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 共查询到19条相似文献,搜索用时 328 毫秒
1.
目的 构建慈丹胶囊活性成分-作用靶点网络和蛋白相互作用网络,对靶点涉及的功能以及通路进行分析,探讨慈丹胶囊抗肝癌作用机制。方法 通过TCMSP数据库(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform, http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php)挖掘获取慈丹胶囊中丹参、当归、黄芪、莪术、鸦胆子、马钱子、冰片、牛黄、山慈菇的主要活性成分。利用GeneCard数据库(http://www.genecards.org/)和OMIM数据库 (Online Mendelian Inheritance in Man,http://www.omim.org/)预测和筛选慈丹胶囊活性成分对应靶点中与肝细胞癌相关靶点。采用Cytoscape构建活性成分-作用靶点网络,采用String数据库(http://string-db.org/)和Cytoscape软件绘制蛋白相互作用网络。采用DAVID数据库(The Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery,https://david.ncifcrf.gov/)对靶点进行GO (Gene ontology) 及KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes )通路分析。结果 筛选得到慈丹胶囊活性成分24个,共得100个作用靶点。网络分析结果表明,慈丹胶囊主要涉及细胞过程、生物调控、代谢过程、对化学刺激反应等生物过程。靶点通路分析结果显示,慈丹胶囊抗肝癌作用的靶点主要涉及TNF、PI3K-Akt、MAPK等信号通路。结论 慈丹胶囊抗肝癌作用具有多成分、多靶点、多通路的特点,其可能通过调节TNF、PI3K-Akt、MAPK等相关通路发挥作用。  相似文献   

2.
目的 利用网络药理学和分子对接技术阐明金丹健肝胶囊治疗肝纤维化可能的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库分析平台(http://tcmspw.com/tcmsp.php)和HERB数据库(http://herb.ac.cn)检索金丹健肝胶囊活性成分和靶点,通过DisGeNET、药物靶点数据库(Therapeutic Target Database, TTD)筛选肝纤维化疾病靶点;将金丹健肝胶囊活性成分的药物靶点与疾病靶点匹配,所得共同靶点导入STRING数据库平台构建蛋白质相互作用(protein protein interaction, PPI)网络;利用Cytoscape3.9.1软件CytoNCA工具进行拓扑分析,筛选关键靶点;应用Cytoscape3.9.1软件构建“中药-关键活性成分-关键靶点”网络图;通过DAVID平台(https://david.ncifcrf.gov)对关键靶点进行KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)富集分析;采用LeDock软件对活性成分与靶点进行分子对接验证。结果 筛选获得金丹健肝胶囊180个...  相似文献   

3.
[目的]运用网络药理学的方法,探究当归补血汤作为化疗后辅助用药治疗肺癌的可能作用机制。[方法]通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库查询当归补血汤中的成分,并通过口服生物利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18,筛选出活性成分,通过中药成分靶点数据库(HIT)及Swiss Target Prediction Database进行成分靶点的垂钓,通过Therapeutic Target Database(TTD)、Drugbank、DisGeNET数据库查询肺癌相关靶点,利用Cytoscape 3.2.1构建成分-靶点等多层次网络图。使用DAVID数据库对当归补血汤辅助治疗肺癌的潜在作用靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。[结果]当归补血汤中共筛选得到27个活性成分,其中23个属于黄芪,4个属于当归,黄芪中的山奈酚、槲皮素、芒柄花素可能是辅助治疗肺癌比较重要的成分,微管相关蛋白Tau(MAPT)、细胞色素P450 19A1(CYP19A1)、雌激素受体α(ESR1)可能是当归补血汤辅助治疗肺癌比较重要的潜在作用靶点。GO富集分析显示,靶点涉及到170个生物过程相关条目、30个细胞组成相关条目、54个分子功能相关条目。KEGG通路富集分析显示,癌症通路(pathwanys in cancer)、癌症蛋白聚糖(proteoglycans in cancer)、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B信号通路(PI3K-Akt signaling pathway)等是比较重要的通路。[结论]当归补血汤中的活性成分山奈酚、槲皮素、芒柄花素可能通过作用于MAPT、CYP19A1、ESR1发挥辅助治疗肺癌的作用,为进一步研究其辅助治疗肺癌的作用机制奠定基础。  相似文献   

