miR-196a2单核苷酸多态与乳腺癌易感性关系

miRNA是一类长约21-24bp、内源性、非编码、单链RNAs,进化上高度保守,广泛存在于动、植物细胞中。可以调节基因表达[1]。miRNAs可以与靶mRNAs互补序列配对结合,有效并且稳定地降低mRNAs的翻译活性。哺乳动物成熟miRNAs大多通过不完全互补配对与靶mRNA 3′-UTRs结合,调节靶基因的表达,有时也可以直接将靶mRNAs切断。生物信息学数据表明一条单链miRNA可以[2]     

GSTM家族基因多态性与乳腺癌遗传易感性

乳腺癌是复杂性多基因疾病.低外显率基因谷胱甘肽-S-转移酶(GST)基因在乳腺癌遗传易感性中的作用逐渐受到重视.GST基因家族成员之一的GSTM基因的多态性与某些癌症的发生相关联,尽管GSTM基因多态性与乳腺癌遗传易感性的研究尚未获得一致的结论,但相关研究及其进展值得关注.     

儿茶酚-O-甲基转移酶基因Val158Met多态性与乳腺癌易感性关系研究

目的研究儿茶酚-O-甲基转移酶(COMT)基因Val158Met多态性与乳腺癌易感性的关系。方法用人工修饰双等位基因特异性引物结合SYBR Green I荧光聚合酶链式反应法对96例乳腺癌患者(试验组)和116例健康志愿者(对照组)进行COMT Val158Met基因分型,分析2组各基因型和等位基因分布频率的差异。结果试验组和对照组的COMT Val158Met G等位基因分别为65.10%和71.98%,A等位基因分别为34.90%和28.02%,差异均无统计学意义(均P>0.05)。试验组和对照组的COMT Val158Met G/G野生纯合子基因型分布频率分别为38.54%和54.31%,A/G杂合子基因型分布频率分别为53.13%和35.34%,差异均有统计学意义(均P<0.05)。试验组和对照组的A/A突变纯合子基因型分布频率分别为8.33%和10.35%,差异无统计学意义(P>0.05)。相对于G/G基因型,试验组A/G基因型增加患乳腺癌风险(风险度为2.118,95%CI为1.189~3.744)。结论 COMT Val158Met基因多态性可能与乳腺癌易感性有关。     

骨桥蛋白基因多态性与胃癌易感性的关系

目的 探讨骨桥蛋白(OPN)基因多态性与胃癌易感性的相关性.方法 采用聚合酶链式反应及基因测序的方法检测胃癌患者(200例)与健康对照者(200例)中OPN启动子(-66、-156、-443)的基因型分布.构建OPN-443位点野生型质粒以及突变型质粒,利用荧光素酶报告基因检测系统检测相对荧光强度.结果 OPN SNP-443 C/C突变型基因型在胃癌患者中Ⅳ期与Ⅰ(IA +ⅠB)期、其他分期(Ⅰ A+Ⅰ B+Ⅱ+Ⅲ)间差异均有统计学意义(P＜0.05),OPN SNP-443 T/C杂合子型基因型在Ⅳ期与其他分期(Ⅰ A+Ⅰ B+Ⅱ+Ⅲ)间差异有统计学意义(P＜0.05).与野生型报告基因质粒相比,胃癌MKN28细胞中突变型报告基因相对荧光素酶活性增加(P＜0.05).结论 OPN基因启动子区-433位点的变异可能与胃癌转移相关.     

ficolins基因多态性与临床疾病易感性的研究进展

ficolins是天然免疫中的一种模式识别分子,最早被作为转化生长因子β1结合蛋白从猪子宫内膜中分离而来。ficolins与甘露聚糖结合植物凝集素功能相似,能结合病原微生物的糖类配基,通过补体途径和调理吞噬作用消灭病原体,在天然免疫中发挥重要作用。迄今为止,已发现M-ficolin,L-ficolin和H-ficolin 3种人类ficolin蛋白,分别由FCN1,FCN 2和FCN 3基因编码。随着研究的深入,越来越多的学者开始关注FCN基因多态性与疾病易感性之间的关系。大量研究发现,FCN基因多态性与疾病的易感性、严重性及疾病的发生发展密切相关。本文就FCN基因多态性与相关疾病易感性间的关系进行简述。     

