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相似文献
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1.
目的 分析半胱氨酸蛋白酶3基因(caspase-3,CASP3)多态性与中国儿童川崎病(Kawasakidisease,KD)临床表型的潜在相关性,以寻找中国儿童KD发生发展的高风险分子标记.方法 采用病例对照研究,实验组包括238例KD患儿,对照组包含年龄与性别组成匹配的364名非KD儿童.同时应用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性与DNA测序技术,对研究对象的CASP3基因包括功能性单核苷酸多态位点(single nucleotide polymorphism,SNP)rs113420705在内的3个多态位点进行基因分型,分别比较KD组与对照组、继发与不继发冠状动脉损伤(coronary artery lesions,CALs)以及静脉注射免疫球蛋白(intravenous immunoglobulin,IVIG)治疗敏感与抗性情况下这些SNP位点等位基因与基因型频率.结果 KD组中rs113420705的T等位基因频率与该等位基因携带者频率均显著高于对照组.在3种常见的单倍型中,2种包含SNP rs113420705风险等位基因的单倍型更常见于KD患者组.3个SNP位点的等位基因、基因型与次等位基因携带者频率在继发与不继发CALs患者组,以及IVIG治疗敏感与不敏感患者组之间差异均无统计学意义.结论 CASP3基因rs113420705与中国人群川崎病的发生存在显著的相关性,提示该SNP的风险等位基因有希望成为判断中国儿童川崎病易患性的分子遗传标记.CASP3基因风险单倍型的证实为该基因在KD发生中的作用提供了新的证据.  相似文献   

2.
目的 探讨云南人群PTPN22和PADI4基因的7个SNP多态与类风湿关节炎易感性的相关性.方法 选取192例类风湿关节炎患者和288名正常人进行病例对照研究.分别用PCR-RFLP法检测PTPN22基因的rs33996649和1858位点、PADI4基因的rs11203366和rs874881位点,用焦磷酸测序法检测PADI4基因的rs1635579、rs2428736和rs2240340共7个SNP位点的基因型.结果 在7个SNP位点中,PADI4基因的rs2240340位点的等位基因频率和基因型频率在病例组和对照组间差异有统计学意义(P<0.05).结论 在云南人群中PADI4基因的rs2240340多态性与类风湿关节炎的易感性存在相关性.  相似文献   

3.
目的探讨NBN基因与中国北方人群乳腺癌的相关性。方法对188例正常人及205例乳腺癌患者NBN基因的16个外显子进行直接测序。结果在中国北方人群乳腺癌样本中未发现NBN基因突变。对基因频率大于5%的NBN基因SNPs进行分析,发现rs709816(D399D,AG)的AG基因型较AA基因型发生乳腺癌的风险增加2.34倍,有显著的统计学差异,提示该SNP与乳腺癌的发生相关。结论 NBN基因第10外显子内SNP rs709816(AG)可能与中国北方人群乳腺癌发生相关。  相似文献   

4.
目的:探讨湖北地区儿童VDR基因(rs2239185、rs7975232、rs2525046、rs2228570)和GSDMB基因(rs2305480)单核苷酸多态性(SNP)与儿童哮喘的易感性。方法:采用前瞻性研究方法,纳入158例哮喘患儿(哮喘组)和156例健康儿童(对照组),运用Sequenom MassArray质谱芯片微列阵技术对两组对象VDR和GSDMB基因的多个SNP位点进行基因分型,分析上述各位点在两组间分布的差异,筛选湖北地区儿童哮喘易感SNP位点。结果:GSDMB基因rs2305480位点GG、AG、AA 3种基因型频率在哮喘组中分别为64.56%、4.43%、31.01%,在对照组中分别为51.28%、8.97%、39.74%,两组间GG基因型分布频率差异具有统计学意义(P<0.05);GSDMB基因rs2305480位点的等位基因G、A在哮喘组中的分布频率分别为80.06%、19.94%,在对照组中的分布频率分别为71.15%、28.85%,两组间的等位基因A分布频率差异具有统计学意义(P<0.05);GSDMB基因rs2305480位点不同基因分布...  相似文献   