4.
目的 通过网络药理学和生物信息学方法探究西黄丸治疗肝癌的潜在作用机制。方法 利用TCMSP、化学专业数据库和SwissADME数据库筛选西黄丸活性成分,通过SwissTargetPrediction数据库预测活性成分对应靶点,GEPIA数据库分析靶点基因在肝癌组织与正常组织的表达差异,通过DAVID数据库对差异表达基因进行GO功能和KEGG通路富集分析,借助STRING和Cytoscape3.9.0软件构建靶点蛋白相互作用网络,并筛选核心靶点;采用Kaplan-Meier Plotter数据库分析核心基因与肝癌患者预后的相关性,运用CB-Dock工具进行分子对接验证。结果 共筛选得到194个活性成分,147个差异表达靶点基因(上调靶点基因89个、下调靶点基因58个)。GO功能分析得到生物过程19个、细胞组分13个、分子功能16个。KEGG通路富集得到9条信号通路,主要涉及调控细胞周期、孕酮介导的卵母细胞成熟、细胞色素P450对外源性药物代谢、视黄醇代谢等。靶点蛋白相互作用网络及生存分析得到MAPK3、CDK1、PLK1等8个与肝癌患者预后密切相关的核心靶点基因。分子对接结果显示,洋椿苦...  相似文献   

5.
[目的] 旨在通过网络药理学方法探究荷丹片治疗高脂血症的可能作用机制。[方法] 在中药系统药理学数据库(TCMSP)和中医药百科全书(ETCM)数据库中检索得到荷丹片中5味药材类药成分与作用靶点,借助Uniprot数据库查询靶点对应基因,在DisGeNET数据库搜索得到高脂血症的疾病靶点。利用STRING数据平台构建活性组分-作用靶点和蛋白-蛋白相互作用网络(PPI)的网络图,采用Cytoscape软件构建"中药-活性成分-疾病-靶点"网络,利用DAVID生物信息学资源对相关靶点进行GO功能与KEGG通路富集分析。[结果] 从荷丹片中共筛选出61个活性化合物,对应于281个类药活性成分作用靶点,231个疾病靶点与高脂血症密切相关,其中20个疾病靶点与药物作用靶点重叠,为荷丹片治疗高脂血症具有重要意义的作用靶点。中药-活性成分-疾病-靶点可视化网络图推测发挥调节血脂作用的中药主要是丹参、山楂、补骨脂,其中关键的化合物为Ergosterol、Guercetol、Corylinal等,关键的作用靶点为PTGS1、ADRB2、F2、PPARG等。GO富集分析表明,荷丹片主要参与调节氧化还原酶活性、脂质结合、离子结合、信号转导活性、核酸结合转录因子活性、脂质代谢过程、单一有机体代谢过程、小分子代谢过程、细胞增殖等生命过程。KEGG通路富集分析结果表明,荷丹片通过调节含血清素的神经突触、PPAR信号通路、药物代谢细胞色素P450、花生四烯酸代谢、亚油酸的新陈代谢等多种途径在高脂血症中发挥药理作用。[结论] 本研究揭示了荷丹片治疗高脂血症的可能作用机制,体现了中药复方多成分、多途径、多靶点协同作用的特点,为进一步研究荷丹片治疗高脂血症的机理提供了新的思路和方法。  相似文献   

6.
目的 基于网络药理学和分子模拟对接技术探究苦黄颗粒治疗自身免疫性肝炎(autoimmune hepatitis,AIH)的活性成分和作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)获取苦黄颗粒中5味药材的化学成分和作用靶点,并重新纳入药典标记的关键成分;通过PubChem数据库和String平台获得活性化合物的作用靶点,同时采用GeneCards和DisGeNET数据库获得AIH相关基因,两者取交集获得共有靶点,并经Cytoscape软件将结果可视化,通过网络拓扑算法获得核心化合物和核心靶点;通过String平台构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络获得苦黄颗粒治疗AIH的重要靶点,通过DAVID平台对重要靶点进行GO富集及京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析;使用Autodock Vina软件进行分子对接,验证网络分析结果.结果 苦黄颗粒的主要活性成分84个,其中羽扇豆碱、梨果仙人掌基质以及槐胺碱等可能是苦黄颗粒治疗AIH的核心化合物.筛选出苦黄颗粒治疗AIH的7个核心靶点,即IL-6、IL-10、CXCL8、IL-4、ICAM1、HMOX1和IL-2.GO功能富集分析和KEGG通路富集分析显示,苦黄颗粒主要对细胞凋亡进程、炎症反应以及机体免疫等生物过程进程调控.结论 苦黄颗粒可通过多组分-多靶点-多通路调控机体炎症,调节免疫反应,从而发挥治疗AIH的作用,其中7个主要核心靶点可能为苦黄颗粒发挥作用的关键靶点,TNF信号通路、T细胞受体信号通路及Toll样受体信号通路可能是苦黄颗粒参与调控机体炎症和免疫的关键信号通路,可成为后续探究苦黄颗粒治疗AIH作用机制的潜在研究方向.  相似文献   

