乙型肝炎患者基因分型和耐药情况分析

目的:分析乙型肝炎患者的基因分型及耐药情况。方法:采取临床基因扩增技术和基因测序技术对149例乙型肝炎患者血清进行乙型肝炎病毒基因分型和耐药位点检测。结果:149例乙型肝炎患者基因分型:B型3例,C型133例,13例病毒序列无扩增;114例乙肝患者的相关耐药药物和百分比为拉米夫定(LAM)46.02%、阿德福韦脂(ADV)4.42%、恩替卡韦(ETV)22.12%、替比夫定(LDT)28.31%、替诺福韦脂(TDF)0%。结论乙型肝炎疑似耐药患者其基因型以C型为主;耐药位点以rtL180M、rtA181V/T、rtM204V/I为主;易产生耐药抗病毒药物是拉米夫定(LAM),恩替卡韦(ETV),替比夫定(LDT)次之。     

乙型肝炎患者基因分型和耐药情况分析

目的:分析乙型肝炎患者的基因分型及耐药情况。方法:采取临床基因扩增技术和基因测序技术对149例乙型肝炎患者血清进行乙型肝炎病毒基因分型和耐药位点检测。结果:149例乙型肝炎患者基因分型:B型3例,C型133例,13例病毒序列无扩增;114例乙肝患者的相关耐药药物和百分比为拉米夫定(LAM)46.02%、阿德福韦脂(ADV)4.42%、恩替卡韦(ETV)22.12%、替比夫定(LDT)28.31%、替诺福韦脂(TDF)0%。结论乙型肝炎疑似耐药患者其基因型以C型为主;耐药位点以rtL180M、rtA181V/T、rtM204V/I为主;易产生耐药抗病毒药物是拉米夫定(LAM),恩替卡韦(ETV),替比夫定(LDT)次之。     

CHB感染者耐核苷(酸)类似物种类与HBV基因分型的研究

目的探讨唐山地区慢性乙型肝炎病毒(CHB)感染者的年龄、性别特征、耐药种类与乙型肝炎病毒(HBV)基因分型之间的相关性。方法选择2009年10月-2014年4月医院慢性乙型肝炎病毒患者467例为研究对象,通过毛细管电泳仪采用双脱氧终止法测序技术对患者的血清进行HBV基因分型的检测,并分析HBV基因分型与耐药种类之间的相关性。结果唐山地区CHB感染者的467份样本中未检出基因型22份,已检测出HBV基因型的445份样本中共检出B、C、D三种基因型,其中B基因型64例占14.38%,C基因型380例占85.39%,D基因型1例占0.22%,C基因型为优势基因型(P<0.001)。已检测出B、C基因型的444例感染者中,<40岁和≥40岁分别占34.68%(154/444)和65.32%(290/444),差异有统计学意义(P<0.001);男性和女性感染者中,均以C基因型为主;男性感染者355例多于女性感染者89例(P<0.001);男性和女性CHB感染者不同基因分型间耐药种类的差异无统计学意义(P=0.345)。结论唐山地区CHB感染者主要耐药种类是拉米夫定、恩替卡韦和替比夫定的同时耐药,其次是阿德福韦酯的耐药。     

杭州地区乙型肝炎病毒基因型和P区耐药突变模式的相关性研究

目的研究杭州地区乙型肝炎患者乙型肝炎病毒(HBV)基因型分布、P区耐药突变基因状况及两者的相关性。方法利用荧光定量PCR和DNA测序技术,对慢性乙型肝炎患者的血清标本进行HBV基因型及P区耐药突变位点检测。结果 217例慢性乙型肝炎患者中检出HBV基因B型59例,C型127例,D型2例,B+C混合型6例,B+D混合型1例。对拉米夫定、阿德福韦、恩替卡韦和替比夫定耐药数分别是39例、18例、25例和71例。突变基因以M204I、L180M和M204V最多。YMDD突变类型在B、C基因型中的分布差异无统计学意义(P0.05),而YMDD中的M204I、M204V发生在B、C基因型中的差异有统计学意义(P0.05)。结论杭州地区HBV基因型以B型和C型为主,HBV耐药突变以M204I、L180M和M204V多见。应根据基因分型和耐药突变情况对慢性乙型肝炎患者选择适合的治疗方案。     

