安徽省GII.P16-GII.2诺如病毒暴发疫情的基因特征分析

目的了解2018年安徽省一起感染性胃肠炎暴发疫情的病原学特征。方法收集2018年10月一起急性胃肠炎病例粪便/肛拭子12份标本,采用Real-time PCR检测诺如病毒GII基因组,阳性标本经RT-PCR扩增聚合酶区和衣壳蛋白区部分基因序列,进行核苷酸序列测定和遗传进化树分析。结果 12份急性胃肠炎病例标本,荧光PCR检出诺如病毒核酸均为阳性,测序获得10条序列。遗传进化树显示:10条GII.2型间核苷酸序列同源性为100%,与台州参考株GII.2(GenBank登录号:MH806429,MH842206)同源性最高(同源性最高为99.47%),且处于同一分支。结论此次急性胃肠炎暴发疫情由GII.P16-GII.2诺如病毒引起,鉴于它在中国的广泛流行,应重视GII.P16-GII.2重组株在本地区诺如病毒的监测。     

2016 - 2018无锡市腹泻病疫情中诺如病毒的分子流行病学特征

目的 鉴定无锡市2016年3月 - 2018年3月急性腹泻病突发疫情中诺如病毒的感染流行情况,并对病原体进行分子特征研究。方法 对疫情上送的暴发急性病例标本,采用荧光PCR初步判定病原体,常规RT - PCR检测诺如病毒RNA聚合酶和衣壳蛋白基因片段,并进行序列测定和分子特征分析。结果 在30起暴发疫情中共有162份标本经荧光PCR检测均为诺如病毒核酸阳性,其中154份标本RT - PCR检测判为GII型诺如病毒,120份标本成功测序。测序结果显示,2016 - 2018年突发疫情中有5种基因型,分别是GII.P16 - GII.2、GII.P17 - GII.17、GII.4_Sydney2012、GII.4_NewOrleans和GI.6,2017年之前以GII.17病毒株流行为主,2017之后新的GII.P16 - GII.2重组株成为无锡市病毒性腹泻疫情中的绝对优势株。结论 诺如病毒是无锡市腹泻病疫情的最常见病原体,其最新的优势流行株是GII.P16 - GII.2重组株,和全国趋势一致。     

安徽省诺如病毒G II.4/Sydney 2012变异株分子特征分析

目的了解安徽省某高校一起急性胃肠炎暴发疫情的病原体基因分型和分子特征。方法采用实时荧光定量PCR法(Real-time PCR)对6份粪便/肛拭子标本检测诺如病毒核酸,检出的阳性标本经传统RT-PCR扩增衣壳蛋白区(ORF2)部分序列、基因测序和型别鉴定,利用Clustal X 2.0和Mega 6.0软件对测定序列进行核苷酸同源性比对和构建基因进化和亲缘性关系树。结果检出4份标本诺如病毒核酸阳性,阳性率为66.67%(4/6);基因序列比对和进化亲缘性关系显示:诺如病毒基因型为GII.4型;2毒株序列之间核苷酸同源性为100%;与2014~2015年上海株、香港株核酸同源性最高,均为100%;与2012澳大利亚Sydney株(JX459908)同源性为99.6%;与上海和香港两地区毒株亲缘性关系最近,聚为独立一簇,同属GII.4/Sydney 2012分支。结论引发该起急性胃肠炎暴发的病原体为GII.4型诺如病毒,且属于GII.4 Sydney 2012变异株。     

舟山市一起诺如病毒暴发疫情的病原学鉴定及基因特征分析

目的对舟山市海岛地区2017年12月一起诺如病毒暴发疫情进行病原学鉴定及基因分子特征研究。方法采用荧光定量PCR法对送检的18份样本进行诺如病毒核酸检测,阳性样本使用常规RT-PCR扩增聚合酶及衣壳蛋白区基因序列,采用Mega6.06及Simplot软件对扩增序列进行系统进化及重组位点分析。结果 12份样本筛查为诺如病毒GII型阳性,阳性率66.67%,经基因序列分子特征分析,证实本次暴发疫情的病原体为诺如病毒GII.P7-GII.6型,重组位点位于ORF1-ORF2连接处180-182bp(5031-5033bp)之间,本次分离的GII.P7-GII.6型衣壳蛋白区序列隶属于GII.6型a簇,与北京市2016年所报道毒株型同源性最高,达97.8%。结论这是舟山市海岛地区首次在暴发疫情中检测出诺如病毒GII.P7-GII.6型,除当前流行株外,本区域内诺如病毒的基因型别的分布与流行情况较复杂,应结合国内外的流行趋势,及早、及时的开展预防控制工作。     

