结果 先后检测到了引起拉米夫定耐药的M204I/V共生突变、L180M+M204V突变,引起恩替卡韦耐药的S202G突变,以及引起HBeAg阴转的G1896A突变,检测结果与临床病情发展情况符合.结论 采用DNA序列测定方法可以全面了解HBV基因突变,有助于临床监测病情发展,合理进行抗病毒治疗.     

联合检测HBV前S1抗原和核心抗原的临床意义

探讨联合检测血清HBV前s1抗原（preSl）和核心抗原（HBcAg）（均为HBV核酸相关抗原，nucleic acids related antigen，HBV NRAg）的意义及临床价值。方法：采用ELISA法对393份HBsAg、HBV DNA双阳性的血清和612份HBsAg阴性血清进行HBV NRAg检测，所有标本均采用多区段巢式PCR确认阳性、阴性，采用荧光定量PCR法进行HBV DNA定量分析。结果：393份HBsAg、HBV DNA双阳性血清中，HBV NRAg阳性为382份，其阳性率为97．2％；612份HBsAg阴性的血清标本中，609份确认为HBV DNA阴性，其中检出2份HBV NRAg阳性，607份为阴性，其HBV NRAg的阴性率为99．7％（607／609），另3份HBsAg阴性血清HBV DNA阳性者，其HBV NRAg均为阳性。结论：联合检测preSl和HBcAg的HBV NRAg可作为临床HBV感染的筛选及判断HBV复制的有意义的补充项目。     

快速方法检测耐利福平结核分枝杆菌基因突变的研究

目的建立快速诊断结核杆菌利福平（RFP）耐药的方法，探讨其临床应用价值。方法设计5条覆盖rpoB基因热点突变区域的MGB探针，结合实时PCR方法检测结核杆菌rpoB基因的点突变。结果50株临床分离结核杆菌菌株中，12株RFP耐药株，38株敏感株。双探针实时PCR方法检测结核杆菌13株检出rpoB基因突变，突变率占26％。531位点单突变11株，526位点单突变1株，531、526双位点联合突变1株。12株耐药株均检出rpoB基因突变。结论双探针实时PCR技术能快速、准确地检测结核杆菌rpoB基因位点的突变，可用于临床对结核杆菌RFP耐药的快速诊断。     

焦磷酸测序技术检测乙型肝炎病毒多个基因型耐药突变方法的建立及初步评价

目的建立焦磷酸测序(Pyrosequencing,PyroS)法检测HBV反转录酶基因区(rt区)与核苷(酸)类似物(NAs)耐药相关基因突变的检测方法。方法针对HBVDNArt区10个已知常见耐药突变位点的12种突变形式,分别构建野生型和突变型质粒作为标准品;设计通用PCR扩增引物和针对不同突变位点的焦磷酸测序引物,建立基于PyroS技术的HBV耐药突变检测方法。分别采用传统的双脱氧测序法和我们构建的PyroS法对接受/未接受NAs治疗的慢性乙型肝炎患者95份血清标本进行检测比较,并采用克隆测序法进行结果验证。结果 1.构建了HBVrt区常见耐药突变的野生株和变异株标准质粒,并建立了能对12种常见NAs耐药突变同时进行检测的PyroS方法;证实当标准质粒浓度≥1000拷贝/mL时,PyroS法对耐药突变位点的检出率、特异性和重复率均可达100%;2.对95份临床血清标本共检测了950个耐药相关氨基酸置换位点,PyroS法检测结果与直接测序法相符位点939个(符合率98.84%),PyroS法较直接测序法多检出8份标本中共11个变异位点,克隆测序法证实了焦磷酸测序法结果。结论成功建立了能同时定量检测10个已知NAs相关耐药基因突变的PyroS技术,可用于临床抗病毒疗效的监测、及早发现基因型耐药突变,并指导治疗方案的及时调整。     