拉米夫定耐药后乙型肝炎肝硬化治疗的研究进展

使用拉米夫定可治疗HBV肝硬化,但长期使用易诱发病毒耐药.拉米夫定耐药,主要是由于HBV DNA链上酪氨酸-甲硫氨酸-天门冬氨酸-天门冬氨酸(YMDD)发生氨基酸置换,甲硫氨酸的rt204位点被异亮氨酸(rtM204I)或缬氨酸(rtM204V)替换.发生拉米夫定耐药的乙型肝炎肝硬化患者可以采用拉米夫定、恩替卡韦、替比夫定联合阿德福韦酯或替诺福韦等方案进行治疗.此文对以上各种治疗方案的疗效及不良反应进行综述.     

新疆地区维、汉民族乙型肝炎病毒耐药基因型分布与变异研究

目的 探讨新疆地区维吾尔族与汉族乙型肝炎病毒耐药基因型分布及耐药变异情况.方法 采用基因芯片对来自维族、汉族人群乙型肝炎病毒核酸阳性的927份标本进行与乙型肝炎病毒耐药相关的rtL180M、rtM204I/V、rtA181T/V和rtN236T的耐药突变和基因型分析.结果 维吾尔族与汉族的乙型肝炎病毒耐药突变率分别为53.26％和59.28％,差异无统计学意义;在4个耐药变异位点中,rtL180M、rtM204I/V、rtN236T 3个位点的突变在两个民族之间差异无统计学意义;rtA181T/V在两个民族中的突变率分别为13.04％和31.74％,差异有统计学意义(x2=13.8204,P＜0.05).结论 维吾尔族与汉族的乙型肝炎病毒耐药突变不存在差异,4个突变位点的6种突变中,只有rtA181T/V在两个民族之间有差异,且维吾尔族低于汉族,rtL180M、rtM204I/V和rtN236仍是维吾尔族乙型肝炎病毒耐药的常见变异.     

HBV基因型与耐药变异的关系

目的探讨乙型肝炎病毒（HBV）基因型与核苷（酸）类似物耐药变异的关系。方法湖南省衡阳地区122例慢性乙型肝炎患者接受拉米夫定治疗（100mg／d）48-96周,发生耐药变异者改用阿德福韦酯治疗（10mg／d）96周。采用直接测序法进行HBV基因分型,同时检测拉米夫定、阿德福韦酯和恩替卡韦耐药变异位点。结果122例慢性乙型肝炎患者中,B基因型86例（70．49%）,C基因型24例（19．67％）,未分型12例（9．84％）。42例检出拉米夫定变异株,其中B基因型32例,C基因型10例,B、C基因型拉米夫定耐药变异率分别为37．21％（32／86）和41．67％（10／24）,差异无显著性（x^2=0．16,P=0．69）;42例经阿德福韦酯治疗48周和96周的变异发生率分别为0．00％（0／42）和2．38％（1／42）,B、C基因型阿德福韦酯耐药变异率分别为3．13％（1／32）和0．00％（0／10）。拉米夫定耐药变异类型主要为rtM204V＋rtL180M（35．71％）和rtM204I（38．10％）;B、C基因型比较,拉米夫定耐药变异类型差异无显著性（x^2=17．44,P=0．23）。结论湖南省衡阳地区HBV基因型以B型为主,C型次之;HBV基因型对拉米夫定耐药变异发生率及变异类型无明显影响。     