7.
[目的] 利用网络药理学探讨红花治疗非酒精性脂肪肝(NAFLD)的可能性。[方法] 通过中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)数据库得到红花OB≥30%,DL≥0.18的有效活动成分,通过Swiss靶点预测数据库获取成分对应靶点。利用DisGeNet数据库及OMIM数据库获取NAFLD的靶点。采用STRING数据库构建交互基因蛋白之间的关系网络,利用DAVID数据库分析GO富集和KEGG信号通路。[结果] 筛选得到红花的361个靶点,其中涉及NAFLD的靶点38个,主要与VDR、PPARD、TNF、INSR等靶点有关。KEGG富集分析结果表示红花治疗NAFLD与胰岛素抵抗、催乳激素信号通路、PPAR信号通路等通路有关。[结论] 研究通过网络药理学系统探讨了红花活性成分及其所对应的靶点,以及治疗NAFLD潜在通路,为深入研究红花治疗NAFLD的基础和临床研究提供参考。  相似文献   

8.
狄海波  张洪壮  侯世科  王振国  闫利 《浙江医学》2020,42(23):2538-2543
目的通过网络药理学方法,预测积雪草治疗病理性瘢痕(PS)的作用靶点并探讨其作用机制。方法通过TCMSP数据库筛选出积雪草的活性成分和药物靶点,在GeneCards(https://www.genecards.org/)数据库获取PS疾病靶点,对积雪草药物靶点和PS疾病靶点进行韦恩图分析,以共同靶点作为积雪草治疗PS的作用靶点。通过String网站构建蛋白质相互作用(PPI)网络,用Cytoscape3.7.1软件绘制PPI网络图,并筛选其关键蛋白模块及关键(Hub)基因;在DAVID数据库对关键模块的Hub基因进行基因本体论(GO)功能注释和KEGG通路富集分析。结果筛选出槲皮素和谷甾醇2个活性成分,155个药物靶点,4571个PS疾病靶点;取交集后得到130个积雪草治疗PS的作用靶点。经Cytoscape软件分析后,得到丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、IL-6、TNF、IL-10、基质金属蛋白酶9(MMP-9)、转化生长因子β1(TGF-β1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、IL-1B、表皮生长因子(EGF)、MMP-2、MMP-1等Hub基因,涉及TNF信号通路、MAPK信号通路、HIF-1信号通路等。结论积雪草可通过调控TNF信号通路、MAPK信号通路、HIF-1信号通路等,改善PS患者的炎症反应、缺氧状态及成纤维细胞增殖平衡,具有多中心、多靶点、多途径的作用特点。  相似文献   

9.
[目的] 基于网络药理学和生物信息学方法分析女贞子治疗动脉粥样硬化的分子生物学机制。[方法] 基于TCMSP数据库与文献挖掘女贞子中化学成分; 利用PharmMapper网站预测女贞子化学成分靶点, 构建"成分-靶点"网络; 利用TTD、DisGeNET、DrugBank数据库筛选与AS疾病作用相关靶点。利用Cytoscape软件对化合物靶点和AS疾病靶点进行网络拓扑分析。利用STRING数据库对共有靶点构建PPI网络, 进行GO分析和KEGG分析。采用油红O染色和检测细胞内总胆固醇含量评价红景天苷和毛蕊花糖苷抗动脉粥样硬化活性。[结果] "成分-AS疾病靶点"网络显示14个活性成分和170个疾病靶点; 女贞子化学成分和动脉粥样硬化共同靶点9个; GO分析确定352个条目, KEGG通路富集结果确定了14条与AS相关的通路。细胞实验显示红景天苷和毛蕊花糖苷显著减少泡沫细胞的形成, 降低细胞内胆固醇含量。[结论] 女贞子中苯乙醇苷类化合物可能通过调节AMPK、PPAR信号通路调节胆固醇代谢发挥抗动脉粥样硬化作用。  相似文献   

