青藏高原鼠疫耶尔森菌基因型分布

目的研究青藏高原鼠疫耶尔森菌（鼠疫菌）基因组型分布特征.方法对分离到的青藏高原鼠疫菌297株,根据已经证实的22个差异区段设计引物,每株鼠疫菌的每个基因差异区段都采用PCR技术进行验证.结果在喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地中,鼠疫菌基因组型有9种,分别为1、5、6、7、8、10、11、新基因组型和Ype-ancestor型,其中以5、8和10型为主,3种基因组型合计所占比例为80.6%（204/253）,而且不同地区鼠疫菌基因组型的分布也不一致.青藏高原青海田鼠鼠疫疫源地鼠疫菌基因组型全部为14型.结论青藏高原鼠疫菌基因组型分布具有明显的地理特征.根据基因组型的分布状况推测出了鼠疫菌在青藏高原的传播路径.     

鼠疫耶尔森菌rRNA基因识别特征研究

目的 分析鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)的rRNA基因识别特征.方法 通过比较基因组学方法,利用Clustal W软件,对目前已完成全基因组测序的9株鼠疫菌的rRNA基因序列进行分析,分别比对rRNA基因簇两侧的2000bp序列、基因簇内16S、23S、5S rRNA及16S～23S基因间隔区序列,以确定鼠疫菌rRNA基因的识别特征.结果 菌株D182038、D106004、Z176003和CO92分别有6个rRNA基因簇拷贝(6拷贝菌株),菌株91001、KIM、Nepa1516、Antiqua和Pestoides F分别有7个rRNA基因簇拷贝(7拷贝菌株).按照两侧2000bp序列不同,可将鼠疫菌rRNA基因簇分成13种类型,并可将6拷贝与7拷贝菌株进行区分;16S～23S rRNA基因间隔区含有4种不同种类和数量的tRNA基因,可将6拷贝菌株和7拷贝菌株分别进行区分;23S rRNA基因在不同菌株间及不同rRNA拷贝间的碱基突变数方差分析显示,各菌株间F=0.548,P=0.815>0.05;各拷贝间F=5.228,P<0.01.结论 鼠疫菌rRNA基因簇两侧序列、间隔区tRNA基因和23S rRNA基因可作为识别不同菌株和不同rRNA基因簇拷贝的指标,将鼠疫菌不同菌株进行分类.

Abstract：

Objective To study the identification characteristics of rRNA genes on Yersinia (Y.)pestis.Methods By means of comparative genomics,we compared the rRNA genome sequences of nine completely sequenced strains of Y. pestis isolated from China and other countries by Clustal W software.we also compared the 2000 bp sequence adjacent to the rRNA genes,rRNA genes and 16S-23S rRNA spacer region respectively to determine the identification features of rRNA genes for Y. pestis.Results There were 6 rRNA gene clusters in the strains of D182038,D106004,Z176003 and CO92 respectively(6 copies strain).There were 7 rRNA gene clusters in the strains of 91001,KIM,Nepa1516,Antiqua and Pestoides F(7 copies strain).According to the 2000 bp sequence,13 types of rRNA gene clusters could classify the strains between the 6 copies and 7 copies.There were 4 types of tRNA gene among the 16S-23S rRNA spacer region that could classify the strains among the 6 copies and 7 copies strains respectively.The number of point mutation among the 23S rRNA gene was statistically different in some copies under ANOVA analysis(F=0.548,P=0.815>0.05 among the strains and F=5.228,P<0.01 among the copies).Conclusion The 2000 bp sequence adjacent to the rRNA genes,tRNA gene and 23S rRNA gene sequence could serve as the identification sign of rRNA genes for classifing the strains of Y. pestis.     

