乌蔹莓对溃疡性结肠炎治疗靶点及机制研究：网络药理学研究

[目的]采取网络药理学与分子对接技术探究乌蔹莓治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis, UC)的潜在靶点及机制。[方法]从TCMSP数据库中筛选出乌蔹莓有效活性成分,获得其药物靶标,通过GeneCards数据库、NCBI基因数据及OMIM数据库检索UC疾病相关靶点。将乌蔹莓活性化合物相关靶点与UC疾病靶点互相映射得到交集靶点,作为乌蔹莓治疗UC的潜在靶点。运用R 3.6.3软件及相应程序包对交集靶点进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析。通过MCODE分析进行基因簇的分析以及核心靶点的筛选,通过Cytoscape3.8.0软件和String数据库构建乌蔹莓的潜在活性成分-潜在基因-通路网络和PPI网络。最后进行分子对接验证。[结果]共得到5种活性成分,54个药物靶标基因简称,2 304个UC相关靶点,75个乌蔹莓-UC交集靶点和交集靶点对应的5个潜在活性成分。GO功能富集分析得到包括生物过程(BP)1 684个,细胞组成(CC)40个和分子功能(MF)81个。KEGG功能富集分析得到79条通路,结果提示缺氧诱导因子HIF-1信号通路、p53信号通路、细胞凋亡、PI3...     

基于网络药理学及分子对接探究党参治疗射血分数保留性心力衰竭的分子机制

目的:基于网络药理学及分子对接预测党参治疗射血分数保留性心力衰竭的相关靶点及信号通路,探讨其发挥治疗作用的潜在机制。方法:利用中药系统网络药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索党参的有效成分;通过Swiss Target Prediction数据库预测其潜在靶点;通过检索DisGeNET数据库获得射血分数保留性心力衰竭的相关靶点后,构建“药物-疾病”共同靶点韦恩图;使用Cytoscape 3.7.2软件构建“党参-有效成分-潜在靶点”网络;利用STRING数据库构建靶蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图;借助Cytoscape软件获取核心成分、关键靶点;利用Metascape数据库进行基因本体(GO)功能与京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;采用分子对接将核心成分与关键靶点进行结果验证。结果:筛选获得党参作用于射血分数保留性心力衰竭有效成分16个,疾病共同靶点116个,关键靶点5个;GO功能富集获得党参治疗射血分数保留性心力衰竭生物学过程主要富集在丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)级联反应的正调控、循环系统过程、激素水平的调节、调节离子传输、细胞对氮化合物的反应等;KEG...     

基于网络药理学与分子对接研究四逆散治疗肝癌的作用机制

目的联合网络药理学-分子对接研究四逆散治疗肝癌的作用机制。方法运用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)获取四逆散的化合物及靶标,通过Uniprot获取对应的基因Symbol;从人类基因数据库获取肝癌的疾病基因,并筛选出与四逆散靶标基因的交集基因;运用Cytoscape3.7.1软件绘制"中药-化合物-治疗靶标"网络图;运用STRING构建蛋白质相互作用(PPI)网络、R studio软件对治疗靶标进行GO和KEGG富集分析,并对结果进行可视化;选择靶点数目最多的活性成分作为配体,PPI网络中度值(Degree)最大的靶点作为受体,预测受体-配体复合物结构与相互结合的氨基酸残基。结果研究筛选得到四逆散治疗肝癌核心靶标91个,相关活性成分141种,其中槲皮素、山柰酚等为四逆散治疗肝癌的主要活性成分; TP53、HSP90AA1等是治疗主要作用靶标; GO富集分析后共获得符合筛选标准的条目1007条,主要涉及抗氧化反应、蛋白丝氨酸-苏氨酸激酶活性调控、细胞应激反应等多个生物过程,KEGG富集分析共获得102条,主要调控乙型肝炎通路、PI3K-Akt信号通路以防治肝癌,分子对接结果验证槲皮素-TP53的VAL147、CYS220、GLU221、PRO222等晶体结构域的协同抗癌效应。结论本研究揭示了四逆散作用于多靶点、多信号通路治疗肝癌的作用机制,为生物实验提供理论基础。     

