KCNQ1基因单核苷酸多态性与妊娠期糖尿病的相关性

  目的  探讨电压依赖性钾离子通道(potassium voltage-gated channel, subfamily Q, member 1, KCNQ1)基因多态性与妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus, GDM)发病风险的关系,为GDM的机制研究提供线索与依据。  方法  采用匹配的病例对照研究设计,病例组来自2012年3月1日—2014年7月30日在山西医科大学第一医院分娩的334名GDM孕妇,按年龄和居住地1∶1匹配334名健康对照,对研究对象进行DNA基因分型。在共显性、显性、隐性、相加等遗传模式下,通过Logistic回归分析模型分析KCNQ1基因的13个候选单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)和GDM发病风险的关系,并采用HaploView软件分析单倍体与GDM之间的关系。  结果  在调整糖尿病家族史、孕前BMI且调整多重比较后,在共显性遗传模式下,rs4930000位点携带GG基因型的孕妇与携带AA基因型相比是发生GDM的危险因素(OR=3.37, 95% CI: 1.30~8.73, P=0.013)。rs163171位点携带GA基因型与AA基因型孕妇相比(OR=0.70, 95% CI: 0.50~0.98, P=0.037),rs2074196位点携带CA基因型与携带CC基因型孕妇相比(OR=0.65, 95% CI: 0.46~0.91, P=0.012),rs2237888位点携带GA基因型与GG基因型孕妇相比(OR=0.69, 95% CI: 0.49~0.98, P=0.037),rs72847583位点携带CG基因型与携带CC基因型的孕妇相比(OR=0.63, 95% CI: 0.43~0.92, P=0.017),发生GDM风险低,均是GDM的保护因素。在KCNQ1基因内由rs11023996、rs7924946组成的单倍体Block1 AA表型和由rs233446、rs2237893、rs151293、rs16318、rs163183与rs234852组成的单倍体Block2 CGACG表型与GDM的发病风险相关。  结论  KCNQ1基因位点多态性(rs4930000、rs163171、rs2074196、rs2237888、rs72847583)、单倍体Block1 AA表型与Block2 CGACG表型均与GDM的发病风险相关。     

新疆哈萨克族食管癌与HLA-G基因多态性

目的 研究免疫相关基因HLA-G多态性与新疆哈萨克族食管癌易感性的关系.方法 采用病例-对照研究方法,调查新疆哈萨克族食管癌患者132例和非食管癌患者254例,应用聚合酶链反应(PCR)技术和聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术分别对HLA-G基因14bp缺失(rs16375)和HLA-G0105N(rs41557518)多态性进行检测,并比较2个位点不同基因型与食管癌发病风险的关系.结果 rs16375位点基因型为+14 bp/+14 bp、-14 bp/+14 bp、-14 bp/-14 bp;病例组与对照组的基因型及等位基因频率分布差异有统计学意义(χ2=7.54,P=0.02;χ2=6.80,P=0.01);携带-14bp/-14bp基因型的个体发生食管癌的危险性是+14 bp/+14 bp基因型的2.69倍(OR=2.69,95%CI=1.30～5.55);rs41557518位点基因型为C/-、C/C、-/-;病例组与对照组的基因型及等位基因频率分布差异无统计学意义(χ2=1.19,P=0.28;χ2=1.13,P=0.29);同时携带基因型-14bp/-14bp和C/C的个体发生食管癌的危险性是同时携带基因型+14bp/+14bp和C/C个体的2.82倍(OR=2.82,95%CI=1.32～6.04).结论 HLA-G基因14bp缺失(rs16375)多态性与哈萨克族食管癌发生有关.     

IL-10启动子区基因多态性与抗结核药物性肝损伤关系

  目的  探讨白细胞介素10（interleukin 10，IL-10）启动子区的-592 A/C（rs1800872）和-819 C/T（rs1800871）位点基因多态性与抗结核药物性肝损伤（antituberculosis drug-induced liver injury，ADLI）易感性关系。  方法  采用病例对照研究设计，以发生肝损伤的180例患者为病例组，按性别进行频数匹配未发生肝损伤的180例患者为对照组。对研究对象进行流行病学调查，同时留取外周血以聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性技术鉴定两位点基因型。  结果  研究对象两位点的基因型分布在ADLI间差异均无统计学意义（均有P>0.05）。-592 A/C位点的C等位基因在病例组的频率高于对照组，显性模型（CC+AC）出现ADLI的危险是AA型的1.62倍，分布差异均有统计学意义（均有P<0.05）。-819 C/T位点等位基因在两组中的分布差异无统计学意义（P=0.190），但-592 A/C和-819 C/T两位点间存在连锁不平衡，单倍型-819 C/-512 C（OR=1.37，95%CI:1.02~1.85）和-819 C/-512 A（OR=0.49，95%CI:0.34~0.70）在病例组和对照组中的分布均有统计学差异（均有P<0.05）。  结论  IL-10启动子区-592 A/C和-819 C/T位点的基因多态性可能与ADLI易感性有关。     