鼠疫耶尔森菌和假结核耶尔森菌基因鉴别方法的建立及评价

目的 建立鼠疫耶尔森菌和假结核耶尔森菌基因鉴别方法。方法 依据鼠疫菌、假结核菌特有的基因组序列["疫岛(PeI)"和"假岛(PsI)"], 与已公布的12株鼠疫菌和4株假结核菌全基因序列进行比对, 设计特异性的引物, 对鼠疫菌、假结核菌和其他肠道细菌进行鉴定。结果 用52株鼠疫菌、57株假结核菌和其他肠道菌株进行验证, 结果显示, 5对鼠疫菌的鉴定引物中, 2对(PeI2和PeI11)仅在52株鼠疫菌中扩出目的条带, 另3对引物(PeI1、PeI3和PeI12)除鼠疫菌外在部分假结核菌株中也扩出目的条带;5对假结核菌鉴定引物中, 1对引物(PsI1)在52株鼠疫菌和57株假结核菌株中扩出目的条带, 4对引物(PsI7、PsI16、PsI18和 PsI19)仅在57株假结核菌株中均扩出目的条带, 在鼠疫菌中未扩出目的条带。结论 用鼠疫菌和假结核菌共有的PsI1序列、鼠疫菌特有的PeI2和PeI11序列及假结核菌特有的PsI7、PsI16、PsI18和 PsI19序列组成的基因鉴别方法, 可以用于鼠疫菌和假结核菌的基因快速鉴别。     

四川石渠县鼠疫耶尔森菌的分子生物学特征

目的：对四川省石渠县鼠疫耶尔森菌的遗传特性进行分析。并与其他类型的鼠疫苗株相比较。方法：特征性基因的PCR扩增，随机扩增多态性DNA，脉冲场电泳、rRNA基因指纹图分析等。结果：石渠县的菌株为典型的鼠疫菌株，具有鼠疫强毒菌的典型特征，从该县青海田鼠中分离的鼠疫菌株，其分子生物学特征与我国其他疫源地中的鼠疫菌株明显不同。结论：该地可能存在一种新类型的鼠疫自然疫源地，其鼠疫菌属于一单独型别；1999年该县发生的人间鼠疫。感染来自该疫源地之外；对该疫源地仍须密切监视，以确定其对人类的威胁。     

甘肃省58株鼠疫菌基因分型及地理分布的研究

本研究采用差异区段(different regions,DFR)方法对分离自甘肃省鼠疫疫源地的58株鼠疫菌进行基因分型,分析其地理分布.     

我国鼠疫耶尔森菌Pgm特征的研究

目的　对从我国不同类型疫源地分离的鼠疫菌进行色素沉着因子 (Pgm )表型的分析。方法　用氯化血红素培养基或刚果红培养基培养鼠疫菌 ,对不同颜色的菌落进行计数 ,计算鼠疫菌Pgm的阳性率。 结果　我国 10个疫源地的 16个生态型和新发现的四川青海田鼠型 ,除昆仑山A、B型外 ,其他各型的菌株均含有Pgm+ 菌 ,以青海田鼠型、锡林郭勒高原型、北天山东段型、北天山西段A型、北天山西段B型菌株的Pgm+ 率为高 ,Pgm+ 菌株 >90 %。结论　青海田鼠型、锡林郭勒高原型、北天山东段型、北天山西段A型、北天山西段B型菌株的Pgm+ 表型稳定。     

鼠疫耶尔森菌检测方法的研究进展

鼠疫（Plague）是由鼠疫耶尔森菌（Yersinia Pestis）引起的人畜共患的烈性传染病之一。自1894年耶尔森和北里2位学者成功分离和鉴定出鼠疫耶尔森菌以来，人们己成功地建立起常规的病原学和血清学检测方法。随着分子生物学技术的飞跃发展，鼠疫菌检测技术正发生着日新月异的变化。现就近年来鼠疫耶尔森氏菌检测的研究进展作一综述。     

生物传感器与鼠疫耶尔森菌检测

生物传感器由于具有轻巧和灵敏度高的特点，可能会在微生物检测中发挥重要作用。尽管目前由于微生物检测的商品化传感器还十分稀少，但是一个值得探讨的发展方向。鼠疫作为一种典型的人兽共患病广泛分布在全世界，其病原鼠疫耶尔森菌的检测因此显得尤为重要。本综述了光纤传感器、不寻址电位传感器和平面波导传感器在鼠疫耶尔森菌检测中的应用，介绍了各传感器原理与特点，并对灵敏度和特异性进行了讨论。     

甘肃省58株鼠疫菌基因分型及地理分布的研究

本研究采用差异区段(different regions,DFR)方法对分离自甘肃省鼠疫疫源地的58株鼠疫菌进行基因分型,分析其地理分布.     

