基于网络药理学探讨何首乌-丹参治疗阿尔茨海默病的作用机制

目的应用网络药理学方法预测何首乌-丹参抗阿尔茨海默病(AD)的作用靶点及相关信号通路,挖掘其抗AD的作用机制。方法通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)网站检索何首乌-丹参的活性成分及对应的作用靶点,再通过Drugbank数据库、Dis Ge NET数据库和TTD数据库获得AD的主要致病靶点,采用Cytoscape 3.7.1软件构建药物活性成分-靶点网络图,利用STRING数据库构建蛋白与蛋白相互作用网络,然后运用生物信息学的方法对关键靶点进行基因功能分析和通路富集分析,最后采用MTT法、ELISA法、比色法和实时荧光定量PCR法对网络药理学主要预测的生物过程与信号通路进行验证。结果研究共筛选出何首乌-丹参药对的有效成分24个,对应靶点274个,与AD相关靶点共107个,相关信号通路前10条,GO分析相关度前20个靶点分子功能。细胞实验证实了何首乌-丹参能有效提高PC12细胞的细胞存活率及抑制PC12细胞的炎症反应和氧化应激反应,并促进Nrf2/HO-1信号通路的激活。结论何首乌-丹参主要是通过抗炎和抗氧化应激对AD产生重要的治疗作用,为后续临床治疗AD提供新的思路。     

枸杞子干预阿尔茨海默病作用机制的网络药理学研究

目的 利用计算机网络药理学技术分析枸杞子干预阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)的功效作用网络,预测药效作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库(TCMSP)获得并筛选枸杞子的化学成分,多种数据库联合分析活性成分和AD的作用靶点,构建枸杞子活性成分-作用靶点网络图,筛选核心靶点,并进一步进行Cl...     

基于网络药理学探讨覆盆子防治阿尔茨海默病的物质基础与作用机制

目的：运用网络药理学方法探讨覆盆子防治阿尔茨海默病（AD）的主要物质基础与作用机制。方法：收集Drugbank数据库和相关文献中的AD关键治疗靶点,利用TCMSP数据收集构建覆盆子的化学成分库;运用Discovery Studio软件进行分子虚拟对接,筛选出覆盆子中与AD关键靶点结合的化学成分集,再利用KEGG数据库对这些关键靶点进行通路富集分析,建立成分-靶点-通路关系,通过Cytoscape软件构建覆盆子成分-靶点-通路网络图。结果：从覆盆子中筛选出成分50个,其中多数为脂肪类化合物如十三烷、二十六碳醇等,此外还有黄酮类化合物如山奈酚、槲皮素,羧酸类如L-苹果酸、香豆素类如欧前胡素、秦皮乙素,萜类化合物和多酚类等成分。这些成分可能通过调节AKT1、CAMK2A、CAMK2B、CAMK2D,CAMK2G、CHRM1、GLP1R、PDE4A、PDE4B等39个靶蛋白,涉及环磷酸腺苷信号通路、阿尔茨海默病、胆碱能突触等21条信号通路发挥防治AD作用。结论：覆盆子防治AD可能与影响神经细胞胆碱能,影响细胞生长,抗细胞凋亡和抗神经炎性反应等机制有关,其物质基础可能是槲皮素、香草酸、阿魏酸、山...     

基于网络药理学预测白藜芦醇治疗溃疡性结肠炎靶点与分子机制

目的：运用网络药理学方法探寻白藜芦醇治疗溃疡性结肠炎的关键靶点及分子作用机制。方法：通过SwissTargetPrediction数据库查找白藜芦醇的作用靶点;采用GeneCards数据库搜索溃疡性结肠炎的相关蛋白。将白藜芦醇作用靶点和溃疡性结肠炎靶点取交集,即为白藜芦醇治疗溃疡性结肠炎潜在靶点。采用STRING数据库找出靶点的作用关系,使用Cytoscape 3.9.2软件筛选核心靶点。使用基因微生信网站进行GO与KEGG通路富集分析,以Cytoscape3.9.2软件构建“成分-靶点-通路”网络。使用SwissDock进行分子对接。结果：从SwissTargetPrediction得到69个白藜芦醇作用靶点,GeneCards数据库得到的533个溃疡性结肠炎相关靶点,两者取交集后共得到22个白藜芦醇抗溃疡性结肠炎的作用靶点。在蛋白相互作用网络中EGFR、SRC、MMP9、MMP2处于核心位置。在GO富集分析和KEGG通路分析中,EGFR、SRC、MMP9、MMP2均存在于内分泌抵抗、松弛素信号通路、雌激素信号通路中。分子对接结果显示,白藜芦醇与核心靶点均有较强的相互作用。结论：白藜...     