5.
目的探讨CD80基因多态性与云南汉族人群宫颈癌发生发展的相关性。方法本研究选取云南地区汉族人群癌前病变(CINⅢ期)患者126例,宫颈癌患者450例,健康体检人群500例,采用TaqMan探针基因分型方法对CD80基因中的4个SNP位点rs16829980(AG)、rs16829984(GC)、rs41271391(GT)和rs41271393(CT)进行基因分型,并研究其等位基因、基因型及所构建的单倍型在CINⅢ期患者、宫颈癌患者和健康对照人群中分布频率的差异。结果 rs16829984(GC)等位基因C和G在CINⅢ期组和对照组、癌症组和对照组中分布频率的差异具有统计学意义(P=0.026和0.006)。rs16829980(AG)中等位基因A和G在CINⅢ期组和癌症组中分布频率的差异具有统计学意义(P=0.038)。而rs41271391(GT)和rs41271393(CT)的等位基因和基因型在病例组(CINⅢ期组和癌症组)和对照组中的分布频率的差异无统计学意义(P0.05)。单倍型分析结果显示AGGC单倍型可能是宫颈癌发生的危险因素(OR=1.449;95%CI:1.096-1.915)。结论位于CD80基因启动子区域的SNP位点rs16829984(GC)等位基因C可能是云南汉族人群宫颈癌发生的保护性因素(OR=0.700;95%CI:0.510-0.960),rs16829980(AG)等位基因A可能是云南汉族人群CINⅢ期向宫颈癌发展的保护性因素(OR=0.703;95%CI:0.503-0.982)。  相似文献   

6.
目的 研究云南汉族人群中PSMB8、PSMB9及TAP2基因多态性与类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的相关性.方法 应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性法对177例RA患者及288名健康对照PSMB8基因的rs2071543、rs55745125、rs138635403位点和PSMB9基因的rs17587多态性位点进行基因分型,应用多聚酶链反应扩增阻碍系统法对TAP2基因的rs2228396多态性位点进行基因分型.计算基因型及等位基因频率.采用Epi Info 7软件计算上述多态位点在RA组及正常对照组之间的比值比(OR值).结果 rs138635403及rs17587位点的等位基因及基因型频率在RA组和对照组间差异有统计学意义(P<0.05),其中RA组rs17587的GG基因型频率(0.672)高于对照组(0.524)(OR=1.862,95%CI:1.261~2.749).结论 云南汉族人群PSMB9基因的rs17587位点多态性与RA存在关联.  相似文献   

7.
目的:探讨孕酮受体基因(PGR基因)rs590688、rs1042838、rs11224592三个单核苷酸多态性(SNP)位点在宁夏回、汉族人群的分布特征并与1000Genomes网站上公布的其他群体分布频率进行比较分析。方法:采用TaqMan探针基因分型方法分析宁夏回、汉族人群867例(回族335例,汉族532例)PGR 3个SNPs位点rs590688、rs1042838、rs11224592基因型及等位基因频率的分布情况。结果:宁夏回、汉族人群PGR基因rs590688和rs1042838两个位点基因型及等位基因频率分布差异无统计学意义;rs11224592位点基因型及等位基因频率在宁夏回、汉族人群的分布差异有统计学意义;3个SNP位点的基因型及等位基因分布频率在男、女性别间差异无统计学意义。宁夏人群PGR基因rs590688、rs1042838、rs11224592位点基因型及等位基因分布频率与1000Genomes网站公布的其他群体相比较,rs590688位点与欧洲人群及非洲人群差异均有统计学意义;rs1042838位点与欧洲人群的差异有统计学意义;rs11224592位点与非洲人群的差异有统计学意义。结论:PGR基因rs590688、rs1042838、rs11224592位点基因型及等位基因频率在宁夏回、汉族人群的分布中,rs590688和rs1042838两个位点的分布无民族差异;rs11224592位点的分布具有民族差异;3个SNP位点的分布无性别差异。PGR 3个SNP位点基因型及等位基因频率在不同种族和地区的分布不同。  相似文献   