广东地区100例乙型肝炎患者核苷类似物耐药位点检测及分析

摘要:目的 对样本血清进行核苷类似物的耐药突变位点检测,分析各耐药位点在人群中的发生率并以此为依据对含不同的耐药突变的患者提出相应的临床用药改进策略。方法 采用PCR产物直接测序法,对筛选出的100例符合送检要求的乙肝患者血清标本进行6种核苷类似物共21个耐药突变位点的检测,并对结果进行统计分析。结果 100例标本中21个耐药突变位点均阴性,即表现为6种核苷类似物全敏感者共36例,有1种或2种以上药物敏感性改变者共64例发生率达64%。其中,拉米夫定（LAM）、替比夫定(LdT)、恩曲他滨(FTC)耐药者均为32例,以rtM204I/V±rtL180M变异最多见。阿德福韦(ADV)耐药者29例,主要变异位点为rtN236T及rtA181T。恩替卡韦(ETV)耐药者7例,暂未发现替诺福韦(TDF)耐药病例。 结论 广东地区乙肝患者人群中对核苷类似物的耐药发生率较高,提示临床应用HBV耐药变异检测手段对患者进行核苷类似物耐药位点分析,有利于为患者设计合理的有针对性的个体化用药方案。     

慢性HBV感染患者核苷类药物治疗后相应突变位点检测分析

目的:通过基因测序检测分析拉米夫定(LAM)、阿德福韦(ADV)、恩替卡韦(ETV)、替比夫定(LdT)四种核苷类似物耐药者HBV多聚酶区基因主要耐药突变的分布情况。方法:采用实时荧光定量PCR方法对253例LAM,78例ADV和9例ETV以及6例LdT耐药患者血清HBV多聚酶区进行扩增,对PCR产物进行直接测序。结果:253例LAM耐药患者中有16种突变类型,其中以rtM204I突变最多见,为101例(39.92%)。78例ADV耐药患者中有7种突变类型,其中以rtA181V/T/S突变最多见,为47例(60.25%)。9例ETV耐药患者中有3种突变类型,其中以rtT184A/G/I/S突变最多见,为6例(66.66%)。6例LdT耐药患者中有2种突变类型。结论:四种核苷类似物耐药株的氨基酸突变复杂多样,建议抗病毒治疗失败后参考基因型耐药检测结果更换药物。     

连云港市473例慢性乙肝患者乙型肝炎病毒基因型及耐药基因研究

目的 探讨连云港市慢性乙肝（CHB）患者乙型肝炎病毒（HBV）基因型及耐药基因特点。方法 选择2019年5月至2021年7月连云港市某医院诊断为CHB的患者作为研究对象,采用PCR和反向杂交技术进行HBV的基因序列分型,同时检测HBV的耐药突变位点,并分析不同基因型的耐药突变发生率。结果 共纳入473例HBV患者进行研究,HBV基因型构成比前3位为B型、C型及D型,分别占35.52%、30.02%、14.16%。不同性别HBV基因型比较差异无统计学意义（P>0.05）。检出耐药基因突变100例,突变率为21.14%;共检测出14种耐药突变基因,其中rt180M+rt204V的突变率最高,其次为rt204I、rt204V。100例耐药基因突变中由高到低分别为C型、B型、D型,突变率分别为30.3%、19.0%、11.9%,不同性别间差异有统计学意义（P<0.01）。结论 连云港市HBV基因型以B型及C型为主,其中C型基因的突变率最高,rt180M+rt204V、rt204I、rt204V是本地区常见耐药突变位点,C型基因更容易发生rt204I、rt180M突变。     