甘肃省58株鼠疫菌基因分型及地理分布的研究

本研究采用差异区段(different regions,DFR)方法对分离自甘肃省鼠疫疫源地的58株鼠疫菌进行基因分型,分析其地理分布.     

2009-2020年我国轮状病毒腹泻流行特征和基因型变化趋势

目的 了解2009-2020年我国全人群腹泻患者中轮状病毒感染者的流行特征和基因型变化趋势,为进一步开展腹泻监测和防控提供科学依据。方法 资料来源于国家科技重大专项传染病监测技术平台信息管理系统的我国28个省份252家哨点医院腹泻症候群监测数据,采用描述性流行病学方法分析2009-2020年轮状病毒腹泻病例在不同气候带地区、人群以及时间的分布特点及A组轮状病毒腹泻病例的基因分型特征和变化趋势。结果 2009-2020年共对114 606例腹泻病例进行轮状病毒检测,轮状病毒阳性率为19.1%（21 872/114 606）,阳性病例以A组轮状病毒为主（98.2%,21 471/21 872）。轮状病毒阳性率较高的年份分别为2009年（36.9%,2 436/6 604）和2010年（30.6%,5 130/16 790）,2011-2017年在14.0%~18.0%之间变化,2018年小幅上升（20.3%,2 211/10 900）,之后两年连续下降（15.5%,2 262/14 611和9.5%,470/4 963）。男性（20.2%,13 660/67 471）的轮状病毒阳性率明显高于女性（17.4%,8 212/47 135）;＜5岁婴幼儿的轮状病毒阳性率最高（28.4%,18 261/64 300）,是成年人的4倍以上。中温带、暖温带及亚热带地区的轮状病毒阳性率于12月至次年2月达高峰,而高原寒带存在2个高峰,分别出现在11月至次年1月及5-6月。2009-2020年A组轮状病毒优势基因型由G3P［8］、G1P［8］逐步发展为G9P［8］。结论 2009-2020年我国轮状病毒感染总体呈现下降趋势,呈明显的季节性流行,各年龄组人群阳性率差异较大,儿童腹泻仍是重点关注的问题,需进一步加强轮状病毒疫苗的接种,持续开展流行特征和基因型变化的监测。     

2016 - 2017年云南省手足口病流行及病原学特征分析

目的 对2016 - 2017年云南省手足口病流行现状和病原学分布特征进行分析,及时把握手足口病的变化趋势。方法 采集2016 - 2017年云南省中国疾病监测信息报告管理系统中手足口病疫情监测报告和个案资料,采用流行病学描述性统计分析方法和地理信息系统进行分析。结果 云南省2016 - 2017年共报告手足口病154 335例,2016年手足口病报告85 455例,发病率为180.2164/10万,死亡4例,死亡率为0.0126/10万; 2017年报告68 880例,发病率为144.3722/10万,死亡6例,死亡率为0.0084/10万; 每年4 - 7月为发病的高峰期,在9 - 12月出现次高峰;主要发病人群为5岁以下的幼托儿童,散居儿童,男女占比为1.37∶1;发病地区集中在中心城市以及多数旅游景区;感染病原体主要为其他肠道病毒。结论 云南省手足口病发病具有时间和空间的聚集性,需重视病原监测及分型,在多发地区和发病高峰期,针对高发人群开展重点防控。     