基于网络药理学探讨当归治疗阿尔茨海默病的机制

目的 采用网络药理学的方法,预测当归治疗阿尔茨海默病(AD)的潜在作用靶点及其作用机制。方法通过中药系统药理学(TCMSP)数据库筛选当归的主要活性成分,并在Swiss Target Prediction平台对当归活性成分的作用靶点进行预测。通过Genecads数据库筛选AD的主要靶点,将当归有效成分靶点与AD的主要靶点取交集,得到当归治疗AD的靶点。利用String平台构建蛋白质相互作用(PPI)网络,运用Metascape平台进行基因本体(GO)及代谢途径分析数据库(KEGG)进行富集分析。应用Autodock vina软件对网络药理学结果进行验证。结果经筛选获得西多糖苷、豆甾醇、α-胡麻烯、β-谷甾醇等10种当归治疗AD的有效成分,329个潜在药物靶点,当归有效成分与AD共有靶点75个,Sitogluside,beta-sitosterol,Stigmasterol可能是当归治疗AD的关键活性成分。PPI网络分析显示,AKT1、PTGS2、MAPK14可能是当归治疗AD的核心靶点。通路分析提示当归治疗AD的机制可能与cGMP-PKG信号通路、NF-kB信号通路、神经活性配体-受体...     

基于网络药理学探讨何首乌治疗动脉粥样硬化作用机制

目的:基于网络药理学,探讨何首乌治疗动脉粥样硬化(AS)的作用靶点及通路,明确其作用机制。方法:搜索中医药数据库和文献,从中对何首乌有效成分及靶点蛋白进行筛选整合,在TCMSP数据库和Drugbank数据库中检索并获取何首乌有效成分及作用靶点,在Cytoscape软件中构建何首乌的化合物-靶点网络及其相应的蛋白质相互作用(PPI)网络,并在DAVID数据库中进行基因GO功能和KEGG通路富集分析。筛选出何首乌治疗动脉粥样硬化的有效成分及作用靶点,并绘制靶点通路网络模型。结果:预测得出治疗AS的药物活性成分8个和有效靶点109个,并推断奎硫醇、大黄酸、扁蓄苷等成分具有潜在治疗动脉粥样硬化的作用,如钙调蛋白、醛糖还原酶、胰蛋白酶等靶基因可能起着关键性的作用。结论:基于网络药理学探究了何首乌治疗动脉粥样硬化多活性成分-多作用靶点-多联系通路的特点,进行深入研究,以期为系统阐明何首乌治疗动脉粥样硬化作用机制提供科学依据。     

基于网络药理学探讨柴胡治疗动脉粥样硬化作用机制

目的 基于网络药理学方法探讨柴胡治疗动脉粥样硬化的有效活性成分及靶点的作用机制.方法 该研究运用TCMSP数据库结合筛选条件确定柴胡的主要有效活性成分及其作用靶点,构建主要有效活性成分-靶点网络图.利用GeneCards数据库获取动脉粥样硬化疾病靶点,取柴胡和动脉粥样硬化的交集靶点,对交集靶点进行蛋白质互相作用网络分析...     

基于网络药理学方法探讨地榆治疗结直肠癌的作用机制

目的 基于网络药理学方法探讨地榆治疗结直肠癌的作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台获取地榆的有效活性成分及其作用靶点，利用药物靶标数据库、OMIM^?、GeneCards^?数据库获取结直肠癌的相关靶点。将地榆有效活性成分的作用靶点与结直肠癌的相关靶点取交集，获得共同靶点。将有效活性成分和共同靶点导入Cytoscape 3.7.2软件构建“中药-成分-靶点-疾病”网络。针对共同靶点，使用STRING数据库和Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络，使用Metascape线上软件进行基因本体论(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果 共筛选出9个地榆有效活性成分，包括槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等。获得地榆有效活性成分的作用靶点154个和结直肠癌相关靶点1 908个，取交集后获得共同靶点94个。PPI网络显示，地榆治疗结直肠癌的关键作用靶点包括肿瘤蛋白p53、苏氨酸蛋白激酶(AKT)1、Caspase-3、血管内皮生长因子A及肿瘤坏死因子等。GO功能富集分析结果显示，地榆...     