诺如病毒GII.17和GI.3基因型引起急性胃肠炎疫情的病原分析

目的对安庆市某中学暴发的急性胃肠炎疫情进行病原鉴定,并进一步对部分基因序列测序分析,以确定其基因亚型。方法对采集的13份肛拭子,3份生活饮用水标本,采用实时荧光定量RT-PCR方法进行诺如病毒GI/GII型检测,对阳性标本的病毒VP1区部分核酸序列测序和基因库数据比对,并采用MAGA5.0软件构建进化树。结果在13份肛拭子样本7份诺如病毒阳性中,6份属于GI.3型,1份属于GII.17型;3份生活饮用水样本GI.3和GII.17型均有检出。结论该起疫情由诺如病毒感染引起,为GI.3和GII.17基因亚型。     

无锡一起诺如病毒感染性腹泻病原基因测序分析

目的对无锡一起诺如病毒急性胃肠炎疫情进行病原基因测序分析,以确证其病原体,并对其基因进行分型。方法采用荧光定量PCR法对74份疫情病例样本进行诺如病毒RNA检测,在阳性标本中取3份病毒样本和1份日常监测检出的诺如病毒Ⅱ型阳性标本,经RT-PCR扩增,然后纯化、测序和进化树分析。结果 74份疫情样本中的17份样本测出诺如病毒Ⅱ型RNA,阳性率23%;其中3株疫情病毒和1株日常哨点医院腹泻病监测所得的Ⅱ型诺如病毒的ORF1-ORF2连接区序列与DNA Data Bank of Japan(DDBJ)中的GII.4参考株Lordsdale病毒(Lordsdale virus,LV)同源性最高,达95%。结论序列测定结果证实这起无锡急性胃肠炎疫情是诺如病毒感染所致,其病毒基因型为GⅡ.4型。     

丽水市一起学校暴发诺如病毒疫情的实验室基因检测分析

目的测定丽水市一起学校病毒性胃肠炎暴发疫情诺如病毒的RNA聚合酶区(RdRp)和衣壳蛋白区(VP1)基因序列,从分子水平对病原进行分型鉴定。方法收集疫情现场现症患者肛拭子、呕吐物、各类饮用水、可疑食物留样标本总计98份,采用荧光定量PCR方法检测诺如病毒,将阳性标本通过测序引物RT-PCR扩增RdRp和VP1基因序列并测定,通过生物信息学软件进行基因分型鉴定和序列分析。结果共检出诺如病毒阳性4份,阳性检出率为4.08%(4/98),均为GⅡ基因型;RdRp和VP1序列BLAST和种系发生分型结果均显示为诺如病毒GⅡ.4亚型。结论诺如病毒优势流行株GⅡ.4亚型是本次学校病毒性胃肠炎暴发疫情的重要病原体。     

重组GII型诺如病毒长沙株全基因组序列的测定与分析

目的 对2016年长沙地区一起由GII型诺如病毒引起的急性胃肠炎暴发疫情致病原进行全基因组序列测定,掌握其基因类型、分子进化特征和抗原重组情况。方法 提取疫情中患者粪便标本的总RNA,反转录成cDNA,PCR扩增病毒全基因组并采用Sanger法测序,比对拼接后获得病毒全基因组序列;通过BLAST比对和诺如病毒在线分型工具(typing online tool)确定其基因型别;从GenBank中下载GII型诺如病毒参考序列,采用DNA Star软件进行序列多序列比对和同源性分析,绘制系统遗传进化树,基因重组特征分析采用SimPlot软件。结果 通过一代测序获得病毒基因组序列长7491bp,有3个开放阅读框(ORF),长度分别为5100bp,1647bp,765bp。多序列比对和同源分析发现ORF1区与GII.P12型代表株同源性最高,VP1区则与GII.3型同源性最高;因此,将该毒株命名为Hu/GII.P12-GII.3/CS02/2016 /CHN。分子遗传进化分析显示其与中国其他地区如北京、上海、广东等地流行的GII.P12-GII.3重组型诺如病毒亲缘关系最为接近。抗原重组分析发现Hu/GII.P12-GII.3/CS02/2016 /CHN长沙株重组位点在5080bp,为ORF1与 ORF2重叠区的起点。结论 除了GII.P16-GII.2重组诺如病毒的广泛流行外,长沙地区仍存在GII.P12/GII.3重组诺如病毒的散发流行,需加其强监测。     