基于网络药理学和分子对接探讨巴戟天抗动脉粥样硬化的靶点及信号通路

[目的]应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及小分子药物靶点预测在线平台(Swiss Target Prediction)和疾病基因组数据库,结合分子对接技术,预测巴戟天抗动脉粥样硬化(As)的靶点及信号通路。[方法]通过中药网络药理学数据库及小分子药物靶点预测在线平台挖掘巴戟天的有效成分及其所对应的靶点,利用GeneCards、OMIM、Disgenet、UniProt收集并筛选As相关的疾病基因靶点,获取交集基因,将其导入String 11.5数据库中,构建疾病-药物蛋白互作分析(String-PPI)网络图,利用Cytoscape 3.9.1软件对关键靶点网络进行可视化;此外,运用Metascape网络在线平台进行GO、KEGG富集挖掘出其抗As的分子靶点,并通过KEGG数据库绘制通路图。最后,使用Autodock vina 1.1.2软件对核心化合物及核心靶点基因进行分子对接验证。[结果]通过以上数据库共收集得到包括β-谷甾醇和蒽醌在内的17个有效药物化合物、73个核心靶点和1 450个关键疾病基因;取交集后得到巴戟天治疗As的35个核心基因;经String-PPI...     

基于网络药理学与分子对接探讨失笑散治疗冠心病的作用机制

目的:基于网络药理学及分子对接技术探讨失笑散治疗冠心病的作用机制。方法:收集TCMSP及BATMAN-TCM、HERB数据库,分别检索蒲黄和五灵脂的化学成分及靶点,运用Cytoscape 3.9.0软件构建药物-活性成分-潜在靶点网络图。通过GeneCards、OMIM、TTD数据库筛选冠心病相关的靶点。利用Venny图获取疾病-药物交集靶点,并将其上传至STRING数据库,进一步通过Cytoscape 3.9.0软件绘制核心蛋白-蛋白互作(PPI)网络图。采用Metascape平台对交集靶点进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。利用AutoDockTools-1.5.7软件对核心成分与核心靶点进行分子对接,采用PyMOL软件进行可视化。结果:经筛选后获得失笑散核心成分为槲皮素、山柰酚、异鼠李素等;核心靶点包括蛋白激酶B(AKT1)、细胞肿瘤抗原p53(p53)、热休克蛋白90α家族A类成员1(HSP90AA1)等。KEGG通路富集的主要通路为环磷酸腺苷(cAMP)信号通路、核因子-κB(NF-κB)信号通路等。分子对接验证显示：多数核心成分与核心靶点具有...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨四妙勇安汤治疗冠心病的作用机制

目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨四妙勇安汤治疗冠心病(CHD)的潜在作用机制。方法:应用中药系统药理学技术平台(TCMSP)筛选四妙勇安汤的药物有效活性成分及作用靶点,应用全球蛋白质资源(UniProt)数据库对基因标准化处理。通过GeneCards数据库和在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库检索冠心病的有关靶点,将药物有效活性成分靶点与冠心病的相关靶点进行映射,取交集即为四妙勇安汤治疗冠心病的潜在靶点。使用Cytoscape 3.7.2软件构建四妙勇安汤治疗冠心病的“药物-成分-疾病-靶点”网络图,运用生物分子功能注释系统(STRING)数据库及Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络图,并筛选核心靶点。利用DAVID数据库对得到的交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并利用AutoDock及PyMOL等软件进行分子对接验证及结果的可视化分析。结果:共得到四妙勇安汤治疗冠心病的活性成分127个、相关靶点137个、交集靶点120个。四妙勇安汤治疗冠心病的生物过程涉及对缺氧的反应、一氧化氮生物合成过程的...     

基于健脾法和网络药理学探讨“茯苓-白术”药对治疗非酒精性脂肪性肝病的作用机制

目的:基于健脾法,借助网络药理学探讨“茯苓-白术”药对(FB)治疗非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的作用机制。方法:通过TCMSP与Swiss Target Prediction数据库获取茯苓与白术的活性成分及作用靶点,利用GeneCards和DisGeNET数据库检索NAFLD相关靶点,将上述交集靶点输入STRING数据库,从而获取蛋白质互作关系网络。运用DAVID6.7数据库进行GO与KEGG富集分析,Cytoscape 3.7.2软件构建“药对成分-异常靶点-通路”网络图,AutoVina软件进行分子对接。结果:共得到20个活性成分,206个潜在靶点、2 088个疾病靶点,88个交集靶点。GO富集主要涉及类固醇激素介导的信号通路、RNA聚合酶Ⅱ对转录的正调控、细胞对缺氧的反应等,KEGG主要与胰岛素信号通路、PPAR信号通道和胰岛素抵抗等相关。网络分析结果表明,FB治疗NAFLD的核心成分为齿孔酸、多孔菌酸C、茯苓酸C、去氢齿孔酸,核心靶点为TNF、MAPK3、PIK3CA、NR1H3。分子对接结果显示核心靶点与核心成分的结合能均小于≤-5.0 kcal/mol,展现出较好的亲和...     