8.
目的检测HOXD10、HOXD12、HOXD13基因内4个已知单核苷酸多态(single nucleotide poly-morphisms,SNP)rs2593778、rs847154、rs847151、rs13392701在单纯性马蹄内翻足核心家系中的分布情况,分析各个SNP位点及所构成单倍型与单纯性马蹄内翻足的相关性。方法应用限制性片段长度多态性技术结合测序,分析84个单纯性马蹄内翻足核心家系4个SNP位点基因型;应用ETDT软件统计分析各SNP位点基因型与单纯性马蹄内翻足的相关性;应用TRANSMIT软件构建单倍型并统计分析单倍型频率是否存在差异。结果位于HOXD12基因5′侧翼序列的SNP位点rs847154和位于HOXD13第1外显子的SNP位点rs13392701在单纯性马蹄内翻核心家系中存在传递不平衡(P<0.05);位于HOXD12基因第1外显子的SNP位点rs847151未检测到多态;位于HOXD10第1外显子的SNP位点rs2593778经ETDT分析无统计学意义。结论HOXD12基因5′侧翼序列的SNP位点rs847154和位于HOXD13第1外显子的SNP位点rs13392701与单纯性先天性马蹄内翻足有明显的相关性,提示HOXD12、HOXD13可能是单纯性马蹄内翻足重要的易感基因。  相似文献   

9.
目的 研究原发性高尿酸血症患者SLC22AI2基因第8内含子和第8外显子单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,SNP)位点与原发性高尿酸血症遗传易感性的关系.方法 选择山东沿海地区原发性高尿酸血症患者215例,正常对照人群323名.提取基因组DNA,PCR扩增SLC22A12基因第8内含子和第8外显子,对PCR扩增产物进行测序.结果 序列分析发现:(1)SLC22AI2基因第8外显子存在T1309C单核苷酸多态,第8内含子存在-103A>G单核苷酸多态,这2个多态位点完全连锁.(2)高尿酸血症组-103A>G G等位基因频率和T1309C C等位基因频率明显高于正常对照组(均为51.9%vs.42.4%,P<0.01);(3)高尿酸血症组GG+GA基因型频率和CC+CT基因型频率显著高于正常对照组(均为80.0%vs.69.0%,P<0.01).(4)-103 A>G和T1309C基因多态中,含有等位基因G的基因型GG+GA及含有等位基因C的基因型CC+CT均使高尿酸血症的发病危险性上升了1.79倍(OR=1.79,95%CI:1.19~2.70).结论 SLC22A12基因第8外显子T130gC及第8内含子-103A>G SNP与原发性高尿酸血症密切相关.  相似文献   

10.
目的:探讨共济失调毛细血管扩张症突变基因(ataxia telangiectasia mutated,ATM)rs227060位点单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与肺癌易感性之间的相关性.方法:采用聚合酶链反应-SNP敏感性分子开关方法,检测225例肺癌患者和128例健康体检者ATM基因rs227060多态位点等位基因以及基因型频率分布特点;并应用非条件Logistic回归法统计分析rs227060单核苷酸多态性与肺癌的相关性.结果:rs227060多态位点共检测出CC,CT,TT三种基因型和C,T两种等位基因,其在肺癌组与对照组的基因型分布频率为:CC基因型17.3%与29.7%、CT基因型61,4%与59.3%、TT基因型21.3%与11%,两组间基因型频率和等位基因频率分布差异均有统计学意义(P<0.05).在对ATM rs227060基因型的多态性分析过程中发现:吸烟史在肺癌组与对照组相比差异无统计学意义(P>0.05),而年龄、性别、肿瘤家族史在肺癌组与对照组相比差异均有统计学意义(P<0.05);且以CC基因型作为对照,携带TT基因型的个体患肺癌的风险是携带CT基因型个体的3.49倍(OR=1.829;95%CI:1.045~3.199).结论:ATM基因rs227060位点单核苷酸多态性与肺癌易感性存在相关性,且携带TT基因型可增加肺癌的发病风险.  相似文献   