乙型肝炎病毒基因型、YMDD变异与拉米夫定治疗后HBV DNA反弹关系的研究

目的探讨HBV基因型、YMDD变异与拉米夫定抗病毒治疗后HBV DNA反弹的关系。方法应用多引物对巢式PCR法、PCR-序列分析法检测拉米夫定治疗的27例乙型肝炎患者和19例从未用过抗病毒治疗的患者HBV基因型和P区（YMDD）的突变位点。结果在27例HBV DNA反弹的患者中，13例（48．15％）检出YMDD变异，而对照人群无YMDD变异（P〈0．05）。YMDD变异的位点为rtM204V／I（C区）±rtL180M（B区）；在治疗组YMDD变异的患者中，B、C基因型构成比（46．15％和59．26％）与对照组（53．85％和68．42％）比较无显著性差异（P〉0．05）。结论YMDD变异是拉米夫定治疗后出现耐药导致HBV DNA反弹的主要原因；YMDD变异的常见位点依然为rtM204V／I（C区）±rtL180M（B区）；YMDD变异在B、C基因型病人中无差别。     

740例 HBV 感染者血清 HBV 逆转录酶区耐药位点分析

目的：了解乙型肝炎病毒（HBV）感染者 HBV 基因型的构成状况及 HBV P 区基因变异的特点。方法对2010年8月～2011年10月送检的740份 HBV 感染者血清,采用 ABI 基因测序仪检测 HBV 耐药位点和基因型,应用 SPSS15.0软件进行统计分析。结果在740例 HBV 感染者中,检出 HBV B 基因型40例（5.41%）,C 基因型695例（93.92%）,D 基因型5例（0.68%）;与拉米夫定、阿德福韦酯和恩替卡韦耐药明确相关的位点突变377例（50.95%）,其中195例（51.72%）患者既往有明确的应用核苷（酸）类似物（NA）史,在这195例发生耐药的患者中,B基因型12例,C 基因型183例,两基因型间耐药发生率无明显差异,他们中包括 CHB 患者118例,肝硬化患者77例,主要耐药变异模式为 M204V＋L180M、M204I、M204I＋L180M 和 A181V,两组间 ALT、HBV DNA 载量和主要耐药变异模式检出率均无统计学差异;HBV DNA 载量是影响 NA 耐药的相关因素（x2=0.496,P〈0.001）,但耐药与年龄、性别、疾病严重程度（CHB 或肝硬化）和 ALT 水平无显著性相关;此外,本文还检出多处未知变异位点,如 rt64、rt126、rt178和 rt129等。结论核苷（酸）类似物的使用将伴随病毒变异的发生,其耐药基因变异位点具有一定的特点及规律性,动态监测 HBV DNA 载量对早期发现耐药有一定的价值。     

慢性乙型肝炎患者HBV基因型分布及其耐药基因突变分析*

目的 探讨慢性乙型肝炎（CHB）患者HBV基因型及其耐药突变发生情况。方法 纳入240例接受核苷（酸）类似物单药或联合或序贯治疗的CHB患者,采用PCR扩增HBV逆转录（RT）区和序列测定鉴定耐药基因突变,采用HBV S基因测序法鉴定基因型。结果 在35例单用拉米夫定治疗的CHB患者中,发生耐药突变14例（40.0%）,突变位点为rtL80I/V、rtVl73L、rtLl80M、rtM204V/I和rtV207I,23例单用阿德福韦治疗者发生耐药突变11例（47.8%）,突变位点为rtAl81T/V、rtS213T/N、rtV214A、rtQ215S/H/P、rtl233V、rtN236T、rtP237H和rtN/H238A/K/D/S,70例单用恩替卡韦治疗者发生耐药突变10例（14.3%）,突变位点为rtM204I,12例单用替比夫定治疗者发生耐药突变5例（41.7%）,突变位点为rtI169T、rtL180M、rtT184G/S/A/I/L/F、rtS202I/G、rtM204V和rtM250V/I/L,100例接受联合或序贯治疗者发生耐药突变51例（51.0%）,突变位点为rtA194T,恩替卡韦治疗患者耐药突变发生率最低（P<0.05）;240例CHB患者中,HBV基因B型21例（8.8%）、C型216例（90.0）和D型3例（1.2%）;在发生耐药突变的91例患者中,B型6例（6.6%）、C型83例（91.2%）和D型2例（2.2%,x²=1.22,P>0.05）;在发生耐药突变的6例B型感染者中有2例（33.3%）和83例C型感染者中有15例（18.1%）发生了多重耐药突变。结论 检测CHB患者感染HBV基因型并及时获得耐药突变基因分布,将有助于指导临床治疗。     