一起急性胃肠炎暴发疫情中诺如病毒的分子流行病学分析

目的研究导致本次急性胃肠炎暴发疫情的诺如病毒的分子流行病学特征。方法对2015年2月7日北京市某旅行团急性胃肠炎暴发疫情病例标本进行实时荧光定量PCR(Real-time PCR)检测,并对感染病例的诺如病毒进行RNA依赖性RNA聚合酶基因(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)和VP1区基因序列的检测和分析。结果 18份便标本经Real-time PCR检出12份GⅡ型诺如病毒阳性标本,RdRp区和VP1区序列扩增各得到11条诺如病毒基因序列。根据RdRp区和VP1区系统进化分析证明感染病例的诺如病毒分型为GⅡ.17型。该病毒株与引起暴发疫情的诺如病毒GⅡ.17型新变异株珠海ZHITHC-12株高度同源,RdRp区和VP1区核苷酸差异分别为0%和0.1%,氨基酸差异均为0%。结论引发北京某旅行团旅客急性胃肠炎暴发疫情的病原体是引起中国2015年暴发流行的诺如病毒GⅡ.17型新变异株。     

一起水源性污染导致的诺如病毒胃肠炎暴发调查

目的通过对一起诺如病毒胃肠炎暴发疫情开展流行病学调查,为类似事件调查处置提供参考。方法根据诺如病毒调查问卷,对所有病例进行流行病学调查,采用荧光PCR检测诺如病毒核酸。结果此次疫情共有诺如病毒感染病例47例,采集现症患者粪便标本3份,经检测3份为诺如病毒GII阳性;罹患率为27.65%。平均年龄51岁,临床表现为腹泻(100.00%)、腹痛(80.85%)、恶心(89.36%)、呕吐(8.51%)等等胃肠道症状。结论本次疫情为一起由GII型诺如病毒引起的胃肠炎暴发疫情,供水管网泄漏为本次疫情的危险因素。     

安徽省农村地区40～60岁妇女更年期综合征及影响因素分析

目的了解安徽省农村地区40~60岁妇女中更年期综合征的发生率及其相关因素。方法采取分层整群抽样方法,抽取1 780名农村40~60岁女性,对这些人群开展面对面问卷调查。采用Kupperman评分量表进行更年期综合征的评分、分级和判定。结果共调查1 780名40~60岁农村妇女,平均年龄(50.0±5.6)岁。自我报告具有更年期综合征的有1 004人,发生率56.4%,其中轻度583人(占32.8%)、中度357人(占20.1%)、重度64人(占3.6%)。较为常见的症状依次是关节肌肉痛、烦躁易怒、眩晕、失眠、头痛和乏力(均高于45%)。单因素分析显示,年龄、文化程度等诸多因素影响更年期综合征(P<0.05)。多因素logistic回归分析显示,年龄、日常工作、BMI指数、睡眠、牙齿、视力、听力、腿脚、食欲状况、慢性病、焦虑和抑郁是更年期综合征的相关因素(P<0.05)。结论安徽省农村40~60岁妇女更年期综合征发生率较高,可能的影响因素包括年龄,日常工作、BMI指数、睡眠、牙齿、视力、听力、腿脚、食欲状况、慢性病、焦虑和抑郁等。     

池州市2014～2018年手足口病重复感染病例特征与影响因素分析

目的了解池州市手足口病重复感染的流行病学特征及其影响因素。方法根据"传染病报告信息管理系统"中的池州市2014~2018年期间手足口病病例个案数据,建立重复感染病例定义,筛选出重复感染病例,采用描述性流行病学方法和多因素logistic回归分析重复感染病例的流行病学特征和影响因素。结果共报告手足口病重复感染229人次,重复感染率为2.02%(229/11 334)。重复感染的发病高峰集中在每年的5~6月份,以≥3岁的幼托儿童为主。报告重复感染病例数最多的为贵池区,城市重复感染率明显高于农村(χ2 =10.614,P=0.001)。多因素分析显示,年龄和居住地是重复感染独立的影响因素。结论手足口病存在重复感染,小年龄组,即小于3岁和农村是重复感染的保护因素,应采取针对性地防控措施,减少手足口病重复感染发生的风险。     