基于网络药理学及分子对接探讨熟地黄-山茱萸药对治疗阿尔茨海默病的潜在机制

目的 采用网络药理学及分子对接技术探讨熟地黄-山茱萸药对治疗阿尔茨海默病（Alzheimer’s disease, AD）的活性成分和潜在分子机制。方法 通过TCMSP数据库、SwissTargetPrediction平台、GeneCards和DisGeNET数据库及查阅文献收集并获取熟地黄和山茱萸的主要化学成分、作用靶点及AD疾病的相关靶点。将疾病靶点与药物靶点取交集获得熟地黄-山茱萸药对治疗AD的潜在靶点,将这些交集靶点导入STRING数据库,建立蛋白质-蛋白质相互作用（protein-protein interaction, PPI）网络。利用Cytoscape软件对PPI网络进行拓扑分析并提取核心靶点,利用CytoNCA插件计算度值,筛选出药对的关键成分。通过Metascape平台进行GO和KEGG通路富集分析,并构建“中药-相关关键成分-关键靶点-通路”网络,然后使用AutoDock Vina和PyMOL软件对核心靶点和关键成分进行分子对接。结果 筛选出熟地黄-山茱萸药对治疗AD的10个关键成分、718个药物靶点和450个疾病靶点,药物与疾病的共同靶点120个。PPI网络最终...     

基于网络药理学的人参抗抑郁作用机制研究(英文)

抑郁症是一种精神障碍,给患者及其家庭带来沉重负担.近年来,中医药疗法治疗抑郁症得到广泛报道.本研究旨在探讨人参治疗抑郁症的潜在靶点及作用机制.采用网络药理学的技术方法,通过构建"成分-靶点-通路"网络和"蛋白-蛋白相互作用"网络探寻人参治疗抑郁症的有效成分和关键靶点,分析相关机制通路,并对结果进行分子对接验证.结果表明...     

基于网络药理学的清胰化积方治疗胰腺癌的作用机制研究

目的：通过网络药理学研究预测清胰化积方(QYHJ)主要成分作用的靶点,探讨其MAPK信号通路治疗胰腺癌上皮间质化转移的作用机制并选取AMPK信号通路进行动物模型验证。方法：采用BATMAN-TCM数据库查找QYHJ中的主要有效单体及其靶基因,并对QYHJ治疗组与对照组裸鼠肿瘤组织基因测序筛选胰腺癌表达差异基因,经Venn分析筛选靶标基因并对靶标基因KEGG通路分析,构建功能成分治疗胰腺癌的调控机制网络图。结果：共获得QYHJ潜在的7个有效成分,预测成分作用靶标共963个;胰腺癌小鼠肿瘤组织(QYHJ实验组Vs对照组)基因测序得到6039个差异基因。经Venn分析,筛选248个共靶标基因。KEGG通路富集分析发现QYHJ 治疗胰腺癌的作用机制可能与MAPK,FoxO,cAMP,cGMP-PKG等信号通路有关。进一步通过动物模型验证,QYHJ治疗组相比于对照组,MAP2K1(MEK1),MAPK3(ERK),MAP2K3(MKK3)和MAPK13(p38)表达抑制,RNA测序表明MAPK 信号通路参与主要调节,验证了网络药理学的部分预测结果。结论：QYHJ治疗胰腺癌的作用机制与AMPK信号通路有关,MAP2K1(MEK1)、MAPK3(ERK)、MAP2K3(MKK3)和MAPK13(p38)可作为QYHJ治疗胰腺癌过程中的潜在预后因子。     

基于网络药理学的抗肿瘤药物发现策略

肿瘤是受到遗传和环境因素影响的系统性疾病,传统的“一病一靶”的药物研发和治疗方式效果不尽人意。网络药理学是近年来新兴的基于“整体论”的新药研发策略,通过网络构建与分析,可为抗肿瘤新药研发提供新的手段和方法。本文简要介绍将网络药理学研究手段用于药物研究的基本概念,并探讨网络药理学在抗肿瘤药物设计、新靶点发现、药物联用设计等方面的应用。随着系统生物学、计算生物学等相关学科的快速发展,网路药理学将在揭示新的肿瘤治疗靶标、治疗药物组合规律以及耐药性的潜在机制等方面为我们提供重要帮助。     