铜绿假单胞菌的耐药性及耐药基因研究

目的分析临床分离铜绿假单胞菌的耐药性,检测耐药基因,探讨耐药基因与耐药性的关系。方法采用美国德灵Microscan WalkAway 40系统对病原菌进行鉴定及药敏试验;采用PCR扩增技术对临床分离铜绿假单胞菌耐药性相关基因TEM、CARB、OXA-10、VIM、VEB、IMP、DHA、aac(6′)-Ⅰb、aac(6′)-Ⅱ、ant(2′)-Ⅰ、qacE△1-sul1、oprD2进行检测。结果 67株铜绿假单胞菌耐药严重,对哌拉西林/他唑巴坦、哌拉西林、替卡西林/克拉维酸的耐药率达100.0%;检出TEM、CARB、OXA-10、aac(6′)-Ⅰb、aac(6′)-Ⅱ、ant(2′)-Ⅰ、qacE△1-sul1、VIM、VEB基因,检出阳性率分别为98.6%、82.1%、88.1%、92.6%、92.6%、71.7%、83.6%、13.4%、1.5%,未检出IMP、DHA基因。结论β-内酰胺酶耐药是多机制联合作用的结果,氨基糖苷类修饰酶基因的高检出率与铜绿假单胞菌对氨基糖苷类的耐药关系有待进一步探讨,医院分离铜绿假单胞菌对季铵类、双胍类消毒剂耐药。     

耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌耐药性及耐药基因的研究

目的:研究耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药性及耐药基因类型,为合理使用抗菌药物及监测院内感染等提供有效的科学指导。方法:对医院收治的肺炎患者分离出的29株CRKP,采用改良碳青霉烯类失活(mCIM)试验法检测肺炎克雷伯菌中的碳青霉烯酶,通过聚合酶链反应(PCR)及测序方法对碳青霉烯酶基因KPC、IMP、NDM型、超广谱β内酰胺酶基因(ESBLs)、TEM、SHV、CTX-M型以及AmpC酶基因DHA进行检测。结果:29株耐药菌株对大部分临床常用抗菌药物高度耐药,对氟喹诺酮类抗菌药物和氨基糖苷类抗菌药物有较高的敏感性。表型确认试验中7株改良Hodge实验阳性,18株mCIM试验阳性。20株(占68.97%)菌检测到碳青霉烯酶基因,其中KPC为17.24%(5/29),IMP为13.79%(4/29),NDM为37.93%(11/29)。25株(占86.20%)菌检测到ESBLs菌株的基因,其中TEM型为62.07%(18/29),SHV型为79.31%(23/29),CTX-M型为62.07%(18/29)。3株菌检测到AmpC酶基因,其中DHA为10.34%(3/29)。29株CRKP中有14株既表达了碳青霉烯酶基因又表达了ESBLs的基因,共同表达率为48.28%。对耐药基因抽取其中部分阳性结果进行测序后均为目标基因,其中KPC为KPC-2、NDM为NDM-1。结论:29株CRKP对多种抗生素耐药率均较高,且对碳青霉类抗菌药物的耐药基因型主要为KPC-2和NDM-1,故加强院内感染预防控制措施,防止此类菌株的播散。     

铜绿假单胞菌对哌拉西林耐药及其多重耐药评估

铜绿假单胞菌是医院感染的重要病原菌,尤其常见于重症监护病房(ICU)、烧伤病房及老年病房的医院感染患者。近年来,抗假单胞菌药物增强了抗菌活性,但其耐药率也在逐步增加,甚或局部暴发多重耐药铜绿假单胞菌感染流行,使临床治疗十分困难,带来严重后果[1]。近来,国外有学者提出铜     