安徽省2015年18岁及以上居民二手烟暴露状况分析

目的利用2015年中国成人慢性病与营养监测数据,分析安徽省≥18岁人群的二手烟暴露情况。方法采用多阶段分层整群随机抽样,有效样本量为7 553人,使用事后分层权重调整和复杂抽样设计方法进行统计分析。结果 18岁及以上居民二手烟暴露率为65.8%,男性和女性二手烟暴露率分别为68.3%和64.7%,差异无统计学意义(P>0.05)。二手烟暴露率在各年龄组(χ~2=10.460,P=0.010)、文化程度(χ~2=17.630,P=0.002)、婚姻状况(χ~2=8.784,P=0.013)和职业间(χ~2=17853,P=0.001)均存在差异。一周中每天受到暴露的比例最高(34.8%)。结论安徽省成年居民二手烟暴露水平较高,并且长期暴露二手烟者数量多,控烟形势非常严峻。     

安徽省国家疾病监测点2013～2017年死因网报数据质量评估

目的评估安徽省国家疾病监测点死因数据报告质量,分析存在的问题。方法采用分层整群随机抽样方法评估安徽省国家死因监测点(DSPs)2013-2017年死因填报质量。结果2013.2017年安徽省DSPs死因网报个案身份证号、死因链、根本死因及其编码填报年均准确率分别为85.83%.64.14%和82.19%,其中前两项指标准确率均见逐年增高趋势(P<0.05),第3项指标准确率比2013年提高2.77%。3项指标准确率在新老点和城乡之间的差异逐年缩小。除根本死因及其编码准确率外,新点填报准确率均优于老点;身份证号准确率城市点较优,死因链准确率农村点较优,而根本死因及其编码准确率无城乡差异。死因链上疾病编码缺失或错误、多死因链填报不准确是死因填报中主要的错误类型。结论2013-2017年安徽省国家疾病监测点死因网报质量不断提升,但仍有进步空间。在强化培训和督导的同时,各级疾控中心要严把审核工作的质量,并定期开展抽审评估工作,及时发现和解决问题。     

怀宁县2014～2018年手足口病流行特征分析

目的通过对手足口病报告和监测资料的分析,探讨手足口病流行特点和规律。方法根据传染病报告信息管理系统的手足口病监测数据,采集手足口病患者咽拭子标本,检测肠道病毒核酸并进行分型,对怀宁县2014.2018年手足口病流行特征和病原学监测数据进行分析。结果2014.2018年怀宁县共报告手足口病2675例,年均发病率为88.61/10万;春夏之交是手足口病高发阶段;不同乡镇报告发病水平明显不同;≤5岁与>5岁人群年均发病率差异有统计学意义(χ^2=6774.70,,P<0.001),男女年均发病率差异有统计学意义(χ^2=28.794,P<0.001)。5年的手足口病病原学检测阳性率为62.24%,阳性标本中,以其他肠道病毒感染为主(占61.16%)。结论怀宁县手足口病具有明显的季节和人群聚集性,应加强散居儿童和人口密集场所的防控工作。     

铜陵某高校一起肺结核聚集性疫情调查分析

目的通过分析铜陵市某高校肺结核聚集性疫情,探讨学校肺结核疫情发生的风险。方法应用现场流行病学方法,开展病例搜索,对病例之间的流行病学关联性进行分析,追溯传染源。结果共搜索到15例学生结核病例,其中9例存在流行病学关联,为聚集性疫情;首发病例痰涂片未阴转的情况下返校复课,是聚集性病例发生的重要原因;高暴露等级的密切接触者结核菌素(PPD)试验强阳性率61.02%,中等暴露密切接触者PPD强阳性率17.02%,高暴露密切接触者患者检出率13.56%,中等暴露密切接触者没有发现患者;首次暴露的密切接触者中,PPD强阳性组肺结核续发率是PPD非强阳性组的1.95倍。结论传染源未得到有效管理是本次聚集性疫情发生的主要原因,做好传染源的管理及结核菌感染者的预防性治疗是防控学校结核病疫情的关键措施。     