11.
臧东钰  万义增 《解剖科学进展》2010,16(6):535-538,542
目的探讨14-3-3ζ在T1期非小细胞肺癌(NSCLC)中的表达及其临床病理意义。方法采用免疫组化、免疫印迹及RT-PCR技术检测110例T1期NSCLC及癌旁正常肺组织中14-3-3ζ蛋白的表达。结果 T1期NSCLC中14-3-3ζ蛋白及mRNA表达水平均较正常肺组织明显增强,14-3-3ζ的表达与患者的年龄、性别及病理学分型不相关。但随着肺癌分化程度的降低,14-3-3ζ的表达逐渐增强。在淋巴结转移阳性的癌组织中,14-3-3ζ表达高于淋巴结转移阴性的癌组织。生存曲线分析结果显示14-3-3ζ表达阴性患者的5年生存率及平均生存时间均高于表达阳性者。结论 14-3-3ζ与肺癌的分化程度、淋巴结转移及患者预后密切相关,提示14-3-3ζ有可能作为判断T1期NSCLC发展与预后的生物学指标之一。  相似文献   

12.
目的研究及探讨非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)组织中粘附蛋白-E(E-cadherin)和S100A2表达与临床生物学行为的关系。方法采用RT-PCR方法及免疫组织化学(IHC)法,检测95例NSCLC组织标本、配对癌旁组织及正常肺组织E-cadherin和S100A2表达情况,分析它们与肿瘤临床特征的相关性及其在非小细胞肺癌进展中的作用。结果 RT-PCR结果表明E-cadherin在正常肺组织中高表达,在肺癌组织中表达下调,S100A2在正常肺组织中低表达,在肺癌组织中表达上调。免疫组化结果表明E-cadherin在正常肺组织中阳性率为100%,随着NSCLC组织分化的降低阳性率下降,S100A2表达上调。结论 E-cadherin在NSCLC的低表达和S100A2在NSCLC组织过表达可能与NSCLC发病相关。  相似文献   

13.
Objectives: Low-density lipoprotein receptor-related protein 6 (LRP6) modulates Wnt signaling transduction. Altered LRP6 expression leads to abnormal Wnt protein activation, cell proliferation and tumorigenesis. This study investigated the association between LRP6 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) and non-small-cell lung cancer (NSCLC) in a Chinese population. Methods: A total of 500 NSCLC patients and 500 healthy controls were recruited for assessment of four LRP6 SNPs using the SEQUENOM MassARRAY matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry. The association between genotype and NSCLC risk was evaluated by computing the odds ratio (OR) and 95% confidence interval (CI) with multivariate unconditional logistic regression analyses. Results: The frequency of the LRP6 rs10845498 genotype was 60.9% (A/A), 35.5% (AG) and 3.6% (GG) in patients with lung squamous cell carcinoma (SCC) and 69.2% (A/A), 27.2% (A/G) and 3.6% (GG) in controls. Logistic regression analysis revealed that the LRP6 rs10845498 A/A major allele was associated with a reduced risk in developing lung SCC (OR = 0.69; 95% CI, 0.48-1.00; P=0.04), and tobacco smokers had a 2.21 fold greater risk in developing SCC than nonsmokers (p<0.01, 95% CI, 1.72-2.85), and tobacco smokers who carried an “A” allele (AA+AG) in rs6488507 had a 2.34-fold greater risk in developing NSCLC than other patients (p< 0.01, 95%CI, 1.74-3.13). Conclusions: The LRP6 rs10845498 SNP is associated with a reduced risk of lung SCC, while tobacco smoke increases the risk. LRP6 rs6488507 polymorphism synergistically increased the risk of NSCLC in tobacco smokers. Further studies are needed to elucidate the functional impact of LRP6 expression and activity in NSCLC.  相似文献   