基于网络药理学的参桂胶囊治疗2型糖尿病作用机制研究

目的：通过网络药理学研究参桂胶囊（SGC）治疗2型糖尿病（T2DM）的作用机制。方法：使用中药系统药理学分析平台（TCMSP）检索SGC中的主要活性成分及靶点,治疗靶标数据库（TTD）、比较毒性基因组学数据库（CTD）、在线孟德尔遗传（OMIM）、GeneCards数据库获取T2DM靶点,进而筛选出中药和疾病的共同靶点。采用Cytoscape3.8.2软件构建“成分-靶点”网络图,并通过Metascape对共同靶点进行GO和KEGG富集分析预测SGC主要作用通路。结果：分析显示SGC中的人参皂苷、咖啡酸、油酸、肉桂醛和β-谷甾醇为主要活性成分,核心靶点有胰岛素（INS）、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子（TNF）、过氧化物酶体增殖物激活受体-γ(PPAR-γ)等。主要涉及低氧诱导因子-1(HIF-1)、晚期糖基化终末产物（AGE）-糖基化终末产物受体（RAGE）信号通路、c AMP信号通路等。结论：揭示了SGC可通过“多成分、多靶点、多途径”作用机制对抗T2DM,为今后研究SGC治疗T2DM提供了文献依据。     

Network pharmacology-based analysis of effective components and mechanism of Rhizoma coptidis in treating diabetes

Objective: To identify the active ingredients, potential targets, and mechanism of Rhizoma coptidis by bioinformatics method, and to explore the hypoglycemic ef...     

基于网络药理学探讨荷丹片治疗高脂血症的作用机制

[目的] 旨在通过网络药理学方法探究荷丹片治疗高脂血症的可能作用机制。[方法] 在中药系统药理学数据库（TCMSP）和中医药百科全书（ETCM）数据库中检索得到荷丹片中5味药材类药成分与作用靶点，借助Uniprot数据库查询靶点对应基因，在DisGeNET数据库搜索得到高脂血症的疾病靶点。利用STRING数据平台构建活性组分-作用靶点和蛋白-蛋白相互作用网络（PPI）的网络图，采用Cytoscape软件构建"中药-活性成分-疾病-靶点"网络，利用DAVID生物信息学资源对相关靶点进行GO功能与KEGG通路富集分析。[结果] 从荷丹片中共筛选出61个活性化合物，对应于281个类药活性成分作用靶点，231个疾病靶点与高脂血症密切相关，其中20个疾病靶点与药物作用靶点重叠，为荷丹片治疗高脂血症具有重要意义的作用靶点。中药-活性成分-疾病-靶点可视化网络图推测发挥调节血脂作用的中药主要是丹参、山楂、补骨脂，其中关键的化合物为Ergosterol、Guercetol、Corylinal等，关键的作用靶点为PTGS1、ADRB2、F2、PPARG等。GO富集分析表明，荷丹片主要参与调节氧化还原酶活性、脂质结合、离子结合、信号转导活性、核酸结合转录因子活性、脂质代谢过程、单一有机体代谢过程、小分子代谢过程、细胞增殖等生命过程。KEGG通路富集分析结果表明，荷丹片通过调节含血清素的神经突触、PPAR信号通路、药物代谢细胞色素P450、花生四烯酸代谢、亚油酸的新陈代谢等多种途径在高脂血症中发挥药理作用。[结论] 本研究揭示了荷丹片治疗高脂血症的可能作用机制，体现了中药复方多成分、多途径、多靶点协同作用的特点，为进一步研究荷丹片治疗高脂血症的机理提供了新的思路和方法。     

白藜芦醇抑制细胞增殖研究新进展

白藜芦醇具有抗癌、抗增生性疾病的作用，近年来，有关其抑制细胞增殖的研究表明白藜芦醇能抑制DNA的复制；干扰细胞周期，使其发生Gl／S与S／G2阻滞；还能干预信号转导通路，拮抗性激素等使细胞生长受阻。白藜芦醇也能通过诱导凋亡导致细胞数减少，从而抑制细胞增殖。     