拉米夫定耐药株感染者HBV基因型和逆转录酶区变异分析

目的了解拉米夫定耐药株感染者HBV基因型特征并分析耐药株HBV逆转录酶（RT）区变异位点和变异类型。方法应用PCR扩增和直接测序HBV逆转录酶区并与Genebank中90株不同基因型野毒株序列进行比较,确定54例耐药株感染者HBV基因型和HBVRT核苷酸的变异特点。结果在54例拉米夫定耐药株感染者中,HBVB基因型占27．78％,C型占70．37％,B／C混合型占1．85％;51例患者出现RT保守区氨基酸变异（包括550和526位氨基酸变异）;18例患者出现除主型区外HBVRT非主型区伴随变异;3例患者未检测到与拉米夫定相关性变异。结论拉米夫定耐药株感染者HBV基因型主要为B型和C型;拉米夫定耐药株的氨基酸变异不仅见于RT区的526和550两个位点,其他位点以及RT非保守区也可发生变异。     

HBsAg和HBsAb双阳性检测结果的初步分析

目的对临床检测中少见的HBsAg和HBsAb双阳性结果进行分析,寻找可能的产生原因。方法对3家医院初筛HBsAg和HBsAb双阳性的81份血标本进行同种和不同种试剂盒复检,并检测HBsAg145位氨基酸变异（G145R变异）、HBVDNA基因型和血清型分析。结果81份双阳性标本经复检有30例（37％）仍然为双阳性;对30例复检双阳性标本应用不同试剂盒再次检测,HBsAg／HBsAb仍为双阳性者18例（22．2％）;18例双阳性标本G145R检测全部为阴性;其中8例HBV DNA阳性血清的基因型分布为B型2例和C型6例,血清型分布为adw2例、adr5例和ayr1例,与9份对照血清的检测结果比无显著性差异。结论HBsAg和HBsAb双阳性检测结果大多数与操作或试剂的质量有关,少数可能为S基因变异或不同血清型的再次感染等有关。     

慢性乙型肝炎患者血清前S1抗原检测的意义

目的探讨PreS1抗原检测的临床价值。方法采用酶联免疫吸附试验法检测421例慢性乙型肝炎患者血清PreS1抗原和HBV标记物;采用荧光定量PCR法检测HBVDNA。结果在421例慢性乙型肝炎患者中,HBVDNA阳性者367例,其中PreS1Ag阳性者188例(51.2%),HBeAg阳性者119例(32.4%),后两者有显著性差异(P0.01);在高HBVDNA载量(105～107copies/ml和107copies/ml)组患者中,PreS1Ag阳性率(60.2%,60.0%)显著高于HBVDNA阴性组(33.3%)和低载量(103～105copies/ml)组(41.9%,P0.01);但在421例患者中,PreS1Ag阳性率(48.9%)低于HBVDNA(87.2%,P0.01)。结论 PreS1Ag能够较HBeAg更好地反映HBV在体内的复制状态,但尚不能代替HBVDNA的检测。     