14.
目的 探讨CD133及SLC7A11在非小细胞肺癌(NSCLC)组织及邻近正常肺组织中的表达及临床意义。方法 选取2015年1月~2019年7月我院经病理科确诊的NSCLC组织标本42例,并选取病理证实无癌细胞浸润的邻近正常肺组织标本(距癌组织>5 cm)30例,比较NSCLC组织和邻近正常肺组织中CD133和SLC7A11阳性率表达、CD133及SLC7A11阳性表达与临床病理的关系及其在NSCLC组织中共表达关系。结果 NSCLC组织中CD133、SLC7A11阳性率为57.14%、64.29%,高于邻近正常肺组织的10.00%、6.67%,差异有统计学意义(P<0.05)。不同分化程度、淋巴结转移、TNM分期癌组织中CD133、SLC7A11阳性表达比较,差异有统计学意义(P<0.05);不同性别、年龄、组织学类型癌组织中的CD133、SLC7A11阳性表达比较,差异无统计学意义(P>0.05)。24例CD133阳性表达中,有21例SLC7A11阳性表达;18例CD133阴性表达中,有12例SLC7A11阴性表达,CD133、SLC7A11在NSCLC中的表达呈正相关(r=0.532,P<0.05)。结论 CD133、SLC7A11在NSCLC中的高表达与癌组织的恶性行为及患者较差预后密切相关,对NSCLC早期诊断和靶向治疗具有重要意义。  相似文献   

15.
目的探讨前蛋白转化酶枯草溶菌素9(PCSK9)基因rs2479409位点多态性与认知功能障碍的相关性。方法在中国江苏省如皋县开展的以人群为基础的病例对照研究中,共纳入了1 707例年龄70~84岁的研究对象,使用改良长谷川痴呆量表(HDS-R)评价该人群认知功能,并检测了该人群中PCSK9基因rs2479409位点单核苷酸多态性情况。结果该人群PCSK9基因rs2479409多态性主要以GG和AG基因型存在。认知障碍组和对照组在rs2479409位点的等位基因频率、基因型频率分布有差异(P0.05)。A等位基因为认知障碍保护性因素,GG基因型相对于AA基因型1.66倍增加认知障碍发生风险(OR=1.66,95%CI 1.16~2.36,P0.01),调整相关混杂因素后仍有统计学差异(P0.05)。结论 PCSK9基因rs2479409位点多态性与认知障碍相关。  相似文献   

16.
目的:探讨瘦素受体基因Gln223Arg 位点多态性与哮喘和代谢综合征之间的关系。方法:选择120 例哮喘病人(A)、92 例代谢综合征病人(M)、54 例哮喘合并代谢综合征病人(A+M)和81 例健康对照者(NC),其中哮喘组根据肺功能进一步分为轻-中度哮喘组和重度哮喘组。应用聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)方法测定所有受试者瘦素受体基因Gln223Arg 位点基因型,ELISA 法检测血清瘦素浓度,同时测定所有受试者BMI、血压、肺功能及空腹血糖。结果: 代谢综合征组和哮喘合并代谢综合征组AA+AG 基因型和A 等位基因频率较健康对照组显著性增高(P<0.05); 哮喘组中重度持续组AA+AG 基因型和A 等位基因频率较健康对照组显著增高(P<0.05); AA+AG 基因型的血浆瘦素浓度、 MBI、收缩压与GG 基因型比均显著升高,FEV1%、FEV1/ FVC 明显下降(P<0.05)。结论:瘦素受体Gln223Arg 位点基因多态性与哮喘和代谢综合征具有相关性,其中A 等位基因可能通过瘦素抵抗诱导哮喘和代谢综合征的发生,是哮喘和代谢综合征的共同遗传易感因子。  相似文献   