2011 - 2017年贵州省其他感染性腹泻流行特征分析

目的 分析贵州省2011 - 2017年其他感染性腹泻流行特征和病原学信息,为制定科学的防治策略提供参考。方法 通过中国疾病预防控制信息系统,收集其他感染性腹泻病例和突发公共卫生事件资料,并对其进行描述性流行病学和病原学分析。结果 贵州省2011 - 2017年共报告其他感染性腹泻64 691例,年均发病率26.38/10万。年龄别发病率最高的是0岁~组（541.28/10万）,发病率由2011年的371.96/10万上升到2017年的942.74/10万;散居儿童所占比例最高（57.25%）。季节高峰在8 - 10月和11 - 12月。市州和区县平均发病率最高的分别是贵阳市（47.68/10万）和观山湖区（346.20/10万）。有明确病原学诊断8 366例,占12.93%。病毒感染占96.22%,其中,轮状病毒占99.52%,≤1岁组占94.26%,散居儿童占98.48%,季节高峰在冬季。细菌感染占3.56%,≤1岁组占68.18%,散居儿童占63.42%,季节高峰在夏秋季。死亡3例,均无病原学诊断。结论 全省其他感染性腹泻报告病例以＜2岁组和散居儿童为主;病原学特征以病毒为主,病原诊断比例偏低。应对重点人群和地区采取针对性措施,提高病原学诊断率。     

山西省传染性非典型肺炎流行病学特征分析

目的：描述山西省传染性非典型肺炎[严重急性呼吸综合征(SARS)]的流行特征，分析形成这些特征的因素。方法：收集2003年3月初至5月20日山西省SARS疫情报告系统报至山西省疾病预防控制中心全部SARS临床诊断病例及部分流行病学个案调查报告，描述SARS在山西省的时间、地区、人群分布特征，采用EPIinfo6．0软件进行统计学分析。结果：山西省自2003年3月7日诊断首例输入性SARS病例后，至5月20日累计临床诊断SARS病例445例，罹患率1．34／10万，死亡20例，病死率4．49％。发病人数从3月28日起增高形成第一个高峰，至4月18日继续升高，形成第二个高峰，以后逐渐下降，至5月19日首次出现临床诊断病例零报告。目前疫情呈低水平流行势态。SARS病例主要集中在人口密集的城市市区，占83．82％，农村地区呈散发状态。职业构成以学生、医务人员居多。年龄分布以20—59岁为高发人群，病死率随年龄的增高而上升，男女发病之比为1：0．87。结论：山西省SARS流行呈输入、上升、高峰并逐步下降的趋势，早期发现和有效控制传染源是控制疫情蔓延的关键。     

132例麻疹住院病例临床分析

目的探讨近年来麻疹的临床特点和流行特征,为预防和控制该病提供科学依据。方法对某医院2001—2010年132例住院麻疹患者资料进行回顾性分析,总结其流行病学及临床特征分布情况。结果132例麻疹患者发病时间主要集中在2—6月,共111例（84．00％）;以19—36岁成人为主,共95例（71．97％）;市区为主,共108例（81．82％）;男：女为2．57：1。所有患者均发热,其中体温超过39℃者共57例,占43．18％;均有皮疹,96例（72．73％）患者皮疹较为典型,在病程前4d内出疹者98例,达74．24％;有麻疹黏膜斑者54例（40．91％）。支气管炎、肺炎36例（27．27％）,中毒性肝炎18例（13．64％）,中毒性心肌炎10例（7．58％）。仅42例（31．82％）患者有明确的麻疹疫苗接种史。所有患者预后良好。结论成人麻疹发病率增高,症状典型,但预后良好。建议要完善麻疹疫苗接种,重视对成人的后续强化免疫接种。     

2007-2014年贵州省务川仡佬族苗族自治县 水痘流行病学特征分析

摘要:目的　了解务川仡佬族苗族自治县（以下简称务川自治县）2007-2014年水痘发病情况,为制定水痘疫情防控措施提供科学依据。方法　对2007-2014年务川自治县报告的水痘病例及暴发疫情数据经Excel2003软件整理后,采用描述流行病学方法进行分析。结果　2007-2014年务川自治县县共报告水痘798例,年均报告发病率为22.73/10万,年报告发病率在54.63/10万～2.86/10万之间,发病数逐年增高,到2014年达到最高,为54.63/10万。全县15个乡镇都有病例发生,以都濡镇发病为最多,男性发病高于女性,男∶女＝2.01∶1,年龄分布以5岁以下儿童发病最高,占总病例数的44.86%,以夏季发病较多,占病例总数的41.23%,病例主要集中在学生和散居儿童,学生占42.36%。结论　务川自治县水痘疫情主要发生在夏季和冬季,学生和散居儿童及幼托儿童是水痘的高发人群,发病逐年增高。要控制水痘疫情,必须加大水痘等二类疫苗的宣传力度,提高水痘疫苗的接种率,有效降低水痘的发病率。     