10.
[目的] 明确丹知青娥方(DZQE)是否具有调节膀胱功能改善男性下尿路症状(LUTS)的潜在作用,并预测可能的靶点和通路。[方法] 用膀胱灌流法检测DZQE对正常雄性Wistar大鼠排尿参数的影响;分离正常大鼠膀胱逼尿肌肌条,用肌条张力实验检测DZQE对膀胱逼尿肌舒缩的调节作用;在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中医百科全书(ETCM)筛选DZQE中的活性成分和靶点信息;通过GeneCards和DisGeNET数据库获取LUTS疾病靶点;筛选DZQE与LUTS的共同作用靶点,并归属其蛋白质类型;通过Cytoscape_v3.7.1软件构建中药-活性成分-作用靶点网络;通过富集分析数据库(DAVID)v6.8对相关靶点进行基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组百科全书通路富集分析(KEGG)信号通路富集分析。[结果] DZQE能够降低雄鼠膀胱漏尿点压(DLPP)和最大排尿压(MVP);促进大鼠膀胱逼尿肌收缩,同时抑制氯化钾(KCl)诱导的肌条过度收缩,呈现双向调节效应。筛选得到DZQE中102个活性成分,共对应258个药物潜在靶点,LUTS疾病靶点246个,其中共同作用靶点47个,DZQE可能作用于LUTS的活性成分59个;GO富集分析涉及平滑肌收缩、血管收缩、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)级联、雌激素应答等生物过程;KEGG分析后得到包括磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKt)、甲状腺激素、钙离子、雌激素、肿瘤坏死因子(TNF)、ErbB、MAPK、转化生长因子β(TGF-β)信号通路等88条信号通路。[结论] DZQE可以通过多条信号通路调节膀胱平滑肌舒缩,改善雄鼠下尿路症状。  相似文献   

11.
[目的]预测锦灯笼中抗炎活性成分发挥作用的分子作用机制。[方法]采用反向分子对接方法,将筛选的锦灯笼的活性成分与药物信息数据库Therapeutic Target Database和Drug Bank检索的抗炎作用靶点进行对比分析,归纳总结出锦灯笼活性成分抗炎作用的潜在靶点,并通过MAS3.0对潜在靶点信息进行基因注释,利用Cytoscape3.4.0软件构建锦灯笼活性成分-靶点-通路-疾病网络并分析。[结果]锦灯笼54个活性成分作用于12个炎症靶点,涉及参与信号转导、蛋白水解和炎症反应等16条相关生物过程的代谢通路。[结论]网络药理学的研究方法预测锦灯笼活性成分,从分子水平解释了锦灯笼抗炎的作用机制,并为了中药多成分、多靶点、多通路的药效机制提供了科学依据。  相似文献   

12.
[目的]通过网络药理学的方法,研究墨旱莲-女贞子药对"异病同治"糖尿病肾病(DN)与糖尿病视网膜病变(DR)的药理作用机制,验证国医大师吕仁和教授治疗DN与DR的临床经验。[方法]利用TCMSP、TCMID和Uniprot数据库,搜集并获取墨旱莲、女贞子的化学成分及其作用靶点。利用NCBI-gene、Genecards和OMIM数据库搜集DN和DR的疾病相关靶点。通过String数据库、Cytoscape3.7.2软件、TBtools软件构建药物靶点蛋白相互作用网络,获取交集靶点。利用BioGPS数据库和Cytoscape3.7.2软件构建作用靶点-组织分布网络图,运用GO数据库和Cytoscape3.7.2软件的ClueGO插件对交集靶点进行GO和KEGG富集分析。[结果]墨旱莲-女贞子药对主要含有14个活性成分和124个潜在作用靶点,DN相关靶点2 614个,DR相关靶点2 587个,其中药对同时作用于DN和DR的共同靶点有63个。有11个作用靶点在胰岛、视网膜和肾脏高表达,KEGG富集分析得到共同靶点主要富集在糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路和IL-17信号通路等115条通路上,涉及对含氧化合物的反应、细胞对化学刺激的反应、对脂质的反应和细胞群增殖的调节等1 686个生物过程。[结论]墨旱莲-女贞子药对可能通过调节多个靶点、多条通路和多个生物反应过程,达到对DN与DR的"异病同治"作用,为吕仁和教授的临床经验用药提供了网络药理学验证,也为今后进一步研究墨旱莲-女贞子药对的药理作用机制提供了依据。  相似文献   