基于网络药理学及分子对接技术探讨五苓散治疗慢性心力衰竭的作用机制

目的应用网络药理学及分子对接技术探讨五苓散治疗慢性心力衰竭(CHF)的作用机制。方法在中药系统药理学技术平台(TCMSP)检索五苓散主要成分及对应靶点;检索GeneCards、TTD、DrugBank、DisGeNET数据库,筛选CHF相关靶点;取疾病与药物交集靶点,构建韦恩图;应用Cytoscape 3.8.0软件建立五苓散药物-活性成分-靶点网络及药物成分-交集靶点网络,获得关键化合物;应用STRING平台构建交集靶点蛋白-蛋白相互作用(PPI)的网络图,分析网络图得到关键靶点;应用Metascape数据库对交集基因进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。比较关键靶点及KEGG通路富集基因,选取主要靶点蛋白及关键化合物,应用CB-Dock平台进行分子对接验证。结果通过口服生物利用度(OB)及生物活性分子类药性(DL)筛选得到五苓散共有46个活性成分,共涉及63个作用靶点,与CHF重合的靶点有36个,得到谷甾醇、3β-乙酰氧基-白术酮、二氢槲皮素等10个关键化合物,NOS3、CASP3、PTGS2等10个关键靶点。GO分析得到与循环系统、细胞膜成分及蛋白质相关的注释条目。KEGG通路富集通路主要包括AGE-RAGE信号通路、细胞凋亡、白细胞介素-17(IL-17)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路等。分子对接结果显示,五苓散关键化合物与新型利尿剂托伐普坦,与治疗靶点均具有良好结合活性。结论五苓散包括多个活性成分,作用于多个靶点,通过抑制细胞凋亡、氧化应激、心肌重构、炎症通路等多种机制作用于CHF,体现了中药治疗疾病多成分、多靶点、多途径的特点。     

基于网络药理学探讨附子理中汤治疗非酒精性脂肪性肝病作用机制

目的:运用网络药理学方法分析附子理中汤(FZLZD)治疗非酒精性脂肪肝性病(NAFLD)的潜在作用机制。方法:检索TCMSP数据库筛选出FZLZD药物活性成分及作用靶点,并借助Uniprot平台进行靶点蛋白规范化处理。检索GeneCards与OMIM数据库得到NAFLD靶点基因,进一步获取药物和疾病共有靶点,即为FZLZD治疗NAFLD的潜在靶点基因。利用Cytoscape 3.7.2绘制药物活性成分-靶点-疾病网络图,利用Cytoscape 3.7.2结合String数据库构建蛋白互作(PPI)网络,利用Metascape数据库对共有靶点进行GO和KEGG富集分析。结果:最终筛选出80种药物活性成分、43个潜在作用靶点;富集分析获取808个生物学过程及25条与NAFLD相关信号通路。结论:FZLZD通过多成分-多靶点-多信号通路协同调控NAFLD。     

半夏泻心汤治疗幽门螺杆菌相关性胃炎作用机制的网络药理学分析北大核心CSCD

目的为了探究半夏泻心汤治疗幽门螺杆菌相关性胃炎作用机制,应用网络药理学方法分析半夏泻心汤治疗幽门螺杆菌相关性胃炎(HAG)的主要活性化合物、潜在靶点和相关通路。方法运用中药系统药理学分析平台(TCMSP)对半夏泻心汤药物活性化合物及药物作用靶点基因进行筛选。通过GeneCards数据库和OMIM数据库收集HAG疾病相关靶点,对药物作用靶点及疾病相关靶点进行韦恩分析,确定药物作用潜在靶点;应用Cytoscape 3.6.1软件以及String数据库分别构建"药物-化合物-潜在靶点"相互作用网络及蛋白相互作用(PPI)网络图。运用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体(GO)功能,京都基因及基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果终筛选出槲皮素、山柰酚和汉黄芩素等150种药物活性化合物,涉及SATA3、TP53、MAPK1等109个潜在靶点以及PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、FoxO信号通路等96条作用通路。结论半夏泻心汤治疗HAG通过多成分、多靶点、多途径发挥其抑菌、抗炎、调控癌症进展的作用。     