IFITM3基因rs12252位点多态性与中国人群流感易感性:基于研究的序贯Meta分析

  目的  系统评价干扰素诱导跨膜蛋白3（interferon-induced transmembrane protein 3,IFITM3）基因rs12252位点多态性与中国人群流感易感性的定量关系。  方法  检索Medline、PubMed、Embase、Web of Science以及中国知网、万方、维普数据库,收集IFITM3与中国人群流感易感性相关的文章。采用Meta分析方法对收集的文章进行定量地综合分析。  结果  本次研究共纳入7篇文献,共计919例流感感染的病例,涉及到甲型流感（H7N9、H1N1pmd09、H3N2）及乙型流感病毒,序贯Meta分析显示本研究纳入的研究总样本已达到了得到稳定阳性结局所需的样本量。Meta分析结果发现,IFITM3基因的rs12252多态性与中国人群流感病毒易感性存在关联,携带rs12252 C等位基因的人群更易发生流感（C vs T:OR=1.67,95% CI:1.45~1.92;CC vs TT:OR=2.61,95% CI:1.97~3.46;TC vs TT:OR=1.55,95% CI:1.20~2.00;CC vs TC+TT:OR=2.01,95% CI:1.49~2.72;CC+TC vs TT:OR=8.90,95% CI:4.94~16.06）。  结论  IFITM3基因rs12252位点多态性是中国人群发生流感的危险因素。     

原发性肝细胞癌与IL-2、IFN-γ基因多态性关系

目的探讨细胞因子IL-2基因-330T/G(rs2069762)位点和IFN-γ基因-1615C/T(rs2069705)、+5171A/G(rs2069727)位点单核苷酸多态性与原发性肝细胞癌(HCC)发生的关系。方法采用医院为基础的病例对照研究方法于2007年6月—2010年7月在广西医科大学第一附属医院和广西肿瘤医院收集784例HCC患者和同期在广西医科大学第一附属医院及广西区医院体检中心1 017名健康对照人群进行环境暴露调查;采用Taq-Man荧光定量PCR技术对上述位点进行分型,应用logistic回归模型分析组间基因-环境和基因-基因的交互作用。结果 IFN-γ的-1615C/T和+5171A/G位点存在连锁不平衡(D’=0.976,r2=0.549,P=2.22-16),单倍型CG在人群中发生频率<0.03,其他3种单倍型CA、TA、TG频率在病例组和对照组间分布差异均无统计学意义(P>0.05);IL-2-330T/G和IFN-γ-1615C/T、+5171A/G 3个位点的基因型在HCC患者和健康对照人群中分布差异均无统计学意义(P>0.05);吸烟、饮酒和携带HBV等环境暴露因素与-330T/G位点的突变基因G对HCC的发生有协同作用,交互作用指数S分别为1.38、1.50、1.03;吸烟、饮酒、有肝癌相关家族史和携带HBV等环境暴露因素与-1615C/T、+5171A/G位点的基因多态性在HCC患病风险中存在负交互作用;logistic回归分析结果表明,携带IL-2的-330T/G位点突变基因G并且同时携带IFN-γ的-1615C/T、+5171A/G位点的突变纯合子TT/GG能增加HCC患病风险(OR=1.84,95%CI=1.08～3.83)。结论 IL-2基因-330T/G和IFN-γ基因-1615C/T、+5171A/G位点多态性与环境暴露因素存在交互作用,基因-环境、基因-基因交互作用可能增加HCC发生风险。     