HIV-1 drug resistance and resistance testing

The global scale-up of antiretroviral (ARV) therapy (ART) has led to dramatic reductions in HIV-1 mortality and incidence. However, HIV drug resistance (HIVDR) poses a potential threat to the long-term success of ART and is emerging as a threat to the elimination of AIDS as a public health problem by 2030. In this review we describe the genetic mechanisms, epidemiology, and management of HIVDR at both individual and population levels across diverse economic and geographic settings. To describe the genetic mechanisms of HIVDR, we review the genetic barriers to resistance for the most commonly used ARVs and describe the extent of cross-resistance between them. To describe the epidemiology of HIVDR, we summarize the prevalence and patterns of transmitted drug resistance (TDR) and acquired drug resistance (ADR) in both high-income and low- and middle-income countries (LMICs). We also review to two categories of HIVDR with important public health relevance: (i) pre-treatment drug resistance (PDR), a World Health Organization-recommended HIVDR surveillance metric and (ii) and pre-exposure prophylaxis (PrEP)-related drug resistance, a type of ADR that can impact clinical outcomes if present at the time of treatment initiation. To summarize the implications of HIVDR for patient management, we review the role of genotypic resistance testing and treatment practices in both high-income and LMIC settings. In high-income countries where drug resistance testing is part of routine care, such an understanding can help clinicians prevent virological failure and accumulation of further HIVDR on an individual level by selecting the most efficacious regimens for their patients. Although there is reduced access to diagnostic testing and to many ARVs in LMIC, understanding the scientific basis and clinical implications of HIVDR is useful in all regions in order to shape appropriate surveillance, inform treatment algorithms, and manage difficult cases.     

黏液型铜绿假单胞菌的耐药特点和耐药基因研究

目的 分析黏液型铜绿假单胞菌（mucoid pseudomonas aeruginosa,mPA）的耐药特点,检测其耐药基因携带情况,为临床合理选用抗菌药物提供参考依据。方法 收集赣南医学院第一附属医院2017年1月 - 2018年12月临床标本中分离的40株黏液型铜绿假单胞菌,采用K - B纸片扩散法检测黏液型铜绿假单胞菌对临床常用抗菌药物的耐药性,用PCR对耐药基因AmpC、KPC - 2、TEM、IMP、SPM - 1、VIM - 1、VIM - 2、OXA - 10、OprD2进行检测。结果 40株mPA除1株来自中段尿以外,其余39株均来自呼吸道,患者以支气管扩张、慢性阻塞性肺疾病为主,主要来自呼吸内科,占52.5%（21/40）。mPA对哌拉西林/他唑巴坦、头孢哌酮/舒巴坦、头孢他啶、头孢吡肟、阿米卡星、庆大霉素的耐药率均＜30%,但对亚胺培南和美罗培南的耐药率高达31.6%和21.1%,2018年与2017年比较,mPA对哌拉西林、哌拉西林/他唑巴坦、头孢吡肟、氨曲南、亚胺培南、庆大霉素、左氧氟沙星和环丙沙星的耐药率明显下降,差异具有统计学意义（P＜0.05）。11株对亚胺培南和（或）美罗培南耐药的mPA中IMP基因阳性10株（90.9%）,TEM基因阳性9株（81.8%）,同时携带IMP和TEM基因8株（72.7%）,外膜孔蛋白OprD2基因缺失3株（27.3%）,未检测出其他基因型。结论 mPA对亚胺培南和美罗培南的耐药率较高,其耐药机制主要与携带IMP基因和TEM基因密切相关。     

Antimalarial drug resistance

Drug resistant malaria is mostly due to Plasmodium falciparum, the highly prevalent species in tropical Africa, Amazon, and Southeast Asia. P. falciparum is responsible for severe involvement of fever or anemia causing more than a million deaths per year. Rationale for treatment is becoming weak as multiple drug resistance against well-tolerated drugs develops. P. falciparum drug resistant malaria originates from chromosomal mutations. Analyses using molecular, genetic and biochemical approaches showed that: 1) impaired uptake of chloroquine by the parasite vacuole is a common characteristic of resistant strains, this phenotype correlates with pfmdr1 and pfcrt gene mutations; 2) one S108N to four (N51I, C59R, I164L) point mutations of dihydrofolate reductase, the enzyme target of antifolinics (pyrimethamine and proguanil), give moderate to high level of resistance to these drugs; 3) resistance to sulfonamides and sulfones involves mutations of dihydropteroate synthase (A437G, K540E), their enzyme target, impairing their capacity to potentiate antifolinic drugs; 4) resistance to atovaquone plus proguanil involves one single mutation on atovaquone target, cytochrome b (Y268S, C or N); 5) resistance to mefloquine is thought to be linked to the over expression of pfmdr1, a pump expelling toxic waste from eukaryotic cells. P. falciparum resistance levels may differ according to places and time, depending on malaria transmission and drug pressure. Coupling in vivo to in vitro tests, and using molecular tests is essential for the surveillance of replacement drugs. Low cost biochemical tools are urgently needed for a prospective monitoring of resistance.     