川芎抗动脉粥样硬化作用机制的网络药理学与分子对接技术研究

目的使用网络药理学与分子对接技术探究川芎抗动脉粥样硬化的作用机制。方法运用中药系统药理(TCMSP)数据库筛选川芎的活性成分及质控成分,通过Swiss Target Prediction预测药物靶点。在DrugBank和DisGeNET数据库筛选出动脉粥样硬化的相关靶点。通过STRING构建靶点蛋白互作网络,运用Cytoscape绘制网络并进行拓扑学分析。使用Omicshare对相关靶点进行GO富集分析与KEGG富集分析。运用DockThor进行分子对接。结果获得川芎抗动脉粥样硬化的167个相关治疗靶点,通过网络拓扑分析发现钙敏感受体、丝裂原活化蛋白激酶3等46个靶点为核心靶点。GO富集分析发现川芎在生物过程、分子功能、细胞组成多方面影响动脉粥样硬化的发生发展。KEGG通路富集分析发现,川芎可能通过调节神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路等多条代谢通路来发挥抗动脉粥样硬化的作用。结论运用网络药理学的方法证实了川芎抗动脉粥样硬化具有多途径、多靶点作用的特点。预测了川芎抗动脉粥样硬化的可能机制,为其后续基础研究提供了参考和理论依据。     

基于网络药理学与分子对接技术探究三棱-莪术药对治疗动脉粥样硬化的作用机制

[目的]运用网络药理学与分子对接技术探究三棱-莪术药对治疗动脉粥样硬化(As)的作用机制。[方法]通过TCMSP、Swiss Target Prediction、STRING数据库和Cytoscape软件发现并探究相关治疗靶点的作用关系,通过Omicshare平台进行GO富集分析与KEGG通路富集分析,运用DockThor平台进行分子对接。[结果]研究结果发现158个相关治疗靶点,其中丝氨酸/苏氨酸激酶1、SRC原癌基因、肿瘤坏死因子、丝裂原激活蛋白激酶3、白细胞介素6等49个靶点为核心靶点。GO富集分析发现三棱-莪术药对可以在多方面影响As的发生发展。KEGG通路富集分析发现,三棱-莪术药对可能通过C型凝集素受体信号通路、癌症通路等多条代谢通路来发挥治疗As的作用。分子对接显示靶点TNF与常春藤皂苷元的结合活性最高。[结论]三棱-莪术药对治疗As的作用机制复杂,主要通过C型凝集素受体信号通路、癌症通路等多条代谢通路发挥作用。     

Network pharmacology-based screening of the active ingredients and mechanisms of Huangqi against aging

Studies have shown that Huangqi (HQ) has anti-aging efficacy. However, its active ingredients and mechanisms for anti-aging are still unclear. In this study, we will systematically screen the active ingredients of HQ and explore the possible mechanism of HQ in prevention from aging through network pharmacology technology.The main active ingredients of HQ were obtained from Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform (TCMSP). The possible targets were predicted by TCMSP. The related targets for aging were obtained from GeneCards (The Human Gene Database) and Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) database. The common targets of HQ and aging were obtained using R 3.6.3 software. The protein–protein interaction (PPI) network and the ingredient-target-disease network were constructed using Cytoscape 3.7.2 software for visualization. In addition, the Gene Ontology (GO) functional enrichment and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway annotation of potential targets were performed using R 3.6.3 software.Based on the screening conditions, 16 active ingredients and 28 drug targets were obtained. The PPI network contained 29 proteins, including PTGS2, AR, NOS2, and so on. GO functional enrichment analysis obtained 40 GO items (P < .05). KEGG pathway enrichment analysis obtained 110 aging related pathways (P < .05), including hypoxia inducible factor 1 signaling pathway, PI3K-Akt signaling pathway, AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complication, among others.Sixteen effective ingredients of HQ and 28 targets against aging were identified through network pharmacology. Multiple pathways were involved in the effect of HQ on preventing aging.     