hOGG1基因多态性与胃癌遗传易感性的关系

目的探讨人类8-羟基鸟嘌呤DNA糖苷酶1（hOGG1）基因多态性与胃癌遗传易感性的关系。方法收集河南郑州和开封地区98例胃癌患者和80例非肿瘤对照组志愿者外周血样,应用聚合酶链反应一限制性片段长度多态性（PCR—RFLP）检测法检测胃癌人群的外周血中DNA损伤修复酶基因多态性,分析其与肿瘤遗传易感性的关系。结果hOGGISer326Cys基因的各基因型频率在胃癌组和对照组间的分布差异有统计学意义（P〈0．05）。携带Cys326Cys基因型者胃癌的发病风险增加1．7倍（OR=I．706,95％CI=0．341～2．462,P=0．002）。hOGGlSer326Cys基因多态性与酒的交互作用增加胃癌的发病风险（S〉1,API=0．38）。结论Cys326Cys基因型是胃癌发病的危险基因型,携带Cys易感基因与饮酒交互作用时可能增加患胃癌的易感性。     

BRAP rs3782886 A＞G基因多态性与食管癌易感性的关系

目的 探讨中国汉族人群中乳腺癌易感基因相关蛋白(BRAP) rs3782886 A＞G基因多态性与食管癌发生风险的关系.方法 采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱( MALDI-TOFMS)技术分析380例食管癌(食管癌组)和380例非肿瘤组(对照组)BRAP rs3782886 A＞G基因多态性,计算各种基因型的食管癌发生风险.结果 Logistic回归分析显示,与携带BRAP rs3782886AA+ AG基因型的群体相比较,携带BRAP rs3782886 GG等位基因型群体的食管癌发病风险略有降低(OR=0.53,95％ CI=0.26-1.09).结论 BRAP rs3782886 A＞G基因多态性与食管癌的发病风险无明显相关.     

rs2233678和rs2233679多态性与福建汉族人群肺癌易感性及临床病理学特征的关系

目的了解福建汉族人群肽酰脯氨酰基顺反异构酶1（Pin1）基因rs2233678（-842G/C）和rs2233679（-667T/C）多态性分布规律及其与肺癌发生、发展的关系。方法采用聚合酶链反应（PCR）技术,对80例汉族肺癌患者和135例健康对照的Pin1基因启动子进行扩增并对PCR产物直接测序,分析Pin1基因启动子多态性与肺癌易感性及其临床病理学特征的关系。结果 rs2233678位点只检测到GG和GC两种基因型,没有检测到CC基因型。rs2233678和rs2233679位点的等位基因和基因型分布在肺癌组和健康对照组中比较差异无统计学意义（P〉0.05）;其组成的单体型C-C、G-C和G-T均与肺癌发生风险无相关性（P〉0.05）,rs2233678的基因型分布与肺癌的临床病理学特征无相关性（P〉0.05）,rs2233679的基因型分布与肺癌病理类型呈弱相关（r=0.285,P=0.010）。结论 rs2233678和rs2233679多态性可能与福建汉族人群肺癌易感性无关,rs2233679的基因型分布与肺癌病理类型有一定的相关性。     

MBL基因多态性与结核病易感性之间的关系

目的探讨MBL与MASP-2的基因多态性与结核易感性之间的关系,为相关防治工作的开展提供了依据。方法随机选取2017年2月至2018年2月来我院就诊的结核病患者60例作为研究对象,比较其与对照组rs7096206/rs2273346/rs6695096等三个位点单核苷酸多态性的差异。结果 rs6695096位点的单核苷酸多态性与结核病易感性之间不存在关联,而rs7096206位点GC基因型患者感染结核的风险是CC者的1.39倍(95%CI 1.21～1.67),rs6695096 TC基因型患者感染结核的风险是TT者的1.64倍(95%CI 1.56～1.78)。结论血清甘露糖结合凝集素(MBL)与MBL相关丝氨酸蛋白酶-2(MASP-2)相关基因多态性与结核病易感性之间存在关联     

