2016-2017年山西省太原市艾滋病病毒感染者毒株基因特征及耐药分析

目的了解山西省太原市2016-2017年新报告未经治疗艾滋病病毒(HIV)感染者毒株亚型分布以及耐药毒株的传播。方法对太原市2016年8月至2017年12月新报告未经治疗的HIV/艾滋病患者(AIDS)进行调查。采集血样,提取RNA,获得pol区序列,构建系统进化树判定亚型。应用美国斯坦福大学HIVdb Program库进行耐药解读,并运用HyPhy 2.2.4软件和Cytoscape 3.6.1软件进行HIV-1分子网络分析。结果从调查的251名新报告未经治疗HIV/AIDS中获得227条pol区序列。发现太原市HIV-1毒株以CRF01AE亚型为主,占52.0%(118/227),其次为CRF07BC亚型占32.6%(74/227);2016-2017年新报告未经治疗HIV/AIDS中HIV-1耐药率为5.3%(12/227),针对非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTI)耐药率为5.3%(12/227),针对核苷类反转录酶抑制剂(NRTI)耐药率为1.3%(3/227),未发现有蛋白酶抑制剂(PI)的耐药;按1.5%基因距离阈值构建分子网络入网率为40.1%(91/227),发现12个分子簇;亚型为CRF790107(P=0.01)的感染者入网率较高。结论太原市HIV-1流行毒株CRF01AE和CRF07BC两种亚型合计超过80%,针对NNRTI耐药率已超过5%;感染新型重组亚型CRF790107的感染者已形成簇传播,需加强该人群的调查和干预。     

上海地区HIV-1感染者耐药基因型检测及亚型分析

目的研究上海地区人类免疫缺陷病毒（H IV）感染者/获得性免疫缺陷综合征（AIDS）患者耐药性基因型以及亚型的分布情况。方法采用美国拜耳公司H IV耐药检测试剂盒（TRUGENE（H IV-1 Genotyp ingK it）,扩增H IV-1靶序列（pol基因）中长度分别为297bp的蛋白酶基因片段和621bp的逆转录酶基因片段,OpenGene（DNA测序系统和数据分析软件进行测序和序列分析,利用H IV Database网站提供的H IV基因亚型分析软件（BLAST）对所得到的靶序列进行亚型分析。结果对87例H IV/AIDS患者的病毒载量和CD4＋T淋巴细胞计数4年随访中,其中61例接受高效抗逆转录病毒联合治疗（HARRT）的患者中,有4例性传播患者检测结果显示出现逆转录酶类耐药相关位点,49例合并血友病的患者,服药的依从性好,病毒载量检测均低于检测限（？50拷贝/mL）。10例未接受过HARRT治疗的患者标本中未检出耐药相关突变。对16份标本进行亚型分析,发现1例国内尚未见报道的ADHK重组型。结论利用TRUGENE（H IV-1系统,进行H IV-1耐药性基因型的检测,可以有效地监测接受HARRT治疗前后患者血浆H IV-1的耐药情况,并对不同的亚型进行分析。     

上海地区艾滋病病毒感染者/艾滋病患者原发性耐药基因调查及抗病毒治疗效果观察

目的 了解上海地区伴有HIV-1原发性耐药的艾滋病病毒感染者/艾滋病患者（HIV/AIDS）对高效抗反转录病毒治疗（HAART）效果的影响,评估长期抗病毒治疗方案,为调整治疗策略提供依据。方法 从上海市艾滋病治疗数据库中随机选取2007-2013年期间被诊断为HIV-1的感染者,在未治疗前进行原发性耐药检测。对其中原发性耐药的病例进行1~7年不等的随访检测,通过CD4+T淋巴细胞计数及病毒载量结果评估抗病毒治疗效果。结果 1 543例HIV-1感染者中发现HIV原发性耐药42例,其中失访8例,死亡1例,停药1例,最后获得32例原发性耐药者。32例中非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTI）耐药相关突变11例,核苷类反转录酶抑制剂（NRTI）耐药相关突变7例,蛋白酶抑制剂（PI）耐药相关突变6例;对NRTIs和NNRTIs同时耐药突变有3例,同时发生对PIs和NNRTIs的耐药相关突变1例,同时发生对PIs和NRTIs的耐药相关突变2例;对整合酶抑制剂（IN）耐药相关突变2例,平均原发性耐药率为2.7%。随访监测CD4+T淋巴细胞计数和病毒载量变化结果显示,32例患者的CD4+T淋巴细胞数量在HAART治疗前和治疗后的0.5、1、2、3、4、5、6和7年（1个月）时分别为249.5157.4、304.9188.7、356.3206.4、441.4245.7、455.4256.8、453.2168.5、458.2202.4、454.066.8和432.0100.4个/l。服药依从性指标评估显示所有病例均每年检测病毒载量,除了2例病例病毒载量为600拷贝/ml和700拷贝/ml外,其余病毒载量检测均低于检测下限,病毒抑制率为100%。上述病例在随访期间,均因毒副反应而更换为其他一线药物或二线药物。结论 通过随访观察上海地区伴原发性耐药的HIV/AIDS对抗病毒的治疗效果,在原发性耐药率低的流行地区,如果治疗管理规范,患者服药依从性好,并经常开展公共卫生原发性耐药监测,在条件有限的情况下可不考虑进行治疗前原发性耐药检测。     