To explore the Radix Paeoniae Rubra-Flos Carthami herb pair's potential mechanism in the treatment of ischemic stroke by network pharmacology and molecular docking technology

To explore the Radix Paeoniae Rubra-Flos Carthami herb pair''s (RPR-FC) potential mechanism in treating ischemic stroke (IS) by network pharmacology and molecular docking technology.The Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database was used to screen the active components of the RPR-FC, and Cytoscape 3.8 software was used to construct a network map of its active components and targets of action. The GeneCards and OMIM databases were used to identify disease targets of IS, and the common targets were chosen as research targets and imported into the STRING database to construct a protein–protein interaction network map of these targets. R language software was used to analyze the enrichment of GO terms and KEGG pathways, and explore the mechanisms of these targets. Molecular docking technology was used to verify that the RPR-FC components had a good bonding activity with their potential targets.A total of 44 active components, which corresponded to 197 targets, were identified in the RPR-FC. There were 139 common targets between the herb pair and IS. GO functional enrichment analysis revealed 2253 biological process entries, 72 cellular components entries, and 183 molecular functions entries. KEGG pathway enrichment analysis was mainly related to the NF-kappa B signaling pathway, the TNF signaling pathway, apoptosis, the MAPK signaling pathway, the PI3K-Akt signaling pathway, the VEGF signaling pathway, etc. The molecular docking results showed the components that docked well with key targets were quercetin, luteolin, kaempferol, and baicalein.The active components (quercetin, luteolin, kaempferol, and baicalein) of the RPR-FC and their targets act on proteins such as MAPK1, AKT1, VEGFA, and CASP3, which are closely related to IS.¹ These targets are closely related to the NF-kappa B signaling pathway, the MAPK signaling pathway, the PI3K-Akt signaling pathway, the VEGF signaling pathway, and other signaling pathways. These pathways are involved in the recovery of nerve function, angiogenesis, and neuronal apoptosis and the regulation of inflammatory factors, which may have a therapeutic effect on IS.     

Prediction and validation of potential molecular targets for the combination of Astragalus membranaceus and Angelica sinensis in the treatment of atherosclerosis based on network pharmacology

Since the 20^th century, mortality rate due to cardiovascular diseases has increased, posing a substantial economic burden on society. Atherosclerosis is a common cardiovascular disease that requires urgent and careful attention. This study was conducted to predict and validate the potential molecular targets and pathways of Astragalus membranaceus and Angelica sinensis (A&A) in the treatment of atherosclerosis using network pharmacology. The active ingredients of A&A were obtained using the TCMSP database, while the target genes of atherosclerosis were acquired using 2 databases, namely GeneCards and DrugBank. The disease-target-component model map and the core network were obtained using Cytoscape 3.8.2 and MCODE plug-in, respectively. The core network was then imported into the STRING database to obtain the protein-protein interaction (PPI) network diagram. Moreover, gene ontology (GO) and Kyoto encyclopedia of genes and genomes (KEGG) enrichment analyses were performed using the HIPLOT online website. Finally, the small molecules related to key signaling pathways were molecularly docked and visualized. Under the screening conditions of oral bioavailability ≥ 30% and drug-likeness ≥ 0.18, 22 active ingredients were identified from A&A, and 174 relevant targets were obtained. Additionally, 54 active ingredients were found in the extracted core network. Interleukin (IL)-17 signaling pathway, tumor necrosis factor (TNF) signaling pathway, and Toll-like receptor (TLR) signaling pathway were selected as the main subjects through KEGG enrichment analysis. Core targets (RELA, IKBKB, CHUK, and MMP3) and active ingredients (kaempferol, quercetin, and isorhamnetin) were selected and validated using molecular docking. This study identified multiple molecular targets and pathways for A&A in the treatment of atherosclerosis. A&A has the potential to treat atherosclerosis through an antiinflammatory approach.     

基于网络药理学探讨人参-钩藤药对治疗原发性高血压的作用机制

目的基于网络药理学探究人参-钩藤药对治疗原发性高血压有效成分的靶基因及作用机制。方法通过中药系统药理学数据库(TCMSP)中药数据库检索人参-钩藤药对的化学成分和靶基因,以生物利用度(OB)>30%和类药性(DL)>0.18为条件筛选药对的潜在有效成分,并通过TCMSP数据库预测药对的潜在靶点。运用Uniprot数据库寻找到潜在靶点相对应的人类基因名称,通过GeneCards数据库检索原发性高血压的疾病靶点,与药对的潜在靶点相映射,绘制韦恩图,将映射找到的有效成分的靶基因导入Cytoscape 3.7.2构建疾病-药对-成分-靶点网络图。利用STRING数据库构建蛋白互作网络图选出核心靶标,最后将人参-钩藤药对治疗原发性高血压的有效靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果共获得人参-钩藤药对46个有效成分和176个有效靶点。GO分析发现,主要途径有调控核受体活性、转录因子活性、肾上腺素能受体活性、类固醇激素受体活性、G蛋白偶联胺受体活性等。KEGG通路富集分析发现,主要通路为丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、白细胞介素-17(IL-17)信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路等。结论人参-钩藤药对通过多种靶点、多种途径、多种信号通路协同发挥治疗原发性高血压的作用,为进一步药物作用机制的研究提供理论基础,并为指导临床提供依据。     