受体相互作用蛋白激酶1在类风湿关节炎发病中的作用及其遗传易感性

  目的  分析受体相互作用蛋白激酶1(receptor interacting serine/threonine protein kinase 1, RIPK1)在类风湿关节炎(rheumatoid arthritis, RA)发病中的作用及其基因多态性与RA遗传易感性的关联。  方法  采用实时定量PCR(quantitative real-time PCR, qRT-PCR)方法检测RA和健康对照者的外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell, PBMC)中RIPK1的mRNA水平,分析其在RA发病中的作用。在RIPK1调控区和蛋白修饰功能区中筛选单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点,筛选了rs111393904、rs115041708、rs1158343326、rs116040763、rs116603010、rs116696494、rs1186968649、rs1189800403、rs1193251671、rs1255389565、rs138277932、rs17548629、rs200610530、rs547953577、rs557588787、rs561972571、rs760405932、rs77736895和rs934053809共19个位点,采用iMLDR技术进行基因分型,分析RIPK1基因多态性与RA遗传易感性的关联。  结果  比较88例RA患者和85例健康对照者RIPK1 mRNA表达水平,结果显示RA组低于健康对照组(Z=3.152, P < 0.000 1);进一步比较RA活动组(50例)、RA稳定组(38例)和健康对照组三组间差异,结果显示RA活动组RIPK1 mRNA表达水平低于稳定组(Z=2.987, P=0.008 4)和健康对照组(Z=4.247, P < 0.000 1),RA稳定组与健康对照组间差异无统计学意义(Z=0.584, P>0.999 0)。对103例RA患者和90例健康对照者的SNP位点进行基因分型,结果显示RA患者上述SNP位点基因型和等位基因频率与健康对照组的差异均无统计学意义(均有P>0.05)。  结论  RIPK1对RA病情活动可能有保护作用,但其基因多态性与RA遗传易感性可能无关联。     

中国老年人HDAC9和PPP3CA基因多态性与衰弱的关联

  目的  探讨组蛋白去乙酰化酶9(histone deacetylase 9, HDAC9) rs2074633及钙调神经磷酸酶催化亚基A(calcineurin catalytic subunit A, PPP3CA) rs17030795的多态性与中国老年人衰弱发生的关联。  方法  本研究纳入衰弱组665例,对照组3 388例。基于基因型频率及五种遗传模型(共显性、加性、显性、隐性和超显性),评估rs2074633及rs17030795多态性与衰弱之间的关联。  结果  在共显性模型中,与携带rs2074633 TT基因型相比,携带TC型(OR=1.99,95% CI: 1.36~2.90)、CC型(OR=2.15,95% CI: 1.48~3.13)的个体发生衰弱的风险增加;在加性(OR=1.28,95% CI: 1.11~1.47)、显性(OR=2.07,95% CI: 1.44~2.98)及隐形模型(OR=1.21,95% CI: 1.01~1.45)中rs2074633多态性均增加衰弱的发生风险;在共显性模型中,与携带rs17030795 AA基因型相比,携带AG(OR=1.72,95% CI: 1.19~2.51)、GG(OR=1.98,95% CI: 1.37~2.87)型的个体发生衰弱的风险增加;在加性(OR=1.28,95% CI: 1.11~1.48)、显性(OR=1.85,95% CI: 1.29~2.66)及隐性(OR=1.25,95% CI: 1.04~1.50)中rs17030795多态性均增加衰弱的发生风险。   结论  HDAC9 rs2074633及PPP3CA rs17030795多态性与中国老年人衰弱发生风险有关。     

TLR基因多态性对广西汉族儿童乙型肝炎疫苗初次免疫应答水平的影响

  目的  探讨Toll样受体(toll-like receptors,TLR)基因多态性与广西汉族儿童乙型肝炎(以下简称乙肝)疫苗初次免疫应答水平的关联。  方法  收集2014-2016年到广西自治区妇幼保健院、南宁市妇幼保健院儿科就诊的8~9月龄汉族儿童513例为研究对象。采集外周血标本,采用微粒子酶免疫法检测乙肝血清标志物"两对半",用套式聚合酶链式反应法检测乙肝病毒DNA,应用SNPscanTM多重SNP分型技术检测TLR基因10个位点的基因多态性。采用非条件Logistic回归分析TLR等位基因、基因型与儿童乙肝疫苗免疫后应答的关联。  结果  TLR3基因rs13126816的基因多态性与广西汉族儿童初次乙肝疫苗免疫后应答情况有关(OR=1.79,95% CI:1.11~2.89,P=0.018);A/A基因型[238.04(519.75) mIU/L]和G/A基因型[347.96(619.68) mIU/L]儿童的乙肝病毒表面抗体(hepatitis B surface antibody,抗-HBs)水平明显低于G/G基因型[489.08(854.76) mIU/L]的儿童,差异均有统计学意义(均有P < 0.05);携带等位基因A[317.20(608.72) mIU/L]儿童的抗-HBs水平也明显低于携带等位基因G[457.01(852.66) mIU/L]的儿童,差异有统计学意义(Z=-3.055,P < 0.05)。TLR基因其余位点均与乙肝疫苗免疫应答无关(均有P>0.05)。  结论  TLR3基因rs13126816位点等位基因A可能是汉族儿童产生初次乙肝疫苗免疫低应答的影响因素。     