维生素D受体基因多态性位点rs7975232与肺癌发病风险的相关性

目的探讨维生素D受体基因rs7975232位点与汉族人群肺癌发病风险的相关性。方法用直接测序法对72例肺癌患者及67名健康对照者进行单核苷酸多态性位点检测,采用ABI3700XL基因分析仪测序。结果维生素D受体基因rs7975232位点等位基因A携带者肺癌发病风险明显低于等位基因C携带者[比值比（OR）=0．501,95％置信区间（CI）为0．273～0．920,P=0．026]。rs7975232位点可能与鳞癌发病相关（等位基因之比：OR=0．274,95％CI为0．087～0．861,P=0．027;显性基因模型：OR=0．269,95％C,为0．074—0．971,P=0．045）。结论维生素D受体基因rs7975232位点与肺癌发病相关。     

单核苷酸多态性与胃癌易感性的相关性研究

目的研究单核苷酸多态性与胃癌易感性的相关性。方法选取2009年5月～2012年5月笔者所在医院收治的242例胃癌患者血样(实验组)与344例来自健康人群的正常血样(对照组)。对两组血样EZH2rs734004、rs734005、rs2072407、rs6464926、rs12670401多态性测序,运用组织芯片技术与免疫组化检测240例同一来源胃癌组织与30例正常胃黏膜EZH2蛋白表达。结果检测发现EZH2中rs12670401基因型CC与rs6464926基因型TT在胃癌患者中所占的比例较高,EZH2与rs2072404比例增加会严重影响到胃癌发生率与风险(P=0.007,OR=1.785,95%CI=1.171～2.724;P=0.012,OR=1.720,95%CI=1.121～2.623)。胃癌患者中的EZH2包含的杂合基因型rs2072407TC、rs734004TC、rs734004CG所占比例低于正常血液对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。所占比例减少可降低患者胃癌发生的几率与风险(P=0.032,OR=0.712,95%CI=0.520～0.975;P=0.033,OR=0.708,95%CI=0.517～0.971;P=0.035,OR=0.712,95%CI=0.517～0.977)。应用连锁不平衡分析LD进一步对上述观察进行证实。胃癌不同组织学类型与不同临床参数间的EZH2免疫组化染色强度差异无统计学意义(P>0.05)。结论单核甘酸多态性与胃癌易感性相关。     

CYP3A4基因多态性与汉族小儿耐药性癫痫的关系

目的探讨耐药性癫痫的汉族儿童CYP3A4*18A、CYP3A4*1G与癫痫耐药的相关性。方法应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术,共检测西南地区238例儿童的CYP3A4*18A、CYP3A4*1G基因型频率和等位基因频率,其中耐药性癫痫(耐药组)83例、抗癫痫药物治疗有效(有效组)87例、健康儿童(正常组)68例。结果 CYP3A4*1G野生纯合子频率在耐药组、有效组、正常组分别为47%、45%、50%,突变杂合子频率分别为46%、49%、43%,突变纯合子频率为7%、6%、7%;等位基因野生型频率分别为70%、70%、71%,突变型频率分别为30%、30%、29%。3组基因型频率及等位基因频率差异均无显著意义(P>0.05)。CYP3A4*18A在耐药组中分布野生纯合子93%、突变杂合子7%,等位基因野生型96%、突变型4%;有效组、正常组野生纯合子100%,未发现突变。耐药组CYP3A4*18A多态性的突变杂合子基因型频率及突变型等位基因频率高于有效组,差异有显著意义(P<0.05),耐药组与正常组基因型频率及等位基因频率比较,差异无显著意义(P>0.05)。结论西南地区汉族儿童CYP3A4*18A基因多态性可能与癫痫耐药存在相关性,CYP3A4*1G基因多态性与癫痫耐药可能无相关性。检测CYP3A4*18A基因型也许是选择有效抗癫痫药物的方法之一。     

Relationship between CYP3A activity and breast cancer susceptibility in Chinese Han women