13.
目的 通过网络药理学分析六君子汤治疗年龄相关性黄斑变性(AMD)的靶点和信号通路,并探讨其作用机制.方法 从中药网络药理学数据和分析平台(TCMSP)搜索六君子汤6味中药的化学成分,并筛选出可能活性成分;在Swiss Target Prediction数据库查询活性成分的对应靶点;使用DrugBank、TTD和OMIM...  相似文献   

14.
目的 借助网络药理学联合分子对接技术探讨高良姜治疗抑郁症的作用机制。方法 通过TCMSP数据库 检索高良姜有效成分及靶点,使用GeneCards数据库获取抑郁症疾病靶点基因,利用STRING数据库和Cytoscape 3.9.1 软 件构建PPI网络图并获取蛋白互作关系,筛选出高良姜治疗抑郁症的核心靶点;借助David数据库对相交靶点进行GO功 能分析以及KEGG通路富集分析,得到高良姜治疗抑郁症的潜在作用通路。结果 筛选出高良姜 13 种活性成分和 169 个高良姜治疗抑郁症的潜在作用靶点,包括JUN、MAPK1、AKT1、RELA、ESR1、IL6、MAPK14、MAPK8、RXRA等核心 靶点;GO功能解析得到 654 个生物相关过程、85 个细胞组分及 147 个分子功能;KEGG富集解析获得 171 条相关通路, 分子对接验证了核心靶点与高良姜主要成分具有较强结合力。结论 高良姜可通过多个靶点、多条通路治疗抑郁症。  相似文献   

15.
运用网络药理学探索芍药甘草汤对多囊卵巢综合征高雄激素血症的作用机理。方法 通过TCMSP数据库结合口服生物利用度(OB)、类药性(DL)、半衰期(HL)筛选芍药甘草汤的有效活性成分及作用靶点,运用Genecards、Drugbank、OMIM数据库获取多囊卵巢综合征高雄激素血症的治疗靶点。借助Cytoscape3.7.2 软件构建“中药-活性成分-靶点”可视化网络,利用VENNY图筛选出药物与疾病的共同靶点,运用STRING在线分析工具构建蛋白互作网络图(PPI),通过David数据库对关键靶点进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析。结果 从芍药甘草汤中筛选出槲皮素、山奈酚、7-甲氧基-2-甲基异黄酮、 刺芒柄花素等83个有效成分,作用于MAPK3、MMP-9、STAT3、TNF、IL-6、VEGFA等41个关键靶点。KEGG通路富集分析发现这些靶点参与了TNF、HIF-1、FoxO、Toll样受体等信号通路。结论 芍药甘草汤中的槲皮素、山奈酚等可能通过TNF、IL-6、STAT3、VEGFA等靶点作用于TNF、HIF-1、FoxO、Toll样受体等信号通路来调节糖脂代谢、保护血管内皮、参与炎症反应,以减少雄激素的合成,发挥治疗多囊卵巢综合征高雄激素血症的作用。  相似文献   

16.
[目的] 应用网络药理学的研究方法分析葱白提取物治疗非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的潜在作用靶点,并通过小分子RNA干扰(RNAi)技术在NAFLD大鼠进行验证。[方法] 通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索葱白的有效成分及作用靶点,再利用GeneCards网络数据库搜索NAFLD关键靶点,运用Perl语言软件对数据进行预处理,再通过R语言软件、Cytoscape软件以及String网络数据平台进行数据分析及作图。最后以RNAi技术抑制过氧化物酶体增殖物受体γ(PPARG)辅助活化因子A(PPARGC1A)PPARGC1A的表达,在NAFLD模型大鼠中验证葱白提取物的疗效。[结果] 通过网络药理学的方法得到两个化合物,即山奈酚(kaempferol)与儿茶素(catechin),具有潜在疗效,并得到关键作用靶点PPARGC1A和PPARG。动物实验结果证实,与模型组相比葱白提取物可以改善脂肪肝病变,同时上调PPARGC1A及PPARG的表达(P<0.01)。[结论] 运用网络药理学的方法预测了葱白治疗NAFLD的关键靶分子,并进行动物实验验证了葱白提取物通过诱导PPARGC1A治疗NAFLD的可行性。  相似文献   