太和县某小学流行性腮腺炎暴发疫情分析

目的通过对2018年太和县某小学流行性腮腺炎暴发疫情进行分析,查找暴发和疫情持续的原因。方法采用流行病学调查和现场调查危险因素相结合的方法开展病例搜索、危险因素查找,并将结果录入Excel表格,通过SPSS 19.0软件进行结果统计分析。结果太和县某小学2018年3月至6月共发生流行性腮腺炎暴发疫情195例,罹患率10.66%,疫情持续70余天,10~12岁是高发年龄段,首发病例未能有效隔离、10岁以上儿童流行性腮腺炎疫苗接种史大部分不详、学校传染病病例复课不规范,病例隔离期限不足即复课、教室通风不良以及存在校内外交叉感染可能是该起疫情发生的原因。结论严格病例隔离,加强应急接种和基层医疗机构疫情报告管理,有效落实学校传染病防控制度是控制学校传染病暴发疫情的重要手段。     

肥西县2013～2017年居民死因分析

目的了解肥西县2013.2017年居民死亡水平,探讨死亡原因和死亡人群分布特征。方法收集2013-2017年《人口死亡信息登记管理系统》上报的肥西县居民死亡信息,采用ICD10进行根本死因编码和分类,使用SPSS20.0和Excel软件计算和分析居民粗死亡率、构成比、死因顺位及不同年龄居民死因构成等。结果2013-2017年肥西县居民死亡率为559.73/10万,男性死亡率648.34/10万,女性死亡率463.63/10万,差异有统计学意义(χ^2=617.048,P<0.01);居民死亡率随着年龄的增长呈上升趋势,各年龄组的男性死亡率均高于女性;前5位死因分别为恶性肿瘤、脑血管病、心脏病、呼吸系统疾病以及伤害,占全部死亡原因的89.51%。结论2013-2017年肥西县居民死亡水平呈上升趋势,恶性肿瘤、脑血管病、心脏病、呼吸系统疾病等慢性病是影响肥西县居民健康的主要死因,加强全生命周期的慢性病防控指导和干预,降低人群慢性病患病风险。     

2010-2015年安徽省灵璧县农村地区宫颈癌发病与死亡趋势分析

目的分析2010-2015年安徽省灵璧县农村地区宫颈癌发病及死亡情况,为宫颈癌防治提供参考依据。方法收集2010-2015年灵璧县农村地区宫颈癌登记上报资料,根据全国肿瘤登记中心制定的审核方法和评价标准,计算宫颈癌的发病率、死亡率。Join-Point回归模型计算年度变化百分比。分析2010-2015年宫颈癌发病率及死亡率变化趋势。结果宫颈癌的发病率由2010年的6.13/10万上升到2015年的12.63/10万,差异有统计学意义(χ^2=12.459,P<0.01)。2010-2015年宫颈癌发病率逐年增加趋势,以每年21.19%的速度递增。上升趋势明显(APC=21.19%,95%CI=2.8~42.8)。死亡率由2010年1.49/10万上升到2015年2.90/10万,差异无统计学意义(χ^2=2.529,P=0.112),2012-2017年间,宫颈癌死亡率变化趋势差异无统计学意义(APC=14.71%,95%CI=-8.2~43.3)。发病年龄主要集中在35~65岁。30岁及以下组宫颈癌发病率由2010-2012年的0.85/10万上升到2013-2015年的2.95/10万,差异有统计学意义(P<0.05)。结论安徽省灵璧县农村地区宫颈癌发病率呈逐年上升趋势,特别是35~65岁的女性。10年间宫颈癌发病年轻化趋势。重点应加强早期筛查、加强对宫颈癌防治措施的制定。     

舒城县2018年土源性线虫病感染现状调查结果分析

目的了解舒城县土源性线虫病流行现状。方法按地理位置抽取5个乡镇,每个乡镇抽取1个行政村,每个村抽取200名常驻居民,采集粪便标本,对标本采用改良加藤厚涂片法查常见肠道寄生虫卵,钩蚴培养法鉴定钩虫虫种,透明胶带肛拭法检查3～9岁儿童蛲虫卵。结果共调查1 000人,寄生虫感染人数35人,总感染率为3.50%;其中34人感染钩虫,1人感染蛲虫。有10名钩虫感染者存在家庭聚集性,钩虫感染以低学历、高年龄人群为主,不同文化程度人群钩虫感染率差异有统计学意义(χ~2=30.558,P<0.05),不同年龄人群钩虫感染率差异有统计学意义(χ~2=23.328,P<0.05)。结论舒城县土源性线虫感染率小于5%,呈低感染状态,虫种以钩虫为主。