BACKGROUND. Breast cancer is the most frequent type of tumor in women. The main cause of breast cancer remains unknown. Extensive studies have shown that endogenous steroid hormones, especially estrogens, are important in the development and the progression of breast cancer, and the carcinogenesis of estrogens is related to their major oxidative metabolites, 16alpha-hydroxyestrogens and 4-hydroxyestrogens. CYP3A plays a major role in the 4- and 16alpha-hydroxylation of estrogens. Furthermore, CYP3A is present in human mammary epithelial cells and expressed higher and more frequently in malignant breast cells than in the adjacent normal breast tissue. Hence, it will be significant to perform more work to determine the association between CYP3A activity and breast cancer susceptibility. AIMS. To evaluate the relationship of CYP3A activity to breast cancer susceptibility in Chinese Han women using the plasma 1-hydroxymidazolam (1-OHMDZ) to midazolam (MDZ) ratio as the marker of CYP3A activity. METHODS. One hundred and twenty-nine Chinese Han female breast tumor patients and 121 healthy unrelated female volunteers were enrolled in the current study. After an overnight fast, each subject was administered a single oral dose (7.5 mg) of midazolam. Blood samples (5 ml) were drawn at 1 h after the drug administration. The concentration of parent MDZ and its major metabolite 1-OH-MDZ was measured in all the plasma samples using high-performance liquid chromatography. RESULTS. Complete chromatographic data on plasma ratios of 1-OHMDZ to MDZ for 103 cases of breast cancer and 114 controls were available. The plasma concentration ratios of 1-OHMDZ to MDZ were 0.4520+/-0.2318 and 0.3298+/-0.1610 for the malignant cases and the controls, respectively. A higher CYP3A activity was found in the breast cancer cases than in the controls ( P<0.001), and the CYP3A activity of patients with lymph-node metastasis was higher than that of patients without lymph-node metastasis ( P=0.028). CYP3A activity in estrogen receptor or progesterone receptor positive cases was the same as in estrogen receptor or progesterone receptor negative cases ( P=0.124, 0.175). CONCLUSIONS. Our results indicate that high CYP3A activity may contribute to breast cancer disease genesis and may promote breast cancer to lymph-node metastasis.     

单核苷酸多态性与阿司匹林抵抗的相关性研究

目的：本研究选取4个基因研究其中7个单核苷酸多态性与阿司匹林抵抗是否存在相关性。方法：2010年10月-2012年3月在本院急诊内科和心内科病房住院患者中入选服用阿司匹林的心血管疾病患者330例,对其COX-1、COX-2及GPIIIa、P2Y1基因的多态性位点通过直接测序法进行基因型检测。结果：29％仰：95）的患者存在阿司匹林抵抗,P2RY,基因的893T〉C变异与阿司匹林抵抗发生率增加有关（OR3．16、95％CI1.36～7．16、P=0．05）,而其余的ITGB3、PTGS1、PTGS2基因与阿司匹林抵抗无相关性。且统计临床资料发现,年龄大、有糖尿病史、HDL水平低的患者阿司匹林抵抗发生率高。结论：P2RY1基因的893T〉C变异与阿司匹林抵抗有关。     

单核苷酸多态性与NSCLC铂类化疗敏感性的关系

目的探讨ERCC1(C118T)、XRCC1(G399A)的单核苷酸多态性(SNP)与非小细胞肺癌(NSCLC)对铂类为主化疗方案敏感性的关系。方法经病理学确诊的晚期NSCLC患者120例,采用铂类为主的两药联合化疗方案,2～3个周期后进行临床疗效评价。根据cDNA芯片原理制作目的基因芯片,利用双色荧光探针杂交进行ERCC1、XRCC1的多态性的基因分型,比较不同基因型与化疗敏感性的关系。结果 ERCC1(C118T)至少携带1个T等位基因型的患者化疗有效率为44.7%,显著高于C/C基因型的19.2%(P<0.05);携带XRCC1(G399A)G/G基因型者化疗有效率为43.8%,高于至少携带1个A等位基因的19.4%(P<0.05)。结论 ERCC1、XRCC1基因多态性与NSCLC患者对铂类药物化疗的敏感性相关。     