表面抗原和抗体双阳性慢性乙型肝炎病毒感染者病毒S基因的变异分析

目的 了解HBsAg和抗-HBs双阳性慢性HBV感染者的S基因变异情况.方法 分别对8例HBsAg和抗-HBs双阳性(实验组)及9例HBsAg阳性、抗-HBs阴性慢性HBV感染者(对照组)的S基因进行PCR扩增并测序,将测序结果进行对比分析.基因型和血清型分布比较、主要亲水区变异位点数比较采用Fisher'S精确检验,核苷酸和氨基酸序列的同源性比较采用t检验.结果 感染HBV的基因型分布:实验组为B型2例、C型6例,对照组为B型6例、C型3例,两组间差异无统计学意义(P>0.05);血清型分布:实验组为adw 2例、adr 5例、ayr 1例,对照组为adw 6例、adr 3例,两组间差异无统计学意义(P>0.05).实验组和对照组HBV前S1区的核苷酸替换率(2.29%比1.8%)和氨基酸替换率(2.66%比1.59%)差异无统计学意义(t值分别为1.56和1.39,P值均>0.05),前S2区的核苷酸替换率(1.74%比0.91%)差异有统计学意义(t=4.68,P<0.01),氨基酸替换率(3.18%比2.05%)差异无统计学意义(t=1.85,P>0.05);S区的核苷酸替换率(2.13%比0.81%)和氨基酸替换率(4.37%比1.52%)差异有统计学意义(t值分别为6.00和5.32,P值均<0.01).主要亲水区内外均存在氨基酸的替换,"a"决定簇变异相对较高(P<0.05).结论 HBsAg和抗-HBs双阳性慢性HBV感染者的S基因变异率相对较高.     

核苷(酸)类似物治疗对乙型肝炎病毒感染者聚合酶区基因变异的影响

目的分析不同核苷(酸)类似物治疗的乙型肝炎病毒感染者乙型肝炎病毒P基因逆转录酶区变异特点。方法采用直接测序法对471例慢性乙型肝炎病毒感染者乙型肝炎病毒P基因逆转录酶区进行测序,比较未曾应用核苷(酸)类似物(第1组)、曾经应用核苷(酸)类似物停药(第2组)和正在应用核苷(酸)类似物(第3组)治疗患者基因突变的特点。结果在第1组、第2组和第3组中分别检出耐药相关错义变异6例(2.0%)、4例(8.2%)和50例(38.5%),同义变异分别为25例(8.5%)、5例(10.2%)和20例(15.4%);在第3组患者中,错义变异组、同义变异组和未变异组血清HBV DNA分别为5.58±1.36lgcopies/ml、5.27±1.05lgcopies/ml和4.98±1.50 lgcopies/ml,差异无统计学意义(P>0.05)。结论不同核苷(酸)类似物治疗的乙型肝炎病毒感染者体内病毒耐药变异株存在的意义还需要进一步研究。     

Molecular analysis of hepatitis B virus isolates in Mexico: Predominant circulation of hepatitis B virus genotype H

AIM:To determine the genotypes in Mexican hepatitis B virus (HBV) isolates and characterize their precore and core promoter mutations.METHODS: Forty-nine HBV isolates of Mexico obtained from sera of 15 hepatitis patients, 6 hemodialysis patients, 20 men seeking HIV testing, and 8 AIDS patients were analyzed. HBV isolates were amplified by PCR,and genotyped by line probe assay (INNO-LiPA HBV Genotyping; INNOGENETICS N V, Ghent, Belgium).HBV genotype confirmation was performed by DNA sequencing part of the sAg region. Precore and core promoter mutation characterization was performed by line probe assay (INNO-LiPA HBV PreCore; INNOGENETICS N.V.; Ghent, Belgium).RESULTS: Overall, HBV genotype H was found in 37(75.5%) out of the 49 isolates studied. HBV genotypes G, A, and D were found in 5 (10.2%), 4 (8.2%), and 3(6.1%) isolates, respectively. HBV genotype H was predominant in isolates from hemodialysis patients (100%),hepatitis patients (80%), and men seeking HIV testing (75%), and accounted for half of infections in AIDS patients (50%). Six (12.2%) out of the 49 HBV isolates showed both wild type and mutant populations at precore codon 28. These mixed wild type and precore murant populations were observed in one HBV genotype A isolate and in all HBV genotype G isolates. A dual variant core promoter mutation was observed in 1 (2%) of the isolates, which was genotype H.CONCLUSION: HBV genotype H is highly predominant in HBV isolates of Mexico followed by genotypes G, A and D. A low frequency of precore and core promoter mutations is observed in HBV Mexican isolates.     

Molecular analysis of hepatitis B virus isolates in Mexico： Predominant circulation of hepatitis B virus genotype H

INTRODUCTIONHepatitis B virus(HBV)is an important cause of morbidity and mortality worldwide.It is estimated that2billion people are infected with HBV and350million individuals suffer from chronic HBV infection in the world[1,2].Chronic HBV infection may …