17.
目的 运用网络药理学研究方法探讨哮喘宁颗粒防治心理应激哮喘的作用网络与潜在机制。方法 在中药系统药理学分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、中药分子机制的生物信息学分析网络(Bioinformatics Analysis Tool for Molecular Mechanism of Traditional Chinese Medicine,BATMAN-TCM)等数据平台筛选哮喘宁颗粒的主要有效成分与靶点;并通过相关疾病靶点数据库检索心理应激哮喘的相关靶点;通过韦恩图得到哮喘宁颗粒与心理应激哮喘之共同靶点,利用Cytoscape 3.7.2建立"药物-成分-靶点"作用网络,然后使用STRING数据库进行化合物-疾病共同靶点的蛋白互作分析(protein-protein interaction,PPI),运用Cytoscape 3.7.2的插件MCODE、cytohubba及拓扑运算后筛选关键靶点;利用David数据库进行基因本体(Gene Ontology,GO)分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。结果 筛选出哮喘宁颗粒39个主要有效成分和121个交集预测靶点,心理应激哮喘靶点1 063个;通过韦恩图得到共同靶点72个,继用cytohubba插件及拓扑运算得到重要基因,通过MCODE筛选出基因互作模块,从而得到MAPK1、MAPK8、TNF、VEGFA、EGF、PTGS2、JUN、IL-6等交集靶点;通过GO和KEGG富集分析得知这些靶点涉及信号转导、细胞增生正调控、MAPK信号通路激活等生物学过程,神经活性配体受体相互作用、TNF、NOD样受体、Toll样受体、钙离子、T细胞受体、PI3K-Akt等信号通路。结论 哮喘宁颗粒可能通过多种有效成分作用于神经机制、免疫炎性反应、细胞增生等方面以综合调节"神经-内分泌-免疫"网络,从而防治心理应激哮喘。  相似文献   

18.
目的:运用网络药理学探讨茵陈蒿汤调节阻塞性黄疸氧化应激的作用机制,并用分子对接及免疫组化进行验证。方法:首先利用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)和UniProt数据库检索并筛选茵陈蒿汤有效成分及作用靶点;通过Gene Cards数据库检索阻塞性黄疸的作用靶点;利用R语言将疾病与药物的有效靶点进行分析,确定交集靶点;通过STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白互作网络;利用R语言进行基因本体论(GO)生物学过程富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;利用Autodock_vina软件对内皮型一氧化氮合成酶(eNOS)、诱导型一氧化氮合成酶(iNOS)和茵陈蒿汤主要化学成分进行分子对接验证;最后通过免疫组织化学方法(IHC)验证茵陈蒿汤对阻塞性黄疸大鼠肝组织中eNOS和iNOS的影响。结果:研究共筛选获得茵陈蒿汤中29个有效成分及177个作用靶点,阻塞性黄疸的2 183个疾病靶点,茵陈蒿汤和阻塞性黄疸的交集靶点123个;经GO和KEGG富集分析得到133个GO生物过程和127个相关信号通路,主要涉及Hepatitis B、流体剪应力与动脉粥样硬化、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)-蛋白激酶B(Akt)、肝细胞癌、低氧诱导因子(HIF)-1等信号通路;拓扑属性分析发现槲皮素、山奈酚、异鼠李素等主要成分和Akt1、TP53、白细胞介素(IL)6、血管内皮生长因子(VEGF)A、eNOS和iNOS等关键靶点。分子对接验证表明,eNOS和iNOS蛋白与槲皮素、山奈酚、异鼠李素有较好的亲和能力;IHC实验证明与假手术组相比,模型组肝组织中eNOS表达水平降低,而iNOS表达水平升高(P<0.05);与模型组相比,茵陈蒿汤组肝组织中eNOS表达水平升高,iNOS表达水平降低(P<0.01)。结论:茵陈蒿汤对阻塞性黄疸的作用具有多成分、多靶点、多通路的特点,茵陈蒿汤对阻塞性黄疸氧化应激的调节可能与改变eNOS、iNOS蛋白的表达有关。  相似文献   

19.
目的 从药物、疾病、靶点角度研究沙参麦冬汤治疗肺癌的作用机制,为进一步实验验证提供理论基础.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及中医药综合数据库(TCMID)收集沙参麦冬汤药物有效成分,导入PubChem数据库获取有效成分结构,将结构导入Swiss TargetPrediction数据库进行靶点预测...  相似文献   

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