芜湖市1957～2011年麻风病流行状况剖析

目的探讨芜湖市麻风病流行规律,更好的指导麻风病防治工作。方法收集1957年至2011年7月芜湖市麻风病发病资料,进行描述性分析。结果报告病例主要集中在1960～1974年,发病率由1960年的2.78/10万,降至1997年的0.05/10万,并一直控制在该水平之下。发现率最高为1972年的3.71/10万,2011年控制在0.5/10万以下。患病率最高为1972年的21.51/10万,2011年控制在1/10万以下。结论麻风病目前处于低流行状态,需要被动与主动发现两种方式相结合开展防治工作,加强社区居民的针对性健康教育和皮肤科医生、基层医务人员的专业知识培训以促进病例的早期发现。     

2008 - 2018年贵阳市流行性腮腺炎流行特征分析

目的 及时掌握贵阳市流行性腮腺炎（以下简称流腮）流行特征,为制定有效可行的流腮免疫策略提供科学依据。方法 采用描述流行病学方法,对2008年1月1日 - 2018年6月30日贵阳市疾病监测信息管理系统报告流腮病例进行分析。结果 贵阳市2008 - 2018年流腮年均报告发病率为27.71/10万;5 - 7月和11月 - 次年1月报告发病数占全年报告发病数的 63.02%。3～14岁年龄组流腮报告发病数占86.91%;学生、托幼儿童和散童报告发病数分别占报告发病总数的54.26%、23.95%和15.62%;各区（市、县）流腮年平均发病率有统计学差异。结论 贵阳市流腮报告病例近年持续上升,聚集性疫情主要在学校和托幼机构;建议在做好麻腮风三联疫苗常规免疫接种基础上,对入学入托儿童加强1剂腮腺炎类疫苗接种,同时在小学高年级、初中学校开展腮腺炎类疫苗普种,才能短期内有效降低流腮发病率。     

2005-2008年云南省保山市流行性乙型脑炎流行特征分析

目的了解保山市2005-2008年流行性乙型脑炎（乙脑）流行病学特征,为防治提供依据。方法对2005-2008年报告的乙脑病例进行描述性流行病学分析。结果 2005-2008年保山市共报告乙脑病例224例,各年发病率分别为1.70/10万、2.68/10万、2.46/10万和2.35/10万,各年皆呈高度散发状态。流行高峰为7-8月,占总发病数的63.84%。主要发病人群为10岁以下儿童,占发病总数的76.79%。死亡3例,病死率为1.34%。结论保山市乙脑疫情得到了较好控制,但仍应加强预防接种、防蚊灭蚊为主的综合防治措施。     

2008 - 2017年济南市流行性乙型脑炎流行特征分析

目的 分析济南市2008 - 2017年流行性乙型脑炎（简称乙脑）的流行病学特征,为制定乙脑预防控制策略提供科学依据。方法 对济南市2008 - 2017年实验室确诊的乙脑病例进行流行病学特征的描述分析。结果 2008 - 2017年济南市共报告乙脑病例146例,年均发病率为0.22/10万,发病率总体呈下降趋势（χ2 = 12.23,P＜0.01）。所辖的10个区县均有乙脑病例报告,年均发病率前5位的是章丘（0.41/10万）、济阳（0.40/10万）、商河（0.33/10万）、平阴（0.20/10万）、天桥（0.19/10万）,发病数占全市79.45％。发病有明显季节性,主要集中在8 - 10月,占总病例数的92.47%。女性发病高于男性,男女性别比为0.80∶1。病例以15岁以上人群为主,职业构成主要为农民（47.95%）、学生（17.12%）和散居儿童（8.90%）。有全程免疫史的病例占全部病例的10.96%,无接种史和接种史不详占80.14%。对全部病例进行随访,18.49%的病例死亡,8.22%留有后遗症。结论 济南市乙脑发病总体呈下降趋势,发病有明显季节性,发病高峰后移,50岁以上年龄组发病最多。建议在保持适龄儿童高接种率水平的基础上,针对高危人群开展预防接种工作。