盐诱导激酶3基因单核苷酸多态性rs12225230与儿童肥胖表型的关联

  目的  探讨盐诱导激酶3(SIK3)基因单核苷酸多态性rs12225230与儿童青少年肥胖相关表型的关联，为儿童青少年肥胖的筛查干预提供证据。  方法  整群抽取北京市2 030名7~18岁儿童青少年为研究对象，进行身体测量及超重肥胖分组。利用基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)检测单核苷酸多态性rs12225230基因型频率。分别采用Logistic回归和多元线性回归分析单核苷酸多态性rs12225230与肥胖、中心性肥胖相关表型的关联。使用Polyphen2数据库分析单核苷酸多态性rs12225230对SIK3基因蛋白质功能的影响；使用GTEx数据库探索与单核苷酸多态性rs12225230相关联的组织特异性基因表达。  结果  单核苷酸多态性rs12225230 C等位基因是儿童青少年肥胖、重度肥胖发生的危险因素(OR_肥胖=1.50，95%CI=1.10~2.04，P=0.01；OR_重度肥胖=1.72，95%CI=1.23~2.39，P < 0.01)。单核苷酸多态性rs12225230 C等位基因与腰围、腰高比存在正相关(β_腰围=1.40，95%CI=0.28~2.52，P=0.01；β_腰高比=0.01，95%CI=0.00~0.02，P=0.01)；单核苷酸多态性rs12225230 C等位基因对SIK3基因编码的蛋白质可能存在功能损害，且与心脏组织中APOA1基因表达升高相关。  结论  SIK3基因单核苷酸多态性rs12225230与儿童青少年肥胖、中心性肥胖相关，且与APOA1表达相关，但与脂代谢之间的关联尚需进一步论证。     

趋化因子CXCL10单核苷酸多态性与慢性乙型肝炎遗传易感性的关系

目的 探讨IFN γ诱导蛋白10(CXCL10)单核苷酸多态性(SNP)位点rs4257674和rs4256246的多态性和中国人群慢性乙型肝炎(CHB)遗传易感性的关系.方法 采用多通道Snapshot分型技术检测501例CHB患者(CHB组)和301例自限性乙型肝炎者(对照组)CXCL10基因rs4257674和rs4256246的多态性,计算和分析基因型、等位基因频率和单体型频率.结果 CXCL10 rs4257674位点多态性在CHB组和对照组组中的等位基因频率(OR=2.347,95％CI:1.478～3.729,x2=13.763,P＜0.01)和基因型分布(x2=12.910,P＜0.01),差异有统计学意义;rs4256246位点多态性在CHB组和对照组中的基因型分布(x2=1.795,P＞0.05)、等位基因频率(OR=1.107,95％ CI:0.897～1.366,x2=0.899,P＞0.05)差异无统计学意义.rs4257674和rs4256246两位点构成的单体型C/T在CHB组和对照组频率分布差异有统计学意义(OR=2.139,95％CI:1.340～ 3.413,x2=10.597,P＜0.01);单体型C/C、T/C频率分布在两组之间差异无统计学意义(x2C/C=0.262,x2T/C=1.342,P＞0.05);单体型T/T频率＜0.03.结论 CXCL10基因多态性位点rs42.57674可能与中国人群CHB发病相关.     

雌激素受体α基因多态性与膀胱癌发病风险的相关性

  目的  研究雌激素受体α基因单核苷酸多态性与膀胱癌易感性的关系。  方法  从两医院收集膀胱癌新发病例220例及同期健康体检对照220例,通过问卷收集研究对象一般情况,查阅电子病历收集临床检查资料;用多重高温连接酶检测反应技术（improved multiple ligase detection reaction,iMLDR）检测基因型;采用酶联免疫法检测两组血清中雌激素受体α（estrogen receptor alpha,ESRα）的表达量。  结果  病例组的体重指数、饮食及生活行为习惯和血红蛋白、中性粒细胞百分率等临床检查结果与对照组人群差异均有统计学意义（均有P < 0.05）。rs1801132位点基因及基因型频率与病理分级（χ2=9.607,P=0.022;χ2=24.468,P < 0.001）、远处转移（χ2=2.367,P=0.027;χ2=21.758,P=0.001）有关。膀胱癌患者血清中ESRα受体表达量低于正常人群（t=5.588,P < 0.001）。rs1801132位点多态性在不同基因型人群中膀胱癌发病风险均有统计学差异[GG:OR（95% CI）=0.325（0.141~0.751）,P=0.009;GC:OR（95% CI）=0.409（0.198~0.847）,P=0.016]。  结论  rs1801132位点多态性与膀胱癌发病相关,GG/GC基因型在膀胱癌中具有保护作用;rs2234693位点多态性与膀胱癌无相关性。     