102例HIV-1感染者病毒株反转录酶基因多态性及耐药性变异研究

目的:目前中国未接受或已接受反转录酶抑制剂(RTI)治疗的HIV感染者的HIV反转录酶基因类型的数据较少。本研究探讨了HIV-1反转录酶的基因多态性,及在RTI选择性压力下出现的已知和未知变异位点。方法:分析研究21例未接受治疗及81例接受RTI治疗的HIV感染者的RT基因。大部分感染者(>80%)应用司他夫定(d4T) 地达诺新(ddI) 奈韦拉平(NVP)或d4T 拉米夫定(3TC) 依菲韦仑(EFV)三联HAART治疗方案。结果:在未接受治疗的患者中,发现了4个高度多态性位点(122、200、207和211)。在接受RTI治疗的患者中,发现了2种耐药相关变异(RAMs):①接受ddI d4T NVP治疗方案的患者中发现,K65R(9.8%)、L74V(7.4%)、M184V(7.4%)、Q151M(5%)和胸腺嘧啶类似物变异(TAMs)(9.3%),包括T215Y(5.5%);②接受d4T 3TC EFV治疗方案的患者中发现,T215Y(23%)、M184V(20%)和TAMs(15.4%)。在所有病例中,非核苷反转录酶抑制剂(NNRTI)RAM的出现率很高(41.9%),而在142、221、224和228位点发现了4种可疑的新RAMs。结论:目前中国非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTI)耐药相关变异十分普遍,本研究描述了RTI选择性变异的基因模式,提出了新的一些变异与RTI治疗的相关性。     

我国237例未接受抗病毒治疗的HIV/AIDS患者中原发性基因型耐药监测和病毒亚型分析

目的 分析237例HIV/AIDS患者中原发性耐药的发生率和病毒亚型分布情况.方法 从河南、云南、上海等20个地区采集237例未经抗病毒治疗的HIV/AIDS患者血浆HIV-1进行基因测序,通过病毒亚型分析软件REGA HIV-1 Subtyping Tool确定测序样本的HIV-1亚型,并与斯坦福大学HIV耐药数据库比对确定测序样本HIV-1耐药相关突变位点.采用b-DNA方法检测患者血浆病毒载量,采用流式细胞仪检测CD4+ T淋巴细胞计数.结果 237例未接受抗病毒治疗的HIV/AIDS患者感染的HIV-1毒株分布为A1、B、C、CRF01-AE、CRF02-AG、CRY7-BC、CRF08-BC、CRF12-BF、G等9个不同亚型,可能的感染时间分布在1990-2006年.237例患者中仅有3例分别对核苷类逆转录酶抑制剂高度耐药、蛋白酶类抑制剂低度耐药和非核苷类逆转录酶抑制剂高度耐药,原发性耐药的发生率为1.3%(3/237).结论我国部分地区未经抗病毒治疗的HIV/AIDS患者中HIV-1原发性基因型耐药的发生比例处于较低水平,病毒亚型分布在9个亚型.     

2014－2015年云南省文山州HIV-1毒株耐药基因变异研究

目的：了解2014－2015年云南省文山州免费抗病毒治疗获得性免疫缺陷综合征（简称艾滋病）感染者和艾滋病患者HIV-1基因型耐药发生情况及特点。方法收集文山州2014－2015年接受免费抗病毒治疗的艾滋病患者的临床及实验室资料,对抗病毒治疗持续6个月以上、病毒载量仍大于1000 copies／mL的患者进行基因型耐药检测,分析耐药发生情况及耐药毒株流行特点。结果2014－2015年共计176例艾滋病患者发生病毒学失败,共检测基因型耐药176人次,获得可用序列137条。该人群中耐药发生率为62．0％（85／137）。在使用过的药物中,对奈韦拉平（NVP）、依非韦仑（EFV）高度耐药的有62（45．3％）、50（36．5％）;对拉米夫定（3TC）、替诺福韦（TDF）、司他夫定（D4T）、齐多夫定（AZT）高度耐药的情况分别是31（22．6％）、12（8．8％）、8（5．8％）、2（1．5％）,对蛋白酶抑制剂（PI）没有出现高度耐药的情况。耐药突变与PI 相关的主要耐药基因突变位点有3例,占2．2％（3／137）;M46IM、T74S和L33I各1例。与核苷类反转录酶抑制剂（NRTI）相关的突变中,突变位点发生频率最高的是 M184V／I,为23．4％（32／137）。与非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTI）的突变中,突变位点发生频率最高的是K103N／S,为27％（34／137）。137条完整基因序列中,主要为 CRF08 BC 亚型,共67例（48．9％）;其次是 CRF01 AE 亚型,共49例（35．8％）;CRF07 BC亚型有6例（4．4％）;另外还有15例（10．9％）URFs。结论当前文山州的耐药发生率在增加,毒株正变得复杂化,重组毒株在逐渐增加,应加强监测,防止耐药毒株的传播。