苦参汤治疗隐孢子虫病的潜在靶标及协同作用机制研究

目的　采用网络药理学方法和分子对接技术探究苦参汤治疗隐孢子虫病的潜在作用靶标及协同作用机制。方法　检索中药系统药理学数据库与分析平台（Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform, TCMSP）及蛋白质信息数据库（The Universal Protein Resource, UniProt）,获取苦参汤主要活性成分并预测其潜在靶标。检索中国知网、万方数据、中国生物医学文献数据库（CBM）、PubMed和Web of Science数据库,对TCMSP数据库未收录的成分加以补充,利用TargetNet数据库在线预测所补充活性成分的靶标基因。应用Cytoscape软件进行网络构建与分析,在比较毒物遗传学数据库和GeneCards数据库中检索隐孢子虫病相关疾病靶标。基于STRING数据库构建靶标蛋白质⁃蛋白质相互作用网络（PPI）,采用DAVID数据库进行基因本体（GO）功能富集分析及京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路注释分析,采用BioGPS数据库定位关键靶标的组织器官分布,应用AutoDockTools软件进行分子对接模拟验证。结果　共筛选出苦参汤活性成分38种,其中核心成分为槲皮素、（+）⁃14α⁃羟基苦参碱、芹菜素等。预测得到831个苦参汤相关靶标及512个隐孢子虫病相关靶标。PPI网络分析发现AKT1、TNF、IL⁃6等69个关键靶标。苦参汤治疗隐孢子虫病可能与303个生物进程、46种分子功能、29种细胞组分相关,Toll样受体（TLR）、核因子kappa B（NF⁃ĸB）、核苷酸结合寡聚化结构域样受体（NLR）信号通路等13条KEGG通路在多靶标协同作用下发挥治疗作用。进一步分析发现,核心靶标主要分布于血液和免疫系统。分子对接显示,活性成分与关键靶标对接的结合能均小于0 kJ/mol,配体与受体结合紧密。结论　苦参汤中槲皮素、（+）⁃14α⁃羟基苦参碱、芹菜素等活性成分可能作用于AKT1、TNF、IL⁃6等靶标,进而调控TLR、NLR、NF⁃κB等信号通路,并主要在血液免疫系统中协同发挥对隐孢子虫病的治疗作用。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨瓜蒌薤白半夏汤治疗冠心病的作用机制

目的基于网络药理学探讨瓜蒌薤白半夏汤治疗冠心病的作用机制。方法检索中药系统药理学技术平台(TCMSP)数据库中各中药化合物,并将化合物的靶蛋白信息导入UniProt网站进行基因名转换。将整合的数据导入Cytoscape 3.5.1软件,构建“中药-化合物-靶点”可视化网络图。登录DisGeNET、GeneCards、DrugBank、OMIM、GAD、TTD数据库对冠心病基因靶点进行检索,并将疾病与药物的交集靶点录入STRING网站构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络,对节点信息进行分析与计算后筛选得到核心靶点。将靶点基因导入Metascape网站进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,同时对通路进行预测。运用AutoDock 4.2、PyMOL 2.3.2软件对核心靶点进行分子对接验证。结果共筛选出瓜蒌薤白半夏汤包含的32种化合物,度值较高的是β-谷甾醇、豆甾醇、柚皮素等。通过Cytoscape 3.5.1软件构建的PPI网络包含98个节点、1318条边,核心靶点为前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、磷脂酰肌醇3-激酶催化亚基a(PIK3CA)、基质金属蛋白酶2(MMP2)、血管内皮生长因子A(VEGFA)等。通过GO及KEGG富集筛选出与冠心病相关的磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)等10条核心通路,并采用分子对接方法对结果进行了验证。结论柚皮素、β-谷甾醇、豆甾醇、松柏苷、槲皮素可能是瓜蒌薤白半夏汤治疗冠心病发挥关键作用的化合物,可能通过作用于PTGS2、PIK3CA、MMP2、VEGFA等靶点对肾素-血管紧张素系统(RAS)、RAS相关蛋白-A(Rap1)、血管内皮生长因子(VEGF)等通路进行调控,而PI3K-Akt可能是瓜蒌薤白半夏汤治疗冠心病的核心通路。