STAT4遗传变异与原发性肝癌病理特征的关联

  目的  探讨STAT4遗传变异及其与运动的交互作用对原发性肝癌患者病理特征的影响。  方法  在601例新发肝癌患者中,采用多因素Logistic回归分析模型分析rs7574865、rs897200、rs1031507与肿瘤淋巴结转移（tumor node metastasis,TNM）分期、门脉癌栓的关联。应用相乘交互项和"Delta"法分别评价相乘和相加交互作用。  结果  在显性模型下,rs897200变异与患者首诊时晚期的风险存在临界统计学关联（调整OR=0.64,95%CI:0.41~1.01,P=0.057）。携带rs1031507 CC+AC基因型的患者晚期风险低于AA基因型患者（调整OR=0.63,95%CI:0.40~0.99,P=0.046）。叉生分析中,与携带rs897200 CT+CC基因型且有运动的患者相比,缺乏运动的TT基因型患者晚期风险增高（OR=3.71,95%CI:1.97~6.98,P < 0.001）。类似,rs1031507AA基因型与缺乏运动共同升高患者的晚期风险（OR=3.78,95%CI:2.01~7.13,P < 0.001）。但未观察到rs897200、rs1031507与运动存在影响肝癌分期的统计学交互作用。  结论  STAT4 rs897200和rs1031507遗传变异的独立效应及与运动的联合效应影响肝癌患者首诊时的临床分期。     

TNF-α基因rs1800629多态性与中国人群宫颈癌的易感性

  目的  探讨肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor α,TNF-α)基因位点rs1800629单核苷酸多态性与宫颈癌发生的关系。  方法  选择经组织学确诊的汉族552例新发宫颈癌患者作为病例组,与病例组人群不存在生物学相关的654例正常人群作为对照组,利用Taqman实时荧光定量聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术检测基因型,Logistic回归模型计算基因型与人群罹患宫颈癌的风险比(odds ratio,OR)及其95%的可信区间(95%CI);Stata 11.0软件对中国人群rs1800629多态性与宫颈癌的关系进行Meta分析。  结果  与TNF-α rs1800629野生型GG基因型的相比,个体携带rs1800629 GA、AA及GA/AA基因型的个体罹患宫颈癌的风险差异无统计学意义(均有P>0.05);对该位点多态性与宫颈癌关系的Meta分析发现,TNF-α rs1800629遗传变异与中国人群宫颈癌的发生无明显相关性。  结论  TNF-α基因rs1800629位点多态性可能与中国人群宫颈癌发生无关。     

ATP2B1-eNOS通路基因多态性与生活方式对青少年血压偏高的交互作用

目的 探索ATP2B1-eNOS通路基因多态性对血压表型的基因-生活方式交互作用,为阐明青少年血压偏高的发生机制提供线索。方法 采用方便整群抽样设计,于2019年7—8月对3所初中872名学生进行问卷调查、人体指标测量和血液样本收集。在外周血液样本提取DNA后,对基因多态性(ATP2B1/rs17249754和rs2070759,eNOS/rs1799983和rs2070744)进行基因分型。采用Logistic回归分析基因多态性与血压表型之间的关联并纳入交互项分析基因多态性与生活方式交互作用。结果 青少年血压偏高的检出率为9.52%(男生9.15%,女生9.87%),性别差异无统计学意义(χ²=0.13,P=0.72)。男生和女生之间年龄、收缩压、舒张压、体质量指数(BMI)分类、出生体重、每日在校体育锻炼时间与每日在家玩电子游戏时间差异均有统计学意义(P值均<0.05)。Logistic回归分析显示,eNOS/rs2070744多态性在隐性模型下与血压偏高存在关联,且CC基因型携带者相较于TT/TC基因型携带者血压偏高的发生风险升高(OR=3.88,95...