17.
Apoptosis plays a key role in inhibiting tumor growth, progression and resistance to anti-tumor therapy. We hypothesized that genetic variants in apoptotic genes may affect the prognosis of lung cancer. To test this hypothesis, we selected 38 potentially functional single nucleotide polymorphisms (SNPs) from 12 genes (BAX, BCL2, BID, CASP3, CASP6, CASP7, CASP8, CASP9, CASP10, FAS, FASLG and MCL1) involved in apoptosis to assess their prognostic significance in lung cancer in a Chinese case cohort with 568 non-small cell lung cancer (NSCLC) patients. Thirty-five SNPs passing quality control underwent association analyses, 11 of which were shown to be significantly associated with NSCLC survival (P < 0.05). After Cox stepwise regression analyses, 3 SNPs were independently associated with the outcome of NSCLC (BID rs8190315: P = 0.003; CASP9 rs4645981: P = 0.007 and FAS rs1800682: P = 0.016). A favorable survival of NSCLC was significantly associated with the genotypes of BID rs8190315 AG/GG (adjusted HR = 0.65, 95% CI: 0.49-0.88), CASP9 rs4645981 AA (HR = 0.22, 95% CI: 0.07-0.69) and FAS rs1800682 GG (adjusted HR = 0.67, 95% CI: 0.46-0.97). Time-dependent receptor operation curve (ROC) analysis revealed that the area under curve (AUC) at year 5 was significantly increased from 0.762 to 0.819 after adding the risk score of these 3 SNPs to the clinical risk score. The remaining 32 SNPs were not significantly associated with NSCLC prognosis after adjustment for these 3 SNPs. These findings indicate that BID rs8190315, CASP9 rs4645981 and FAS rs1800682 polymorphisms in the apoptotic pathway may be involved in the prognosis of NSCLC in the Chinese population.  相似文献   

18.
目的:研究E-选择素基因单核苷酸多态性(SNP)rs5359A/G、rs4786G/A等位基因及其基因型在中国广西地区健康人群中的分布频率,并与其他种族和地区间的分布进行比较。方法:应用单碱基延伸PCR技术和DNA测序方法检测199例中国广西人群E-选择素基因rs5359A/G、rs4786G/A的多态性,并与人类基因组计划(Hapmap)公布的欧洲、非洲、日本和中国北京人群的基因型及等位基因的频率进行比较分析。结果:E-选择素基因rs5359A/G、rs4786G/A存在多态性,其基因型及等位基因频率在广西地区男女组间及与非洲、日本、中国北京人群比较无统计学差异(P>0.05),但与欧洲人群比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论:中国广西地区健康人群E-选择素基因rs5359A/G、rs4786G/A存在多态性,与欧洲人群比较存在显著性差异,这种差异对于人类学研究可能起到重要作用。  相似文献   

19.
The single nucleotide polymorphism (SNP) rs6983267 and cancer‐associated region long non‐coding RNA (CARLo‐5) are associated with various human cancers. This study aimed to investigate the expression of CARLo‐5 in endometrial carcinoma (EC) and its relationship with clinicopathological features and patient survival. The association of the rs6983267 SNP with EC risk and its involvement in the regulation of CARLo‐5 expression in EC were investigated. The rs6983267 SNP was genotyped by polymerase chain reaction (PCR) and ligase detection reaction in 543 EC patients and 584 controls. The expression of CARLo‐5 in 108 EC tissues and 66 normal endometrial tissues (NETs) was determined using quantitative real‐time PCR. The genotype and allele distributions of the rs6983267 SNP differed significantly between patients and controls. There was a significant correlation between the rs6983267 genotypes and lymph node metastasis of EC patients (P = 0.026). CARLo‐5 expression was significantly higher in EC tissues than in NETs (P < 0.001) and significantly associated with FIGO stage (P = 0.029) and lymph node metastasis (P = 0.030). Patients with high CARLo‐5 expression had significantly shorter overall survival than those with low CARLo‐5 expression (P = 0.003). The rs6983267 genotype was significantly correlated with CARLo‐5 expression (P < 0.05). In conclusion, CARLo‐5 was identified as a pro‐oncogenic lncRNA that may play an important role in EC progression and represent a prognostic marker for EC. The expression of CARLo‐5 was significantly correlated with the rs6983267 genotype associated with increased susceptibility to EC. Environ. Mol. Mutagen. 57:508–515, 2016. © 2016 Wiley Periodicals, Inc.  相似文献   

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