类风湿关节炎患者转运蛋白基因多态性与甲氨蝶呤疗效及不良反应的相关性研究

目的探讨类风湿关节炎（RA）患者还原型叶酸载体（RFC-1）基因G80A及三磷酸腺苷结合盒转运体B1（ABCB1）基因C3435T单核苷酸多态性（SNP）与甲氨蝶呤（MTX）疗效与不良反应的相关性。方法采用实时荧光定量聚合酶链反应（FQ-PCR）法检测136例单用MTX的RA患者RFC-1基因G80A及ABCB1基因C3435T多态性,并与MTX治疗疗效和不良反应相关分析。结果 RFC-1基因G80A及ABCB1基因C3435T多态性与MTX治疗RA的不良反应无明显相关性（P〉0.05）;RFC-1基因G80A多态性与MTX治疗RA的疗效无明显相关（P〉0.05）,而ABCB1基因C3435T的多态性与疗效相关,携带有CC基因型的患者MTX疗效明显优于携带有TT或CT基因型的患者。CT和CC比较,（P=0.015,OR=4.189,95%CI为1.314~13.353）;TT和CC比较,（P=0.02,OR=5.941,95%CI为1.320~26.739）。结论 ABCB1基因C3435T多态性可能对RA患者应用MTX的疗效有预测作用。     

STAT4 rs7574865单核苷酸多态性与ANCA相关性血管炎的关系

目的 探索信号转导和转录激活因子-4（STAT4）rs7574865单核苷酸多态性与原发性抗中性粒细胞胞浆抗体相关性血管炎（AAV）的关系。方法 纳入145例AAV患者（AAV组）和216例健康体检者（对照组）并收集患者就诊时是否伴发热、蛋白尿、血尿、咯血症状。采用多重PCR结合高通量测序（MPCR-HTS）进行基因分型;比较2组间、各临床症状亚组间rs7574865基因型、等位基因和不同遗传模型下基因型的分布差异;Logistic回归分析评估基因型与临床症状发生风险的关系。结果 2组间STAT4 rs7574865基因型、等位基因、不同遗传模型下基因型分布差异无统计学意义;不同亚组中基因型、等位基因分布差异均无统计学意义。隐性模型下,血尿组TT基因型分布比例低于无血尿组（P<0.05）;Logistic回归分析显示TT基因型与血尿发生风险无关。结论 STAT4 rs7574865单核苷酸多态性与AAV易感性和发热、蛋白尿、血尿、咯血临床症状不相关。     

Association study of IL10 gene polymorphisms (rs1800872 and rs1800896) with cervical cancer in the Bangladeshi women

ObjectiveCervical cancer is one of the most destructive diseases among females worldwide, especially in developing countries. Interleukin-10 (IL10) is a multifunctional cytokine, and polymorphisms in the IL10 gene have been identified in multiple malignancies. However, no prior studies were conducted to determine the association of IL10 polymorphisms (rs1800872 and rs1800896) with cervical cancer patients in Bangladesh.MethodsThis case-control study was carried out on 240 cervical cancer patients and 204 healthy volunteers. Genotyping was performed using the tetra-primer amplification refractory mutation system polymerase chain reaction (ARMS-PCR).ResultsIn the case of rs1800872, CA and AA genotypes significantly increased the risk of cervical cancer (OR = 1.59, 95% CI = 1.01–2.49, p = 0.043; OR = 2.75, 95% CI = 1.53–4.93, p = 0.0007, respectively) but the significance did not exist for CA genotype after Bonferroni correction (p < 0.025). An increased risk was also observed for the dominant model, recessive model, and allele model (A vs. C) of rs1800872 (dominant model: OR = 1.83, 95% CI = 1.18–2.80, p = 0.006; recessive model: OR = 2.00, 95% CI = 1.22–3.29, p = 0.006; allele model: OR = 1.55, 95% CI = 1.19–2.03, p = 0.001) which remained significant after the correction of Bonferroni. For rs1800896, only GG genotype and recessive model showed increased risk for cervical cancer (GG vs. AA: OR = 3.48, 95% CI = 1.46–8.31, p = 0.005; recessive model: OR = 3.57, 95% CI = 1.52–8.38, p = 0.003). These associations were statistically significant, and the significance existed after Bonferroni correction. Haplotype analysis revealed that AA haplotype significantly increased the risk (OR = 1.56, p = 0.001) whereas, CA haplotype significantly lowered the risk (OR = 0.42, p = 2.42x10^-8), and both rs1800872 and rs1800896 are strongly in linkage disequilibrium (D’=1, r² = 0.333). Moreover, the IL10 mRNA level was found up-regulated in silico in cervical squamous cell carcinoma tissues compared to healthy tissues (p = 1.11x10^-16).ConclusionOur study suggests that rs1800872 and rs1800896 polymorphisms of IL10 gene are associated with cervical cancer in Bangladeshi females.