Fungal biofilms and drug resistance

Candida species, including the novel opportunistic pathogen Candida dubliniensis, are now emerging as major agents of nosocomial infections. Many such manifestations of infections associated with the formation of Candida biofilms include those occurring on devices such as indwelling intravascular catheters. Fungal biofilm-associated infections are frequently refractory to conventional therapy because of resistance to antimicrobial agents. This resistance could be in part due to the surface-induced upregulation of drug efflux pumps. Biofilm-associated Candida show uniform resistance to a wide spectrum of the currently available conventional antifungal agents, which implies that antimicrobial drugs that specifically target biofilm-associated infections are needed. The novel classes of antifungal agents, the lipid formulation of amphotericins, and the echinocandins have demonstrated unique antifungal activity against the resistant Candida biofilms, providing a breakthrough in the treatment of life-threatening invasive systemic mycoses. The use of drugs effective in combating biofilm-associated infections could lead to major developments in the treatment of fungal implant infections.     

基层医院铜绿假单胞菌耐药性分析及耐药基因检测

目的分析二级医院临床分离铜绿假单胞菌抗菌药物敏感性和金属酶、β-内酰胺酶流行情况,指导临床用药。方法回顾性分析2013年2月-2015年10月医院临床分离的非重复铜绿假单胞菌318株,所有菌株均用K-B法进行药敏试验;收集30株耐亚胺培南铜绿假单胞菌,采用聚合酶链反应(PCR)检测4种碳青霉烯酶耐药基因IMP、VIM、OXA-10、OXA-23。结果铜绿假单胞菌对阿米卡星耐药率最低,对头孢哌酮/舒巴坦、环丙沙星、哌拉西林/他唑巴坦、头孢他啶、亚胺培南耐药率依次为27.9%,30.9%,33.0%,34.2%,35.7%,对哌拉西林、美洛西林耐药率较高,耐药率分别为42.0%、54.6%。经基因检测发现VIM型阳性株24株,OXA-10阳性株1株,未扩增出IMP、OXA-23阳性株。结论基层医院铜绿假单胞菌耐药率也很高,以产金属β-内酰胺酶为主,OXA酶检出率较低,基因型为OXA-10。     

非发酵菌感染临床特点及耐药情况

摘要:目的　了解佛山市某医院住院患者非发酵菌感染临床分布及耐药性特点,为预防及治疗非发酵菌引起的感染提供科学依据。方法　回顾性调查2011年1月-2014年12月临床送检的各类标本中,非发酵菌的感染情况。结果　共分离非发酵菌2589株,其中检出率最高的前四种非发酵菌分别为铜绿假单胞菌（PAE）、鲍曼氏不动杆菌（ABA）、洋葱伯克霍尔德氏菌（BCE）及嗜麦芽寡养单胞菌（SMA）。PAE的检出率在4年里保持平稳,ABA及SMA的检出率持续上升,BCE检出率有所下降。PAE的耐药率较低,除替卡西林/克拉维酸钾外均不超过30%。ABA、BCE及SMA的耐药率较高,高于2012年CHINET的统计率。结论　在医院感染中非发酵菌为重要的致病菌,由于大部分耐药性严重,临床应重视细菌耐药性监测结果,防止医院感染暴发。