大黄素治疗类风湿关节炎的作用机制：基于网络药理学方法

目的 基于网络药理学方法,运用在线数据库研究大黄素治疗类风湿关节炎的作用机制,并在成纤维样滑膜细胞细胞系中进行验证。方法 通过Targetnet、SwissTargetPrediction、Genecards、DisGeNET和OMIM数据库,分别获得大黄素作用靶点及类风湿关节炎相关基因,并构建靶点蛋白质相互作用网络（PPI）,对交集基因进行Gene Ontology与KEGG通路富集分析。运用AutoDock4.2.6软件模拟分子对接。将大黄素与经TNF-α诱导的MH7A细胞共同培养,培养分组情况：空白对照组、模型组（TNF-α组,10 ng/mL）、药物干预组（TNF-α 10 ng/mL+Emodin20、40、60、80、100 μmol/L）。采用CCK-8法、细胞划痕实验及流式细胞周期实验探究大黄素对MH7A细胞增殖的抑制作用。通过Western blot观察其NF-κB通路蛋白表达情况,通过Rt-PCR实验分析 CAPS3、PTGS2（COX2）、MAPK14 基因的表达。结果 获得大黄素和类风湿关节炎交集基因32个,其中心节点为CAPS3、ESR1、MAPK14等,主要涉及NF-κB信号通路等。分子对接提示大黄素与核心靶点能较好的结合。实验结果显示,大黄素能明显抑制MH7A细胞过度增殖（P<0.05）。Western blot结果显示,TNF-α诱导的MH7A细胞NF-κB 蛋白表达水平升高（P<0.01）,而予以大黄素80 μmol/L干预后IκBα、p-NF-κB表达水平均有所降低（P<0.01）。Rt-PCR结果显示,TNF-a组COX2、 P38MAPK（MAPK14）核心基因的表达量明显上调,而大黄素（80 μmol/L）处理后各组COX2、P38MAPK14的mRNA表达下降mRNA的表达下降（P<0.01）,凋亡相关基因CASP3上调。结论 大黄素通过调控细胞增殖凋亡,调节NF-κB等信号通路等发挥治疗类风湿关节炎作用。     

白藜芦醇对帕金森病大鼠的保护作用及机制研究

目的观察白藜芦醇对帕金森病大鼠的保护作用,并探讨其可能机制。方法应用6-OHDA纹状体内注射制作PD模型大鼠,将模型成功大鼠随机分为4组：模型组及白藜芦醇（10,20。40mg/kg/d）治疗组,并设假手术组及正常给药组（白藜芦醇20mg／kg/d）,每日口服给药一次,连续10周,给药过程中每周进行一次行为学检测。电镜下观察黑质神经元超微结构改变,RT—PCR法检测大鼠黑质部caspase－3 mRNA的表达。结果①白藜芦醇能改善大鼠的旋转行为;②白藜芦醇能减轻6-OHDA诱导的帕金森病大鼠黑质多巴胺能神经元的变性;③白藜芦醇抑制大鼠黑质中caspase－3 mRNA的表达。结论白藜芦醇对帕金森病大鼠产生保护作用,其机制可能与caspase-3 mRNA的表达下调有关。     

盐酸多奈哌齐联合美金刚对阿尔茨海默病患者认知及生活能力改善的研究

目的观察盐酸多奈哌齐联合美金刚对阿尔茨海默病患者认知及生活能力的改善作用。方法将阿尔茨海默病患者48例按随机数字表法分为2组,各24例。对照组接受盐酸多奈哌齐治疗,观察组接受盐酸多奈哌齐联合美金刚治疗,疗程12周,每4周进行1次随访。治疗前后采用阿尔茨海默病评价量表—认知分量表(ADAScog)、神经精神科问卷(NPI)、日常生活能力量表(ADL)、痴呆行为量表(BEHAVE-AD)、简明智能量表(MMSE)对患者进行评估,并观察不良反应发生情况。结果 2组患者治疗前各项评分差异无统计学意义(P>0.05)。治疗12周后,观察组与对照组的ADAS-cog评分、NPI评分、ADL评分、BEHAVE-AD评分均有所下降(P<0.05),MMSE评分均有上升(P<0.05),且观察组各表评分改善较对照组更明显,2组比较差异均有统计学意义(P<0.05)。对照组发生不良反应2例(8.33%),观察组未见明确不良反应。结论盐酸多奈哌齐联合美金刚对阿尔茨海默病患者的认知及生活能力有明显改善作用,治疗效果优于单用盐酸多奈哌齐治疗。